logo

Genes within 1Mb (chr1:55015431:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 214108 sc-eQTL 6.64e-01 0.072 0.166 0.071 B L1
ENSG00000116133 DHCR24 128236 sc-eQTL 3.10e-01 -0.159 0.156 0.071 B L1
ENSG00000116205 TCEANC2 961847 sc-eQTL 4.34e-01 0.106 0.135 0.071 B L1
ENSG00000116209 TMEM59 961927 sc-eQTL 3.35e-01 0.0795 0.0823 0.071 B L1
ENSG00000116221 MRPL37 831390 sc-eQTL 2.18e-01 0.133 0.107 0.071 B L1
ENSG00000157216 SSBP3 601952 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0741 0.113 0.071 B L1
ENSG00000162402 USP24 -199933 sc-eQTL 5.20e-01 0.0616 0.0956 0.071 B L1
ENSG00000215883 CYB5RL 815395 sc-eQTL 5.05e-01 -0.123 0.184 0.071 B L1
ENSG00000243725 TTC4 299570 sc-eQTL 2.44e-02 -0.359 0.158 0.071 B L1
ENSG00000006555 TTC22 214108 sc-eQTL 7.59e-01 0.0396 0.129 0.071 CD4T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 961847 sc-eQTL 5.07e-01 0.0701 0.106 0.071 CD4T L1
ENSG00000116209 TMEM59 961927 sc-eQTL 5.05e-01 0.0657 0.0984 0.071 CD4T L1
ENSG00000116221 MRPL37 831390 sc-eQTL 6.23e-02 -0.253 0.135 0.071 CD4T L1
ENSG00000157216 SSBP3 601952 sc-eQTL 4.01e-01 0.0949 0.113 0.071 CD4T L1
ENSG00000162402 USP24 -199933 sc-eQTL 6.84e-01 0.0375 0.092 0.071 CD4T L1
ENSG00000243725 TTC4 299570 sc-eQTL 4.64e-01 -0.101 0.138 0.071 CD4T L1
ENSG00000006555 TTC22 214108 sc-eQTL 9.79e-01 0.00297 0.111 0.071 CD8T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 961847 sc-eQTL 3.88e-01 0.119 0.138 0.071 CD8T L1
ENSG00000116209 TMEM59 961927 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0304 0.0959 0.071 CD8T L1
ENSG00000116221 MRPL37 831390 sc-eQTL 5.26e-01 0.0838 0.132 0.071 CD8T L1
ENSG00000157216 SSBP3 601952 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0314 0.0948 0.071 CD8T L1
ENSG00000162402 USP24 -199933 sc-eQTL 2.30e-01 0.11 0.0914 0.071 CD8T L1
ENSG00000243725 TTC4 299570 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0333 0.159 0.071 CD8T L1
ENSG00000116133 DHCR24 128236 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0768 0.15 0.068 DC L1
ENSG00000116205 TCEANC2 961847 sc-eQTL 4.03e-01 0.141 0.168 0.068 DC L1
ENSG00000116209 TMEM59 961927 sc-eQTL 6.05e-01 0.0685 0.132 0.068 DC L1
ENSG00000116221 MRPL37 831390 sc-eQTL 4.58e-01 0.132 0.177 0.068 DC L1
ENSG00000157216 SSBP3 601952 sc-eQTL 7.74e-01 0.0454 0.158 0.068 DC L1
ENSG00000162390 ACOT11 473174 sc-eQTL 8.05e-01 0.0376 0.152 0.068 DC L1
ENSG00000162402 USP24 -199933 sc-eQTL 1.67e-01 -0.127 0.0914 0.068 DC L1
ENSG00000215883 CYB5RL 815395 sc-eQTL 4.72e-02 -0.328 0.164 0.068 DC L1
ENSG00000243725 TTC4 299570 sc-eQTL 3.57e-01 0.164 0.178 0.068 DC L1
ENSG00000116133 DHCR24 128236 sc-eQTL 2.88e-01 0.115 0.108 0.071 Mono L1
ENSG00000116205 TCEANC2 961847 sc-eQTL 7.95e-01 0.0304 0.117 0.071 Mono L1
ENSG00000116209 TMEM59 961927 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0269 0.0867 0.071 Mono L1
ENSG00000116221 MRPL37 831390 sc-eQTL 9.47e-01 0.00964 0.145 0.071 Mono L1
ENSG00000157216 SSBP3 601952 sc-eQTL 1.58e-01 -0.234 0.165 0.071 Mono L1
ENSG00000162402 USP24 -199933 sc-eQTL 7.65e-01 0.0296 0.099 0.071 Mono L1
ENSG00000243725 TTC4 299570 sc-eQTL 8.11e-01 0.0417 0.174 0.071 Mono L1
ENSG00000006555 TTC22 214108 sc-eQTL 7.16e-01 -0.054 0.148 0.071 NK L1
ENSG00000116133 DHCR24 128236 sc-eQTL 1.20e-01 0.232 0.149 0.071 NK L1
ENSG00000116205 TCEANC2 961847 sc-eQTL 7.64e-02 0.261 0.147 0.071 NK L1
ENSG00000116209 TMEM59 961927 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0526 0.116 0.071 NK L1
ENSG00000116221 MRPL37 831390 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0254 0.144 0.071 NK L1
ENSG00000157216 SSBP3 601952 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0671 0.125 0.071 NK L1
ENSG00000162398 LEXM 209368 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0596 0.14 0.071 NK L1
ENSG00000162402 USP24 -199933 sc-eQTL 2.35e-01 0.101 0.0846 0.071 NK L1
ENSG00000243725 TTC4 299570 sc-eQTL 8.26e-01 0.0353 0.16 0.071 NK L1
ENSG00000006555 TTC22 214108 sc-eQTL 5.78e-01 0.0741 0.133 0.071 Other_T L1
ENSG00000116133 DHCR24 128236 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0619 0.103 0.071 Other_T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 961847 sc-eQTL 2.25e-01 0.187 0.154 0.071 Other_T L1
ENSG00000116209 TMEM59 961927 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0955 0.106 0.071 Other_T L1
ENSG00000116221 MRPL37 831390 sc-eQTL 6.62e-01 0.0435 0.0993 0.071 Other_T L1
ENSG00000157216 SSBP3 601952 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0863 0.115 0.071 Other_T L1
ENSG00000162402 USP24 -199933 sc-eQTL 8.88e-01 0.0173 0.122 0.071 Other_T L1
ENSG00000215883 CYB5RL 815395 sc-eQTL 6.51e-01 0.0758 0.167 0.071 Other_T L1
ENSG00000243725 TTC4 299570 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0194 0.167 0.071 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 214108 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0487 0.147 0.064 B_Activated L2
ENSG00000116133 DHCR24 128236 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0896 0.173 0.064 B_Activated L2
ENSG00000116205 TCEANC2 961847 sc-eQTL 2.94e-01 -0.195 0.185 0.064 B_Activated L2
ENSG00000116209 TMEM59 961927 sc-eQTL 7.98e-01 0.0506 0.197 0.064 B_Activated L2
ENSG00000116221 MRPL37 831390 sc-eQTL 3.79e-01 -0.188 0.213 0.064 B_Activated L2
ENSG00000157216 SSBP3 601952 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0757 0.193 0.064 B_Activated L2
ENSG00000162402 USP24 -199933 sc-eQTL 5.72e-01 -0.107 0.188 0.064 B_Activated L2
ENSG00000215883 CYB5RL 815395 sc-eQTL 4.14e-01 -0.136 0.166 0.064 B_Activated L2
ENSG00000243725 TTC4 299570 sc-eQTL 3.27e-02 -0.383 0.178 0.064 B_Activated L2
ENSG00000006555 TTC22 214108 sc-eQTL 1.96e-01 -0.233 0.18 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000116133 DHCR24 128236 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0372 0.168 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000116205 TCEANC2 961847 sc-eQTL 9.39e-01 -0.0128 0.167 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000116209 TMEM59 961927 sc-eQTL 9.35e-01 0.0116 0.143 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000116221 MRPL37 831390 sc-eQTL 3.90e-01 -0.145 0.168 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000157216 SSBP3 601952 sc-eQTL 9.46e-01 -0.0107 0.157 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000162402 USP24 -199933 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0597 0.132 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000215883 CYB5RL 815395 sc-eQTL 4.30e-01 -0.148 0.187 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000243725 TTC4 299570 sc-eQTL 5.47e-01 0.103 0.17 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000006555 TTC22 214108 sc-eQTL 3.73e-01 0.152 0.171 0.071 B_Memory L2
ENSG00000116133 DHCR24 128236 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00918 0.17 0.071 B_Memory L2
ENSG00000116205 TCEANC2 961847 sc-eQTL 3.96e-01 0.154 0.181 0.071 B_Memory L2
ENSG00000116209 TMEM59 961927 sc-eQTL 9.86e-01 -0.0026 0.151 0.071 B_Memory L2
ENSG00000116221 MRPL37 831390 sc-eQTL 4.98e-01 -0.104 0.153 0.071 B_Memory L2
ENSG00000157216 SSBP3 601952 sc-eQTL 2.58e-01 -0.162 0.143 0.071 B_Memory L2
ENSG00000162402 USP24 -199933 sc-eQTL 1.77e-01 -0.189 0.139 0.071 B_Memory L2
ENSG00000215883 CYB5RL 815395 sc-eQTL 4.46e-01 0.132 0.173 0.071 B_Memory L2
ENSG00000243725 TTC4 299570 sc-eQTL 8.53e-02 -0.308 0.178 0.071 B_Memory L2
ENSG00000006555 TTC22 214108 sc-eQTL 8.10e-01 0.0422 0.175 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000116133 DHCR24 128236 sc-eQTL 2.89e-01 -0.174 0.164 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 961847 sc-eQTL 2.78e-01 0.159 0.146 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000116209 TMEM59 961927 sc-eQTL 7.54e-01 0.0334 0.106 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000116221 MRPL37 831390 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0554 0.157 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000157216 SSBP3 601952 sc-eQTL 9.43e-01 -0.0106 0.149 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000162402 USP24 -199933 sc-eQTL 2.71e-01 0.129 0.117 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 815395 sc-eQTL 9.33e-01 0.0149 0.178 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000243725 TTC4 299570 sc-eQTL 1.85e-01 -0.212 0.16 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000006555 TTC22 214108 sc-eQTL 4.65e-01 0.128 0.175 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000116133 DHCR24 128236 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0788 0.153 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 961847 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0963 0.169 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000116209 TMEM59 961927 sc-eQTL 4.64e-01 -0.102 0.139 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000116221 MRPL37 831390 sc-eQTL 5.09e-01 0.108 0.164 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000157216 SSBP3 601952 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0377 0.162 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000162402 USP24 -199933 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00671 0.128 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 815395 sc-eQTL 1.06e-01 -0.291 0.179 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000243725 TTC4 299570 sc-eQTL 3.07e-01 -0.192 0.187 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000006555 TTC22 214108 sc-eQTL 3.97e-01 -0.141 0.167 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 961847 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00463 0.172 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 961927 sc-eQTL 2.62e-01 0.175 0.156 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 831390 sc-eQTL 1.34e-01 -0.287 0.191 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 601952 sc-eQTL 2.30e-01 0.142 0.118 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -199933 sc-eQTL 8.29e-01 0.0352 0.162 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 299570 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000295 0.182 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 214108 sc-eQTL 9.64e-01 0.00678 0.152 0.071 CD4_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 961847 sc-eQTL 8.37e-01 0.0238 0.116 0.071 CD4_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 961927 sc-eQTL 2.60e-01 0.127 0.112 0.071 CD4_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 831390 sc-eQTL 6.69e-02 -0.265 0.144 0.071 CD4_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 601952 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00171 0.116 0.071 CD4_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -199933 sc-eQTL 4.57e-01 0.0742 0.0997 0.071 CD4_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 299570 sc-eQTL 3.52e-01 -0.142 0.152 0.071 CD4_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 214108 sc-eQTL 8.46e-01 0.031 0.159 0.071 CD4_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 961847 sc-eQTL 1.29e-01 0.234 0.154 0.071 CD4_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 961927 sc-eQTL 9.23e-01 0.0113 0.117 0.071 CD4_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 831390 sc-eQTL 8.12e-01 -0.035 0.147 0.071 CD4_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 601952 sc-eQTL 5.40e-01 0.0883 0.144 0.071 CD4_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -199933 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0636 0.119 0.071 CD4_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 299570 sc-eQTL 9.27e-01 0.0157 0.172 0.071 CD4_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 214108 sc-eQTL 4.19e-01 0.15 0.185 0.071 CD4_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 961847 sc-eQTL 3.61e-01 0.16 0.175 0.071 CD4_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 961927 sc-eQTL 1.52e-01 -0.195 0.135 0.071 CD4_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 831390 sc-eQTL 3.68e-01 -0.157 0.175 0.071 CD4_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 601952 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0648 0.15 0.071 CD4_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -199933 sc-eQTL 1.82e-01 -0.182 0.136 0.071 CD4_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 299570 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0166 0.18 0.071 CD4_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 214108 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0548 0.147 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 961847 sc-eQTL 9.90e-04 0.529 0.158 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 961927 sc-eQTL 7.90e-02 -0.248 0.14 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 831390 sc-eQTL 6.36e-01 0.0793 0.167 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 601952 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0744 0.114 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -199933 sc-eQTL 1.19e-01 0.177 0.113 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 299570 sc-eQTL 4.04e-01 -0.142 0.17 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 214108 sc-eQTL 5.55e-01 0.0959 0.162 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 961847 sc-eQTL 3.29e-01 -0.143 0.147 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 961927 sc-eQTL 1.31e-01 0.217 0.143 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 831390 sc-eQTL 7.81e-01 0.048 0.172 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 601952 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0251 0.13 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -199933 sc-eQTL 1.94e-01 0.154 0.118 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 299570 sc-eQTL 5.84e-01 0.0952 0.173 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 214108 sc-eQTL 4.67e-01 -0.131 0.18 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 961847 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0216 0.181 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 961927 sc-eQTL 1.24e-01 -0.245 0.159 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 831390 sc-eQTL 8.82e-01 -0.027 0.181 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 601952 sc-eQTL 2.23e-01 0.192 0.157 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -199933 sc-eQTL 3.33e-01 -0.147 0.152 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 299570 sc-eQTL 3.99e-01 -0.156 0.185 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 214108 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0667 0.176 0.066 CD8_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 961847 sc-eQTL 7.81e-02 0.323 0.183 0.066 CD8_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 961927 sc-eQTL 5.29e-01 -0.112 0.178 0.066 CD8_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 831390 sc-eQTL 1.97e-01 -0.233 0.18 0.066 CD8_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 601952 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0461 0.171 0.066 CD8_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -199933 sc-eQTL 2.03e-01 -0.229 0.179 0.066 CD8_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 299570 sc-eQTL 9.92e-01 0.0019 0.183 0.066 CD8_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 214108 sc-eQTL 1.79e-01 0.212 0.157 0.071 MAIT L2
ENSG00000116133 DHCR24 128236 sc-eQTL 7.78e-01 -0.033 0.117 0.071 MAIT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 961847 sc-eQTL 1.19e-01 -0.256 0.164 0.071 MAIT L2
ENSG00000116209 TMEM59 961927 sc-eQTL 7.95e-01 0.0388 0.149 0.071 MAIT L2
ENSG00000116221 MRPL37 831390 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0396 0.181 0.071 MAIT L2
ENSG00000157216 SSBP3 601952 sc-eQTL 3.59e-01 -0.147 0.16 0.071 MAIT L2
ENSG00000162402 USP24 -199933 sc-eQTL 3.02e-02 -0.307 0.141 0.071 MAIT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 815395 sc-eQTL 6.95e-01 0.065 0.165 0.071 MAIT L2
ENSG00000243725 TTC4 299570 sc-eQTL 1.59e-01 -0.231 0.164 0.071 MAIT L2
ENSG00000006555 TTC22 214108 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0879 0.186 0.069 NK_CD56bright L2
ENSG00000116133 DHCR24 128236 sc-eQTL 5.71e-01 0.0931 0.164 0.069 NK_CD56bright L2
ENSG00000116205 TCEANC2 961847 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0299 0.174 0.069 NK_CD56bright L2
ENSG00000116209 TMEM59 961927 sc-eQTL 3.45e-01 0.16 0.169 0.069 NK_CD56bright L2
ENSG00000116221 MRPL37 831390 sc-eQTL 1.78e-01 -0.255 0.188 0.069 NK_CD56bright L2
ENSG00000157216 SSBP3 601952 sc-eQTL 3.56e-02 -0.298 0.141 0.069 NK_CD56bright L2
ENSG00000162398 LEXM 209368 sc-eQTL 4.41e-01 0.13 0.168 0.069 NK_CD56bright L2
ENSG00000162402 USP24 -199933 sc-eQTL 3.21e-01 0.144 0.145 0.069 NK_CD56bright L2
ENSG00000243725 TTC4 299570 sc-eQTL 2.30e-01 -0.219 0.182 0.069 NK_CD56bright L2
ENSG00000006555 TTC22 214108 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0206 0.15 0.071 NK_CD56dim L2
ENSG00000116133 DHCR24 128236 sc-eQTL 6.19e-02 0.292 0.155 0.071 NK_CD56dim L2
ENSG00000116205 TCEANC2 961847 sc-eQTL 1.35e-01 0.253 0.169 0.071 NK_CD56dim L2
ENSG00000116209 TMEM59 961927 sc-eQTL 7.78e-01 0.0355 0.126 0.071 NK_CD56dim L2
ENSG00000116221 MRPL37 831390 sc-eQTL 3.32e-01 -0.159 0.163 0.071 NK_CD56dim L2
ENSG00000157216 SSBP3 601952 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0503 0.134 0.071 NK_CD56dim L2
ENSG00000162398 LEXM 209368 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0333 0.154 0.071 NK_CD56dim L2
ENSG00000162402 USP24 -199933 sc-eQTL 2.01e-01 0.125 0.0975 0.071 NK_CD56dim L2
ENSG00000243725 TTC4 299570 sc-eQTL 7.26e-01 0.0587 0.168 0.071 NK_CD56dim L2
ENSG00000006555 TTC22 214108 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00752 0.176 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000116133 DHCR24 128236 sc-eQTL 2.60e-01 0.193 0.171 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000116205 TCEANC2 961847 sc-eQTL 4.22e-01 0.133 0.165 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000116209 TMEM59 961927 sc-eQTL 9.63e-01 0.00771 0.164 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000116221 MRPL37 831390 sc-eQTL 4.79e-01 -0.128 0.181 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000157216 SSBP3 601952 sc-eQTL 2.53e-01 -0.169 0.147 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000162398 LEXM 209368 sc-eQTL 4.04e-01 0.139 0.166 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000162402 USP24 -199933 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0841 0.122 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000243725 TTC4 299570 sc-eQTL 1.55e-01 -0.259 0.182 0.073 NK_HLA L2
ENSG00000006555 TTC22 214108 sc-eQTL 8.92e-01 0.0217 0.159 0.071 NK_cytokine L2
ENSG00000116133 DHCR24 128236 sc-eQTL 4.47e-01 0.123 0.161 0.071 NK_cytokine L2
ENSG00000116205 TCEANC2 961847 sc-eQTL 1.53e-01 0.228 0.159 0.071 NK_cytokine L2
ENSG00000116209 TMEM59 961927 sc-eQTL 4.80e-02 -0.256 0.129 0.071 NK_cytokine L2
ENSG00000116221 MRPL37 831390 sc-eQTL 2.26e-01 0.194 0.16 0.071 NK_cytokine L2
ENSG00000157216 SSBP3 601952 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0908 0.134 0.071 NK_cytokine L2
ENSG00000162398 LEXM 209368 sc-eQTL 3.89e-01 -0.145 0.168 0.071 NK_cytokine L2
ENSG00000162402 USP24 -199933 sc-eQTL 9.18e-01 0.0118 0.115 0.071 NK_cytokine L2
ENSG00000243725 TTC4 299570 sc-eQTL 6.95e-01 0.0666 0.17 0.071 NK_cytokine L2
ENSG00000006555 TTC22 214108 sc-eQTL 4.88e-01 -0.151 0.217 0.063 PB L2
ENSG00000116133 DHCR24 128236 sc-eQTL 5.18e-01 0.125 0.192 0.063 PB L2
ENSG00000116205 TCEANC2 961847 sc-eQTL 9.70e-01 0.00873 0.235 0.063 PB L2
ENSG00000116209 TMEM59 961927 sc-eQTL 1.70e-01 -0.134 0.0973 0.063 PB L2
ENSG00000116221 MRPL37 831390 sc-eQTL 3.49e-01 -0.167 0.178 0.063 PB L2
ENSG00000157216 SSBP3 601952 sc-eQTL 7.55e-01 0.0644 0.206 0.063 PB L2
ENSG00000162402 USP24 -199933 sc-eQTL 3.65e-01 0.212 0.233 0.063 PB L2
ENSG00000215883 CYB5RL 815395 sc-eQTL 8.52e-02 -0.415 0.239 0.063 PB L2
ENSG00000243725 TTC4 299570 sc-eQTL 8.05e-01 -0.056 0.226 0.063 PB L2
ENSG00000006555 TTC22 214108 sc-eQTL 2.75e-02 0.364 0.164 0.072 Pro_T L2
ENSG00000116133 DHCR24 128236 sc-eQTL 4.15e-02 -0.287 0.14 0.072 Pro_T L2
ENSG00000116205 TCEANC2 961847 sc-eQTL 8.35e-01 -0.036 0.172 0.072 Pro_T L2
ENSG00000116209 TMEM59 961927 sc-eQTL 2.60e-01 -0.134 0.119 0.072 Pro_T L2
ENSG00000116221 MRPL37 831390 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0566 0.117 0.072 Pro_T L2
ENSG00000157216 SSBP3 601952 sc-eQTL 2.40e-01 0.154 0.131 0.072 Pro_T L2
ENSG00000162402 USP24 -199933 sc-eQTL 3.12e-01 0.162 0.16 0.072 Pro_T L2
ENSG00000215883 CYB5RL 815395 sc-eQTL 7.95e-01 -0.041 0.158 0.072 Pro_T L2
ENSG00000243725 TTC4 299570 sc-eQTL 2.28e-01 0.212 0.175 0.072 Pro_T L2
ENSG00000006555 TTC22 214108 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0295 0.165 0.071 Treg L2
ENSG00000116205 TCEANC2 961847 sc-eQTL 9.22e-01 0.0173 0.177 0.071 Treg L2
ENSG00000116209 TMEM59 961927 sc-eQTL 6.84e-01 0.057 0.14 0.071 Treg L2
ENSG00000116221 MRPL37 831390 sc-eQTL 8.56e-01 0.0314 0.173 0.071 Treg L2
ENSG00000157216 SSBP3 601952 sc-eQTL 3.74e-01 0.138 0.154 0.071 Treg L2
ENSG00000162402 USP24 -199933 sc-eQTL 8.45e-01 0.0289 0.147 0.071 Treg L2
ENSG00000243725 TTC4 299570 sc-eQTL 7.42e-01 -0.061 0.185 0.071 Treg L2
ENSG00000116133 DHCR24 128236 sc-eQTL 1.60e-01 -0.21 0.149 0.066 cDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 961847 sc-eQTL 2.72e-01 0.193 0.176 0.066 cDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 961927 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0405 0.15 0.066 cDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 831390 sc-eQTL 3.89e-01 0.165 0.191 0.066 cDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 601952 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0565 0.176 0.066 cDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 473174 sc-eQTL 4.85e-01 -0.115 0.164 0.066 cDC L2
ENSG00000162402 USP24 -199933 sc-eQTL 1.44e-01 -0.268 0.183 0.066 cDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 815395 sc-eQTL 1.20e-01 -0.245 0.157 0.066 cDC L2
ENSG00000243725 TTC4 299570 sc-eQTL 2.41e-01 0.221 0.188 0.066 cDC L2
ENSG00000116133 DHCR24 128236 sc-eQTL 5.08e-02 0.204 0.104 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000116205 TCEANC2 961847 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0344 0.146 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000116209 TMEM59 961927 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0564 0.0883 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000116221 MRPL37 831390 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00896 0.158 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000157216 SSBP3 601952 sc-eQTL 1.03e-01 -0.262 0.16 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000162402 USP24 -199933 sc-eQTL 7.82e-01 0.033 0.119 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000243725 TTC4 299570 sc-eQTL 8.01e-01 0.0459 0.182 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000116133 DHCR24 128236 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0429 0.0982 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000116205 TCEANC2 961847 sc-eQTL 7.41e-01 0.0497 0.15 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000116209 TMEM59 961927 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0154 0.12 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000116221 MRPL37 831390 sc-eQTL 7.48e-01 0.0559 0.173 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000157216 SSBP3 601952 sc-eQTL 9.28e-01 -0.0163 0.18 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000162402 USP24 -199933 sc-eQTL 3.89e-01 -0.126 0.145 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000243725 TTC4 299570 sc-eQTL 3.39e-01 0.175 0.182 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000006555 TTC22 214108 sc-eQTL 4.95e-01 -0.118 0.172 0.067 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 128236 sc-eQTL 3.44e-01 0.182 0.191 0.067 gdT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 961847 sc-eQTL 5.25e-01 0.123 0.193 0.067 gdT L2
ENSG00000116209 TMEM59 961927 sc-eQTL 4.55e-01 -0.146 0.195 0.067 gdT L2
ENSG00000116221 MRPL37 831390 sc-eQTL 6.13e-01 -0.114 0.224 0.067 gdT L2
ENSG00000157216 SSBP3 601952 sc-eQTL 8.86e-02 -0.233 0.136 0.067 gdT L2
ENSG00000162402 USP24 -199933 sc-eQTL 6.79e-01 0.0764 0.184 0.067 gdT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 815395 sc-eQTL 9.09e-01 -0.022 0.192 0.067 gdT L2
ENSG00000243725 TTC4 299570 sc-eQTL 4.05e-01 -0.18 0.216 0.067 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 128236 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0716 0.13 0.073 intMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 961847 sc-eQTL 1.16e-01 0.254 0.161 0.073 intMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 961927 sc-eQTL 2.87e-01 0.126 0.119 0.073 intMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 831390 sc-eQTL 8.22e-01 0.041 0.182 0.073 intMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 601952 sc-eQTL 3.65e-01 -0.168 0.185 0.073 intMono L2
ENSG00000162402 USP24 -199933 sc-eQTL 6.62e-01 0.0725 0.165 0.073 intMono L2
ENSG00000243725 TTC4 299570 sc-eQTL 4.15e-01 -0.144 0.176 0.073 intMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 128236 sc-eQTL 7.30e-01 0.046 0.133 0.068 ncMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 961847 sc-eQTL 7.33e-01 0.0568 0.166 0.068 ncMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 961927 sc-eQTL 9.75e-01 0.00422 0.133 0.068 ncMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 831390 sc-eQTL 3.00e-01 -0.178 0.171 0.068 ncMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 601952 sc-eQTL 3.23e-01 -0.186 0.187 0.068 ncMono L2
ENSG00000162402 USP24 -199933 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0362 0.15 0.068 ncMono L2
ENSG00000243725 TTC4 299570 sc-eQTL 2.72e-01 -0.195 0.177 0.068 ncMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 128236 sc-eQTL 3.53e-02 0.318 0.15 0.073 pDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 961847 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0638 0.182 0.073 pDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 961927 sc-eQTL 6.82e-01 0.0597 0.145 0.073 pDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 831390 sc-eQTL 5.40e-01 0.119 0.193 0.073 pDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 601952 sc-eQTL 9.18e-02 -0.289 0.17 0.073 pDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 473174 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0285 0.0722 0.073 pDC L2
ENSG00000162402 USP24 -199933 sc-eQTL 5.02e-01 -0.082 0.122 0.073 pDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 815395 sc-eQTL 3.02e-01 -0.172 0.166 0.073 pDC L2
ENSG00000243725 TTC4 299570 sc-eQTL 8.85e-01 0.028 0.193 0.073 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 214108 sc-eQTL 4.51e-01 -0.129 0.171 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 128236 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0711 0.172 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 961847 sc-eQTL 6.49e-01 0.0758 0.166 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 961927 sc-eQTL 4.70e-01 0.0936 0.129 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 831390 sc-eQTL 3.21e-01 -0.154 0.155 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 601952 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0695 0.135 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -199933 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0476 0.123 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 815395 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0789 0.189 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 299570 sc-eQTL 3.64e-01 -0.154 0.169 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 214108 sc-eQTL 7.02e-01 0.0676 0.176 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 128236 sc-eQTL 4.17e-01 -0.129 0.159 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 961847 sc-eQTL 3.65e-01 0.13 0.143 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 961927 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0258 0.102 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 831390 sc-eQTL 7.97e-01 0.0378 0.147 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 601952 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0594 0.131 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -199933 sc-eQTL 4.89e-01 0.0778 0.112 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 815395 sc-eQTL 2.05e-01 -0.226 0.177 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 299570 sc-eQTL 9.12e-02 -0.282 0.166 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 128236 sc-eQTL 2.00e-01 0.13 0.101 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 961847 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0488 0.127 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 961927 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0437 0.0878 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 831390 sc-eQTL 9.67e-01 0.00635 0.156 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 601952 sc-eQTL 1.35e-01 -0.243 0.162 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -199933 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000549 0.111 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 299570 sc-eQTL 4.75e-01 0.132 0.184 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 128236 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0423 0.124 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 961847 sc-eQTL 2.73e-01 0.179 0.163 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 961927 sc-eQTL 3.48e-01 0.114 0.121 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 831390 sc-eQTL 4.28e-01 -0.132 0.166 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 601952 sc-eQTL 1.90e-01 -0.232 0.176 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -199933 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0372 0.14 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 299570 sc-eQTL 1.91e-01 -0.229 0.174 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 214108 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0376 0.145 0.071 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 128236 sc-eQTL 9.20e-02 0.254 0.15 0.071 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 961847 sc-eQTL 6.82e-02 0.27 0.147 0.071 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 961927 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0681 0.115 0.071 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 831390 sc-eQTL 7.49e-01 0.0493 0.154 0.071 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 601952 sc-eQTL 7.57e-01 -0.039 0.126 0.071 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162398 LEXM 209368 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0777 0.142 0.071 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -199933 sc-eQTL 2.98e-01 0.0938 0.0899 0.071 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 299570 sc-eQTL 6.77e-01 0.0669 0.16 0.071 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000116133 DHCR24 128236 eQTL 0.0382 0.0934 0.045 0.0 0.0 0.0888
ENSG00000162390 ACOT11 473174 eQTL 0.00438 -0.109 0.0383 0.00303 0.001 0.0888
ENSG00000162398 LEXM 209368 eQTL 0.0107 -0.0883 0.0345 0.0 0.0 0.0888
ENSG00000169174 PCSK9 -24117 pQTL 0.0468 0.0967 0.0486 0.0 0.0 0.0816
ENSG00000169174 PCSK9 -24117 eQTL 0.00194 0.0875 0.0282 0.0 0.0 0.0888
ENSG00000184313 MROH7 373677 eQTL 0.0955 -0.0785 0.047 0.00136 0.0 0.0888
ENSG00000234810 AL603840.1 -313857 eQTL 5.03e-06 0.236 0.0515 0.0 0.0 0.0888

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000162390 ACOT11 473174 3.27e-07 2.56e-07 6.86e-08 2.53e-07 1.08e-07 8.75e-08 2.63e-07 6.2e-08 1.94e-07 1.11e-07 2.07e-07 1.37e-07 3.48e-07 8.42e-08 6.2e-08 9.48e-08 5.73e-08 2.33e-07 7.53e-08 6.58e-08 1.24e-07 1.81e-07 1.73e-07 4.34e-08 2.74e-07 1.51e-07 1.29e-07 1.26e-07 1.39e-07 1.59e-07 1.52e-07 5.38e-08 3.46e-08 1.01e-07 6.78e-08 5.04e-08 9.9e-08 7.25e-08 5.25e-08 7.92e-08 6.21e-08 2.15e-07 3.18e-08 1.77e-08 3.61e-08 6.68e-09 7.92e-08 2.05e-09 4.67e-08
ENSG00000162398 LEXM 209368 1.28e-06 1.4e-06 2.74e-07 1.21e-06 3.44e-07 5.4e-07 1.53e-06 4.04e-07 1.47e-06 6.29e-07 1.84e-06 7.82e-07 2.56e-06 3.26e-07 5.42e-07 9.19e-07 9.15e-07 9.05e-07 8.19e-07 6.19e-07 6.61e-07 1.74e-06 8.95e-07 5.58e-07 2.41e-06 6.16e-07 9.18e-07 7.03e-07 1.39e-06 1.17e-06 7.84e-07 3e-07 2.13e-07 5.6e-07 5.39e-07 4.82e-07 7.02e-07 2.26e-07 4.85e-07 2.8e-07 3.05e-07 1.77e-06 1.41e-07 1.06e-07 1.65e-07 1.19e-07 2.15e-07 8.25e-08 9.42e-08