logo

Genes within 1Mb (chr1:54990002:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 188679 sc-eQTL 7.59e-01 0.0339 0.11 0.15 B L1
ENSG00000116133 DHCR24 102807 sc-eQTL 6.42e-01 0.0486 0.104 0.15 B L1
ENSG00000116205 TCEANC2 936418 sc-eQTL 2.66e-01 0.1 0.0899 0.15 B L1
ENSG00000116209 TMEM59 936498 sc-eQTL 3.69e-02 -0.114 0.0543 0.15 B L1
ENSG00000116221 MRPL37 805961 sc-eQTL 5.10e-01 0.0474 0.0718 0.15 B L1
ENSG00000157216 SSBP3 576523 sc-eQTL 6.41e-01 0.0351 0.0752 0.15 B L1
ENSG00000162402 USP24 -225362 sc-eQTL 1.80e-01 0.0854 0.0634 0.15 B L1
ENSG00000215883 CYB5RL 789966 sc-eQTL 6.77e-01 0.0512 0.123 0.15 B L1
ENSG00000243725 TTC4 274141 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0674 0.107 0.15 B L1
ENSG00000006555 TTC22 188679 sc-eQTL 1.32e-01 -0.127 0.0843 0.15 CD4T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 936418 sc-eQTL 8.81e-01 0.0104 0.0693 0.15 CD4T L1
ENSG00000116209 TMEM59 936498 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0109 0.0646 0.15 CD4T L1
ENSG00000116221 MRPL37 805961 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0106 0.0892 0.15 CD4T L1
ENSG00000157216 SSBP3 576523 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0411 0.074 0.15 CD4T L1
ENSG00000162402 USP24 -225362 sc-eQTL 1.42e-01 0.0886 0.0601 0.15 CD4T L1
ENSG00000243725 TTC4 274141 sc-eQTL 2.33e-01 0.108 0.0906 0.15 CD4T L1
ENSG00000006555 TTC22 188679 sc-eQTL 7.89e-01 0.0197 0.0736 0.15 CD8T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 936418 sc-eQTL 3.14e-01 -0.0924 0.0915 0.15 CD8T L1
ENSG00000116209 TMEM59 936498 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0134 0.0637 0.15 CD8T L1
ENSG00000116221 MRPL37 805961 sc-eQTL 1.38e-01 -0.13 0.0872 0.15 CD8T L1
ENSG00000157216 SSBP3 576523 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0119 0.063 0.15 CD8T L1
ENSG00000162402 USP24 -225362 sc-eQTL 3.71e-01 0.0545 0.0608 0.15 CD8T L1
ENSG00000243725 TTC4 274141 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0701 0.106 0.15 CD8T L1
ENSG00000116133 DHCR24 102807 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0193 0.0968 0.151 DC L1
ENSG00000116205 TCEANC2 936418 sc-eQTL 6.14e-01 0.0548 0.108 0.151 DC L1
ENSG00000116209 TMEM59 936498 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00197 0.0853 0.151 DC L1
ENSG00000116221 MRPL37 805961 sc-eQTL 6.42e-01 0.0533 0.114 0.151 DC L1
ENSG00000157216 SSBP3 576523 sc-eQTL 3.35e-01 0.0985 0.102 0.151 DC L1
ENSG00000162390 ACOT11 447745 sc-eQTL 5.37e-01 0.0606 0.0981 0.151 DC L1
ENSG00000162402 USP24 -225362 sc-eQTL 4.72e-01 0.0426 0.0592 0.151 DC L1
ENSG00000215883 CYB5RL 789966 sc-eQTL 5.97e-01 0.0567 0.107 0.151 DC L1
ENSG00000243725 TTC4 274141 sc-eQTL 4.42e-01 0.0886 0.115 0.151 DC L1
ENSG00000116133 DHCR24 102807 sc-eQTL 8.00e-01 0.0181 0.0714 0.15 Mono L1
ENSG00000116205 TCEANC2 936418 sc-eQTL 5.13e-01 0.0504 0.077 0.15 Mono L1
ENSG00000116209 TMEM59 936498 sc-eQTL 1.43e-01 -0.0836 0.0569 0.15 Mono L1
ENSG00000116221 MRPL37 805961 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0204 0.0957 0.15 Mono L1
ENSG00000157216 SSBP3 576523 sc-eQTL 3.43e-02 -0.231 0.109 0.15 Mono L1
ENSG00000162402 USP24 -225362 sc-eQTL 5.25e-01 0.0416 0.0653 0.15 Mono L1
ENSG00000243725 TTC4 274141 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0947 0.115 0.15 Mono L1
ENSG00000006555 TTC22 188679 sc-eQTL 1.86e-01 0.129 0.097 0.148 NK L1
ENSG00000116133 DHCR24 102807 sc-eQTL 4.99e-02 0.192 0.0975 0.148 NK L1
ENSG00000116205 TCEANC2 936418 sc-eQTL 1.92e-01 0.127 0.0966 0.148 NK L1
ENSG00000116209 TMEM59 936498 sc-eQTL 5.86e-01 0.0415 0.076 0.148 NK L1
ENSG00000116221 MRPL37 805961 sc-eQTL 8.48e-01 0.0181 0.0945 0.148 NK L1
ENSG00000157216 SSBP3 576523 sc-eQTL 1.42e-01 -0.12 0.0815 0.148 NK L1
ENSG00000162398 LEXM 183939 sc-eQTL 1.53e-02 -0.222 0.0907 0.148 NK L1
ENSG00000162402 USP24 -225362 sc-eQTL 5.04e-01 0.0372 0.0557 0.148 NK L1
ENSG00000243725 TTC4 274141 sc-eQTL 7.97e-01 0.0272 0.105 0.148 NK L1
ENSG00000006555 TTC22 188679 sc-eQTL 4.73e-01 0.0625 0.0869 0.15 Other_T L1
ENSG00000116133 DHCR24 102807 sc-eQTL 4.38e-01 0.0524 0.0674 0.15 Other_T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 936418 sc-eQTL 9.74e-02 0.167 0.1 0.15 Other_T L1
ENSG00000116209 TMEM59 936498 sc-eQTL 1.47e-01 0.1 0.069 0.15 Other_T L1
ENSG00000116221 MRPL37 805961 sc-eQTL 9.72e-01 0.00228 0.065 0.15 Other_T L1
ENSG00000157216 SSBP3 576523 sc-eQTL 3.34e-01 -0.0727 0.075 0.15 Other_T L1
ENSG00000162402 USP24 -225362 sc-eQTL 9.80e-01 0.00199 0.08 0.15 Other_T L1
ENSG00000215883 CYB5RL 789966 sc-eQTL 4.14e-01 0.0895 0.109 0.15 Other_T L1
ENSG00000243725 TTC4 274141 sc-eQTL 6.10e-01 0.0556 0.109 0.15 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 188679 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0728 0.0922 0.145 B_Activated L2
ENSG00000116133 DHCR24 102807 sc-eQTL 3.90e-01 0.0934 0.108 0.145 B_Activated L2
ENSG00000116205 TCEANC2 936418 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0177 0.116 0.145 B_Activated L2
ENSG00000116209 TMEM59 936498 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0673 0.124 0.145 B_Activated L2
ENSG00000116221 MRPL37 805961 sc-eQTL 6.08e-01 0.0686 0.134 0.145 B_Activated L2
ENSG00000157216 SSBP3 576523 sc-eQTL 5.92e-01 0.065 0.121 0.145 B_Activated L2
ENSG00000162402 USP24 -225362 sc-eQTL 3.30e-01 -0.115 0.118 0.145 B_Activated L2
ENSG00000215883 CYB5RL 789966 sc-eQTL 6.98e-01 0.0404 0.104 0.145 B_Activated L2
ENSG00000243725 TTC4 274141 sc-eQTL 1.60e-01 -0.159 0.113 0.145 B_Activated L2
ENSG00000006555 TTC22 188679 sc-eQTL 1.42e-01 -0.171 0.116 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000116133 DHCR24 102807 sc-eQTL 3.35e-01 0.104 0.108 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000116205 TCEANC2 936418 sc-eQTL 7.49e-01 0.0346 0.108 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000116209 TMEM59 936498 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0211 0.0923 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000116221 MRPL37 805961 sc-eQTL 9.99e-02 0.178 0.108 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000157216 SSBP3 576523 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0189 0.101 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000162402 USP24 -225362 sc-eQTL 2.01e-01 0.109 0.0851 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000215883 CYB5RL 789966 sc-eQTL 5.95e-01 0.0644 0.121 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000243725 TTC4 274141 sc-eQTL 5.33e-01 0.0687 0.11 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000006555 TTC22 188679 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0191 0.11 0.151 B_Memory L2
ENSG00000116133 DHCR24 102807 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00856 0.109 0.151 B_Memory L2
ENSG00000116205 TCEANC2 936418 sc-eQTL 9.61e-01 0.00576 0.117 0.151 B_Memory L2
ENSG00000116209 TMEM59 936498 sc-eQTL 9.80e-01 0.00244 0.0975 0.151 B_Memory L2
ENSG00000116221 MRPL37 805961 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0719 0.0987 0.151 B_Memory L2
ENSG00000157216 SSBP3 576523 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0722 0.0921 0.151 B_Memory L2
ENSG00000162402 USP24 -225362 sc-eQTL 2.95e-01 -0.0944 0.0899 0.151 B_Memory L2
ENSG00000215883 CYB5RL 789966 sc-eQTL 2.71e-02 0.245 0.11 0.151 B_Memory L2
ENSG00000243725 TTC4 274141 sc-eQTL 7.51e-02 -0.205 0.115 0.151 B_Memory L2
ENSG00000006555 TTC22 188679 sc-eQTL 8.08e-01 0.0282 0.116 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000116133 DHCR24 102807 sc-eQTL 6.96e-01 0.0426 0.109 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 936418 sc-eQTL 5.84e-01 0.0531 0.097 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000116209 TMEM59 936498 sc-eQTL 4.34e-02 -0.142 0.0699 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000116221 MRPL37 805961 sc-eQTL 8.35e-01 0.0217 0.104 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000157216 SSBP3 576523 sc-eQTL 5.12e-02 0.192 0.0982 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000162402 USP24 -225362 sc-eQTL 1.02e-01 0.127 0.0775 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 789966 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0234 0.118 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000243725 TTC4 274141 sc-eQTL 7.99e-01 0.0271 0.106 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000006555 TTC22 188679 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0731 0.118 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000116133 DHCR24 102807 sc-eQTL 1.02e-01 -0.167 0.102 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 936418 sc-eQTL 1.47e-01 0.165 0.113 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000116209 TMEM59 936498 sc-eQTL 8.88e-02 -0.159 0.0929 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000116221 MRPL37 805961 sc-eQTL 6.76e-01 -0.046 0.11 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000157216 SSBP3 576523 sc-eQTL 2.60e-01 0.122 0.108 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000162402 USP24 -225362 sc-eQTL 8.81e-01 0.0129 0.086 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 789966 sc-eQTL 4.03e-02 -0.247 0.12 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000243725 TTC4 274141 sc-eQTL 6.82e-01 0.0517 0.126 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000006555 TTC22 188679 sc-eQTL 9.63e-01 0.00516 0.113 0.15 CD4_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 936418 sc-eQTL 2.43e-01 -0.135 0.115 0.15 CD4_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 936498 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0349 0.105 0.15 CD4_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 805961 sc-eQTL 3.62e-02 -0.27 0.128 0.15 CD4_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 576523 sc-eQTL 4.28e-01 0.0632 0.0796 0.15 CD4_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -225362 sc-eQTL 7.58e-02 0.194 0.109 0.15 CD4_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 274141 sc-eQTL 8.36e-01 0.0255 0.122 0.15 CD4_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 188679 sc-eQTL 9.02e-02 -0.169 0.0992 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 936418 sc-eQTL 9.11e-01 -0.00851 0.076 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 936498 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0165 0.0739 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 805961 sc-eQTL 9.67e-01 0.00391 0.0953 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 576523 sc-eQTL 7.08e-02 -0.137 0.0755 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -225362 sc-eQTL 6.20e-01 0.0326 0.0656 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 274141 sc-eQTL 4.62e-01 0.0736 0.0999 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 188679 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0935 0.104 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 936418 sc-eQTL 8.13e-01 0.0241 0.102 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 936498 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0674 0.0765 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 805961 sc-eQTL 5.00e-01 -0.065 0.0964 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 576523 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0303 0.0945 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -225362 sc-eQTL 2.54e-01 0.0893 0.0781 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 274141 sc-eQTL 6.71e-01 0.048 0.113 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 188679 sc-eQTL 9.27e-01 0.0111 0.121 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 936418 sc-eQTL 2.19e-01 0.141 0.115 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 936498 sc-eQTL 4.98e-02 0.174 0.0883 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 805961 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00155 0.115 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 576523 sc-eQTL 2.88e-02 0.214 0.0972 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -225362 sc-eQTL 1.07e-01 0.144 0.0889 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 274141 sc-eQTL 2.54e-01 0.135 0.118 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 188679 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0461 0.0959 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 936418 sc-eQTL 2.72e-01 0.117 0.106 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 936498 sc-eQTL 3.48e-01 -0.0867 0.0922 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 805961 sc-eQTL 6.38e-01 0.0516 0.109 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 576523 sc-eQTL 1.34e-01 -0.112 0.0744 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -225362 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0424 0.0744 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 274141 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00939 0.111 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 188679 sc-eQTL 6.18e-01 0.0536 0.107 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 936418 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0808 0.0971 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 936498 sc-eQTL 2.66e-01 0.106 0.0949 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 805961 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0884 0.114 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 576523 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0156 0.0864 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -225362 sc-eQTL 6.36e-01 0.0372 0.0785 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 274141 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0227 0.115 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 188679 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0583 0.117 0.15 CD8_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 936418 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0777 0.117 0.15 CD8_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 936498 sc-eQTL 2.15e-01 -0.128 0.103 0.15 CD8_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 805961 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0458 0.117 0.15 CD8_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 576523 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0448 0.102 0.15 CD8_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -225362 sc-eQTL 4.59e-01 0.0731 0.0985 0.15 CD8_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 274141 sc-eQTL 7.01e-02 -0.217 0.119 0.15 CD8_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 188679 sc-eQTL 7.19e-01 0.0422 0.117 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 936418 sc-eQTL 3.61e-01 -0.112 0.122 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 936498 sc-eQTL 1.26e-01 -0.181 0.118 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 805961 sc-eQTL 7.87e-02 -0.21 0.119 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 576523 sc-eQTL 7.56e-01 0.0353 0.113 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -225362 sc-eQTL 8.61e-01 -0.021 0.119 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 274141 sc-eQTL 1.39e-01 0.179 0.121 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 188679 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0499 0.105 0.149 MAIT L2
ENSG00000116133 DHCR24 102807 sc-eQTL 2.88e-03 0.23 0.0762 0.149 MAIT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 936418 sc-eQTL 2.18e-01 0.135 0.109 0.149 MAIT L2
ENSG00000116209 TMEM59 936498 sc-eQTL 7.51e-01 0.0315 0.0989 0.149 MAIT L2
ENSG00000116221 MRPL37 805961 sc-eQTL 4.03e-02 -0.246 0.119 0.149 MAIT L2
ENSG00000157216 SSBP3 576523 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0536 0.107 0.149 MAIT L2
ENSG00000162402 USP24 -225362 sc-eQTL 7.27e-01 0.0331 0.0946 0.149 MAIT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 789966 sc-eQTL 5.26e-01 0.0698 0.11 0.149 MAIT L2
ENSG00000243725 TTC4 274141 sc-eQTL 7.58e-01 0.0338 0.109 0.149 MAIT L2
ENSG00000006555 TTC22 188679 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0767 0.12 0.151 NK_CD56bright L2
ENSG00000116133 DHCR24 102807 sc-eQTL 9.84e-01 0.00213 0.106 0.151 NK_CD56bright L2
ENSG00000116205 TCEANC2 936418 sc-eQTL 6.62e-01 0.0491 0.112 0.151 NK_CD56bright L2
ENSG00000116209 TMEM59 936498 sc-eQTL 6.72e-01 0.0463 0.109 0.151 NK_CD56bright L2
ENSG00000116221 MRPL37 805961 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00738 0.122 0.151 NK_CD56bright L2
ENSG00000157216 SSBP3 576523 sc-eQTL 3.01e-01 -0.0953 0.0918 0.151 NK_CD56bright L2
ENSG00000162398 LEXM 183939 sc-eQTL 4.92e-01 0.0747 0.109 0.151 NK_CD56bright L2
ENSG00000162402 USP24 -225362 sc-eQTL 1.46e-01 0.136 0.0931 0.151 NK_CD56bright L2
ENSG00000243725 TTC4 274141 sc-eQTL 9.17e-01 0.0123 0.118 0.151 NK_CD56bright L2
ENSG00000006555 TTC22 188679 sc-eQTL 2.05e-01 0.124 0.0978 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000116133 DHCR24 102807 sc-eQTL 3.96e-01 0.0869 0.102 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000116205 TCEANC2 936418 sc-eQTL 7.09e-03 0.296 0.109 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000116209 TMEM59 936498 sc-eQTL 4.56e-01 0.0613 0.0821 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000116221 MRPL37 805961 sc-eQTL 9.01e-01 0.0133 0.107 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000157216 SSBP3 576523 sc-eQTL 1.92e-01 -0.114 0.0872 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000162398 LEXM 183939 sc-eQTL 1.56e-03 -0.315 0.0983 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000162402 USP24 -225362 sc-eQTL 5.16e-01 0.0415 0.0639 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000243725 TTC4 274141 sc-eQTL 5.38e-01 0.0675 0.109 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000006555 TTC22 188679 sc-eQTL 9.16e-01 0.0128 0.121 0.151 NK_HLA L2
ENSG00000116133 DHCR24 102807 sc-eQTL 6.83e-02 0.214 0.117 0.151 NK_HLA L2
ENSG00000116205 TCEANC2 936418 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0753 0.113 0.151 NK_HLA L2
ENSG00000116209 TMEM59 936498 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0415 0.113 0.151 NK_HLA L2
ENSG00000116221 MRPL37 805961 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0863 0.124 0.151 NK_HLA L2
ENSG00000157216 SSBP3 576523 sc-eQTL 2.21e-01 -0.124 0.101 0.151 NK_HLA L2
ENSG00000162398 LEXM 183939 sc-eQTL 8.83e-01 0.0168 0.114 0.151 NK_HLA L2
ENSG00000162402 USP24 -225362 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0632 0.0837 0.151 NK_HLA L2
ENSG00000243725 TTC4 274141 sc-eQTL 7.84e-02 0.22 0.124 0.151 NK_HLA L2
ENSG00000006555 TTC22 188679 sc-eQTL 8.22e-01 0.0237 0.105 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000116133 DHCR24 102807 sc-eQTL 3.57e-02 0.222 0.105 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000116205 TCEANC2 936418 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0577 0.105 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000116209 TMEM59 936498 sc-eQTL 4.87e-01 0.0595 0.0854 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000116221 MRPL37 805961 sc-eQTL 9.78e-01 0.0029 0.105 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000157216 SSBP3 576523 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0814 0.0882 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000162398 LEXM 183939 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0726 0.11 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000162402 USP24 -225362 sc-eQTL 5.08e-01 0.0499 0.0752 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000243725 TTC4 274141 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0225 0.112 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000006555 TTC22 188679 sc-eQTL 1.46e-01 0.198 0.135 0.144 PB L2
ENSG00000116133 DHCR24 102807 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0369 0.121 0.144 PB L2
ENSG00000116205 TCEANC2 936418 sc-eQTL 3.69e-01 -0.132 0.147 0.144 PB L2
ENSG00000116209 TMEM59 936498 sc-eQTL 3.31e-02 -0.13 0.0605 0.144 PB L2
ENSG00000116221 MRPL37 805961 sc-eQTL 3.59e-01 0.103 0.112 0.144 PB L2
ENSG00000157216 SSBP3 576523 sc-eQTL 1.96e-01 -0.167 0.129 0.144 PB L2
ENSG00000162402 USP24 -225362 sc-eQTL 2.72e-01 0.162 0.146 0.144 PB L2
ENSG00000215883 CYB5RL 789966 sc-eQTL 1.41e-01 -0.224 0.151 0.144 PB L2
ENSG00000243725 TTC4 274141 sc-eQTL 2.27e-01 -0.172 0.141 0.144 PB L2
ENSG00000006555 TTC22 188679 sc-eQTL 2.82e-01 0.113 0.105 0.15 Pro_T L2
ENSG00000116133 DHCR24 102807 sc-eQTL 9.05e-01 0.0107 0.0897 0.15 Pro_T L2
ENSG00000116205 TCEANC2 936418 sc-eQTL 4.04e-01 0.0914 0.109 0.15 Pro_T L2
ENSG00000116209 TMEM59 936498 sc-eQTL 3.63e-01 0.0691 0.0758 0.15 Pro_T L2
ENSG00000116221 MRPL37 805961 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0183 0.0744 0.15 Pro_T L2
ENSG00000157216 SSBP3 576523 sc-eQTL 1.09e-01 -0.134 0.0829 0.15 Pro_T L2
ENSG00000162402 USP24 -225362 sc-eQTL 3.55e-01 0.0941 0.102 0.15 Pro_T L2
ENSG00000215883 CYB5RL 789966 sc-eQTL 4.52e-01 0.0755 0.1 0.15 Pro_T L2
ENSG00000243725 TTC4 274141 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0419 0.112 0.15 Pro_T L2
ENSG00000006555 TTC22 188679 sc-eQTL 6.07e-02 -0.202 0.107 0.15 Treg L2
ENSG00000116205 TCEANC2 936418 sc-eQTL 2.78e-01 0.126 0.116 0.15 Treg L2
ENSG00000116209 TMEM59 936498 sc-eQTL 6.42e-01 0.0427 0.0917 0.15 Treg L2
ENSG00000116221 MRPL37 805961 sc-eQTL 3.44e-01 0.107 0.113 0.15 Treg L2
ENSG00000157216 SSBP3 576523 sc-eQTL 5.37e-02 0.195 0.1 0.15 Treg L2
ENSG00000162402 USP24 -225362 sc-eQTL 9.39e-01 -0.0074 0.0964 0.15 Treg L2
ENSG00000243725 TTC4 274141 sc-eQTL 8.25e-01 0.0269 0.121 0.15 Treg L2
ENSG00000116133 DHCR24 102807 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0245 0.0943 0.159 cDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 936418 sc-eQTL 5.76e-01 0.0623 0.111 0.159 cDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 936498 sc-eQTL 8.09e-01 0.0229 0.0945 0.159 cDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 805961 sc-eQTL 1.49e-01 0.174 0.12 0.159 cDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 576523 sc-eQTL 1.65e-01 0.154 0.111 0.159 cDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 447745 sc-eQTL 5.90e-01 0.0559 0.104 0.159 cDC L2
ENSG00000162402 USP24 -225362 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0299 0.116 0.159 cDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 789966 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0264 0.0998 0.159 cDC L2
ENSG00000243725 TTC4 274141 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0823 0.119 0.159 cDC L2
ENSG00000116133 DHCR24 102807 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0101 0.069 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000116205 TCEANC2 936418 sc-eQTL 2.42e-01 0.112 0.0955 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000116209 TMEM59 936498 sc-eQTL 8.73e-01 -0.00932 0.0581 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000116221 MRPL37 805961 sc-eQTL 2.87e-01 -0.11 0.103 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000157216 SSBP3 576523 sc-eQTL 2.36e-01 -0.125 0.105 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000162402 USP24 -225362 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0371 0.078 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000243725 TTC4 274141 sc-eQTL 7.51e-01 0.0379 0.119 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000116133 DHCR24 102807 sc-eQTL 9.11e-01 -0.00724 0.0644 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000116205 TCEANC2 936418 sc-eQTL 3.01e-01 -0.102 0.098 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000116209 TMEM59 936498 sc-eQTL 2.05e-01 -0.0996 0.0783 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000116221 MRPL37 805961 sc-eQTL 1.81e-01 0.152 0.113 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000157216 SSBP3 576523 sc-eQTL 1.45e-01 -0.172 0.117 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000162402 USP24 -225362 sc-eQTL 3.12e-01 0.0965 0.0953 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000243725 TTC4 274141 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0976 0.119 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000006555 TTC22 188679 sc-eQTL 8.50e-01 0.0209 0.111 0.148 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 102807 sc-eQTL 7.22e-01 0.044 0.123 0.148 gdT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 936418 sc-eQTL 9.35e-01 -0.0101 0.124 0.148 gdT L2
ENSG00000116209 TMEM59 936498 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0388 0.126 0.148 gdT L2
ENSG00000116221 MRPL37 805961 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0139 0.144 0.148 gdT L2
ENSG00000157216 SSBP3 576523 sc-eQTL 2.57e-01 -0.1 0.088 0.148 gdT L2
ENSG00000162402 USP24 -225362 sc-eQTL 2.44e-01 -0.138 0.118 0.148 gdT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 789966 sc-eQTL 9.54e-01 -0.0072 0.123 0.148 gdT L2
ENSG00000243725 TTC4 274141 sc-eQTL 1.40e-01 -0.205 0.138 0.148 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 102807 sc-eQTL 1.09e-01 0.141 0.0873 0.151 intMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 936418 sc-eQTL 7.37e-02 0.195 0.109 0.151 intMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 936498 sc-eQTL 1.91e-01 0.105 0.0801 0.151 intMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 805961 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0598 0.123 0.151 intMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 576523 sc-eQTL 2.15e-01 -0.156 0.125 0.151 intMono L2
ENSG00000162402 USP24 -225362 sc-eQTL 4.85e-01 0.0782 0.112 0.151 intMono L2
ENSG00000243725 TTC4 274141 sc-eQTL 3.72e-01 -0.106 0.119 0.151 intMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 102807 sc-eQTL 6.25e-01 0.0437 0.0893 0.147 ncMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 936418 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00534 0.112 0.147 ncMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 936498 sc-eQTL 9.04e-01 0.0108 0.0894 0.147 ncMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 805961 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0774 0.115 0.147 ncMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 576523 sc-eQTL 2.10e-01 -0.158 0.126 0.147 ncMono L2
ENSG00000162402 USP24 -225362 sc-eQTL 6.89e-01 0.0404 0.101 0.147 ncMono L2
ENSG00000243725 TTC4 274141 sc-eQTL 8.64e-02 -0.204 0.118 0.147 ncMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 102807 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0435 0.0996 0.158 pDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 936418 sc-eQTL 2.57e-01 -0.135 0.119 0.158 pDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 936498 sc-eQTL 3.59e-01 0.0875 0.0952 0.158 pDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 805961 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0366 0.127 0.158 pDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 576523 sc-eQTL 1.37e-01 0.167 0.112 0.158 pDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 447745 sc-eQTL 7.72e-01 0.0138 0.0473 0.158 pDC L2
ENSG00000162402 USP24 -225362 sc-eQTL 1.76e-01 0.108 0.0795 0.158 pDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 789966 sc-eQTL 9.06e-01 0.013 0.109 0.158 pDC L2
ENSG00000243725 TTC4 274141 sc-eQTL 3.76e-01 0.112 0.126 0.158 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 188679 sc-eQTL 2.11e-01 -0.141 0.112 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 102807 sc-eQTL 4.89e-01 0.0783 0.113 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 936418 sc-eQTL 9.42e-01 0.00796 0.109 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 936498 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0626 0.085 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 805961 sc-eQTL 3.83e-01 0.0889 0.102 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 576523 sc-eQTL 7.10e-01 -0.033 0.0886 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -225362 sc-eQTL 8.17e-01 0.0187 0.0808 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 789966 sc-eQTL 1.81e-01 0.166 0.124 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 274141 sc-eQTL 3.63e-01 -0.102 0.111 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 188679 sc-eQTL 7.53e-01 0.0371 0.118 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 102807 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0396 0.106 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 936418 sc-eQTL 2.02e-01 0.122 0.0954 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 936498 sc-eQTL 3.19e-02 -0.145 0.0673 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 805961 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0139 0.0979 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 576523 sc-eQTL 8.37e-02 0.151 0.0869 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -225362 sc-eQTL 2.23e-01 0.0913 0.0748 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 789966 sc-eQTL 6.92e-02 -0.215 0.118 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 274141 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0141 0.112 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 102807 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0216 0.0674 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 936418 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0139 0.0843 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 936498 sc-eQTL 3.20e-01 -0.0579 0.058 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 805961 sc-eQTL 8.50e-01 0.0195 0.103 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 576523 sc-eQTL 7.84e-02 -0.189 0.107 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -225362 sc-eQTL 9.82e-01 0.00171 0.0737 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 274141 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0379 0.122 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 102807 sc-eQTL 3.42e-01 0.0792 0.0832 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 936418 sc-eQTL 1.63e-01 0.153 0.109 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 936498 sc-eQTL 4.30e-01 0.0643 0.0813 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 805961 sc-eQTL 3.54e-01 -0.103 0.111 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 576523 sc-eQTL 3.72e-02 -0.247 0.118 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -225362 sc-eQTL 9.26e-01 0.00866 0.0938 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 274141 sc-eQTL 5.72e-02 -0.223 0.117 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 188679 sc-eQTL 2.92e-01 0.101 0.0953 0.149 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 102807 sc-eQTL 6.63e-02 0.183 0.099 0.149 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 936418 sc-eQTL 8.65e-02 0.167 0.0972 0.149 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 936498 sc-eQTL 4.99e-01 0.0512 0.0756 0.149 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 805961 sc-eQTL 7.63e-01 0.0307 0.101 0.149 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 576523 sc-eQTL 1.24e-01 -0.128 0.0827 0.149 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162398 LEXM 183939 sc-eQTL 1.01e-02 -0.24 0.0923 0.149 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -225362 sc-eQTL 3.62e-01 0.0542 0.0593 0.149 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 274141 sc-eQTL 7.23e-01 0.0375 0.106 0.149 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000116133 DHCR24 102807 eQTL 0.00425 0.0948 0.0331 0.0 0.0 0.184
ENSG00000162398 LEXM 183939 eQTL 0.00106 -0.0834 0.0254 0.0 0.0 0.184
ENSG00000243725 TTC4 274141 eQTL 0.0316 0.0467 0.0217 0.0 0.0 0.184

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000116133 DHCR24 102807 6.57e-06 9.5e-06 6.5e-07 4.47e-06 1.72e-06 2.81e-06 9.52e-06 1.46e-06 6.39e-06 3.54e-06 9.41e-06 4.74e-06 1.13e-05 3.56e-06 1.09e-06 5.1e-06 3.71e-06 3.95e-06 1.93e-06 2e-06 2.66e-06 7.46e-06 5.85e-06 2.01e-06 1.27e-05 2.3e-06 4.07e-06 2.21e-06 7e-06 6.83e-06 4.23e-06 8.65e-07 5.74e-07 2.34e-06 3.49e-06 1.18e-06 9.95e-07 5.58e-07 1.09e-06 7.22e-07 6.55e-07 9.56e-06 8.87e-07 2.66e-07 7.66e-07 8.98e-07 1.05e-06 7.1e-07 3.91e-07