Genes within 1Mb (chr1:55051628:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 250305 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0831 0.124 0.124 B L1
ENSG00000116133 DHCR24 164433 sc-eQTL 1.41e-01 -0.172 0.116 0.124 B L1
ENSG00000116205 TCEANC2 998044 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0168 0.101 0.124 B L1
ENSG00000116209 TMEM59 998124 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0123 0.0615 0.124 B L1
ENSG00000116221 MRPL37 867587 sc-eQTL 2.79e-01 0.0871 0.0803 0.124 B L1
ENSG00000157216 SSBP3 638149 sc-eQTL 2.03e-01 -0.107 0.084 0.124 B L1
ENSG00000162402 USP24 -163736 sc-eQTL 2.80e-02 -0.156 0.0706 0.124 B L1
ENSG00000215883 CYB5RL 851592 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0183 0.137 0.124 B L1
ENSG00000243725 TTC4 335767 sc-eQTL 8.94e-01 -0.016 0.12 0.124 B L1
ENSG00000006555 TTC22 250305 sc-eQTL 3.65e-01 0.0883 0.0974 0.124 CD4T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 998044 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0118 0.0798 0.124 CD4T L1
ENSG00000116209 TMEM59 998124 sc-eQTL 9.99e-01 8.65e-05 0.0744 0.124 CD4T L1
ENSG00000116221 MRPL37 867587 sc-eQTL 7.78e-01 0.029 0.103 0.124 CD4T L1
ENSG00000157216 SSBP3 638149 sc-eQTL 5.21e-01 0.0548 0.0852 0.124 CD4T L1
ENSG00000162402 USP24 -163736 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0329 0.0695 0.124 CD4T L1
ENSG00000243725 TTC4 335767 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0652 0.105 0.124 CD4T L1
ENSG00000006555 TTC22 250305 sc-eQTL 9.28e-01 0.0076 0.0842 0.124 CD8T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 998044 sc-eQTL 1.19e-01 -0.164 0.104 0.124 CD8T L1
ENSG00000116209 TMEM59 998124 sc-eQTL 7.27e-01 0.0254 0.0728 0.124 CD8T L1
ENSG00000116221 MRPL37 867587 sc-eQTL 1.17e-01 0.157 0.0997 0.124 CD8T L1
ENSG00000157216 SSBP3 638149 sc-eQTL 5.67e-02 0.137 0.0714 0.124 CD8T L1
ENSG00000162402 USP24 -163736 sc-eQTL 6.64e-02 -0.128 0.0691 0.124 CD8T L1
ENSG00000243725 TTC4 335767 sc-eQTL 6.33e-01 0.0578 0.121 0.124 CD8T L1
ENSG00000116133 DHCR24 164433 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0452 0.111 0.126 DC L1
ENSG00000116205 TCEANC2 998044 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00219 0.125 0.126 DC L1
ENSG00000116209 TMEM59 998124 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00777 0.098 0.126 DC L1
ENSG00000116221 MRPL37 867587 sc-eQTL 7.92e-01 0.0348 0.132 0.126 DC L1
ENSG00000157216 SSBP3 638149 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0287 0.117 0.126 DC L1
ENSG00000162390 ACOT11 509371 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0477 0.113 0.126 DC L1
ENSG00000162402 USP24 -163736 sc-eQTL 4.73e-02 0.135 0.0674 0.126 DC L1
ENSG00000215883 CYB5RL 851592 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0318 0.123 0.126 DC L1
ENSG00000243725 TTC4 335767 sc-eQTL 2.85e-01 -0.142 0.132 0.126 DC L1
ENSG00000116133 DHCR24 164433 sc-eQTL 8.86e-01 0.0115 0.0805 0.124 Mono L1
ENSG00000116205 TCEANC2 998044 sc-eQTL 4.83e-01 0.061 0.0868 0.124 Mono L1
ENSG00000116209 TMEM59 998124 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0302 0.0645 0.124 Mono L1
ENSG00000116221 MRPL37 867587 sc-eQTL 4.63e-01 0.0792 0.108 0.124 Mono L1
ENSG00000157216 SSBP3 638149 sc-eQTL 6.52e-01 0.0557 0.124 0.124 Mono L1
ENSG00000162402 USP24 -163736 sc-eQTL 3.29e-02 -0.157 0.0729 0.124 Mono L1
ENSG00000243725 TTC4 335767 sc-eQTL 1.75e-01 -0.176 0.129 0.124 Mono L1
ENSG00000006555 TTC22 250305 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0896 0.111 0.124 NK L1
ENSG00000116133 DHCR24 164433 sc-eQTL 3.59e-01 -0.103 0.112 0.124 NK L1
ENSG00000116205 TCEANC2 998044 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0282 0.111 0.124 NK L1
ENSG00000116209 TMEM59 998124 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0129 0.0867 0.124 NK L1
ENSG00000116221 MRPL37 867587 sc-eQTL 1.51e-01 -0.155 0.107 0.124 NK L1
ENSG00000157216 SSBP3 638149 sc-eQTL 3.40e-01 0.0891 0.0933 0.124 NK L1
ENSG00000162398 LEXM 245565 sc-eQTL 5.07e-01 0.0697 0.105 0.124 NK L1
ENSG00000162402 USP24 -163736 sc-eQTL 8.42e-01 0.0127 0.0636 0.124 NK L1
ENSG00000243725 TTC4 335767 sc-eQTL 2.79e-01 -0.13 0.12 0.124 NK L1
ENSG00000006555 TTC22 250305 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0147 0.0996 0.124 Other_T L1
ENSG00000116133 DHCR24 164433 sc-eQTL 7.06e-01 0.0292 0.0773 0.124 Other_T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 998044 sc-eQTL 1.70e-01 -0.159 0.115 0.124 Other_T L1
ENSG00000116209 TMEM59 998124 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0224 0.0794 0.124 Other_T L1
ENSG00000116221 MRPL37 867587 sc-eQTL 8.71e-02 0.127 0.0738 0.124 Other_T L1
ENSG00000157216 SSBP3 638149 sc-eQTL 2.15e-04 0.314 0.0833 0.124 Other_T L1
ENSG00000162402 USP24 -163736 sc-eQTL 1.07e-01 0.147 0.091 0.124 Other_T L1
ENSG00000215883 CYB5RL 851592 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0754 0.125 0.124 Other_T L1
ENSG00000243725 TTC4 335767 sc-eQTL 3.62e-03 -0.36 0.122 0.124 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 250305 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0524 0.102 0.128 B_Activated L2
ENSG00000116133 DHCR24 164433 sc-eQTL 1.13e-01 -0.19 0.119 0.128 B_Activated L2
ENSG00000116205 TCEANC2 998044 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0166 0.129 0.128 B_Activated L2
ENSG00000116209 TMEM59 998124 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0637 0.137 0.128 B_Activated L2
ENSG00000116221 MRPL37 867587 sc-eQTL 6.42e-01 0.069 0.148 0.128 B_Activated L2
ENSG00000157216 SSBP3 638149 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000956 0.134 0.128 B_Activated L2
ENSG00000162402 USP24 -163736 sc-eQTL 2.93e-02 -0.284 0.129 0.128 B_Activated L2
ENSG00000215883 CYB5RL 851592 sc-eQTL 2.37e-01 -0.137 0.115 0.128 B_Activated L2
ENSG00000243725 TTC4 335767 sc-eQTL 3.34e-01 0.121 0.125 0.128 B_Activated L2
ENSG00000006555 TTC22 250305 sc-eQTL 5.87e-01 -0.073 0.134 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000116133 DHCR24 164433 sc-eQTL 4.98e-01 0.0844 0.124 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000116205 TCEANC2 998044 sc-eQTL 8.08e-01 0.0301 0.124 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000116209 TMEM59 998124 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0934 0.106 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000116221 MRPL37 867587 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0193 0.125 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000157216 SSBP3 638149 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0846 0.116 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000162402 USP24 -163736 sc-eQTL 1.26e-01 -0.15 0.0976 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000215883 CYB5RL 851592 sc-eQTL 3.20e-01 0.138 0.139 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000243725 TTC4 335767 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00226 0.126 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000006555 TTC22 250305 sc-eQTL 7.55e-01 0.0397 0.127 0.125 B_Memory L2
ENSG00000116133 DHCR24 164433 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0785 0.126 0.125 B_Memory L2
ENSG00000116205 TCEANC2 998044 sc-eQTL 4.03e-01 0.113 0.135 0.125 B_Memory L2
ENSG00000116209 TMEM59 998124 sc-eQTL 2.29e-01 -0.135 0.112 0.125 B_Memory L2
ENSG00000116221 MRPL37 867587 sc-eQTL 2.20e-01 0.14 0.114 0.125 B_Memory L2
ENSG00000157216 SSBP3 638149 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00121 0.106 0.125 B_Memory L2
ENSG00000162402 USP24 -163736 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0412 0.104 0.125 B_Memory L2
ENSG00000215883 CYB5RL 851592 sc-eQTL 2.55e-01 -0.146 0.128 0.125 B_Memory L2
ENSG00000243725 TTC4 335767 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0558 0.133 0.125 B_Memory L2
ENSG00000006555 TTC22 250305 sc-eQTL 2.95e-01 -0.138 0.132 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000116133 DHCR24 164433 sc-eQTL 1.40e-01 -0.183 0.123 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 998044 sc-eQTL 4.53e-01 0.0831 0.11 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000116209 TMEM59 998124 sc-eQTL 9.30e-01 0.0071 0.0803 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000116221 MRPL37 867587 sc-eQTL 6.59e-01 0.0523 0.118 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000157216 SSBP3 638149 sc-eQTL 9.25e-01 0.0106 0.113 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000162402 USP24 -163736 sc-eQTL 6.93e-01 0.0351 0.0888 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 851592 sc-eQTL 5.68e-01 0.0766 0.134 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000243725 TTC4 335767 sc-eQTL 9.82e-01 0.00268 0.121 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000006555 TTC22 250305 sc-eQTL 8.89e-01 0.0186 0.134 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000116133 DHCR24 164433 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0684 0.116 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 998044 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0495 0.129 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000116209 TMEM59 998124 sc-eQTL 3.39e-02 0.225 0.105 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000116221 MRPL37 867587 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0494 0.125 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000157216 SSBP3 638149 sc-eQTL 8.86e-01 0.0176 0.123 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000162402 USP24 -163736 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0699 0.0976 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 851592 sc-eQTL 1.05e-01 -0.223 0.137 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000243725 TTC4 335767 sc-eQTL 3.23e-01 -0.141 0.143 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000006555 TTC22 250305 sc-eQTL 1.24e-02 0.31 0.123 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 998044 sc-eQTL 8.23e-01 0.0288 0.128 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 998124 sc-eQTL 9.00e-01 0.0147 0.117 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 867587 sc-eQTL 7.77e-01 0.0407 0.144 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 638149 sc-eQTL 6.08e-01 0.0453 0.0883 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -163736 sc-eQTL 4.85e-01 0.0847 0.121 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 335767 sc-eQTL 9.69e-01 0.00526 0.136 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 250305 sc-eQTL 7.45e-01 0.037 0.114 0.124 CD4_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 998044 sc-eQTL 8.89e-01 0.0121 0.0866 0.124 CD4_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 998124 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0224 0.0842 0.124 CD4_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 867587 sc-eQTL 6.74e-01 0.0458 0.108 0.124 CD4_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 638149 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00579 0.0866 0.124 CD4_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -163736 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0472 0.0747 0.124 CD4_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 335767 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0623 0.114 0.124 CD4_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 250305 sc-eQTL 6.17e-01 0.0602 0.12 0.124 CD4_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 998044 sc-eQTL 6.35e-01 0.0556 0.117 0.124 CD4_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 998124 sc-eQTL 5.14e-01 0.0578 0.0883 0.124 CD4_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 867587 sc-eQTL 5.87e-01 0.0605 0.111 0.124 CD4_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 638149 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0147 0.109 0.124 CD4_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -163736 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0508 0.0903 0.124 CD4_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 335767 sc-eQTL 3.04e-01 -0.134 0.13 0.124 CD4_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 250305 sc-eQTL 2.12e-01 0.172 0.137 0.124 CD4_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 998044 sc-eQTL 5.99e-01 0.0688 0.131 0.124 CD4_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 998124 sc-eQTL 8.13e-01 0.024 0.101 0.124 CD4_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 867587 sc-eQTL 2.38e-01 0.154 0.13 0.124 CD4_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 638149 sc-eQTL 2.15e-01 0.138 0.111 0.124 CD4_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -163736 sc-eQTL 6.21e-01 0.0503 0.102 0.124 CD4_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 335767 sc-eQTL 8.59e-01 0.0239 0.134 0.124 CD4_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 250305 sc-eQTL 3.14e-01 0.111 0.11 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 998044 sc-eQTL 2.88e-01 -0.13 0.122 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 998124 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00735 0.106 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 867587 sc-eQTL 6.11e-01 0.0642 0.126 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 638149 sc-eQTL 1.53e-01 0.123 0.0858 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -163736 sc-eQTL 9.83e-02 -0.141 0.0852 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 335767 sc-eQTL 1.41e-01 0.188 0.128 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 250305 sc-eQTL 2.45e-01 -0.143 0.122 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 998044 sc-eQTL 5.33e-02 -0.214 0.11 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 998124 sc-eQTL 8.96e-01 0.0142 0.109 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 867587 sc-eQTL 2.60e-01 0.147 0.13 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 638149 sc-eQTL 1.02e-01 0.161 0.0981 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -163736 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0623 0.0897 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 335767 sc-eQTL 9.99e-01 0.00024 0.131 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 250305 sc-eQTL 3.11e-01 -0.138 0.136 0.12 CD8_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 998044 sc-eQTL 1.92e-02 -0.319 0.135 0.12 CD8_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 998124 sc-eQTL 4.38e-01 0.0936 0.12 0.12 CD8_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 867587 sc-eQTL 4.02e-01 0.115 0.136 0.12 CD8_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 638149 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0289 0.119 0.12 CD8_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -163736 sc-eQTL 2.92e-01 -0.121 0.115 0.12 CD8_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 335767 sc-eQTL 1.56e-01 -0.198 0.139 0.12 CD8_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 250305 sc-eQTL 8.68e-01 0.0217 0.131 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 998044 sc-eQTL 2.11e-01 0.17 0.136 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 998124 sc-eQTL 9.96e-01 0.000693 0.132 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 867587 sc-eQTL 3.92e-01 -0.115 0.134 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 638149 sc-eQTL 2.18e-03 0.384 0.124 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -163736 sc-eQTL 5.70e-01 0.0759 0.133 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 335767 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0664 0.135 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 250305 sc-eQTL 9.47e-01 0.0079 0.119 0.126 MAIT L2
ENSG00000116133 DHCR24 164433 sc-eQTL 5.58e-01 0.0518 0.0883 0.126 MAIT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 998044 sc-eQTL 9.14e-02 -0.21 0.124 0.126 MAIT L2
ENSG00000116209 TMEM59 998124 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0201 0.112 0.126 MAIT L2
ENSG00000116221 MRPL37 867587 sc-eQTL 1.27e-01 0.208 0.136 0.126 MAIT L2
ENSG00000157216 SSBP3 638149 sc-eQTL 2.97e-03 0.356 0.119 0.126 MAIT L2
ENSG00000162402 USP24 -163736 sc-eQTL 8.81e-01 0.0161 0.108 0.126 MAIT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 851592 sc-eQTL 3.49e-01 -0.117 0.125 0.126 MAIT L2
ENSG00000243725 TTC4 335767 sc-eQTL 9.43e-03 -0.32 0.122 0.126 MAIT L2
ENSG00000006555 TTC22 250305 sc-eQTL 6.50e-01 0.0616 0.136 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000116133 DHCR24 164433 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0143 0.12 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000116205 TCEANC2 998044 sc-eQTL 5.07e-01 0.0841 0.127 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000116209 TMEM59 998124 sc-eQTL 1.49e-01 0.178 0.123 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000116221 MRPL37 867587 sc-eQTL 2.10e-01 0.173 0.138 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000157216 SSBP3 638149 sc-eQTL 4.84e-01 0.0729 0.104 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000162398 LEXM 245565 sc-eQTL 2.28e-01 0.148 0.122 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000162402 USP24 -163736 sc-eQTL 9.52e-01 0.00633 0.106 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000243725 TTC4 335767 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0141 0.133 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000006555 TTC22 250305 sc-eQTL 9.61e-01 0.00558 0.113 0.125 NK_CD56dim L2
ENSG00000116133 DHCR24 164433 sc-eQTL 5.56e-01 0.0695 0.118 0.125 NK_CD56dim L2
ENSG00000116205 TCEANC2 998044 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0288 0.128 0.125 NK_CD56dim L2
ENSG00000116209 TMEM59 998124 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0349 0.0947 0.125 NK_CD56dim L2
ENSG00000116221 MRPL37 867587 sc-eQTL 6.24e-02 -0.229 0.122 0.125 NK_CD56dim L2
ENSG00000157216 SSBP3 638149 sc-eQTL 2.44e-01 0.117 0.101 0.125 NK_CD56dim L2
ENSG00000162398 LEXM 245565 sc-eQTL 7.52e-01 0.0366 0.116 0.125 NK_CD56dim L2
ENSG00000162402 USP24 -163736 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0495 0.0736 0.125 NK_CD56dim L2
ENSG00000243725 TTC4 335767 sc-eQTL 1.01e-01 -0.207 0.125 0.125 NK_CD56dim L2
ENSG00000006555 TTC22 250305 sc-eQTL 6.58e-01 0.061 0.138 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000116133 DHCR24 164433 sc-eQTL 3.35e-01 -0.13 0.134 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000116205 TCEANC2 998044 sc-eQTL 4.24e-01 0.104 0.129 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000116209 TMEM59 998124 sc-eQTL 7.18e-01 0.0466 0.129 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000116221 MRPL37 867587 sc-eQTL 2.44e-01 -0.165 0.141 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000157216 SSBP3 638149 sc-eQTL 3.65e-01 0.105 0.116 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000162398 LEXM 245565 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0438 0.131 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000162402 USP24 -163736 sc-eQTL 8.32e-01 0.0204 0.0958 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000243725 TTC4 335767 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0481 0.143 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000006555 TTC22 250305 sc-eQTL 2.09e-01 -0.15 0.119 0.125 NK_cytokine L2
ENSG00000116133 DHCR24 164433 sc-eQTL 2.98e-01 -0.125 0.12 0.125 NK_cytokine L2
ENSG00000116205 TCEANC2 998044 sc-eQTL 1.98e-01 -0.154 0.119 0.125 NK_cytokine L2
ENSG00000116209 TMEM59 998124 sc-eQTL 1.63e-01 -0.136 0.0968 0.125 NK_cytokine L2
ENSG00000116221 MRPL37 867587 sc-eQTL 5.60e-01 -0.07 0.12 0.125 NK_cytokine L2
ENSG00000157216 SSBP3 638149 sc-eQTL 2.01e-01 0.129 0.1 0.125 NK_cytokine L2
ENSG00000162398 LEXM 245565 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0636 0.126 0.125 NK_cytokine L2
ENSG00000162402 USP24 -163736 sc-eQTL 9.63e-01 0.00403 0.0857 0.125 NK_cytokine L2
ENSG00000243725 TTC4 335767 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0974 0.127 0.125 NK_cytokine L2
ENSG00000006555 TTC22 250305 sc-eQTL 3.58e-01 0.139 0.15 0.133 PB L2
ENSG00000116133 DHCR24 164433 sc-eQTL 3.94e-01 0.114 0.133 0.133 PB L2
ENSG00000116205 TCEANC2 998044 sc-eQTL 9.55e-01 0.00926 0.163 0.133 PB L2
ENSG00000116209 TMEM59 998124 sc-eQTL 5.28e-01 0.043 0.068 0.133 PB L2
ENSG00000116221 MRPL37 867587 sc-eQTL 9.34e-01 -0.0102 0.124 0.133 PB L2
ENSG00000157216 SSBP3 638149 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0203 0.143 0.133 PB L2
ENSG00000162402 USP24 -163736 sc-eQTL 4.47e-01 -0.124 0.162 0.133 PB L2
ENSG00000215883 CYB5RL 851592 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0722 0.168 0.133 PB L2
ENSG00000243725 TTC4 335767 sc-eQTL 3.98e-02 0.321 0.154 0.133 PB L2
ENSG00000006555 TTC22 250305 sc-eQTL 3.17e-01 0.123 0.122 0.126 Pro_T L2
ENSG00000116133 DHCR24 164433 sc-eQTL 4.83e-01 0.0732 0.104 0.126 Pro_T L2
ENSG00000116205 TCEANC2 998044 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0406 0.127 0.126 Pro_T L2
ENSG00000116209 TMEM59 998124 sc-eQTL 6.46e-01 0.0406 0.0883 0.126 Pro_T L2
ENSG00000116221 MRPL37 867587 sc-eQTL 9.64e-01 0.00388 0.0865 0.126 Pro_T L2
ENSG00000157216 SSBP3 638149 sc-eQTL 9.27e-02 0.163 0.0964 0.126 Pro_T L2
ENSG00000162402 USP24 -163736 sc-eQTL 7.19e-02 0.212 0.117 0.126 Pro_T L2
ENSG00000215883 CYB5RL 851592 sc-eQTL 7.70e-03 0.309 0.115 0.126 Pro_T L2
ENSG00000243725 TTC4 335767 sc-eQTL 1.70e-01 -0.178 0.129 0.126 Pro_T L2
ENSG00000006555 TTC22 250305 sc-eQTL 7.86e-01 0.0332 0.122 0.124 Treg L2
ENSG00000116205 TCEANC2 998044 sc-eQTL 3.46e-01 -0.124 0.131 0.124 Treg L2
ENSG00000116209 TMEM59 998124 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0621 0.103 0.124 Treg L2
ENSG00000116221 MRPL37 867587 sc-eQTL 7.93e-01 0.0336 0.128 0.124 Treg L2
ENSG00000157216 SSBP3 638149 sc-eQTL 1.04e-01 0.186 0.114 0.124 Treg L2
ENSG00000162402 USP24 -163736 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0306 0.109 0.124 Treg L2
ENSG00000243725 TTC4 335767 sc-eQTL 4.68e-01 0.0995 0.137 0.124 Treg L2
ENSG00000116133 DHCR24 164433 sc-eQTL 3.35e-01 -0.105 0.108 0.129 cDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 998044 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0936 0.128 0.129 cDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 998124 sc-eQTL 3.72e-01 -0.0971 0.108 0.129 cDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 867587 sc-eQTL 1.67e-01 -0.192 0.138 0.129 cDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 638149 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0596 0.128 0.129 cDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 509371 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0219 0.119 0.129 cDC L2
ENSG00000162402 USP24 -163736 sc-eQTL 5.08e-01 0.0885 0.133 0.129 cDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 851592 sc-eQTL 9.02e-01 0.0141 0.115 0.129 cDC L2
ENSG00000243725 TTC4 335767 sc-eQTL 2.04e-01 -0.174 0.136 0.129 cDC L2
ENSG00000116133 DHCR24 164433 sc-eQTL 4.27e-01 0.062 0.078 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000116205 TCEANC2 998044 sc-eQTL 7.50e-01 0.0346 0.108 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000116209 TMEM59 998124 sc-eQTL 9.56e-01 0.00367 0.0658 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000116221 MRPL37 867587 sc-eQTL 3.15e-01 0.118 0.117 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000157216 SSBP3 638149 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0495 0.12 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000162402 USP24 -163736 sc-eQTL 1.64e-01 -0.123 0.088 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000243725 TTC4 335767 sc-eQTL 1.49e-01 -0.195 0.135 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000116133 DHCR24 164433 sc-eQTL 4.29e-02 -0.149 0.073 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000116205 TCEANC2 998044 sc-eQTL 2.37e-01 0.133 0.112 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000116209 TMEM59 998124 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0457 0.09 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000116221 MRPL37 867587 sc-eQTL 7.05e-01 0.0493 0.13 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000157216 SSBP3 638149 sc-eQTL 8.40e-01 0.0273 0.135 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000162402 USP24 -163736 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0277 0.109 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000243725 TTC4 335767 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0969 0.137 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000006555 TTC22 250305 sc-eQTL 1.45e-01 -0.179 0.122 0.121 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 164433 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0795 0.137 0.121 gdT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 998044 sc-eQTL 9.83e-01 0.00294 0.138 0.121 gdT L2
ENSG00000116209 TMEM59 998124 sc-eQTL 6.91e-01 0.0556 0.14 0.121 gdT L2
ENSG00000116221 MRPL37 867587 sc-eQTL 3.48e-01 0.15 0.16 0.121 gdT L2
ENSG00000157216 SSBP3 638149 sc-eQTL 4.07e-01 0.0812 0.0978 0.121 gdT L2
ENSG00000162402 USP24 -163736 sc-eQTL 3.45e-01 0.124 0.131 0.121 gdT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 851592 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0192 0.137 0.121 gdT L2
ENSG00000243725 TTC4 335767 sc-eQTL 8.41e-02 -0.266 0.153 0.121 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 164433 sc-eQTL 6.11e-01 0.0506 0.0995 0.124 intMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 998044 sc-eQTL 7.64e-02 -0.219 0.123 0.124 intMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 998124 sc-eQTL 5.84e-02 -0.172 0.0903 0.124 intMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 867587 sc-eQTL 3.85e-01 0.121 0.139 0.124 intMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 638149 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0657 0.142 0.124 intMono L2
ENSG00000162402 USP24 -163736 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0245 0.127 0.124 intMono L2
ENSG00000243725 TTC4 335767 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0419 0.135 0.124 intMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 164433 sc-eQTL 3.81e-01 0.0863 0.0984 0.12 ncMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 998044 sc-eQTL 7.22e-01 0.0438 0.123 0.12 ncMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 998124 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0254 0.0986 0.12 ncMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 867587 sc-eQTL 2.50e-01 -0.146 0.127 0.12 ncMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 638149 sc-eQTL 2.45e-02 0.311 0.137 0.12 ncMono L2
ENSG00000162402 USP24 -163736 sc-eQTL 4.27e-02 -0.224 0.11 0.12 ncMono L2
ENSG00000243725 TTC4 335767 sc-eQTL 2.05e-01 0.167 0.131 0.12 ncMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 164433 sc-eQTL 8.46e-01 0.0232 0.119 0.127 pDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 998044 sc-eQTL 8.25e-01 0.0315 0.143 0.127 pDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 998124 sc-eQTL 7.49e-01 0.0365 0.114 0.127 pDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 867587 sc-eQTL 5.01e-02 0.295 0.149 0.127 pDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 638149 sc-eQTL 6.67e-01 0.0579 0.134 0.127 pDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 509371 sc-eQTL 7.91e-01 -0.015 0.0565 0.127 pDC L2
ENSG00000162402 USP24 -163736 sc-eQTL 3.00e-02 0.206 0.0939 0.127 pDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 851592 sc-eQTL 5.05e-01 -0.087 0.13 0.127 pDC L2
ENSG00000243725 TTC4 335767 sc-eQTL 5.29e-01 0.0949 0.15 0.127 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 250305 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0303 0.127 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 164433 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0666 0.128 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 998044 sc-eQTL 6.05e-01 -0.064 0.123 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 998124 sc-eQTL 1.53e-01 -0.137 0.0957 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 867587 sc-eQTL 1.81e-01 0.154 0.115 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 638149 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0258 0.1 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -163736 sc-eQTL 8.34e-02 -0.158 0.0907 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 851592 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0174 0.14 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 335767 sc-eQTL 8.10e-01 0.0304 0.126 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 250305 sc-eQTL 4.40e-01 -0.103 0.134 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 164433 sc-eQTL 3.30e-01 -0.117 0.12 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 998044 sc-eQTL 9.41e-01 0.00803 0.109 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 998124 sc-eQTL 2.75e-01 0.0845 0.0772 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 867587 sc-eQTL 9.14e-01 0.0121 0.111 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 638149 sc-eQTL 7.55e-01 0.031 0.0995 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -163736 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00451 0.0854 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 851592 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0786 0.135 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 335767 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0565 0.127 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 164433 sc-eQTL 9.11e-01 0.00847 0.0759 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 998044 sc-eQTL 2.93e-01 0.0998 0.0947 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 998124 sc-eQTL 9.22e-01 -0.00645 0.0655 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 867587 sc-eQTL 3.76e-01 0.103 0.116 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 638149 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0241 0.121 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -163736 sc-eQTL 1.18e-01 -0.129 0.0824 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 335767 sc-eQTL 1.94e-01 -0.178 0.137 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 164433 sc-eQTL 5.35e-01 0.0584 0.094 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 998044 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0571 0.124 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 998124 sc-eQTL 1.81e-01 -0.123 0.0915 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 867587 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0341 0.126 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 638149 sc-eQTL 3.06e-01 0.138 0.134 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -163736 sc-eQTL 1.65e-01 -0.147 0.105 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 335767 sc-eQTL 6.62e-01 0.0581 0.133 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 250305 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0704 0.109 0.125 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 164433 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0571 0.114 0.125 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 998044 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0683 0.111 0.125 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 998124 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0535 0.0861 0.125 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 867587 sc-eQTL 4.53e-02 -0.23 0.114 0.125 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 638149 sc-eQTL 2.32e-01 0.113 0.0944 0.125 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162398 LEXM 245565 sc-eQTL 8.82e-01 0.0158 0.107 0.125 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -163736 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0337 0.0677 0.125 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 335767 sc-eQTL 1.00e-01 -0.198 0.12 0.125 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000169174 PCSK9 12080 pQTL 4.26e-06 -0.181 0.0391 0.0 0.0 0.134
ENSG00000169174 PCSK9 12080 eQTL 0.000226 -0.0897 0.0242 0.0 0.0 0.13


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina