logo

Genes within 1Mb (chr1:55052643:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 251320 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0329 0.0946 0.231 B L1
ENSG00000116133 DHCR24 165448 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00504 0.0895 0.231 B L1
ENSG00000116205 TCEANC2 999059 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0684 0.0771 0.231 B L1
ENSG00000116209 TMEM59 999139 sc-eQTL 5.06e-01 0.0313 0.047 0.231 B L1
ENSG00000116221 MRPL37 868602 sc-eQTL 1.36e-01 -0.0916 0.0612 0.231 B L1
ENSG00000157216 SSBP3 639164 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0119 0.0645 0.231 B L1
ENSG00000162402 USP24 -162721 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0363 0.0546 0.231 B L1
ENSG00000215883 CYB5RL 852607 sc-eQTL 1.03e-01 -0.171 0.104 0.231 B L1
ENSG00000243725 TTC4 336782 sc-eQTL 9.76e-01 -0.0027 0.0915 0.231 B L1
ENSG00000006555 TTC22 251320 sc-eQTL 2.47e-01 0.0856 0.0737 0.231 CD4T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 999059 sc-eQTL 3.91e-01 0.0519 0.0604 0.231 CD4T L1
ENSG00000116209 TMEM59 999139 sc-eQTL 7.90e-01 -0.015 0.0563 0.231 CD4T L1
ENSG00000116221 MRPL37 868602 sc-eQTL 7.96e-01 0.0202 0.0779 0.231 CD4T L1
ENSG00000157216 SSBP3 639164 sc-eQTL 1.79e-01 0.0869 0.0644 0.231 CD4T L1
ENSG00000162402 USP24 -162721 sc-eQTL 7.23e-01 0.0187 0.0527 0.231 CD4T L1
ENSG00000243725 TTC4 336782 sc-eQTL 2.31e-01 -0.095 0.079 0.231 CD4T L1
ENSG00000006555 TTC22 251320 sc-eQTL 5.71e-01 0.0365 0.0643 0.231 CD8T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 999059 sc-eQTL 9.92e-01 -0.000848 0.0801 0.231 CD8T L1
ENSG00000116209 TMEM59 999139 sc-eQTL 7.87e-01 0.0151 0.0556 0.231 CD8T L1
ENSG00000116221 MRPL37 868602 sc-eQTL 4.03e-01 0.0641 0.0765 0.231 CD8T L1
ENSG00000157216 SSBP3 639164 sc-eQTL 4.84e-02 0.108 0.0545 0.231 CD8T L1
ENSG00000162402 USP24 -162721 sc-eQTL 9.21e-01 -0.00529 0.0532 0.231 CD8T L1
ENSG00000243725 TTC4 336782 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0729 0.0922 0.231 CD8T L1
ENSG00000116133 DHCR24 165448 sc-eQTL 6.79e-01 0.0354 0.0854 0.232 DC L1
ENSG00000116205 TCEANC2 999059 sc-eQTL 8.55e-01 0.0175 0.0957 0.232 DC L1
ENSG00000116209 TMEM59 999139 sc-eQTL 3.23e-02 -0.16 0.0744 0.232 DC L1
ENSG00000116221 MRPL37 868602 sc-eQTL 4.06e-01 0.0839 0.101 0.232 DC L1
ENSG00000157216 SSBP3 639164 sc-eQTL 9.73e-01 0.00302 0.0901 0.232 DC L1
ENSG00000162390 ACOT11 510386 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0647 0.0865 0.232 DC L1
ENSG00000162402 USP24 -162721 sc-eQTL 3.03e-02 0.113 0.0517 0.232 DC L1
ENSG00000215883 CYB5RL 852607 sc-eQTL 1.84e-01 0.125 0.094 0.232 DC L1
ENSG00000243725 TTC4 336782 sc-eQTL 5.91e-02 -0.191 0.101 0.232 DC L1
ENSG00000116133 DHCR24 165448 sc-eQTL 9.75e-01 0.00191 0.0612 0.231 Mono L1
ENSG00000116205 TCEANC2 999059 sc-eQTL 7.09e-01 0.0246 0.066 0.231 Mono L1
ENSG00000116209 TMEM59 999139 sc-eQTL 9.84e-01 -0.000961 0.0491 0.231 Mono L1
ENSG00000116221 MRPL37 868602 sc-eQTL 6.00e-01 0.043 0.082 0.231 Mono L1
ENSG00000157216 SSBP3 639164 sc-eQTL 1.60e-01 0.132 0.0936 0.231 Mono L1
ENSG00000162402 USP24 -162721 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0525 0.0559 0.231 Mono L1
ENSG00000243725 TTC4 336782 sc-eQTL 1.85e-01 -0.131 0.0982 0.231 Mono L1
ENSG00000006555 TTC22 251320 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0746 0.0848 0.232 NK L1
ENSG00000116133 DHCR24 165448 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0809 0.0856 0.232 NK L1
ENSG00000116205 TCEANC2 999059 sc-eQTL 1.67e-01 -0.117 0.0842 0.232 NK L1
ENSG00000116209 TMEM59 999139 sc-eQTL 8.97e-01 0.00862 0.0663 0.232 NK L1
ENSG00000116221 MRPL37 868602 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0576 0.0823 0.232 NK L1
ENSG00000157216 SSBP3 639164 sc-eQTL 7.27e-01 0.025 0.0714 0.232 NK L1
ENSG00000162398 LEXM 246580 sc-eQTL 7.13e-03 0.214 0.0788 0.232 NK L1
ENSG00000162402 USP24 -162721 sc-eQTL 5.53e-01 0.0289 0.0486 0.232 NK L1
ENSG00000243725 TTC4 336782 sc-eQTL 4.48e-01 0.0698 0.0918 0.232 NK L1
ENSG00000006555 TTC22 251320 sc-eQTL 9.61e-01 0.00369 0.0761 0.231 Other_T L1
ENSG00000116133 DHCR24 165448 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0434 0.059 0.231 Other_T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 999059 sc-eQTL 3.99e-01 0.0745 0.0882 0.231 Other_T L1
ENSG00000116209 TMEM59 999139 sc-eQTL 5.00e-01 0.0409 0.0606 0.231 Other_T L1
ENSG00000116221 MRPL37 868602 sc-eQTL 1.35e-01 0.0847 0.0565 0.231 Other_T L1
ENSG00000157216 SSBP3 639164 sc-eQTL 2.40e-04 0.238 0.0636 0.231 Other_T L1
ENSG00000162402 USP24 -162721 sc-eQTL 5.41e-01 0.0428 0.0699 0.231 Other_T L1
ENSG00000215883 CYB5RL 852607 sc-eQTL 6.68e-01 -0.041 0.0956 0.231 Other_T L1
ENSG00000243725 TTC4 336782 sc-eQTL 9.45e-02 -0.159 0.0946 0.231 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 251320 sc-eQTL 8.08e-01 -0.019 0.0779 0.253 B_Activated L2
ENSG00000116133 DHCR24 165448 sc-eQTL 2.01e-01 -0.117 0.0911 0.253 B_Activated L2
ENSG00000116205 TCEANC2 999059 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0759 0.0981 0.253 B_Activated L2
ENSG00000116209 TMEM59 999139 sc-eQTL 9.94e-01 0.000829 0.104 0.253 B_Activated L2
ENSG00000116221 MRPL37 868602 sc-eQTL 2.19e-01 0.138 0.112 0.253 B_Activated L2
ENSG00000157216 SSBP3 639164 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0403 0.102 0.253 B_Activated L2
ENSG00000162402 USP24 -162721 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0632 0.0996 0.253 B_Activated L2
ENSG00000215883 CYB5RL 852607 sc-eQTL 5.06e-03 -0.244 0.086 0.253 B_Activated L2
ENSG00000243725 TTC4 336782 sc-eQTL 1.99e-01 0.123 0.095 0.253 B_Activated L2
ENSG00000006555 TTC22 251320 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00315 0.101 0.232 B_Intermediate L2
ENSG00000116133 DHCR24 165448 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0229 0.0939 0.232 B_Intermediate L2
ENSG00000116205 TCEANC2 999059 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0813 0.0933 0.232 B_Intermediate L2
ENSG00000116209 TMEM59 999139 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0256 0.08 0.232 B_Intermediate L2
ENSG00000116221 MRPL37 868602 sc-eQTL 2.83e-01 -0.101 0.0939 0.232 B_Intermediate L2
ENSG00000157216 SSBP3 639164 sc-eQTL 7.15e-01 0.0321 0.0879 0.232 B_Intermediate L2
ENSG00000162402 USP24 -162721 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00383 0.0741 0.232 B_Intermediate L2
ENSG00000215883 CYB5RL 852607 sc-eQTL 2.36e-01 0.124 0.105 0.232 B_Intermediate L2
ENSG00000243725 TTC4 336782 sc-eQTL 2.47e-01 -0.11 0.095 0.232 B_Intermediate L2
ENSG00000006555 TTC22 251320 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0539 0.0966 0.228 B_Memory L2
ENSG00000116133 DHCR24 165448 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0284 0.0959 0.228 B_Memory L2
ENSG00000116205 TCEANC2 999059 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0881 0.102 0.228 B_Memory L2
ENSG00000116209 TMEM59 999139 sc-eQTL 7.44e-01 0.0279 0.0855 0.228 B_Memory L2
ENSG00000116221 MRPL37 868602 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0107 0.0867 0.228 B_Memory L2
ENSG00000157216 SSBP3 639164 sc-eQTL 3.43e-01 0.0767 0.0807 0.228 B_Memory L2
ENSG00000162402 USP24 -162721 sc-eQTL 6.29e-01 0.0382 0.0791 0.228 B_Memory L2
ENSG00000215883 CYB5RL 852607 sc-eQTL 1.67e-01 -0.135 0.0974 0.228 B_Memory L2
ENSG00000243725 TTC4 336782 sc-eQTL 8.74e-01 0.0162 0.101 0.228 B_Memory L2
ENSG00000006555 TTC22 251320 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0524 0.101 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000116133 DHCR24 165448 sc-eQTL 7.12e-01 0.035 0.0948 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 999059 sc-eQTL 1.80e-01 0.113 0.0842 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000116209 TMEM59 999139 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0118 0.0614 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000116221 MRPL37 868602 sc-eQTL 1.50e-01 -0.13 0.0902 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000157216 SSBP3 639164 sc-eQTL 9.45e-01 0.00596 0.0863 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000162402 USP24 -162721 sc-eQTL 8.95e-01 -0.00895 0.068 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 852607 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0601 0.102 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000243725 TTC4 336782 sc-eQTL 4.92e-01 0.0637 0.0925 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000006555 TTC22 251320 sc-eQTL 7.08e-01 0.0385 0.103 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000116133 DHCR24 165448 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0105 0.0894 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 999059 sc-eQTL 3.67e-02 -0.207 0.0982 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000116209 TMEM59 999139 sc-eQTL 4.90e-02 0.16 0.081 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000116221 MRPL37 868602 sc-eQTL 1.59e-01 -0.135 0.0958 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000157216 SSBP3 639164 sc-eQTL 4.59e-01 0.0702 0.0946 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000162402 USP24 -162721 sc-eQTL 4.61e-01 0.0554 0.075 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 852607 sc-eQTL 1.87e-01 -0.139 0.105 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000243725 TTC4 336782 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0732 0.11 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000006555 TTC22 251320 sc-eQTL 1.46e-02 0.231 0.0937 0.223 CD4_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 999059 sc-eQTL 6.76e-01 0.0409 0.0979 0.223 CD4_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 999139 sc-eQTL 2.42e-01 0.104 0.0887 0.223 CD4_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 868602 sc-eQTL 9.61e-01 0.00533 0.109 0.223 CD4_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 639164 sc-eQTL 7.52e-01 0.0213 0.0673 0.223 CD4_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -162721 sc-eQTL 1.71e-01 0.127 0.092 0.223 CD4_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 336782 sc-eQTL 5.99e-01 0.0545 0.103 0.223 CD4_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 251320 sc-eQTL 2.55e-01 0.099 0.0867 0.231 CD4_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 999059 sc-eQTL 5.53e-01 0.0393 0.0661 0.231 CD4_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 999139 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0302 0.0643 0.231 CD4_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 868602 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0229 0.0829 0.231 CD4_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 639164 sc-eQTL 5.72e-01 0.0375 0.0662 0.231 CD4_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -162721 sc-eQTL 7.72e-01 0.0166 0.0571 0.231 CD4_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 336782 sc-eQTL 4.22e-01 -0.07 0.0869 0.231 CD4_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 251320 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0253 0.0912 0.231 CD4_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 999059 sc-eQTL 1.04e-01 0.144 0.0882 0.231 CD4_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 999139 sc-eQTL 6.35e-01 0.0318 0.0669 0.231 CD4_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 868602 sc-eQTL 1.82e-01 0.112 0.0838 0.231 CD4_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 639164 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0277 0.0825 0.231 CD4_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -162721 sc-eQTL 7.05e-01 0.0259 0.0684 0.231 CD4_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 336782 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00764 0.0985 0.231 CD4_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 251320 sc-eQTL 6.38e-02 0.194 0.104 0.231 CD4_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 999059 sc-eQTL 8.40e-01 0.0201 0.0996 0.231 CD4_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 999139 sc-eQTL 2.85e-01 -0.0824 0.0769 0.231 CD4_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 868602 sc-eQTL 9.10e-01 0.0113 0.0993 0.231 CD4_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 639164 sc-eQTL 8.78e-02 0.145 0.0846 0.231 CD4_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -162721 sc-eQTL 2.55e-01 0.0881 0.0772 0.231 CD4_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 336782 sc-eQTL 3.54e-01 -0.095 0.102 0.231 CD4_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 251320 sc-eQTL 5.26e-01 0.0536 0.0843 0.231 CD8_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 999059 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0288 0.0934 0.231 CD8_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 999139 sc-eQTL 1.90e-01 0.106 0.0809 0.231 CD8_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 868602 sc-eQTL 9.86e-01 0.00172 0.0963 0.231 CD8_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 639164 sc-eQTL 3.21e-01 0.0653 0.0657 0.231 CD8_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -162721 sc-eQTL 2.51e-01 -0.075 0.0653 0.231 CD8_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 336782 sc-eQTL 1.33e-01 -0.147 0.0974 0.231 CD8_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 251320 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0769 0.0936 0.231 CD8_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 999059 sc-eQTL 2.79e-01 -0.0919 0.0846 0.231 CD8_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 999139 sc-eQTL 3.50e-01 -0.0775 0.0828 0.231 CD8_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 868602 sc-eQTL 8.19e-01 0.0229 0.0996 0.231 CD8_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 639164 sc-eQTL 2.79e-01 0.0815 0.0751 0.231 CD8_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -162721 sc-eQTL 6.57e-01 0.0305 0.0685 0.231 CD8_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 336782 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0672 0.1 0.231 CD8_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 251320 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0865 0.103 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 999059 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0511 0.103 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 999139 sc-eQTL 3.00e-01 0.0943 0.0907 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 868602 sc-eQTL 4.53e-01 0.0774 0.103 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 639164 sc-eQTL 3.96e-01 -0.076 0.0893 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -162721 sc-eQTL 3.98e-01 0.0734 0.0866 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 336782 sc-eQTL 8.21e-01 0.0239 0.105 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 251320 sc-eQTL 4.67e-01 0.0718 0.0984 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 999059 sc-eQTL 2.77e-02 0.225 0.102 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 999139 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000754 0.0995 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 868602 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000126 0.101 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 639164 sc-eQTL 7.47e-03 0.253 0.0936 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -162721 sc-eQTL 9.18e-01 0.0103 0.1 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 336782 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0189 0.102 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 251320 sc-eQTL 7.27e-01 0.0318 0.0911 0.234 MAIT L2
ENSG00000116133 DHCR24 165448 sc-eQTL 4.50e-02 -0.135 0.0668 0.234 MAIT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 999059 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0645 0.0948 0.234 MAIT L2
ENSG00000116209 TMEM59 999139 sc-eQTL 8.43e-01 -0.017 0.0857 0.234 MAIT L2
ENSG00000116221 MRPL37 868602 sc-eQTL 4.44e-01 0.0799 0.104 0.234 MAIT L2
ENSG00000157216 SSBP3 639164 sc-eQTL 2.25e-04 0.336 0.0893 0.234 MAIT L2
ENSG00000162402 USP24 -162721 sc-eQTL 6.42e-01 0.0381 0.082 0.234 MAIT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 852607 sc-eQTL 2.41e-01 -0.112 0.095 0.234 MAIT L2
ENSG00000243725 TTC4 336782 sc-eQTL 2.62e-01 -0.106 0.0945 0.234 MAIT L2
ENSG00000006555 TTC22 251320 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0783 0.103 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000116133 DHCR24 165448 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0429 0.0912 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000116205 TCEANC2 999059 sc-eQTL 3.39e-01 -0.0922 0.0962 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000116209 TMEM59 999139 sc-eQTL 2.78e-01 0.102 0.0937 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000116221 MRPL37 868602 sc-eQTL 5.42e-01 0.0641 0.105 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000157216 SSBP3 639164 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0231 0.0791 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000162398 LEXM 246580 sc-eQTL 1.81e-01 0.125 0.0931 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000162402 USP24 -162721 sc-eQTL 6.70e-01 0.0343 0.0804 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000243725 TTC4 336782 sc-eQTL 1.38e-01 0.15 0.101 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000006555 TTC22 251320 sc-eQTL 7.11e-01 0.0319 0.086 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000116133 DHCR24 165448 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0147 0.0897 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000116205 TCEANC2 999059 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0777 0.097 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000116209 TMEM59 999139 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0294 0.072 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000116221 MRPL37 868602 sc-eQTL 3.65e-01 -0.085 0.0935 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000157216 SSBP3 639164 sc-eQTL 6.87e-01 0.0309 0.0767 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000162398 LEXM 246580 sc-eQTL 5.62e-02 0.168 0.0875 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000162402 USP24 -162721 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0293 0.056 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000243725 TTC4 336782 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0343 0.096 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000006555 TTC22 251320 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0226 0.104 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000116133 DHCR24 165448 sc-eQTL 2.73e-01 -0.111 0.101 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000116205 TCEANC2 999059 sc-eQTL 5.07e-01 0.0646 0.0973 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000116209 TMEM59 999139 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0432 0.0967 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000116221 MRPL37 868602 sc-eQTL 4.20e-01 0.086 0.106 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000157216 SSBP3 639164 sc-eQTL 2.86e-01 0.0928 0.0868 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000162398 LEXM 246580 sc-eQTL 1.68e-01 0.135 0.0977 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000162402 USP24 -162721 sc-eQTL 1.05e-01 0.117 0.0715 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000243725 TTC4 336782 sc-eQTL 6.42e-01 -0.05 0.107 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000006555 TTC22 251320 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0666 0.0919 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000116133 DHCR24 165448 sc-eQTL 3.31e-01 -0.0905 0.0929 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000116205 TCEANC2 999059 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0605 0.0923 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000116209 TMEM59 999139 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0502 0.0751 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000116221 MRPL37 868602 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00149 0.0926 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000157216 SSBP3 639164 sc-eQTL 4.00e-01 0.0653 0.0775 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000162398 LEXM 246580 sc-eQTL 3.89e-01 0.0836 0.0969 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000162402 USP24 -162721 sc-eQTL 7.20e-01 0.0238 0.0661 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000243725 TTC4 336782 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000387 0.0981 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000006555 TTC22 251320 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0532 0.12 0.226 PB L2
ENSG00000116133 DHCR24 165448 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0101 0.107 0.226 PB L2
ENSG00000116205 TCEANC2 999059 sc-eQTL 3.33e-01 0.126 0.129 0.226 PB L2
ENSG00000116209 TMEM59 999139 sc-eQTL 6.65e-01 0.0235 0.0542 0.226 PB L2
ENSG00000116221 MRPL37 868602 sc-eQTL 6.51e-01 0.0447 0.0985 0.226 PB L2
ENSG00000157216 SSBP3 639164 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0837 0.114 0.226 PB L2
ENSG00000162402 USP24 -162721 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0645 0.129 0.226 PB L2
ENSG00000215883 CYB5RL 852607 sc-eQTL 9.00e-01 0.0169 0.134 0.226 PB L2
ENSG00000243725 TTC4 336782 sc-eQTL 1.60e-02 0.299 0.122 0.226 PB L2
ENSG00000006555 TTC22 251320 sc-eQTL 4.60e-01 0.0688 0.0928 0.233 Pro_T L2
ENSG00000116133 DHCR24 165448 sc-eQTL 2.33e-01 0.0941 0.0787 0.233 Pro_T L2
ENSG00000116205 TCEANC2 999059 sc-eQTL 4.41e-01 0.0743 0.0963 0.233 Pro_T L2
ENSG00000116209 TMEM59 999139 sc-eQTL 2.75e-01 0.073 0.0667 0.233 Pro_T L2
ENSG00000116221 MRPL37 868602 sc-eQTL 6.22e-01 0.0323 0.0655 0.233 Pro_T L2
ENSG00000157216 SSBP3 639164 sc-eQTL 5.12e-01 0.0482 0.0734 0.233 Pro_T L2
ENSG00000162402 USP24 -162721 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0136 0.0896 0.233 Pro_T L2
ENSG00000215883 CYB5RL 852607 sc-eQTL 4.16e-01 0.072 0.0883 0.233 Pro_T L2
ENSG00000243725 TTC4 336782 sc-eQTL 6.68e-01 0.0422 0.0984 0.233 Pro_T L2
ENSG00000006555 TTC22 251320 sc-eQTL 6.09e-01 0.0471 0.0919 0.231 Treg L2
ENSG00000116205 TCEANC2 999059 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0238 0.0985 0.231 Treg L2
ENSG00000116209 TMEM59 999139 sc-eQTL 8.41e-01 0.0156 0.0779 0.231 Treg L2
ENSG00000116221 MRPL37 868602 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0795 0.0962 0.231 Treg L2
ENSG00000157216 SSBP3 639164 sc-eQTL 1.88e-01 0.113 0.0856 0.231 Treg L2
ENSG00000162402 USP24 -162721 sc-eQTL 2.14e-01 -0.102 0.0816 0.231 Treg L2
ENSG00000243725 TTC4 336782 sc-eQTL 9.48e-01 0.00676 0.103 0.231 Treg L2
ENSG00000116133 DHCR24 165448 sc-eQTL 8.74e-01 0.0135 0.0851 0.234 cDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 999059 sc-eQTL 2.51e-01 -0.115 0.1 0.234 cDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 999139 sc-eQTL 4.72e-02 -0.169 0.0844 0.234 cDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 868602 sc-eQTL 9.20e-01 -0.011 0.109 0.234 cDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 639164 sc-eQTL 9.74e-01 0.00325 0.101 0.234 cDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 510386 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0168 0.0935 0.234 cDC L2
ENSG00000162402 USP24 -162721 sc-eQTL 5.98e-01 0.0553 0.105 0.234 cDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 852607 sc-eQTL 6.10e-03 0.245 0.0882 0.234 cDC L2
ENSG00000243725 TTC4 336782 sc-eQTL 1.22e-01 -0.166 0.107 0.234 cDC L2
ENSG00000116133 DHCR24 165448 sc-eQTL 9.20e-01 -0.006 0.0596 0.231 cMono_IL1B L2
ENSG00000116205 TCEANC2 999059 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0671 0.0826 0.231 cMono_IL1B L2
ENSG00000116209 TMEM59 999139 sc-eQTL 7.73e-01 0.0145 0.0502 0.231 cMono_IL1B L2
ENSG00000116221 MRPL37 868602 sc-eQTL 5.86e-01 0.0487 0.0894 0.231 cMono_IL1B L2
ENSG00000157216 SSBP3 639164 sc-eQTL 8.90e-01 0.0127 0.0913 0.231 cMono_IL1B L2
ENSG00000162402 USP24 -162721 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0335 0.0674 0.231 cMono_IL1B L2
ENSG00000243725 TTC4 336782 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0367 0.103 0.231 cMono_IL1B L2
ENSG00000116133 DHCR24 165448 sc-eQTL 5.90e-02 -0.105 0.0553 0.231 cMono_S100A L2
ENSG00000116205 TCEANC2 999059 sc-eQTL 1.33e-01 0.128 0.0847 0.231 cMono_S100A L2
ENSG00000116209 TMEM59 999139 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0358 0.0681 0.231 cMono_S100A L2
ENSG00000116221 MRPL37 868602 sc-eQTL 8.08e-01 0.0239 0.0985 0.231 cMono_S100A L2
ENSG00000157216 SSBP3 639164 sc-eQTL 1.19e-02 0.255 0.101 0.231 cMono_S100A L2
ENSG00000162402 USP24 -162721 sc-eQTL 9.98e-01 0.000156 0.0827 0.231 cMono_S100A L2
ENSG00000243725 TTC4 336782 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0748 0.103 0.231 cMono_S100A L2
ENSG00000006555 TTC22 251320 sc-eQTL 8.44e-02 -0.157 0.0905 0.239 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 165448 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0867 0.102 0.239 gdT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 999059 sc-eQTL 3.48e-01 0.0961 0.102 0.239 gdT L2
ENSG00000116209 TMEM59 999139 sc-eQTL 4.12e-01 0.0853 0.104 0.239 gdT L2
ENSG00000116221 MRPL37 868602 sc-eQTL 7.89e-01 -0.032 0.119 0.239 gdT L2
ENSG00000157216 SSBP3 639164 sc-eQTL 9.80e-01 0.0018 0.0729 0.239 gdT L2
ENSG00000162402 USP24 -162721 sc-eQTL 3.64e-01 0.089 0.0977 0.239 gdT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 852607 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0839 0.102 0.239 gdT L2
ENSG00000243725 TTC4 336782 sc-eQTL 8.07e-02 -0.2 0.114 0.239 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 165448 sc-eQTL 5.51e-01 0.0452 0.0757 0.233 intMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 999059 sc-eQTL 8.49e-01 -0.018 0.0944 0.233 intMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 999139 sc-eQTL 3.05e-01 -0.0711 0.0692 0.233 intMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 868602 sc-eQTL 3.45e-01 0.1 0.106 0.233 intMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 639164 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0586 0.108 0.233 intMono L2
ENSG00000162402 USP24 -162721 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0839 0.0964 0.233 intMono L2
ENSG00000243725 TTC4 336782 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0563 0.103 0.233 intMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 165448 sc-eQTL 2.00e-01 0.0964 0.0749 0.231 ncMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 999059 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0285 0.0941 0.231 ncMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 999139 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0444 0.0752 0.231 ncMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 868602 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0406 0.0971 0.231 ncMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 639164 sc-eQTL 2.21e-02 0.242 0.105 0.231 ncMono L2
ENSG00000162402 USP24 -162721 sc-eQTL 5.50e-02 -0.162 0.0841 0.231 ncMono L2
ENSG00000243725 TTC4 336782 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00592 0.1 0.231 ncMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 165448 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0591 0.0944 0.226 pDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 999059 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0528 0.113 0.226 pDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 999139 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0791 0.0903 0.226 pDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 868602 sc-eQTL 6.04e-02 0.225 0.119 0.226 pDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 639164 sc-eQTL 5.80e-01 0.0592 0.107 0.226 pDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 510386 sc-eQTL 5.61e-02 -0.0854 0.0444 0.226 pDC L2
ENSG00000162402 USP24 -162721 sc-eQTL 3.70e-02 0.157 0.0748 0.226 pDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 852607 sc-eQTL 6.38e-01 0.0489 0.104 0.226 pDC L2
ENSG00000243725 TTC4 336782 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0626 0.12 0.226 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 251320 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0461 0.0974 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 165448 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0217 0.0978 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 999059 sc-eQTL 3.08e-02 -0.203 0.0935 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 999139 sc-eQTL 9.62e-01 0.00355 0.0736 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 868602 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0369 0.0881 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 639164 sc-eQTL 4.13e-01 0.0628 0.0765 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -162721 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0499 0.0698 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 852607 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0472 0.107 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 336782 sc-eQTL 2.28e-01 -0.116 0.0961 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 251320 sc-eQTL 9.85e-01 0.00188 0.103 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 165448 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0284 0.093 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 999059 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0189 0.084 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 999139 sc-eQTL 1.80e-01 0.08 0.0595 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 868602 sc-eQTL 1.01e-01 -0.14 0.0853 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 639164 sc-eQTL 4.87e-01 0.0534 0.0767 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -162721 sc-eQTL 6.30e-01 0.0318 0.0658 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 852607 sc-eQTL 1.80e-01 -0.14 0.104 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 336782 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00363 0.0981 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 165448 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0199 0.0573 0.231 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 999059 sc-eQTL 7.10e-01 0.0267 0.0718 0.231 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 999139 sc-eQTL 8.95e-01 -0.00655 0.0495 0.231 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 868602 sc-eQTL 6.46e-01 0.0403 0.0876 0.231 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 639164 sc-eQTL 4.06e-01 0.0763 0.0916 0.231 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -162721 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0145 0.0627 0.231 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 336782 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0912 0.104 0.231 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 165448 sc-eQTL 2.92e-01 0.0744 0.0705 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 999059 sc-eQTL 8.13e-01 0.022 0.0929 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 999139 sc-eQTL 2.73e-01 -0.0756 0.0689 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 868602 sc-eQTL 7.84e-01 0.0259 0.0946 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 639164 sc-eQTL 2.85e-01 0.108 0.101 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -162721 sc-eQTL 6.59e-02 -0.146 0.0789 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 336782 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0503 0.0997 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 251320 sc-eQTL 8.02e-01 -0.021 0.0837 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 165448 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0771 0.0873 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 999059 sc-eQTL 2.53e-01 -0.0979 0.0855 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 999139 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00631 0.0663 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 868602 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0627 0.0888 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 639164 sc-eQTL 3.85e-01 0.0634 0.0728 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162398 LEXM 246580 sc-eQTL 5.65e-02 0.156 0.0815 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -162721 sc-eQTL 9.51e-01 0.00318 0.0521 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 336782 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0242 0.0928 0.231 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000169174 PCSK9 13095 pQTL 3.92e-07 -0.157 0.0308 0.00357 0.00399 0.246
ENSG00000169174 PCSK9 13095 eQTL 1.48e-06 -0.092 0.019 0.00596 0.00956 0.236

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000116205 \N 999059 2.61e-07 1.11e-07 3.62e-08 1.78e-07 8.92e-08 9.57e-08 1.38e-07 5.49e-08 1.41e-07 4.38e-08 1.6e-07 7.88e-08 1.3e-07 6.21e-08 5.4e-08 7.89e-08 3.88e-08 1.14e-07 5.19e-08 4.2e-08 1.04e-07 1.28e-07 1.26e-07 4.53e-08 1.31e-07 1.19e-07 1.12e-07 8.71e-08 1.03e-07 1.1e-07 9.73e-08 4.03e-08 3.26e-08 8.68e-08 9.07e-08 3.87e-08 5.05e-08 9.6e-08 7.63e-08 3.01e-08 4.44e-08 1.35e-07 4.14e-08 1.38e-08 7.79e-08 1.69e-08 1.24e-07 4.09e-09 5.04e-08
ENSG00000169174 PCSK9 13095 5.29e-05 4.88e-05 8.23e-06 2.03e-05 8.85e-06 2.01e-05 5.94e-05 7.48e-06 5.13e-05 2.61e-05 6.48e-05 2.57e-05 8.11e-05 2.01e-05 1.03e-05 3.15e-05 2.56e-05 3.71e-05 1.21e-05 1.03e-05 2.63e-05 5.47e-05 4.11e-05 1.32e-05 6.71e-05 1.42e-05 2.29e-05 2.1e-05 4.62e-05 3.25e-05 3.22e-05 2.67e-06 4.74e-06 8.99e-06 1.62e-05 8e-06 4.75e-06 5.03e-06 7.16e-06 4.25e-06 2.03e-06 5.34e-05 4.94e-06 5.78e-07 4.14e-06 6.48e-06 6.45e-06 2.96e-06 1.86e-06