logo

Genes within 1Mb (chr1:55033846:A:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 232523 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0431 0.177 0.062 B L1
ENSG00000116133 DHCR24 146651 sc-eQTL 7.89e-01 0.0449 0.168 0.062 B L1
ENSG00000116205 TCEANC2 980262 sc-eQTL 6.41e-01 0.0677 0.145 0.062 B L1
ENSG00000116209 TMEM59 980342 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0475 0.0881 0.062 B L1
ENSG00000116221 MRPL37 849805 sc-eQTL 1.81e-01 -0.154 0.115 0.062 B L1
ENSG00000157216 SSBP3 620367 sc-eQTL 1.75e-01 0.164 0.12 0.062 B L1
ENSG00000162402 USP24 -181518 sc-eQTL 3.90e-01 -0.088 0.102 0.062 B L1
ENSG00000215883 CYB5RL 833810 sc-eQTL 4.11e-02 -0.401 0.195 0.062 B L1
ENSG00000243725 TTC4 317985 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00794 0.172 0.062 B L1
ENSG00000006555 TTC22 232523 sc-eQTL 1.55e-01 0.194 0.136 0.062 CD4T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 980262 sc-eQTL 2.17e-01 -0.138 0.111 0.062 CD4T L1
ENSG00000116209 TMEM59 980342 sc-eQTL 7.25e-01 0.0367 0.104 0.062 CD4T L1
ENSG00000116221 MRPL37 849805 sc-eQTL 1.30e-01 0.218 0.143 0.062 CD4T L1
ENSG00000157216 SSBP3 620367 sc-eQTL 2.48e-01 0.138 0.119 0.062 CD4T L1
ENSG00000162402 USP24 -181518 sc-eQTL 4.04e-01 0.0813 0.0973 0.062 CD4T L1
ENSG00000243725 TTC4 317985 sc-eQTL 7.84e-01 0.0403 0.147 0.062 CD4T L1
ENSG00000006555 TTC22 232523 sc-eQTL 7.92e-01 0.0313 0.119 0.062 CD8T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 980262 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00732 0.148 0.062 CD8T L1
ENSG00000116209 TMEM59 980342 sc-eQTL 4.68e-01 0.0746 0.103 0.062 CD8T L1
ENSG00000116221 MRPL37 849805 sc-eQTL 1.06e-01 0.228 0.14 0.062 CD8T L1
ENSG00000157216 SSBP3 620367 sc-eQTL 2.83e-01 0.109 0.101 0.062 CD8T L1
ENSG00000162402 USP24 -181518 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0472 0.0981 0.062 CD8T L1
ENSG00000243725 TTC4 317985 sc-eQTL 2.15e-01 0.211 0.17 0.062 CD8T L1
ENSG00000116133 DHCR24 146651 sc-eQTL 3.34e-01 0.148 0.152 0.065 DC L1
ENSG00000116205 TCEANC2 980262 sc-eQTL 3.03e-01 -0.176 0.171 0.065 DC L1
ENSG00000116209 TMEM59 980342 sc-eQTL 4.12e-01 -0.11 0.134 0.065 DC L1
ENSG00000116221 MRPL37 849805 sc-eQTL 2.68e-01 -0.2 0.18 0.065 DC L1
ENSG00000157216 SSBP3 620367 sc-eQTL 3.51e-01 0.15 0.161 0.065 DC L1
ENSG00000162390 ACOT11 491589 sc-eQTL 4.71e-01 -0.112 0.155 0.065 DC L1
ENSG00000162402 USP24 -181518 sc-eQTL 2.32e-01 0.112 0.0932 0.065 DC L1
ENSG00000215883 CYB5RL 833810 sc-eQTL 8.49e-01 0.0323 0.169 0.065 DC L1
ENSG00000243725 TTC4 317985 sc-eQTL 2.45e-01 -0.211 0.181 0.065 DC L1
ENSG00000116133 DHCR24 146651 sc-eQTL 5.30e-01 0.0712 0.113 0.062 Mono L1
ENSG00000116205 TCEANC2 980262 sc-eQTL 8.39e-01 0.0249 0.122 0.062 Mono L1
ENSG00000116209 TMEM59 980342 sc-eQTL 6.54e-01 0.0408 0.0908 0.062 Mono L1
ENSG00000116221 MRPL37 849805 sc-eQTL 1.42e-01 0.223 0.151 0.062 Mono L1
ENSG00000157216 SSBP3 620367 sc-eQTL 7.34e-01 0.0591 0.174 0.062 Mono L1
ENSG00000162402 USP24 -181518 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0441 0.104 0.062 Mono L1
ENSG00000243725 TTC4 317985 sc-eQTL 8.32e-01 0.0387 0.183 0.062 Mono L1
ENSG00000006555 TTC22 232523 sc-eQTL 4.23e-01 -0.127 0.158 0.062 NK L1
ENSG00000116133 DHCR24 146651 sc-eQTL 3.30e-01 0.155 0.159 0.062 NK L1
ENSG00000116205 TCEANC2 980262 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0379 0.157 0.062 NK L1
ENSG00000116209 TMEM59 980342 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0892 0.123 0.062 NK L1
ENSG00000116221 MRPL37 849805 sc-eQTL 4.04e-01 0.128 0.153 0.062 NK L1
ENSG00000157216 SSBP3 620367 sc-eQTL 9.42e-01 0.00966 0.133 0.062 NK L1
ENSG00000162398 LEXM 227783 sc-eQTL 1.27e-01 0.227 0.148 0.062 NK L1
ENSG00000162402 USP24 -181518 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0312 0.0905 0.062 NK L1
ENSG00000243725 TTC4 317985 sc-eQTL 8.47e-01 -0.033 0.171 0.062 NK L1
ENSG00000006555 TTC22 232523 sc-eQTL 7.41e-01 0.0464 0.14 0.062 Other_T L1
ENSG00000116133 DHCR24 146651 sc-eQTL 4.36e-02 0.219 0.108 0.062 Other_T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 980262 sc-eQTL 5.05e-01 -0.109 0.163 0.062 Other_T L1
ENSG00000116209 TMEM59 980342 sc-eQTL 6.03e-01 0.0582 0.112 0.062 Other_T L1
ENSG00000116221 MRPL37 849805 sc-eQTL 2.02e-01 0.133 0.104 0.062 Other_T L1
ENSG00000157216 SSBP3 620367 sc-eQTL 2.83e-01 0.13 0.121 0.062 Other_T L1
ENSG00000162402 USP24 -181518 sc-eQTL 5.54e-01 0.0763 0.129 0.062 Other_T L1
ENSG00000215883 CYB5RL 833810 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00562 0.176 0.062 Other_T L1
ENSG00000243725 TTC4 317985 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0975 0.175 0.062 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 232523 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0172 0.153 0.061 B_Activated L2
ENSG00000116133 DHCR24 146651 sc-eQTL 5.51e-01 -0.107 0.179 0.061 B_Activated L2
ENSG00000116205 TCEANC2 980262 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0871 0.192 0.061 B_Activated L2
ENSG00000116209 TMEM59 980342 sc-eQTL 7.68e-01 0.0606 0.205 0.061 B_Activated L2
ENSG00000116221 MRPL37 849805 sc-eQTL 6.39e-01 0.104 0.221 0.061 B_Activated L2
ENSG00000157216 SSBP3 620367 sc-eQTL 4.21e-01 0.161 0.2 0.061 B_Activated L2
ENSG00000162402 USP24 -181518 sc-eQTL 4.81e-01 -0.138 0.195 0.061 B_Activated L2
ENSG00000215883 CYB5RL 833810 sc-eQTL 4.88e-01 -0.12 0.172 0.061 B_Activated L2
ENSG00000243725 TTC4 317985 sc-eQTL 5.61e-01 -0.109 0.187 0.061 B_Activated L2
ENSG00000006555 TTC22 232523 sc-eQTL 7.83e-01 -0.051 0.185 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000116133 DHCR24 146651 sc-eQTL 2.04e-01 -0.219 0.171 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000116205 TCEANC2 980262 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0824 0.171 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000116209 TMEM59 980342 sc-eQTL 9.25e-01 0.0138 0.147 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000116221 MRPL37 849805 sc-eQTL 2.81e-01 -0.186 0.172 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000157216 SSBP3 620367 sc-eQTL 2.09e-01 0.203 0.161 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000162402 USP24 -181518 sc-eQTL 7.24e-01 -0.048 0.136 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000215883 CYB5RL 833810 sc-eQTL 4.41e-01 0.148 0.192 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000243725 TTC4 317985 sc-eQTL 4.20e-01 0.141 0.174 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000006555 TTC22 232523 sc-eQTL 7.36e-01 0.0598 0.177 0.062 B_Memory L2
ENSG00000116133 DHCR24 146651 sc-eQTL 7.01e-01 0.0676 0.176 0.062 B_Memory L2
ENSG00000116205 TCEANC2 980262 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0823 0.188 0.062 B_Memory L2
ENSG00000116209 TMEM59 980342 sc-eQTL 2.57e-01 -0.178 0.156 0.062 B_Memory L2
ENSG00000116221 MRPL37 849805 sc-eQTL 8.42e-01 0.0317 0.159 0.062 B_Memory L2
ENSG00000157216 SSBP3 620367 sc-eQTL 4.21e-01 0.119 0.148 0.062 B_Memory L2
ENSG00000162402 USP24 -181518 sc-eQTL 9.09e-01 0.0167 0.145 0.062 B_Memory L2
ENSG00000215883 CYB5RL 833810 sc-eQTL 2.51e-01 -0.206 0.179 0.062 B_Memory L2
ENSG00000243725 TTC4 317985 sc-eQTL 1.90e-01 -0.243 0.185 0.062 B_Memory L2
ENSG00000006555 TTC22 232523 sc-eQTL 4.14e-01 -0.153 0.187 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000116133 DHCR24 146651 sc-eQTL 4.56e-01 0.131 0.175 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 980262 sc-eQTL 2.12e-01 0.195 0.156 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000116209 TMEM59 980342 sc-eQTL 9.16e-01 -0.012 0.114 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000116221 MRPL37 849805 sc-eQTL 9.45e-01 -0.0115 0.167 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000157216 SSBP3 620367 sc-eQTL 1.16e-01 0.25 0.159 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000162402 USP24 -181518 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0637 0.126 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 833810 sc-eQTL 1.68e-01 -0.261 0.189 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000243725 TTC4 317985 sc-eQTL 6.08e-01 0.0879 0.171 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000006555 TTC22 232523 sc-eQTL 2.42e-01 0.219 0.186 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000116133 DHCR24 146651 sc-eQTL 1.63e-01 0.226 0.162 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 980262 sc-eQTL 8.49e-01 0.0343 0.18 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000116209 TMEM59 980342 sc-eQTL 2.43e-01 0.174 0.148 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000116221 MRPL37 849805 sc-eQTL 3.35e-02 -0.37 0.173 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000157216 SSBP3 620367 sc-eQTL 5.43e-01 -0.105 0.172 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000162402 USP24 -181518 sc-eQTL 7.65e-01 0.0408 0.137 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 833810 sc-eQTL 5.25e-02 -0.371 0.19 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000243725 TTC4 317985 sc-eQTL 9.38e-01 -0.0157 0.2 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000006555 TTC22 232523 sc-eQTL 4.05e-02 0.352 0.171 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 980262 sc-eQTL 9.62e-02 0.295 0.177 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 980342 sc-eQTL 7.02e-01 0.062 0.162 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 849805 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0628 0.199 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 620367 sc-eQTL 7.54e-01 0.0384 0.122 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -181518 sc-eQTL 3.84e-01 0.146 0.168 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 317985 sc-eQTL 7.00e-01 0.0724 0.188 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 232523 sc-eQTL 9.94e-01 -0.00111 0.161 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 980262 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0625 0.122 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 980342 sc-eQTL 9.62e-01 0.00568 0.119 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 849805 sc-eQTL 1.43e-01 0.224 0.152 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 620367 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0108 0.122 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -181518 sc-eQTL 6.62e-01 0.0461 0.105 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 317985 sc-eQTL 5.79e-01 0.0894 0.161 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 232523 sc-eQTL 2.43e-02 0.382 0.169 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 980262 sc-eQTL 2.28e-01 -0.2 0.165 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 980342 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0317 0.125 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 849805 sc-eQTL 2.79e-02 0.345 0.156 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 620367 sc-eQTL 4.24e-01 0.124 0.154 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -181518 sc-eQTL 1.89e-01 -0.168 0.127 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 317985 sc-eQTL 6.86e-01 0.0746 0.184 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 232523 sc-eQTL 4.83e-01 0.136 0.194 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 980262 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0936 0.184 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 980342 sc-eQTL 8.20e-01 0.0325 0.142 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 849805 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00564 0.183 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 620367 sc-eQTL 3.00e-01 0.163 0.157 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -181518 sc-eQTL 8.67e-01 0.024 0.143 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 317985 sc-eQTL 4.89e-01 0.131 0.189 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 232523 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0792 0.157 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 980262 sc-eQTL 4.44e-01 -0.133 0.174 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 980342 sc-eQTL 2.50e-01 0.174 0.151 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 849805 sc-eQTL 2.54e-01 0.205 0.179 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 620367 sc-eQTL 3.83e-01 0.107 0.122 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -181518 sc-eQTL 2.17e-01 -0.151 0.122 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 317985 sc-eQTL 8.44e-01 0.0359 0.182 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 232523 sc-eQTL 5.56e-01 -0.101 0.172 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 980262 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0287 0.156 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 980342 sc-eQTL 3.95e-01 0.13 0.152 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 849805 sc-eQTL 2.78e-01 0.198 0.182 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 620367 sc-eQTL 4.87e-01 -0.096 0.138 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -181518 sc-eQTL 3.81e-01 -0.11 0.125 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 317985 sc-eQTL 3.00e-01 0.191 0.183 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 232523 sc-eQTL 5.19e-01 -0.12 0.185 0.065 CD8_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 980262 sc-eQTL 3.21e-01 -0.185 0.186 0.065 CD8_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 980342 sc-eQTL 9.51e-01 -0.0101 0.164 0.065 CD8_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 849805 sc-eQTL 7.20e-01 0.0668 0.186 0.065 CD8_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 620367 sc-eQTL 5.24e-01 -0.103 0.162 0.065 CD8_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -181518 sc-eQTL 3.07e-01 0.16 0.156 0.065 CD8_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 317985 sc-eQTL 3.00e-01 -0.197 0.19 0.065 CD8_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 232523 sc-eQTL 1.31e-01 0.282 0.186 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 980262 sc-eQTL 3.96e-01 0.166 0.195 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 980342 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0394 0.189 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 849805 sc-eQTL 5.86e-01 0.104 0.192 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 620367 sc-eQTL 6.02e-01 0.0946 0.181 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -181518 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0607 0.191 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 317985 sc-eQTL 1.71e-01 0.265 0.193 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 232523 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0553 0.167 0.063 MAIT L2
ENSG00000116133 DHCR24 146651 sc-eQTL 9.93e-01 0.00113 0.124 0.063 MAIT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 980262 sc-eQTL 2.63e-01 -0.195 0.174 0.063 MAIT L2
ENSG00000116209 TMEM59 980342 sc-eQTL 7.60e-01 0.0481 0.158 0.063 MAIT L2
ENSG00000116221 MRPL37 849805 sc-eQTL 5.98e-01 0.101 0.192 0.063 MAIT L2
ENSG00000157216 SSBP3 620367 sc-eQTL 3.59e-01 0.156 0.169 0.063 MAIT L2
ENSG00000162402 USP24 -181518 sc-eQTL 4.87e-01 -0.105 0.151 0.063 MAIT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 833810 sc-eQTL 3.52e-01 -0.163 0.175 0.063 MAIT L2
ENSG00000243725 TTC4 317985 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0347 0.174 0.063 MAIT L2
ENSG00000006555 TTC22 232523 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0541 0.191 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000116133 DHCR24 146651 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0707 0.169 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000116205 TCEANC2 980262 sc-eQTL 3.47e-01 -0.167 0.178 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000116209 TMEM59 980342 sc-eQTL 3.27e-01 0.17 0.173 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000116221 MRPL37 849805 sc-eQTL 1.79e-01 0.261 0.193 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000157216 SSBP3 620367 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0477 0.146 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000162398 LEXM 227783 sc-eQTL 1.29e-02 0.427 0.17 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000162402 USP24 -181518 sc-eQTL 6.48e-01 -0.068 0.149 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000243725 TTC4 317985 sc-eQTL 7.87e-02 0.329 0.186 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000006555 TTC22 232523 sc-eQTL 3.87e-01 -0.137 0.158 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000116133 DHCR24 146651 sc-eQTL 1.72e-01 0.225 0.165 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000116205 TCEANC2 980262 sc-eQTL 6.69e-01 0.0765 0.179 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000116209 TMEM59 980342 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0468 0.133 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000116221 MRPL37 849805 sc-eQTL 4.17e-01 0.14 0.172 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000157216 SSBP3 620367 sc-eQTL 9.71e-01 -0.0051 0.141 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000162398 LEXM 227783 sc-eQTL 3.06e-01 0.166 0.162 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000162402 USP24 -181518 sc-eQTL 2.74e-01 -0.113 0.103 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000243725 TTC4 317985 sc-eQTL 4.26e-01 -0.141 0.177 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000006555 TTC22 232523 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0468 0.189 0.066 NK_HLA L2
ENSG00000116133 DHCR24 146651 sc-eQTL 6.72e-01 0.0779 0.184 0.066 NK_HLA L2
ENSG00000116205 TCEANC2 980262 sc-eQTL 2.16e-01 0.219 0.177 0.066 NK_HLA L2
ENSG00000116209 TMEM59 980342 sc-eQTL 9.56e-01 0.0098 0.176 0.066 NK_HLA L2
ENSG00000116221 MRPL37 849805 sc-eQTL 3.64e-02 0.405 0.192 0.066 NK_HLA L2
ENSG00000157216 SSBP3 620367 sc-eQTL 5.23e-01 0.101 0.158 0.066 NK_HLA L2
ENSG00000162398 LEXM 227783 sc-eQTL 7.31e-01 0.0614 0.179 0.066 NK_HLA L2
ENSG00000162402 USP24 -181518 sc-eQTL 3.59e-01 -0.12 0.131 0.066 NK_HLA L2
ENSG00000243725 TTC4 317985 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0755 0.196 0.066 NK_HLA L2
ENSG00000006555 TTC22 232523 sc-eQTL 7.93e-01 0.0445 0.17 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000116133 DHCR24 146651 sc-eQTL 1.98e-01 0.22 0.171 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000116205 TCEANC2 980262 sc-eQTL 5.25e-01 -0.108 0.17 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000116209 TMEM59 980342 sc-eQTL 1.18e-02 -0.346 0.136 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000116221 MRPL37 849805 sc-eQTL 3.01e-01 -0.176 0.17 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000157216 SSBP3 620367 sc-eQTL 9.39e-01 0.011 0.143 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000162398 LEXM 227783 sc-eQTL 7.79e-01 0.0501 0.179 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000162402 USP24 -181518 sc-eQTL 8.53e-01 0.0226 0.122 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000243725 TTC4 317985 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0341 0.181 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000006555 TTC22 232523 sc-eQTL 8.17e-01 0.0523 0.226 0.059 PB L2
ENSG00000116133 DHCR24 146651 sc-eQTL 9.48e-01 0.013 0.2 0.059 PB L2
ENSG00000116205 TCEANC2 980262 sc-eQTL 2.08e-01 0.306 0.242 0.059 PB L2
ENSG00000116209 TMEM59 980342 sc-eQTL 9.92e-01 0.00106 0.102 0.059 PB L2
ENSG00000116221 MRPL37 849805 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0829 0.185 0.059 PB L2
ENSG00000157216 SSBP3 620367 sc-eQTL 7.71e-01 0.0623 0.214 0.059 PB L2
ENSG00000162402 USP24 -181518 sc-eQTL 6.32e-01 0.117 0.242 0.059 PB L2
ENSG00000215883 CYB5RL 833810 sc-eQTL 5.43e-01 -0.153 0.251 0.059 PB L2
ENSG00000243725 TTC4 317985 sc-eQTL 9.08e-01 0.0273 0.235 0.059 PB L2
ENSG00000006555 TTC22 232523 sc-eQTL 5.41e-01 0.104 0.17 0.063 Pro_T L2
ENSG00000116133 DHCR24 146651 sc-eQTL 9.55e-02 0.241 0.144 0.063 Pro_T L2
ENSG00000116205 TCEANC2 980262 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0716 0.177 0.063 Pro_T L2
ENSG00000116209 TMEM59 980342 sc-eQTL 5.01e-01 0.0828 0.123 0.063 Pro_T L2
ENSG00000116221 MRPL37 849805 sc-eQTL 9.19e-01 0.0123 0.12 0.063 Pro_T L2
ENSG00000157216 SSBP3 620367 sc-eQTL 2.63e-02 0.298 0.133 0.063 Pro_T L2
ENSG00000162402 USP24 -181518 sc-eQTL 4.19e-01 0.133 0.164 0.063 Pro_T L2
ENSG00000215883 CYB5RL 833810 sc-eQTL 8.61e-02 0.278 0.161 0.063 Pro_T L2
ENSG00000243725 TTC4 317985 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0357 0.181 0.063 Pro_T L2
ENSG00000006555 TTC22 232523 sc-eQTL 7.46e-01 0.0557 0.172 0.062 Treg L2
ENSG00000116205 TCEANC2 980262 sc-eQTL 5.42e-01 -0.113 0.184 0.062 Treg L2
ENSG00000116209 TMEM59 980342 sc-eQTL 8.41e-01 0.0292 0.146 0.062 Treg L2
ENSG00000116221 MRPL37 849805 sc-eQTL 4.56e-01 0.135 0.18 0.062 Treg L2
ENSG00000157216 SSBP3 620367 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0437 0.161 0.062 Treg L2
ENSG00000162402 USP24 -181518 sc-eQTL 3.38e-01 -0.147 0.153 0.062 Treg L2
ENSG00000243725 TTC4 317985 sc-eQTL 2.78e-01 -0.21 0.193 0.062 Treg L2
ENSG00000116133 DHCR24 146651 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0785 0.153 0.066 cDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 980262 sc-eQTL 3.49e-01 -0.169 0.18 0.066 cDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 980342 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0937 0.153 0.066 cDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 849805 sc-eQTL 5.34e-02 -0.377 0.194 0.066 cDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 620367 sc-eQTL 3.17e-01 -0.181 0.18 0.066 cDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 491589 sc-eQTL 3.69e-01 -0.151 0.167 0.066 cDC L2
ENSG00000162402 USP24 -181518 sc-eQTL 2.45e-01 0.219 0.187 0.066 cDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 833810 sc-eQTL 1.34e-02 0.397 0.159 0.066 cDC L2
ENSG00000243725 TTC4 317985 sc-eQTL 3.80e-01 -0.169 0.193 0.066 cDC L2
ENSG00000116133 DHCR24 146651 sc-eQTL 8.72e-01 0.0178 0.11 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000116205 TCEANC2 980262 sc-eQTL 1.58e-01 -0.215 0.152 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000116209 TMEM59 980342 sc-eQTL 6.98e-01 0.0359 0.0925 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000116221 MRPL37 849805 sc-eQTL 1.12e-01 0.261 0.164 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000157216 SSBP3 620367 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0325 0.168 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000162402 USP24 -181518 sc-eQTL 6.77e-01 0.0519 0.124 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000243725 TTC4 317985 sc-eQTL 8.57e-01 0.0342 0.19 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000116133 DHCR24 146651 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00586 0.103 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000116205 TCEANC2 980262 sc-eQTL 1.87e-01 0.207 0.156 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000116209 TMEM59 980342 sc-eQTL 5.75e-01 0.0705 0.125 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000116221 MRPL37 849805 sc-eQTL 5.68e-02 0.345 0.18 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000157216 SSBP3 620367 sc-eQTL 1.72e-01 0.257 0.187 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000162402 USP24 -181518 sc-eQTL 7.23e-01 0.0541 0.152 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000243725 TTC4 317985 sc-eQTL 5.97e-01 -0.101 0.191 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000006555 TTC22 232523 sc-eQTL 8.33e-01 0.0355 0.168 0.07 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 146651 sc-eQTL 3.41e-02 0.395 0.185 0.07 gdT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 980262 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0684 0.188 0.07 gdT L2
ENSG00000116209 TMEM59 980342 sc-eQTL 7.90e-01 0.051 0.191 0.07 gdT L2
ENSG00000116221 MRPL37 849805 sc-eQTL 3.97e-01 0.186 0.218 0.07 gdT L2
ENSG00000157216 SSBP3 620367 sc-eQTL 6.81e-01 0.0552 0.134 0.07 gdT L2
ENSG00000162402 USP24 -181518 sc-eQTL 6.40e-01 0.0843 0.18 0.07 gdT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 833810 sc-eQTL 5.19e-01 -0.121 0.187 0.07 gdT L2
ENSG00000243725 TTC4 317985 sc-eQTL 1.05e-01 -0.341 0.209 0.07 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 146651 sc-eQTL 6.25e-02 0.255 0.136 0.064 intMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 980262 sc-eQTL 7.01e-01 0.0657 0.171 0.064 intMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 980342 sc-eQTL 9.67e-01 0.00514 0.125 0.064 intMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 849805 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00296 0.192 0.064 intMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 620367 sc-eQTL 4.93e-01 -0.134 0.196 0.064 intMono L2
ENSG00000162402 USP24 -181518 sc-eQTL 1.66e-01 -0.242 0.174 0.064 intMono L2
ENSG00000243725 TTC4 317985 sc-eQTL 8.18e-01 0.0428 0.186 0.064 intMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 146651 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0443 0.136 0.063 ncMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 980262 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0497 0.17 0.063 ncMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 980342 sc-eQTL 5.07e-02 -0.264 0.134 0.063 ncMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 849805 sc-eQTL 9.48e-01 -0.0115 0.175 0.063 ncMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 620367 sc-eQTL 6.80e-01 0.0791 0.191 0.063 ncMono L2
ENSG00000162402 USP24 -181518 sc-eQTL 2.63e-01 -0.171 0.152 0.063 ncMono L2
ENSG00000243725 TTC4 317985 sc-eQTL 2.21e-01 0.221 0.18 0.063 ncMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 146651 sc-eQTL 4.28e-01 0.131 0.165 0.062 pDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 980262 sc-eQTL 2.48e-01 -0.228 0.197 0.062 pDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 980342 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0565 0.158 0.062 pDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 849805 sc-eQTL 1.81e-01 0.28 0.209 0.062 pDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 620367 sc-eQTL 3.40e-02 0.393 0.184 0.062 pDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 491589 sc-eQTL 8.15e-01 0.0183 0.0783 0.062 pDC L2
ENSG00000162402 USP24 -181518 sc-eQTL 6.75e-01 0.0556 0.132 0.062 pDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 833810 sc-eQTL 5.68e-01 -0.103 0.181 0.062 pDC L2
ENSG00000243725 TTC4 317985 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0732 0.209 0.062 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 232523 sc-eQTL 9.88e-01 0.00261 0.178 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 146651 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0929 0.179 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 980262 sc-eQTL 2.56e-01 -0.196 0.172 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 980342 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0257 0.134 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 849805 sc-eQTL 3.35e-01 -0.155 0.16 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 620367 sc-eQTL 2.26e-01 0.169 0.139 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -181518 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0775 0.127 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 833810 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0382 0.196 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 317985 sc-eQTL 3.69e-01 -0.158 0.176 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 232523 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0535 0.188 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 146651 sc-eQTL 1.38e-01 0.252 0.169 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 980262 sc-eQTL 4.92e-01 0.105 0.153 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 980342 sc-eQTL 4.50e-01 0.0823 0.109 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 849805 sc-eQTL 2.43e-01 -0.183 0.156 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 620367 sc-eQTL 2.57e-01 0.159 0.14 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -181518 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0416 0.12 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 833810 sc-eQTL 6.94e-03 -0.51 0.187 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 317985 sc-eQTL 7.98e-01 0.0459 0.179 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 146651 sc-eQTL 9.75e-01 0.00338 0.106 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 980262 sc-eQTL 9.34e-01 0.011 0.133 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 980342 sc-eQTL 6.26e-01 0.0448 0.0917 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 849805 sc-eQTL 3.34e-02 0.344 0.161 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 620367 sc-eQTL 5.15e-01 0.111 0.17 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -181518 sc-eQTL 6.96e-01 0.0455 0.116 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 317985 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00858 0.193 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 146651 sc-eQTL 2.72e-01 0.144 0.131 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 980262 sc-eQTL 7.74e-01 0.0494 0.172 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 980342 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0918 0.128 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 849805 sc-eQTL 5.03e-01 -0.118 0.175 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 620367 sc-eQTL 3.86e-01 -0.162 0.187 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -181518 sc-eQTL 6.25e-02 -0.274 0.146 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 317985 sc-eQTL 1.94e-01 0.24 0.184 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 232523 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0867 0.155 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 146651 sc-eQTL 1.47e-01 0.234 0.161 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 980262 sc-eQTL 9.29e-01 -0.0142 0.158 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 980342 sc-eQTL 3.55e-01 -0.113 0.122 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 849805 sc-eQTL 6.77e-01 0.0685 0.164 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 620367 sc-eQTL 6.80e-01 0.0557 0.135 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162398 LEXM 227783 sc-eQTL 3.82e-01 0.133 0.152 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -181518 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0625 0.0962 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 317985 sc-eQTL 2.04e-01 -0.217 0.171 0.062 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000162398 LEXM 227783 eQTL 0.0208 0.0905 0.0391 0.0 0.0 0.0711
ENSG00000169174 PCSK9 -5702 pQTL 0.0461 -0.104 0.0522 0.0 0.0 0.0733
ENSG00000169174 PCSK9 -5702 eQTL 0.00388 -0.0922 0.0319 0.0 0.0 0.0711

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000162398 LEXM 227783 1.3e-06 1.24e-06 2.95e-07 1.23e-06 3.58e-07 6.25e-07 1.49e-06 4.1e-07 1.47e-06 5.99e-07 2.01e-06 8.26e-07 2.52e-06 2.82e-07 5.42e-07 9.92e-07 9.64e-07 9.53e-07 7.29e-07 5.11e-07 8.02e-07 1.81e-06 1.12e-06 5.47e-07 2.41e-06 6.58e-07 9.45e-07 9.25e-07 1.62e-06 1.3e-06 7.79e-07 2.42e-07 2.88e-07 6.06e-07 5.31e-07 5.24e-07 6.89e-07 2.78e-07 4.87e-07 3.35e-07 2.59e-07 1.8e-06 1.37e-07 1.66e-07 2.95e-07 1.46e-07 2.46e-07 1.49e-07 1.6e-07