Genes within 1Mb (chr1:54899991:T:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 98668 sc-eQTL 2.44e-01 0.214 0.183 0.053 B L1
ENSG00000081870 HSPB11 954062 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0938 0.117 0.053 B L1
ENSG00000116133 DHCR24 12796 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0793 0.174 0.053 B L1
ENSG00000116205 TCEANC2 846407 sc-eQTL 6.39e-01 0.0704 0.15 0.053 B L1
ENSG00000116209 TMEM59 846487 sc-eQTL 4.01e-01 0.0767 0.0912 0.053 B L1
ENSG00000116212 LRRC42 953906 sc-eQTL 1.37e-01 -0.244 0.164 0.053 B L1
ENSG00000116221 MRPL37 715950 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0246 0.12 0.053 B L1
ENSG00000157216 SSBP3 486512 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0309 0.125 0.053 B L1
ENSG00000162402 USP24 -315373 sc-eQTL 5.67e-02 0.201 0.105 0.053 B L1
ENSG00000215883 CYB5RL 699955 sc-eQTL 4.87e-01 -0.142 0.204 0.053 B L1
ENSG00000243725 TTC4 184130 sc-eQTL 9.48e-01 0.0117 0.178 0.053 B L1
ENSG00000006555 TTC22 98668 sc-eQTL 5.07e-02 0.278 0.141 0.053 CD4T L1
ENSG00000081870 HSPB11 954062 sc-eQTL 8.96e-01 0.0158 0.121 0.053 CD4T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 846407 sc-eQTL 3.40e-01 -0.111 0.116 0.053 CD4T L1
ENSG00000116209 TMEM59 846487 sc-eQTL 3.10e-02 -0.233 0.107 0.053 CD4T L1
ENSG00000116212 LRRC42 953906 sc-eQTL 5.25e-01 -0.108 0.17 0.053 CD4T L1
ENSG00000116221 MRPL37 715950 sc-eQTL 3.16e-01 0.151 0.15 0.053 CD4T L1
ENSG00000157216 SSBP3 486512 sc-eQTL 7.01e-01 -0.048 0.125 0.053 CD4T L1
ENSG00000162402 USP24 -315373 sc-eQTL 8.19e-01 0.0233 0.102 0.053 CD4T L1
ENSG00000243725 TTC4 184130 sc-eQTL 9.52e-01 0.0093 0.153 0.053 CD4T L1
ENSG00000006555 TTC22 98668 sc-eQTL 9.05e-01 0.0149 0.124 0.053 CD8T L1
ENSG00000081870 HSPB11 954062 sc-eQTL 1.02e-01 -0.182 0.111 0.053 CD8T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 846407 sc-eQTL 3.11e-01 -0.156 0.154 0.053 CD8T L1
ENSG00000116209 TMEM59 846487 sc-eQTL 7.67e-01 0.0318 0.107 0.053 CD8T L1
ENSG00000116212 LRRC42 953906 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0785 0.172 0.053 CD8T L1
ENSG00000116221 MRPL37 715950 sc-eQTL 1.92e-01 -0.193 0.147 0.053 CD8T L1
ENSG00000157216 SSBP3 486512 sc-eQTL 2.50e-01 -0.122 0.106 0.053 CD8T L1
ENSG00000162402 USP24 -315373 sc-eQTL 4.23e-02 0.208 0.102 0.053 CD8T L1
ENSG00000243725 TTC4 184130 sc-eQTL 5.18e-01 0.115 0.178 0.053 CD8T L1
ENSG00000081870 HSPB11 954062 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0354 0.183 0.054 DC L1
ENSG00000116133 DHCR24 12796 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0367 0.172 0.054 DC L1
ENSG00000116205 TCEANC2 846407 sc-eQTL 6.44e-01 -0.089 0.193 0.054 DC L1
ENSG00000116209 TMEM59 846487 sc-eQTL 3.94e-01 0.129 0.151 0.054 DC L1
ENSG00000116212 LRRC42 953906 sc-eQTL 4.68e-01 -0.143 0.197 0.054 DC L1
ENSG00000116221 MRPL37 715950 sc-eQTL 4.60e-01 0.15 0.203 0.054 DC L1
ENSG00000157216 SSBP3 486512 sc-eQTL 3.84e-01 -0.158 0.181 0.054 DC L1
ENSG00000162390 ACOT11 357734 sc-eQTL 6.31e-01 0.0838 0.174 0.054 DC L1
ENSG00000162402 USP24 -315373 sc-eQTL 2.22e-02 0.239 0.104 0.054 DC L1
ENSG00000215883 CYB5RL 699955 sc-eQTL 1.95e-01 0.246 0.189 0.054 DC L1
ENSG00000243725 TTC4 184130 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0762 0.205 0.054 DC L1
ENSG00000081870 HSPB11 954062 sc-eQTL 1.71e-01 0.201 0.146 0.053 Mono L1
ENSG00000116133 DHCR24 12796 sc-eQTL 4.72e-01 -0.085 0.118 0.053 Mono L1
ENSG00000116205 TCEANC2 846407 sc-eQTL 8.94e-01 0.0171 0.127 0.053 Mono L1
ENSG00000116209 TMEM59 846487 sc-eQTL 9.79e-01 0.00255 0.0946 0.053 Mono L1
ENSG00000116212 LRRC42 953906 sc-eQTL 1.02e-01 -0.314 0.191 0.053 Mono L1
ENSG00000116221 MRPL37 715950 sc-eQTL 2.72e-01 -0.174 0.158 0.053 Mono L1
ENSG00000157216 SSBP3 486512 sc-eQTL 4.02e-02 -0.371 0.18 0.053 Mono L1
ENSG00000162402 USP24 -315373 sc-eQTL 3.87e-01 0.0936 0.108 0.053 Mono L1
ENSG00000243725 TTC4 184130 sc-eQTL 4.73e-01 -0.137 0.19 0.053 Mono L1
ENSG00000006555 TTC22 98668 sc-eQTL 9.42e-01 0.013 0.178 0.054 NK L1
ENSG00000081870 HSPB11 954062 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0522 0.155 0.054 NK L1
ENSG00000116133 DHCR24 12796 sc-eQTL 2.18e-01 -0.221 0.179 0.054 NK L1
ENSG00000116205 TCEANC2 846407 sc-eQTL 3.44e-01 -0.168 0.177 0.054 NK L1
ENSG00000116209 TMEM59 846487 sc-eQTL 3.53e-01 -0.129 0.138 0.054 NK L1
ENSG00000116212 LRRC42 953906 sc-eQTL 2.83e-01 -0.221 0.206 0.054 NK L1
ENSG00000116221 MRPL37 715950 sc-eQTL 6.03e-02 -0.323 0.171 0.054 NK L1
ENSG00000157216 SSBP3 486512 sc-eQTL 4.31e-01 0.118 0.149 0.054 NK L1
ENSG00000162398 LEXM 93928 sc-eQTL 2.93e-01 0.176 0.167 0.054 NK L1
ENSG00000162402 USP24 -315373 sc-eQTL 4.50e-02 0.203 0.101 0.054 NK L1
ENSG00000243725 TTC4 184130 sc-eQTL 1.16e-01 0.302 0.191 0.054 NK L1
ENSG00000006555 TTC22 98668 sc-eQTL 8.89e-01 0.0206 0.148 0.053 Other_T L1
ENSG00000081870 HSPB11 954062 sc-eQTL 2.27e-01 -0.13 0.107 0.053 Other_T L1
ENSG00000116133 DHCR24 12796 sc-eQTL 8.08e-01 0.0279 0.114 0.053 Other_T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 846407 sc-eQTL 6.02e-01 0.0894 0.171 0.053 Other_T L1
ENSG00000116209 TMEM59 846487 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0127 0.118 0.053 Other_T L1
ENSG00000116212 LRRC42 953906 sc-eQTL 2.47e-02 -0.361 0.16 0.053 Other_T L1
ENSG00000116221 MRPL37 715950 sc-eQTL 3.36e-02 -0.233 0.109 0.053 Other_T L1
ENSG00000157216 SSBP3 486512 sc-eQTL 7.17e-01 0.0463 0.127 0.053 Other_T L1
ENSG00000162402 USP24 -315373 sc-eQTL 5.35e-01 0.0841 0.135 0.053 Other_T L1
ENSG00000215883 CYB5RL 699955 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0503 0.185 0.053 Other_T L1
ENSG00000243725 TTC4 184130 sc-eQTL 1.23e-01 0.285 0.184 0.053 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 98668 sc-eQTL 7.70e-01 0.0472 0.161 0.056 B_Activated L2
ENSG00000081870 HSPB11 954062 sc-eQTL 1.43e-01 0.325 0.221 0.056 B_Activated L2
ENSG00000116133 DHCR24 12796 sc-eQTL 3.34e-01 0.183 0.189 0.056 B_Activated L2
ENSG00000116205 TCEANC2 846407 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0675 0.204 0.056 B_Activated L2
ENSG00000116209 TMEM59 846487 sc-eQTL 7.39e-01 0.0721 0.216 0.056 B_Activated L2
ENSG00000116212 LRRC42 953906 sc-eQTL 3.46e-01 0.198 0.209 0.056 B_Activated L2
ENSG00000116221 MRPL37 715950 sc-eQTL 1.44e-01 -0.341 0.232 0.056 B_Activated L2
ENSG00000157216 SSBP3 486512 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0835 0.211 0.056 B_Activated L2
ENSG00000162402 USP24 -315373 sc-eQTL 4.08e-01 -0.171 0.206 0.056 B_Activated L2
ENSG00000215883 CYB5RL 699955 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0411 0.182 0.056 B_Activated L2
ENSG00000243725 TTC4 184130 sc-eQTL 6.63e-02 -0.362 0.196 0.056 B_Activated L2
ENSG00000006555 TTC22 98668 sc-eQTL 5.83e-01 -0.112 0.204 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000081870 HSPB11 954062 sc-eQTL 9.41e-01 -0.0142 0.193 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000116133 DHCR24 12796 sc-eQTL 1.10e-01 -0.302 0.188 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000116205 TCEANC2 846407 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0865 0.188 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000116209 TMEM59 846487 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00308 0.161 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000116212 LRRC42 953906 sc-eQTL 2.97e-01 -0.204 0.196 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000116221 MRPL37 715950 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0793 0.19 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000157216 SSBP3 486512 sc-eQTL 4.90e-01 -0.123 0.177 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000162402 USP24 -315373 sc-eQTL 7.07e-03 0.399 0.147 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000215883 CYB5RL 699955 sc-eQTL 7.25e-01 0.0745 0.211 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000243725 TTC4 184130 sc-eQTL 9.43e-01 0.0139 0.192 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000006555 TTC22 98668 sc-eQTL 6.13e-01 0.0949 0.187 0.052 B_Memory L2
ENSG00000081870 HSPB11 954062 sc-eQTL 9.28e-01 0.0157 0.175 0.052 B_Memory L2
ENSG00000116133 DHCR24 12796 sc-eQTL 9.09e-01 0.0212 0.186 0.052 B_Memory L2
ENSG00000116205 TCEANC2 846407 sc-eQTL 4.34e-01 -0.156 0.199 0.052 B_Memory L2
ENSG00000116209 TMEM59 846487 sc-eQTL 5.04e-01 0.111 0.166 0.052 B_Memory L2
ENSG00000116212 LRRC42 953906 sc-eQTL 4.46e-01 -0.153 0.2 0.052 B_Memory L2
ENSG00000116221 MRPL37 715950 sc-eQTL 5.60e-01 0.0981 0.168 0.052 B_Memory L2
ENSG00000157216 SSBP3 486512 sc-eQTL 7.91e-02 0.275 0.156 0.052 B_Memory L2
ENSG00000162402 USP24 -315373 sc-eQTL 4.94e-01 0.105 0.153 0.052 B_Memory L2
ENSG00000215883 CYB5RL 699955 sc-eQTL 1.95e-01 -0.246 0.189 0.052 B_Memory L2
ENSG00000243725 TTC4 184130 sc-eQTL 6.07e-01 0.101 0.197 0.052 B_Memory L2
ENSG00000006555 TTC22 98668 sc-eQTL 9.79e-02 0.348 0.209 0.053 B_Naive1 L2
ENSG00000081870 HSPB11 954062 sc-eQTL 5.55e-01 -0.105 0.177 0.053 B_Naive1 L2
ENSG00000116133 DHCR24 12796 sc-eQTL 1.98e-01 0.254 0.197 0.053 B_Naive1 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 846407 sc-eQTL 4.48e-01 0.134 0.176 0.053 B_Naive1 L2
ENSG00000116209 TMEM59 846487 sc-eQTL 7.92e-01 0.0338 0.128 0.053 B_Naive1 L2
ENSG00000116212 LRRC42 953906 sc-eQTL 3.20e-01 -0.225 0.226 0.053 B_Naive1 L2
ENSG00000116221 MRPL37 715950 sc-eQTL 8.97e-01 0.0245 0.189 0.053 B_Naive1 L2
ENSG00000157216 SSBP3 486512 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0947 0.18 0.053 B_Naive1 L2
ENSG00000162402 USP24 -315373 sc-eQTL 8.53e-02 0.243 0.141 0.053 B_Naive1 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 699955 sc-eQTL 3.66e-01 0.193 0.213 0.053 B_Naive1 L2
ENSG00000243725 TTC4 184130 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0184 0.193 0.053 B_Naive1 L2
ENSG00000006555 TTC22 98668 sc-eQTL 2.31e-01 0.258 0.214 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000081870 HSPB11 954062 sc-eQTL 8.06e-01 0.0518 0.211 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000116133 DHCR24 12796 sc-eQTL 7.81e-01 0.0521 0.187 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 846407 sc-eQTL 6.08e-01 0.107 0.208 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000116209 TMEM59 846487 sc-eQTL 9.36e-01 -0.0137 0.171 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000116212 LRRC42 953906 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0814 0.215 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000116221 MRPL37 715950 sc-eQTL 1.65e-01 -0.28 0.2 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000157216 SSBP3 486512 sc-eQTL 1.66e-01 0.274 0.197 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000162402 USP24 -315373 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0834 0.157 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 699955 sc-eQTL 7.29e-01 0.0768 0.221 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000243725 TTC4 184130 sc-eQTL 6.11e-01 0.117 0.23 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000006555 TTC22 98668 sc-eQTL 9.54e-02 0.278 0.166 0.053 CD4_Naive L2
ENSG00000081870 HSPB11 954062 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0761 0.151 0.053 CD4_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 846407 sc-eQTL 9.34e-01 -0.0105 0.127 0.053 CD4_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 846487 sc-eQTL 2.18e-03 -0.374 0.121 0.053 CD4_Naive L2
ENSG00000116212 LRRC42 953906 sc-eQTL 5.47e-01 -0.113 0.188 0.053 CD4_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 715950 sc-eQTL 1.09e-01 0.254 0.158 0.053 CD4_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 486512 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0717 0.127 0.053 CD4_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -315373 sc-eQTL 8.37e-01 0.0226 0.11 0.053 CD4_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 184130 sc-eQTL 9.32e-01 -0.0142 0.167 0.053 CD4_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 98668 sc-eQTL 4.12e-01 0.147 0.179 0.053 CD4_TCM L2
ENSG00000081870 HSPB11 954062 sc-eQTL 5.05e-01 0.104 0.156 0.053 CD4_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 846407 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0921 0.174 0.053 CD4_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 846487 sc-eQTL 3.09e-01 -0.133 0.131 0.053 CD4_TCM L2
ENSG00000116212 LRRC42 953906 sc-eQTL 4.04e-01 -0.165 0.197 0.053 CD4_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 715950 sc-eQTL 4.52e-01 0.124 0.165 0.053 CD4_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 486512 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0298 0.162 0.053 CD4_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -315373 sc-eQTL 6.67e-01 0.0577 0.134 0.053 CD4_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 184130 sc-eQTL 4.61e-01 0.142 0.193 0.053 CD4_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 98668 sc-eQTL 2.63e-02 0.447 0.2 0.053 CD4_TEM L2
ENSG00000081870 HSPB11 954062 sc-eQTL 1.87e-01 0.24 0.181 0.053 CD4_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 846407 sc-eQTL 1.62e-01 -0.268 0.191 0.053 CD4_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 846487 sc-eQTL 2.55e-01 -0.169 0.148 0.053 CD4_TEM L2
ENSG00000116212 LRRC42 953906 sc-eQTL 5.02e-01 0.131 0.195 0.053 CD4_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 715950 sc-eQTL 2.46e-01 -0.222 0.191 0.053 CD4_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 486512 sc-eQTL 6.15e-02 -0.306 0.163 0.053 CD4_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -315373 sc-eQTL 3.07e-01 0.152 0.149 0.053 CD4_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 184130 sc-eQTL 7.73e-01 0.057 0.197 0.053 CD4_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 98668 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0671 0.164 0.053 CD8_CTL L2
ENSG00000081870 HSPB11 954062 sc-eQTL 1.08e-01 -0.283 0.176 0.053 CD8_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 846407 sc-eQTL 7.56e-01 0.0564 0.182 0.053 CD8_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 846487 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0599 0.158 0.053 CD8_CTL L2
ENSG00000116212 LRRC42 953906 sc-eQTL 3.74e-01 -0.169 0.19 0.053 CD8_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 715950 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0334 0.187 0.053 CD8_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 486512 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0309 0.128 0.053 CD8_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -315373 sc-eQTL 3.47e-01 0.12 0.127 0.053 CD8_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 184130 sc-eQTL 9.64e-01 0.00858 0.19 0.053 CD8_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 98668 sc-eQTL 1.42e-01 0.268 0.182 0.053 CD8_Naive L2
ENSG00000081870 HSPB11 954062 sc-eQTL 4.92e-01 -0.104 0.151 0.053 CD8_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 846407 sc-eQTL 4.40e-01 -0.128 0.165 0.053 CD8_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 846487 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0194 0.162 0.053 CD8_Naive L2
ENSG00000116212 LRRC42 953906 sc-eQTL 1.91e-01 0.257 0.196 0.053 CD8_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 715950 sc-eQTL 5.59e-02 -0.369 0.192 0.053 CD8_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 486512 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0951 0.146 0.053 CD8_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -315373 sc-eQTL 9.93e-01 0.00118 0.133 0.053 CD8_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 184130 sc-eQTL 3.95e-01 0.166 0.195 0.053 CD8_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 98668 sc-eQTL 9.56e-01 0.0112 0.203 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000081870 HSPB11 954062 sc-eQTL 4.36e-01 -0.146 0.187 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 846407 sc-eQTL 7.84e-01 0.056 0.204 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 846487 sc-eQTL 5.08e-01 -0.119 0.18 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000116212 LRRC42 953906 sc-eQTL 4.09e-01 -0.176 0.213 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 715950 sc-eQTL 9.39e-01 0.0157 0.204 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 486512 sc-eQTL 9.45e-02 -0.295 0.176 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -315373 sc-eQTL 6.03e-02 0.321 0.17 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 184130 sc-eQTL 5.62e-01 0.121 0.208 0.053 CD8_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 98668 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0677 0.184 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000081870 HSPB11 954062 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0824 0.178 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 846407 sc-eQTL 9.42e-01 0.0139 0.192 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 846487 sc-eQTL 2.48e-01 0.214 0.185 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000116212 LRRC42 953906 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0954 0.2 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 715950 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0841 0.188 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 486512 sc-eQTL 6.69e-01 0.0762 0.178 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -315373 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0718 0.188 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 184130 sc-eQTL 2.51e-01 -0.219 0.19 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 98668 sc-eQTL 5.49e-01 -0.105 0.175 0.054 MAIT L2
ENSG00000081870 HSPB11 954062 sc-eQTL 2.85e-01 0.203 0.189 0.054 MAIT L2
ENSG00000116133 DHCR24 12796 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0328 0.13 0.054 MAIT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 846407 sc-eQTL 3.28e-01 0.179 0.183 0.054 MAIT L2
ENSG00000116209 TMEM59 846487 sc-eQTL 5.86e-01 0.0901 0.165 0.054 MAIT L2
ENSG00000116212 LRRC42 953906 sc-eQTL 3.19e-01 -0.198 0.199 0.054 MAIT L2
ENSG00000116221 MRPL37 715950 sc-eQTL 4.97e-01 -0.137 0.201 0.054 MAIT L2
ENSG00000157216 SSBP3 486512 sc-eQTL 5.89e-01 0.0963 0.178 0.054 MAIT L2
ENSG00000162402 USP24 -315373 sc-eQTL 2.24e-01 0.192 0.158 0.054 MAIT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 699955 sc-eQTL 2.45e-01 -0.214 0.183 0.054 MAIT L2
ENSG00000243725 TTC4 184130 sc-eQTL 6.19e-01 0.0908 0.183 0.054 MAIT L2
ENSG00000006555 TTC22 98668 sc-eQTL 2.54e-01 -0.266 0.232 0.059 PB L2
ENSG00000081870 HSPB11 954062 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0892 0.206 0.059 PB L2
ENSG00000116133 DHCR24 12796 sc-eQTL 7.94e-02 -0.362 0.204 0.059 PB L2
ENSG00000116205 TCEANC2 846407 sc-eQTL 2.26e-01 0.305 0.251 0.059 PB L2
ENSG00000116209 TMEM59 846487 sc-eQTL 3.43e-02 0.221 0.103 0.059 PB L2
ENSG00000116212 LRRC42 953906 sc-eQTL 5.15e-01 -0.155 0.237 0.059 PB L2
ENSG00000116221 MRPL37 715950 sc-eQTL 4.73e-01 0.138 0.191 0.059 PB L2
ENSG00000157216 SSBP3 486512 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0808 0.221 0.059 PB L2
ENSG00000162402 USP24 -315373 sc-eQTL 3.76e-01 -0.222 0.25 0.059 PB L2
ENSG00000215883 CYB5RL 699955 sc-eQTL 4.01e-01 0.219 0.26 0.059 PB L2
ENSG00000243725 TTC4 184130 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0565 0.243 0.059 PB L2
ENSG00000006555 TTC22 98668 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0608 0.177 0.054 Pro_T L2
ENSG00000081870 HSPB11 954062 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0579 0.119 0.054 Pro_T L2
ENSG00000116133 DHCR24 12796 sc-eQTL 5.00e-01 -0.101 0.15 0.054 Pro_T L2
ENSG00000116205 TCEANC2 846407 sc-eQTL 1.08e-01 -0.294 0.182 0.054 Pro_T L2
ENSG00000116209 TMEM59 846487 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0135 0.127 0.054 Pro_T L2
ENSG00000116212 LRRC42 953906 sc-eQTL 1.32e-01 -0.246 0.163 0.054 Pro_T L2
ENSG00000116221 MRPL37 715950 sc-eQTL 5.15e-02 -0.242 0.123 0.054 Pro_T L2
ENSG00000157216 SSBP3 486512 sc-eQTL 7.62e-01 0.0423 0.14 0.054 Pro_T L2
ENSG00000162402 USP24 -315373 sc-eQTL 7.88e-01 0.0459 0.17 0.054 Pro_T L2
ENSG00000215883 CYB5RL 699955 sc-eQTL 5.40e-01 0.103 0.168 0.054 Pro_T L2
ENSG00000243725 TTC4 184130 sc-eQTL 2.73e-01 0.205 0.187 0.054 Pro_T L2
ENSG00000006555 TTC22 98668 sc-eQTL 9.63e-01 0.00824 0.18 0.053 Treg L2
ENSG00000081870 HSPB11 954062 sc-eQTL 4.65e-01 -0.138 0.188 0.053 Treg L2
ENSG00000116205 TCEANC2 846407 sc-eQTL 1.36e-01 -0.287 0.192 0.053 Treg L2
ENSG00000116209 TMEM59 846487 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0959 0.152 0.053 Treg L2
ENSG00000116212 LRRC42 953906 sc-eQTL 6.19e-01 -0.101 0.203 0.053 Treg L2
ENSG00000116221 MRPL37 715950 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00392 0.188 0.053 Treg L2
ENSG00000157216 SSBP3 486512 sc-eQTL 5.32e-01 0.105 0.168 0.053 Treg L2
ENSG00000162402 USP24 -315373 sc-eQTL 9.53e-01 0.00955 0.16 0.053 Treg L2
ENSG00000243725 TTC4 184130 sc-eQTL 4.45e-01 0.154 0.202 0.053 Treg L2
ENSG00000081870 HSPB11 954062 sc-eQTL 6.05e-02 0.309 0.164 0.053 cMono_IL1B L2
ENSG00000116133 DHCR24 12796 sc-eQTL 8.58e-01 0.0206 0.115 0.053 cMono_IL1B L2
ENSG00000116205 TCEANC2 846407 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0243 0.159 0.053 cMono_IL1B L2
ENSG00000116209 TMEM59 846487 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0344 0.0966 0.053 cMono_IL1B L2
ENSG00000116212 LRRC42 953906 sc-eQTL 9.68e-02 -0.324 0.194 0.053 cMono_IL1B L2
ENSG00000116221 MRPL37 715950 sc-eQTL 9.40e-01 0.0131 0.172 0.053 cMono_IL1B L2
ENSG00000157216 SSBP3 486512 sc-eQTL 1.60e-01 -0.247 0.175 0.053 cMono_IL1B L2
ENSG00000162402 USP24 -315373 sc-eQTL 1.81e-02 0.305 0.128 0.053 cMono_IL1B L2
ENSG00000243725 TTC4 184130 sc-eQTL 3.87e-01 -0.172 0.198 0.053 cMono_IL1B L2
ENSG00000081870 HSPB11 954062 sc-eQTL 1.31e-01 0.274 0.181 0.053 cMono_S100A L2
ENSG00000116133 DHCR24 12796 sc-eQTL 2.66e-01 -0.119 0.106 0.053 cMono_S100A L2
ENSG00000116205 TCEANC2 846407 sc-eQTL 6.29e-01 0.0785 0.162 0.053 cMono_S100A L2
ENSG00000116209 TMEM59 846487 sc-eQTL 8.06e-01 0.032 0.13 0.053 cMono_S100A L2
ENSG00000116212 LRRC42 953906 sc-eQTL 2.19e-01 -0.254 0.206 0.053 cMono_S100A L2
ENSG00000116221 MRPL37 715950 sc-eQTL 3.52e-02 -0.395 0.186 0.053 cMono_S100A L2
ENSG00000157216 SSBP3 486512 sc-eQTL 5.09e-01 -0.129 0.195 0.053 cMono_S100A L2
ENSG00000162402 USP24 -315373 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00257 0.158 0.053 cMono_S100A L2
ENSG00000243725 TTC4 184130 sc-eQTL 3.04e-01 -0.203 0.197 0.053 cMono_S100A L2
ENSG00000006555 TTC22 98668 sc-eQTL 3.61e-01 0.168 0.183 0.055 gdT L2
ENSG00000081870 HSPB11 954062 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0794 0.255 0.055 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 12796 sc-eQTL 5.50e-01 0.123 0.204 0.055 gdT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 846407 sc-eQTL 1.39e-01 0.304 0.204 0.055 gdT L2
ENSG00000116209 TMEM59 846487 sc-eQTL 1.44e-01 0.304 0.207 0.055 gdT L2
ENSG00000116212 LRRC42 953906 sc-eQTL 5.97e-02 -0.459 0.242 0.055 gdT L2
ENSG00000116221 MRPL37 715950 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0734 0.239 0.055 gdT L2
ENSG00000157216 SSBP3 486512 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0444 0.146 0.055 gdT L2
ENSG00000162402 USP24 -315373 sc-eQTL 2.33e-01 0.234 0.196 0.055 gdT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 699955 sc-eQTL 9.31e-01 0.0178 0.204 0.055 gdT L2
ENSG00000243725 TTC4 184130 sc-eQTL 1.46e-01 0.335 0.229 0.055 gdT L2
ENSG00000081870 HSPB11 954062 sc-eQTL 2.46e-01 -0.22 0.189 0.053 intMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 12796 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0521 0.145 0.053 intMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 846407 sc-eQTL 5.02e-01 -0.121 0.18 0.053 intMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 846487 sc-eQTL 2.11e-01 -0.166 0.132 0.053 intMono L2
ENSG00000116212 LRRC42 953906 sc-eQTL 2.27e-01 0.251 0.207 0.053 intMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 715950 sc-eQTL 8.25e-01 0.0449 0.202 0.053 intMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 486512 sc-eQTL 2.07e-02 -0.476 0.204 0.053 intMono L2
ENSG00000162402 USP24 -315373 sc-eQTL 1.51e-01 -0.265 0.183 0.053 intMono L2
ENSG00000243725 TTC4 184130 sc-eQTL 4.01e-01 0.165 0.196 0.053 intMono L2
ENSG00000081870 HSPB11 954062 sc-eQTL 5.63e-01 -0.114 0.196 0.057 ncMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 12796 sc-eQTL 7.96e-01 0.0364 0.141 0.057 ncMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 846407 sc-eQTL 6.30e-01 0.0849 0.176 0.057 ncMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 846487 sc-eQTL 1.19e-01 0.219 0.14 0.057 ncMono L2
ENSG00000116212 LRRC42 953906 sc-eQTL 4.35e-01 0.15 0.192 0.057 ncMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 715950 sc-eQTL 3.36e-01 0.175 0.181 0.057 ncMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 486512 sc-eQTL 4.99e-02 -0.388 0.197 0.057 ncMono L2
ENSG00000162402 USP24 -315373 sc-eQTL 5.08e-01 -0.105 0.159 0.057 ncMono L2
ENSG00000243725 TTC4 184130 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000524 0.188 0.057 ncMono L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 98668 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0313 0.188 0.053 B_Memory LOneK1K
ENSG00000081870 HSPB11 954062 sc-eQTL 9.40e-01 -0.0124 0.163 0.053 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 12796 sc-eQTL 2.39e-01 -0.222 0.188 0.053 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 846407 sc-eQTL 2.70e-01 -0.201 0.182 0.053 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 846487 sc-eQTL 2.56e-01 0.161 0.142 0.053 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116212 LRRC42 953906 sc-eQTL 2.88e-01 -0.207 0.194 0.053 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 715950 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0379 0.17 0.053 B_Memory LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 486512 sc-eQTL 7.54e-01 0.0463 0.148 0.053 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -315373 sc-eQTL 1.03e-01 0.219 0.134 0.053 B_Memory LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 699955 sc-eQTL 5.42e-01 -0.126 0.207 0.053 B_Memory LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 184130 sc-eQTL 5.77e-01 -0.104 0.186 0.053 B_Memory LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 98668 sc-eQTL 1.04e-01 0.343 0.21 0.053 B_Naive LOneK1K
ENSG00000081870 HSPB11 954062 sc-eQTL 5.23e-01 -0.111 0.174 0.053 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 12796 sc-eQTL 2.72e-01 0.209 0.19 0.053 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 846407 sc-eQTL 1.32e-01 0.259 0.171 0.053 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 846487 sc-eQTL 9.43e-01 0.00879 0.122 0.053 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116212 LRRC42 953906 sc-eQTL 3.77e-01 -0.193 0.217 0.053 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 715950 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0808 0.176 0.053 B_Naive LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 486512 sc-eQTL 7.46e-01 0.051 0.157 0.053 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -315373 sc-eQTL 3.33e-01 0.131 0.135 0.053 B_Naive LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 699955 sc-eQTL 4.99e-01 0.145 0.213 0.053 B_Naive LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 184130 sc-eQTL 9.97e-01 0.000641 0.201 0.053 B_Naive LOneK1K
ENSG00000081870 HSPB11 954062 sc-eQTL 1.46e-02 0.382 0.155 0.053 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 12796 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0449 0.111 0.053 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 846407 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0275 0.139 0.053 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 846487 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0188 0.096 0.053 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116212 LRRC42 953906 sc-eQTL 2.23e-02 -0.445 0.193 0.053 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 715950 sc-eQTL 4.21e-01 -0.137 0.17 0.053 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 486512 sc-eQTL 7.52e-02 -0.316 0.177 0.053 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -315373 sc-eQTL 1.17e-01 0.19 0.121 0.053 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 184130 sc-eQTL 2.39e-01 -0.238 0.201 0.053 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000081870 HSPB11 954062 sc-eQTL 8.62e-02 -0.299 0.174 0.054 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 12796 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0856 0.133 0.054 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 846407 sc-eQTL 9.72e-01 0.00623 0.175 0.054 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 846487 sc-eQTL 5.82e-01 0.0716 0.13 0.054 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116212 LRRC42 953906 sc-eQTL 3.12e-01 0.202 0.199 0.054 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 715950 sc-eQTL 9.45e-01 -0.0124 0.178 0.054 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 486512 sc-eQTL 1.02e-02 -0.485 0.187 0.054 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -315373 sc-eQTL 3.20e-01 -0.149 0.149 0.054 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 184130 sc-eQTL 7.95e-01 0.0487 0.188 0.054 CD16_Mono LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000243725 TTC4 184130 eQTL 0.0459 -0.0845 0.0423 0.0 0.0 0.0427


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina