logo

Genes within 1Mb (chr1:55053079:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 251756 sc-eQTL 1.09e-01 -0.163 0.101 0.212 B L1
ENSG00000116133 DHCR24 165884 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0558 0.0963 0.212 B L1
ENSG00000116205 TCEANC2 999495 sc-eQTL 3.41e-02 0.175 0.0822 0.212 B L1
ENSG00000116209 TMEM59 999575 sc-eQTL 7.56e-01 0.0157 0.0506 0.212 B L1
ENSG00000116221 MRPL37 869038 sc-eQTL 7.82e-02 0.116 0.0658 0.212 B L1
ENSG00000157216 SSBP3 639600 sc-eQTL 8.89e-01 -0.00971 0.0694 0.212 B L1
ENSG00000162402 USP24 -162285 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00103 0.0588 0.212 B L1
ENSG00000215883 CYB5RL 853043 sc-eQTL 5.10e-01 0.0747 0.113 0.212 B L1
ENSG00000243725 TTC4 337218 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0539 0.0984 0.212 B L1
ENSG00000006555 TTC22 251756 sc-eQTL 5.11e-01 0.0525 0.0798 0.212 CD4T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 999495 sc-eQTL 3.22e-01 -0.0647 0.0652 0.212 CD4T L1
ENSG00000116209 TMEM59 999575 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0347 0.0608 0.212 CD4T L1
ENSG00000116221 MRPL37 869038 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0498 0.084 0.212 CD4T L1
ENSG00000157216 SSBP3 639600 sc-eQTL 8.87e-01 0.0099 0.0698 0.212 CD4T L1
ENSG00000162402 USP24 -162285 sc-eQTL 3.98e-02 -0.117 0.0564 0.212 CD4T L1
ENSG00000243725 TTC4 337218 sc-eQTL 3.15e-01 -0.0861 0.0854 0.212 CD4T L1
ENSG00000006555 TTC22 251756 sc-eQTL 6.89e-01 0.0279 0.0696 0.212 CD8T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 999495 sc-eQTL 6.17e-01 0.0435 0.0867 0.212 CD8T L1
ENSG00000116209 TMEM59 999575 sc-eQTL 3.01e-01 -0.0623 0.0601 0.212 CD8T L1
ENSG00000116221 MRPL37 869038 sc-eQTL 1.85e-01 0.11 0.0826 0.212 CD8T L1
ENSG00000157216 SSBP3 639600 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0141 0.0596 0.212 CD8T L1
ENSG00000162402 USP24 -162285 sc-eQTL 7.60e-01 0.0176 0.0576 0.212 CD8T L1
ENSG00000243725 TTC4 337218 sc-eQTL 6.33e-01 0.0478 0.0999 0.212 CD8T L1
ENSG00000116133 DHCR24 165884 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0583 0.0949 0.207 DC L1
ENSG00000116205 TCEANC2 999495 sc-eQTL 4.57e-01 0.0792 0.106 0.207 DC L1
ENSG00000116209 TMEM59 999575 sc-eQTL 2.01e-02 0.193 0.0825 0.207 DC L1
ENSG00000116221 MRPL37 869038 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0639 0.112 0.207 DC L1
ENSG00000157216 SSBP3 639600 sc-eQTL 2.76e-01 0.109 0.0999 0.207 DC L1
ENSG00000162390 ACOT11 510822 sc-eQTL 5.87e-02 0.181 0.0955 0.207 DC L1
ENSG00000162402 USP24 -162285 sc-eQTL 9.19e-01 -0.00594 0.0581 0.207 DC L1
ENSG00000215883 CYB5RL 853043 sc-eQTL 2.97e-02 -0.227 0.104 0.207 DC L1
ENSG00000243725 TTC4 337218 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0329 0.113 0.207 DC L1
ENSG00000116133 DHCR24 165884 sc-eQTL 6.39e-01 0.0318 0.0678 0.212 Mono L1
ENSG00000116205 TCEANC2 999495 sc-eQTL 4.51e-01 0.0552 0.0731 0.212 Mono L1
ENSG00000116209 TMEM59 999575 sc-eQTL 9.53e-01 0.00319 0.0543 0.212 Mono L1
ENSG00000116221 MRPL37 869038 sc-eQTL 8.15e-01 0.0213 0.0909 0.212 Mono L1
ENSG00000157216 SSBP3 639600 sc-eQTL 3.22e-02 -0.222 0.103 0.212 Mono L1
ENSG00000162402 USP24 -162285 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0553 0.0619 0.212 Mono L1
ENSG00000243725 TTC4 337218 sc-eQTL 9.36e-01 0.00874 0.109 0.212 Mono L1
ENSG00000006555 TTC22 251756 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0464 0.0927 0.212 NK L1
ENSG00000116133 DHCR24 165884 sc-eQTL 7.28e-01 0.0326 0.0936 0.212 NK L1
ENSG00000116205 TCEANC2 999495 sc-eQTL 1.42e-01 0.136 0.0919 0.212 NK L1
ENSG00000116209 TMEM59 999575 sc-eQTL 2.90e-01 -0.0766 0.0722 0.212 NK L1
ENSG00000116221 MRPL37 869038 sc-eQTL 6.31e-01 0.0433 0.0899 0.212 NK L1
ENSG00000157216 SSBP3 639600 sc-eQTL 9.61e-01 0.00387 0.078 0.212 NK L1
ENSG00000162398 LEXM 247016 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00415 0.0875 0.212 NK L1
ENSG00000162402 USP24 -162285 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00162 0.0531 0.212 NK L1
ENSG00000243725 TTC4 337218 sc-eQTL 1.52e-01 -0.143 0.0999 0.212 NK L1
ENSG00000006555 TTC22 251756 sc-eQTL 1.55e-02 0.198 0.0812 0.212 Other_T L1
ENSG00000116133 DHCR24 165884 sc-eQTL 3.16e-01 0.0641 0.0637 0.212 Other_T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 999495 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00212 0.0956 0.212 Other_T L1
ENSG00000116209 TMEM59 999575 sc-eQTL 1.86e-01 -0.0867 0.0653 0.212 Other_T L1
ENSG00000116221 MRPL37 869038 sc-eQTL 3.81e-01 0.0539 0.0613 0.212 Other_T L1
ENSG00000157216 SSBP3 639600 sc-eQTL 1.01e-01 -0.116 0.0706 0.212 Other_T L1
ENSG00000162402 USP24 -162285 sc-eQTL 7.91e-01 0.0201 0.0757 0.212 Other_T L1
ENSG00000215883 CYB5RL 853043 sc-eQTL 7.34e-01 0.0351 0.103 0.212 Other_T L1
ENSG00000243725 TTC4 337218 sc-eQTL 1.14e-01 0.163 0.102 0.212 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 251756 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0634 0.0931 0.199 B_Activated L2
ENSG00000116133 DHCR24 165884 sc-eQTL 5.40e-01 0.0672 0.109 0.199 B_Activated L2
ENSG00000116205 TCEANC2 999495 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0561 0.117 0.199 B_Activated L2
ENSG00000116209 TMEM59 999575 sc-eQTL 8.80e-02 0.212 0.124 0.199 B_Activated L2
ENSG00000116221 MRPL37 869038 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0587 0.135 0.199 B_Activated L2
ENSG00000157216 SSBP3 639600 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0754 0.122 0.199 B_Activated L2
ENSG00000162402 USP24 -162285 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0655 0.119 0.199 B_Activated L2
ENSG00000215883 CYB5RL 853043 sc-eQTL 6.97e-01 -0.041 0.105 0.199 B_Activated L2
ENSG00000243725 TTC4 337218 sc-eQTL 9.16e-01 -0.012 0.114 0.199 B_Activated L2
ENSG00000006555 TTC22 251756 sc-eQTL 6.92e-01 0.0447 0.113 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000116133 DHCR24 165884 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0153 0.105 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000116205 TCEANC2 999495 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0111 0.104 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000116209 TMEM59 999575 sc-eQTL 9.47e-01 0.00595 0.0893 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000116221 MRPL37 869038 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0149 0.105 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000157216 SSBP3 639600 sc-eQTL 3.57e-01 0.0904 0.0979 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000162402 USP24 -162285 sc-eQTL 6.96e-01 0.0323 0.0826 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000215883 CYB5RL 853043 sc-eQTL 6.87e-01 0.0472 0.117 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000243725 TTC4 337218 sc-eQTL 2.21e-01 0.13 0.106 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000006555 TTC22 251756 sc-eQTL 1.17e-01 -0.165 0.105 0.211 B_Memory L2
ENSG00000116133 DHCR24 165884 sc-eQTL 1.12e-01 -0.166 0.104 0.211 B_Memory L2
ENSG00000116205 TCEANC2 999495 sc-eQTL 6.66e-02 0.205 0.111 0.211 B_Memory L2
ENSG00000116209 TMEM59 999575 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0505 0.0933 0.211 B_Memory L2
ENSG00000116221 MRPL37 869038 sc-eQTL 6.36e-01 0.0448 0.0946 0.211 B_Memory L2
ENSG00000157216 SSBP3 639600 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0217 0.0883 0.211 B_Memory L2
ENSG00000162402 USP24 -162285 sc-eQTL 2.53e-01 -0.0987 0.0861 0.211 B_Memory L2
ENSG00000215883 CYB5RL 853043 sc-eQTL 8.71e-01 0.0173 0.107 0.211 B_Memory L2
ENSG00000243725 TTC4 337218 sc-eQTL 2.76e-01 -0.12 0.11 0.211 B_Memory L2
ENSG00000006555 TTC22 251756 sc-eQTL 3.69e-01 -0.0986 0.11 0.212 B_Naive1 L2
ENSG00000116133 DHCR24 165884 sc-eQTL 2.83e-01 0.111 0.103 0.212 B_Naive1 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 999495 sc-eQTL 4.24e-01 0.0734 0.0917 0.212 B_Naive1 L2
ENSG00000116209 TMEM59 999575 sc-eQTL 9.87e-02 0.11 0.0663 0.212 B_Naive1 L2
ENSG00000116221 MRPL37 869038 sc-eQTL 1.49e-01 0.142 0.0979 0.212 B_Naive1 L2
ENSG00000157216 SSBP3 639600 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0293 0.0937 0.212 B_Naive1 L2
ENSG00000162402 USP24 -162285 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0428 0.0737 0.212 B_Naive1 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 853043 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0558 0.111 0.212 B_Naive1 L2
ENSG00000243725 TTC4 337218 sc-eQTL 1.70e-01 -0.138 0.1 0.212 B_Naive1 L2
ENSG00000006555 TTC22 251756 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0538 0.11 0.21 B_Naive2 L2
ENSG00000116133 DHCR24 165884 sc-eQTL 1.84e-01 0.127 0.0954 0.21 B_Naive2 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 999495 sc-eQTL 3.86e-01 0.0923 0.106 0.21 B_Naive2 L2
ENSG00000116209 TMEM59 999575 sc-eQTL 9.38e-01 0.00685 0.0875 0.21 B_Naive2 L2
ENSG00000116221 MRPL37 869038 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0598 0.103 0.21 B_Naive2 L2
ENSG00000157216 SSBP3 639600 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0499 0.101 0.21 B_Naive2 L2
ENSG00000162402 USP24 -162285 sc-eQTL 4.26e-01 0.064 0.0803 0.21 B_Naive2 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 853043 sc-eQTL 7.19e-01 0.0407 0.113 0.21 B_Naive2 L2
ENSG00000243725 TTC4 337218 sc-eQTL 9.63e-01 0.00554 0.118 0.21 B_Naive2 L2
ENSG00000006555 TTC22 251756 sc-eQTL 3.93e-01 0.0888 0.104 0.218 CD4_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 999495 sc-eQTL 9.64e-01 0.00484 0.107 0.218 CD4_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 999575 sc-eQTL 2.80e-01 0.105 0.0969 0.218 CD4_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 869038 sc-eQTL 6.22e-01 -0.059 0.119 0.218 CD4_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 639600 sc-eQTL 8.37e-01 0.0152 0.0735 0.218 CD4_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -162285 sc-eQTL 1.11e-01 -0.161 0.1 0.218 CD4_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 337218 sc-eQTL 5.72e-02 -0.214 0.112 0.218 CD4_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 251756 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0141 0.0936 0.212 CD4_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 999495 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0404 0.0712 0.212 CD4_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 999575 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0187 0.0693 0.212 CD4_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 869038 sc-eQTL 2.68e-01 -0.0989 0.089 0.212 CD4_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 639600 sc-eQTL 8.23e-02 0.124 0.0708 0.212 CD4_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -162285 sc-eQTL 5.03e-02 -0.12 0.0609 0.212 CD4_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 337218 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0411 0.0937 0.212 CD4_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 251756 sc-eQTL 6.92e-02 0.18 0.0984 0.212 CD4_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 999495 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0501 0.0964 0.212 CD4_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 999575 sc-eQTL 7.85e-01 0.0199 0.0727 0.212 CD4_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 869038 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0803 0.0914 0.212 CD4_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 639600 sc-eQTL 3.41e-01 0.0854 0.0895 0.212 CD4_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -162285 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0635 0.0742 0.212 CD4_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 337218 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0845 0.107 0.212 CD4_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 251756 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0395 0.114 0.212 CD4_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 999495 sc-eQTL 1.00e-01 -0.177 0.107 0.212 CD4_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 999575 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0148 0.0837 0.212 CD4_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 869038 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0525 0.108 0.212 CD4_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 639600 sc-eQTL 1.39e-01 -0.137 0.0919 0.212 CD4_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -162285 sc-eQTL 1.27e-01 -0.128 0.0836 0.212 CD4_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 337218 sc-eQTL 5.81e-01 0.0615 0.111 0.212 CD4_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 251756 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0342 0.0921 0.212 CD8_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 999495 sc-eQTL 2.36e-01 0.121 0.102 0.212 CD8_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 999575 sc-eQTL 4.46e-02 -0.178 0.0879 0.212 CD8_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 869038 sc-eQTL 2.01e-01 0.134 0.105 0.212 CD8_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 639600 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0247 0.0718 0.212 CD8_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -162285 sc-eQTL 3.13e-01 0.072 0.0713 0.212 CD8_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 337218 sc-eQTL 8.84e-01 0.0156 0.107 0.212 CD8_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 251756 sc-eQTL 7.58e-01 0.0314 0.102 0.212 CD8_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 999495 sc-eQTL 8.89e-01 0.0129 0.0922 0.212 CD8_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 999575 sc-eQTL 5.72e-01 0.051 0.0901 0.212 CD8_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 869038 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00889 0.108 0.212 CD8_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 639600 sc-eQTL 4.88e-01 0.0567 0.0817 0.212 CD8_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -162285 sc-eQTL 7.46e-01 0.0241 0.0744 0.212 CD8_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 337218 sc-eQTL 6.03e-01 0.0566 0.109 0.212 CD8_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 251756 sc-eQTL 2.70e-02 0.249 0.112 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 999495 sc-eQTL 6.61e-01 -0.05 0.114 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 999575 sc-eQTL 3.72e-01 0.0896 0.1 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 869038 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0706 0.114 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 639600 sc-eQTL 3.58e-01 0.0907 0.0985 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -162285 sc-eQTL 7.95e-01 0.0249 0.0957 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 337218 sc-eQTL 4.09e-01 0.0961 0.116 0.211 CD8_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 251756 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0528 0.107 0.212 CD8_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 999495 sc-eQTL 9.50e-01 0.00703 0.112 0.212 CD8_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 999575 sc-eQTL 8.99e-01 0.0138 0.108 0.212 CD8_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 869038 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0439 0.11 0.212 CD8_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 639600 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0418 0.104 0.212 CD8_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -162285 sc-eQTL 1.12e-01 -0.173 0.109 0.212 CD8_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 337218 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0346 0.111 0.212 CD8_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 251756 sc-eQTL 1.40e-02 0.238 0.096 0.212 MAIT L2
ENSG00000116133 DHCR24 165884 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0335 0.0721 0.212 MAIT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 999495 sc-eQTL 5.27e-02 -0.196 0.101 0.212 MAIT L2
ENSG00000116209 TMEM59 999575 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0384 0.0917 0.212 MAIT L2
ENSG00000116221 MRPL37 869038 sc-eQTL 4.76e-01 0.0795 0.111 0.212 MAIT L2
ENSG00000157216 SSBP3 639600 sc-eQTL 2.26e-01 -0.119 0.0984 0.212 MAIT L2
ENSG00000162402 USP24 -162285 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0221 0.0877 0.212 MAIT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 853043 sc-eQTL 3.10e-01 0.104 0.102 0.212 MAIT L2
ENSG00000243725 TTC4 337218 sc-eQTL 5.16e-01 0.0658 0.101 0.212 MAIT L2
ENSG00000006555 TTC22 251756 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0136 0.114 0.209 NK_CD56bright L2
ENSG00000116133 DHCR24 165884 sc-eQTL 3.17e-01 -0.101 0.1 0.209 NK_CD56bright L2
ENSG00000116205 TCEANC2 999495 sc-eQTL 6.66e-01 0.0458 0.106 0.209 NK_CD56bright L2
ENSG00000116209 TMEM59 999575 sc-eQTL 1.67e-01 -0.143 0.103 0.209 NK_CD56bright L2
ENSG00000116221 MRPL37 869038 sc-eQTL 1.99e-01 -0.148 0.115 0.209 NK_CD56bright L2
ENSG00000157216 SSBP3 639600 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0193 0.0872 0.209 NK_CD56bright L2
ENSG00000162398 LEXM 247016 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0826 0.103 0.209 NK_CD56bright L2
ENSG00000162402 USP24 -162285 sc-eQTL 2.27e-01 -0.107 0.0883 0.209 NK_CD56bright L2
ENSG00000243725 TTC4 337218 sc-eQTL 5.40e-02 -0.215 0.111 0.209 NK_CD56bright L2
ENSG00000006555 TTC22 251756 sc-eQTL 3.34e-01 -0.0905 0.0934 0.213 NK_CD56dim L2
ENSG00000116133 DHCR24 165884 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0312 0.0976 0.213 NK_CD56dim L2
ENSG00000116205 TCEANC2 999495 sc-eQTL 3.13e-01 0.107 0.105 0.213 NK_CD56dim L2
ENSG00000116209 TMEM59 999575 sc-eQTL 5.94e-01 0.0418 0.0783 0.213 NK_CD56dim L2
ENSG00000116221 MRPL37 869038 sc-eQTL 4.60e-01 0.0754 0.102 0.213 NK_CD56dim L2
ENSG00000157216 SSBP3 639600 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0261 0.0835 0.213 NK_CD56dim L2
ENSG00000162398 LEXM 247016 sc-eQTL 6.21e-01 0.0475 0.0959 0.213 NK_CD56dim L2
ENSG00000162402 USP24 -162285 sc-eQTL 6.08e-01 0.0313 0.061 0.213 NK_CD56dim L2
ENSG00000243725 TTC4 337218 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0325 0.104 0.213 NK_CD56dim L2
ENSG00000006555 TTC22 251756 sc-eQTL 5.46e-01 0.067 0.111 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000116133 DHCR24 165884 sc-eQTL 3.65e-01 0.0982 0.108 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000116205 TCEANC2 999495 sc-eQTL 4.85e-01 -0.073 0.104 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000116209 TMEM59 999575 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0794 0.104 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000116221 MRPL37 869038 sc-eQTL 3.82e-01 -0.1 0.114 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000157216 SSBP3 639600 sc-eQTL 2.31e-01 0.112 0.093 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000162398 LEXM 247016 sc-eQTL 2.31e-01 0.126 0.105 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000162402 USP24 -162285 sc-eQTL 8.79e-01 0.0117 0.0772 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000243725 TTC4 337218 sc-eQTL 8.59e-02 -0.198 0.114 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000006555 TTC22 251756 sc-eQTL 6.84e-01 0.041 0.101 0.213 NK_cytokine L2
ENSG00000116133 DHCR24 165884 sc-eQTL 3.01e-01 0.105 0.101 0.213 NK_cytokine L2
ENSG00000116205 TCEANC2 999495 sc-eQTL 1.32e-02 0.249 0.0995 0.213 NK_cytokine L2
ENSG00000116209 TMEM59 999575 sc-eQTL 1.65e-01 -0.114 0.0817 0.213 NK_cytokine L2
ENSG00000116221 MRPL37 869038 sc-eQTL 7.51e-01 0.0322 0.101 0.213 NK_cytokine L2
ENSG00000157216 SSBP3 639600 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0278 0.0848 0.213 NK_cytokine L2
ENSG00000162398 LEXM 247016 sc-eQTL 9.70e-01 0.00395 0.106 0.213 NK_cytokine L2
ENSG00000162402 USP24 -162285 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0184 0.0723 0.213 NK_cytokine L2
ENSG00000243725 TTC4 337218 sc-eQTL 1.38e-01 -0.159 0.107 0.213 NK_cytokine L2
ENSG00000006555 TTC22 251756 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0853 0.136 0.222 PB L2
ENSG00000116133 DHCR24 165884 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0842 0.12 0.222 PB L2
ENSG00000116205 TCEANC2 999495 sc-eQTL 6.80e-01 0.0605 0.147 0.222 PB L2
ENSG00000116209 TMEM59 999575 sc-eQTL 1.85e-01 0.0813 0.0609 0.222 PB L2
ENSG00000116221 MRPL37 869038 sc-eQTL 3.58e-01 0.103 0.111 0.222 PB L2
ENSG00000157216 SSBP3 639600 sc-eQTL 4.91e-01 0.0887 0.128 0.222 PB L2
ENSG00000162402 USP24 -162285 sc-eQTL 9.86e-02 0.241 0.144 0.222 PB L2
ENSG00000215883 CYB5RL 853043 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0727 0.151 0.222 PB L2
ENSG00000243725 TTC4 337218 sc-eQTL 6.15e-02 -0.263 0.139 0.222 PB L2
ENSG00000006555 TTC22 251756 sc-eQTL 1.77e-01 0.139 0.103 0.211 Pro_T L2
ENSG00000116133 DHCR24 165884 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0229 0.0876 0.211 Pro_T L2
ENSG00000116205 TCEANC2 999495 sc-eQTL 2.39e-01 0.126 0.107 0.211 Pro_T L2
ENSG00000116209 TMEM59 999575 sc-eQTL 3.35e-01 -0.0715 0.0741 0.211 Pro_T L2
ENSG00000116221 MRPL37 869038 sc-eQTL 5.68e-01 0.0416 0.0726 0.211 Pro_T L2
ENSG00000157216 SSBP3 639600 sc-eQTL 8.33e-01 0.0172 0.0815 0.211 Pro_T L2
ENSG00000162402 USP24 -162285 sc-eQTL 2.91e-01 0.105 0.0992 0.211 Pro_T L2
ENSG00000215883 CYB5RL 853043 sc-eQTL 2.72e-01 -0.108 0.0979 0.211 Pro_T L2
ENSG00000243725 TTC4 337218 sc-eQTL 2.61e-01 0.123 0.109 0.211 Pro_T L2
ENSG00000006555 TTC22 251756 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000613 0.1 0.212 Treg L2
ENSG00000116205 TCEANC2 999495 sc-eQTL 9.29e-01 -0.00962 0.107 0.212 Treg L2
ENSG00000116209 TMEM59 999575 sc-eQTL 5.48e-01 -0.051 0.0847 0.212 Treg L2
ENSG00000116221 MRPL37 869038 sc-eQTL 4.54e-01 0.0787 0.105 0.212 Treg L2
ENSG00000157216 SSBP3 639600 sc-eQTL 8.56e-01 -0.017 0.0936 0.212 Treg L2
ENSG00000162402 USP24 -162285 sc-eQTL 2.82e-01 -0.0959 0.089 0.212 Treg L2
ENSG00000243725 TTC4 337218 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0416 0.112 0.212 Treg L2
ENSG00000116133 DHCR24 165884 sc-eQTL 1.36e-01 -0.143 0.0953 0.195 cDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 999495 sc-eQTL 1.66e-01 0.156 0.112 0.195 cDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 999575 sc-eQTL 2.79e-01 0.104 0.0957 0.195 cDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 869038 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0439 0.123 0.195 cDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 639600 sc-eQTL 7.98e-01 0.029 0.113 0.195 cDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 510822 sc-eQTL 4.34e-01 0.0824 0.105 0.195 cDC L2
ENSG00000162402 USP24 -162285 sc-eQTL 2.15e-01 0.146 0.118 0.195 cDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 853043 sc-eQTL 1.01e-01 -0.166 0.101 0.195 cDC L2
ENSG00000243725 TTC4 337218 sc-eQTL 5.14e-01 0.0791 0.121 0.195 cDC L2
ENSG00000116133 DHCR24 165884 sc-eQTL 4.57e-01 0.0491 0.0659 0.212 cMono_IL1B L2
ENSG00000116205 TCEANC2 999495 sc-eQTL 8.59e-01 0.0163 0.0917 0.212 cMono_IL1B L2
ENSG00000116209 TMEM59 999575 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000186 0.0556 0.212 cMono_IL1B L2
ENSG00000116221 MRPL37 869038 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0184 0.0991 0.212 cMono_IL1B L2
ENSG00000157216 SSBP3 639600 sc-eQTL 3.44e-02 -0.213 0.1 0.212 cMono_IL1B L2
ENSG00000162402 USP24 -162285 sc-eQTL 9.13e-01 -0.00816 0.0747 0.212 cMono_IL1B L2
ENSG00000243725 TTC4 337218 sc-eQTL 7.42e-01 0.0376 0.114 0.212 cMono_IL1B L2
ENSG00000116133 DHCR24 165884 sc-eQTL 4.19e-01 0.0494 0.0611 0.212 cMono_S100A L2
ENSG00000116205 TCEANC2 999495 sc-eQTL 5.83e-01 0.0513 0.0932 0.212 cMono_S100A L2
ENSG00000116209 TMEM59 999575 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000549 0.0747 0.212 cMono_S100A L2
ENSG00000116221 MRPL37 869038 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0259 0.108 0.212 cMono_S100A L2
ENSG00000157216 SSBP3 639600 sc-eQTL 1.23e-01 -0.172 0.111 0.212 cMono_S100A L2
ENSG00000162402 USP24 -162285 sc-eQTL 2.47e-01 -0.105 0.0904 0.212 cMono_S100A L2
ENSG00000243725 TTC4 337218 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0241 0.114 0.212 cMono_S100A L2
ENSG00000006555 TTC22 251756 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0459 0.103 0.209 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 165884 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0537 0.115 0.209 gdT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 999495 sc-eQTL 3.66e-01 0.105 0.116 0.209 gdT L2
ENSG00000116209 TMEM59 999575 sc-eQTL 1.27e-01 -0.179 0.117 0.209 gdT L2
ENSG00000116221 MRPL37 869038 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00328 0.135 0.209 gdT L2
ENSG00000157216 SSBP3 639600 sc-eQTL 4.05e-01 0.0688 0.0823 0.209 gdT L2
ENSG00000162402 USP24 -162285 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0408 0.111 0.209 gdT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 853043 sc-eQTL 5.25e-01 0.0733 0.115 0.209 gdT L2
ENSG00000243725 TTC4 337218 sc-eQTL 1.28e-01 0.197 0.129 0.209 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 165884 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0358 0.0844 0.211 intMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 999495 sc-eQTL 1.18e-01 0.164 0.105 0.211 intMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 999575 sc-eQTL 4.49e-01 0.0585 0.0772 0.211 intMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 869038 sc-eQTL 8.13e-01 -0.028 0.118 0.211 intMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 639600 sc-eQTL 2.21e-01 -0.148 0.12 0.211 intMono L2
ENSG00000162402 USP24 -162285 sc-eQTL 3.30e-01 -0.105 0.107 0.211 intMono L2
ENSG00000243725 TTC4 337218 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0877 0.114 0.211 intMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 165884 sc-eQTL 9.13e-02 -0.14 0.0825 0.208 ncMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 999495 sc-eQTL 8.23e-01 0.0233 0.104 0.208 ncMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 999575 sc-eQTL 4.58e-02 -0.165 0.0823 0.208 ncMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 869038 sc-eQTL 1.84e-01 0.142 0.107 0.208 ncMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 639600 sc-eQTL 1.99e-01 -0.15 0.117 0.208 ncMono L2
ENSG00000162402 USP24 -162285 sc-eQTL 7.88e-01 0.0253 0.0937 0.208 ncMono L2
ENSG00000243725 TTC4 337218 sc-eQTL 4.16e-01 0.0902 0.111 0.208 ncMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 165884 sc-eQTL 1.03e-01 0.166 0.101 0.203 pDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 999495 sc-eQTL 2.90e-01 -0.13 0.122 0.203 pDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 999575 sc-eQTL 8.63e-02 0.167 0.0968 0.203 pDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 869038 sc-eQTL 6.84e-01 0.0529 0.13 0.203 pDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 639600 sc-eQTL 2.20e-01 -0.141 0.115 0.203 pDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 510822 sc-eQTL 4.80e-01 0.0343 0.0484 0.203 pDC L2
ENSG00000162402 USP24 -162285 sc-eQTL 1.66e-01 -0.113 0.0814 0.203 pDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 853043 sc-eQTL 2.36e-01 -0.133 0.111 0.203 pDC L2
ENSG00000243725 TTC4 337218 sc-eQTL 8.58e-01 0.0231 0.129 0.203 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 251756 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0837 0.107 0.212 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 165884 sc-eQTL 2.12e-01 -0.134 0.107 0.212 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 999495 sc-eQTL 1.28e-01 0.158 0.103 0.212 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 999575 sc-eQTL 6.12e-01 0.041 0.0808 0.212 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 869038 sc-eQTL 8.15e-01 0.0227 0.0968 0.212 B_Memory LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 639600 sc-eQTL 5.66e-01 0.0484 0.0841 0.212 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -162285 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0178 0.0768 0.212 B_Memory LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 853043 sc-eQTL 7.18e-01 0.0426 0.118 0.212 B_Memory LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 337218 sc-eQTL 6.05e-01 0.0548 0.106 0.212 B_Memory LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 251756 sc-eQTL 2.67e-01 -0.123 0.11 0.212 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 165884 sc-eQTL 3.78e-02 0.206 0.0988 0.212 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 999495 sc-eQTL 1.87e-01 0.119 0.0898 0.212 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 999575 sc-eQTL 5.58e-01 0.0375 0.064 0.212 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 869038 sc-eQTL 3.28e-01 0.0901 0.0919 0.212 B_Naive LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 639600 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0705 0.0822 0.212 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -162285 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0246 0.0707 0.212 B_Naive LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 853043 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0368 0.112 0.212 B_Naive LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 337218 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0551 0.105 0.212 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 165884 sc-eQTL 5.13e-01 0.0416 0.0635 0.212 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 999495 sc-eQTL 6.88e-01 0.032 0.0795 0.212 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 999575 sc-eQTL 8.12e-01 0.0131 0.0549 0.212 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 869038 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0128 0.0972 0.212 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 639600 sc-eQTL 3.84e-02 -0.21 0.101 0.212 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -162285 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0542 0.0694 0.212 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 337218 sc-eQTL 7.99e-01 0.0293 0.115 0.212 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 165884 sc-eQTL 3.12e-01 -0.0788 0.0777 0.211 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 999495 sc-eQTL 3.84e-01 0.0891 0.102 0.211 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 999575 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0331 0.0761 0.211 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 869038 sc-eQTL 7.23e-01 0.037 0.104 0.211 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 639600 sc-eQTL 1.32e-01 -0.167 0.111 0.211 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -162285 sc-eQTL 9.01e-01 0.0109 0.0877 0.211 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 337218 sc-eQTL 9.82e-01 0.00252 0.11 0.211 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 251756 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0115 0.091 0.213 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 165884 sc-eQTL 6.14e-01 0.048 0.095 0.213 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 999495 sc-eQTL 9.24e-02 0.156 0.0926 0.213 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 999575 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0353 0.0721 0.213 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 869038 sc-eQTL 5.31e-01 0.0605 0.0965 0.213 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 639600 sc-eQTL 8.35e-01 0.0165 0.0792 0.213 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162398 LEXM 247016 sc-eQTL 8.58e-01 0.016 0.0893 0.213 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -162285 sc-eQTL 9.12e-01 0.00625 0.0566 0.213 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 337218 sc-eQTL 2.38e-01 -0.119 0.1 0.213 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000162398 LEXM 247016 eQTL 0.00172 -0.0732 0.0233 0.00128 0.0 0.24
ENSG00000169174 PCSK9 13531 pQTL 0.00925 0.083 0.0318 0.0 0.0 0.224
ENSG00000169174 PCSK9 13531 eQTL 0.0172 0.0455 0.0191 0.0 0.0 0.24
ENSG00000234810 AL603840.1 -276209 eQTL 0.000141 0.133 0.0349 0.0 0.0 0.24

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000116205 \N 999495 2.69e-07 1.3e-07 3.62e-08 1.82e-07 8.83e-08 9.65e-08 1.49e-07 5.33e-08 1.44e-07 4.57e-08 1.62e-07 8.36e-08 1.33e-07 6.38e-08 6e-08 7.17e-08 3.9e-08 1.21e-07 5.36e-08 4.03e-08 1.08e-07 1.23e-07 1.39e-07 3.79e-08 1.37e-07 1.14e-07 1.11e-07 9.15e-08 1.05e-07 1.1e-07 9.64e-08 3.96e-08 3.3e-08 8.65e-08 8.98e-08 3.96e-08 5.06e-08 9.22e-08 6.78e-08 3.77e-08 4.35e-08 1.36e-07 4.89e-08 1.18e-08 5.75e-08 1.67e-08 1.23e-07 3.92e-09 4.9e-08
ENSG00000169174 PCSK9 13531 3.12e-05 3.07e-05 4.84e-06 1.47e-05 4.75e-06 1.34e-05 3.84e-05 3.93e-06 2.72e-05 1.27e-05 3.38e-05 1.48e-05 4.46e-05 1.17e-05 5.98e-06 1.42e-05 1.53e-05 2.21e-05 7.14e-06 5.62e-06 1.21e-05 2.74e-05 2.73e-05 7.57e-06 3.87e-05 6.66e-06 1.06e-05 1.04e-05 2.71e-05 2.14e-05 1.83e-05 1.61e-06 2.29e-06 5.74e-06 1.03e-05 4.68e-06 2.73e-06 2.99e-06 4e-06 2.93e-06 1.67e-06 3.42e-05 2.98e-06 3.24e-07 2.12e-06 3.23e-06 3.67e-06 1.5e-06 1.32e-06
ENSG00000184313 \N 411325 1.05e-06 8.33e-07 8.83e-08 4.39e-07 1.13e-07 2.67e-07 6.54e-07 1.37e-07 5.88e-07 2.57e-07 1.03e-06 4.62e-07 9.37e-07 1.48e-07 2.44e-07 2.23e-07 4.29e-07 4.22e-07 2.17e-07 1.24e-07 2.52e-07 4.31e-07 4.4e-07 1.76e-07 1.13e-06 2.4e-07 2.62e-07 2.24e-07 4.39e-07 6.98e-07 3.68e-07 7.69e-08 4.42e-08 1.36e-07 3.31e-07 8.75e-08 1.1e-07 7.93e-08 6.49e-08 2.83e-08 5.38e-08 9.14e-07 5.98e-08 1.04e-08 1.23e-07 1.81e-08 9.46e-08 1.11e-08 5.76e-08
ENSG00000234810 AL603840.1 -276209 1.27e-06 1.36e-06 3.03e-07 1.17e-06 2.33e-07 5.95e-07 1.48e-06 3.34e-07 1.52e-06 4.31e-07 2.01e-06 7.82e-07 2.31e-06 3.03e-07 5.73e-07 8.25e-07 8.89e-07 6.85e-07 6.68e-07 6.11e-07 6.36e-07 1.56e-06 8.95e-07 6.31e-07 2.16e-06 3.91e-07 7.66e-07 6.83e-07 1.43e-06 1.31e-06 7.41e-07 4.91e-08 2.31e-07 5.28e-07 6.22e-07 4.34e-07 4e-07 1.46e-07 3.34e-07 2.51e-07 2.36e-07 1.77e-06 1.41e-07 3.38e-08 1.85e-07 7.36e-08 1.91e-07 8.66e-08 8.28e-08