Genes within 1Mb (chr1:54982031:G:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 180708 sc-eQTL 7.08e-01 0.0483 0.129 0.12 B L1
ENSG00000116133 DHCR24 94836 sc-eQTL 6.60e-01 0.0536 0.122 0.12 B L1
ENSG00000116205 TCEANC2 928447 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00907 0.105 0.12 B L1
ENSG00000116209 TMEM59 928527 sc-eQTL 4.46e-02 -0.128 0.0634 0.12 B L1
ENSG00000116221 MRPL37 797990 sc-eQTL 1.58e-01 0.118 0.0833 0.12 B L1
ENSG00000157216 SSBP3 568552 sc-eQTL 4.69e-01 0.0635 0.0875 0.12 B L1
ENSG00000162402 USP24 -233333 sc-eQTL 1.69e-01 0.102 0.0739 0.12 B L1
ENSG00000215883 CYB5RL 781995 sc-eQTL 9.68e-01 0.00573 0.143 0.12 B L1
ENSG00000243725 TTC4 266170 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0822 0.124 0.12 B L1
ENSG00000006555 TTC22 180708 sc-eQTL 1.25e-01 -0.152 0.0987 0.12 CD4T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 928447 sc-eQTL 9.09e-01 0.00928 0.0811 0.12 CD4T L1
ENSG00000116209 TMEM59 928527 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0259 0.0756 0.12 CD4T L1
ENSG00000116221 MRPL37 797990 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00206 0.104 0.12 CD4T L1
ENSG00000157216 SSBP3 568552 sc-eQTL 3.45e-01 -0.0819 0.0866 0.12 CD4T L1
ENSG00000162402 USP24 -233333 sc-eQTL 3.19e-01 0.0704 0.0705 0.12 CD4T L1
ENSG00000243725 TTC4 266170 sc-eQTL 1.55e-01 0.151 0.106 0.12 CD4T L1
ENSG00000006555 TTC22 180708 sc-eQTL 6.86e-01 0.0348 0.0861 0.12 CD8T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 928447 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0322 0.107 0.12 CD8T L1
ENSG00000116209 TMEM59 928527 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0655 0.0744 0.12 CD8T L1
ENSG00000116221 MRPL37 797990 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0606 0.102 0.12 CD8T L1
ENSG00000157216 SSBP3 568552 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0292 0.0736 0.12 CD8T L1
ENSG00000162402 USP24 -233333 sc-eQTL 1.05e-01 0.115 0.0708 0.12 CD8T L1
ENSG00000243725 TTC4 266170 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0552 0.124 0.12 CD8T L1
ENSG00000116133 DHCR24 94836 sc-eQTL 6.65e-01 0.0495 0.114 0.119 DC L1
ENSG00000116205 TCEANC2 928447 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0267 0.128 0.119 DC L1
ENSG00000116209 TMEM59 928527 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0583 0.101 0.119 DC L1
ENSG00000116221 MRPL37 797990 sc-eQTL 6.45e-01 0.0623 0.135 0.119 DC L1
ENSG00000157216 SSBP3 568552 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0452 0.12 0.119 DC L1
ENSG00000162390 ACOT11 439774 sc-eQTL 7.10e-02 0.209 0.115 0.119 DC L1
ENSG00000162402 USP24 -233333 sc-eQTL 3.95e-01 0.0595 0.0698 0.119 DC L1
ENSG00000215883 CYB5RL 781995 sc-eQTL 8.96e-01 0.0165 0.126 0.119 DC L1
ENSG00000243725 TTC4 266170 sc-eQTL 2.05e-01 0.172 0.135 0.119 DC L1
ENSG00000116133 DHCR24 94836 sc-eQTL 7.07e-01 0.0311 0.0827 0.12 Mono L1
ENSG00000116205 TCEANC2 928447 sc-eQTL 8.97e-01 0.0116 0.0893 0.12 Mono L1
ENSG00000116209 TMEM59 928527 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0544 0.0662 0.12 Mono L1
ENSG00000116221 MRPL37 797990 sc-eQTL 9.14e-01 -0.012 0.111 0.12 Mono L1
ENSG00000157216 SSBP3 568552 sc-eQTL 1.28e-01 -0.193 0.126 0.12 Mono L1
ENSG00000162402 USP24 -233333 sc-eQTL 4.71e-01 0.0546 0.0757 0.12 Mono L1
ENSG00000243725 TTC4 266170 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0402 0.133 0.12 Mono L1
ENSG00000006555 TTC22 180708 sc-eQTL 1.79e-01 0.154 0.114 0.118 NK L1
ENSG00000116133 DHCR24 94836 sc-eQTL 2.34e-01 0.138 0.115 0.118 NK L1
ENSG00000116205 TCEANC2 928447 sc-eQTL 4.90e-01 0.0788 0.114 0.118 NK L1
ENSG00000116209 TMEM59 928527 sc-eQTL 8.37e-01 0.0185 0.0895 0.118 NK L1
ENSG00000116221 MRPL37 797990 sc-eQTL 2.55e-01 0.127 0.111 0.118 NK L1
ENSG00000157216 SSBP3 568552 sc-eQTL 1.75e-01 -0.131 0.096 0.118 NK L1
ENSG00000162398 LEXM 175968 sc-eQTL 2.49e-02 -0.242 0.107 0.118 NK L1
ENSG00000162402 USP24 -233333 sc-eQTL 5.71e-01 0.0372 0.0656 0.118 NK L1
ENSG00000243725 TTC4 266170 sc-eQTL 8.05e-01 0.0306 0.124 0.118 NK L1
ENSG00000006555 TTC22 180708 sc-eQTL 2.99e-01 0.106 0.101 0.12 Other_T L1
ENSG00000116133 DHCR24 94836 sc-eQTL 5.85e-01 0.0431 0.0789 0.12 Other_T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 928447 sc-eQTL 1.38e-01 0.175 0.117 0.12 Other_T L1
ENSG00000116209 TMEM59 928527 sc-eQTL 6.98e-01 0.0315 0.081 0.12 Other_T L1
ENSG00000116221 MRPL37 797990 sc-eQTL 9.16e-01 -0.008 0.0759 0.12 Other_T L1
ENSG00000157216 SSBP3 568552 sc-eQTL 7.78e-02 -0.154 0.0872 0.12 Other_T L1
ENSG00000162402 USP24 -233333 sc-eQTL 6.44e-01 0.0432 0.0934 0.12 Other_T L1
ENSG00000215883 CYB5RL 781995 sc-eQTL 3.04e-01 0.131 0.127 0.12 Other_T L1
ENSG00000243725 TTC4 266170 sc-eQTL 7.11e-01 0.0473 0.127 0.12 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 180708 sc-eQTL 7.47e-02 -0.194 0.108 0.122 B_Activated L2
ENSG00000116133 DHCR24 94836 sc-eQTL 7.80e-01 0.0358 0.128 0.122 B_Activated L2
ENSG00000116205 TCEANC2 928447 sc-eQTL 9.08e-01 -0.016 0.138 0.122 B_Activated L2
ENSG00000116209 TMEM59 928527 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0763 0.146 0.122 B_Activated L2
ENSG00000116221 MRPL37 797990 sc-eQTL 3.71e-01 0.141 0.158 0.122 B_Activated L2
ENSG00000157216 SSBP3 568552 sc-eQTL 4.75e-01 0.102 0.143 0.122 B_Activated L2
ENSG00000162402 USP24 -233333 sc-eQTL 1.70e-01 -0.191 0.139 0.122 B_Activated L2
ENSG00000215883 CYB5RL 781995 sc-eQTL 7.02e-01 0.0472 0.123 0.122 B_Activated L2
ENSG00000243725 TTC4 266170 sc-eQTL 1.32e-01 -0.201 0.133 0.122 B_Activated L2
ENSG00000006555 TTC22 180708 sc-eQTL 4.05e-01 -0.114 0.136 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000116133 DHCR24 94836 sc-eQTL 7.77e-01 -0.036 0.127 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000116205 TCEANC2 928447 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0694 0.126 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000116209 TMEM59 928527 sc-eQTL 7.20e-01 0.0388 0.108 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000116221 MRPL37 797990 sc-eQTL 2.04e-02 0.293 0.125 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000157216 SSBP3 568552 sc-eQTL 3.49e-01 -0.111 0.118 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000162402 USP24 -233333 sc-eQTL 4.09e-01 0.0826 0.0998 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000215883 CYB5RL 781995 sc-eQTL 6.69e-01 0.0605 0.142 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000243725 TTC4 266170 sc-eQTL 1.93e-01 0.167 0.128 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000006555 TTC22 180708 sc-eQTL 9.94e-01 0.00104 0.13 0.121 B_Memory L2
ENSG00000116133 DHCR24 94836 sc-eQTL 5.53e-01 0.0764 0.129 0.121 B_Memory L2
ENSG00000116205 TCEANC2 928447 sc-eQTL 7.75e-01 0.0394 0.138 0.121 B_Memory L2
ENSG00000116209 TMEM59 928527 sc-eQTL 9.23e-01 0.0111 0.115 0.121 B_Memory L2
ENSG00000116221 MRPL37 797990 sc-eQTL 2.85e-01 -0.124 0.116 0.121 B_Memory L2
ENSG00000157216 SSBP3 568552 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0635 0.108 0.121 B_Memory L2
ENSG00000162402 USP24 -233333 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0884 0.106 0.121 B_Memory L2
ENSG00000215883 CYB5RL 781995 sc-eQTL 6.70e-02 0.24 0.13 0.121 B_Memory L2
ENSG00000243725 TTC4 266170 sc-eQTL 1.23e-01 -0.209 0.135 0.121 B_Memory L2
ENSG00000006555 TTC22 180708 sc-eQTL 8.27e-01 0.0296 0.135 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000116133 DHCR24 94836 sc-eQTL 3.98e-01 0.107 0.126 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 928447 sc-eQTL 8.44e-01 0.0222 0.113 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000116209 TMEM59 928527 sc-eQTL 1.32e-02 -0.202 0.0809 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000116221 MRPL37 797990 sc-eQTL 8.15e-01 0.0283 0.121 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000157216 SSBP3 568552 sc-eQTL 4.79e-02 0.227 0.114 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000162402 USP24 -233333 sc-eQTL 4.46e-02 0.182 0.09 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 781995 sc-eQTL 9.58e-01 0.00715 0.137 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000243725 TTC4 266170 sc-eQTL 6.24e-01 0.0607 0.124 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000006555 TTC22 180708 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0201 0.136 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000116133 DHCR24 94836 sc-eQTL 1.44e-01 -0.173 0.118 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 928447 sc-eQTL 8.51e-01 0.0248 0.132 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000116209 TMEM59 928527 sc-eQTL 5.07e-02 -0.211 0.107 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000116221 MRPL37 797990 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0921 0.127 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000157216 SSBP3 568552 sc-eQTL 4.59e-01 0.0932 0.126 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000162402 USP24 -233333 sc-eQTL 4.95e-01 0.0681 0.0995 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 781995 sc-eQTL 8.39e-03 -0.367 0.138 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000243725 TTC4 266170 sc-eQTL 7.57e-01 0.0452 0.146 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000006555 TTC22 180708 sc-eQTL 4.25e-01 -0.103 0.128 0.118 CD4_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 928447 sc-eQTL 1.72e-01 -0.181 0.132 0.118 CD4_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 928527 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0172 0.12 0.118 CD4_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 797990 sc-eQTL 4.27e-02 -0.299 0.146 0.118 CD4_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 568552 sc-eQTL 9.22e-01 -0.00893 0.091 0.118 CD4_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -233333 sc-eQTL 9.37e-03 0.322 0.123 0.118 CD4_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 266170 sc-eQTL 8.83e-01 0.0206 0.14 0.118 CD4_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 180708 sc-eQTL 7.95e-02 -0.204 0.116 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 928447 sc-eQTL 9.68e-01 -0.0036 0.0889 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 928527 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00779 0.0864 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 797990 sc-eQTL 9.26e-01 0.0104 0.111 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 568552 sc-eQTL 4.66e-02 -0.176 0.0881 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -233333 sc-eQTL 9.33e-01 0.00645 0.0767 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 266170 sc-eQTL 1.91e-01 0.153 0.116 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 180708 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0971 0.123 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 928447 sc-eQTL 3.69e-01 0.107 0.119 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 928527 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0456 0.0901 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 797990 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0587 0.113 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 568552 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0892 0.111 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -233333 sc-eQTL 2.14e-01 0.114 0.0917 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 266170 sc-eQTL 6.80e-01 0.0547 0.133 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 180708 sc-eQTL 3.28e-01 0.14 0.142 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 928447 sc-eQTL 5.73e-01 0.0764 0.135 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 928527 sc-eQTL 4.18e-01 0.0849 0.105 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 797990 sc-eQTL 7.91e-01 0.0358 0.135 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 568552 sc-eQTL 2.04e-01 0.147 0.115 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -233333 sc-eQTL 1.12e-01 0.167 0.105 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 266170 sc-eQTL 8.23e-01 0.0312 0.139 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 180708 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0455 0.113 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 928447 sc-eQTL 2.14e-01 0.155 0.124 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 928527 sc-eQTL 3.23e-01 -0.107 0.108 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 797990 sc-eQTL 4.10e-01 0.106 0.129 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 568552 sc-eQTL 2.50e-01 -0.101 0.0877 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -233333 sc-eQTL 6.29e-01 0.0423 0.0875 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 266170 sc-eQTL 9.91e-01 0.00154 0.131 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 180708 sc-eQTL 5.85e-01 0.0692 0.126 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 928447 sc-eQTL 8.04e-01 0.0285 0.114 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 928527 sc-eQTL 7.04e-01 0.0426 0.112 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 797990 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0279 0.134 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 568552 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0611 0.102 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -233333 sc-eQTL 4.87e-01 0.0643 0.0923 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 266170 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0458 0.135 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 180708 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0623 0.138 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 928447 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0139 0.139 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 928527 sc-eQTL 4.55e-02 -0.243 0.121 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 797990 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0857 0.138 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 568552 sc-eQTL 2.99e-01 -0.125 0.12 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -233333 sc-eQTL 8.78e-01 0.0179 0.116 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 266170 sc-eQTL 1.02e-01 -0.231 0.141 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 180708 sc-eQTL 5.80e-01 0.0752 0.135 0.112 CD8_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 928447 sc-eQTL 3.88e-01 -0.122 0.141 0.112 CD8_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 928527 sc-eQTL 3.21e-02 -0.292 0.135 0.112 CD8_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 797990 sc-eQTL 7.71e-02 -0.244 0.138 0.112 CD8_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 568552 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0803 0.131 0.112 CD8_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -233333 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0709 0.138 0.112 CD8_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 266170 sc-eQTL 1.07e-01 0.226 0.14 0.112 CD8_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 180708 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0846 0.122 0.119 MAIT L2
ENSG00000116133 DHCR24 94836 sc-eQTL 2.93e-03 0.266 0.0882 0.119 MAIT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 928447 sc-eQTL 8.18e-01 0.0292 0.127 0.119 MAIT L2
ENSG00000116209 TMEM59 928527 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0363 0.115 0.119 MAIT L2
ENSG00000116221 MRPL37 797990 sc-eQTL 1.14e-01 -0.22 0.138 0.119 MAIT L2
ENSG00000157216 SSBP3 568552 sc-eQTL 3.51e-01 -0.115 0.123 0.119 MAIT L2
ENSG00000162402 USP24 -233333 sc-eQTL 3.51e-01 0.102 0.109 0.119 MAIT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 781995 sc-eQTL 7.36e-01 0.043 0.127 0.119 MAIT L2
ENSG00000243725 TTC4 266170 sc-eQTL 8.42e-01 0.0253 0.127 0.119 MAIT L2
ENSG00000006555 TTC22 180708 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0525 0.14 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000116133 DHCR24 94836 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00857 0.124 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000116205 TCEANC2 928447 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0496 0.13 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000116209 TMEM59 928527 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0259 0.127 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000116221 MRPL37 797990 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0138 0.142 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000157216 SSBP3 568552 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0452 0.107 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000162398 LEXM 175968 sc-eQTL 7.11e-01 0.0469 0.127 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000162402 USP24 -233333 sc-eQTL 2.73e-01 0.119 0.109 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000243725 TTC4 266170 sc-eQTL 7.46e-01 0.0445 0.137 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000006555 TTC22 180708 sc-eQTL 2.00e-01 0.148 0.115 0.119 NK_CD56dim L2
ENSG00000116133 DHCR24 94836 sc-eQTL 8.32e-01 0.0257 0.121 0.119 NK_CD56dim L2
ENSG00000116205 TCEANC2 928447 sc-eQTL 4.61e-02 0.26 0.129 0.119 NK_CD56dim L2
ENSG00000116209 TMEM59 928527 sc-eQTL 3.72e-01 0.0865 0.0967 0.119 NK_CD56dim L2
ENSG00000116221 MRPL37 797990 sc-eQTL 4.83e-01 0.0883 0.126 0.119 NK_CD56dim L2
ENSG00000157216 SSBP3 568552 sc-eQTL 3.53e-01 -0.0958 0.103 0.119 NK_CD56dim L2
ENSG00000162398 LEXM 175968 sc-eQTL 1.45e-02 -0.288 0.117 0.119 NK_CD56dim L2
ENSG00000162402 USP24 -233333 sc-eQTL 6.64e-01 0.0328 0.0753 0.119 NK_CD56dim L2
ENSG00000243725 TTC4 266170 sc-eQTL 7.70e-01 0.0377 0.129 0.119 NK_CD56dim L2
ENSG00000006555 TTC22 180708 sc-eQTL 6.88e-01 0.0544 0.135 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000116133 DHCR24 94836 sc-eQTL 1.06e-01 0.213 0.131 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000116205 TCEANC2 928447 sc-eQTL 3.27e-01 -0.125 0.127 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000116209 TMEM59 928527 sc-eQTL 2.76e-01 -0.138 0.126 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000116221 MRPL37 797990 sc-eQTL 9.62e-01 0.0066 0.139 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000157216 SSBP3 568552 sc-eQTL 1.11e-01 -0.181 0.113 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000162398 LEXM 175968 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0129 0.128 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000162402 USP24 -233333 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0284 0.094 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000243725 TTC4 266170 sc-eQTL 2.06e-01 0.177 0.14 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000006555 TTC22 180708 sc-eQTL 6.04e-01 0.0637 0.123 0.119 NK_cytokine L2
ENSG00000116133 DHCR24 94836 sc-eQTL 1.06e-01 0.2 0.123 0.119 NK_cytokine L2
ENSG00000116205 TCEANC2 928447 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0179 0.123 0.119 NK_cytokine L2
ENSG00000116209 TMEM59 928527 sc-eQTL 9.90e-01 0.00132 0.1 0.119 NK_cytokine L2
ENSG00000116221 MRPL37 797990 sc-eQTL 5.25e-01 0.0786 0.123 0.119 NK_cytokine L2
ENSG00000157216 SSBP3 568552 sc-eQTL 2.49e-01 -0.119 0.103 0.119 NK_cytokine L2
ENSG00000162398 LEXM 175968 sc-eQTL 1.99e-01 -0.166 0.129 0.119 NK_cytokine L2
ENSG00000162402 USP24 -233333 sc-eQTL 3.87e-01 0.0763 0.0881 0.119 NK_cytokine L2
ENSG00000243725 TTC4 266170 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0632 0.131 0.119 NK_cytokine L2
ENSG00000006555 TTC22 180708 sc-eQTL 1.77e-01 0.212 0.156 0.119 PB L2
ENSG00000116133 DHCR24 94836 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0443 0.14 0.119 PB L2
ENSG00000116205 TCEANC2 928447 sc-eQTL 4.08e-01 -0.141 0.169 0.119 PB L2
ENSG00000116209 TMEM59 928527 sc-eQTL 2.80e-02 -0.155 0.0695 0.119 PB L2
ENSG00000116221 MRPL37 797990 sc-eQTL 4.98e-01 0.0876 0.129 0.119 PB L2
ENSG00000157216 SSBP3 568552 sc-eQTL 3.03e-01 -0.154 0.148 0.119 PB L2
ENSG00000162402 USP24 -233333 sc-eQTL 3.71e-01 0.152 0.169 0.119 PB L2
ENSG00000215883 CYB5RL 781995 sc-eQTL 1.87e-01 -0.231 0.174 0.119 PB L2
ENSG00000243725 TTC4 266170 sc-eQTL 7.49e-02 -0.291 0.162 0.119 PB L2
ENSG00000006555 TTC22 180708 sc-eQTL 2.64e-02 0.273 0.122 0.12 Pro_T L2
ENSG00000116133 DHCR24 94836 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0473 0.105 0.12 Pro_T L2
ENSG00000116205 TCEANC2 928447 sc-eQTL 2.18e-01 0.158 0.128 0.12 Pro_T L2
ENSG00000116209 TMEM59 928527 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0149 0.0889 0.12 Pro_T L2
ENSG00000116221 MRPL37 797990 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0103 0.0871 0.12 Pro_T L2
ENSG00000157216 SSBP3 568552 sc-eQTL 2.39e-01 -0.115 0.0974 0.12 Pro_T L2
ENSG00000162402 USP24 -233333 sc-eQTL 4.27e-01 0.0946 0.119 0.12 Pro_T L2
ENSG00000215883 CYB5RL 781995 sc-eQTL 2.29e-01 0.141 0.117 0.12 Pro_T L2
ENSG00000243725 TTC4 266170 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0779 0.131 0.12 Pro_T L2
ENSG00000006555 TTC22 180708 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0541 0.126 0.12 Treg L2
ENSG00000116205 TCEANC2 928447 sc-eQTL 6.96e-01 0.0526 0.135 0.12 Treg L2
ENSG00000116209 TMEM59 928527 sc-eQTL 7.12e-01 0.0393 0.106 0.12 Treg L2
ENSG00000116221 MRPL37 797990 sc-eQTL 4.89e-01 0.0911 0.132 0.12 Treg L2
ENSG00000157216 SSBP3 568552 sc-eQTL 4.54e-01 0.088 0.117 0.12 Treg L2
ENSG00000162402 USP24 -233333 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0343 0.112 0.12 Treg L2
ENSG00000243725 TTC4 266170 sc-eQTL 3.55e-01 0.13 0.141 0.12 Treg L2
ENSG00000116133 DHCR24 94836 sc-eQTL 9.48e-01 0.00716 0.11 0.127 cDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 928447 sc-eQTL 8.01e-01 0.0326 0.129 0.127 cDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 928527 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00598 0.11 0.127 cDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 797990 sc-eQTL 1.68e-01 0.193 0.14 0.127 cDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 568552 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00841 0.129 0.127 cDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 439774 sc-eQTL 1.41e-01 0.177 0.12 0.127 cDC L2
ENSG00000162402 USP24 -233333 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0306 0.135 0.127 cDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 781995 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00772 0.116 0.127 cDC L2
ENSG00000243725 TTC4 266170 sc-eQTL 7.36e-01 0.0468 0.138 0.127 cDC L2
ENSG00000116133 DHCR24 94836 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0277 0.0804 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000116205 TCEANC2 928447 sc-eQTL 6.29e-01 0.054 0.112 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000116209 TMEM59 928527 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0267 0.0677 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000116221 MRPL37 797990 sc-eQTL 3.31e-01 -0.117 0.12 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000157216 SSBP3 568552 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0955 0.123 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000162402 USP24 -233333 sc-eQTL 8.01e-01 0.0229 0.091 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000243725 TTC4 266170 sc-eQTL 7.80e-01 0.0388 0.139 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000116133 DHCR24 94836 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0126 0.0755 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000116205 TCEANC2 928447 sc-eQTL 1.50e-01 -0.166 0.115 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000116209 TMEM59 928527 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0754 0.092 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000116221 MRPL37 797990 sc-eQTL 5.05e-02 0.26 0.132 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000157216 SSBP3 568552 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0955 0.138 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000162402 USP24 -233333 sc-eQTL 7.03e-01 0.0427 0.112 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000243725 TTC4 266170 sc-eQTL 9.43e-01 0.00996 0.14 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000006555 TTC22 180708 sc-eQTL 6.77e-01 0.0523 0.125 0.121 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 94836 sc-eQTL 4.19e-01 0.113 0.139 0.121 gdT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 928447 sc-eQTL 4.37e-01 0.109 0.14 0.121 gdT L2
ENSG00000116209 TMEM59 928527 sc-eQTL 3.06e-01 -0.146 0.142 0.121 gdT L2
ENSG00000116221 MRPL37 797990 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0795 0.163 0.121 gdT L2
ENSG00000157216 SSBP3 568552 sc-eQTL 1.41e-01 -0.147 0.0992 0.121 gdT L2
ENSG00000162402 USP24 -233333 sc-eQTL 9.29e-01 -0.012 0.134 0.121 gdT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 781995 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0408 0.139 0.121 gdT L2
ENSG00000243725 TTC4 266170 sc-eQTL 2.18e-01 -0.193 0.156 0.121 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 94836 sc-eQTL 4.07e-01 0.0841 0.101 0.122 intMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 928447 sc-eQTL 1.21e-01 0.195 0.125 0.122 intMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 928527 sc-eQTL 5.41e-01 0.0567 0.0926 0.122 intMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 797990 sc-eQTL 3.83e-01 -0.124 0.141 0.122 intMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 568552 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0958 0.145 0.122 intMono L2
ENSG00000162402 USP24 -233333 sc-eQTL 5.60e-01 0.0753 0.129 0.122 intMono L2
ENSG00000243725 TTC4 266170 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0815 0.137 0.122 intMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 94836 sc-eQTL 3.89e-01 0.0865 0.1 0.122 ncMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 928447 sc-eQTL 4.23e-01 0.101 0.125 0.122 ncMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 928527 sc-eQTL 6.14e-01 0.0507 0.1 0.122 ncMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 797990 sc-eQTL 2.65e-01 -0.145 0.129 0.122 ncMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 568552 sc-eQTL 5.50e-02 -0.271 0.14 0.122 ncMono L2
ENSG00000162402 USP24 -233333 sc-eQTL 6.95e-01 0.0445 0.113 0.122 ncMono L2
ENSG00000243725 TTC4 266170 sc-eQTL 1.56e-01 -0.19 0.133 0.122 ncMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 94836 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0219 0.113 0.136 pDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 928447 sc-eQTL 1.89e-01 -0.178 0.135 0.136 pDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 928527 sc-eQTL 3.31e-01 0.106 0.108 0.136 pDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 797990 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0652 0.144 0.136 pDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 568552 sc-eQTL 8.95e-01 0.0169 0.128 0.136 pDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 439774 sc-eQTL 5.74e-01 0.0303 0.0538 0.136 pDC L2
ENSG00000162402 USP24 -233333 sc-eQTL 3.44e-01 0.086 0.0907 0.136 pDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 781995 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0536 0.124 0.136 pDC L2
ENSG00000243725 TTC4 266170 sc-eQTL 4.24e-01 0.115 0.143 0.136 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 180708 sc-eQTL 5.60e-01 -0.077 0.132 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 94836 sc-eQTL 9.61e-01 0.00654 0.133 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 928447 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0129 0.128 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 928527 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0505 0.0997 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 797990 sc-eQTL 1.55e-01 0.17 0.119 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 568552 sc-eQTL 5.07e-01 -0.069 0.104 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -233333 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0457 0.0947 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 781995 sc-eQTL 2.51e-01 0.167 0.145 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 266170 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00229 0.131 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 180708 sc-eQTL 7.70e-01 0.0401 0.137 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 94836 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0481 0.123 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 928447 sc-eQTL 8.92e-01 0.0152 0.111 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 928527 sc-eQTL 4.63e-03 -0.222 0.0776 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 797990 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0156 0.114 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 568552 sc-eQTL 7.44e-02 0.181 0.101 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -233333 sc-eQTL 4.41e-02 0.175 0.0865 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 781995 sc-eQTL 8.08e-02 -0.241 0.137 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 266170 sc-eQTL 9.58e-01 0.00687 0.13 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 94836 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0182 0.078 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 928447 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0897 0.0974 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 928527 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0417 0.0673 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 797990 sc-eQTL 6.56e-01 0.0532 0.119 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 568552 sc-eQTL 3.04e-01 -0.128 0.124 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -233333 sc-eQTL 7.26e-01 0.0299 0.0852 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 266170 sc-eQTL 9.16e-01 0.015 0.141 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 94836 sc-eQTL 6.29e-01 0.0464 0.0961 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 928447 sc-eQTL 1.50e-01 0.182 0.126 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 928527 sc-eQTL 7.69e-01 0.0276 0.0939 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 797990 sc-eQTL 1.38e-01 -0.191 0.128 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 568552 sc-eQTL 3.86e-02 -0.283 0.136 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -233333 sc-eQTL 9.16e-01 0.0114 0.108 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 266170 sc-eQTL 1.75e-01 -0.184 0.135 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 180708 sc-eQTL 1.50e-01 0.161 0.112 0.119 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 94836 sc-eQTL 3.01e-01 0.121 0.117 0.119 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 928447 sc-eQTL 2.59e-01 0.13 0.115 0.119 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 928527 sc-eQTL 7.31e-01 0.0306 0.0889 0.119 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 797990 sc-eQTL 3.10e-01 0.121 0.119 0.119 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 568552 sc-eQTL 1.82e-01 -0.13 0.0973 0.119 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162398 LEXM 175968 sc-eQTL 1.56e-02 -0.265 0.109 0.119 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -233333 sc-eQTL 5.31e-01 0.0438 0.0698 0.119 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 266170 sc-eQTL 9.94e-01 0.000933 0.124 0.119 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000162398 LEXM 175968 eQTL 2.62e-05 -0.12 0.0284 0.00105 0.0 0.146


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000116133 \N 94836 6.01e-06 5.11e-06 8.95e-07 3.02e-06 1.57e-06 1.56e-06 6.63e-06 9.79e-07 5.26e-06 2.44e-06 6.15e-06 3.32e-06 7.43e-06 1.97e-06 1.33e-06 3.78e-06 1.92e-06 3.81e-06 1.45e-06 1.02e-06 2.77e-06 4.96e-06 4.62e-06 1.4e-06 8.59e-06 2.02e-06 2.27e-06 1.81e-06 4.44e-06 4.29e-06 2.79e-06 4.38e-07 7.52e-07 1.52e-06 2.06e-06 9.77e-07 9.6e-07 4.74e-07 1.05e-06 3.61e-07 4.72e-07 6.04e-06 5.26e-07 1.65e-07 4.38e-07 6.92e-07 1.13e-06 4.41e-07 3.34e-07