Genes within 1Mb (chr1:55018909:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 217586 sc-eQTL 9.20e-01 0.0097 0.0964 0.263 B L1
ENSG00000116133 DHCR24 131714 sc-eQTL 4.95e-01 0.0623 0.0911 0.263 B L1
ENSG00000116205 TCEANC2 965325 sc-eQTL 7.66e-01 0.0234 0.0787 0.263 B L1
ENSG00000116209 TMEM59 965405 sc-eQTL 3.70e-01 0.043 0.0478 0.263 B L1
ENSG00000116221 MRPL37 834868 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0497 0.0626 0.263 B L1
ENSG00000157216 SSBP3 605430 sc-eQTL 1.80e-01 0.0881 0.0654 0.263 B L1
ENSG00000162402 USP24 -196455 sc-eQTL 6.69e-01 0.0238 0.0556 0.263 B L1
ENSG00000215883 CYB5RL 818873 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0726 0.107 0.263 B L1
ENSG00000243725 TTC4 303048 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0121 0.0932 0.263 B L1
ENSG00000006555 TTC22 217586 sc-eQTL 4.08e-01 0.0631 0.0761 0.263 CD4T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 965325 sc-eQTL 7.39e-01 0.0208 0.0623 0.263 CD4T L1
ENSG00000116209 TMEM59 965405 sc-eQTL 3.41e-01 0.0553 0.0579 0.263 CD4T L1
ENSG00000116221 MRPL37 834868 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0129 0.0802 0.263 CD4T L1
ENSG00000157216 SSBP3 605430 sc-eQTL 1.61e-02 0.159 0.0657 0.263 CD4T L1
ENSG00000162402 USP24 -196455 sc-eQTL 6.07e-01 0.028 0.0543 0.263 CD4T L1
ENSG00000243725 TTC4 303048 sc-eQTL 1.55e-01 -0.116 0.0813 0.263 CD4T L1
ENSG00000006555 TTC22 217586 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0403 0.0655 0.263 CD8T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 965325 sc-eQTL 4.29e-01 0.0647 0.0816 0.263 CD8T L1
ENSG00000116209 TMEM59 965405 sc-eQTL 5.07e-01 0.0376 0.0567 0.263 CD8T L1
ENSG00000116221 MRPL37 834868 sc-eQTL 5.50e-01 0.0467 0.078 0.263 CD8T L1
ENSG00000157216 SSBP3 605430 sc-eQTL 8.27e-02 0.0971 0.0557 0.263 CD8T L1
ENSG00000162402 USP24 -196455 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000256 0.0542 0.263 CD8T L1
ENSG00000243725 TTC4 303048 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0789 0.0939 0.263 CD8T L1
ENSG00000116133 DHCR24 131714 sc-eQTL 9.18e-01 -0.00899 0.0868 0.266 DC L1
ENSG00000116205 TCEANC2 965325 sc-eQTL 9.38e-02 -0.163 0.0966 0.266 DC L1
ENSG00000116209 TMEM59 965405 sc-eQTL 5.96e-01 0.0406 0.0764 0.266 DC L1
ENSG00000116221 MRPL37 834868 sc-eQTL 3.52e-01 -0.0955 0.102 0.266 DC L1
ENSG00000157216 SSBP3 605430 sc-eQTL 4.85e-01 0.0639 0.0915 0.266 DC L1
ENSG00000162390 ACOT11 476652 sc-eQTL 1.33e-02 0.216 0.0867 0.266 DC L1
ENSG00000162402 USP24 -196455 sc-eQTL 7.20e-06 0.233 0.0505 0.266 DC L1
ENSG00000215883 CYB5RL 818873 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0849 0.0958 0.266 DC L1
ENSG00000243725 TTC4 303048 sc-eQTL 8.46e-01 0.0201 0.103 0.266 DC L1
ENSG00000116133 DHCR24 131714 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0224 0.0632 0.263 Mono L1
ENSG00000116205 TCEANC2 965325 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0104 0.0682 0.263 Mono L1
ENSG00000116209 TMEM59 965405 sc-eQTL 3.51e-01 0.0472 0.0505 0.263 Mono L1
ENSG00000116221 MRPL37 834868 sc-eQTL 9.32e-01 0.0072 0.0847 0.263 Mono L1
ENSG00000157216 SSBP3 605430 sc-eQTL 2.48e-01 0.112 0.0968 0.263 Mono L1
ENSG00000162402 USP24 -196455 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0261 0.0578 0.263 Mono L1
ENSG00000243725 TTC4 303048 sc-eQTL 8.48e-01 0.0195 0.102 0.263 Mono L1
ENSG00000006555 TTC22 217586 sc-eQTL 3.24e-01 -0.0859 0.0869 0.262 NK L1
ENSG00000116133 DHCR24 131714 sc-eQTL 3.92e-01 0.0753 0.0878 0.262 NK L1
ENSG00000116205 TCEANC2 965325 sc-eQTL 9.27e-01 -0.008 0.0867 0.262 NK L1
ENSG00000116209 TMEM59 965405 sc-eQTL 9.87e-01 0.00109 0.068 0.262 NK L1
ENSG00000116221 MRPL37 834868 sc-eQTL 7.18e-01 0.0305 0.0845 0.262 NK L1
ENSG00000157216 SSBP3 605430 sc-eQTL 1.90e-01 0.0959 0.073 0.262 NK L1
ENSG00000162398 LEXM 212846 sc-eQTL 7.05e-01 0.0311 0.0822 0.262 NK L1
ENSG00000162402 USP24 -196455 sc-eQTL 5.16e-01 0.0324 0.0498 0.262 NK L1
ENSG00000243725 TTC4 303048 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0596 0.0942 0.262 NK L1
ENSG00000006555 TTC22 217586 sc-eQTL 3.55e-01 0.0715 0.077 0.263 Other_T L1
ENSG00000116133 DHCR24 131714 sc-eQTL 6.36e-02 0.111 0.0594 0.263 Other_T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 965325 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0278 0.0896 0.263 Other_T L1
ENSG00000116209 TMEM59 965405 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0443 0.0614 0.263 Other_T L1
ENSG00000116221 MRPL37 834868 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0525 0.0575 0.263 Other_T L1
ENSG00000157216 SSBP3 605430 sc-eQTL 5.85e-01 0.0364 0.0666 0.263 Other_T L1
ENSG00000162402 USP24 -196455 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0453 0.0709 0.263 Other_T L1
ENSG00000215883 CYB5RL 818873 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0373 0.097 0.263 Other_T L1
ENSG00000243725 TTC4 303048 sc-eQTL 8.73e-01 0.0155 0.0966 0.263 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 217586 sc-eQTL 1.67e-01 -0.111 0.0801 0.26 B_Activated L2
ENSG00000116133 DHCR24 131714 sc-eQTL 4.81e-01 0.0668 0.0945 0.26 B_Activated L2
ENSG00000116205 TCEANC2 965325 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0818 0.101 0.26 B_Activated L2
ENSG00000116209 TMEM59 965405 sc-eQTL 3.58e-01 0.0992 0.108 0.26 B_Activated L2
ENSG00000116221 MRPL37 834868 sc-eQTL 8.77e-01 0.0181 0.117 0.26 B_Activated L2
ENSG00000157216 SSBP3 605430 sc-eQTL 3.65e-01 0.0957 0.105 0.26 B_Activated L2
ENSG00000162402 USP24 -196455 sc-eQTL 4.95e-02 0.202 0.102 0.26 B_Activated L2
ENSG00000215883 CYB5RL 818873 sc-eQTL 8.44e-01 0.0179 0.0909 0.26 B_Activated L2
ENSG00000243725 TTC4 303048 sc-eQTL 5.21e-01 0.0633 0.0986 0.26 B_Activated L2
ENSG00000006555 TTC22 217586 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0376 0.104 0.262 B_Intermediate L2
ENSG00000116133 DHCR24 131714 sc-eQTL 6.00e-01 0.0508 0.0967 0.262 B_Intermediate L2
ENSG00000116205 TCEANC2 965325 sc-eQTL 3.15e-01 0.0968 0.0961 0.262 B_Intermediate L2
ENSG00000116209 TMEM59 965405 sc-eQTL 1.77e-01 0.111 0.0821 0.262 B_Intermediate L2
ENSG00000116221 MRPL37 834868 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0133 0.097 0.262 B_Intermediate L2
ENSG00000157216 SSBP3 605430 sc-eQTL 3.01e-01 0.0937 0.0904 0.262 B_Intermediate L2
ENSG00000162402 USP24 -196455 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0264 0.0763 0.262 B_Intermediate L2
ENSG00000215883 CYB5RL 818873 sc-eQTL 4.10e-01 0.0891 0.108 0.262 B_Intermediate L2
ENSG00000243725 TTC4 303048 sc-eQTL 8.54e-01 0.0181 0.0983 0.262 B_Intermediate L2
ENSG00000006555 TTC22 217586 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0531 0.0989 0.265 B_Memory L2
ENSG00000116133 DHCR24 131714 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0238 0.0982 0.265 B_Memory L2
ENSG00000116205 TCEANC2 965325 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0473 0.105 0.265 B_Memory L2
ENSG00000116209 TMEM59 965405 sc-eQTL 3.72e-01 0.0782 0.0874 0.265 B_Memory L2
ENSG00000116221 MRPL37 834868 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0434 0.0887 0.265 B_Memory L2
ENSG00000157216 SSBP3 605430 sc-eQTL 7.53e-01 0.0261 0.0828 0.265 B_Memory L2
ENSG00000162402 USP24 -196455 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0511 0.0809 0.265 B_Memory L2
ENSG00000215883 CYB5RL 818873 sc-eQTL 1.22e-01 -0.154 0.0996 0.265 B_Memory L2
ENSG00000243725 TTC4 303048 sc-eQTL 3.47e-01 -0.0975 0.104 0.265 B_Memory L2
ENSG00000006555 TTC22 217586 sc-eQTL 2.52e-01 0.117 0.102 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000116133 DHCR24 131714 sc-eQTL 6.00e-01 0.0505 0.0961 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 965325 sc-eQTL 6.77e-01 0.0358 0.0857 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000116209 TMEM59 965405 sc-eQTL 7.89e-01 0.0167 0.0623 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000116221 MRPL37 834868 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0234 0.0918 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000157216 SSBP3 605430 sc-eQTL 4.85e-01 0.0612 0.0874 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000162402 USP24 -196455 sc-eQTL 2.94e-01 -0.0723 0.0687 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 818873 sc-eQTL 1.86e-01 -0.137 0.104 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000243725 TTC4 303048 sc-eQTL 6.96e-01 0.0367 0.0938 0.263 B_Naive1 L2
ENSG00000006555 TTC22 217586 sc-eQTL 6.03e-01 0.0533 0.102 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000116133 DHCR24 131714 sc-eQTL 1.14e-01 0.141 0.0888 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 965325 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0168 0.0991 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000116209 TMEM59 965405 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00459 0.0816 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000116221 MRPL37 834868 sc-eQTL 5.19e-01 -0.062 0.096 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000157216 SSBP3 605430 sc-eQTL 5.78e-01 0.0527 0.0945 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000162402 USP24 -196455 sc-eQTL 3.22e-01 0.0742 0.0748 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 818873 sc-eQTL 9.64e-01 0.00478 0.106 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000243725 TTC4 303048 sc-eQTL 7.55e-01 0.0344 0.11 0.264 B_Naive2 L2
ENSG00000006555 TTC22 217586 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0265 0.0994 0.268 CD4_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 965325 sc-eQTL 1.50e-01 0.147 0.102 0.268 CD4_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 965405 sc-eQTL 5.94e-01 0.0496 0.093 0.268 CD4_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 834868 sc-eQTL 2.85e-01 0.122 0.114 0.268 CD4_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 605430 sc-eQTL 8.87e-01 0.01 0.0704 0.268 CD4_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -196455 sc-eQTL 5.46e-01 0.0584 0.0966 0.268 CD4_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 303048 sc-eQTL 9.89e-01 0.00151 0.108 0.268 CD4_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 217586 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0331 0.089 0.263 CD4_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 965325 sc-eQTL 6.74e-01 0.0285 0.0677 0.263 CD4_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 965405 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0359 0.0658 0.263 CD4_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 834868 sc-eQTL 9.23e-01 0.00822 0.0849 0.263 CD4_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 605430 sc-eQTL 1.71e-01 0.0927 0.0675 0.263 CD4_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -196455 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0187 0.0585 0.263 CD4_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 303048 sc-eQTL 2.88e-01 -0.0947 0.0889 0.263 CD4_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 217586 sc-eQTL 4.04e-01 0.0785 0.094 0.263 CD4_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 965325 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0611 0.0915 0.263 CD4_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 965405 sc-eQTL 4.20e-01 0.0557 0.069 0.263 CD4_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 834868 sc-eQTL 1.27e-01 -0.132 0.0864 0.263 CD4_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 605430 sc-eQTL 9.29e-03 0.22 0.0838 0.263 CD4_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -196455 sc-eQTL 9.05e-01 0.00845 0.0706 0.263 CD4_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 303048 sc-eQTL 9.01e-01 0.0127 0.102 0.263 CD4_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 217586 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0371 0.107 0.263 CD4_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 965325 sc-eQTL 8.06e-01 0.025 0.102 0.263 CD4_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 965405 sc-eQTL 8.89e-02 0.134 0.0784 0.263 CD4_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 834868 sc-eQTL 7.83e-01 0.028 0.102 0.263 CD4_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 605430 sc-eQTL 1.88e-01 0.114 0.0867 0.263 CD4_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -196455 sc-eQTL 8.54e-01 0.0146 0.0792 0.263 CD4_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 303048 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0202 0.105 0.263 CD4_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 217586 sc-eQTL 3.16e-01 -0.087 0.0865 0.263 CD8_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 965325 sc-eQTL 8.37e-01 0.0197 0.096 0.263 CD8_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 965405 sc-eQTL 2.00e-01 0.107 0.0831 0.263 CD8_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 834868 sc-eQTL 7.45e-02 0.176 0.0981 0.263 CD8_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 605430 sc-eQTL 4.75e-01 0.0483 0.0675 0.263 CD8_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -196455 sc-eQTL 3.00e-01 0.0697 0.067 0.263 CD8_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 303048 sc-eQTL 1.56e-02 -0.242 0.0992 0.263 CD8_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 217586 sc-eQTL 8.93e-02 -0.164 0.0962 0.263 CD8_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 965325 sc-eQTL 4.15e-01 0.0715 0.0875 0.263 CD8_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 965405 sc-eQTL 7.01e-01 -0.033 0.0857 0.263 CD8_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 834868 sc-eQTL 5.50e-01 0.0614 0.103 0.263 CD8_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 605430 sc-eQTL 2.95e-01 0.0815 0.0776 0.263 CD8_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -196455 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0183 0.0707 0.263 CD8_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 303048 sc-eQTL 2.89e-01 0.11 0.103 0.263 CD8_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 217586 sc-eQTL 8.30e-02 0.183 0.105 0.273 CD8_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 965325 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0459 0.106 0.273 CD8_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 965405 sc-eQTL 3.01e-01 0.0968 0.0933 0.273 CD8_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 834868 sc-eQTL 8.36e-01 0.022 0.106 0.273 CD8_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 605430 sc-eQTL 7.23e-01 0.0326 0.092 0.273 CD8_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -196455 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0207 0.0892 0.273 CD8_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 303048 sc-eQTL 6.52e-01 0.049 0.108 0.273 CD8_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 217586 sc-eQTL 5.69e-01 0.0572 0.1 0.258 CD8_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 965325 sc-eQTL 7.54e-02 -0.186 0.104 0.258 CD8_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 965405 sc-eQTL 1.69e-01 -0.139 0.101 0.258 CD8_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 834868 sc-eQTL 8.99e-01 0.0131 0.103 0.258 CD8_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 605430 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0207 0.0972 0.258 CD8_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -196455 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0383 0.102 0.258 CD8_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 303048 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0937 0.104 0.258 CD8_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 217586 sc-eQTL 7.81e-01 -0.026 0.0934 0.262 MAIT L2
ENSG00000116133 DHCR24 131714 sc-eQTL 8.04e-01 0.0172 0.0692 0.262 MAIT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 965325 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0216 0.0974 0.262 MAIT L2
ENSG00000116209 TMEM59 965405 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0125 0.088 0.262 MAIT L2
ENSG00000116221 MRPL37 834868 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0156 0.107 0.262 MAIT L2
ENSG00000157216 SSBP3 605430 sc-eQTL 2.06e-01 0.12 0.0944 0.262 MAIT L2
ENSG00000162402 USP24 -196455 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0758 0.084 0.262 MAIT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 818873 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0242 0.0978 0.262 MAIT L2
ENSG00000243725 TTC4 303048 sc-eQTL 4.83e-01 0.0682 0.0971 0.262 MAIT L2
ENSG00000006555 TTC22 217586 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0409 0.106 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000116133 DHCR24 131714 sc-eQTL 2.92e-01 0.099 0.0938 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000116205 TCEANC2 965325 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0936 0.0991 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000116209 TMEM59 965405 sc-eQTL 9.89e-01 0.0014 0.0969 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000116221 MRPL37 834868 sc-eQTL 7.83e-01 0.0299 0.108 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000157216 SSBP3 605430 sc-eQTL 7.78e-01 0.023 0.0816 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000162398 LEXM 212846 sc-eQTL 2.48e-01 0.111 0.096 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000162402 USP24 -196455 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0435 0.0828 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000243725 TTC4 303048 sc-eQTL 9.03e-01 0.0128 0.105 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000006555 TTC22 217586 sc-eQTL 2.19e-01 -0.108 0.0873 0.263 NK_CD56dim L2
ENSG00000116133 DHCR24 131714 sc-eQTL 6.40e-01 0.0428 0.0914 0.263 NK_CD56dim L2
ENSG00000116205 TCEANC2 965325 sc-eQTL 6.65e-01 0.0429 0.099 0.263 NK_CD56dim L2
ENSG00000116209 TMEM59 965405 sc-eQTL 3.38e-01 0.0704 0.0733 0.263 NK_CD56dim L2
ENSG00000116221 MRPL37 834868 sc-eQTL 4.95e-01 0.0653 0.0954 0.263 NK_CD56dim L2
ENSG00000157216 SSBP3 605430 sc-eQTL 2.07e-01 0.0985 0.0779 0.263 NK_CD56dim L2
ENSG00000162398 LEXM 212846 sc-eQTL 9.26e-01 0.00841 0.0899 0.263 NK_CD56dim L2
ENSG00000162402 USP24 -196455 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00376 0.0571 0.263 NK_CD56dim L2
ENSG00000243725 TTC4 303048 sc-eQTL 7.71e-02 -0.172 0.0971 0.263 NK_CD56dim L2
ENSG00000006555 TTC22 217586 sc-eQTL 1.92e-01 -0.139 0.106 0.269 NK_HLA L2
ENSG00000116133 DHCR24 131714 sc-eQTL 3.52e-01 0.0969 0.104 0.269 NK_HLA L2
ENSG00000116205 TCEANC2 965325 sc-eQTL 8.42e-01 0.02 0.1 0.269 NK_HLA L2
ENSG00000116209 TMEM59 965405 sc-eQTL 8.56e-01 0.0181 0.0997 0.269 NK_HLA L2
ENSG00000116221 MRPL37 834868 sc-eQTL 3.18e-01 0.11 0.11 0.269 NK_HLA L2
ENSG00000157216 SSBP3 605430 sc-eQTL 5.73e-01 0.0506 0.0896 0.269 NK_HLA L2
ENSG00000162398 LEXM 212846 sc-eQTL 6.94e-01 0.0399 0.101 0.269 NK_HLA L2
ENSG00000162402 USP24 -196455 sc-eQTL 2.52e-01 0.085 0.074 0.269 NK_HLA L2
ENSG00000243725 TTC4 303048 sc-eQTL 8.85e-01 0.0161 0.111 0.269 NK_HLA L2
ENSG00000006555 TTC22 217586 sc-eQTL 5.08e-01 0.0625 0.0943 0.263 NK_cytokine L2
ENSG00000116133 DHCR24 131714 sc-eQTL 4.38e-01 0.0741 0.0953 0.263 NK_cytokine L2
ENSG00000116205 TCEANC2 965325 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0147 0.0947 0.263 NK_cytokine L2
ENSG00000116209 TMEM59 965405 sc-eQTL 2.60e-01 -0.0868 0.0768 0.263 NK_cytokine L2
ENSG00000116221 MRPL37 834868 sc-eQTL 2.18e-01 -0.117 0.0946 0.263 NK_cytokine L2
ENSG00000157216 SSBP3 605430 sc-eQTL 7.52e-02 0.141 0.079 0.263 NK_cytokine L2
ENSG00000162398 LEXM 212846 sc-eQTL 9.42e-01 0.0073 0.0995 0.263 NK_cytokine L2
ENSG00000162402 USP24 -196455 sc-eQTL 5.84e-01 0.0372 0.0678 0.263 NK_cytokine L2
ENSG00000243725 TTC4 303048 sc-eQTL 9.05e-01 -0.012 0.101 0.263 NK_cytokine L2
ENSG00000006555 TTC22 217586 sc-eQTL 7.78e-01 0.0358 0.127 0.256 PB L2
ENSG00000116133 DHCR24 131714 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0441 0.113 0.256 PB L2
ENSG00000116205 TCEANC2 965325 sc-eQTL 7.58e-01 0.0424 0.137 0.256 PB L2
ENSG00000116209 TMEM59 965405 sc-eQTL 4.31e-01 0.0452 0.0572 0.256 PB L2
ENSG00000116221 MRPL37 834868 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0757 0.104 0.256 PB L2
ENSG00000157216 SSBP3 605430 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0403 0.12 0.256 PB L2
ENSG00000162402 USP24 -196455 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0939 0.136 0.256 PB L2
ENSG00000215883 CYB5RL 818873 sc-eQTL 2.52e-01 -0.162 0.141 0.256 PB L2
ENSG00000243725 TTC4 303048 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0483 0.132 0.256 PB L2
ENSG00000006555 TTC22 217586 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0286 0.0949 0.265 Pro_T L2
ENSG00000116133 DHCR24 131714 sc-eQTL 9.89e-03 0.207 0.0793 0.265 Pro_T L2
ENSG00000116205 TCEANC2 965325 sc-eQTL 2.31e-01 0.118 0.0981 0.265 Pro_T L2
ENSG00000116209 TMEM59 965405 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0286 0.0683 0.265 Pro_T L2
ENSG00000116221 MRPL37 834868 sc-eQTL 1.01e-01 -0.109 0.0665 0.265 Pro_T L2
ENSG00000157216 SSBP3 605430 sc-eQTL 1.89e-01 -0.0985 0.0747 0.265 Pro_T L2
ENSG00000162402 USP24 -196455 sc-eQTL 7.64e-01 0.0275 0.0915 0.265 Pro_T L2
ENSG00000215883 CYB5RL 818873 sc-eQTL 8.55e-01 0.0165 0.0903 0.265 Pro_T L2
ENSG00000243725 TTC4 303048 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00348 0.1 0.265 Pro_T L2
ENSG00000006555 TTC22 217586 sc-eQTL 8.23e-02 0.165 0.0944 0.263 Treg L2
ENSG00000116205 TCEANC2 965325 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0108 0.102 0.263 Treg L2
ENSG00000116209 TMEM59 965405 sc-eQTL 8.33e-01 -0.017 0.0805 0.263 Treg L2
ENSG00000116221 MRPL37 834868 sc-eQTL 6.12e-01 0.0506 0.0996 0.263 Treg L2
ENSG00000157216 SSBP3 605430 sc-eQTL 8.66e-01 0.015 0.0889 0.263 Treg L2
ENSG00000162402 USP24 -196455 sc-eQTL 7.20e-01 0.0304 0.0846 0.263 Treg L2
ENSG00000243725 TTC4 303048 sc-eQTL 1.96e-01 -0.138 0.106 0.263 Treg L2
ENSG00000116133 DHCR24 131714 sc-eQTL 8.43e-01 0.0168 0.0847 0.268 cDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 965325 sc-eQTL 7.11e-02 -0.18 0.099 0.268 cDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 965405 sc-eQTL 2.68e-01 -0.094 0.0846 0.268 cDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 834868 sc-eQTL 1.97e-01 -0.14 0.108 0.268 cDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 605430 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0187 0.1 0.268 cDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 476652 sc-eQTL 7.59e-03 0.246 0.0913 0.268 cDC L2
ENSG00000162402 USP24 -196455 sc-eQTL 8.20e-02 0.181 0.104 0.268 cDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 818873 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0816 0.0894 0.268 cDC L2
ENSG00000243725 TTC4 303048 sc-eQTL 5.26e-01 0.068 0.107 0.268 cDC L2
ENSG00000116133 DHCR24 131714 sc-eQTL 3.27e-02 -0.13 0.0606 0.263 cMono_IL1B L2
ENSG00000116205 TCEANC2 965325 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0587 0.085 0.263 cMono_IL1B L2
ENSG00000116209 TMEM59 965405 sc-eQTL 1.22e-01 0.0797 0.0513 0.263 cMono_IL1B L2
ENSG00000116221 MRPL37 834868 sc-eQTL 7.45e-01 -0.03 0.092 0.263 cMono_IL1B L2
ENSG00000157216 SSBP3 605430 sc-eQTL 3.76e-01 0.0831 0.0937 0.263 cMono_IL1B L2
ENSG00000162402 USP24 -196455 sc-eQTL 3.70e-01 -0.0622 0.0692 0.263 cMono_IL1B L2
ENSG00000243725 TTC4 303048 sc-eQTL 3.02e-01 0.109 0.106 0.263 cMono_IL1B L2
ENSG00000116133 DHCR24 131714 sc-eQTL 2.73e-01 0.063 0.0574 0.263 cMono_S100A L2
ENSG00000116205 TCEANC2 965325 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0104 0.0878 0.263 cMono_S100A L2
ENSG00000116209 TMEM59 965405 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00397 0.0702 0.263 cMono_S100A L2
ENSG00000116221 MRPL37 834868 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0157 0.102 0.263 cMono_S100A L2
ENSG00000157216 SSBP3 605430 sc-eQTL 5.16e-01 0.0684 0.105 0.263 cMono_S100A L2
ENSG00000162402 USP24 -196455 sc-eQTL 6.89e-01 0.0342 0.0853 0.263 cMono_S100A L2
ENSG00000243725 TTC4 303048 sc-eQTL 1.14e-01 -0.169 0.106 0.263 cMono_S100A L2
ENSG00000006555 TTC22 217586 sc-eQTL 1.22e-01 0.152 0.0975 0.261 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 131714 sc-eQTL 2.92e-01 0.116 0.109 0.261 gdT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 965325 sc-eQTL 8.86e-01 0.0158 0.11 0.261 gdT L2
ENSG00000116209 TMEM59 965405 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0367 0.112 0.261 gdT L2
ENSG00000116221 MRPL37 834868 sc-eQTL 8.34e-01 0.0268 0.128 0.261 gdT L2
ENSG00000157216 SSBP3 605430 sc-eQTL 9.13e-01 0.00859 0.0783 0.261 gdT L2
ENSG00000162402 USP24 -196455 sc-eQTL 5.05e-01 0.0702 0.105 0.261 gdT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 818873 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0562 0.109 0.261 gdT L2
ENSG00000243725 TTC4 303048 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0308 0.123 0.261 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 131714 sc-eQTL 4.02e-01 0.0649 0.0773 0.269 intMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 965325 sc-eQTL 1.59e-02 0.231 0.095 0.269 intMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 965405 sc-eQTL 8.41e-01 0.0142 0.0708 0.269 intMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 834868 sc-eQTL 4.63e-01 0.0796 0.108 0.269 intMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 605430 sc-eQTL 4.86e-01 0.0771 0.11 0.269 intMono L2
ENSG00000162402 USP24 -196455 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0524 0.0986 0.269 intMono L2
ENSG00000243725 TTC4 303048 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0185 0.105 0.269 intMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 131714 sc-eQTL 6.35e-01 -0.036 0.0758 0.262 ncMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 965325 sc-eQTL 3.11e-01 -0.0961 0.0946 0.262 ncMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 965405 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0121 0.0759 0.262 ncMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 834868 sc-eQTL 1.63e-01 0.136 0.0974 0.262 ncMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 605430 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0254 0.107 0.262 ncMono L2
ENSG00000162402 USP24 -196455 sc-eQTL 2.45e-01 0.0994 0.0853 0.262 ncMono L2
ENSG00000243725 TTC4 303048 sc-eQTL 8.02e-01 0.0255 0.101 0.262 ncMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 131714 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0358 0.0907 0.266 pDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 965325 sc-eQTL 7.97e-02 -0.19 0.108 0.266 pDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 965405 sc-eQTL 4.27e-02 0.175 0.0858 0.266 pDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 834868 sc-eQTL 3.33e-01 0.112 0.115 0.266 pDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 605430 sc-eQTL 3.13e-01 0.104 0.102 0.266 pDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 476652 sc-eQTL 2.02e-01 0.055 0.0429 0.266 pDC L2
ENSG00000162402 USP24 -196455 sc-eQTL 2.14e-03 0.221 0.0706 0.266 pDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 818873 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00129 0.0996 0.266 pDC L2
ENSG00000243725 TTC4 303048 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0218 0.115 0.266 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 217586 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0628 0.0999 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 131714 sc-eQTL 6.79e-01 0.0416 0.1 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 965325 sc-eQTL 7.17e-01 0.0352 0.097 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 965405 sc-eQTL 1.34e-01 0.113 0.075 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 834868 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0421 0.0903 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 605430 sc-eQTL 2.63e-01 0.0879 0.0783 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -196455 sc-eQTL 8.11e-01 0.0172 0.0717 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 818873 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0664 0.11 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 303048 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0333 0.0989 0.263 B_Memory LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 217586 sc-eQTL 1.54e-01 0.147 0.103 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 131714 sc-eQTL 1.69e-01 0.128 0.0926 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 965325 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00217 0.084 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 965405 sc-eQTL 9.67e-01 0.00245 0.0597 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 834868 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0596 0.0858 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 605430 sc-eQTL 3.08e-01 0.0782 0.0766 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -196455 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0259 0.0659 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 818873 sc-eQTL 1.87e-01 -0.137 0.104 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 303048 sc-eQTL 5.97e-01 0.0519 0.0981 0.263 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 131714 sc-eQTL 2.31e-01 -0.071 0.0592 0.263 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 965325 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0499 0.0742 0.263 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 965405 sc-eQTL 4.24e-01 0.041 0.0512 0.263 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 834868 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00751 0.0908 0.263 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 605430 sc-eQTL 3.33e-01 0.092 0.0948 0.263 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -196455 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0279 0.0649 0.263 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 303048 sc-eQTL 8.40e-01 0.0218 0.108 0.263 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 131714 sc-eQTL 5.86e-01 0.0396 0.0727 0.261 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 965325 sc-eQTL 8.05e-01 0.0237 0.0955 0.261 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 965405 sc-eQTL 6.26e-01 0.0346 0.071 0.261 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 834868 sc-eQTL 1.90e-01 0.127 0.0969 0.261 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 605430 sc-eQTL 8.02e-01 0.026 0.104 0.261 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -196455 sc-eQTL 4.07e-01 0.0679 0.0817 0.261 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 303048 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000389 0.103 0.261 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 217586 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0741 0.0849 0.263 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 131714 sc-eQTL 5.30e-01 0.0559 0.0887 0.263 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 965325 sc-eQTL 8.10e-01 -0.021 0.0871 0.263 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 965405 sc-eQTL 8.27e-01 0.0147 0.0674 0.263 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 834868 sc-eQTL 8.16e-01 0.0211 0.0903 0.263 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 605430 sc-eQTL 1.45e-01 0.108 0.0737 0.263 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162398 LEXM 212846 sc-eQTL 7.64e-01 0.0251 0.0835 0.263 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -196455 sc-eQTL 5.83e-01 0.0291 0.0529 0.263 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 303048 sc-eQTL 2.52e-01 -0.108 0.0939 0.263 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000162398 LEXM 212846 eQTL 0.0369 0.0506 0.0242 0.0 0.0 0.262
ENSG00000184313 MROH7 377155 eQTL 0.0269 0.0729 0.0329 0.0 0.0 0.262


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina