Genes within 1Mb (chr1:55041683:A:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 240360 sc-eQTL 8.49e-01 0.0266 0.14 0.1 B L1
ENSG00000116133 DHCR24 154488 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0486 0.132 0.1 B L1
ENSG00000116205 TCEANC2 988099 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0257 0.114 0.1 B L1
ENSG00000116209 TMEM59 988179 sc-eQTL 4.32e-01 0.0547 0.0695 0.1 B L1
ENSG00000116221 MRPL37 857642 sc-eQTL 3.24e-01 -0.0897 0.0909 0.1 B L1
ENSG00000157216 SSBP3 628204 sc-eQTL 7.47e-02 0.17 0.0946 0.1 B L1
ENSG00000162402 USP24 -173681 sc-eQTL 7.11e-01 -0.03 0.0808 0.1 B L1
ENSG00000215883 CYB5RL 841647 sc-eQTL 1.31e-02 -0.383 0.153 0.1 B L1
ENSG00000243725 TTC4 325822 sc-eQTL 2.85e-01 0.145 0.135 0.1 B L1
ENSG00000006555 TTC22 240360 sc-eQTL 6.36e-02 0.202 0.108 0.1 CD4T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 988099 sc-eQTL 2.91e-01 -0.0944 0.0892 0.1 CD4T L1
ENSG00000116209 TMEM59 988179 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00213 0.0833 0.1 CD4T L1
ENSG00000116221 MRPL37 857642 sc-eQTL 1.31e-01 0.174 0.114 0.1 CD4T L1
ENSG00000157216 SSBP3 628204 sc-eQTL 1.35e-01 0.143 0.0951 0.1 CD4T L1
ENSG00000162402 USP24 -173681 sc-eQTL 9.14e-01 0.00841 0.0779 0.1 CD4T L1
ENSG00000243725 TTC4 325822 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0779 0.117 0.1 CD4T L1
ENSG00000006555 TTC22 240360 sc-eQTL 6.85e-01 0.039 0.096 0.1 CD8T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 988099 sc-eQTL 7.05e-01 0.0453 0.12 0.1 CD8T L1
ENSG00000116209 TMEM59 988179 sc-eQTL 7.39e-01 0.0277 0.083 0.1 CD8T L1
ENSG00000116221 MRPL37 857642 sc-eQTL 3.98e-02 0.234 0.113 0.1 CD8T L1
ENSG00000157216 SSBP3 628204 sc-eQTL 2.29e-01 0.0986 0.0818 0.1 CD8T L1
ENSG00000162402 USP24 -173681 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0689 0.0793 0.1 CD8T L1
ENSG00000243725 TTC4 325822 sc-eQTL 2.07e-01 0.174 0.137 0.1 CD8T L1
ENSG00000116133 DHCR24 154488 sc-eQTL 8.38e-01 0.0262 0.128 0.101 DC L1
ENSG00000116205 TCEANC2 988099 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0849 0.143 0.101 DC L1
ENSG00000116209 TMEM59 988179 sc-eQTL 3.68e-01 -0.101 0.112 0.101 DC L1
ENSG00000116221 MRPL37 857642 sc-eQTL 1.85e-01 -0.2 0.151 0.101 DC L1
ENSG00000157216 SSBP3 628204 sc-eQTL 2.77e-01 0.146 0.134 0.101 DC L1
ENSG00000162390 ACOT11 499426 sc-eQTL 7.78e-01 0.0366 0.13 0.101 DC L1
ENSG00000162402 USP24 -173681 sc-eQTL 3.41e-02 0.165 0.0774 0.101 DC L1
ENSG00000215883 CYB5RL 841647 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0634 0.141 0.101 DC L1
ENSG00000243725 TTC4 325822 sc-eQTL 3.67e-01 -0.137 0.152 0.101 DC L1
ENSG00000116133 DHCR24 154488 sc-eQTL 2.46e-01 -0.106 0.0915 0.1 Mono L1
ENSG00000116205 TCEANC2 988099 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0798 0.0988 0.1 Mono L1
ENSG00000116209 TMEM59 988179 sc-eQTL 5.53e-01 0.0437 0.0734 0.1 Mono L1
ENSG00000116221 MRPL37 857642 sc-eQTL 2.80e-01 0.133 0.123 0.1 Mono L1
ENSG00000157216 SSBP3 628204 sc-eQTL 4.10e-01 0.116 0.141 0.1 Mono L1
ENSG00000162402 USP24 -173681 sc-eQTL 2.75e-01 -0.0916 0.0837 0.1 Mono L1
ENSG00000243725 TTC4 325822 sc-eQTL 9.62e-01 0.007 0.148 0.1 Mono L1
ENSG00000006555 TTC22 240360 sc-eQTL 1.30e-01 -0.189 0.125 0.101 NK L1
ENSG00000116133 DHCR24 154488 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0597 0.127 0.101 NK L1
ENSG00000116205 TCEANC2 988099 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0844 0.125 0.101 NK L1
ENSG00000116209 TMEM59 988179 sc-eQTL 8.13e-01 0.0231 0.0978 0.101 NK L1
ENSG00000116221 MRPL37 857642 sc-eQTL 9.34e-01 -0.01 0.122 0.101 NK L1
ENSG00000157216 SSBP3 628204 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0135 0.105 0.101 NK L1
ENSG00000162398 LEXM 235620 sc-eQTL 1.01e-01 0.194 0.118 0.101 NK L1
ENSG00000162402 USP24 -173681 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0364 0.0717 0.101 NK L1
ENSG00000243725 TTC4 325822 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0305 0.136 0.101 NK L1
ENSG00000006555 TTC22 240360 sc-eQTL 5.83e-01 0.0624 0.114 0.1 Other_T L1
ENSG00000116133 DHCR24 154488 sc-eQTL 7.94e-02 0.154 0.0875 0.1 Other_T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 988099 sc-eQTL 3.57e-01 -0.122 0.132 0.1 Other_T L1
ENSG00000116209 TMEM59 988179 sc-eQTL 7.91e-01 0.0241 0.0905 0.1 Other_T L1
ENSG00000116221 MRPL37 857642 sc-eQTL 5.67e-01 0.0486 0.0847 0.1 Other_T L1
ENSG00000157216 SSBP3 628204 sc-eQTL 1.10e-01 0.156 0.0975 0.1 Other_T L1
ENSG00000162402 USP24 -173681 sc-eQTL 8.05e-01 0.0258 0.104 0.1 Other_T L1
ENSG00000215883 CYB5RL 841647 sc-eQTL 4.69e-01 -0.104 0.143 0.1 Other_T L1
ENSG00000243725 TTC4 325822 sc-eQTL 2.29e-01 -0.171 0.142 0.1 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 240360 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0942 0.115 0.107 B_Activated L2
ENSG00000116133 DHCR24 154488 sc-eQTL 4.27e-01 -0.108 0.135 0.107 B_Activated L2
ENSG00000116205 TCEANC2 988099 sc-eQTL 9.36e-01 0.0117 0.145 0.107 B_Activated L2
ENSG00000116209 TMEM59 988179 sc-eQTL 5.68e-01 0.0882 0.154 0.107 B_Activated L2
ENSG00000116221 MRPL37 857642 sc-eQTL 6.96e-01 0.0653 0.167 0.107 B_Activated L2
ENSG00000157216 SSBP3 628204 sc-eQTL 5.62e-01 0.0878 0.151 0.107 B_Activated L2
ENSG00000162402 USP24 -173681 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0909 0.147 0.107 B_Activated L2
ENSG00000215883 CYB5RL 841647 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0161 0.13 0.107 B_Activated L2
ENSG00000243725 TTC4 325822 sc-eQTL 2.67e-01 -0.157 0.141 0.107 B_Activated L2
ENSG00000006555 TTC22 240360 sc-eQTL 4.81e-01 0.106 0.15 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000116133 DHCR24 154488 sc-eQTL 7.90e-02 -0.244 0.138 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000116205 TCEANC2 988099 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0242 0.138 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000116209 TMEM59 988179 sc-eQTL 7.08e-01 0.0444 0.118 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000116221 MRPL37 857642 sc-eQTL 1.05e-01 -0.225 0.139 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000157216 SSBP3 628204 sc-eQTL 6.32e-01 0.0625 0.13 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000162402 USP24 -173681 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0349 0.11 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000215883 CYB5RL 841647 sc-eQTL 4.16e-01 0.126 0.155 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000243725 TTC4 325822 sc-eQTL 4.81e-01 0.0996 0.141 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000006555 TTC22 240360 sc-eQTL 2.46e-01 0.167 0.144 0.101 B_Memory L2
ENSG00000116133 DHCR24 154488 sc-eQTL 6.55e-01 0.064 0.143 0.101 B_Memory L2
ENSG00000116205 TCEANC2 988099 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0634 0.153 0.101 B_Memory L2
ENSG00000116209 TMEM59 988179 sc-eQTL 4.27e-01 -0.101 0.127 0.101 B_Memory L2
ENSG00000116221 MRPL37 857642 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0604 0.129 0.101 B_Memory L2
ENSG00000157216 SSBP3 628204 sc-eQTL 4.01e-02 0.247 0.119 0.101 B_Memory L2
ENSG00000162402 USP24 -173681 sc-eQTL 3.63e-01 0.107 0.118 0.101 B_Memory L2
ENSG00000215883 CYB5RL 841647 sc-eQTL 7.43e-02 -0.26 0.145 0.101 B_Memory L2
ENSG00000243725 TTC4 325822 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0583 0.151 0.101 B_Memory L2
ENSG00000006555 TTC22 240360 sc-eQTL 9.31e-01 0.0129 0.148 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000116133 DHCR24 154488 sc-eQTL 7.75e-01 0.0399 0.139 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 988099 sc-eQTL 7.45e-01 0.0404 0.124 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000116209 TMEM59 988179 sc-eQTL 4.94e-01 0.0618 0.0901 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000116221 MRPL37 857642 sc-eQTL 8.13e-01 0.0315 0.133 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000157216 SSBP3 628204 sc-eQTL 5.50e-01 0.0759 0.127 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000162402 USP24 -173681 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0413 0.0997 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 841647 sc-eQTL 5.94e-02 -0.283 0.149 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000243725 TTC4 325822 sc-eQTL 3.56e-01 0.125 0.136 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000006555 TTC22 240360 sc-eQTL 6.10e-01 0.0763 0.15 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000116133 DHCR24 154488 sc-eQTL 7.11e-01 0.0484 0.13 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 988099 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0241 0.145 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000116209 TMEM59 988179 sc-eQTL 1.09e-01 0.19 0.118 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000116221 MRPL37 857642 sc-eQTL 1.34e-01 -0.21 0.139 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000157216 SSBP3 628204 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00538 0.138 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000162402 USP24 -173681 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0256 0.109 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 841647 sc-eQTL 1.47e-01 -0.223 0.153 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000243725 TTC4 325822 sc-eQTL 2.62e-01 0.18 0.16 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000006555 TTC22 240360 sc-eQTL 1.05e-01 0.226 0.139 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 988099 sc-eQTL 3.29e-01 0.141 0.144 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 988179 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0603 0.131 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 857642 sc-eQTL 3.91e-01 0.138 0.161 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 628204 sc-eQTL 9.95e-01 0.000563 0.0992 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -173681 sc-eQTL 3.78e-01 0.12 0.136 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 325822 sc-eQTL 9.33e-01 -0.0128 0.152 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 240360 sc-eQTL 2.29e-01 0.154 0.128 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 988099 sc-eQTL 9.20e-01 0.00978 0.0977 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 988179 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0536 0.095 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 857642 sc-eQTL 1.04e-01 0.199 0.122 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 628204 sc-eQTL 7.10e-01 0.0364 0.0977 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -173681 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0205 0.0843 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 325822 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0516 0.128 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 240360 sc-eQTL 1.09e-01 0.219 0.136 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 988099 sc-eQTL 2.47e-01 -0.154 0.133 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 988179 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00357 0.1 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 857642 sc-eQTL 7.32e-01 0.0434 0.126 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 628204 sc-eQTL 9.97e-02 0.204 0.123 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -173681 sc-eQTL 2.07e-01 -0.13 0.102 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 325822 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0164 0.148 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 240360 sc-eQTL 6.61e-01 0.0683 0.156 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 988099 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0222 0.148 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 988179 sc-eQTL 3.58e-01 0.105 0.114 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 857642 sc-eQTL 2.42e-01 0.172 0.147 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 628204 sc-eQTL 3.49e-01 0.118 0.126 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -173681 sc-eQTL 9.68e-01 0.00455 0.115 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 325822 sc-eQTL 2.41e-01 0.178 0.151 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 240360 sc-eQTL 7.25e-01 0.0442 0.126 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 988099 sc-eQTL 2.02e-01 -0.177 0.139 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 988179 sc-eQTL 2.45e-01 0.14 0.121 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 857642 sc-eQTL 9.13e-02 0.242 0.142 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 628204 sc-eQTL 3.38e-01 0.0938 0.0978 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -173681 sc-eQTL 1.44e-01 -0.142 0.0969 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 325822 sc-eQTL 6.74e-01 0.0614 0.146 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 240360 sc-eQTL 2.52e-01 -0.16 0.139 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 988099 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0582 0.126 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 988179 sc-eQTL 9.24e-01 0.0118 0.123 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 857642 sc-eQTL 2.60e-01 0.167 0.148 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 628204 sc-eQTL 7.48e-01 -0.036 0.112 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -173681 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0724 0.102 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 325822 sc-eQTL 3.34e-01 0.144 0.149 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 240360 sc-eQTL 4.33e-01 -0.126 0.161 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 988099 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0994 0.162 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 988179 sc-eQTL 8.87e-01 0.0202 0.142 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 857642 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0487 0.161 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 628204 sc-eQTL 7.91e-01 0.0373 0.14 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -173681 sc-eQTL 6.55e-01 0.0608 0.136 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 325822 sc-eQTL 3.62e-01 -0.151 0.165 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 240360 sc-eQTL 8.43e-02 0.256 0.148 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 988099 sc-eQTL 1.01e-01 0.254 0.154 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 988179 sc-eQTL 4.72e-01 -0.108 0.15 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 857642 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0548 0.152 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 628204 sc-eQTL 1.20e-01 0.223 0.143 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -173681 sc-eQTL 9.61e-01 0.00743 0.152 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 325822 sc-eQTL 2.40e-01 0.181 0.153 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 240360 sc-eQTL 9.46e-01 0.00922 0.136 0.1 MAIT L2
ENSG00000116133 DHCR24 154488 sc-eQTL 4.11e-01 0.0827 0.1 0.1 MAIT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 988099 sc-eQTL 2.34e-01 -0.168 0.141 0.1 MAIT L2
ENSG00000116209 TMEM59 988179 sc-eQTL 8.56e-01 0.0232 0.128 0.1 MAIT L2
ENSG00000116221 MRPL37 857642 sc-eQTL 6.20e-01 -0.077 0.155 0.1 MAIT L2
ENSG00000157216 SSBP3 628204 sc-eQTL 8.83e-02 0.234 0.137 0.1 MAIT L2
ENSG00000162402 USP24 -173681 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0506 0.122 0.1 MAIT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 841647 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0955 0.142 0.1 MAIT L2
ENSG00000243725 TTC4 325822 sc-eQTL 4.63e-01 -0.104 0.141 0.1 MAIT L2
ENSG00000006555 TTC22 240360 sc-eQTL 8.53e-01 0.0282 0.152 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000116133 DHCR24 154488 sc-eQTL 3.73e-01 -0.12 0.134 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000116205 TCEANC2 988099 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0939 0.142 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000116209 TMEM59 988179 sc-eQTL 2.51e-01 0.158 0.138 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000116221 MRPL37 857642 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00644 0.154 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000157216 SSBP3 628204 sc-eQTL 9.45e-01 -0.008 0.116 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000162398 LEXM 235620 sc-eQTL 1.76e-01 0.186 0.137 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000162402 USP24 -173681 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0347 0.118 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000243725 TTC4 325822 sc-eQTL 7.83e-01 0.0411 0.149 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000006555 TTC22 240360 sc-eQTL 1.47e-01 -0.184 0.127 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000116133 DHCR24 154488 sc-eQTL 8.45e-01 0.0259 0.133 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000116205 TCEANC2 988099 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0635 0.144 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000116209 TMEM59 988179 sc-eQTL 7.94e-01 0.0278 0.107 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000116221 MRPL37 857642 sc-eQTL 9.93e-01 0.00116 0.139 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000157216 SSBP3 628204 sc-eQTL 9.49e-01 0.00721 0.113 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000162398 LEXM 235620 sc-eQTL 1.83e-01 0.173 0.13 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000162402 USP24 -173681 sc-eQTL 1.65e-01 -0.115 0.0825 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000243725 TTC4 325822 sc-eQTL 4.34e-01 -0.111 0.142 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000006555 TTC22 240360 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0266 0.152 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000116133 DHCR24 154488 sc-eQTL 4.74e-01 0.106 0.148 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000116205 TCEANC2 988099 sc-eQTL 6.33e-01 0.0682 0.142 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000116209 TMEM59 988179 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0387 0.142 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000116221 MRPL37 857642 sc-eQTL 8.97e-02 0.264 0.155 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000157216 SSBP3 628204 sc-eQTL 4.32e-01 0.1 0.127 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000162398 LEXM 235620 sc-eQTL 1.58e-01 0.203 0.143 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000162402 USP24 -173681 sc-eQTL 7.35e-01 0.0357 0.105 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000243725 TTC4 325822 sc-eQTL 4.52e-01 -0.118 0.157 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000006555 TTC22 240360 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0412 0.136 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000116133 DHCR24 154488 sc-eQTL 8.56e-01 0.025 0.137 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000116205 TCEANC2 988099 sc-eQTL 8.60e-01 0.0241 0.136 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000116209 TMEM59 988179 sc-eQTL 3.23e-01 -0.11 0.111 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000116221 MRPL37 857642 sc-eQTL 3.97e-01 -0.116 0.136 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000157216 SSBP3 628204 sc-eQTL 7.05e-01 0.0434 0.115 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000162398 LEXM 235620 sc-eQTL 6.88e-01 0.0576 0.143 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000162402 USP24 -173681 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0191 0.0976 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000243725 TTC4 325822 sc-eQTL 9.29e-01 0.013 0.145 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000006555 TTC22 240360 sc-eQTL 9.67e-01 0.007 0.171 0.104 PB L2
ENSG00000116133 DHCR24 154488 sc-eQTL 8.55e-01 0.0278 0.152 0.104 PB L2
ENSG00000116205 TCEANC2 988099 sc-eQTL 5.94e-01 0.0987 0.184 0.104 PB L2
ENSG00000116209 TMEM59 988179 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0118 0.0772 0.104 PB L2
ENSG00000116221 MRPL37 857642 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0233 0.14 0.104 PB L2
ENSG00000157216 SSBP3 628204 sc-eQTL 9.35e-01 0.0133 0.162 0.104 PB L2
ENSG00000162402 USP24 -173681 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0467 0.184 0.104 PB L2
ENSG00000215883 CYB5RL 841647 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0274 0.191 0.104 PB L2
ENSG00000243725 TTC4 325822 sc-eQTL 9.59e-01 0.00923 0.178 0.104 PB L2
ENSG00000006555 TTC22 240360 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0341 0.138 0.102 Pro_T L2
ENSG00000116133 DHCR24 154488 sc-eQTL 1.53e-01 0.167 0.117 0.102 Pro_T L2
ENSG00000116205 TCEANC2 988099 sc-eQTL 8.84e-01 0.021 0.143 0.102 Pro_T L2
ENSG00000116209 TMEM59 988179 sc-eQTL 5.76e-01 0.0555 0.0991 0.102 Pro_T L2
ENSG00000116221 MRPL37 857642 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0377 0.0971 0.102 Pro_T L2
ENSG00000157216 SSBP3 628204 sc-eQTL 1.83e-01 0.145 0.108 0.102 Pro_T L2
ENSG00000162402 USP24 -173681 sc-eQTL 2.22e-01 0.162 0.132 0.102 Pro_T L2
ENSG00000215883 CYB5RL 841647 sc-eQTL 8.64e-02 0.224 0.13 0.102 Pro_T L2
ENSG00000243725 TTC4 325822 sc-eQTL 1.41e-01 -0.214 0.145 0.102 Pro_T L2
ENSG00000006555 TTC22 240360 sc-eQTL 6.41e-01 0.0648 0.139 0.1 Treg L2
ENSG00000116205 TCEANC2 988099 sc-eQTL 3.40e-01 -0.142 0.148 0.1 Treg L2
ENSG00000116209 TMEM59 988179 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0132 0.118 0.1 Treg L2
ENSG00000116221 MRPL37 857642 sc-eQTL 7.05e-01 0.0552 0.146 0.1 Treg L2
ENSG00000157216 SSBP3 628204 sc-eQTL 6.89e-01 0.052 0.13 0.1 Treg L2
ENSG00000162402 USP24 -173681 sc-eQTL 4.24e-01 -0.099 0.124 0.1 Treg L2
ENSG00000243725 TTC4 325822 sc-eQTL 2.97e-02 -0.337 0.154 0.1 Treg L2
ENSG00000116133 DHCR24 154488 sc-eQTL 7.66e-01 0.0375 0.126 0.102 cDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 988099 sc-eQTL 4.81e-01 -0.105 0.148 0.102 cDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 988179 sc-eQTL 1.86e-01 -0.167 0.125 0.102 cDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 857642 sc-eQTL 3.08e-02 -0.346 0.159 0.102 cDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 628204 sc-eQTL 9.35e-01 -0.0121 0.149 0.102 cDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 499426 sc-eQTL 7.86e-01 0.0376 0.138 0.102 cDC L2
ENSG00000162402 USP24 -173681 sc-eQTL 2.32e-01 0.185 0.154 0.102 cDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 841647 sc-eQTL 1.73e-01 0.181 0.132 0.102 cDC L2
ENSG00000243725 TTC4 325822 sc-eQTL 3.32e-01 -0.154 0.159 0.102 cDC L2
ENSG00000116133 DHCR24 154488 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0167 0.0885 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000116205 TCEANC2 988099 sc-eQTL 6.92e-02 -0.223 0.122 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000116209 TMEM59 988179 sc-eQTL 4.39e-01 0.0578 0.0745 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000116221 MRPL37 857642 sc-eQTL 1.53e-01 0.19 0.132 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000157216 SSBP3 628204 sc-eQTL 5.87e-01 0.0737 0.136 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000162402 USP24 -173681 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0214 0.1 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000243725 TTC4 325822 sc-eQTL 4.78e-01 -0.109 0.153 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000116133 DHCR24 154488 sc-eQTL 1.44e-01 -0.122 0.0832 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000116205 TCEANC2 988099 sc-eQTL 5.89e-01 0.069 0.127 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000116209 TMEM59 988179 sc-eQTL 1.54e-01 0.145 0.102 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000116221 MRPL37 857642 sc-eQTL 1.48e-01 0.213 0.147 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000157216 SSBP3 628204 sc-eQTL 1.93e-01 0.199 0.152 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000162402 USP24 -173681 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0655 0.124 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000243725 TTC4 325822 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0279 0.155 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000006555 TTC22 240360 sc-eQTL 9.33e-01 0.0119 0.143 0.106 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 154488 sc-eQTL 1.27e-01 0.242 0.158 0.106 gdT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 988099 sc-eQTL 4.07e-01 -0.133 0.159 0.106 gdT L2
ENSG00000116209 TMEM59 988179 sc-eQTL 7.90e-01 0.0432 0.162 0.106 gdT L2
ENSG00000116221 MRPL37 857642 sc-eQTL 3.47e-02 0.39 0.183 0.106 gdT L2
ENSG00000157216 SSBP3 628204 sc-eQTL 5.24e-01 0.0726 0.114 0.106 gdT L2
ENSG00000162402 USP24 -173681 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0502 0.153 0.106 gdT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 841647 sc-eQTL 8.56e-02 -0.272 0.157 0.106 gdT L2
ENSG00000243725 TTC4 325822 sc-eQTL 3.13e-01 -0.181 0.178 0.106 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 154488 sc-eQTL 8.58e-01 0.0202 0.113 0.1 intMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 988099 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0641 0.141 0.1 intMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 988179 sc-eQTL 1.99e-01 -0.133 0.103 0.1 intMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 857642 sc-eQTL 6.77e-01 0.066 0.158 0.1 intMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 628204 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0351 0.162 0.1 intMono L2
ENSG00000162402 USP24 -173681 sc-eQTL 2.76e-01 -0.157 0.144 0.1 intMono L2
ENSG00000243725 TTC4 325822 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0736 0.154 0.1 intMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 154488 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0964 0.109 0.104 ncMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 988099 sc-eQTL 6.26e-01 0.0667 0.137 0.104 ncMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 988179 sc-eQTL 6.45e-02 -0.201 0.108 0.104 ncMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 857642 sc-eQTL 1.80e-01 -0.189 0.14 0.104 ncMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 628204 sc-eQTL 3.64e-01 0.14 0.154 0.104 ncMono L2
ENSG00000162402 USP24 -173681 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0746 0.123 0.104 ncMono L2
ENSG00000243725 TTC4 325822 sc-eQTL 1.35e-01 0.217 0.145 0.104 ncMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 154488 sc-eQTL 7.14e-01 -0.048 0.131 0.102 pDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 988099 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00849 0.157 0.102 pDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 988179 sc-eQTL 7.82e-01 0.0348 0.125 0.102 pDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 857642 sc-eQTL 1.37e-01 0.247 0.165 0.102 pDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 628204 sc-eQTL 4.75e-02 0.292 0.146 0.102 pDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 499426 sc-eQTL 3.70e-01 0.0558 0.062 0.102 pDC L2
ENSG00000162402 USP24 -173681 sc-eQTL 3.12e-01 0.106 0.105 0.102 pDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 841647 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0839 0.143 0.102 pDC L2
ENSG00000243725 TTC4 325822 sc-eQTL 4.14e-01 -0.136 0.165 0.102 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 240360 sc-eQTL 4.27e-01 0.114 0.143 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 154488 sc-eQTL 3.15e-01 -0.144 0.143 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 988099 sc-eQTL 4.01e-01 -0.117 0.139 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 988179 sc-eQTL 8.71e-01 0.0175 0.108 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 857642 sc-eQTL 1.98e-01 -0.166 0.129 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 628204 sc-eQTL 3.70e-02 0.234 0.111 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -173681 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0303 0.103 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 841647 sc-eQTL 5.06e-01 -0.105 0.157 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 325822 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0692 0.141 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 240360 sc-eQTL 7.47e-01 0.0485 0.15 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 154488 sc-eQTL 3.64e-01 0.123 0.135 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 988099 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000685 0.122 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 988179 sc-eQTL 2.59e-01 0.0979 0.0865 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 857642 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0815 0.125 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 628204 sc-eQTL 6.46e-01 0.0513 0.112 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -173681 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0518 0.0956 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 841647 sc-eQTL 8.87e-03 -0.394 0.149 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 325822 sc-eQTL 2.33e-01 0.17 0.142 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 154488 sc-eQTL 2.53e-01 -0.0988 0.0862 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 988099 sc-eQTL 3.72e-01 -0.0966 0.108 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 988179 sc-eQTL 3.16e-01 0.0749 0.0744 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 857642 sc-eQTL 7.09e-02 0.238 0.131 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 628204 sc-eQTL 2.71e-01 0.152 0.138 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -173681 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0707 0.0944 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 325822 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0821 0.157 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 154488 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0786 0.105 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 988099 sc-eQTL 5.73e-01 0.0775 0.137 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 988179 sc-eQTL 9.90e-02 -0.168 0.102 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 857642 sc-eQTL 2.86e-01 -0.149 0.14 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 628204 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00259 0.149 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -173681 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0519 0.118 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 325822 sc-eQTL 3.99e-01 0.125 0.147 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 240360 sc-eQTL 2.72e-01 -0.136 0.124 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 154488 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00894 0.13 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 988099 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0674 0.127 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 988179 sc-eQTL 8.22e-01 0.0221 0.0984 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 857642 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0224 0.132 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 628204 sc-eQTL 5.80e-01 0.06 0.108 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162398 LEXM 235620 sc-eQTL 2.96e-01 0.127 0.122 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -173681 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0659 0.0772 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 325822 sc-eQTL 2.85e-01 -0.147 0.137 0.101 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000162398 LEXM 235620 eQTL 0.0207 0.077 0.0332 0.0 0.0 0.0972
ENSG00000169174 PCSK9 2135 pQTL 0.00391 -0.128 0.0443 0.0 0.0 0.0975
ENSG00000169174 PCSK9 2135 eQTL 0.00845 -0.0715 0.0271 0.0 0.0 0.0972
ENSG00000184313 MROH7 399929 eQTL 0.0507 0.0884 0.0452 0.00103 0.0 0.0972


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000162398 LEXM 235620 1.27e-06 2.43e-06 2.59e-07 1.35e-06 4.72e-07 5.99e-07 1.51e-06 3.85e-07 1.75e-06 5.93e-07 2.05e-06 9.49e-07 2.72e-06 1.16e-06 3.41e-07 9.61e-07 1.14e-06 1.06e-06 6.91e-07 4.42e-07 6.34e-07 1.89e-06 1.14e-06 5.66e-07 2.33e-06 8.11e-07 1.04e-06 1.11e-06 1.48e-06 1.24e-06 7.46e-07 2.62e-07 1.89e-07 6.93e-07 5.3e-07 5.58e-07 6.46e-07 1.65e-07 3.25e-07 3.15e-07 3.6e-08 2.23e-06 5.37e-07 1.67e-07 3.69e-07 2.28e-07 3.02e-07 2.7e-07 2.83e-07