logo

Genes within 1Mb (chr1:54993482:C:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 192159 sc-eQTL 6.50e-01 -0.06 0.132 0.113 B L1
ENSG00000116133 DHCR24 106287 sc-eQTL 5.65e-01 0.0718 0.125 0.113 B L1
ENSG00000116205 TCEANC2 939898 sc-eQTL 8.94e-01 0.0144 0.108 0.113 B L1
ENSG00000116209 TMEM59 939978 sc-eQTL 1.39e-01 -0.0969 0.0653 0.113 B L1
ENSG00000116221 MRPL37 809441 sc-eQTL 2.85e-01 0.0918 0.0856 0.113 B L1
ENSG00000157216 SSBP3 580003 sc-eQTL 6.60e-01 0.0396 0.0898 0.113 B L1
ENSG00000162402 USP24 -221882 sc-eQTL 2.81e-01 0.082 0.0759 0.113 B L1
ENSG00000215883 CYB5RL 793446 sc-eQTL 9.77e-01 0.00421 0.147 0.113 B L1
ENSG00000243725 TTC4 277621 sc-eQTL 4.04e-01 -0.106 0.127 0.113 B L1
ENSG00000006555 TTC22 192159 sc-eQTL 1.39e-01 -0.152 0.102 0.113 CD4T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 939898 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0341 0.0838 0.113 CD4T L1
ENSG00000116209 TMEM59 939978 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0635 0.078 0.113 CD4T L1
ENSG00000116221 MRPL37 809441 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0401 0.108 0.113 CD4T L1
ENSG00000157216 SSBP3 580003 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0642 0.0895 0.113 CD4T L1
ENSG00000162402 USP24 -221882 sc-eQTL 4.31e-01 0.0576 0.0729 0.113 CD4T L1
ENSG00000243725 TTC4 277621 sc-eQTL 2.50e-01 0.126 0.11 0.113 CD4T L1
ENSG00000006555 TTC22 192159 sc-eQTL 6.30e-01 0.0423 0.0876 0.113 CD8T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 939898 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0379 0.109 0.113 CD8T L1
ENSG00000116209 TMEM59 939978 sc-eQTL 3.44e-01 -0.0717 0.0756 0.113 CD8T L1
ENSG00000116221 MRPL37 809441 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0906 0.104 0.113 CD8T L1
ENSG00000157216 SSBP3 580003 sc-eQTL 9.26e-01 0.00693 0.075 0.113 CD8T L1
ENSG00000162402 USP24 -221882 sc-eQTL 1.69e-01 0.0995 0.0722 0.113 CD8T L1
ENSG00000243725 TTC4 277621 sc-eQTL 9.74e-01 0.00411 0.126 0.113 CD8T L1
ENSG00000116133 DHCR24 106287 sc-eQTL 3.81e-01 0.102 0.116 0.113 DC L1
ENSG00000116205 TCEANC2 939898 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0432 0.13 0.113 DC L1
ENSG00000116209 TMEM59 939978 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0471 0.102 0.113 DC L1
ENSG00000116221 MRPL37 809441 sc-eQTL 9.44e-01 0.0097 0.137 0.113 DC L1
ENSG00000157216 SSBP3 580003 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0315 0.122 0.113 DC L1
ENSG00000162390 ACOT11 451225 sc-eQTL 6.40e-02 0.217 0.117 0.113 DC L1
ENSG00000162402 USP24 -221882 sc-eQTL 4.81e-01 0.05 0.0709 0.113 DC L1
ENSG00000215883 CYB5RL 793446 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0159 0.128 0.113 DC L1
ENSG00000243725 TTC4 277621 sc-eQTL 2.52e-01 0.158 0.138 0.113 DC L1
ENSG00000116133 DHCR24 106287 sc-eQTL 4.65e-01 0.0617 0.0843 0.113 Mono L1
ENSG00000116205 TCEANC2 939898 sc-eQTL 9.98e-01 0.000247 0.0911 0.113 Mono L1
ENSG00000116209 TMEM59 939978 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0164 0.0676 0.113 Mono L1
ENSG00000116221 MRPL37 809441 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0318 0.113 0.113 Mono L1
ENSG00000157216 SSBP3 580003 sc-eQTL 2.42e-02 -0.291 0.128 0.113 Mono L1
ENSG00000162402 USP24 -221882 sc-eQTL 6.31e-01 0.0372 0.0772 0.113 Mono L1
ENSG00000243725 TTC4 277621 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0157 0.136 0.113 Mono L1
ENSG00000006555 TTC22 192159 sc-eQTL 7.45e-01 0.0379 0.116 0.112 NK L1
ENSG00000116133 DHCR24 106287 sc-eQTL 3.45e-01 0.111 0.117 0.112 NK L1
ENSG00000116205 TCEANC2 939898 sc-eQTL 3.84e-01 0.101 0.115 0.112 NK L1
ENSG00000116209 TMEM59 939978 sc-eQTL 9.89e-01 0.00122 0.0906 0.112 NK L1
ENSG00000116221 MRPL37 809441 sc-eQTL 2.73e-01 0.123 0.112 0.112 NK L1
ENSG00000157216 SSBP3 580003 sc-eQTL 1.83e-01 -0.13 0.0973 0.112 NK L1
ENSG00000162398 LEXM 187419 sc-eQTL 2.79e-02 -0.24 0.108 0.112 NK L1
ENSG00000162402 USP24 -221882 sc-eQTL 4.75e-01 0.0475 0.0664 0.112 NK L1
ENSG00000243725 TTC4 277621 sc-eQTL 8.96e-01 0.0164 0.126 0.112 NK L1
ENSG00000006555 TTC22 192159 sc-eQTL 2.64e-01 0.116 0.103 0.113 Other_T L1
ENSG00000116133 DHCR24 106287 sc-eQTL 6.24e-01 0.0394 0.0802 0.113 Other_T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 939898 sc-eQTL 3.12e-02 0.258 0.119 0.113 Other_T L1
ENSG00000116209 TMEM59 939978 sc-eQTL 9.61e-01 0.00404 0.0824 0.113 Other_T L1
ENSG00000116221 MRPL37 809441 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0292 0.0772 0.113 Other_T L1
ENSG00000157216 SSBP3 580003 sc-eQTL 2.86e-01 -0.0954 0.0891 0.113 Other_T L1
ENSG00000162402 USP24 -221882 sc-eQTL 4.75e-01 0.068 0.095 0.113 Other_T L1
ENSG00000215883 CYB5RL 793446 sc-eQTL 4.04e-01 0.109 0.13 0.113 Other_T L1
ENSG00000243725 TTC4 277621 sc-eQTL 2.91e-01 0.137 0.129 0.113 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 192159 sc-eQTL 1.19e-01 -0.17 0.108 0.117 B_Activated L2
ENSG00000116133 DHCR24 106287 sc-eQTL 7.45e-01 0.0417 0.128 0.117 B_Activated L2
ENSG00000116205 TCEANC2 939898 sc-eQTL 6.52e-01 -0.062 0.137 0.117 B_Activated L2
ENSG00000116209 TMEM59 939978 sc-eQTL 4.71e-01 -0.105 0.146 0.117 B_Activated L2
ENSG00000116221 MRPL37 809441 sc-eQTL 6.90e-01 0.0632 0.158 0.117 B_Activated L2
ENSG00000157216 SSBP3 580003 sc-eQTL 6.94e-01 0.0562 0.143 0.117 B_Activated L2
ENSG00000162402 USP24 -221882 sc-eQTL 1.07e-01 -0.224 0.138 0.117 B_Activated L2
ENSG00000215883 CYB5RL 793446 sc-eQTL 3.51e-01 0.115 0.123 0.117 B_Activated L2
ENSG00000243725 TTC4 277621 sc-eQTL 2.05e-01 -0.169 0.133 0.117 B_Activated L2
ENSG00000006555 TTC22 192159 sc-eQTL 2.62e-01 -0.155 0.138 0.114 B_Intermediate L2
ENSG00000116133 DHCR24 106287 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0838 0.129 0.114 B_Intermediate L2
ENSG00000116205 TCEANC2 939898 sc-eQTL 6.67e-01 0.0553 0.128 0.114 B_Intermediate L2
ENSG00000116209 TMEM59 939978 sc-eQTL 8.99e-01 0.014 0.11 0.114 B_Intermediate L2
ENSG00000116221 MRPL37 809441 sc-eQTL 7.93e-02 0.226 0.128 0.114 B_Intermediate L2
ENSG00000157216 SSBP3 580003 sc-eQTL 3.75e-01 -0.107 0.12 0.114 B_Intermediate L2
ENSG00000162402 USP24 -221882 sc-eQTL 7.29e-01 0.0353 0.102 0.114 B_Intermediate L2
ENSG00000215883 CYB5RL 793446 sc-eQTL 4.78e-01 0.102 0.144 0.114 B_Intermediate L2
ENSG00000243725 TTC4 277621 sc-eQTL 2.59e-01 0.147 0.13 0.114 B_Intermediate L2
ENSG00000006555 TTC22 192159 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0465 0.13 0.114 B_Memory L2
ENSG00000116133 DHCR24 106287 sc-eQTL 6.39e-01 0.0609 0.129 0.114 B_Memory L2
ENSG00000116205 TCEANC2 939898 sc-eQTL 9.38e-01 -0.0108 0.138 0.114 B_Memory L2
ENSG00000116209 TMEM59 939978 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0173 0.115 0.114 B_Memory L2
ENSG00000116221 MRPL37 809441 sc-eQTL 7.30e-02 -0.209 0.116 0.114 B_Memory L2
ENSG00000157216 SSBP3 580003 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0817 0.109 0.114 B_Memory L2
ENSG00000162402 USP24 -221882 sc-eQTL 5.13e-01 -0.07 0.107 0.114 B_Memory L2
ENSG00000215883 CYB5RL 793446 sc-eQTL 8.84e-02 0.224 0.131 0.114 B_Memory L2
ENSG00000243725 TTC4 277621 sc-eQTL 7.37e-02 -0.244 0.136 0.114 B_Memory L2
ENSG00000006555 TTC22 192159 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0314 0.139 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000116133 DHCR24 106287 sc-eQTL 5.20e-01 0.084 0.13 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 939898 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0319 0.116 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000116209 TMEM59 939978 sc-eQTL 3.49e-02 -0.178 0.0836 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000116221 MRPL37 809441 sc-eQTL 6.93e-01 0.0492 0.125 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000157216 SSBP3 580003 sc-eQTL 1.73e-02 0.281 0.117 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000162402 USP24 -221882 sc-eQTL 4.65e-02 0.185 0.0926 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 793446 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0691 0.141 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000243725 TTC4 277621 sc-eQTL 8.66e-01 0.0215 0.127 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000006555 TTC22 192159 sc-eQTL 3.92e-01 -0.12 0.14 0.114 B_Naive2 L2
ENSG00000116133 DHCR24 106287 sc-eQTL 2.55e-01 -0.139 0.122 0.114 B_Naive2 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 939898 sc-eQTL 5.82e-01 0.0748 0.136 0.114 B_Naive2 L2
ENSG00000116209 TMEM59 939978 sc-eQTL 1.21e-01 -0.173 0.111 0.114 B_Naive2 L2
ENSG00000116221 MRPL37 809441 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0985 0.131 0.114 B_Naive2 L2
ENSG00000157216 SSBP3 580003 sc-eQTL 8.95e-01 0.017 0.129 0.114 B_Naive2 L2
ENSG00000162402 USP24 -221882 sc-eQTL 6.12e-01 0.0521 0.103 0.114 B_Naive2 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 793446 sc-eQTL 9.56e-03 -0.372 0.142 0.114 B_Naive2 L2
ENSG00000243725 TTC4 277621 sc-eQTL 7.62e-01 0.0455 0.15 0.114 B_Naive2 L2
ENSG00000006555 TTC22 192159 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0353 0.132 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 939898 sc-eQTL 9.16e-02 -0.228 0.135 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 939978 sc-eQTL 9.74e-01 0.00408 0.123 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 809441 sc-eQTL 5.05e-02 -0.295 0.15 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 580003 sc-eQTL 6.71e-01 0.0396 0.0932 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -221882 sc-eQTL 1.19e-02 0.32 0.126 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 277621 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0485 0.143 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 192159 sc-eQTL 7.20e-02 -0.215 0.119 0.113 CD4_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 939898 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0595 0.091 0.113 CD4_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 939978 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0349 0.0885 0.113 CD4_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 809441 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0814 0.114 0.113 CD4_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 580003 sc-eQTL 1.66e-01 -0.126 0.0907 0.113 CD4_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -221882 sc-eQTL 7.73e-01 0.0227 0.0786 0.113 CD4_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 277621 sc-eQTL 3.13e-01 0.121 0.12 0.113 CD4_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 192159 sc-eQTL 2.94e-01 -0.131 0.125 0.113 CD4_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 939898 sc-eQTL 4.84e-01 0.0852 0.121 0.113 CD4_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 939978 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0809 0.0915 0.113 CD4_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 809441 sc-eQTL 6.03e-01 -0.06 0.115 0.113 CD4_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 580003 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0509 0.113 0.113 CD4_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -221882 sc-eQTL 4.83e-01 0.0658 0.0936 0.113 CD4_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 277621 sc-eQTL 5.17e-01 0.0875 0.135 0.113 CD4_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 192159 sc-eQTL 5.94e-01 0.0779 0.146 0.113 CD4_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 939898 sc-eQTL 4.11e-01 0.114 0.138 0.113 CD4_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 939978 sc-eQTL 6.34e-01 0.0511 0.107 0.113 CD4_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 809441 sc-eQTL 9.69e-01 0.00538 0.138 0.113 CD4_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 580003 sc-eQTL 5.33e-01 0.0738 0.118 0.113 CD4_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -221882 sc-eQTL 5.55e-02 0.205 0.107 0.113 CD4_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 277621 sc-eQTL 6.20e-01 0.0706 0.142 0.113 CD4_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 192159 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0425 0.114 0.113 CD8_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 939898 sc-eQTL 1.94e-01 0.165 0.126 0.113 CD8_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 939978 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0566 0.11 0.113 CD8_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 809441 sc-eQTL 4.01e-01 0.11 0.13 0.113 CD8_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 580003 sc-eQTL 3.18e-01 -0.089 0.089 0.113 CD8_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -221882 sc-eQTL 6.02e-01 0.0463 0.0887 0.113 CD8_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 277621 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0534 0.133 0.113 CD8_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 192159 sc-eQTL 6.99e-01 0.0498 0.129 0.113 CD8_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 939898 sc-eQTL 8.60e-01 0.0205 0.116 0.113 CD8_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 939978 sc-eQTL 8.10e-01 0.0274 0.114 0.113 CD8_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 809441 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0769 0.136 0.113 CD8_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 580003 sc-eQTL 9.35e-01 0.00849 0.103 0.113 CD8_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -221882 sc-eQTL 7.17e-01 0.0341 0.0939 0.113 CD8_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 277621 sc-eQTL 9.34e-01 -0.0114 0.137 0.113 CD8_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 192159 sc-eQTL 9.43e-01 -0.01 0.141 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 939898 sc-eQTL 6.42e-01 0.0658 0.141 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 939978 sc-eQTL 2.27e-01 -0.15 0.124 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 809441 sc-eQTL 4.10e-01 -0.116 0.141 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 580003 sc-eQTL 3.14e-01 -0.123 0.122 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -221882 sc-eQTL 9.08e-01 0.0137 0.119 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 277621 sc-eQTL 2.26e-01 -0.175 0.144 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 192159 sc-eQTL 3.06e-01 0.141 0.137 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 939898 sc-eQTL 2.65e-01 -0.16 0.143 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 939978 sc-eQTL 7.69e-02 -0.245 0.138 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 809441 sc-eQTL 8.67e-02 -0.241 0.14 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 580003 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0233 0.133 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -221882 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0709 0.14 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 277621 sc-eQTL 2.15e-02 0.326 0.141 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 192159 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0755 0.123 0.113 MAIT L2
ENSG00000116133 DHCR24 106287 sc-eQTL 3.09e-02 0.196 0.0904 0.113 MAIT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 939898 sc-eQTL 3.25e-01 0.127 0.128 0.113 MAIT L2
ENSG00000116209 TMEM59 939978 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0717 0.116 0.113 MAIT L2
ENSG00000116221 MRPL37 809441 sc-eQTL 6.77e-02 -0.258 0.14 0.113 MAIT L2
ENSG00000157216 SSBP3 580003 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0388 0.125 0.113 MAIT L2
ENSG00000162402 USP24 -221882 sc-eQTL 4.02e-01 0.0932 0.111 0.113 MAIT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 793446 sc-eQTL 8.73e-01 0.0207 0.129 0.113 MAIT L2
ENSG00000243725 TTC4 277621 sc-eQTL 7.32e-01 0.0441 0.128 0.113 MAIT L2
ENSG00000006555 TTC22 192159 sc-eQTL 2.79e-01 -0.153 0.141 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000116133 DHCR24 106287 sc-eQTL 8.12e-01 0.0298 0.125 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000116205 TCEANC2 939898 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0657 0.132 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000116209 TMEM59 939978 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0209 0.129 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000116221 MRPL37 809441 sc-eQTL 9.65e-01 -0.0064 0.144 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000157216 SSBP3 580003 sc-eQTL 3.47e-01 -0.102 0.108 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000162398 LEXM 187419 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00342 0.128 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000162402 USP24 -221882 sc-eQTL 1.38e-01 0.163 0.11 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000243725 TTC4 277621 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0213 0.139 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000006555 TTC22 192159 sc-eQTL 5.61e-01 0.0682 0.117 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000116133 DHCR24 106287 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00148 0.122 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000116205 TCEANC2 939898 sc-eQTL 3.20e-02 0.283 0.131 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000116209 TMEM59 939978 sc-eQTL 4.07e-01 0.0815 0.0981 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000116221 MRPL37 809441 sc-eQTL 4.83e-01 0.0898 0.128 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000157216 SSBP3 580003 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0955 0.104 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000162398 LEXM 187419 sc-eQTL 1.57e-02 -0.289 0.119 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000162402 USP24 -221882 sc-eQTL 5.96e-01 0.0406 0.0765 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000243725 TTC4 277621 sc-eQTL 8.99e-01 0.0166 0.131 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000006555 TTC22 192159 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0569 0.136 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000116133 DHCR24 106287 sc-eQTL 8.40e-02 0.229 0.132 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000116205 TCEANC2 939898 sc-eQTL 3.65e-01 -0.116 0.128 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000116209 TMEM59 939978 sc-eQTL 2.66e-01 -0.142 0.127 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000116221 MRPL37 809441 sc-eQTL 7.01e-01 -0.054 0.141 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000157216 SSBP3 580003 sc-eQTL 2.43e-01 -0.134 0.114 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000162398 LEXM 187419 sc-eQTL 9.28e-01 0.0116 0.129 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000162402 USP24 -221882 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0166 0.0949 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000243725 TTC4 277621 sc-eQTL 2.99e-01 0.147 0.141 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000006555 TTC22 192159 sc-eQTL 9.89e-01 0.0017 0.125 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000116133 DHCR24 106287 sc-eQTL 1.95e-01 0.163 0.126 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000116205 TCEANC2 939898 sc-eQTL 8.67e-01 -0.021 0.125 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000116209 TMEM59 939978 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00753 0.102 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000116221 MRPL37 809441 sc-eQTL 5.51e-01 0.0748 0.125 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000157216 SSBP3 580003 sc-eQTL 3.05e-01 -0.108 0.105 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000162398 LEXM 187419 sc-eQTL 2.04e-01 -0.167 0.131 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000162402 USP24 -221882 sc-eQTL 2.56e-01 0.102 0.0893 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000243725 TTC4 277621 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0295 0.133 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000006555 TTC22 192159 sc-eQTL 3.43e-01 0.154 0.161 0.111 PB L2
ENSG00000116133 DHCR24 106287 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0526 0.143 0.111 PB L2
ENSG00000116205 TCEANC2 939898 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0916 0.174 0.111 PB L2
ENSG00000116209 TMEM59 939978 sc-eQTL 2.44e-02 -0.163 0.0713 0.111 PB L2
ENSG00000116221 MRPL37 809441 sc-eQTL 4.93e-01 0.091 0.132 0.111 PB L2
ENSG00000157216 SSBP3 580003 sc-eQTL 3.34e-01 -0.148 0.153 0.111 PB L2
ENSG00000162402 USP24 -221882 sc-eQTL 3.27e-01 0.17 0.173 0.111 PB L2
ENSG00000215883 CYB5RL 793446 sc-eQTL 1.68e-01 -0.248 0.179 0.111 PB L2
ENSG00000243725 TTC4 277621 sc-eQTL 1.57e-01 -0.238 0.167 0.111 PB L2
ENSG00000006555 TTC22 192159 sc-eQTL 2.45e-02 0.28 0.124 0.113 Pro_T L2
ENSG00000116133 DHCR24 106287 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0362 0.106 0.113 Pro_T L2
ENSG00000116205 TCEANC2 939898 sc-eQTL 2.40e-01 0.152 0.129 0.113 Pro_T L2
ENSG00000116209 TMEM59 939978 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000746 0.09 0.113 Pro_T L2
ENSG00000116221 MRPL37 809441 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0395 0.0881 0.113 Pro_T L2
ENSG00000157216 SSBP3 580003 sc-eQTL 3.32e-01 -0.0959 0.0987 0.113 Pro_T L2
ENSG00000162402 USP24 -221882 sc-eQTL 1.54e-01 0.172 0.12 0.113 Pro_T L2
ENSG00000215883 CYB5RL 793446 sc-eQTL 3.56e-01 0.11 0.119 0.113 Pro_T L2
ENSG00000243725 TTC4 277621 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0225 0.132 0.113 Pro_T L2
ENSG00000006555 TTC22 192159 sc-eQTL 4.17e-01 -0.104 0.128 0.113 Treg L2
ENSG00000116205 TCEANC2 939898 sc-eQTL 8.20e-01 0.0312 0.137 0.113 Treg L2
ENSG00000116209 TMEM59 939978 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00675 0.108 0.113 Treg L2
ENSG00000116221 MRPL37 809441 sc-eQTL 4.64e-01 0.0981 0.134 0.113 Treg L2
ENSG00000157216 SSBP3 580003 sc-eQTL 3.74e-01 0.106 0.119 0.113 Treg L2
ENSG00000162402 USP24 -221882 sc-eQTL 7.43e-01 0.0374 0.114 0.113 Treg L2
ENSG00000243725 TTC4 277621 sc-eQTL 9.32e-01 0.0123 0.144 0.113 Treg L2
ENSG00000116133 DHCR24 106287 sc-eQTL 5.78e-01 0.0621 0.111 0.12 cDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 939898 sc-eQTL 9.01e-01 0.0163 0.131 0.12 cDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 939978 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0363 0.112 0.12 cDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 809441 sc-eQTL 3.79e-01 0.126 0.143 0.12 cDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 580003 sc-eQTL 8.74e-01 0.021 0.132 0.12 cDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 451225 sc-eQTL 9.22e-02 0.206 0.122 0.12 cDC L2
ENSG00000162402 USP24 -221882 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0536 0.137 0.12 cDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 793446 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0593 0.118 0.12 cDC L2
ENSG00000243725 TTC4 277621 sc-eQTL 4.14e-01 0.115 0.141 0.12 cDC L2
ENSG00000116133 DHCR24 106287 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0188 0.0819 0.113 cMono_IL1B L2
ENSG00000116205 TCEANC2 939898 sc-eQTL 6.78e-01 0.0473 0.114 0.113 cMono_IL1B L2
ENSG00000116209 TMEM59 939978 sc-eQTL 9.13e-01 0.00756 0.069 0.113 cMono_IL1B L2
ENSG00000116221 MRPL37 809441 sc-eQTL 3.43e-01 -0.117 0.123 0.113 cMono_IL1B L2
ENSG00000157216 SSBP3 580003 sc-eQTL 1.47e-01 -0.182 0.125 0.113 cMono_IL1B L2
ENSG00000162402 USP24 -221882 sc-eQTL 8.33e-01 0.0196 0.0927 0.113 cMono_IL1B L2
ENSG00000243725 TTC4 277621 sc-eQTL 6.75e-01 0.0595 0.142 0.113 cMono_IL1B L2
ENSG00000116133 DHCR24 106287 sc-eQTL 9.10e-01 0.00862 0.0765 0.113 cMono_S100A L2
ENSG00000116205 TCEANC2 939898 sc-eQTL 1.75e-01 -0.158 0.116 0.113 cMono_S100A L2
ENSG00000116209 TMEM59 939978 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00754 0.0934 0.113 cMono_S100A L2
ENSG00000116221 MRPL37 809441 sc-eQTL 1.48e-01 0.195 0.134 0.113 cMono_S100A L2
ENSG00000157216 SSBP3 580003 sc-eQTL 1.01e-01 -0.229 0.139 0.113 cMono_S100A L2
ENSG00000162402 USP24 -221882 sc-eQTL 7.66e-01 0.0338 0.113 0.113 cMono_S100A L2
ENSG00000243725 TTC4 277621 sc-eQTL 9.93e-01 0.00133 0.142 0.113 cMono_S100A L2
ENSG00000006555 TTC22 192159 sc-eQTL 9.89e-01 0.00166 0.125 0.118 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 106287 sc-eQTL 5.31e-01 0.0873 0.139 0.118 gdT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 939898 sc-eQTL 4.40e-01 0.108 0.139 0.118 gdT L2
ENSG00000116209 TMEM59 939978 sc-eQTL 3.04e-01 -0.146 0.141 0.118 gdT L2
ENSG00000116221 MRPL37 809441 sc-eQTL 2.69e-01 -0.179 0.162 0.118 gdT L2
ENSG00000157216 SSBP3 580003 sc-eQTL 1.22e-01 -0.153 0.0986 0.118 gdT L2
ENSG00000162402 USP24 -221882 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0126 0.134 0.118 gdT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 793446 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0244 0.139 0.118 gdT L2
ENSG00000243725 TTC4 277621 sc-eQTL 6.19e-01 -0.078 0.156 0.118 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 106287 sc-eQTL 3.15e-01 0.103 0.102 0.116 intMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 939898 sc-eQTL 1.20e-01 0.198 0.127 0.116 intMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 939978 sc-eQTL 5.60e-01 0.0547 0.0938 0.116 intMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 809441 sc-eQTL 2.82e-01 -0.154 0.143 0.116 intMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 580003 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0771 0.147 0.116 intMono L2
ENSG00000162402 USP24 -221882 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00565 0.131 0.116 intMono L2
ENSG00000243725 TTC4 277621 sc-eQTL 4.32e-01 -0.11 0.139 0.116 intMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 106287 sc-eQTL 3.46e-01 0.0962 0.102 0.115 ncMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 939898 sc-eQTL 4.24e-01 0.102 0.127 0.115 ncMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 939978 sc-eQTL 3.71e-01 0.0913 0.102 0.115 ncMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 809441 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0816 0.132 0.115 ncMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 580003 sc-eQTL 8.22e-02 -0.25 0.143 0.115 ncMono L2
ENSG00000162402 USP24 -221882 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00864 0.115 0.115 ncMono L2
ENSG00000243725 TTC4 277621 sc-eQTL 1.62e-01 -0.19 0.135 0.115 ncMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 106287 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000734 0.113 0.133 pDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 939898 sc-eQTL 1.16e-01 -0.213 0.135 0.133 pDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 939978 sc-eQTL 3.48e-01 0.102 0.108 0.133 pDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 809441 sc-eQTL 6.47e-01 -0.066 0.144 0.133 pDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 580003 sc-eQTL 8.29e-01 0.0276 0.128 0.133 pDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 451225 sc-eQTL 4.51e-01 0.0406 0.0537 0.133 pDC L2
ENSG00000162402 USP24 -221882 sc-eQTL 3.62e-01 0.0828 0.0905 0.133 pDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 793446 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0125 0.124 0.133 pDC L2
ENSG00000243725 TTC4 277621 sc-eQTL 6.86e-01 0.058 0.143 0.133 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 192159 sc-eQTL 2.43e-01 -0.156 0.133 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 106287 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0145 0.134 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 939898 sc-eQTL 7.34e-01 0.044 0.129 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 939978 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0688 0.1 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 809441 sc-eQTL 5.06e-01 0.0801 0.12 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 580003 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0987 0.104 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -221882 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0829 0.0953 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 793446 sc-eQTL 2.63e-01 0.164 0.146 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 277621 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0177 0.132 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 192159 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0527 0.141 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 106287 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0386 0.127 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 939898 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00177 0.115 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 939978 sc-eQTL 2.54e-02 -0.181 0.0804 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 809441 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00524 0.117 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 580003 sc-eQTL 5.72e-02 0.198 0.104 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -221882 sc-eQTL 7.42e-02 0.16 0.0891 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 793446 sc-eQTL 2.91e-02 -0.309 0.141 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 277621 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0298 0.134 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 106287 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0079 0.0794 0.113 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 939898 sc-eQTL 3.56e-01 -0.0918 0.0992 0.113 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 939978 sc-eQTL 9.31e-01 0.00593 0.0685 0.113 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 809441 sc-eQTL 8.34e-01 0.0255 0.121 0.113 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 580003 sc-eQTL 4.64e-02 -0.252 0.126 0.113 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -221882 sc-eQTL 7.87e-01 0.0235 0.0868 0.113 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 277621 sc-eQTL 8.46e-01 0.028 0.144 0.113 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 106287 sc-eQTL 3.64e-01 0.0887 0.0975 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 939898 sc-eQTL 1.61e-01 0.18 0.128 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 939978 sc-eQTL 6.00e-01 0.0502 0.0954 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 809441 sc-eQTL 1.36e-01 -0.195 0.13 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 580003 sc-eQTL 7.73e-02 -0.246 0.138 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -221882 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0416 0.11 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 277621 sc-eQTL 1.34e-01 -0.206 0.137 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 192159 sc-eQTL 6.31e-01 0.0547 0.114 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 106287 sc-eQTL 4.58e-01 0.0882 0.119 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 939898 sc-eQTL 2.18e-01 0.143 0.116 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 939978 sc-eQTL 9.11e-01 0.0101 0.0901 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 809441 sc-eQTL 3.35e-01 0.116 0.12 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 580003 sc-eQTL 1.93e-01 -0.129 0.0987 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162398 LEXM 187419 sc-eQTL 1.96e-02 -0.259 0.11 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -221882 sc-eQTL 4.40e-01 0.0547 0.0707 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 277621 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00442 0.126 0.112 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000116133 DHCR24 106287 eQTL 0.0475 0.0753 0.0379 0.0 0.0 0.136
ENSG00000162398 LEXM 187419 eQTL 0.000152 -0.11 0.029 0.0 0.0 0.136

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000116133 DHCR24 106287 4.7e-06 4.28e-06 3.29e-07 1.8e-06 4.77e-07 1.19e-06 2.4e-06 6.93e-07 2.27e-06 1.21e-06 3.13e-06 1.64e-06 5.37e-06 1.17e-06 9.04e-07 1.93e-06 1.58e-06 2.22e-06 1.42e-06 1.27e-06 1.21e-06 3.29e-06 3.36e-06 1.6e-06 4.81e-06 1.09e-06 1.44e-06 1.77e-06 3.19e-06 2.95e-06 1.91e-06 3.22e-07 4.73e-07 1.68e-06 1.84e-06 8.31e-07 8.47e-07 3.52e-07 1.35e-06 4.35e-07 1.52e-07 4.29e-06 5.11e-07 1.99e-07 3.61e-07 3.28e-07 8.54e-07 2.53e-07 2.74e-07
ENSG00000162398 LEXM 187419 1.61e-06 1.31e-06 3.05e-07 1.2e-06 2.66e-07 6.36e-07 1.5e-06 3.34e-07 1.42e-06 4.48e-07 1.84e-06 6.55e-07 2.46e-06 2.86e-07 5.28e-07 8.62e-07 9.01e-07 8.82e-07 7.4e-07 6.96e-07 4.57e-07 1.63e-06 8.98e-07 5.66e-07 2.41e-06 4.32e-07 8.34e-07 7.27e-07 1.38e-06 1.24e-06 7.26e-07 1.86e-07 1.81e-07 5.89e-07 5.42e-07 4.09e-07 5.15e-07 1.59e-07 5.03e-07 2.91e-07 2.67e-07 1.62e-06 1.09e-07 4.16e-08 1.81e-07 1.27e-07 2.26e-07 8.74e-08 5.55e-08