logo

Genes within 1Mb (chr1:55005149:T:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 203826 sc-eQTL 3.28e-01 -0.136 0.139 0.103 B L1
ENSG00000116133 DHCR24 117954 sc-eQTL 9.76e-01 0.00393 0.131 0.103 B L1
ENSG00000116205 TCEANC2 951565 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0129 0.113 0.103 B L1
ENSG00000116209 TMEM59 951645 sc-eQTL 3.73e-02 -0.143 0.0683 0.103 B L1
ENSG00000116221 MRPL37 821108 sc-eQTL 8.68e-02 0.154 0.0897 0.103 B L1
ENSG00000157216 SSBP3 591670 sc-eQTL 9.17e-01 -0.00985 0.0945 0.103 B L1
ENSG00000162402 USP24 -210215 sc-eQTL 4.94e-01 0.0549 0.08 0.103 B L1
ENSG00000215883 CYB5RL 805113 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0997 0.154 0.103 B L1
ENSG00000243725 TTC4 289288 sc-eQTL 1.30e-01 -0.203 0.133 0.103 B L1
ENSG00000006555 TTC22 203826 sc-eQTL 1.32e-01 -0.162 0.107 0.103 CD4T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 951565 sc-eQTL 9.26e-01 -0.00814 0.0881 0.103 CD4T L1
ENSG00000116209 TMEM59 951645 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0416 0.082 0.103 CD4T L1
ENSG00000116221 MRPL37 821108 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0177 0.113 0.103 CD4T L1
ENSG00000157216 SSBP3 591670 sc-eQTL 9.28e-01 0.00853 0.0942 0.103 CD4T L1
ENSG00000162402 USP24 -210215 sc-eQTL 3.51e-01 0.0716 0.0766 0.103 CD4T L1
ENSG00000243725 TTC4 289288 sc-eQTL 4.78e-01 0.082 0.115 0.103 CD4T L1
ENSG00000006555 TTC22 203826 sc-eQTL 7.08e-01 0.0349 0.0931 0.103 CD8T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 951565 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0572 0.116 0.103 CD8T L1
ENSG00000116209 TMEM59 951645 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0386 0.0805 0.103 CD8T L1
ENSG00000116221 MRPL37 821108 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0143 0.111 0.103 CD8T L1
ENSG00000157216 SSBP3 591670 sc-eQTL 5.22e-01 -0.051 0.0795 0.103 CD8T L1
ENSG00000162402 USP24 -210215 sc-eQTL 2.33e-01 0.0918 0.0767 0.103 CD8T L1
ENSG00000243725 TTC4 289288 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0242 0.134 0.103 CD8T L1
ENSG00000116133 DHCR24 117954 sc-eQTL 3.89e-01 0.111 0.129 0.099 DC L1
ENSG00000116205 TCEANC2 951565 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0154 0.144 0.099 DC L1
ENSG00000116209 TMEM59 951645 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0945 0.113 0.099 DC L1
ENSG00000116221 MRPL37 821108 sc-eQTL 3.60e-01 0.14 0.152 0.099 DC L1
ENSG00000157216 SSBP3 591670 sc-eQTL 3.19e-01 -0.135 0.136 0.099 DC L1
ENSG00000162390 ACOT11 462892 sc-eQTL 5.87e-01 0.0711 0.131 0.099 DC L1
ENSG00000162402 USP24 -210215 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0253 0.0789 0.099 DC L1
ENSG00000215883 CYB5RL 805113 sc-eQTL 8.94e-01 0.019 0.143 0.099 DC L1
ENSG00000243725 TTC4 289288 sc-eQTL 4.31e-01 0.121 0.153 0.099 DC L1
ENSG00000116133 DHCR24 117954 sc-eQTL 3.78e-01 0.0791 0.0896 0.103 Mono L1
ENSG00000116205 TCEANC2 951565 sc-eQTL 5.95e-01 0.0515 0.0968 0.103 Mono L1
ENSG00000116209 TMEM59 951645 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0504 0.0718 0.103 Mono L1
ENSG00000116221 MRPL37 821108 sc-eQTL 1.73e-02 0.285 0.119 0.103 Mono L1
ENSG00000157216 SSBP3 591670 sc-eQTL 6.47e-02 -0.254 0.137 0.103 Mono L1
ENSG00000162402 USP24 -210215 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00508 0.0821 0.103 Mono L1
ENSG00000243725 TTC4 289288 sc-eQTL 8.20e-01 -0.033 0.145 0.103 Mono L1
ENSG00000006555 TTC22 203826 sc-eQTL 5.04e-01 0.0849 0.127 0.099 NK L1
ENSG00000116133 DHCR24 117954 sc-eQTL 3.61e-01 0.117 0.128 0.099 NK L1
ENSG00000116205 TCEANC2 951565 sc-eQTL 2.98e-01 0.132 0.126 0.099 NK L1
ENSG00000116209 TMEM59 951645 sc-eQTL 8.49e-01 0.0189 0.0991 0.099 NK L1
ENSG00000116221 MRPL37 821108 sc-eQTL 2.64e-01 0.138 0.123 0.099 NK L1
ENSG00000157216 SSBP3 591670 sc-eQTL 7.46e-02 -0.19 0.106 0.099 NK L1
ENSG00000162398 LEXM 199086 sc-eQTL 8.20e-02 -0.208 0.119 0.099 NK L1
ENSG00000162402 USP24 -210215 sc-eQTL 2.48e-01 -0.084 0.0725 0.099 NK L1
ENSG00000243725 TTC4 289288 sc-eQTL 9.67e-01 0.00567 0.138 0.099 NK L1
ENSG00000006555 TTC22 203826 sc-eQTL 5.05e-01 0.0738 0.111 0.103 Other_T L1
ENSG00000116133 DHCR24 117954 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0197 0.0859 0.103 Other_T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 951565 sc-eQTL 2.09e-01 0.161 0.128 0.103 Other_T L1
ENSG00000116209 TMEM59 951645 sc-eQTL 3.39e-01 -0.0843 0.088 0.103 Other_T L1
ENSG00000116221 MRPL37 821108 sc-eQTL 9.64e-01 0.00372 0.0826 0.103 Other_T L1
ENSG00000157216 SSBP3 591670 sc-eQTL 7.83e-02 -0.168 0.0949 0.103 Other_T L1
ENSG00000162402 USP24 -210215 sc-eQTL 9.58e-01 0.00538 0.102 0.103 Other_T L1
ENSG00000215883 CYB5RL 805113 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0294 0.139 0.103 Other_T L1
ENSG00000243725 TTC4 289288 sc-eQTL 4.72e-01 0.0996 0.138 0.103 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 203826 sc-eQTL 1.92e-01 -0.15 0.115 0.107 B_Activated L2
ENSG00000116133 DHCR24 117954 sc-eQTL 6.44e-01 0.0626 0.135 0.107 B_Activated L2
ENSG00000116205 TCEANC2 951565 sc-eQTL 7.90e-02 -0.254 0.144 0.107 B_Activated L2
ENSG00000116209 TMEM59 951645 sc-eQTL 2.60e-02 -0.341 0.152 0.107 B_Activated L2
ENSG00000116221 MRPL37 821108 sc-eQTL 3.15e-01 0.167 0.166 0.107 B_Activated L2
ENSG00000157216 SSBP3 591670 sc-eQTL 5.88e-01 0.0818 0.151 0.107 B_Activated L2
ENSG00000162402 USP24 -210215 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0768 0.147 0.107 B_Activated L2
ENSG00000215883 CYB5RL 805113 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00423 0.13 0.107 B_Activated L2
ENSG00000243725 TTC4 289288 sc-eQTL 7.80e-01 0.0394 0.141 0.107 B_Activated L2
ENSG00000006555 TTC22 203826 sc-eQTL 2.66e-01 -0.164 0.147 0.103 B_Intermediate L2
ENSG00000116133 DHCR24 117954 sc-eQTL 9.35e-01 -0.0113 0.137 0.103 B_Intermediate L2
ENSG00000116205 TCEANC2 951565 sc-eQTL 7.44e-01 0.0447 0.137 0.103 B_Intermediate L2
ENSG00000116209 TMEM59 951645 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0583 0.117 0.103 B_Intermediate L2
ENSG00000116221 MRPL37 821108 sc-eQTL 1.94e-02 0.32 0.136 0.103 B_Intermediate L2
ENSG00000157216 SSBP3 591670 sc-eQTL 1.16e-01 -0.201 0.128 0.103 B_Intermediate L2
ENSG00000162402 USP24 -210215 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0445 0.108 0.103 B_Intermediate L2
ENSG00000215883 CYB5RL 805113 sc-eQTL 7.77e-01 0.0434 0.153 0.103 B_Intermediate L2
ENSG00000243725 TTC4 289288 sc-eQTL 1.55e-01 0.198 0.139 0.103 B_Intermediate L2
ENSG00000006555 TTC22 203826 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0915 0.138 0.103 B_Memory L2
ENSG00000116133 DHCR24 117954 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0368 0.137 0.103 B_Memory L2
ENSG00000116205 TCEANC2 951565 sc-eQTL 8.72e-01 0.0236 0.146 0.103 B_Memory L2
ENSG00000116209 TMEM59 951645 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0188 0.122 0.103 B_Memory L2
ENSG00000116221 MRPL37 821108 sc-eQTL 1.31e-01 -0.186 0.123 0.103 B_Memory L2
ENSG00000157216 SSBP3 591670 sc-eQTL 3.77e-01 -0.102 0.115 0.103 B_Memory L2
ENSG00000162402 USP24 -210215 sc-eQTL 4.07e-01 0.0937 0.113 0.103 B_Memory L2
ENSG00000215883 CYB5RL 805113 sc-eQTL 1.60e-01 0.196 0.139 0.103 B_Memory L2
ENSG00000243725 TTC4 289288 sc-eQTL 1.26e-01 -0.221 0.144 0.103 B_Memory L2
ENSG00000006555 TTC22 203826 sc-eQTL 5.25e-01 0.0927 0.146 0.103 B_Naive1 L2
ENSG00000116133 DHCR24 117954 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0874 0.137 0.103 B_Naive1 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 951565 sc-eQTL 3.75e-01 0.108 0.122 0.103 B_Naive1 L2
ENSG00000116209 TMEM59 951645 sc-eQTL 9.22e-02 -0.149 0.088 0.103 B_Naive1 L2
ENSG00000116221 MRPL37 821108 sc-eQTL 8.92e-01 0.0177 0.131 0.103 B_Naive1 L2
ENSG00000157216 SSBP3 591670 sc-eQTL 1.03e-01 0.202 0.124 0.103 B_Naive1 L2
ENSG00000162402 USP24 -210215 sc-eQTL 2.43e-01 0.115 0.0977 0.103 B_Naive1 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 805113 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0696 0.148 0.103 B_Naive1 L2
ENSG00000243725 TTC4 289288 sc-eQTL 4.02e-01 -0.112 0.133 0.103 B_Naive1 L2
ENSG00000006555 TTC22 203826 sc-eQTL 1.73e-01 -0.2 0.147 0.103 B_Naive2 L2
ENSG00000116133 DHCR24 117954 sc-eQTL 1.82e-01 -0.171 0.128 0.103 B_Naive2 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 951565 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0549 0.142 0.103 B_Naive2 L2
ENSG00000116209 TMEM59 951645 sc-eQTL 8.83e-03 -0.305 0.115 0.103 B_Naive2 L2
ENSG00000116221 MRPL37 821108 sc-eQTL 4.43e-01 0.106 0.138 0.103 B_Naive2 L2
ENSG00000157216 SSBP3 591670 sc-eQTL 3.00e-01 0.141 0.135 0.103 B_Naive2 L2
ENSG00000162402 USP24 -210215 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00586 0.108 0.103 B_Naive2 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 805113 sc-eQTL 6.01e-02 -0.284 0.15 0.103 B_Naive2 L2
ENSG00000243725 TTC4 289288 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0246 0.158 0.103 B_Naive2 L2
ENSG00000006555 TTC22 203826 sc-eQTL 4.51e-01 -0.104 0.138 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 951565 sc-eQTL 6.20e-02 -0.265 0.141 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 951645 sc-eQTL 6.89e-01 0.0519 0.129 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 821108 sc-eQTL 2.01e-01 -0.203 0.158 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 591670 sc-eQTL 9.39e-01 0.00755 0.0979 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -210215 sc-eQTL 8.07e-03 0.353 0.132 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 289288 sc-eQTL 3.83e-01 0.131 0.15 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 203826 sc-eQTL 1.09e-01 -0.202 0.126 0.103 CD4_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 951565 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0146 0.0961 0.103 CD4_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 951645 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0496 0.0935 0.103 CD4_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 821108 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00451 0.121 0.103 CD4_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 591670 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0578 0.0961 0.103 CD4_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -210215 sc-eQTL 6.63e-01 0.0362 0.083 0.103 CD4_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 289288 sc-eQTL 5.54e-01 0.0749 0.126 0.103 CD4_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 203826 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0731 0.133 0.103 CD4_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 951565 sc-eQTL 3.33e-01 0.125 0.129 0.103 CD4_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 951645 sc-eQTL 2.19e-01 -0.12 0.0972 0.103 CD4_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 821108 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0324 0.123 0.103 CD4_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 591670 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0773 0.12 0.103 CD4_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -210215 sc-eQTL 8.10e-01 -0.024 0.0996 0.103 CD4_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 289288 sc-eQTL 7.87e-01 0.0389 0.143 0.103 CD4_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 203826 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0249 0.155 0.103 CD4_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 951565 sc-eQTL 4.69e-01 0.106 0.146 0.103 CD4_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 951645 sc-eQTL 9.71e-01 0.00418 0.114 0.103 CD4_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 821108 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0207 0.146 0.103 CD4_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 591670 sc-eQTL 9.22e-01 0.0122 0.125 0.103 CD4_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -210215 sc-eQTL 1.79e-01 0.153 0.114 0.103 CD4_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 289288 sc-eQTL 5.28e-01 0.0954 0.151 0.103 CD4_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 203826 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0458 0.122 0.103 CD8_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 951565 sc-eQTL 2.59e-01 0.153 0.135 0.103 CD8_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 951645 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0368 0.118 0.103 CD8_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 821108 sc-eQTL 4.97e-01 0.0949 0.139 0.103 CD8_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 591670 sc-eQTL 6.54e-02 -0.175 0.0947 0.103 CD8_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -210215 sc-eQTL 7.83e-01 0.0261 0.0949 0.103 CD8_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 289288 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0705 0.142 0.103 CD8_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 203826 sc-eQTL 9.50e-01 0.00855 0.136 0.103 CD8_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 951565 sc-eQTL 9.65e-01 0.00533 0.123 0.103 CD8_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 951645 sc-eQTL 6.70e-01 0.0512 0.12 0.103 CD8_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 821108 sc-eQTL 8.64e-01 0.0247 0.144 0.103 CD8_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 591670 sc-eQTL 3.26e-01 -0.107 0.109 0.103 CD8_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -210215 sc-eQTL 8.98e-02 0.168 0.0986 0.103 CD8_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 289288 sc-eQTL 3.52e-01 -0.135 0.145 0.103 CD8_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 203826 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0922 0.146 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 951565 sc-eQTL 5.50e-01 -0.088 0.147 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 951645 sc-eQTL 3.06e-01 -0.133 0.129 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 821108 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0604 0.147 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 591670 sc-eQTL 1.49e-01 -0.184 0.127 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -210215 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00357 0.124 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 289288 sc-eQTL 5.98e-01 0.0793 0.15 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 203826 sc-eQTL 1.72e-01 0.199 0.145 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 951565 sc-eQTL 6.74e-02 -0.278 0.151 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 951645 sc-eQTL 3.81e-03 -0.423 0.144 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 821108 sc-eQTL 3.89e-01 -0.129 0.149 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 591670 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0196 0.141 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -210215 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0633 0.149 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 289288 sc-eQTL 1.04e-01 0.246 0.15 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 203826 sc-eQTL 4.93e-01 -0.09 0.131 0.102 MAIT L2
ENSG00000116133 DHCR24 117954 sc-eQTL 1.16e-01 0.152 0.0965 0.102 MAIT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 951565 sc-eQTL 6.99e-01 0.053 0.137 0.102 MAIT L2
ENSG00000116209 TMEM59 951645 sc-eQTL 1.42e-01 -0.181 0.123 0.102 MAIT L2
ENSG00000116221 MRPL37 821108 sc-eQTL 2.28e-01 -0.181 0.15 0.102 MAIT L2
ENSG00000157216 SSBP3 591670 sc-eQTL 4.80e-02 -0.262 0.132 0.102 MAIT L2
ENSG00000162402 USP24 -210215 sc-eQTL 3.65e-01 0.107 0.118 0.102 MAIT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 805113 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0793 0.137 0.102 MAIT L2
ENSG00000243725 TTC4 289288 sc-eQTL 9.78e-01 0.00375 0.136 0.102 MAIT L2
ENSG00000006555 TTC22 203826 sc-eQTL 4.12e-01 -0.127 0.154 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000116133 DHCR24 117954 sc-eQTL 5.84e-01 0.0748 0.136 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000116205 TCEANC2 951565 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0654 0.144 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000116209 TMEM59 951645 sc-eQTL 7.01e-01 0.054 0.14 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000116221 MRPL37 821108 sc-eQTL 8.38e-01 0.0322 0.157 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000157216 SSBP3 591670 sc-eQTL 3.93e-01 -0.101 0.118 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000162398 LEXM 199086 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0147 0.14 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000162402 USP24 -210215 sc-eQTL 3.85e-01 0.105 0.12 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000243725 TTC4 289288 sc-eQTL 9.83e-01 0.00326 0.152 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000006555 TTC22 203826 sc-eQTL 3.78e-01 0.113 0.128 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000116133 DHCR24 117954 sc-eQTL 4.82e-01 0.0943 0.134 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000116205 TCEANC2 951565 sc-eQTL 3.45e-02 0.306 0.144 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000116209 TMEM59 951645 sc-eQTL 4.10e-01 0.0888 0.108 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000116221 MRPL37 821108 sc-eQTL 6.39e-01 0.0658 0.14 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000157216 SSBP3 591670 sc-eQTL 2.74e-01 -0.125 0.114 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000162398 LEXM 199086 sc-eQTL 1.64e-01 -0.183 0.131 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000162402 USP24 -210215 sc-eQTL 4.38e-01 -0.065 0.0837 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000243725 TTC4 289288 sc-eQTL 9.98e-01 0.00035 0.143 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000006555 TTC22 203826 sc-eQTL 2.23e-01 -0.183 0.15 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000116133 DHCR24 117954 sc-eQTL 9.90e-02 0.241 0.145 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000116205 TCEANC2 951565 sc-eQTL 1.24e-01 -0.217 0.14 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000116209 TMEM59 951645 sc-eQTL 3.29e-01 -0.137 0.14 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000116221 MRPL37 821108 sc-eQTL 4.64e-01 -0.113 0.154 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000157216 SSBP3 591670 sc-eQTL 7.58e-02 -0.223 0.125 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000162398 LEXM 199086 sc-eQTL 4.49e-01 0.108 0.142 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000162402 USP24 -210215 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0483 0.104 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000243725 TTC4 289288 sc-eQTL 4.45e-01 0.119 0.156 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000006555 TTC22 203826 sc-eQTL 3.71e-01 0.122 0.136 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000116133 DHCR24 117954 sc-eQTL 3.56e-01 0.127 0.137 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000116205 TCEANC2 951565 sc-eQTL 7.43e-01 0.0449 0.137 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000116209 TMEM59 951645 sc-eQTL 9.13e-01 0.0121 0.111 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000116221 MRPL37 821108 sc-eQTL 8.25e-01 0.0304 0.137 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000157216 SSBP3 591670 sc-eQTL 6.33e-02 -0.213 0.114 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000162398 LEXM 199086 sc-eQTL 2.83e-01 -0.154 0.143 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000162402 USP24 -210215 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0406 0.0978 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000243725 TTC4 289288 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0347 0.145 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000006555 TTC22 203826 sc-eQTL 8.64e-01 0.0284 0.165 0.111 PB L2
ENSG00000116133 DHCR24 117954 sc-eQTL 3.78e-01 0.129 0.146 0.111 PB L2
ENSG00000116205 TCEANC2 951565 sc-eQTL 4.72e-01 -0.128 0.178 0.111 PB L2
ENSG00000116209 TMEM59 951645 sc-eQTL 8.20e-03 -0.195 0.0723 0.111 PB L2
ENSG00000116221 MRPL37 821108 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0512 0.135 0.111 PB L2
ENSG00000157216 SSBP3 591670 sc-eQTL 6.28e-01 -0.076 0.156 0.111 PB L2
ENSG00000162402 USP24 -210215 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0508 0.178 0.111 PB L2
ENSG00000215883 CYB5RL 805113 sc-eQTL 1.93e-01 -0.239 0.183 0.111 PB L2
ENSG00000243725 TTC4 289288 sc-eQTL 1.80e-01 -0.231 0.171 0.111 PB L2
ENSG00000006555 TTC22 203826 sc-eQTL 3.53e-02 0.279 0.132 0.102 Pro_T L2
ENSG00000116133 DHCR24 117954 sc-eQTL 2.46e-01 -0.131 0.113 0.102 Pro_T L2
ENSG00000116205 TCEANC2 951565 sc-eQTL 9.39e-01 0.0105 0.138 0.102 Pro_T L2
ENSG00000116209 TMEM59 951645 sc-eQTL 9.76e-01 0.00295 0.096 0.102 Pro_T L2
ENSG00000116221 MRPL37 821108 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0252 0.094 0.102 Pro_T L2
ENSG00000157216 SSBP3 591670 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0507 0.105 0.102 Pro_T L2
ENSG00000162402 USP24 -210215 sc-eQTL 1.74e-01 0.175 0.128 0.102 Pro_T L2
ENSG00000215883 CYB5RL 805113 sc-eQTL 9.50e-01 -0.0079 0.127 0.102 Pro_T L2
ENSG00000243725 TTC4 289288 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0562 0.141 0.102 Pro_T L2
ENSG00000006555 TTC22 203826 sc-eQTL 2.62e-01 -0.152 0.135 0.103 Treg L2
ENSG00000116205 TCEANC2 951565 sc-eQTL 9.79e-01 0.0038 0.145 0.103 Treg L2
ENSG00000116209 TMEM59 951645 sc-eQTL 6.68e-01 0.0492 0.115 0.103 Treg L2
ENSG00000116221 MRPL37 821108 sc-eQTL 8.14e-01 0.0334 0.142 0.103 Treg L2
ENSG00000157216 SSBP3 591670 sc-eQTL 6.05e-01 0.0656 0.127 0.103 Treg L2
ENSG00000162402 USP24 -210215 sc-eQTL 9.76e-01 0.00366 0.121 0.103 Treg L2
ENSG00000243725 TTC4 289288 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0646 0.152 0.103 Treg L2
ENSG00000116133 DHCR24 117954 sc-eQTL 5.47e-01 0.0745 0.123 0.105 cDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 951565 sc-eQTL 7.85e-01 0.0397 0.146 0.105 cDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 951645 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0178 0.124 0.105 cDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 821108 sc-eQTL 8.90e-02 0.268 0.157 0.105 cDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 591670 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0369 0.146 0.105 cDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 462892 sc-eQTL 6.16e-01 0.0681 0.136 0.105 cDC L2
ENSG00000162402 USP24 -210215 sc-eQTL 4.19e-02 -0.308 0.15 0.105 cDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 805113 sc-eQTL 9.58e-01 0.00686 0.131 0.105 cDC L2
ENSG00000243725 TTC4 289288 sc-eQTL 6.02e-01 0.0815 0.156 0.105 cDC L2
ENSG00000116133 DHCR24 117954 sc-eQTL 6.85e-01 0.0355 0.0874 0.103 cMono_IL1B L2
ENSG00000116205 TCEANC2 951565 sc-eQTL 2.16e-01 0.15 0.121 0.103 cMono_IL1B L2
ENSG00000116209 TMEM59 951645 sc-eQTL 2.93e-01 -0.0775 0.0734 0.103 cMono_IL1B L2
ENSG00000116221 MRPL37 821108 sc-eQTL 2.84e-01 0.14 0.131 0.103 cMono_IL1B L2
ENSG00000157216 SSBP3 591670 sc-eQTL 1.99e-01 -0.172 0.133 0.103 cMono_IL1B L2
ENSG00000162402 USP24 -210215 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00663 0.0989 0.103 cMono_IL1B L2
ENSG00000243725 TTC4 289288 sc-eQTL 5.75e-01 0.0849 0.151 0.103 cMono_IL1B L2
ENSG00000116133 DHCR24 117954 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00268 0.0814 0.103 cMono_S100A L2
ENSG00000116205 TCEANC2 951565 sc-eQTL 5.80e-02 -0.235 0.123 0.103 cMono_S100A L2
ENSG00000116209 TMEM59 951645 sc-eQTL 9.88e-01 0.00152 0.0994 0.103 cMono_S100A L2
ENSG00000116221 MRPL37 821108 sc-eQTL 2.29e-04 0.522 0.139 0.103 cMono_S100A L2
ENSG00000157216 SSBP3 591670 sc-eQTL 1.14e-01 -0.235 0.148 0.103 cMono_S100A L2
ENSG00000162402 USP24 -210215 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00318 0.121 0.103 cMono_S100A L2
ENSG00000243725 TTC4 289288 sc-eQTL 4.90e-01 -0.104 0.151 0.103 cMono_S100A L2
ENSG00000006555 TTC22 203826 sc-eQTL 9.54e-01 0.00808 0.139 0.103 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 117954 sc-eQTL 3.34e-01 0.149 0.154 0.103 gdT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 951565 sc-eQTL 4.53e-01 0.117 0.155 0.103 gdT L2
ENSG00000116209 TMEM59 951645 sc-eQTL 2.12e-01 -0.196 0.157 0.103 gdT L2
ENSG00000116221 MRPL37 821108 sc-eQTL 5.05e-01 -0.12 0.18 0.103 gdT L2
ENSG00000157216 SSBP3 591670 sc-eQTL 1.74e-02 -0.261 0.108 0.103 gdT L2
ENSG00000162402 USP24 -210215 sc-eQTL 2.14e-01 -0.184 0.148 0.103 gdT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 805113 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0697 0.154 0.103 gdT L2
ENSG00000243725 TTC4 289288 sc-eQTL 4.72e-01 -0.125 0.174 0.103 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 117954 sc-eQTL 1.87e-01 0.148 0.112 0.1 intMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 951565 sc-eQTL 1.08e-01 0.224 0.139 0.1 intMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 951645 sc-eQTL 3.42e-01 0.0975 0.102 0.1 intMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 821108 sc-eQTL 9.35e-01 0.0129 0.157 0.1 intMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 591670 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0201 0.16 0.1 intMono L2
ENSG00000162402 USP24 -210215 sc-eQTL 9.43e-01 -0.0103 0.143 0.1 intMono L2
ENSG00000243725 TTC4 289288 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0545 0.152 0.1 intMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 117954 sc-eQTL 3.99e-01 0.0938 0.111 0.102 ncMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 951565 sc-eQTL 1.29e-01 0.211 0.138 0.102 ncMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 951645 sc-eQTL 7.23e-01 0.0394 0.111 0.102 ncMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 821108 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0224 0.143 0.102 ncMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 591670 sc-eQTL 6.27e-02 -0.291 0.155 0.102 ncMono L2
ENSG00000162402 USP24 -210215 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0327 0.125 0.102 ncMono L2
ENSG00000243725 TTC4 289288 sc-eQTL 1.28e-01 -0.225 0.147 0.102 ncMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 117954 sc-eQTL 7.34e-01 0.043 0.126 0.119 pDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 951565 sc-eQTL 1.37e-01 -0.225 0.15 0.119 pDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 951645 sc-eQTL 4.15e-01 0.0985 0.121 0.119 pDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 821108 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00815 0.161 0.119 pDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 591670 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0343 0.143 0.119 pDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 462892 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00162 0.0599 0.119 pDC L2
ENSG00000162402 USP24 -210215 sc-eQTL 4.95e-01 0.0691 0.101 0.119 pDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 805113 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0669 0.138 0.119 pDC L2
ENSG00000243725 TTC4 289288 sc-eQTL 9.78e-01 0.0044 0.16 0.119 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 203826 sc-eQTL 1.49e-01 -0.204 0.141 0.103 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 117954 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0253 0.142 0.103 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 951565 sc-eQTL 9.85e-01 0.0026 0.137 0.103 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 951645 sc-eQTL 1.33e-01 -0.16 0.106 0.103 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 821108 sc-eQTL 1.99e-01 0.164 0.127 0.103 B_Memory LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 591670 sc-eQTL 1.35e-01 -0.166 0.111 0.103 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -210215 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00857 0.102 0.103 B_Memory LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 805113 sc-eQTL 7.43e-01 0.0511 0.156 0.103 B_Memory LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 289288 sc-eQTL 7.29e-01 0.0486 0.14 0.103 B_Memory LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 203826 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0708 0.148 0.103 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 117954 sc-eQTL 1.31e-01 -0.201 0.132 0.103 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 951565 sc-eQTL 5.89e-01 0.065 0.12 0.103 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 951645 sc-eQTL 1.62e-02 -0.204 0.0843 0.103 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 821108 sc-eQTL 7.00e-01 0.0474 0.123 0.103 B_Naive LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 591670 sc-eQTL 1.09e-01 0.176 0.109 0.103 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -210215 sc-eQTL 4.29e-01 0.0746 0.0941 0.103 B_Naive LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 805113 sc-eQTL 8.86e-02 -0.253 0.148 0.103 B_Naive LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 289288 sc-eQTL 2.21e-01 -0.172 0.14 0.103 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 117954 sc-eQTL 9.19e-01 0.0086 0.0841 0.103 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 951565 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0601 0.105 0.103 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 951645 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0374 0.0725 0.103 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 821108 sc-eQTL 3.79e-03 0.369 0.126 0.103 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 591670 sc-eQTL 8.58e-02 -0.23 0.134 0.103 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -210215 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0162 0.0919 0.103 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 289288 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0133 0.152 0.103 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 117954 sc-eQTL 3.25e-01 0.105 0.107 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 951565 sc-eQTL 6.33e-02 0.261 0.14 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 951645 sc-eQTL 6.91e-01 0.0416 0.105 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 821108 sc-eQTL 9.94e-01 0.00102 0.143 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 591670 sc-eQTL 2.05e-01 -0.194 0.152 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -210215 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0922 0.12 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 289288 sc-eQTL 2.34e-01 -0.18 0.151 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 203826 sc-eQTL 4.06e-01 0.103 0.124 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 117954 sc-eQTL 4.31e-01 0.103 0.13 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 951565 sc-eQTL 1.86e-01 0.169 0.127 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 951645 sc-eQTL 7.52e-01 0.0312 0.0986 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 821108 sc-eQTL 4.74e-01 0.0947 0.132 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 591670 sc-eQTL 5.01e-02 -0.212 0.107 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162398 LEXM 199086 sc-eQTL 1.23e-01 -0.188 0.121 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -210215 sc-eQTL 3.12e-01 -0.0783 0.0773 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 289288 sc-eQTL 9.85e-01 0.00261 0.138 0.099 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000116133 DHCR24 117954 eQTL 0.0112 0.0986 0.0388 0.0 0.0 0.131
ENSG00000162398 LEXM 199086 eQTL 0.000341 -0.107 0.0297 0.0 0.0 0.131

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000116133 DHCR24 117954 5.66e-06 6.73e-06 9.7e-07 3.83e-06 1.9e-06 2.09e-06 8.61e-06 1.34e-06 5.07e-06 3.39e-06 8.05e-06 3.63e-06 1.02e-05 2.66e-06 1.03e-06 5.06e-06 3.19e-06 3.84e-06 1.92e-06 1.8e-06 3.25e-06 6.84e-06 5.12e-06 1.91e-06 9.38e-06 2.32e-06 3.61e-06 2.21e-06 5.8e-06 6.59e-06 3.36e-06 8.22e-07 7.77e-07 2.58e-06 1.99e-06 2.12e-06 1.31e-06 9.82e-07 1.3e-06 7.61e-07 7.14e-07 8.29e-06 1.14e-06 1.92e-07 6.87e-07 8.07e-07 9.67e-07 6.45e-07 5.87e-07