Genes within 1Mb (chr1:55003246:G:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 201923 sc-eQTL 2.55e-01 -0.158 0.138 0.098 B L1
ENSG00000116133 DHCR24 116051 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00476 0.131 0.098 B L1
ENSG00000116205 TCEANC2 949662 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0143 0.113 0.098 B L1
ENSG00000116209 TMEM59 949742 sc-eQTL 2.64e-02 -0.153 0.0682 0.098 B L1
ENSG00000116221 MRPL37 819205 sc-eQTL 2.15e-02 0.207 0.0892 0.098 B L1
ENSG00000157216 SSBP3 589767 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0102 0.0945 0.098 B L1
ENSG00000162402 USP24 -212118 sc-eQTL 6.40e-01 0.0375 0.0801 0.098 B L1
ENSG00000215883 CYB5RL 803210 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0997 0.154 0.098 B L1
ENSG00000243725 TTC4 287385 sc-eQTL 1.48e-01 -0.194 0.134 0.098 B L1
ENSG00000006555 TTC22 201923 sc-eQTL 1.04e-01 -0.176 0.108 0.098 CD4T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 949662 sc-eQTL 9.26e-01 0.00826 0.0886 0.098 CD4T L1
ENSG00000116209 TMEM59 949742 sc-eQTL 3.14e-01 -0.0831 0.0823 0.098 CD4T L1
ENSG00000116221 MRPL37 819205 sc-eQTL 7.64e-01 0.0343 0.114 0.098 CD4T L1
ENSG00000157216 SSBP3 589767 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0136 0.0947 0.098 CD4T L1
ENSG00000162402 USP24 -212118 sc-eQTL 4.01e-01 0.0649 0.077 0.098 CD4T L1
ENSG00000243725 TTC4 287385 sc-eQTL 4.53e-01 0.0872 0.116 0.098 CD4T L1
ENSG00000006555 TTC22 201923 sc-eQTL 9.15e-01 0.01 0.0941 0.098 CD8T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 949662 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0428 0.117 0.098 CD8T L1
ENSG00000116209 TMEM59 949742 sc-eQTL 2.49e-01 -0.0938 0.0812 0.098 CD8T L1
ENSG00000116221 MRPL37 819205 sc-eQTL 6.90e-01 0.0447 0.112 0.098 CD8T L1
ENSG00000157216 SSBP3 589767 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0593 0.0804 0.098 CD8T L1
ENSG00000162402 USP24 -212118 sc-eQTL 3.83e-01 0.068 0.0777 0.098 CD8T L1
ENSG00000243725 TTC4 287385 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0202 0.135 0.098 CD8T L1
ENSG00000116133 DHCR24 116051 sc-eQTL 5.01e-01 0.0878 0.13 0.095 DC L1
ENSG00000116205 TCEANC2 949662 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00195 0.146 0.095 DC L1
ENSG00000116209 TMEM59 949742 sc-eQTL 3.15e-01 -0.115 0.115 0.095 DC L1
ENSG00000116221 MRPL37 819205 sc-eQTL 2.66e-01 0.171 0.154 0.095 DC L1
ENSG00000157216 SSBP3 589767 sc-eQTL 2.70e-01 -0.152 0.137 0.095 DC L1
ENSG00000162390 ACOT11 460989 sc-eQTL 8.89e-01 0.0186 0.132 0.095 DC L1
ENSG00000162402 USP24 -212118 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0673 0.0796 0.095 DC L1
ENSG00000215883 CYB5RL 803210 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0158 0.144 0.095 DC L1
ENSG00000243725 TTC4 287385 sc-eQTL 4.24e-01 0.124 0.155 0.095 DC L1
ENSG00000116133 DHCR24 116051 sc-eQTL 4.47e-01 0.0689 0.0904 0.098 Mono L1
ENSG00000116205 TCEANC2 949662 sc-eQTL 5.03e-01 0.0654 0.0975 0.098 Mono L1
ENSG00000116209 TMEM59 949742 sc-eQTL 2.06e-01 -0.0916 0.0722 0.098 Mono L1
ENSG00000116221 MRPL37 819205 sc-eQTL 1.11e-02 0.306 0.119 0.098 Mono L1
ENSG00000157216 SSBP3 589767 sc-eQTL 2.22e-02 -0.316 0.137 0.098 Mono L1
ENSG00000162402 USP24 -212118 sc-eQTL 9.57e-01 0.00451 0.0828 0.098 Mono L1
ENSG00000243725 TTC4 287385 sc-eQTL 9.84e-01 0.00299 0.146 0.098 Mono L1
ENSG00000006555 TTC22 201923 sc-eQTL 3.61e-01 0.117 0.128 0.094 NK L1
ENSG00000116133 DHCR24 116051 sc-eQTL 5.19e-01 0.0835 0.129 0.094 NK L1
ENSG00000116205 TCEANC2 949662 sc-eQTL 3.34e-01 0.123 0.127 0.094 NK L1
ENSG00000116209 TMEM59 949742 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0224 0.0999 0.094 NK L1
ENSG00000116221 MRPL37 819205 sc-eQTL 1.23e-01 0.191 0.123 0.094 NK L1
ENSG00000157216 SSBP3 589767 sc-eQTL 5.72e-02 -0.204 0.107 0.094 NK L1
ENSG00000162398 LEXM 197183 sc-eQTL 1.20e-01 -0.187 0.12 0.094 NK L1
ENSG00000162402 USP24 -212118 sc-eQTL 1.80e-01 -0.0981 0.073 0.094 NK L1
ENSG00000243725 TTC4 287385 sc-eQTL 9.11e-01 0.0156 0.139 0.094 NK L1
ENSG00000006555 TTC22 201923 sc-eQTL 6.78e-01 0.0465 0.112 0.098 Other_T L1
ENSG00000116133 DHCR24 116051 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0336 0.0868 0.098 Other_T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 949662 sc-eQTL 1.61e-01 0.182 0.129 0.098 Other_T L1
ENSG00000116209 TMEM59 949742 sc-eQTL 2.44e-01 -0.104 0.0889 0.098 Other_T L1
ENSG00000116221 MRPL37 819205 sc-eQTL 6.92e-01 0.0331 0.0835 0.098 Other_T L1
ENSG00000157216 SSBP3 589767 sc-eQTL 3.89e-02 -0.199 0.0956 0.098 Other_T L1
ENSG00000162402 USP24 -212118 sc-eQTL 8.23e-01 0.023 0.103 0.098 Other_T L1
ENSG00000215883 CYB5RL 803210 sc-eQTL 9.97e-01 0.000492 0.141 0.098 Other_T L1
ENSG00000243725 TTC4 287385 sc-eQTL 5.24e-01 0.0894 0.14 0.098 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 201923 sc-eQTL 2.53e-01 -0.132 0.115 0.105 B_Activated L2
ENSG00000116133 DHCR24 116051 sc-eQTL 6.40e-01 0.0634 0.135 0.105 B_Activated L2
ENSG00000116205 TCEANC2 949662 sc-eQTL 1.04e-01 -0.235 0.144 0.105 B_Activated L2
ENSG00000116209 TMEM59 949742 sc-eQTL 3.56e-02 -0.323 0.152 0.105 B_Activated L2
ENSG00000116221 MRPL37 819205 sc-eQTL 2.62e-01 0.187 0.166 0.105 B_Activated L2
ENSG00000157216 SSBP3 589767 sc-eQTL 5.80e-01 0.0837 0.151 0.105 B_Activated L2
ENSG00000162402 USP24 -212118 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0709 0.147 0.105 B_Activated L2
ENSG00000215883 CYB5RL 803210 sc-eQTL 9.48e-01 0.00854 0.13 0.105 B_Activated L2
ENSG00000243725 TTC4 287385 sc-eQTL 7.46e-01 0.0458 0.141 0.105 B_Activated L2
ENSG00000006555 TTC22 201923 sc-eQTL 1.91e-01 -0.194 0.148 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000116133 DHCR24 116051 sc-eQTL 9.89e-01 0.00199 0.138 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000116205 TCEANC2 949662 sc-eQTL 9.27e-01 0.0126 0.137 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000116209 TMEM59 949742 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0793 0.117 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000116221 MRPL37 819205 sc-eQTL 7.68e-03 0.366 0.136 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000157216 SSBP3 589767 sc-eQTL 1.23e-01 -0.199 0.128 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000162402 USP24 -212118 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0616 0.109 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000215883 CYB5RL 803210 sc-eQTL 4.86e-01 0.107 0.154 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000243725 TTC4 287385 sc-eQTL 1.52e-01 0.2 0.139 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000006555 TTC22 201923 sc-eQTL 5.49e-01 -0.084 0.14 0.099 B_Memory L2
ENSG00000116133 DHCR24 116051 sc-eQTL 9.34e-01 -0.0115 0.139 0.099 B_Memory L2
ENSG00000116205 TCEANC2 949662 sc-eQTL 6.05e-01 0.0769 0.148 0.099 B_Memory L2
ENSG00000116209 TMEM59 949742 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0202 0.124 0.099 B_Memory L2
ENSG00000116221 MRPL37 819205 sc-eQTL 2.30e-01 -0.15 0.125 0.099 B_Memory L2
ENSG00000157216 SSBP3 589767 sc-eQTL 2.86e-01 -0.125 0.117 0.099 B_Memory L2
ENSG00000162402 USP24 -212118 sc-eQTL 5.54e-01 0.0679 0.114 0.099 B_Memory L2
ENSG00000215883 CYB5RL 803210 sc-eQTL 1.55e-01 0.201 0.141 0.099 B_Memory L2
ENSG00000243725 TTC4 287385 sc-eQTL 1.77e-01 -0.198 0.146 0.099 B_Memory L2
ENSG00000006555 TTC22 201923 sc-eQTL 5.59e-01 0.0859 0.147 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000116133 DHCR24 116051 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0903 0.137 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 949662 sc-eQTL 3.33e-01 0.119 0.122 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000116209 TMEM59 949742 sc-eQTL 5.21e-02 -0.173 0.0884 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000116221 MRPL37 819205 sc-eQTL 7.52e-01 0.0417 0.131 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000157216 SSBP3 589767 sc-eQTL 1.23e-01 0.193 0.125 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000162402 USP24 -212118 sc-eQTL 4.24e-01 0.0788 0.0985 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 803210 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0506 0.149 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000243725 TTC4 287385 sc-eQTL 4.56e-01 -0.1 0.134 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000006555 TTC22 201923 sc-eQTL 1.66e-01 -0.205 0.147 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000116133 DHCR24 116051 sc-eQTL 2.11e-01 -0.161 0.128 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 949662 sc-eQTL 6.65e-01 -0.062 0.143 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000116209 TMEM59 949742 sc-eQTL 8.50e-03 -0.308 0.116 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000116221 MRPL37 819205 sc-eQTL 3.15e-01 0.139 0.138 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000157216 SSBP3 589767 sc-eQTL 3.90e-01 0.117 0.136 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000162402 USP24 -212118 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00813 0.108 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 803210 sc-eQTL 5.60e-02 -0.29 0.151 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000243725 TTC4 287385 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0364 0.158 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000006555 TTC22 201923 sc-eQTL 3.23e-01 -0.138 0.139 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 949662 sc-eQTL 3.05e-02 -0.308 0.142 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 949742 sc-eQTL 6.67e-01 0.0561 0.13 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 819205 sc-eQTL 1.44e-01 -0.234 0.159 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 589767 sc-eQTL 8.77e-01 0.0152 0.0985 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -212118 sc-eQTL 4.10e-03 0.385 0.133 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 287385 sc-eQTL 2.46e-01 0.176 0.151 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 201923 sc-eQTL 1.62e-01 -0.177 0.126 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 949662 sc-eQTL 9.10e-01 0.0109 0.0966 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 949742 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0829 0.0938 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 819205 sc-eQTL 8.56e-01 0.022 0.121 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 589767 sc-eQTL 5.28e-01 -0.061 0.0966 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -212118 sc-eQTL 6.26e-01 0.0407 0.0834 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 287385 sc-eQTL 6.53e-01 0.0572 0.127 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 201923 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0947 0.134 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 949662 sc-eQTL 3.37e-01 0.125 0.13 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 949742 sc-eQTL 1.44e-01 -0.143 0.0976 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 819205 sc-eQTL 7.43e-01 0.0405 0.123 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 589767 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0747 0.121 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -212118 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0728 0.1 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 287385 sc-eQTL 6.44e-01 0.0668 0.144 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 201923 sc-eQTL 9.37e-01 -0.0124 0.155 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 949662 sc-eQTL 3.84e-01 0.128 0.147 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 949742 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0484 0.114 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 819205 sc-eQTL 9.56e-01 0.00819 0.147 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 589767 sc-eQTL 7.76e-01 0.0358 0.126 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -212118 sc-eQTL 2.30e-01 0.137 0.114 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 287385 sc-eQTL 5.17e-01 0.098 0.151 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 201923 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0116 0.123 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 949662 sc-eQTL 1.68e-01 0.188 0.136 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 949742 sc-eQTL 3.60e-01 -0.109 0.119 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 819205 sc-eQTL 4.20e-01 0.114 0.141 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 589767 sc-eQTL 6.17e-02 -0.179 0.0954 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -212118 sc-eQTL 9.39e-01 0.00736 0.0957 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 287385 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0721 0.143 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 201923 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0506 0.138 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 949662 sc-eQTL 9.33e-01 -0.0105 0.125 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 949742 sc-eQTL 8.73e-01 0.0195 0.122 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 819205 sc-eQTL 5.50e-01 0.0875 0.146 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 589767 sc-eQTL 2.79e-01 -0.12 0.11 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -212118 sc-eQTL 1.27e-01 0.153 0.1 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 287385 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0884 0.147 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 201923 sc-eQTL 4.05e-01 -0.124 0.148 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 949662 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0765 0.149 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 949742 sc-eQTL 1.45e-01 -0.191 0.131 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 819205 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0336 0.149 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 589767 sc-eQTL 1.57e-01 -0.183 0.129 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -212118 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0469 0.126 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 287385 sc-eQTL 7.71e-01 0.0446 0.153 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 201923 sc-eQTL 2.07e-01 0.185 0.147 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 949662 sc-eQTL 7.42e-02 -0.273 0.152 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 949742 sc-eQTL 3.57e-03 -0.429 0.145 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 819205 sc-eQTL 4.36e-01 -0.117 0.15 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 589767 sc-eQTL 9.32e-01 0.0121 0.142 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -212118 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0997 0.15 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 287385 sc-eQTL 7.96e-02 0.266 0.151 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 201923 sc-eQTL 4.48e-01 -0.1 0.132 0.1 MAIT L2
ENSG00000116133 DHCR24 116051 sc-eQTL 1.05e-01 0.158 0.0971 0.1 MAIT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 949662 sc-eQTL 7.96e-01 0.0357 0.138 0.1 MAIT L2
ENSG00000116209 TMEM59 949742 sc-eQTL 1.45e-01 -0.181 0.124 0.1 MAIT L2
ENSG00000116221 MRPL37 819205 sc-eQTL 3.13e-01 -0.152 0.151 0.1 MAIT L2
ENSG00000157216 SSBP3 589767 sc-eQTL 3.83e-02 -0.276 0.132 0.1 MAIT L2
ENSG00000162402 USP24 -212118 sc-eQTL 3.48e-01 0.112 0.119 0.1 MAIT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 803210 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0566 0.138 0.1 MAIT L2
ENSG00000243725 TTC4 287385 sc-eQTL 9.25e-01 0.0129 0.137 0.1 MAIT L2
ENSG00000006555 TTC22 201923 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0886 0.156 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000116133 DHCR24 116051 sc-eQTL 4.17e-01 0.112 0.137 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000116205 TCEANC2 949662 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0909 0.145 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000116209 TMEM59 949742 sc-eQTL 6.95e-01 0.0557 0.142 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000116221 MRPL37 819205 sc-eQTL 9.49e-01 0.0102 0.158 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000157216 SSBP3 589767 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0629 0.119 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000162398 LEXM 197183 sc-eQTL 9.86e-01 0.00248 0.141 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000162402 USP24 -212118 sc-eQTL 5.90e-01 0.0654 0.121 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000243725 TTC4 287385 sc-eQTL 9.85e-01 0.00283 0.153 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000006555 TTC22 201923 sc-eQTL 1.95e-01 0.168 0.129 0.095 NK_CD56dim L2
ENSG00000116133 DHCR24 116051 sc-eQTL 6.94e-01 0.0534 0.135 0.095 NK_CD56dim L2
ENSG00000116205 TCEANC2 949662 sc-eQTL 4.70e-02 0.29 0.145 0.095 NK_CD56dim L2
ENSG00000116209 TMEM59 949742 sc-eQTL 5.82e-01 0.0599 0.109 0.095 NK_CD56dim L2
ENSG00000116221 MRPL37 819205 sc-eQTL 4.81e-01 0.0997 0.141 0.095 NK_CD56dim L2
ENSG00000157216 SSBP3 589767 sc-eQTL 2.41e-01 -0.136 0.115 0.095 NK_CD56dim L2
ENSG00000162398 LEXM 197183 sc-eQTL 2.08e-01 -0.167 0.133 0.095 NK_CD56dim L2
ENSG00000162402 USP24 -212118 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0684 0.0844 0.095 NK_CD56dim L2
ENSG00000243725 TTC4 287385 sc-eQTL 9.94e-01 -0.00103 0.145 0.095 NK_CD56dim L2
ENSG00000006555 TTC22 201923 sc-eQTL 3.50e-01 -0.142 0.151 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000116133 DHCR24 116051 sc-eQTL 8.96e-02 0.251 0.147 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000116205 TCEANC2 949662 sc-eQTL 2.09e-01 -0.179 0.142 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000116209 TMEM59 949742 sc-eQTL 1.48e-01 -0.205 0.141 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000116221 MRPL37 819205 sc-eQTL 6.69e-01 -0.067 0.156 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000157216 SSBP3 589767 sc-eQTL 6.58e-02 -0.234 0.126 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000162398 LEXM 197183 sc-eQTL 8.59e-01 0.0256 0.144 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000162402 USP24 -212118 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0804 0.105 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000243725 TTC4 287385 sc-eQTL 5.68e-01 0.09 0.158 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000006555 TTC22 201923 sc-eQTL 4.74e-01 0.0986 0.137 0.095 NK_cytokine L2
ENSG00000116133 DHCR24 116051 sc-eQTL 4.85e-01 0.0973 0.139 0.095 NK_cytokine L2
ENSG00000116205 TCEANC2 949662 sc-eQTL 7.63e-01 0.0416 0.138 0.095 NK_cytokine L2
ENSG00000116209 TMEM59 949742 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0305 0.112 0.095 NK_cytokine L2
ENSG00000116221 MRPL37 819205 sc-eQTL 4.95e-01 0.0945 0.138 0.095 NK_cytokine L2
ENSG00000157216 SSBP3 589767 sc-eQTL 5.59e-02 -0.221 0.115 0.095 NK_cytokine L2
ENSG00000162398 LEXM 197183 sc-eQTL 4.22e-01 -0.116 0.145 0.095 NK_cytokine L2
ENSG00000162402 USP24 -212118 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0721 0.0988 0.095 NK_cytokine L2
ENSG00000243725 TTC4 287385 sc-eQTL 9.43e-01 -0.0106 0.147 0.095 NK_cytokine L2
ENSG00000006555 TTC22 201923 sc-eQTL 9.04e-01 0.0204 0.169 0.104 PB L2
ENSG00000116133 DHCR24 116051 sc-eQTL 3.64e-01 0.136 0.149 0.104 PB L2
ENSG00000116205 TCEANC2 949662 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0512 0.182 0.104 PB L2
ENSG00000116209 TMEM59 949742 sc-eQTL 1.84e-03 -0.233 0.073 0.104 PB L2
ENSG00000116221 MRPL37 819205 sc-eQTL 8.99e-01 0.0177 0.139 0.104 PB L2
ENSG00000157216 SSBP3 589767 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0501 0.16 0.104 PB L2
ENSG00000162402 USP24 -212118 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0272 0.182 0.104 PB L2
ENSG00000215883 CYB5RL 803210 sc-eQTL 5.71e-02 -0.356 0.185 0.104 PB L2
ENSG00000243725 TTC4 287385 sc-eQTL 1.97e-01 -0.227 0.175 0.104 PB L2
ENSG00000006555 TTC22 201923 sc-eQTL 1.47e-02 0.327 0.133 0.098 Pro_T L2
ENSG00000116133 DHCR24 116051 sc-eQTL 3.51e-01 -0.107 0.114 0.098 Pro_T L2
ENSG00000116205 TCEANC2 949662 sc-eQTL 8.76e-01 0.0219 0.14 0.098 Pro_T L2
ENSG00000116209 TMEM59 949742 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00285 0.0972 0.098 Pro_T L2
ENSG00000116221 MRPL37 819205 sc-eQTL 9.98e-01 -0.00024 0.0952 0.098 Pro_T L2
ENSG00000157216 SSBP3 589767 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0925 0.107 0.098 Pro_T L2
ENSG00000162402 USP24 -212118 sc-eQTL 2.04e-01 0.165 0.13 0.098 Pro_T L2
ENSG00000215883 CYB5RL 803210 sc-eQTL 9.14e-01 0.0139 0.128 0.098 Pro_T L2
ENSG00000243725 TTC4 287385 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0335 0.143 0.098 Pro_T L2
ENSG00000006555 TTC22 201923 sc-eQTL 2.71e-01 -0.15 0.136 0.098 Treg L2
ENSG00000116205 TCEANC2 949662 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0414 0.146 0.098 Treg L2
ENSG00000116209 TMEM59 949742 sc-eQTL 9.55e-01 0.00648 0.115 0.098 Treg L2
ENSG00000116221 MRPL37 819205 sc-eQTL 3.84e-01 0.125 0.143 0.098 Treg L2
ENSG00000157216 SSBP3 589767 sc-eQTL 6.89e-01 0.051 0.127 0.098 Treg L2
ENSG00000162402 USP24 -212118 sc-eQTL 9.95e-01 0.000788 0.121 0.098 Treg L2
ENSG00000243725 TTC4 287385 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0438 0.153 0.098 Treg L2
ENSG00000116133 DHCR24 116051 sc-eQTL 6.13e-01 0.0632 0.125 0.1 cDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 949662 sc-eQTL 7.48e-01 0.0474 0.147 0.1 cDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 949742 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0441 0.125 0.1 cDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 819205 sc-eQTL 7.59e-02 0.283 0.159 0.1 cDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 589767 sc-eQTL 4.58e-01 -0.11 0.147 0.1 cDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 460989 sc-eQTL 9.90e-01 0.00174 0.137 0.1 cDC L2
ENSG00000162402 USP24 -212118 sc-eQTL 3.55e-02 -0.322 0.152 0.1 cDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 803210 sc-eQTL 8.56e-01 0.024 0.132 0.1 cDC L2
ENSG00000243725 TTC4 287385 sc-eQTL 6.56e-01 0.0704 0.158 0.1 cDC L2
ENSG00000116133 DHCR24 116051 sc-eQTL 6.49e-01 0.0402 0.0882 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000116205 TCEANC2 949662 sc-eQTL 1.56e-01 0.174 0.122 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000116209 TMEM59 949742 sc-eQTL 1.17e-01 -0.116 0.0739 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000116221 MRPL37 819205 sc-eQTL 2.94e-01 0.139 0.132 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000157216 SSBP3 589767 sc-eQTL 9.23e-02 -0.227 0.134 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000162402 USP24 -212118 sc-eQTL 8.86e-01 0.0144 0.0999 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000243725 TTC4 287385 sc-eQTL 5.78e-01 0.0849 0.153 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000116133 DHCR24 116051 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0312 0.0822 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000116205 TCEANC2 949662 sc-eQTL 8.25e-02 -0.217 0.125 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000116209 TMEM59 949742 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0206 0.1 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000116221 MRPL37 819205 sc-eQTL 1.40e-04 0.544 0.14 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000157216 SSBP3 589767 sc-eQTL 7.31e-02 -0.269 0.149 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000162402 USP24 -212118 sc-eQTL 9.10e-01 0.0138 0.122 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000243725 TTC4 287385 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0817 0.153 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000006555 TTC22 201923 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0337 0.141 0.1 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 116051 sc-eQTL 4.39e-01 0.121 0.157 0.1 gdT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 949662 sc-eQTL 4.75e-01 0.113 0.157 0.1 gdT L2
ENSG00000116209 TMEM59 949742 sc-eQTL 2.57e-01 -0.181 0.159 0.1 gdT L2
ENSG00000116221 MRPL37 819205 sc-eQTL 4.20e-01 -0.148 0.183 0.1 gdT L2
ENSG00000157216 SSBP3 589767 sc-eQTL 1.83e-02 -0.263 0.11 0.1 gdT L2
ENSG00000162402 USP24 -212118 sc-eQTL 3.40e-01 -0.144 0.15 0.1 gdT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 803210 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0492 0.157 0.1 gdT L2
ENSG00000243725 TTC4 287385 sc-eQTL 4.80e-01 -0.125 0.176 0.1 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 116051 sc-eQTL 2.79e-01 0.123 0.113 0.096 intMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 949662 sc-eQTL 8.68e-02 0.241 0.14 0.096 intMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 949742 sc-eQTL 4.56e-01 0.0773 0.104 0.096 intMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 819205 sc-eQTL 7.40e-01 0.0527 0.159 0.096 intMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 589767 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0943 0.162 0.096 intMono L2
ENSG00000162402 USP24 -212118 sc-eQTL 7.77e-01 -0.041 0.145 0.096 intMono L2
ENSG00000243725 TTC4 287385 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0334 0.154 0.096 intMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 116051 sc-eQTL 4.94e-01 0.0769 0.112 0.097 ncMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 949662 sc-eQTL 2.05e-01 0.178 0.14 0.097 ncMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 949742 sc-eQTL 9.43e-01 -0.008 0.112 0.097 ncMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 819205 sc-eQTL 9.48e-01 0.00941 0.145 0.097 ncMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 589767 sc-eQTL 8.10e-02 -0.276 0.157 0.097 ncMono L2
ENSG00000162402 USP24 -212118 sc-eQTL 6.31e-01 -0.061 0.127 0.097 ncMono L2
ENSG00000243725 TTC4 287385 sc-eQTL 3.19e-01 -0.149 0.15 0.097 ncMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 116051 sc-eQTL 8.36e-01 0.0263 0.127 0.113 pDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 949662 sc-eQTL 1.67e-01 -0.21 0.151 0.113 pDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 949742 sc-eQTL 6.22e-01 0.0601 0.121 0.113 pDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 819205 sc-eQTL 8.16e-01 0.0376 0.161 0.113 pDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 589767 sc-eQTL 9.64e-01 0.00655 0.143 0.113 pDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 460989 sc-eQTL 7.78e-01 -0.017 0.0603 0.113 pDC L2
ENSG00000162402 USP24 -212118 sc-eQTL 7.76e-01 0.0289 0.102 0.113 pDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 803210 sc-eQTL 4.35e-01 -0.109 0.139 0.113 pDC L2
ENSG00000243725 TTC4 287385 sc-eQTL 8.94e-01 0.0215 0.161 0.113 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 201923 sc-eQTL 1.15e-01 -0.223 0.141 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 116051 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00824 0.143 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 949662 sc-eQTL 9.85e-01 0.00267 0.138 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 949742 sc-eQTL 9.18e-02 -0.18 0.106 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 819205 sc-eQTL 6.66e-02 0.235 0.127 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 589767 sc-eQTL 9.90e-02 -0.184 0.111 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -212118 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0233 0.102 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 803210 sc-eQTL 5.24e-01 0.0998 0.156 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 287385 sc-eQTL 7.50e-01 0.0449 0.14 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 201923 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0856 0.148 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 116051 sc-eQTL 7.84e-02 -0.235 0.133 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 949662 sc-eQTL 5.75e-01 0.0678 0.121 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 949742 sc-eQTL 1.36e-02 -0.211 0.0846 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 819205 sc-eQTL 4.41e-01 0.0951 0.123 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 589767 sc-eQTL 1.26e-01 0.168 0.11 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -212118 sc-eQTL 5.19e-01 0.0611 0.0946 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 803210 sc-eQTL 1.07e-01 -0.241 0.149 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 287385 sc-eQTL 2.18e-01 -0.174 0.141 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 116051 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00315 0.0848 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 949662 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0395 0.106 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 949742 sc-eQTL 3.38e-01 -0.0702 0.073 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 819205 sc-eQTL 3.41e-03 0.376 0.127 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 589767 sc-eQTL 3.34e-02 -0.287 0.134 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -212118 sc-eQTL 9.12e-01 0.0102 0.0927 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 287385 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000684 0.154 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 116051 sc-eQTL 4.38e-01 0.0841 0.108 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 949662 sc-eQTL 8.93e-02 0.241 0.141 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 949742 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0106 0.106 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 819205 sc-eQTL 7.48e-01 0.0466 0.145 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 589767 sc-eQTL 1.16e-01 -0.243 0.154 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -212118 sc-eQTL 2.96e-01 -0.127 0.122 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 287385 sc-eQTL 4.21e-01 -0.123 0.153 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 201923 sc-eQTL 2.71e-01 0.138 0.125 0.095 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 116051 sc-eQTL 6.56e-01 0.0583 0.131 0.095 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 949662 sc-eQTL 2.29e-01 0.155 0.128 0.095 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 949742 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00515 0.0993 0.095 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 819205 sc-eQTL 2.70e-01 0.147 0.133 0.095 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 589767 sc-eQTL 3.71e-02 -0.227 0.108 0.095 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162398 LEXM 197183 sc-eQTL 1.73e-01 -0.167 0.122 0.095 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -212118 sc-eQTL 2.48e-01 -0.0902 0.0778 0.095 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 287385 sc-eQTL 9.67e-01 0.0057 0.139 0.095 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000116133 DHCR24 116051 eQTL 0.00934 0.102 0.0391 0.0 0.0 0.127
ENSG00000162398 LEXM 197183 eQTL 0.000204 -0.112 0.03 0.0 0.0 0.127


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000116133 DHCR24 116051 4.01e-06 4.86e-06 5.8e-07 2.44e-06 5.79e-07 8.69e-07 4e-06 8.06e-07 2.69e-06 9.75e-07 3.27e-06 1.43e-06 7.2e-06 1.24e-06 9.71e-07 1.51e-06 1.79e-06 2.13e-06 1.54e-06 9.91e-07 1.19e-06 3.51e-06 3.78e-06 9.71e-07 4.75e-06 1.35e-06 1.49e-06 1.79e-06 4.4e-06 2.88e-06 2.05e-06 2.81e-07 5.05e-07 1.24e-06 2.03e-06 7.09e-07 7.95e-07 4.5e-07 1.34e-06 3.46e-07 3.45e-07 4.15e-06 5.58e-07 1.55e-07 3.56e-07 3.33e-07 4.32e-07 2.65e-07 1.74e-07