Genes within 1Mb (chr1:55044342:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 243019 sc-eQTL 8.35e-01 0.0301 0.144 0.094 B L1
ENSG00000116133 DHCR24 157147 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0374 0.136 0.094 B L1
ENSG00000116205 TCEANC2 990758 sc-eQTL 9.40e-01 0.00888 0.117 0.094 B L1
ENSG00000116209 TMEM59 990838 sc-eQTL 3.73e-01 0.0638 0.0714 0.094 B L1
ENSG00000116221 MRPL37 860301 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0403 0.0936 0.094 B L1
ENSG00000157216 SSBP3 630863 sc-eQTL 1.22e-01 0.151 0.0975 0.094 B L1
ENSG00000162402 USP24 -171022 sc-eQTL 2.68e-01 -0.092 0.0828 0.094 B L1
ENSG00000215883 CYB5RL 844306 sc-eQTL 2.47e-02 -0.358 0.158 0.094 B L1
ENSG00000243725 TTC4 328481 sc-eQTL 2.87e-01 0.148 0.139 0.094 B L1
ENSG00000006555 TTC22 243019 sc-eQTL 8.74e-02 0.191 0.111 0.094 CD4T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 990758 sc-eQTL 3.23e-01 -0.0906 0.0914 0.094 CD4T L1
ENSG00000116209 TMEM59 990838 sc-eQTL 7.78e-01 -0.024 0.0853 0.094 CD4T L1
ENSG00000116221 MRPL37 860301 sc-eQTL 4.03e-02 0.241 0.117 0.094 CD4T L1
ENSG00000157216 SSBP3 630863 sc-eQTL 1.14e-01 0.154 0.0974 0.094 CD4T L1
ENSG00000162402 USP24 -171022 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0202 0.0798 0.094 CD4T L1
ENSG00000243725 TTC4 328481 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0835 0.12 0.094 CD4T L1
ENSG00000006555 TTC22 243019 sc-eQTL 6.21e-01 0.0484 0.0978 0.094 CD8T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 990758 sc-eQTL 6.98e-01 0.0474 0.122 0.094 CD8T L1
ENSG00000116209 TMEM59 990838 sc-eQTL 8.32e-01 0.018 0.0846 0.094 CD8T L1
ENSG00000116221 MRPL37 860301 sc-eQTL 1.58e-02 0.28 0.115 0.094 CD8T L1
ENSG00000157216 SSBP3 630863 sc-eQTL 1.76e-01 0.113 0.0834 0.094 CD8T L1
ENSG00000162402 USP24 -171022 sc-eQTL 1.89e-01 -0.106 0.0806 0.094 CD8T L1
ENSG00000243725 TTC4 328481 sc-eQTL 2.73e-01 0.154 0.14 0.094 CD8T L1
ENSG00000116133 DHCR24 157147 sc-eQTL 6.47e-01 0.0595 0.13 0.095 DC L1
ENSG00000116205 TCEANC2 990758 sc-eQTL 3.62e-01 -0.133 0.145 0.095 DC L1
ENSG00000116209 TMEM59 990838 sc-eQTL 2.57e-01 -0.13 0.114 0.095 DC L1
ENSG00000116221 MRPL37 860301 sc-eQTL 3.77e-01 -0.136 0.153 0.095 DC L1
ENSG00000157216 SSBP3 630863 sc-eQTL 3.55e-01 0.127 0.137 0.095 DC L1
ENSG00000162390 ACOT11 502085 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0627 0.132 0.095 DC L1
ENSG00000162402 USP24 -171022 sc-eQTL 1.96e-01 0.103 0.0792 0.095 DC L1
ENSG00000215883 CYB5RL 844306 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0292 0.144 0.095 DC L1
ENSG00000243725 TTC4 328481 sc-eQTL 3.47e-01 -0.145 0.154 0.095 DC L1
ENSG00000116133 DHCR24 157147 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0749 0.0937 0.094 Mono L1
ENSG00000116205 TCEANC2 990758 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0875 0.101 0.094 Mono L1
ENSG00000116209 TMEM59 990838 sc-eQTL 6.13e-01 0.0381 0.0751 0.094 Mono L1
ENSG00000116221 MRPL37 860301 sc-eQTL 1.09e-01 0.201 0.125 0.094 Mono L1
ENSG00000157216 SSBP3 630863 sc-eQTL 3.36e-01 0.139 0.144 0.094 Mono L1
ENSG00000162402 USP24 -171022 sc-eQTL 2.88e-01 -0.0911 0.0856 0.094 Mono L1
ENSG00000243725 TTC4 328481 sc-eQTL 7.27e-01 0.0528 0.151 0.094 Mono L1
ENSG00000006555 TTC22 243019 sc-eQTL 1.66e-01 -0.178 0.128 0.094 NK L1
ENSG00000116133 DHCR24 157147 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00961 0.13 0.094 NK L1
ENSG00000116205 TCEANC2 990758 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0372 0.128 0.094 NK L1
ENSG00000116209 TMEM59 990838 sc-eQTL 8.65e-01 0.017 0.1 0.094 NK L1
ENSG00000116221 MRPL37 860301 sc-eQTL 9.34e-01 -0.0103 0.125 0.094 NK L1
ENSG00000157216 SSBP3 630863 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0226 0.108 0.094 NK L1
ENSG00000162398 LEXM 238279 sc-eQTL 1.69e-01 0.167 0.121 0.094 NK L1
ENSG00000162402 USP24 -171022 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0388 0.0736 0.094 NK L1
ENSG00000243725 TTC4 328481 sc-eQTL 9.78e-01 0.00391 0.139 0.094 NK L1
ENSG00000006555 TTC22 243019 sc-eQTL 5.82e-01 0.0641 0.116 0.094 Other_T L1
ENSG00000116133 DHCR24 157147 sc-eQTL 8.48e-02 0.155 0.0895 0.094 Other_T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 990758 sc-eQTL 3.07e-01 -0.138 0.135 0.094 Other_T L1
ENSG00000116209 TMEM59 990838 sc-eQTL 7.88e-01 0.0249 0.0926 0.094 Other_T L1
ENSG00000116221 MRPL37 860301 sc-eQTL 3.53e-01 0.0806 0.0866 0.094 Other_T L1
ENSG00000157216 SSBP3 630863 sc-eQTL 1.52e-01 0.144 0.0998 0.094 Other_T L1
ENSG00000162402 USP24 -171022 sc-eQTL 6.67e-01 0.046 0.107 0.094 Other_T L1
ENSG00000215883 CYB5RL 844306 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0764 0.146 0.094 Other_T L1
ENSG00000243725 TTC4 328481 sc-eQTL 3.58e-01 -0.134 0.145 0.094 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 243019 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0579 0.119 0.099 B_Activated L2
ENSG00000116133 DHCR24 157147 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0848 0.14 0.099 B_Activated L2
ENSG00000116205 TCEANC2 990758 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0856 0.15 0.099 B_Activated L2
ENSG00000116209 TMEM59 990838 sc-eQTL 5.10e-01 0.106 0.16 0.099 B_Activated L2
ENSG00000116221 MRPL37 860301 sc-eQTL 4.24e-01 0.138 0.172 0.099 B_Activated L2
ENSG00000157216 SSBP3 630863 sc-eQTL 5.85e-01 0.0856 0.156 0.099 B_Activated L2
ENSG00000162402 USP24 -171022 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0702 0.153 0.099 B_Activated L2
ENSG00000215883 CYB5RL 844306 sc-eQTL 8.88e-01 -0.019 0.135 0.099 B_Activated L2
ENSG00000243725 TTC4 328481 sc-eQTL 4.16e-01 -0.119 0.146 0.099 B_Activated L2
ENSG00000006555 TTC22 243019 sc-eQTL 3.15e-01 0.154 0.153 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000116133 DHCR24 157147 sc-eQTL 9.30e-02 -0.239 0.142 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000116205 TCEANC2 990758 sc-eQTL 7.65e-01 0.0425 0.142 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000116209 TMEM59 990838 sc-eQTL 7.65e-01 0.0364 0.121 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000116221 MRPL37 860301 sc-eQTL 3.58e-01 -0.131 0.143 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000157216 SSBP3 630863 sc-eQTL 8.47e-01 0.0257 0.134 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000162402 USP24 -171022 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0231 0.112 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000215883 CYB5RL 844306 sc-eQTL 3.51e-01 0.149 0.159 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000243725 TTC4 328481 sc-eQTL 5.69e-01 0.0825 0.145 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000006555 TTC22 243019 sc-eQTL 1.69e-01 0.202 0.147 0.095 B_Memory L2
ENSG00000116133 DHCR24 157147 sc-eQTL 5.32e-01 0.0915 0.146 0.095 B_Memory L2
ENSG00000116205 TCEANC2 990758 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0143 0.156 0.095 B_Memory L2
ENSG00000116209 TMEM59 990838 sc-eQTL 5.30e-01 -0.082 0.13 0.095 B_Memory L2
ENSG00000116221 MRPL37 860301 sc-eQTL 8.05e-01 0.0326 0.132 0.095 B_Memory L2
ENSG00000157216 SSBP3 630863 sc-eQTL 1.19e-01 0.192 0.123 0.095 B_Memory L2
ENSG00000162402 USP24 -171022 sc-eQTL 5.47e-01 0.0728 0.12 0.095 B_Memory L2
ENSG00000215883 CYB5RL 844306 sc-eQTL 1.09e-01 -0.238 0.148 0.095 B_Memory L2
ENSG00000243725 TTC4 328481 sc-eQTL 9.43e-01 -0.011 0.155 0.095 B_Memory L2
ENSG00000006555 TTC22 243019 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0353 0.152 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000116133 DHCR24 157147 sc-eQTL 6.83e-01 0.0583 0.142 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 990758 sc-eQTL 6.40e-01 0.0596 0.127 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000116209 TMEM59 990838 sc-eQTL 4.93e-01 0.0634 0.0923 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000116221 MRPL37 860301 sc-eQTL 7.31e-01 0.0468 0.136 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000157216 SSBP3 630863 sc-eQTL 3.11e-01 0.131 0.129 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000162402 USP24 -171022 sc-eQTL 2.18e-01 -0.126 0.102 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 844306 sc-eQTL 6.34e-02 -0.285 0.153 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000243725 TTC4 328481 sc-eQTL 3.14e-01 0.14 0.139 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000006555 TTC22 243019 sc-eQTL 5.72e-01 0.0868 0.153 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000116133 DHCR24 157147 sc-eQTL 4.95e-01 0.0911 0.133 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 990758 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00528 0.148 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000116209 TMEM59 990838 sc-eQTL 6.38e-02 0.226 0.121 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000116221 MRPL37 860301 sc-eQTL 2.93e-01 -0.151 0.143 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000157216 SSBP3 630863 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0552 0.141 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000162402 USP24 -171022 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0779 0.112 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 844306 sc-eQTL 2.20e-01 -0.194 0.157 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000243725 TTC4 328481 sc-eQTL 4.03e-01 0.137 0.164 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000006555 TTC22 243019 sc-eQTL 1.65e-01 0.199 0.143 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 990758 sc-eQTL 2.57e-01 0.168 0.147 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 990838 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0862 0.134 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 860301 sc-eQTL 2.94e-01 0.174 0.165 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 630863 sc-eQTL 6.56e-01 0.0453 0.102 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -171022 sc-eQTL 3.65e-01 0.126 0.139 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 328481 sc-eQTL 7.57e-01 0.0483 0.156 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 243019 sc-eQTL 2.15e-01 0.162 0.131 0.094 CD4_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 990758 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000669 0.0998 0.094 CD4_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 990838 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0625 0.097 0.094 CD4_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 860301 sc-eQTL 4.50e-02 0.25 0.124 0.094 CD4_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 630863 sc-eQTL 6.21e-01 0.0495 0.0998 0.094 CD4_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -171022 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0357 0.0861 0.094 CD4_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 328481 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0782 0.131 0.094 CD4_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 243019 sc-eQTL 1.17e-01 0.219 0.139 0.094 CD4_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 990758 sc-eQTL 2.21e-01 -0.166 0.136 0.094 CD4_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 990838 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00887 0.103 0.094 CD4_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 860301 sc-eQTL 3.59e-01 0.118 0.129 0.094 CD4_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 630863 sc-eQTL 1.02e-01 0.207 0.126 0.094 CD4_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -171022 sc-eQTL 1.26e-01 -0.16 0.104 0.094 CD4_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 328481 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00382 0.151 0.094 CD4_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 243019 sc-eQTL 6.13e-01 0.0808 0.159 0.094 CD4_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 990758 sc-eQTL 8.59e-01 0.0269 0.151 0.094 CD4_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 990838 sc-eQTL 8.73e-01 0.0187 0.117 0.094 CD4_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 860301 sc-eQTL 2.12e-01 0.188 0.15 0.094 CD4_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 630863 sc-eQTL 1.78e-01 0.174 0.129 0.094 CD4_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -171022 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0351 0.117 0.094 CD4_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 328481 sc-eQTL 1.72e-01 0.212 0.155 0.094 CD4_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 243019 sc-eQTL 5.33e-01 0.0802 0.128 0.094 CD8_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 990758 sc-eQTL 3.60e-01 -0.13 0.142 0.094 CD8_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 990838 sc-eQTL 5.41e-01 0.0758 0.124 0.094 CD8_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 860301 sc-eQTL 1.25e-01 0.224 0.146 0.094 CD8_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 630863 sc-eQTL 3.77e-01 0.0886 0.1 0.094 CD8_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -171022 sc-eQTL 1.64e-01 -0.138 0.0992 0.094 CD8_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 328481 sc-eQTL 3.86e-01 0.129 0.149 0.094 CD8_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 243019 sc-eQTL 2.60e-01 -0.16 0.142 0.094 CD8_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 990758 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0818 0.129 0.094 CD8_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 990838 sc-eQTL 8.60e-01 0.0222 0.126 0.094 CD8_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 860301 sc-eQTL 1.90e-01 0.198 0.151 0.094 CD8_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 630863 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0264 0.114 0.094 CD8_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -171022 sc-eQTL 2.08e-01 -0.131 0.104 0.094 CD8_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 328481 sc-eQTL 4.54e-01 0.114 0.152 0.094 CD8_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 243019 sc-eQTL 3.41e-01 -0.158 0.165 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 990758 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0994 0.166 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 990838 sc-eQTL 8.86e-01 0.0209 0.146 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 860301 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00327 0.166 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 630863 sc-eQTL 7.87e-01 0.0389 0.144 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -171022 sc-eQTL 8.40e-01 0.0283 0.14 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 328481 sc-eQTL 2.82e-01 -0.183 0.169 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 243019 sc-eQTL 6.43e-02 0.281 0.151 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 990758 sc-eQTL 1.45e-01 0.231 0.158 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 990838 sc-eQTL 4.29e-01 -0.122 0.153 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 860301 sc-eQTL 1.00e+00 -3.2e-05 0.156 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 630863 sc-eQTL 1.69e-01 0.203 0.147 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -171022 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0165 0.155 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 328481 sc-eQTL 3.11e-01 0.16 0.157 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 243019 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00377 0.139 0.093 MAIT L2
ENSG00000116133 DHCR24 157147 sc-eQTL 3.85e-01 0.0896 0.103 0.093 MAIT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 990758 sc-eQTL 2.10e-01 -0.182 0.145 0.093 MAIT L2
ENSG00000116209 TMEM59 990838 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00326 0.131 0.093 MAIT L2
ENSG00000116221 MRPL37 860301 sc-eQTL 9.90e-01 0.00194 0.16 0.093 MAIT L2
ENSG00000157216 SSBP3 630863 sc-eQTL 1.22e-01 0.218 0.141 0.093 MAIT L2
ENSG00000162402 USP24 -171022 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0609 0.126 0.093 MAIT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 844306 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0794 0.146 0.093 MAIT L2
ENSG00000243725 TTC4 328481 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0878 0.145 0.093 MAIT L2
ENSG00000006555 TTC22 243019 sc-eQTL 9.95e-01 0.000968 0.156 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000116133 DHCR24 157147 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0817 0.138 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000116205 TCEANC2 990758 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0806 0.145 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000116209 TMEM59 990838 sc-eQTL 3.65e-01 0.129 0.142 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000116221 MRPL37 860301 sc-eQTL 6.83e-01 0.0649 0.159 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000157216 SSBP3 630863 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0414 0.119 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000162398 LEXM 238279 sc-eQTL 1.18e-01 0.22 0.14 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000162402 USP24 -171022 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0507 0.121 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000243725 TTC4 328481 sc-eQTL 6.50e-01 0.0696 0.153 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000006555 TTC22 243019 sc-eQTL 2.42e-01 -0.153 0.13 0.095 NK_CD56dim L2
ENSG00000116133 DHCR24 157147 sc-eQTL 5.71e-01 0.0772 0.136 0.095 NK_CD56dim L2
ENSG00000116205 TCEANC2 990758 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0595 0.147 0.095 NK_CD56dim L2
ENSG00000116209 TMEM59 990838 sc-eQTL 7.83e-01 0.0302 0.109 0.095 NK_CD56dim L2
ENSG00000116221 MRPL37 860301 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0297 0.142 0.095 NK_CD56dim L2
ENSG00000157216 SSBP3 630863 sc-eQTL 9.78e-01 0.00318 0.116 0.095 NK_CD56dim L2
ENSG00000162398 LEXM 238279 sc-eQTL 3.24e-01 0.132 0.133 0.095 NK_CD56dim L2
ENSG00000162402 USP24 -171022 sc-eQTL 2.13e-01 -0.106 0.0847 0.095 NK_CD56dim L2
ENSG00000243725 TTC4 328481 sc-eQTL 5.97e-01 -0.077 0.145 0.095 NK_CD56dim L2
ENSG00000006555 TTC22 243019 sc-eQTL 9.18e-01 -0.016 0.156 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000116133 DHCR24 157147 sc-eQTL 5.06e-01 0.101 0.152 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000116205 TCEANC2 990758 sc-eQTL 3.06e-01 0.15 0.146 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000116209 TMEM59 990838 sc-eQTL 3.41e-01 -0.139 0.145 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000116221 MRPL37 860301 sc-eQTL 7.16e-02 0.288 0.159 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000157216 SSBP3 630863 sc-eQTL 2.84e-01 0.14 0.131 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000162398 LEXM 238279 sc-eQTL 3.11e-01 0.149 0.147 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000162402 USP24 -171022 sc-eQTL 8.28e-01 0.0235 0.108 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000243725 TTC4 328481 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0798 0.162 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000006555 TTC22 243019 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0529 0.139 0.095 NK_cytokine L2
ENSG00000116133 DHCR24 157147 sc-eQTL 7.70e-01 0.0411 0.141 0.095 NK_cytokine L2
ENSG00000116205 TCEANC2 990758 sc-eQTL 5.02e-01 0.0938 0.139 0.095 NK_cytokine L2
ENSG00000116209 TMEM59 990838 sc-eQTL 3.21e-01 -0.113 0.113 0.095 NK_cytokine L2
ENSG00000116221 MRPL37 860301 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0851 0.14 0.095 NK_cytokine L2
ENSG00000157216 SSBP3 630863 sc-eQTL 8.43e-01 0.0232 0.117 0.095 NK_cytokine L2
ENSG00000162398 LEXM 238279 sc-eQTL 7.53e-01 0.0461 0.147 0.095 NK_cytokine L2
ENSG00000162402 USP24 -171022 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0227 0.0999 0.095 NK_cytokine L2
ENSG00000243725 TTC4 328481 sc-eQTL 9.43e-01 0.0107 0.148 0.095 NK_cytokine L2
ENSG00000006555 TTC22 243019 sc-eQTL 9.25e-01 0.0166 0.176 0.096 PB L2
ENSG00000116133 DHCR24 157147 sc-eQTL 6.61e-01 0.0684 0.156 0.096 PB L2
ENSG00000116205 TCEANC2 990758 sc-eQTL 3.65e-01 0.172 0.189 0.096 PB L2
ENSG00000116209 TMEM59 990838 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00381 0.0793 0.096 PB L2
ENSG00000116221 MRPL37 860301 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0708 0.144 0.096 PB L2
ENSG00000157216 SSBP3 630863 sc-eQTL 4.42e-01 0.128 0.166 0.096 PB L2
ENSG00000162402 USP24 -171022 sc-eQTL 5.14e-01 0.123 0.189 0.096 PB L2
ENSG00000215883 CYB5RL 844306 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0689 0.196 0.096 PB L2
ENSG00000243725 TTC4 328481 sc-eQTL 7.62e-01 0.0555 0.183 0.096 PB L2
ENSG00000006555 TTC22 243019 sc-eQTL 9.27e-01 -0.013 0.141 0.096 Pro_T L2
ENSG00000116133 DHCR24 157147 sc-eQTL 1.16e-01 0.189 0.12 0.096 Pro_T L2
ENSG00000116205 TCEANC2 990758 sc-eQTL 9.36e-01 0.0119 0.147 0.096 Pro_T L2
ENSG00000116209 TMEM59 990838 sc-eQTL 4.20e-01 0.0822 0.102 0.096 Pro_T L2
ENSG00000116221 MRPL37 860301 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0181 0.0997 0.096 Pro_T L2
ENSG00000157216 SSBP3 630863 sc-eQTL 1.60e-01 0.157 0.111 0.096 Pro_T L2
ENSG00000162402 USP24 -171022 sc-eQTL 2.37e-01 0.161 0.136 0.096 Pro_T L2
ENSG00000215883 CYB5RL 844306 sc-eQTL 8.94e-02 0.228 0.134 0.096 Pro_T L2
ENSG00000243725 TTC4 328481 sc-eQTL 2.32e-01 -0.179 0.149 0.096 Pro_T L2
ENSG00000006555 TTC22 243019 sc-eQTL 7.57e-01 0.0439 0.142 0.094 Treg L2
ENSG00000116205 TCEANC2 990758 sc-eQTL 3.77e-01 -0.134 0.152 0.094 Treg L2
ENSG00000116209 TMEM59 990838 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0658 0.12 0.094 Treg L2
ENSG00000116221 MRPL37 860301 sc-eQTL 3.99e-01 0.126 0.149 0.094 Treg L2
ENSG00000157216 SSBP3 630863 sc-eQTL 8.12e-01 0.0317 0.133 0.094 Treg L2
ENSG00000162402 USP24 -171022 sc-eQTL 3.96e-01 -0.107 0.126 0.094 Treg L2
ENSG00000243725 TTC4 328481 sc-eQTL 5.19e-02 -0.309 0.158 0.094 Treg L2
ENSG00000116133 DHCR24 157147 sc-eQTL 8.38e-01 0.0262 0.128 0.098 cDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 990758 sc-eQTL 4.35e-01 -0.118 0.15 0.098 cDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 990838 sc-eQTL 2.76e-01 -0.14 0.128 0.098 cDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 860301 sc-eQTL 4.61e-02 -0.325 0.162 0.098 cDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 630863 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0645 0.151 0.098 cDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 502085 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0621 0.14 0.098 cDC L2
ENSG00000162402 USP24 -171022 sc-eQTL 3.12e-01 0.159 0.157 0.098 cDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 844306 sc-eQTL 9.94e-02 0.222 0.134 0.098 cDC L2
ENSG00000243725 TTC4 328481 sc-eQTL 1.63e-01 -0.225 0.161 0.098 cDC L2
ENSG00000116133 DHCR24 157147 sc-eQTL 7.97e-01 0.0233 0.0906 0.094 cMono_IL1B L2
ENSG00000116205 TCEANC2 990758 sc-eQTL 2.64e-02 -0.278 0.124 0.094 cMono_IL1B L2
ENSG00000116209 TMEM59 990838 sc-eQTL 5.53e-01 0.0454 0.0763 0.094 cMono_IL1B L2
ENSG00000116221 MRPL37 860301 sc-eQTL 5.73e-02 0.258 0.135 0.094 cMono_IL1B L2
ENSG00000157216 SSBP3 630863 sc-eQTL 5.94e-01 0.0741 0.139 0.094 cMono_IL1B L2
ENSG00000162402 USP24 -171022 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0167 0.103 0.094 cMono_IL1B L2
ENSG00000243725 TTC4 328481 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0894 0.157 0.094 cMono_IL1B L2
ENSG00000116133 DHCR24 157147 sc-eQTL 1.38e-01 -0.127 0.0852 0.094 cMono_S100A L2
ENSG00000116205 TCEANC2 990758 sc-eQTL 3.19e-01 0.13 0.13 0.094 cMono_S100A L2
ENSG00000116209 TMEM59 990838 sc-eQTL 1.72e-01 0.143 0.104 0.094 cMono_S100A L2
ENSG00000116221 MRPL37 860301 sc-eQTL 7.11e-02 0.272 0.15 0.094 cMono_S100A L2
ENSG00000157216 SSBP3 630863 sc-eQTL 1.73e-01 0.214 0.156 0.094 cMono_S100A L2
ENSG00000162402 USP24 -171022 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0876 0.127 0.094 cMono_S100A L2
ENSG00000243725 TTC4 328481 sc-eQTL 6.61e-01 0.0698 0.159 0.094 cMono_S100A L2
ENSG00000006555 TTC22 243019 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0346 0.147 0.097 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 157147 sc-eQTL 1.99e-01 0.21 0.163 0.097 gdT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 990758 sc-eQTL 3.92e-01 -0.141 0.164 0.097 gdT L2
ENSG00000116209 TMEM59 990838 sc-eQTL 8.22e-01 0.0377 0.167 0.097 gdT L2
ENSG00000116221 MRPL37 860301 sc-eQTL 3.51e-02 0.401 0.189 0.097 gdT L2
ENSG00000157216 SSBP3 630863 sc-eQTL 7.12e-01 0.0433 0.117 0.097 gdT L2
ENSG00000162402 USP24 -171022 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00893 0.158 0.097 gdT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 844306 sc-eQTL 1.96e-01 -0.212 0.163 0.097 gdT L2
ENSG00000243725 TTC4 328481 sc-eQTL 4.00e-01 -0.155 0.184 0.097 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 157147 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00825 0.115 0.093 intMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 990758 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0585 0.144 0.093 intMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 990838 sc-eQTL 2.74e-01 -0.115 0.105 0.093 intMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 860301 sc-eQTL 5.62e-01 0.0936 0.161 0.093 intMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 630863 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0804 0.165 0.093 intMono L2
ENSG00000162402 USP24 -171022 sc-eQTL 2.86e-01 -0.157 0.146 0.093 intMono L2
ENSG00000243725 TTC4 328481 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0855 0.156 0.093 intMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 157147 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0753 0.112 0.097 ncMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 990758 sc-eQTL 8.02e-01 0.0352 0.14 0.097 ncMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 990838 sc-eQTL 5.15e-02 -0.217 0.111 0.097 ncMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 860301 sc-eQTL 3.50e-01 -0.135 0.144 0.097 ncMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 630863 sc-eQTL 2.54e-01 0.18 0.157 0.097 ncMono L2
ENSG00000162402 USP24 -171022 sc-eQTL 3.51e-01 -0.118 0.126 0.097 ncMono L2
ENSG00000243725 TTC4 328481 sc-eQTL 1.30e-01 0.226 0.148 0.097 ncMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 157147 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0272 0.133 0.096 pDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 990758 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0465 0.159 0.096 pDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 990838 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00135 0.127 0.096 pDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 860301 sc-eQTL 9.22e-02 0.284 0.168 0.096 pDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 630863 sc-eQTL 4.38e-02 0.301 0.148 0.096 pDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 502085 sc-eQTL 3.12e-01 0.0639 0.0629 0.096 pDC L2
ENSG00000162402 USP24 -171022 sc-eQTL 4.66e-01 0.0778 0.106 0.096 pDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 844306 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0994 0.146 0.096 pDC L2
ENSG00000243725 TTC4 328481 sc-eQTL 5.23e-01 -0.108 0.168 0.096 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 243019 sc-eQTL 2.22e-01 0.179 0.146 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 157147 sc-eQTL 4.22e-01 -0.118 0.147 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 990758 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0789 0.142 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 990838 sc-eQTL 7.43e-01 0.0363 0.111 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 860301 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0576 0.133 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 630863 sc-eQTL 9.60e-02 0.192 0.115 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -171022 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0365 0.105 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 844306 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0627 0.161 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 328481 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0614 0.145 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 243019 sc-eQTL 9.52e-01 0.00935 0.154 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 157147 sc-eQTL 2.52e-01 0.159 0.138 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 990758 sc-eQTL 8.44e-01 0.0247 0.125 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 990838 sc-eQTL 1.68e-01 0.122 0.0885 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 860301 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0383 0.128 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 630863 sc-eQTL 5.15e-01 0.0745 0.114 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -171022 sc-eQTL 1.61e-01 -0.137 0.0976 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 844306 sc-eQTL 1.60e-02 -0.372 0.153 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 328481 sc-eQTL 2.82e-01 0.157 0.146 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 157147 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0623 0.0883 0.094 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 990758 sc-eQTL 3.34e-01 -0.107 0.11 0.094 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 990838 sc-eQTL 3.49e-01 0.0714 0.0761 0.094 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 860301 sc-eQTL 2.06e-02 0.311 0.133 0.094 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 630863 sc-eQTL 2.59e-01 0.16 0.141 0.094 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -171022 sc-eQTL 5.08e-01 -0.064 0.0965 0.094 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 328481 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0204 0.16 0.094 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 157147 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0866 0.107 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 990758 sc-eQTL 6.16e-01 0.0707 0.141 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 990838 sc-eQTL 1.36e-01 -0.156 0.104 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 860301 sc-eQTL 4.82e-01 -0.101 0.143 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 630863 sc-eQTL 8.63e-01 0.0265 0.153 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -171022 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0675 0.12 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 328481 sc-eQTL 3.61e-01 0.138 0.151 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 243019 sc-eQTL 3.47e-01 -0.12 0.127 0.095 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 157147 sc-eQTL 7.59e-01 0.0409 0.133 0.095 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 990758 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0193 0.13 0.095 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 990838 sc-eQTL 7.99e-01 0.0258 0.101 0.095 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 860301 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0313 0.135 0.095 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 630863 sc-eQTL 5.95e-01 0.059 0.111 0.095 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162398 LEXM 238279 sc-eQTL 4.59e-01 0.0926 0.125 0.095 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -171022 sc-eQTL 3.98e-01 -0.067 0.0791 0.095 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 328481 sc-eQTL 3.87e-01 -0.122 0.141 0.095 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000162398 LEXM 238279 eQTL 0.032 0.0736 0.0343 0.0 0.0 0.0903
ENSG00000169174 PCSK9 4794 pQTL 0.00075 -0.153 0.0454 0.0 0.0 0.0918
ENSG00000169174 PCSK9 4794 eQTL 0.0163 -0.0673 0.028 0.0 0.0 0.0903


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina