logo

Genes within 1Mb (chr1:55053009:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 251686 sc-eQTL 8.60e-01 0.0175 0.0993 0.199 B L1
ENSG00000116133 DHCR24 165814 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0508 0.0939 0.199 B L1
ENSG00000116205 TCEANC2 999425 sc-eQTL 2.56e-01 -0.092 0.0808 0.199 B L1
ENSG00000116209 TMEM59 999505 sc-eQTL 4.01e-01 0.0415 0.0493 0.199 B L1
ENSG00000116221 MRPL37 868968 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0325 0.0646 0.199 B L1
ENSG00000157216 SSBP3 639530 sc-eQTL 8.97e-01 -0.00876 0.0676 0.199 B L1
ENSG00000162402 USP24 -162355 sc-eQTL 1.15e-01 -0.0902 0.057 0.199 B L1
ENSG00000215883 CYB5RL 852973 sc-eQTL 1.28e-01 -0.168 0.11 0.199 B L1
ENSG00000243725 TTC4 337148 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0382 0.096 0.199 B L1
ENSG00000006555 TTC22 251686 sc-eQTL 1.50e-01 0.112 0.0774 0.199 CD4T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 999425 sc-eQTL 3.33e-01 0.0616 0.0635 0.199 CD4T L1
ENSG00000116209 TMEM59 999505 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0107 0.0593 0.199 CD4T L1
ENSG00000116221 MRPL37 868968 sc-eQTL 8.91e-01 0.0112 0.0819 0.199 CD4T L1
ENSG00000157216 SSBP3 639530 sc-eQTL 2.29e-01 0.0818 0.0678 0.199 CD4T L1
ENSG00000162402 USP24 -162355 sc-eQTL 9.71e-01 0.00201 0.0554 0.199 CD4T L1
ENSG00000243725 TTC4 337148 sc-eQTL 5.15e-02 -0.162 0.0827 0.199 CD4T L1
ENSG00000006555 TTC22 251686 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00258 0.0673 0.199 CD8T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 999425 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0584 0.0837 0.199 CD8T L1
ENSG00000116209 TMEM59 999505 sc-eQTL 5.78e-01 0.0324 0.0582 0.199 CD8T L1
ENSG00000116221 MRPL37 868968 sc-eQTL 2.58e-02 0.178 0.0792 0.199 CD8T L1
ENSG00000157216 SSBP3 639530 sc-eQTL 2.28e-01 0.0694 0.0574 0.199 CD8T L1
ENSG00000162402 USP24 -162355 sc-eQTL 2.84e-01 -0.0597 0.0555 0.199 CD8T L1
ENSG00000243725 TTC4 337148 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00421 0.0966 0.199 CD8T L1
ENSG00000116133 DHCR24 165814 sc-eQTL 3.30e-01 0.0869 0.089 0.198 DC L1
ENSG00000116205 TCEANC2 999425 sc-eQTL 4.96e-01 0.0681 0.0998 0.198 DC L1
ENSG00000116209 TMEM59 999505 sc-eQTL 3.30e-02 -0.167 0.0777 0.198 DC L1
ENSG00000116221 MRPL37 868968 sc-eQTL 3.08e-01 0.108 0.105 0.198 DC L1
ENSG00000157216 SSBP3 639530 sc-eQTL 2.95e-01 -0.0985 0.0938 0.198 DC L1
ENSG00000162390 ACOT11 510752 sc-eQTL 1.95e-01 -0.117 0.0901 0.198 DC L1
ENSG00000162402 USP24 -162355 sc-eQTL 1.53e-02 0.132 0.0538 0.198 DC L1
ENSG00000215883 CYB5RL 852973 sc-eQTL 6.52e-01 0.0445 0.0986 0.198 DC L1
ENSG00000243725 TTC4 337148 sc-eQTL 1.63e-01 -0.148 0.106 0.198 DC L1
ENSG00000116133 DHCR24 165814 sc-eQTL 6.57e-01 0.0284 0.064 0.199 Mono L1
ENSG00000116205 TCEANC2 999425 sc-eQTL 6.12e-01 0.035 0.069 0.199 Mono L1
ENSG00000116209 TMEM59 999505 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0354 0.0512 0.199 Mono L1
ENSG00000116221 MRPL37 868968 sc-eQTL 2.52e-01 0.0982 0.0855 0.199 Mono L1
ENSG00000157216 SSBP3 639530 sc-eQTL 3.10e-01 0.0998 0.098 0.199 Mono L1
ENSG00000162402 USP24 -162355 sc-eQTL 1.02e-01 -0.0955 0.0582 0.199 Mono L1
ENSG00000243725 TTC4 337148 sc-eQTL 2.09e-01 -0.129 0.103 0.199 Mono L1
ENSG00000006555 TTC22 251686 sc-eQTL 2.36e-01 -0.105 0.0884 0.2 NK L1
ENSG00000116133 DHCR24 165814 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0371 0.0894 0.2 NK L1
ENSG00000116205 TCEANC2 999425 sc-eQTL 5.14e-02 -0.171 0.0875 0.2 NK L1
ENSG00000116209 TMEM59 999505 sc-eQTL 9.88e-01 0.00107 0.0692 0.2 NK L1
ENSG00000116221 MRPL37 868968 sc-eQTL 6.25e-01 -0.042 0.0859 0.2 NK L1
ENSG00000157216 SSBP3 639530 sc-eQTL 5.61e-01 0.0434 0.0745 0.2 NK L1
ENSG00000162398 LEXM 246946 sc-eQTL 4.89e-02 0.164 0.0829 0.2 NK L1
ENSG00000162402 USP24 -162355 sc-eQTL 2.48e-01 0.0586 0.0506 0.2 NK L1
ENSG00000243725 TTC4 337148 sc-eQTL 6.52e-01 0.0433 0.0959 0.2 NK L1
ENSG00000006555 TTC22 251686 sc-eQTL 6.54e-01 0.0361 0.0804 0.199 Other_T L1
ENSG00000116133 DHCR24 165814 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0173 0.0624 0.199 Other_T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 999425 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0179 0.0934 0.199 Other_T L1
ENSG00000116209 TMEM59 999505 sc-eQTL 5.46e-01 0.0387 0.064 0.199 Other_T L1
ENSG00000116221 MRPL37 868968 sc-eQTL 3.80e-01 0.0527 0.0599 0.199 Other_T L1
ENSG00000157216 SSBP3 639530 sc-eQTL 1.43e-03 0.219 0.0678 0.199 Other_T L1
ENSG00000162402 USP24 -162355 sc-eQTL 9.60e-02 0.123 0.0734 0.199 Other_T L1
ENSG00000215883 CYB5RL 852973 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0172 0.101 0.199 Other_T L1
ENSG00000243725 TTC4 337148 sc-eQTL 9.05e-03 -0.261 0.099 0.199 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 251686 sc-eQTL 8.78e-01 0.0126 0.0817 0.214 B_Activated L2
ENSG00000116133 DHCR24 165814 sc-eQTL 1.58e-01 -0.135 0.0955 0.214 B_Activated L2
ENSG00000116205 TCEANC2 999425 sc-eQTL 7.05e-01 -0.039 0.103 0.214 B_Activated L2
ENSG00000116209 TMEM59 999505 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0226 0.109 0.214 B_Activated L2
ENSG00000116221 MRPL37 868968 sc-eQTL 1.69e-01 0.162 0.118 0.214 B_Activated L2
ENSG00000157216 SSBP3 639530 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0105 0.107 0.214 B_Activated L2
ENSG00000162402 USP24 -162355 sc-eQTL 2.18e-01 -0.129 0.104 0.214 B_Activated L2
ENSG00000215883 CYB5RL 852973 sc-eQTL 5.54e-02 -0.176 0.0913 0.214 B_Activated L2
ENSG00000243725 TTC4 337148 sc-eQTL 6.12e-01 0.0509 0.1 0.214 B_Activated L2
ENSG00000006555 TTC22 251686 sc-eQTL 9.74e-01 0.00348 0.107 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000116133 DHCR24 165814 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0395 0.0988 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000116205 TCEANC2 999425 sc-eQTL 1.17e-01 -0.154 0.0979 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000116209 TMEM59 999505 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0735 0.0841 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000116221 MRPL37 868968 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0356 0.0991 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000157216 SSBP3 639530 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0537 0.0926 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000162402 USP24 -162355 sc-eQTL 3.34e-01 -0.0754 0.0778 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000215883 CYB5RL 852973 sc-eQTL 3.01e-01 0.114 0.11 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000243725 TTC4 337148 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0477 0.1 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000006555 TTC22 251686 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0413 0.102 0.196 B_Memory L2
ENSG00000116133 DHCR24 165814 sc-eQTL 1.56e-01 -0.143 0.1 0.196 B_Memory L2
ENSG00000116205 TCEANC2 999425 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0145 0.108 0.196 B_Memory L2
ENSG00000116209 TMEM59 999505 sc-eQTL 9.13e-01 0.00985 0.09 0.196 B_Memory L2
ENSG00000116221 MRPL37 868968 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0383 0.0911 0.196 B_Memory L2
ENSG00000157216 SSBP3 639530 sc-eQTL 3.41e-01 0.081 0.0849 0.196 B_Memory L2
ENSG00000162402 USP24 -162355 sc-eQTL 4.56e-01 -0.062 0.0831 0.196 B_Memory L2
ENSG00000215883 CYB5RL 852973 sc-eQTL 3.32e-01 -0.0998 0.103 0.196 B_Memory L2
ENSG00000243725 TTC4 337148 sc-eQTL 3.41e-01 0.102 0.106 0.196 B_Memory L2
ENSG00000006555 TTC22 251686 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0837 0.105 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000116133 DHCR24 165814 sc-eQTL 8.47e-01 0.0191 0.0985 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 999425 sc-eQTL 2.82e-01 0.0944 0.0876 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000116209 TMEM59 999505 sc-eQTL 9.02e-01 0.00786 0.0638 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000116221 MRPL37 868968 sc-eQTL 2.53e-01 -0.108 0.0938 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000157216 SSBP3 639530 sc-eQTL 4.89e-01 0.062 0.0896 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000162402 USP24 -162355 sc-eQTL 9.32e-01 0.00605 0.0706 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 852973 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0736 0.106 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000243725 TTC4 337148 sc-eQTL 6.18e-01 0.0479 0.0961 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000006555 TTC22 251686 sc-eQTL 1.87e-01 0.141 0.106 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000116133 DHCR24 165814 sc-eQTL 3.92e-01 0.0797 0.0929 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 999425 sc-eQTL 9.38e-02 -0.173 0.103 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000116209 TMEM59 999505 sc-eQTL 8.02e-02 0.148 0.0844 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000116221 MRPL37 868968 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0778 0.1 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000157216 SSBP3 639530 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0104 0.0986 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000162402 USP24 -162355 sc-eQTL 3.35e-01 0.0754 0.078 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 852973 sc-eQTL 2.01e-01 -0.141 0.11 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000243725 TTC4 337148 sc-eQTL 2.60e-01 -0.129 0.114 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000006555 TTC22 251686 sc-eQTL 1.99e-03 0.307 0.0979 0.191 CD4_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 999425 sc-eQTL 2.27e-01 0.125 0.103 0.191 CD4_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 999505 sc-eQTL 2.55e-01 0.107 0.0935 0.191 CD4_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 868968 sc-eQTL 2.88e-01 0.123 0.115 0.191 CD4_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 639530 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0497 0.0709 0.191 CD4_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -162355 sc-eQTL 2.05e-01 0.124 0.0971 0.191 CD4_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 337148 sc-eQTL 6.96e-01 0.0426 0.109 0.191 CD4_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 251686 sc-eQTL 2.79e-01 0.0984 0.0906 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 999425 sc-eQTL 7.00e-01 0.0267 0.0691 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 999505 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0448 0.0672 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 868968 sc-eQTL 8.23e-01 0.0194 0.0867 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 639530 sc-eQTL 8.93e-01 -0.00936 0.0692 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -162355 sc-eQTL 9.58e-01 0.00317 0.0597 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 337148 sc-eQTL 9.79e-02 -0.15 0.0904 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 251686 sc-eQTL 9.53e-01 0.00566 0.0962 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 999425 sc-eQTL 1.51e-01 0.134 0.0932 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 999505 sc-eQTL 6.79e-01 0.0292 0.0706 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 868968 sc-eQTL 6.84e-01 0.0362 0.0888 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 639530 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0623 0.087 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -162355 sc-eQTL 7.66e-01 0.0215 0.0722 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 337148 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0559 0.104 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 251686 sc-eQTL 2.24e-01 0.134 0.11 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 999425 sc-eQTL 4.83e-01 0.0736 0.105 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 999505 sc-eQTL 3.44e-01 -0.077 0.0811 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 868968 sc-eQTL 3.24e-01 0.103 0.104 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 639530 sc-eQTL 3.45e-01 0.0847 0.0895 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -162355 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0371 0.0816 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 337148 sc-eQTL 1.88e-01 -0.142 0.107 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 251686 sc-eQTL 6.27e-01 0.0429 0.0883 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 999425 sc-eQTL 8.38e-01 -0.02 0.0978 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 999505 sc-eQTL 4.19e-01 0.0688 0.0849 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 868968 sc-eQTL 3.39e-01 0.0964 0.101 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 639530 sc-eQTL 8.27e-01 0.0151 0.0689 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -162355 sc-eQTL 1.27e-01 -0.104 0.0681 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 337148 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0528 0.102 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 251686 sc-eQTL 3.02e-01 -0.101 0.0978 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 999425 sc-eQTL 4.27e-02 -0.179 0.0878 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 999505 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0431 0.0867 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 868968 sc-eQTL 2.29e-01 0.125 0.104 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 639530 sc-eQTL 4.02e-01 0.066 0.0786 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -162355 sc-eQTL 6.59e-01 0.0316 0.0716 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 337148 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0223 0.105 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 251686 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0672 0.109 0.194 CD8_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 999425 sc-eQTL 1.35e-01 -0.163 0.109 0.194 CD8_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 999505 sc-eQTL 5.18e-01 0.0623 0.0962 0.194 CD8_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 868968 sc-eQTL 1.41e-01 0.161 0.109 0.194 CD8_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 639530 sc-eQTL 2.23e-01 -0.115 0.0944 0.194 CD8_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -162355 sc-eQTL 4.75e-01 0.0657 0.0918 0.194 CD8_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 337148 sc-eQTL 6.40e-01 0.0523 0.112 0.194 CD8_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 251686 sc-eQTL 3.99e-01 0.0882 0.104 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 999425 sc-eQTL 7.23e-02 0.196 0.108 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 999505 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0327 0.106 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 868968 sc-eQTL 9.63e-01 -0.005 0.107 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 639530 sc-eQTL 1.74e-01 0.137 0.101 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -162355 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0298 0.107 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 337148 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0717 0.108 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 251686 sc-eQTL 3.87e-01 0.0829 0.0955 0.201 MAIT L2
ENSG00000116133 DHCR24 165814 sc-eQTL 3.06e-01 -0.0725 0.0707 0.201 MAIT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 999425 sc-eQTL 4.71e-02 -0.197 0.0988 0.201 MAIT L2
ENSG00000116209 TMEM59 999505 sc-eQTL 8.85e-01 0.013 0.0901 0.201 MAIT L2
ENSG00000116221 MRPL37 868968 sc-eQTL 2.98e-01 0.114 0.109 0.201 MAIT L2
ENSG00000157216 SSBP3 639530 sc-eQTL 9.25e-04 0.317 0.0945 0.201 MAIT L2
ENSG00000162402 USP24 -162355 sc-eQTL 8.51e-01 0.0162 0.0861 0.201 MAIT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 852973 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0851 0.1 0.201 MAIT L2
ENSG00000243725 TTC4 337148 sc-eQTL 4.83e-02 -0.196 0.0986 0.201 MAIT L2
ENSG00000006555 TTC22 251686 sc-eQTL 9.07e-01 0.0127 0.108 0.198 NK_CD56bright L2
ENSG00000116133 DHCR24 165814 sc-eQTL 9.82e-01 -0.0022 0.0952 0.198 NK_CD56bright L2
ENSG00000116205 TCEANC2 999425 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0122 0.101 0.198 NK_CD56bright L2
ENSG00000116209 TMEM59 999505 sc-eQTL 2.22e-01 0.12 0.0977 0.198 NK_CD56bright L2
ENSG00000116221 MRPL37 868968 sc-eQTL 1.39e-01 0.162 0.109 0.198 NK_CD56bright L2
ENSG00000157216 SSBP3 639530 sc-eQTL 2.83e-01 0.0887 0.0823 0.198 NK_CD56bright L2
ENSG00000162398 LEXM 246946 sc-eQTL 3.59e-01 0.0895 0.0973 0.198 NK_CD56bright L2
ENSG00000162402 USP24 -162355 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0422 0.0839 0.198 NK_CD56bright L2
ENSG00000243725 TTC4 337148 sc-eQTL 8.03e-02 0.185 0.105 0.198 NK_CD56bright L2
ENSG00000006555 TTC22 251686 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0258 0.0899 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000116133 DHCR24 165814 sc-eQTL 8.62e-01 0.0164 0.0938 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000116205 TCEANC2 999425 sc-eQTL 1.87e-01 -0.134 0.101 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000116209 TMEM59 999505 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0115 0.0753 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000116221 MRPL37 868968 sc-eQTL 1.28e-01 -0.149 0.0975 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000157216 SSBP3 639530 sc-eQTL 4.26e-01 0.064 0.0801 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000162398 LEXM 246946 sc-eQTL 1.51e-01 0.132 0.0918 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000162402 USP24 -162355 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00321 0.0586 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000243725 TTC4 337148 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0689 0.1 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000006555 TTC22 251686 sc-eQTL 8.30e-01 0.0234 0.108 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000116133 DHCR24 165814 sc-eQTL 2.17e-01 -0.131 0.105 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000116205 TCEANC2 999425 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0294 0.102 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000116209 TMEM59 999505 sc-eQTL 6.92e-01 0.0401 0.101 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000116221 MRPL37 868968 sc-eQTL 7.01e-01 0.0429 0.112 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000157216 SSBP3 639530 sc-eQTL 2.64e-01 0.102 0.0908 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000162398 LEXM 246946 sc-eQTL 1.97e-01 0.133 0.102 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000162402 USP24 -162355 sc-eQTL 6.65e-02 0.138 0.0747 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000243725 TTC4 337148 sc-eQTL 3.64e-01 -0.102 0.112 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000006555 TTC22 251686 sc-eQTL 3.06e-01 -0.0985 0.0959 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000116133 DHCR24 165814 sc-eQTL 7.90e-01 -0.026 0.0972 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000116205 TCEANC2 999425 sc-eQTL 3.20e-01 -0.096 0.0963 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000116209 TMEM59 999505 sc-eQTL 1.31e-01 -0.118 0.0781 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000116221 MRPL37 868968 sc-eQTL 7.65e-01 0.029 0.0967 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000157216 SSBP3 639530 sc-eQTL 3.59e-01 0.0744 0.081 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000162398 LEXM 246946 sc-eQTL 5.78e-01 0.0565 0.101 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000162402 USP24 -162355 sc-eQTL 4.32e-01 0.0543 0.069 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000243725 TTC4 337148 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0393 0.102 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000006555 TTC22 251686 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00991 0.126 0.215 PB L2
ENSG00000116133 DHCR24 165814 sc-eQTL 9.74e-01 0.00362 0.112 0.215 PB L2
ENSG00000116205 TCEANC2 999425 sc-eQTL 1.87e-01 0.18 0.135 0.215 PB L2
ENSG00000116209 TMEM59 999505 sc-eQTL 7.50e-01 0.0182 0.057 0.215 PB L2
ENSG00000116221 MRPL37 868968 sc-eQTL 5.54e-01 0.0613 0.103 0.215 PB L2
ENSG00000157216 SSBP3 639530 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0379 0.12 0.215 PB L2
ENSG00000162402 USP24 -162355 sc-eQTL 1.16e-01 -0.213 0.134 0.215 PB L2
ENSG00000215883 CYB5RL 852973 sc-eQTL 4.38e-01 -0.109 0.14 0.215 PB L2
ENSG00000243725 TTC4 337148 sc-eQTL 5.77e-03 0.358 0.127 0.215 PB L2
ENSG00000006555 TTC22 251686 sc-eQTL 1.06e-01 0.159 0.0981 0.198 Pro_T L2
ENSG00000116133 DHCR24 165814 sc-eQTL 9.95e-02 0.138 0.0833 0.198 Pro_T L2
ENSG00000116205 TCEANC2 999425 sc-eQTL 6.18e-01 0.0511 0.102 0.198 Pro_T L2
ENSG00000116209 TMEM59 999505 sc-eQTL 2.48e-01 0.082 0.0708 0.198 Pro_T L2
ENSG00000116221 MRPL37 868968 sc-eQTL 9.15e-01 -0.00744 0.0696 0.198 Pro_T L2
ENSG00000157216 SSBP3 639530 sc-eQTL 1.05e-01 0.126 0.0775 0.198 Pro_T L2
ENSG00000162402 USP24 -162355 sc-eQTL 5.44e-01 0.0578 0.0951 0.198 Pro_T L2
ENSG00000215883 CYB5RL 852973 sc-eQTL 5.92e-01 0.0504 0.0939 0.198 Pro_T L2
ENSG00000243725 TTC4 337148 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0473 0.104 0.198 Pro_T L2
ENSG00000006555 TTC22 251686 sc-eQTL 3.56e-01 0.0904 0.0978 0.199 Treg L2
ENSG00000116205 TCEANC2 999425 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00417 0.105 0.199 Treg L2
ENSG00000116209 TMEM59 999505 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0382 0.0829 0.199 Treg L2
ENSG00000116221 MRPL37 868968 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0449 0.103 0.199 Treg L2
ENSG00000157216 SSBP3 639530 sc-eQTL 9.74e-02 0.151 0.091 0.199 Treg L2
ENSG00000162402 USP24 -162355 sc-eQTL 1.43e-01 -0.128 0.0868 0.199 Treg L2
ENSG00000243725 TTC4 337148 sc-eQTL 7.36e-01 0.0371 0.11 0.199 Treg L2
ENSG00000116133 DHCR24 165814 sc-eQTL 4.43e-01 0.0685 0.089 0.2 cDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 999425 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0302 0.105 0.2 cDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 999505 sc-eQTL 5.17e-02 -0.173 0.0884 0.2 cDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 868968 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0552 0.114 0.2 cDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 639530 sc-eQTL 3.52e-01 -0.0982 0.105 0.2 cDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 510752 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0866 0.0978 0.2 cDC L2
ENSG00000162402 USP24 -162355 sc-eQTL 2.56e-01 0.125 0.109 0.2 cDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 852973 sc-eQTL 1.40e-01 0.139 0.0938 0.2 cDC L2
ENSG00000243725 TTC4 337148 sc-eQTL 3.54e-01 -0.104 0.112 0.2 cDC L2
ENSG00000116133 DHCR24 165814 sc-eQTL 6.35e-01 0.0296 0.0622 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000116205 TCEANC2 999425 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0266 0.0865 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000116209 TMEM59 999505 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0229 0.0524 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000116221 MRPL37 868968 sc-eQTL 3.98e-01 0.0791 0.0933 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000157216 SSBP3 639530 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0206 0.0954 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000162402 USP24 -162355 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0659 0.0703 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000243725 TTC4 337148 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0533 0.108 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000116133 DHCR24 165814 sc-eQTL 1.13e-01 -0.0922 0.0579 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000116205 TCEANC2 999425 sc-eQTL 3.23e-01 0.0878 0.0887 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000116209 TMEM59 999505 sc-eQTL 2.59e-01 -0.0803 0.0709 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000116221 MRPL37 868968 sc-eQTL 3.55e-01 0.0951 0.103 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000157216 SSBP3 639530 sc-eQTL 3.86e-02 0.22 0.106 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000162402 USP24 -162355 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0373 0.0864 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000243725 TTC4 337148 sc-eQTL 1.28e-01 -0.164 0.108 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000006555 TTC22 251686 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0815 0.099 0.188 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 165814 sc-eQTL 9.81e-01 0.0026 0.111 0.188 gdT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 999425 sc-eQTL 3.41e-01 0.106 0.111 0.188 gdT L2
ENSG00000116209 TMEM59 999505 sc-eQTL 6.90e-01 0.045 0.113 0.188 gdT L2
ENSG00000116221 MRPL37 868968 sc-eQTL 7.79e-01 0.0364 0.129 0.188 gdT L2
ENSG00000157216 SSBP3 639530 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0274 0.0791 0.188 gdT L2
ENSG00000162402 USP24 -162355 sc-eQTL 5.58e-02 0.202 0.105 0.188 gdT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 852973 sc-eQTL 8.53e-01 0.0205 0.11 0.188 gdT L2
ENSG00000243725 TTC4 337148 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0983 0.124 0.188 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 165814 sc-eQTL 3.02e-01 0.0816 0.0788 0.202 intMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 999425 sc-eQTL 3.16e-01 -0.0987 0.0982 0.202 intMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 999505 sc-eQTL 1.00e-01 -0.119 0.0718 0.202 intMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 868968 sc-eQTL 2.30e-01 0.133 0.11 0.202 intMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 639530 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0453 0.113 0.202 intMono L2
ENSG00000162402 USP24 -162355 sc-eQTL 2.19e-01 -0.124 0.1 0.202 intMono L2
ENSG00000243725 TTC4 337148 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00162 0.107 0.202 intMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 165814 sc-eQTL 4.48e-02 0.157 0.078 0.192 ncMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 999425 sc-eQTL 6.16e-01 0.0495 0.0984 0.192 ncMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 999505 sc-eQTL 1.56e-01 -0.112 0.0784 0.192 ncMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 868968 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0281 0.102 0.192 ncMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 639530 sc-eQTL 1.16e-01 0.174 0.11 0.192 ncMono L2
ENSG00000162402 USP24 -162355 sc-eQTL 4.81e-02 -0.175 0.0879 0.192 ncMono L2
ENSG00000243725 TTC4 337148 sc-eQTL 6.95e-01 0.0412 0.105 0.192 ncMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 165814 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00848 0.0967 0.203 pDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 999425 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0523 0.116 0.203 pDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 999505 sc-eQTL 2.74e-01 -0.101 0.0922 0.203 pDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 868968 sc-eQTL 9.05e-03 0.318 0.12 0.203 pDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 639530 sc-eQTL 7.37e-01 0.0367 0.109 0.203 pDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 510752 sc-eQTL 2.43e-01 -0.0536 0.0457 0.203 pDC L2
ENSG00000162402 USP24 -162355 sc-eQTL 4.46e-02 0.155 0.0765 0.203 pDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 852973 sc-eQTL 9.86e-01 0.00191 0.106 0.203 pDC L2
ENSG00000243725 TTC4 337148 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000951 0.122 0.203 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 251686 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0384 0.103 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 165814 sc-eQTL 8.61e-02 -0.177 0.102 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 999425 sc-eQTL 3.08e-02 -0.214 0.0986 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 999505 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0348 0.0776 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 868968 sc-eQTL 7.18e-01 0.0335 0.0929 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 639530 sc-eQTL 3.65e-01 0.0732 0.0807 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -162355 sc-eQTL 4.83e-02 -0.145 0.073 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 852973 sc-eQTL 9.17e-01 0.0118 0.113 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 337148 sc-eQTL 6.65e-01 -0.044 0.102 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 251686 sc-eQTL 7.33e-01 0.0367 0.108 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 165814 sc-eQTL 8.82e-01 0.0145 0.0969 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 999425 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0193 0.0875 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 999505 sc-eQTL 1.19e-01 0.0967 0.0618 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 868968 sc-eQTL 2.62e-01 -0.1 0.0891 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 639530 sc-eQTL 2.95e-01 0.0838 0.0798 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -162355 sc-eQTL 5.48e-01 0.0412 0.0685 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 852973 sc-eQTL 1.39e-01 -0.16 0.108 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 337148 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0452 0.102 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 165814 sc-eQTL 1.00e+00 -1.07e-06 0.0602 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 999425 sc-eQTL 6.24e-01 0.037 0.0753 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 999505 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0406 0.0519 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 868968 sc-eQTL 2.75e-01 0.1 0.0917 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 639530 sc-eQTL 5.55e-01 0.0568 0.0962 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -162355 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0582 0.0656 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 337148 sc-eQTL 2.81e-01 -0.117 0.109 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 165814 sc-eQTL 1.43e-01 0.109 0.0739 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 999425 sc-eQTL 8.34e-01 0.0205 0.0976 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 999505 sc-eQTL 2.26e-02 -0.165 0.0716 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 868968 sc-eQTL 5.71e-01 0.0564 0.0993 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 639530 sc-eQTL 5.73e-01 0.0599 0.106 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -162355 sc-eQTL 9.03e-02 -0.141 0.083 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 337148 sc-eQTL 9.83e-01 0.00229 0.105 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 251686 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0579 0.0877 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 165814 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0382 0.0916 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 999425 sc-eQTL 5.20e-02 -0.174 0.0891 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 999505 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0198 0.0695 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 868968 sc-eQTL 3.34e-01 -0.0899 0.0929 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 639530 sc-eQTL 2.79e-01 0.0828 0.0762 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162398 LEXM 246946 sc-eQTL 1.91e-01 0.112 0.0858 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -162355 sc-eQTL 5.29e-01 0.0344 0.0546 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 337148 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0809 0.0971 0.2 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000169174 PCSK9 13461 pQTL 2.38e-05 -0.137 0.0323 0.0 0.0 0.223
ENSG00000169174 PCSK9 13461 eQTL 3.26e-07 -0.102 0.0198 0.0115 0.0279 0.215

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000169174 PCSK9 13461 3.04e-05 3.18e-05 3.73e-06 1.33e-05 4.21e-06 1.15e-05 4.15e-05 3.74e-06 2.5e-05 1.07e-05 3.16e-05 1.29e-05 4.4e-05 1.1e-05 5.68e-06 1.21e-05 1.44e-05 1.93e-05 6.6e-06 5.3e-06 9.96e-06 2.5e-05 2.82e-05 7.18e-06 3.68e-05 6.05e-06 8.36e-06 9.24e-06 2.83e-05 2.14e-05 1.65e-05 1.56e-06 2.04e-06 4.75e-06 8.76e-06 4.43e-06 2.31e-06 2.7e-06 3.56e-06 2.38e-06 1.21e-06 3.45e-05 2.64e-06 2.62e-07 1.92e-06 2.74e-06 2.91e-06 1.3e-06 9.75e-07