logo

Genes within 1Mb (chr1:55045140:CGAA:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 243817 sc-eQTL 4.15e-01 -0.099 0.121 0.141 B L1
ENSG00000116133 DHCR24 157945 sc-eQTL 5.98e-02 -0.215 0.114 0.141 B L1
ENSG00000116205 TCEANC2 991556 sc-eQTL 7.76e-01 0.0283 0.099 0.141 B L1
ENSG00000116209 TMEM59 991636 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0082 0.0603 0.141 B L1
ENSG00000116221 MRPL37 861099 sc-eQTL 4.94e-01 0.0541 0.0789 0.141 B L1
ENSG00000157216 SSBP3 631661 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0149 0.0826 0.141 B L1
ENSG00000162402 USP24 -170224 sc-eQTL 1.43e-02 -0.171 0.069 0.141 B L1
ENSG00000215883 CYB5RL 845104 sc-eQTL 3.78e-01 -0.119 0.135 0.141 B L1
ENSG00000243725 TTC4 329279 sc-eQTL 7.84e-02 0.206 0.116 0.141 B L1
ENSG00000006555 TTC22 243817 sc-eQTL 6.11e-01 0.0491 0.0962 0.141 CD4T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 991556 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0465 0.0786 0.141 CD4T L1
ENSG00000116209 TMEM59 991636 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0673 0.0732 0.141 CD4T L1
ENSG00000116221 MRPL37 861099 sc-eQTL 2.66e-01 0.113 0.101 0.141 CD4T L1
ENSG00000157216 SSBP3 631661 sc-eQTL 7.07e-02 0.152 0.0835 0.141 CD4T L1
ENSG00000162402 USP24 -170224 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0381 0.0685 0.141 CD4T L1
ENSG00000243725 TTC4 329279 sc-eQTL 8.81e-01 0.0154 0.103 0.141 CD4T L1
ENSG00000006555 TTC22 243817 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0203 0.0842 0.141 CD8T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 991556 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0911 0.105 0.141 CD8T L1
ENSG00000116209 TMEM59 991636 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0173 0.0728 0.141 CD8T L1
ENSG00000116221 MRPL37 861099 sc-eQTL 3.94e-02 0.206 0.0992 0.141 CD8T L1
ENSG00000157216 SSBP3 631661 sc-eQTL 2.40e-01 0.0845 0.0718 0.141 CD8T L1
ENSG00000162402 USP24 -170224 sc-eQTL 3.58e-01 -0.064 0.0695 0.141 CD8T L1
ENSG00000243725 TTC4 329279 sc-eQTL 3.64e-01 0.11 0.121 0.141 CD8T L1
ENSG00000116133 DHCR24 157945 sc-eQTL 6.33e-01 0.0531 0.111 0.142 DC L1
ENSG00000116205 TCEANC2 991556 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0639 0.124 0.142 DC L1
ENSG00000116209 TMEM59 991636 sc-eQTL 3.91e-01 -0.084 0.0976 0.142 DC L1
ENSG00000116221 MRPL37 861099 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0932 0.131 0.142 DC L1
ENSG00000157216 SSBP3 631661 sc-eQTL 6.10e-01 0.0598 0.117 0.142 DC L1
ENSG00000162390 ACOT11 502883 sc-eQTL 6.73e-01 0.0476 0.113 0.142 DC L1
ENSG00000162402 USP24 -170224 sc-eQTL 1.55e-01 0.0966 0.0676 0.142 DC L1
ENSG00000215883 CYB5RL 845104 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0903 0.123 0.142 DC L1
ENSG00000243725 TTC4 329279 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0431 0.132 0.142 DC L1
ENSG00000116133 DHCR24 157945 sc-eQTL 9.43e-01 0.00577 0.0805 0.141 Mono L1
ENSG00000116205 TCEANC2 991556 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0324 0.0868 0.141 Mono L1
ENSG00000116209 TMEM59 991636 sc-eQTL 6.65e-01 0.028 0.0645 0.141 Mono L1
ENSG00000116221 MRPL37 861099 sc-eQTL 1.82e-01 0.144 0.107 0.141 Mono L1
ENSG00000157216 SSBP3 631661 sc-eQTL 5.81e-01 0.0683 0.124 0.141 Mono L1
ENSG00000162402 USP24 -170224 sc-eQTL 1.67e-01 -0.102 0.0733 0.141 Mono L1
ENSG00000243725 TTC4 329279 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0185 0.13 0.141 Mono L1
ENSG00000006555 TTC22 243817 sc-eQTL 9.65e-01 0.00478 0.11 0.142 NK L1
ENSG00000116133 DHCR24 157945 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00373 0.111 0.142 NK L1
ENSG00000116205 TCEANC2 991556 sc-eQTL 8.05e-01 -0.027 0.109 0.142 NK L1
ENSG00000116209 TMEM59 991636 sc-eQTL 9.81e-01 0.00207 0.0856 0.142 NK L1
ENSG00000116221 MRPL37 861099 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0901 0.106 0.142 NK L1
ENSG00000157216 SSBP3 631661 sc-eQTL 3.15e-01 0.0928 0.0921 0.142 NK L1
ENSG00000162398 LEXM 239077 sc-eQTL 5.52e-02 0.198 0.103 0.142 NK L1
ENSG00000162402 USP24 -170224 sc-eQTL 2.57e-01 -0.0711 0.0626 0.142 NK L1
ENSG00000243725 TTC4 329279 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0151 0.119 0.142 NK L1
ENSG00000006555 TTC22 243817 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0265 0.1 0.141 Other_T L1
ENSG00000116133 DHCR24 157945 sc-eQTL 1.78e-01 0.105 0.0773 0.141 Other_T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 991556 sc-eQTL 4.11e-02 -0.236 0.115 0.141 Other_T L1
ENSG00000116209 TMEM59 991636 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0263 0.0797 0.141 Other_T L1
ENSG00000116221 MRPL37 861099 sc-eQTL 3.21e-02 0.159 0.0739 0.141 Other_T L1
ENSG00000157216 SSBP3 631661 sc-eQTL 1.05e-02 0.22 0.085 0.141 Other_T L1
ENSG00000162402 USP24 -170224 sc-eQTL 7.79e-02 0.162 0.0913 0.141 Other_T L1
ENSG00000215883 CYB5RL 845104 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0929 0.126 0.141 Other_T L1
ENSG00000243725 TTC4 329279 sc-eQTL 7.04e-02 -0.226 0.124 0.141 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 243817 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0265 0.102 0.145 B_Activated L2
ENSG00000116133 DHCR24 157945 sc-eQTL 1.52e-01 -0.171 0.119 0.145 B_Activated L2
ENSG00000116205 TCEANC2 991556 sc-eQTL 9.44e-01 0.00904 0.128 0.145 B_Activated L2
ENSG00000116209 TMEM59 991636 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0633 0.136 0.145 B_Activated L2
ENSG00000116221 MRPL37 861099 sc-eQTL 9.78e-02 0.243 0.146 0.145 B_Activated L2
ENSG00000157216 SSBP3 631661 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0327 0.133 0.145 B_Activated L2
ENSG00000162402 USP24 -170224 sc-eQTL 4.75e-02 -0.256 0.128 0.145 B_Activated L2
ENSG00000215883 CYB5RL 845104 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0123 0.115 0.145 B_Activated L2
ENSG00000243725 TTC4 329279 sc-eQTL 4.06e-01 0.103 0.124 0.145 B_Activated L2
ENSG00000006555 TTC22 243817 sc-eQTL 3.65e-01 0.12 0.132 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000116133 DHCR24 157945 sc-eQTL 1.34e-01 -0.183 0.122 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000116205 TCEANC2 991556 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0534 0.122 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000116209 TMEM59 991636 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0181 0.104 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000116221 MRPL37 861099 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00127 0.123 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000157216 SSBP3 631661 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0626 0.115 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000162402 USP24 -170224 sc-eQTL 2.88e-01 -0.103 0.0963 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000215883 CYB5RL 845104 sc-eQTL 2.23e-01 0.167 0.136 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000243725 TTC4 329279 sc-eQTL 5.20e-01 0.0801 0.124 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000006555 TTC22 243817 sc-eQTL 5.08e-01 0.0831 0.125 0.142 B_Memory L2
ENSG00000116133 DHCR24 157945 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0733 0.125 0.142 B_Memory L2
ENSG00000116205 TCEANC2 991556 sc-eQTL 5.58e-01 0.0781 0.133 0.142 B_Memory L2
ENSG00000116209 TMEM59 991636 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0615 0.111 0.142 B_Memory L2
ENSG00000116221 MRPL37 861099 sc-eQTL 4.14e-01 0.092 0.112 0.142 B_Memory L2
ENSG00000157216 SSBP3 631661 sc-eQTL 3.83e-01 0.0918 0.105 0.142 B_Memory L2
ENSG00000162402 USP24 -170224 sc-eQTL 9.03e-01 0.0126 0.103 0.142 B_Memory L2
ENSG00000215883 CYB5RL 845104 sc-eQTL 8.09e-02 -0.221 0.126 0.142 B_Memory L2
ENSG00000243725 TTC4 329279 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0252 0.132 0.142 B_Memory L2
ENSG00000006555 TTC22 243817 sc-eQTL 3.90e-01 -0.112 0.13 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000116133 DHCR24 157945 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0681 0.122 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 991556 sc-eQTL 7.26e-01 0.0383 0.109 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000116209 TMEM59 991636 sc-eQTL 8.76e-01 0.0124 0.0791 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000116221 MRPL37 861099 sc-eQTL 5.85e-01 0.0638 0.117 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000157216 SSBP3 631661 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00355 0.111 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000162402 USP24 -170224 sc-eQTL 2.75e-01 -0.0955 0.0873 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 845104 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0959 0.132 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000243725 TTC4 329279 sc-eQTL 7.34e-02 0.213 0.118 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000006555 TTC22 243817 sc-eQTL 8.50e-01 0.0249 0.131 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000116133 DHCR24 157945 sc-eQTL 9.73e-01 0.00384 0.114 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 991556 sc-eQTL 8.00e-01 0.0322 0.127 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000116209 TMEM59 991636 sc-eQTL 3.39e-02 0.22 0.103 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000116221 MRPL37 861099 sc-eQTL 3.57e-01 -0.113 0.123 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000157216 SSBP3 631661 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0356 0.121 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000162402 USP24 -170224 sc-eQTL 1.65e-01 -0.133 0.0955 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 845104 sc-eQTL 3.19e-01 -0.135 0.135 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000243725 TTC4 329279 sc-eQTL 3.03e-01 0.145 0.14 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000006555 TTC22 243817 sc-eQTL 9.77e-03 0.316 0.121 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 991556 sc-eQTL 7.88e-01 0.034 0.127 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 991636 sc-eQTL 8.23e-01 0.0258 0.115 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 861099 sc-eQTL 2.71e-01 0.156 0.141 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 631661 sc-eQTL 7.55e-01 0.0272 0.0871 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -170224 sc-eQTL 7.49e-01 0.0384 0.12 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 329279 sc-eQTL 8.47e-01 0.0259 0.134 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 243817 sc-eQTL 5.97e-01 0.0599 0.113 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 991556 sc-eQTL 7.89e-01 0.0231 0.0861 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 991636 sc-eQTL 2.48e-01 -0.0967 0.0835 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 861099 sc-eQTL 3.31e-01 0.105 0.108 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 631661 sc-eQTL 1.17e-01 0.135 0.0857 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -170224 sc-eQTL 2.68e-01 -0.0824 0.0742 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 329279 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0135 0.113 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 243817 sc-eQTL 2.97e-01 0.125 0.12 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 991556 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000898 0.117 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 991636 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0743 0.0878 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 861099 sc-eQTL 2.94e-01 0.116 0.11 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 631661 sc-eQTL 3.41e-01 0.103 0.108 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -170224 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0218 0.0899 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 329279 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0257 0.129 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 243817 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00328 0.137 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 991556 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0414 0.13 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 991636 sc-eQTL 8.27e-01 -0.022 0.101 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 861099 sc-eQTL 1.16e-01 0.203 0.129 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 631661 sc-eQTL 8.07e-02 0.193 0.11 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -170224 sc-eQTL 9.23e-01 0.00973 0.101 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 329279 sc-eQTL 4.94e-02 0.261 0.132 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 243817 sc-eQTL 5.95e-01 0.0586 0.11 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 991556 sc-eQTL 4.83e-02 -0.24 0.121 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 991636 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0126 0.106 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 861099 sc-eQTL 4.38e-01 0.0976 0.126 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 631661 sc-eQTL 3.73e-01 0.0765 0.0858 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -170224 sc-eQTL 3.69e-01 -0.0767 0.0853 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 329279 sc-eQTL 3.63e-01 0.116 0.128 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 243817 sc-eQTL 4.73e-02 -0.242 0.121 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 991556 sc-eQTL 3.09e-01 -0.113 0.11 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 991636 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0273 0.108 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 861099 sc-eQTL 8.27e-02 0.225 0.129 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 631661 sc-eQTL 3.30e-01 0.0957 0.098 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -170224 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0725 0.0892 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 329279 sc-eQTL 6.29e-01 0.0632 0.131 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 243817 sc-eQTL 3.18e-01 -0.138 0.138 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 991556 sc-eQTL 1.20e-01 -0.216 0.138 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 991636 sc-eQTL 8.78e-01 0.0188 0.122 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 861099 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0169 0.139 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 631661 sc-eQTL 3.19e-01 0.12 0.12 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -170224 sc-eQTL 9.32e-01 0.00997 0.117 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 329279 sc-eQTL 3.54e-01 -0.132 0.142 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 243817 sc-eQTL 1.95e-01 0.168 0.129 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 991556 sc-eQTL 1.40e-01 0.2 0.135 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 991636 sc-eQTL 3.33e-01 -0.127 0.131 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 861099 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0405 0.133 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 631661 sc-eQTL 3.03e-01 0.13 0.125 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -170224 sc-eQTL 5.81e-01 0.0732 0.132 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 329279 sc-eQTL 5.43e-01 0.082 0.135 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 243817 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0254 0.119 0.141 MAIT L2
ENSG00000116133 DHCR24 157945 sc-eQTL 6.62e-02 0.161 0.0871 0.141 MAIT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 991556 sc-eQTL 1.60e-02 -0.296 0.122 0.141 MAIT L2
ENSG00000116209 TMEM59 991636 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0112 0.112 0.141 MAIT L2
ENSG00000116221 MRPL37 861099 sc-eQTL 1.13e-01 0.215 0.135 0.141 MAIT L2
ENSG00000157216 SSBP3 631661 sc-eQTL 1.59e-01 0.169 0.12 0.141 MAIT L2
ENSG00000162402 USP24 -170224 sc-eQTL 5.87e-01 0.0581 0.107 0.141 MAIT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 845104 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0697 0.124 0.141 MAIT L2
ENSG00000243725 TTC4 329279 sc-eQTL 1.40e-01 -0.182 0.123 0.141 MAIT L2
ENSG00000006555 TTC22 243817 sc-eQTL 8.10e-01 0.0323 0.134 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000116133 DHCR24 157945 sc-eQTL 7.26e-01 0.0416 0.119 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000116205 TCEANC2 991556 sc-eQTL 9.33e-01 -0.0105 0.125 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000116209 TMEM59 991636 sc-eQTL 1.43e-01 0.179 0.122 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000116221 MRPL37 861099 sc-eQTL 1.93e-01 0.178 0.136 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000157216 SSBP3 631661 sc-eQTL 6.20e-01 0.0511 0.103 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000162398 LEXM 239077 sc-eQTL 2.36e-01 0.144 0.121 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000162402 USP24 -170224 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0855 0.104 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000243725 TTC4 329279 sc-eQTL 6.76e-01 0.0551 0.132 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000006555 TTC22 243817 sc-eQTL 5.62e-01 0.065 0.112 0.142 NK_CD56dim L2
ENSG00000116133 DHCR24 157945 sc-eQTL 4.08e-01 0.0966 0.117 0.142 NK_CD56dim L2
ENSG00000116205 TCEANC2 991556 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0268 0.126 0.142 NK_CD56dim L2
ENSG00000116209 TMEM59 991636 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0408 0.0937 0.142 NK_CD56dim L2
ENSG00000116221 MRPL37 861099 sc-eQTL 3.53e-02 -0.255 0.121 0.142 NK_CD56dim L2
ENSG00000157216 SSBP3 631661 sc-eQTL 3.45e-01 0.0942 0.0996 0.142 NK_CD56dim L2
ENSG00000162398 LEXM 239077 sc-eQTL 1.70e-01 0.157 0.114 0.142 NK_CD56dim L2
ENSG00000162402 USP24 -170224 sc-eQTL 1.17e-01 -0.114 0.0725 0.142 NK_CD56dim L2
ENSG00000243725 TTC4 329279 sc-eQTL 2.18e-01 -0.154 0.124 0.142 NK_CD56dim L2
ENSG00000006555 TTC22 243817 sc-eQTL 4.18e-01 0.108 0.133 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000116133 DHCR24 157945 sc-eQTL 4.59e-01 0.0965 0.13 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000116205 TCEANC2 991556 sc-eQTL 9.18e-01 0.0129 0.126 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000116209 TMEM59 991636 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0756 0.125 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000116221 MRPL37 861099 sc-eQTL 4.57e-01 0.102 0.137 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000157216 SSBP3 631661 sc-eQTL 2.28e-01 0.135 0.112 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000162398 LEXM 239077 sc-eQTL 2.59e-01 0.143 0.126 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000162402 USP24 -170224 sc-eQTL 7.35e-01 0.0314 0.0928 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000243725 TTC4 329279 sc-eQTL 9.53e-01 0.00814 0.139 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000006555 TTC22 243817 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0457 0.119 0.142 NK_cytokine L2
ENSG00000116133 DHCR24 157945 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0255 0.12 0.142 NK_cytokine L2
ENSG00000116205 TCEANC2 991556 sc-eQTL 3.62e-01 -0.109 0.119 0.142 NK_cytokine L2
ENSG00000116209 TMEM59 991636 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0643 0.0969 0.142 NK_cytokine L2
ENSG00000116221 MRPL37 861099 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0833 0.119 0.142 NK_cytokine L2
ENSG00000157216 SSBP3 631661 sc-eQTL 1.02e-01 0.164 0.0996 0.142 NK_cytokine L2
ENSG00000162398 LEXM 239077 sc-eQTL 4.59e-01 0.0928 0.125 0.142 NK_cytokine L2
ENSG00000162402 USP24 -170224 sc-eQTL 2.45e-01 -0.0992 0.0851 0.142 NK_cytokine L2
ENSG00000243725 TTC4 329279 sc-eQTL 8.64e-01 0.0216 0.127 0.142 NK_cytokine L2
ENSG00000006555 TTC22 243817 sc-eQTL 3.49e-01 -0.137 0.146 0.152 PB L2
ENSG00000116133 DHCR24 157945 sc-eQTL 3.42e-01 0.124 0.129 0.152 PB L2
ENSG00000116205 TCEANC2 991556 sc-eQTL 9.13e-01 0.0174 0.158 0.152 PB L2
ENSG00000116209 TMEM59 991636 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0351 0.0661 0.152 PB L2
ENSG00000116221 MRPL37 861099 sc-eQTL 2.98e-01 -0.125 0.12 0.152 PB L2
ENSG00000157216 SSBP3 631661 sc-eQTL 7.27e-01 0.0487 0.139 0.152 PB L2
ENSG00000162402 USP24 -170224 sc-eQTL 2.47e-01 -0.182 0.157 0.152 PB L2
ENSG00000215883 CYB5RL 845104 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0455 0.163 0.152 PB L2
ENSG00000243725 TTC4 329279 sc-eQTL 7.31e-02 0.272 0.15 0.152 PB L2
ENSG00000006555 TTC22 243817 sc-eQTL 5.39e-01 -0.074 0.12 0.143 Pro_T L2
ENSG00000116133 DHCR24 157945 sc-eQTL 4.26e-01 0.0814 0.102 0.143 Pro_T L2
ENSG00000116205 TCEANC2 991556 sc-eQTL 5.57e-01 0.0735 0.125 0.143 Pro_T L2
ENSG00000116209 TMEM59 991636 sc-eQTL 5.86e-01 0.0473 0.0866 0.143 Pro_T L2
ENSG00000116221 MRPL37 861099 sc-eQTL 9.22e-01 0.00831 0.0849 0.143 Pro_T L2
ENSG00000157216 SSBP3 631661 sc-eQTL 9.48e-02 0.159 0.0945 0.143 Pro_T L2
ENSG00000162402 USP24 -170224 sc-eQTL 1.30e-01 0.176 0.115 0.143 Pro_T L2
ENSG00000215883 CYB5RL 845104 sc-eQTL 1.60e-02 0.274 0.113 0.143 Pro_T L2
ENSG00000243725 TTC4 329279 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0931 0.127 0.143 Pro_T L2
ENSG00000006555 TTC22 243817 sc-eQTL 9.71e-01 0.00442 0.121 0.141 Treg L2
ENSG00000116205 TCEANC2 991556 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0275 0.13 0.141 Treg L2
ENSG00000116209 TMEM59 991636 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0507 0.103 0.141 Treg L2
ENSG00000116221 MRPL37 861099 sc-eQTL 7.48e-01 -0.041 0.127 0.141 Treg L2
ENSG00000157216 SSBP3 631661 sc-eQTL 3.38e-01 0.109 0.113 0.141 Treg L2
ENSG00000162402 USP24 -170224 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0385 0.108 0.141 Treg L2
ENSG00000243725 TTC4 329279 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0558 0.136 0.141 Treg L2
ENSG00000116133 DHCR24 157945 sc-eQTL 4.43e-01 0.0836 0.109 0.141 cDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 991556 sc-eQTL 2.14e-01 -0.159 0.128 0.141 cDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 991636 sc-eQTL 1.33e-01 -0.163 0.108 0.141 cDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 861099 sc-eQTL 2.86e-02 -0.304 0.138 0.141 cDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 631661 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0674 0.129 0.141 cDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 502883 sc-eQTL 6.07e-01 0.0616 0.12 0.141 cDC L2
ENSG00000162402 USP24 -170224 sc-eQTL 4.18e-01 0.109 0.134 0.141 cDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 845104 sc-eQTL 3.02e-01 0.119 0.115 0.141 cDC L2
ENSG00000243725 TTC4 329279 sc-eQTL 2.20e-01 -0.169 0.137 0.141 cDC L2
ENSG00000116133 DHCR24 157945 sc-eQTL 4.05e-01 0.0651 0.078 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000116205 TCEANC2 991556 sc-eQTL 2.22e-01 -0.132 0.108 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000116209 TMEM59 991636 sc-eQTL 5.30e-01 0.0414 0.0657 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000116221 MRPL37 861099 sc-eQTL 3.45e-02 0.247 0.116 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000157216 SSBP3 631661 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0351 0.12 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000162402 USP24 -170224 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0329 0.0884 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000243725 TTC4 329279 sc-eQTL 4.57e-01 -0.101 0.135 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000116133 DHCR24 157945 sc-eQTL 2.61e-01 -0.0827 0.0734 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000116205 TCEANC2 991556 sc-eQTL 5.07e-01 0.0746 0.112 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000116209 TMEM59 991636 sc-eQTL 6.12e-01 0.0456 0.0899 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000116221 MRPL37 861099 sc-eQTL 2.22e-01 0.159 0.13 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000157216 SSBP3 631661 sc-eQTL 6.02e-01 0.0703 0.135 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000162402 USP24 -170224 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0491 0.109 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000243725 TTC4 329279 sc-eQTL 6.41e-01 0.0639 0.137 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000006555 TTC22 243817 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0949 0.128 0.139 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 157945 sc-eQTL 2.79e-01 0.154 0.142 0.139 gdT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 991556 sc-eQTL 3.54e-01 -0.133 0.143 0.139 gdT L2
ENSG00000116209 TMEM59 991636 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0509 0.145 0.139 gdT L2
ENSG00000116221 MRPL37 861099 sc-eQTL 7.39e-02 0.296 0.165 0.139 gdT L2
ENSG00000157216 SSBP3 631661 sc-eQTL 1.36e-01 0.152 0.101 0.139 gdT L2
ENSG00000162402 USP24 -170224 sc-eQTL 5.33e-01 0.0855 0.137 0.139 gdT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 845104 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0785 0.142 0.139 gdT L2
ENSG00000243725 TTC4 329279 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0983 0.16 0.139 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 157945 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0325 0.0985 0.14 intMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 991556 sc-eQTL 3.15e-01 -0.123 0.122 0.14 intMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 991636 sc-eQTL 3.21e-02 -0.192 0.0891 0.14 intMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 861099 sc-eQTL 4.90e-01 0.0951 0.138 0.14 intMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 631661 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0287 0.141 0.14 intMono L2
ENSG00000162402 USP24 -170224 sc-eQTL 8.84e-01 0.0183 0.125 0.14 intMono L2
ENSG00000243725 TTC4 329279 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0306 0.134 0.14 intMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 157945 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00862 0.0975 0.138 ncMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 991556 sc-eQTL 3.41e-01 0.116 0.122 0.138 ncMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 991636 sc-eQTL 2.53e-01 -0.111 0.0972 0.138 ncMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 861099 sc-eQTL 3.60e-02 -0.263 0.124 0.138 ncMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 631661 sc-eQTL 1.14e-01 0.217 0.137 0.138 ncMono L2
ENSG00000162402 USP24 -170224 sc-eQTL 1.44e-01 -0.16 0.109 0.138 ncMono L2
ENSG00000243725 TTC4 329279 sc-eQTL 1.96e-01 0.168 0.13 0.138 ncMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 157945 sc-eQTL 6.83e-01 -0.047 0.115 0.144 pDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 991556 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0774 0.138 0.144 pDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 991636 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0301 0.11 0.144 pDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 861099 sc-eQTL 1.30e-02 0.36 0.143 0.144 pDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 631661 sc-eQTL 3.26e-01 0.128 0.129 0.144 pDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 502883 sc-eQTL 5.64e-01 0.0315 0.0545 0.144 pDC L2
ENSG00000162402 USP24 -170224 sc-eQTL 4.65e-01 0.0674 0.092 0.144 pDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 845104 sc-eQTL 9.77e-02 -0.208 0.125 0.144 pDC L2
ENSG00000243725 TTC4 329279 sc-eQTL 5.16e-01 0.0946 0.145 0.144 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 243817 sc-eQTL 4.27e-01 0.0994 0.125 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 157945 sc-eQTL 1.13e-01 -0.198 0.125 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 991556 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0686 0.121 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 991636 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0494 0.0943 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 861099 sc-eQTL 2.08e-01 0.142 0.113 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 631661 sc-eQTL 7.29e-01 0.0341 0.0982 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -170224 sc-eQTL 2.14e-01 -0.111 0.0893 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 845104 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0922 0.138 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 329279 sc-eQTL 4.19e-01 0.1 0.123 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 243817 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0969 0.131 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 157945 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00475 0.118 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 991556 sc-eQTL 8.36e-01 0.0222 0.107 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 991636 sc-eQTL 3.56e-01 0.0702 0.0759 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 861099 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0172 0.109 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 631661 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00939 0.0977 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -170224 sc-eQTL 1.15e-01 -0.132 0.0834 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 845104 sc-eQTL 2.59e-01 -0.15 0.132 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 329279 sc-eQTL 9.14e-02 0.21 0.124 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 157945 sc-eQTL 9.75e-01 0.0024 0.0759 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 991556 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0297 0.0949 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 991636 sc-eQTL 4.63e-01 0.0481 0.0654 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 861099 sc-eQTL 3.69e-02 0.241 0.115 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 631661 sc-eQTL 9.36e-01 0.00972 0.121 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -170224 sc-eQTL 3.33e-01 -0.0803 0.0828 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 329279 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0291 0.137 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 157945 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0214 0.0934 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 991556 sc-eQTL 4.36e-01 0.0956 0.123 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 991636 sc-eQTL 1.51e-01 -0.131 0.0908 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 861099 sc-eQTL 1.41e-01 -0.184 0.124 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 631661 sc-eQTL 4.56e-01 0.0994 0.133 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -170224 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0888 0.105 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 329279 sc-eQTL 3.17e-01 0.132 0.131 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 243817 sc-eQTL 5.99e-01 0.0567 0.108 0.142 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 157945 sc-eQTL 8.40e-01 0.0228 0.112 0.142 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 991556 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0494 0.11 0.142 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 991636 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0312 0.0853 0.142 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 861099 sc-eQTL 1.15e-01 -0.18 0.114 0.142 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 631661 sc-eQTL 1.31e-01 0.141 0.0933 0.142 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162398 LEXM 239077 sc-eQTL 8.89e-02 0.179 0.105 0.142 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -170224 sc-eQTL 1.32e-01 -0.101 0.0667 0.142 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 329279 sc-eQTL 3.31e-01 -0.116 0.119 0.142 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000169174 PCSK9 5592 pQTL 8.36e-05 -0.156 0.0394 0.0 0.0 0.134
ENSG00000169174 PCSK9 5592 eQTL 0.0052 -0.0677 0.0242 0.0 0.0 0.132
ENSG00000215883 CYB5RL 845104 eQTL 0.0463 0.0545 0.0273 0.0 0.0 0.132

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000215883 CYB5RL 845104 3.91e-06 3.49e-06 1.34e-06 3.08e-06 1.08e-06 1.09e-06 2.48e-06 6.41e-07 2.43e-06 1.48e-06 3.36e-06 2.05e-06 6.61e-06 1.02e-06 9.62e-07 1.99e-06 1.08e-06 2.74e-06 1.35e-06 1.18e-06 2.91e-06 3.97e-06 3.36e-06 1.78e-06 4.41e-06 1.3e-06 1.31e-06 1.81e-06 3.2e-06 1.65e-06 2.07e-06 5.76e-07 6.45e-07 3.31e-06 2.06e-06 1.61e-06 9.63e-07 4.6e-07 1.35e-06 3.57e-07 1.02e-06 5.26e-06 1.4e-06 1.32e-07 3.65e-07 1.72e-06 8.67e-07 6.61e-07 4.55e-07