Genes within 1Mb (chr1:55031246:C:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 229923 sc-eQTL 5.55e-01 -0.104 0.176 0.062 B L1
ENSG00000116133 DHCR24 144051 sc-eQTL 7.90e-01 0.0446 0.167 0.062 B L1
ENSG00000116205 TCEANC2 977662 sc-eQTL 4.03e-01 0.12 0.144 0.062 B L1
ENSG00000116209 TMEM59 977742 sc-eQTL 6.74e-01 -0.037 0.0877 0.062 B L1
ENSG00000116221 MRPL37 847205 sc-eQTL 8.68e-02 -0.196 0.114 0.062 B L1
ENSG00000157216 SSBP3 617767 sc-eQTL 2.47e-01 0.139 0.12 0.062 B L1
ENSG00000162402 USP24 -184118 sc-eQTL 2.39e-01 -0.12 0.102 0.062 B L1
ENSG00000215883 CYB5RL 831210 sc-eQTL 7.44e-02 -0.349 0.195 0.062 B L1
ENSG00000243725 TTC4 315385 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0289 0.171 0.062 B L1
ENSG00000006555 TTC22 229923 sc-eQTL 1.20e-01 0.213 0.137 0.062 CD4T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 977662 sc-eQTL 2.67e-01 -0.125 0.112 0.062 CD4T L1
ENSG00000116209 TMEM59 977742 sc-eQTL 6.69e-01 0.0448 0.105 0.062 CD4T L1
ENSG00000116221 MRPL37 847205 sc-eQTL 3.27e-01 0.142 0.144 0.062 CD4T L1
ENSG00000157216 SSBP3 617767 sc-eQTL 1.61e-01 0.168 0.12 0.062 CD4T L1
ENSG00000162402 USP24 -184118 sc-eQTL 5.21e-01 0.0629 0.0978 0.062 CD4T L1
ENSG00000243725 TTC4 315385 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0479 0.147 0.062 CD4T L1
ENSG00000006555 TTC22 229923 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0486 0.12 0.062 CD8T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 977662 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0303 0.149 0.062 CD8T L1
ENSG00000116209 TMEM59 977742 sc-eQTL 7.45e-01 0.0338 0.104 0.062 CD8T L1
ENSG00000116221 MRPL37 847205 sc-eQTL 1.87e-01 0.188 0.142 0.062 CD8T L1
ENSG00000157216 SSBP3 617767 sc-eQTL 1.60e-01 0.144 0.102 0.062 CD8T L1
ENSG00000162402 USP24 -184118 sc-eQTL 3.31e-01 -0.0963 0.0989 0.062 CD8T L1
ENSG00000243725 TTC4 315385 sc-eQTL 4.85e-01 0.12 0.172 0.062 CD8T L1
ENSG00000116133 DHCR24 144051 sc-eQTL 1.36e-01 0.231 0.154 0.065 DC L1
ENSG00000116205 TCEANC2 977662 sc-eQTL 1.32e-01 -0.261 0.173 0.065 DC L1
ENSG00000116209 TMEM59 977742 sc-eQTL 4.08e-01 -0.113 0.136 0.065 DC L1
ENSG00000116221 MRPL37 847205 sc-eQTL 4.03e-01 -0.153 0.183 0.065 DC L1
ENSG00000157216 SSBP3 617767 sc-eQTL 4.45e-01 0.125 0.163 0.065 DC L1
ENSG00000162390 ACOT11 488989 sc-eQTL 2.81e-01 -0.17 0.157 0.065 DC L1
ENSG00000162402 USP24 -184118 sc-eQTL 3.06e-01 0.0971 0.0947 0.065 DC L1
ENSG00000215883 CYB5RL 831210 sc-eQTL 7.39e-01 0.0573 0.172 0.065 DC L1
ENSG00000243725 TTC4 315385 sc-eQTL 2.35e-01 -0.219 0.184 0.065 DC L1
ENSG00000116133 DHCR24 144051 sc-eQTL 5.66e-01 0.0651 0.113 0.062 Mono L1
ENSG00000116205 TCEANC2 977662 sc-eQTL 5.47e-01 0.0737 0.122 0.062 Mono L1
ENSG00000116209 TMEM59 977742 sc-eQTL 4.34e-01 0.0711 0.0908 0.062 Mono L1
ENSG00000116221 MRPL37 847205 sc-eQTL 2.68e-01 0.168 0.152 0.062 Mono L1
ENSG00000157216 SSBP3 617767 sc-eQTL 9.55e-01 0.00989 0.174 0.062 Mono L1
ENSG00000162402 USP24 -184118 sc-eQTL 3.35e-01 -0.1 0.104 0.062 Mono L1
ENSG00000243725 TTC4 315385 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00814 0.183 0.062 Mono L1
ENSG00000006555 TTC22 229923 sc-eQTL 2.18e-01 -0.195 0.158 0.062 NK L1
ENSG00000116133 DHCR24 144051 sc-eQTL 2.72e-01 0.176 0.159 0.062 NK L1
ENSG00000116205 TCEANC2 977662 sc-eQTL 8.59e-01 -0.028 0.158 0.062 NK L1
ENSG00000116209 TMEM59 977742 sc-eQTL 2.93e-01 -0.13 0.123 0.062 NK L1
ENSG00000116221 MRPL37 847205 sc-eQTL 8.99e-01 0.0195 0.154 0.062 NK L1
ENSG00000157216 SSBP3 617767 sc-eQTL 6.65e-01 0.0578 0.133 0.062 NK L1
ENSG00000162398 LEXM 225183 sc-eQTL 2.08e-01 0.188 0.149 0.062 NK L1
ENSG00000162402 USP24 -184118 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0115 0.0907 0.062 NK L1
ENSG00000243725 TTC4 315385 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0372 0.171 0.062 NK L1
ENSG00000006555 TTC22 229923 sc-eQTL 8.33e-01 0.0295 0.14 0.062 Other_T L1
ENSG00000116133 DHCR24 144051 sc-eQTL 1.35e-02 0.266 0.107 0.062 Other_T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 977662 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0985 0.162 0.062 Other_T L1
ENSG00000116209 TMEM59 977742 sc-eQTL 7.75e-01 0.0318 0.111 0.062 Other_T L1
ENSG00000116221 MRPL37 847205 sc-eQTL 3.19e-01 0.104 0.104 0.062 Other_T L1
ENSG00000157216 SSBP3 617767 sc-eQTL 1.59e-01 0.17 0.12 0.062 Other_T L1
ENSG00000162402 USP24 -184118 sc-eQTL 4.60e-01 0.0949 0.128 0.062 Other_T L1
ENSG00000215883 CYB5RL 831210 sc-eQTL 4.89e-01 -0.122 0.175 0.062 Other_T L1
ENSG00000243725 TTC4 315385 sc-eQTL 3.19e-01 -0.174 0.175 0.062 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 229923 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0303 0.149 0.064 B_Activated L2
ENSG00000116133 DHCR24 144051 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0906 0.175 0.064 B_Activated L2
ENSG00000116205 TCEANC2 977662 sc-eQTL 5.04e-01 -0.126 0.188 0.064 B_Activated L2
ENSG00000116209 TMEM59 977742 sc-eQTL 8.11e-01 0.0479 0.2 0.064 B_Activated L2
ENSG00000116221 MRPL37 847205 sc-eQTL 9.60e-01 0.0108 0.216 0.064 B_Activated L2
ENSG00000157216 SSBP3 617767 sc-eQTL 4.87e-01 0.136 0.195 0.064 B_Activated L2
ENSG00000162402 USP24 -184118 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0475 0.191 0.064 B_Activated L2
ENSG00000215883 CYB5RL 831210 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0808 0.168 0.064 B_Activated L2
ENSG00000243725 TTC4 315385 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0909 0.183 0.064 B_Activated L2
ENSG00000006555 TTC22 229923 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0656 0.186 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000116133 DHCR24 144051 sc-eQTL 1.63e-01 -0.24 0.172 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000116205 TCEANC2 977662 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0862 0.172 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000116209 TMEM59 977742 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0199 0.147 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000116221 MRPL37 847205 sc-eQTL 2.17e-01 -0.213 0.172 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000157216 SSBP3 617767 sc-eQTL 2.47e-01 0.187 0.161 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000162402 USP24 -184118 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0434 0.136 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000215883 CYB5RL 831210 sc-eQTL 4.17e-01 0.156 0.192 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000243725 TTC4 315385 sc-eQTL 6.72e-01 0.0742 0.175 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000006555 TTC22 229923 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00767 0.177 0.062 B_Memory L2
ENSG00000116133 DHCR24 144051 sc-eQTL 2.86e-01 0.188 0.176 0.062 B_Memory L2
ENSG00000116205 TCEANC2 977662 sc-eQTL 3.03e-01 -0.194 0.188 0.062 B_Memory L2
ENSG00000116209 TMEM59 977742 sc-eQTL 1.57e-01 -0.222 0.156 0.062 B_Memory L2
ENSG00000116221 MRPL37 847205 sc-eQTL 4.24e-01 0.127 0.159 0.062 B_Memory L2
ENSG00000157216 SSBP3 617767 sc-eQTL 8.53e-01 0.0276 0.148 0.062 B_Memory L2
ENSG00000162402 USP24 -184118 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0426 0.145 0.062 B_Memory L2
ENSG00000215883 CYB5RL 831210 sc-eQTL 3.55e-01 -0.166 0.179 0.062 B_Memory L2
ENSG00000243725 TTC4 315385 sc-eQTL 1.09e-01 -0.298 0.185 0.062 B_Memory L2
ENSG00000006555 TTC22 229923 sc-eQTL 3.69e-01 -0.168 0.186 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000116133 DHCR24 144051 sc-eQTL 7.33e-01 0.0597 0.175 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 977662 sc-eQTL 5.12e-02 0.303 0.155 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000116209 TMEM59 977742 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00364 0.113 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000116221 MRPL37 847205 sc-eQTL 5.12e-01 -0.11 0.167 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000157216 SSBP3 617767 sc-eQTL 1.32e-01 0.24 0.158 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000162402 USP24 -184118 sc-eQTL 3.35e-01 -0.121 0.125 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 831210 sc-eQTL 2.44e-01 -0.22 0.189 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000243725 TTC4 315385 sc-eQTL 3.92e-01 0.146 0.171 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000006555 TTC22 229923 sc-eQTL 2.43e-01 0.217 0.185 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000116133 DHCR24 144051 sc-eQTL 3.72e-02 0.336 0.16 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 977662 sc-eQTL 6.50e-01 0.0814 0.179 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000116209 TMEM59 977742 sc-eQTL 2.01e-01 0.189 0.147 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000116221 MRPL37 847205 sc-eQTL 1.14e-01 -0.275 0.173 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000157216 SSBP3 617767 sc-eQTL 2.33e-01 -0.204 0.171 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000162402 USP24 -184118 sc-eQTL 9.71e-01 0.00486 0.136 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 831210 sc-eQTL 5.79e-02 -0.361 0.189 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000243725 TTC4 315385 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0422 0.199 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000006555 TTC22 229923 sc-eQTL 6.36e-02 0.319 0.171 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 977662 sc-eQTL 3.19e-01 0.177 0.177 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 977742 sc-eQTL 9.24e-01 0.0155 0.162 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 847205 sc-eQTL 8.90e-01 0.0276 0.199 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 617767 sc-eQTL 6.51e-01 0.0554 0.122 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -184118 sc-eQTL 3.29e-01 0.164 0.167 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 315385 sc-eQTL 5.13e-01 0.123 0.188 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 229923 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00376 0.162 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 977662 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0461 0.123 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 977742 sc-eQTL 9.61e-01 0.0058 0.12 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 847205 sc-eQTL 4.17e-01 0.125 0.154 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 617767 sc-eQTL 8.59e-01 0.0219 0.123 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -184118 sc-eQTL 7.75e-01 0.0304 0.106 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 315385 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00891 0.162 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 229923 sc-eQTL 1.34e-02 0.423 0.17 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 977662 sc-eQTL 2.66e-01 -0.186 0.167 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 977742 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0358 0.126 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 847205 sc-eQTL 8.19e-02 0.276 0.158 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 617767 sc-eQTL 4.58e-01 0.116 0.155 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -184118 sc-eQTL 2.31e-01 -0.154 0.129 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 315385 sc-eQTL 5.65e-01 0.107 0.186 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 229923 sc-eQTL 5.21e-01 0.125 0.194 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 977662 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0857 0.184 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 977742 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0126 0.143 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 847205 sc-eQTL 6.85e-01 0.0747 0.184 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 617767 sc-eQTL 3.40e-01 0.151 0.157 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -184118 sc-eQTL 6.41e-01 -0.067 0.143 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 315385 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00866 0.19 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 229923 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0828 0.157 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 977662 sc-eQTL 9.32e-01 -0.0149 0.174 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 977742 sc-eQTL 6.90e-01 0.0606 0.152 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 847205 sc-eQTL 4.53e-01 0.135 0.18 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 617767 sc-eQTL 4.58e-01 0.0913 0.123 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -184118 sc-eQTL 3.68e-01 -0.11 0.122 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 315385 sc-eQTL 5.33e-01 -0.114 0.183 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 229923 sc-eQTL 4.42e-01 -0.133 0.172 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 977662 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0881 0.156 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 977742 sc-eQTL 4.52e-01 0.115 0.153 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 847205 sc-eQTL 2.18e-01 0.226 0.183 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 617767 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0422 0.139 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -184118 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0936 0.126 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 315385 sc-eQTL 4.80e-01 0.13 0.184 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 229923 sc-eQTL 5.00e-01 -0.126 0.186 0.065 CD8_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 977662 sc-eQTL 3.57e-01 -0.173 0.187 0.065 CD8_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 977742 sc-eQTL 6.68e-01 -0.071 0.165 0.065 CD8_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 847205 sc-eQTL 5.58e-01 0.11 0.187 0.065 CD8_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 617767 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0893 0.162 0.065 CD8_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -184118 sc-eQTL 5.59e-01 0.092 0.157 0.065 CD8_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 315385 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0994 0.191 0.065 CD8_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 229923 sc-eQTL 5.01e-01 0.123 0.183 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 977662 sc-eQTL 4.96e-01 0.13 0.191 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 977742 sc-eQTL 4.90e-01 -0.128 0.185 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 847205 sc-eQTL 3.70e-01 0.168 0.187 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 617767 sc-eQTL 7.59e-01 0.0545 0.177 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -184118 sc-eQTL 2.18e-01 -0.23 0.186 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 315385 sc-eQTL 3.13e-01 0.191 0.189 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 229923 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0389 0.168 0.063 MAIT L2
ENSG00000116133 DHCR24 144051 sc-eQTL 6.93e-01 0.0491 0.124 0.063 MAIT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 977662 sc-eQTL 2.72e-01 -0.192 0.174 0.063 MAIT L2
ENSG00000116209 TMEM59 977742 sc-eQTL 8.47e-01 0.0305 0.158 0.063 MAIT L2
ENSG00000116221 MRPL37 847205 sc-eQTL 6.01e-01 0.1 0.192 0.063 MAIT L2
ENSG00000157216 SSBP3 617767 sc-eQTL 4.10e-01 0.14 0.17 0.063 MAIT L2
ENSG00000162402 USP24 -184118 sc-eQTL 3.70e-01 -0.135 0.151 0.063 MAIT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 831210 sc-eQTL 2.81e-01 -0.189 0.175 0.063 MAIT L2
ENSG00000243725 TTC4 315385 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0946 0.174 0.063 MAIT L2
ENSG00000006555 TTC22 229923 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0777 0.19 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000116133 DHCR24 144051 sc-eQTL 7.93e-01 0.044 0.167 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000116205 TCEANC2 977662 sc-eQTL 4.94e-01 -0.121 0.177 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000116209 TMEM59 977742 sc-eQTL 4.92e-01 0.119 0.172 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000116221 MRPL37 847205 sc-eQTL 3.31e-01 0.188 0.192 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000157216 SSBP3 617767 sc-eQTL 4.54e-01 -0.109 0.145 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000162398 LEXM 225183 sc-eQTL 9.68e-03 0.441 0.169 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000162402 USP24 -184118 sc-eQTL 5.84e-01 -0.081 0.148 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000243725 TTC4 315385 sc-eQTL 2.32e-02 0.421 0.184 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000006555 TTC22 229923 sc-eQTL 1.41e-01 -0.233 0.158 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000116133 DHCR24 144051 sc-eQTL 8.73e-02 0.282 0.164 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000116205 TCEANC2 977662 sc-eQTL 7.69e-01 0.0527 0.179 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000116209 TMEM59 977742 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0406 0.133 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000116221 MRPL37 847205 sc-eQTL 5.79e-01 0.0959 0.173 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000157216 SSBP3 617767 sc-eQTL 6.34e-01 0.0673 0.141 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000162398 LEXM 225183 sc-eQTL 2.02e-01 0.208 0.162 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000162402 USP24 -184118 sc-eQTL 1.96e-01 -0.133 0.103 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000243725 TTC4 315385 sc-eQTL 2.07e-01 -0.223 0.176 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000006555 TTC22 229923 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0588 0.192 0.066 NK_HLA L2
ENSG00000116133 DHCR24 144051 sc-eQTL 9.81e-01 0.00446 0.188 0.066 NK_HLA L2
ENSG00000116205 TCEANC2 977662 sc-eQTL 2.73e-01 0.199 0.18 0.066 NK_HLA L2
ENSG00000116209 TMEM59 977742 sc-eQTL 7.98e-01 0.0461 0.18 0.066 NK_HLA L2
ENSG00000116221 MRPL37 847205 sc-eQTL 1.34e-01 0.296 0.197 0.066 NK_HLA L2
ENSG00000157216 SSBP3 617767 sc-eQTL 5.03e-01 0.108 0.161 0.066 NK_HLA L2
ENSG00000162398 LEXM 225183 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00365 0.182 0.066 NK_HLA L2
ENSG00000162402 USP24 -184118 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0764 0.134 0.066 NK_HLA L2
ENSG00000243725 TTC4 315385 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0699 0.2 0.066 NK_HLA L2
ENSG00000006555 TTC22 229923 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0398 0.17 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000116133 DHCR24 144051 sc-eQTL 2.67e-01 0.191 0.171 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000116205 TCEANC2 977662 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00332 0.17 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000116209 TMEM59 977742 sc-eQTL 1.13e-03 -0.446 0.135 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000116221 MRPL37 847205 sc-eQTL 8.74e-02 -0.291 0.169 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000157216 SSBP3 617767 sc-eQTL 6.49e-01 0.0652 0.143 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000162398 LEXM 225183 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0824 0.179 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000162402 USP24 -184118 sc-eQTL 7.97e-01 0.0313 0.122 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000243725 TTC4 315385 sc-eQTL 9.75e-01 0.00577 0.181 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000006555 TTC22 229923 sc-eQTL 4.94e-01 0.153 0.223 0.059 PB L2
ENSG00000116133 DHCR24 144051 sc-eQTL 6.41e-01 0.0925 0.198 0.059 PB L2
ENSG00000116205 TCEANC2 977662 sc-eQTL 2.71e-01 0.265 0.24 0.059 PB L2
ENSG00000116209 TMEM59 977742 sc-eQTL 6.22e-01 0.0499 0.101 0.059 PB L2
ENSG00000116221 MRPL37 847205 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0896 0.183 0.059 PB L2
ENSG00000157216 SSBP3 617767 sc-eQTL 6.40e-01 0.0992 0.212 0.059 PB L2
ENSG00000162402 USP24 -184118 sc-eQTL 6.72e-01 0.102 0.24 0.059 PB L2
ENSG00000215883 CYB5RL 831210 sc-eQTL 4.00e-01 -0.21 0.248 0.059 PB L2
ENSG00000243725 TTC4 315385 sc-eQTL 2.28e-01 0.28 0.231 0.059 PB L2
ENSG00000006555 TTC22 229923 sc-eQTL 8.27e-01 0.0372 0.17 0.063 Pro_T L2
ENSG00000116133 DHCR24 144051 sc-eQTL 7.23e-02 0.259 0.143 0.063 Pro_T L2
ENSG00000116205 TCEANC2 977662 sc-eQTL 3.81e-01 -0.155 0.176 0.063 Pro_T L2
ENSG00000116209 TMEM59 977742 sc-eQTL 5.36e-01 0.0759 0.122 0.063 Pro_T L2
ENSG00000116221 MRPL37 847205 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0473 0.12 0.063 Pro_T L2
ENSG00000157216 SSBP3 617767 sc-eQTL 6.08e-02 0.251 0.133 0.063 Pro_T L2
ENSG00000162402 USP24 -184118 sc-eQTL 2.68e-01 0.182 0.164 0.063 Pro_T L2
ENSG00000215883 CYB5RL 831210 sc-eQTL 3.68e-01 0.146 0.162 0.063 Pro_T L2
ENSG00000243725 TTC4 315385 sc-eQTL 9.95e-01 -0.00124 0.18 0.063 Pro_T L2
ENSG00000006555 TTC22 229923 sc-eQTL 8.92e-01 0.0234 0.172 0.062 Treg L2
ENSG00000116205 TCEANC2 977662 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0408 0.184 0.062 Treg L2
ENSG00000116209 TMEM59 977742 sc-eQTL 5.49e-01 0.0873 0.146 0.062 Treg L2
ENSG00000116221 MRPL37 847205 sc-eQTL 4.36e-01 0.141 0.18 0.062 Treg L2
ENSG00000157216 SSBP3 617767 sc-eQTL 9.67e-01 0.00676 0.161 0.062 Treg L2
ENSG00000162402 USP24 -184118 sc-eQTL 3.17e-01 -0.153 0.153 0.062 Treg L2
ENSG00000243725 TTC4 315385 sc-eQTL 3.13e-01 -0.195 0.193 0.062 Treg L2
ENSG00000116133 DHCR24 144051 sc-eQTL 6.96e-01 0.0602 0.153 0.066 cDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 977662 sc-eQTL 3.26e-01 -0.178 0.181 0.066 cDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 977742 sc-eQTL 3.98e-01 -0.13 0.154 0.066 cDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 847205 sc-eQTL 1.16e-01 -0.309 0.195 0.066 cDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 617767 sc-eQTL 4.13e-01 -0.149 0.181 0.066 cDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 488989 sc-eQTL 1.85e-01 -0.223 0.168 0.066 cDC L2
ENSG00000162402 USP24 -184118 sc-eQTL 4.56e-01 0.141 0.189 0.066 cDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 831210 sc-eQTL 8.08e-02 0.283 0.161 0.066 cDC L2
ENSG00000243725 TTC4 315385 sc-eQTL 4.34e-01 -0.152 0.194 0.066 cDC L2
ENSG00000116133 DHCR24 144051 sc-eQTL 6.05e-01 0.0566 0.109 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000116205 TCEANC2 977662 sc-eQTL 1.61e-01 -0.213 0.151 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000116209 TMEM59 977742 sc-eQTL 4.60e-01 0.0681 0.0919 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000116221 MRPL37 847205 sc-eQTL 1.38e-01 0.243 0.163 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000157216 SSBP3 617767 sc-eQTL 5.87e-01 -0.091 0.167 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000162402 USP24 -184118 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00481 0.124 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000243725 TTC4 315385 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0184 0.189 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000116133 DHCR24 144051 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0538 0.103 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000116205 TCEANC2 977662 sc-eQTL 8.14e-02 0.272 0.156 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000116209 TMEM59 977742 sc-eQTL 4.27e-01 0.0995 0.125 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000116221 MRPL37 847205 sc-eQTL 2.63e-01 0.203 0.181 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000157216 SSBP3 617767 sc-eQTL 3.17e-01 0.188 0.188 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000162402 USP24 -184118 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0311 0.152 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000243725 TTC4 315385 sc-eQTL 6.71e-01 -0.081 0.191 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000006555 TTC22 229923 sc-eQTL 8.46e-01 0.0327 0.168 0.067 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 144051 sc-eQTL 1.34e-02 0.459 0.183 0.067 gdT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 977662 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0709 0.188 0.067 gdT L2
ENSG00000116209 TMEM59 977742 sc-eQTL 8.01e-01 0.0481 0.191 0.067 gdT L2
ENSG00000116221 MRPL37 847205 sc-eQTL 4.51e-01 0.165 0.218 0.067 gdT L2
ENSG00000157216 SSBP3 617767 sc-eQTL 3.12e-01 0.135 0.134 0.067 gdT L2
ENSG00000162402 USP24 -184118 sc-eQTL 6.91e-01 0.0716 0.18 0.067 gdT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 831210 sc-eQTL 3.49e-01 -0.175 0.187 0.067 gdT L2
ENSG00000243725 TTC4 315385 sc-eQTL 2.58e-01 -0.238 0.21 0.067 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 144051 sc-eQTL 1.80e-01 0.183 0.136 0.064 intMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 977662 sc-eQTL 6.69e-01 0.0729 0.17 0.064 intMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 977742 sc-eQTL 6.88e-01 0.0503 0.125 0.064 intMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 847205 sc-eQTL 7.65e-01 0.0573 0.191 0.064 intMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 617767 sc-eQTL 4.14e-01 -0.16 0.195 0.064 intMono L2
ENSG00000162402 USP24 -184118 sc-eQTL 2.15e-01 -0.216 0.174 0.064 intMono L2
ENSG00000243725 TTC4 315385 sc-eQTL 7.10e-01 -0.069 0.185 0.064 intMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 144051 sc-eQTL 7.98e-01 0.0349 0.136 0.063 ncMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 977662 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0263 0.17 0.063 ncMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 977742 sc-eQTL 8.39e-02 -0.235 0.135 0.063 ncMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 847205 sc-eQTL 8.14e-01 0.0414 0.176 0.063 ncMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 617767 sc-eQTL 4.28e-01 0.152 0.192 0.063 ncMono L2
ENSG00000162402 USP24 -184118 sc-eQTL 1.13e-01 -0.243 0.152 0.063 ncMono L2
ENSG00000243725 TTC4 315385 sc-eQTL 1.77e-01 0.245 0.181 0.063 ncMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 144051 sc-eQTL 3.43e-01 0.155 0.163 0.062 pDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 977662 sc-eQTL 1.51e-01 -0.282 0.195 0.062 pDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 977742 sc-eQTL 9.85e-01 0.00296 0.157 0.062 pDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 847205 sc-eQTL 1.61e-01 0.292 0.207 0.062 pDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 617767 sc-eQTL 1.95e-01 0.239 0.184 0.062 pDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 488989 sc-eQTL 8.92e-01 0.0106 0.0778 0.062 pDC L2
ENSG00000162402 USP24 -184118 sc-eQTL 7.22e-01 0.0469 0.131 0.062 pDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 831210 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0177 0.18 0.062 pDC L2
ENSG00000243725 TTC4 315385 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0608 0.207 0.062 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 229923 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0391 0.178 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 144051 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0463 0.179 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 977662 sc-eQTL 1.37e-01 -0.256 0.172 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 977742 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0747 0.134 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 847205 sc-eQTL 3.66e-01 -0.145 0.161 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 617767 sc-eQTL 3.95e-01 0.119 0.14 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -184118 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0552 0.128 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 831210 sc-eQTL 9.46e-01 -0.0132 0.196 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 315385 sc-eQTL 2.35e-01 -0.209 0.175 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 229923 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0735 0.188 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 144051 sc-eQTL 1.27e-01 0.258 0.168 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 977662 sc-eQTL 1.40e-01 0.225 0.152 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 977742 sc-eQTL 4.15e-01 0.0886 0.109 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 847205 sc-eQTL 2.02e-01 -0.199 0.156 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 617767 sc-eQTL 4.87e-01 0.0973 0.14 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -184118 sc-eQTL 3.66e-01 -0.108 0.12 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 831210 sc-eQTL 6.79e-03 -0.51 0.187 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 315385 sc-eQTL 6.46e-01 0.0821 0.179 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 144051 sc-eQTL 9.82e-01 0.00236 0.106 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 977662 sc-eQTL 7.41e-01 0.0439 0.133 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 977742 sc-eQTL 5.03e-01 0.0613 0.0915 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 847205 sc-eQTL 1.02e-01 0.265 0.161 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 617767 sc-eQTL 8.70e-01 0.0277 0.17 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -184118 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0264 0.116 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 315385 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0563 0.192 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 144051 sc-eQTL 4.29e-01 0.104 0.131 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 977662 sc-eQTL 7.66e-01 0.0512 0.172 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 977742 sc-eQTL 8.33e-01 -0.027 0.128 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 847205 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0569 0.175 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 617767 sc-eQTL 5.28e-01 -0.118 0.187 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -184118 sc-eQTL 4.99e-02 -0.288 0.146 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 315385 sc-eQTL 3.49e-01 0.173 0.184 0.062 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 229923 sc-eQTL 2.95e-01 -0.162 0.155 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 144051 sc-eQTL 1.32e-01 0.243 0.161 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 977662 sc-eQTL 9.37e-01 -0.0126 0.159 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 977742 sc-eQTL 2.28e-01 -0.148 0.122 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 847205 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0585 0.164 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 617767 sc-eQTL 3.90e-01 0.116 0.135 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162398 LEXM 225183 sc-eQTL 5.18e-01 0.0985 0.152 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -184118 sc-eQTL 7.09e-01 -0.036 0.0964 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 315385 sc-eQTL 1.95e-01 -0.222 0.171 0.062 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000162398 LEXM 225183 eQTL 0.0032 0.11 0.037 0.00176 0.0 0.081
ENSG00000169174 PCSK9 -8302 pQTL 0.0182 -0.119 0.0503 0.0 0.0 0.0798
ENSG00000169174 PCSK9 -8302 eQTL 0.00962 -0.0786 0.0303 0.0 0.0 0.081


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000162398 LEXM 225183 2.02e-06 2.49e-06 2.91e-07 1.42e-06 3.75e-07 6.91e-07 1.2e-06 4.39e-07 1.75e-06 7.14e-07 1.81e-06 1.27e-06 3.27e-06 6.67e-07 3.88e-07 9.77e-07 1.1e-06 1.29e-06 5.81e-07 4.68e-07 6.67e-07 1.96e-06 1.58e-06 5.94e-07 2.67e-06 9.6e-07 9.97e-07 1e-06 1.72e-06 1.47e-06 8.88e-07 2.57e-07 2.98e-07 6.19e-07 8.1e-07 5.08e-07 7.4e-07 2.94e-07 5.09e-07 2.97e-07 2.99e-07 2.87e-06 3.44e-07 9e-08 3.24e-07 2.15e-07 2.7e-07 5.95e-08 1.56e-07