logo

Genes within 1Mb (chr1:55044199:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 242876 sc-eQTL 4.15e-01 -0.099 0.121 0.141 B L1
ENSG00000116133 DHCR24 157004 sc-eQTL 5.98e-02 -0.215 0.114 0.141 B L1
ENSG00000116205 TCEANC2 990615 sc-eQTL 7.76e-01 0.0283 0.099 0.141 B L1
ENSG00000116209 TMEM59 990695 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0082 0.0603 0.141 B L1
ENSG00000116221 MRPL37 860158 sc-eQTL 4.94e-01 0.0541 0.0789 0.141 B L1
ENSG00000157216 SSBP3 630720 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0149 0.0826 0.141 B L1
ENSG00000162402 USP24 -171165 sc-eQTL 1.43e-02 -0.171 0.069 0.141 B L1
ENSG00000215883 CYB5RL 844163 sc-eQTL 3.78e-01 -0.119 0.135 0.141 B L1
ENSG00000243725 TTC4 328338 sc-eQTL 7.84e-02 0.206 0.116 0.141 B L1
ENSG00000006555 TTC22 242876 sc-eQTL 6.11e-01 0.0491 0.0962 0.141 CD4T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 990615 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0465 0.0786 0.141 CD4T L1
ENSG00000116209 TMEM59 990695 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0673 0.0732 0.141 CD4T L1
ENSG00000116221 MRPL37 860158 sc-eQTL 2.66e-01 0.113 0.101 0.141 CD4T L1
ENSG00000157216 SSBP3 630720 sc-eQTL 7.07e-02 0.152 0.0835 0.141 CD4T L1
ENSG00000162402 USP24 -171165 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0381 0.0685 0.141 CD4T L1
ENSG00000243725 TTC4 328338 sc-eQTL 8.81e-01 0.0154 0.103 0.141 CD4T L1
ENSG00000006555 TTC22 242876 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0203 0.0842 0.141 CD8T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 990615 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0911 0.105 0.141 CD8T L1
ENSG00000116209 TMEM59 990695 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0173 0.0728 0.141 CD8T L1
ENSG00000116221 MRPL37 860158 sc-eQTL 3.94e-02 0.206 0.0992 0.141 CD8T L1
ENSG00000157216 SSBP3 630720 sc-eQTL 2.40e-01 0.0845 0.0718 0.141 CD8T L1
ENSG00000162402 USP24 -171165 sc-eQTL 3.58e-01 -0.064 0.0695 0.141 CD8T L1
ENSG00000243725 TTC4 328338 sc-eQTL 3.64e-01 0.11 0.121 0.141 CD8T L1
ENSG00000116133 DHCR24 157004 sc-eQTL 6.33e-01 0.0531 0.111 0.142 DC L1
ENSG00000116205 TCEANC2 990615 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0639 0.124 0.142 DC L1
ENSG00000116209 TMEM59 990695 sc-eQTL 3.91e-01 -0.084 0.0976 0.142 DC L1
ENSG00000116221 MRPL37 860158 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0932 0.131 0.142 DC L1
ENSG00000157216 SSBP3 630720 sc-eQTL 6.10e-01 0.0598 0.117 0.142 DC L1
ENSG00000162390 ACOT11 501942 sc-eQTL 6.73e-01 0.0476 0.113 0.142 DC L1
ENSG00000162402 USP24 -171165 sc-eQTL 1.55e-01 0.0966 0.0676 0.142 DC L1
ENSG00000215883 CYB5RL 844163 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0903 0.123 0.142 DC L1
ENSG00000243725 TTC4 328338 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0431 0.132 0.142 DC L1
ENSG00000116133 DHCR24 157004 sc-eQTL 9.43e-01 0.00577 0.0805 0.141 Mono L1
ENSG00000116205 TCEANC2 990615 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0324 0.0868 0.141 Mono L1
ENSG00000116209 TMEM59 990695 sc-eQTL 6.65e-01 0.028 0.0645 0.141 Mono L1
ENSG00000116221 MRPL37 860158 sc-eQTL 1.82e-01 0.144 0.107 0.141 Mono L1
ENSG00000157216 SSBP3 630720 sc-eQTL 5.81e-01 0.0683 0.124 0.141 Mono L1
ENSG00000162402 USP24 -171165 sc-eQTL 1.67e-01 -0.102 0.0733 0.141 Mono L1
ENSG00000243725 TTC4 328338 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0185 0.13 0.141 Mono L1
ENSG00000006555 TTC22 242876 sc-eQTL 9.65e-01 0.00478 0.11 0.142 NK L1
ENSG00000116133 DHCR24 157004 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00373 0.111 0.142 NK L1
ENSG00000116205 TCEANC2 990615 sc-eQTL 8.05e-01 -0.027 0.109 0.142 NK L1
ENSG00000116209 TMEM59 990695 sc-eQTL 9.81e-01 0.00207 0.0856 0.142 NK L1
ENSG00000116221 MRPL37 860158 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0901 0.106 0.142 NK L1
ENSG00000157216 SSBP3 630720 sc-eQTL 3.15e-01 0.0928 0.0921 0.142 NK L1
ENSG00000162398 LEXM 238136 sc-eQTL 5.52e-02 0.198 0.103 0.142 NK L1
ENSG00000162402 USP24 -171165 sc-eQTL 2.57e-01 -0.0711 0.0626 0.142 NK L1
ENSG00000243725 TTC4 328338 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0151 0.119 0.142 NK L1
ENSG00000006555 TTC22 242876 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0265 0.1 0.141 Other_T L1
ENSG00000116133 DHCR24 157004 sc-eQTL 1.78e-01 0.105 0.0773 0.141 Other_T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 990615 sc-eQTL 4.11e-02 -0.236 0.115 0.141 Other_T L1
ENSG00000116209 TMEM59 990695 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0263 0.0797 0.141 Other_T L1
ENSG00000116221 MRPL37 860158 sc-eQTL 3.21e-02 0.159 0.0739 0.141 Other_T L1
ENSG00000157216 SSBP3 630720 sc-eQTL 1.05e-02 0.22 0.085 0.141 Other_T L1
ENSG00000162402 USP24 -171165 sc-eQTL 7.79e-02 0.162 0.0913 0.141 Other_T L1
ENSG00000215883 CYB5RL 844163 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0929 0.126 0.141 Other_T L1
ENSG00000243725 TTC4 328338 sc-eQTL 7.04e-02 -0.226 0.124 0.141 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 242876 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0265 0.102 0.145 B_Activated L2
ENSG00000116133 DHCR24 157004 sc-eQTL 1.52e-01 -0.171 0.119 0.145 B_Activated L2
ENSG00000116205 TCEANC2 990615 sc-eQTL 9.44e-01 0.00904 0.128 0.145 B_Activated L2
ENSG00000116209 TMEM59 990695 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0633 0.136 0.145 B_Activated L2
ENSG00000116221 MRPL37 860158 sc-eQTL 9.78e-02 0.243 0.146 0.145 B_Activated L2
ENSG00000157216 SSBP3 630720 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0327 0.133 0.145 B_Activated L2
ENSG00000162402 USP24 -171165 sc-eQTL 4.75e-02 -0.256 0.128 0.145 B_Activated L2
ENSG00000215883 CYB5RL 844163 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0123 0.115 0.145 B_Activated L2
ENSG00000243725 TTC4 328338 sc-eQTL 4.06e-01 0.103 0.124 0.145 B_Activated L2
ENSG00000006555 TTC22 242876 sc-eQTL 3.65e-01 0.12 0.132 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000116133 DHCR24 157004 sc-eQTL 1.34e-01 -0.183 0.122 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000116205 TCEANC2 990615 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0534 0.122 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000116209 TMEM59 990695 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0181 0.104 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000116221 MRPL37 860158 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00127 0.123 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000157216 SSBP3 630720 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0626 0.115 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000162402 USP24 -171165 sc-eQTL 2.88e-01 -0.103 0.0963 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000215883 CYB5RL 844163 sc-eQTL 2.23e-01 0.167 0.136 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000243725 TTC4 328338 sc-eQTL 5.20e-01 0.0801 0.124 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000006555 TTC22 242876 sc-eQTL 5.08e-01 0.0831 0.125 0.142 B_Memory L2
ENSG00000116133 DHCR24 157004 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0733 0.125 0.142 B_Memory L2
ENSG00000116205 TCEANC2 990615 sc-eQTL 5.58e-01 0.0781 0.133 0.142 B_Memory L2
ENSG00000116209 TMEM59 990695 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0615 0.111 0.142 B_Memory L2
ENSG00000116221 MRPL37 860158 sc-eQTL 4.14e-01 0.092 0.112 0.142 B_Memory L2
ENSG00000157216 SSBP3 630720 sc-eQTL 3.83e-01 0.0918 0.105 0.142 B_Memory L2
ENSG00000162402 USP24 -171165 sc-eQTL 9.03e-01 0.0126 0.103 0.142 B_Memory L2
ENSG00000215883 CYB5RL 844163 sc-eQTL 8.09e-02 -0.221 0.126 0.142 B_Memory L2
ENSG00000243725 TTC4 328338 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0252 0.132 0.142 B_Memory L2
ENSG00000006555 TTC22 242876 sc-eQTL 3.90e-01 -0.112 0.13 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000116133 DHCR24 157004 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0681 0.122 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 990615 sc-eQTL 7.26e-01 0.0383 0.109 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000116209 TMEM59 990695 sc-eQTL 8.76e-01 0.0124 0.0791 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000116221 MRPL37 860158 sc-eQTL 5.85e-01 0.0638 0.117 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000157216 SSBP3 630720 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00355 0.111 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000162402 USP24 -171165 sc-eQTL 2.75e-01 -0.0955 0.0873 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 844163 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0959 0.132 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000243725 TTC4 328338 sc-eQTL 7.34e-02 0.213 0.118 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000006555 TTC22 242876 sc-eQTL 8.50e-01 0.0249 0.131 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000116133 DHCR24 157004 sc-eQTL 9.73e-01 0.00384 0.114 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 990615 sc-eQTL 8.00e-01 0.0322 0.127 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000116209 TMEM59 990695 sc-eQTL 3.39e-02 0.22 0.103 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000116221 MRPL37 860158 sc-eQTL 3.57e-01 -0.113 0.123 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000157216 SSBP3 630720 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0356 0.121 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000162402 USP24 -171165 sc-eQTL 1.65e-01 -0.133 0.0955 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 844163 sc-eQTL 3.19e-01 -0.135 0.135 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000243725 TTC4 328338 sc-eQTL 3.03e-01 0.145 0.14 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000006555 TTC22 242876 sc-eQTL 9.77e-03 0.316 0.121 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 990615 sc-eQTL 7.88e-01 0.034 0.127 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 990695 sc-eQTL 8.23e-01 0.0258 0.115 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 860158 sc-eQTL 2.71e-01 0.156 0.141 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 630720 sc-eQTL 7.55e-01 0.0272 0.0871 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -171165 sc-eQTL 7.49e-01 0.0384 0.12 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 328338 sc-eQTL 8.47e-01 0.0259 0.134 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 242876 sc-eQTL 5.97e-01 0.0599 0.113 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 990615 sc-eQTL 7.89e-01 0.0231 0.0861 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 990695 sc-eQTL 2.48e-01 -0.0967 0.0835 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 860158 sc-eQTL 3.31e-01 0.105 0.108 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 630720 sc-eQTL 1.17e-01 0.135 0.0857 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -171165 sc-eQTL 2.68e-01 -0.0824 0.0742 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 328338 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0135 0.113 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 242876 sc-eQTL 2.97e-01 0.125 0.12 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 990615 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000898 0.117 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 990695 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0743 0.0878 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 860158 sc-eQTL 2.94e-01 0.116 0.11 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 630720 sc-eQTL 3.41e-01 0.103 0.108 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -171165 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0218 0.0899 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 328338 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0257 0.129 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 242876 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00328 0.137 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 990615 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0414 0.13 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 990695 sc-eQTL 8.27e-01 -0.022 0.101 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 860158 sc-eQTL 1.16e-01 0.203 0.129 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 630720 sc-eQTL 8.07e-02 0.193 0.11 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -171165 sc-eQTL 9.23e-01 0.00973 0.101 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 328338 sc-eQTL 4.94e-02 0.261 0.132 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 242876 sc-eQTL 5.95e-01 0.0586 0.11 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 990615 sc-eQTL 4.83e-02 -0.24 0.121 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 990695 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0126 0.106 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 860158 sc-eQTL 4.38e-01 0.0976 0.126 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 630720 sc-eQTL 3.73e-01 0.0765 0.0858 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -171165 sc-eQTL 3.69e-01 -0.0767 0.0853 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 328338 sc-eQTL 3.63e-01 0.116 0.128 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 242876 sc-eQTL 4.73e-02 -0.242 0.121 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 990615 sc-eQTL 3.09e-01 -0.113 0.11 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 990695 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0273 0.108 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 860158 sc-eQTL 8.27e-02 0.225 0.129 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 630720 sc-eQTL 3.30e-01 0.0957 0.098 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -171165 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0725 0.0892 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 328338 sc-eQTL 6.29e-01 0.0632 0.131 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 242876 sc-eQTL 3.18e-01 -0.138 0.138 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 990615 sc-eQTL 1.20e-01 -0.216 0.138 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 990695 sc-eQTL 8.78e-01 0.0188 0.122 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 860158 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0169 0.139 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 630720 sc-eQTL 3.19e-01 0.12 0.12 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -171165 sc-eQTL 9.32e-01 0.00997 0.117 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 328338 sc-eQTL 3.54e-01 -0.132 0.142 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 242876 sc-eQTL 1.95e-01 0.168 0.129 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 990615 sc-eQTL 1.40e-01 0.2 0.135 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 990695 sc-eQTL 3.33e-01 -0.127 0.131 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 860158 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0405 0.133 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 630720 sc-eQTL 3.03e-01 0.13 0.125 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -171165 sc-eQTL 5.81e-01 0.0732 0.132 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 328338 sc-eQTL 5.43e-01 0.082 0.135 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 242876 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0254 0.119 0.141 MAIT L2
ENSG00000116133 DHCR24 157004 sc-eQTL 6.62e-02 0.161 0.0871 0.141 MAIT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 990615 sc-eQTL 1.60e-02 -0.296 0.122 0.141 MAIT L2
ENSG00000116209 TMEM59 990695 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0112 0.112 0.141 MAIT L2
ENSG00000116221 MRPL37 860158 sc-eQTL 1.13e-01 0.215 0.135 0.141 MAIT L2
ENSG00000157216 SSBP3 630720 sc-eQTL 1.59e-01 0.169 0.12 0.141 MAIT L2
ENSG00000162402 USP24 -171165 sc-eQTL 5.87e-01 0.0581 0.107 0.141 MAIT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 844163 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0697 0.124 0.141 MAIT L2
ENSG00000243725 TTC4 328338 sc-eQTL 1.40e-01 -0.182 0.123 0.141 MAIT L2
ENSG00000006555 TTC22 242876 sc-eQTL 8.10e-01 0.0323 0.134 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000116133 DHCR24 157004 sc-eQTL 7.26e-01 0.0416 0.119 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000116205 TCEANC2 990615 sc-eQTL 9.33e-01 -0.0105 0.125 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000116209 TMEM59 990695 sc-eQTL 1.43e-01 0.179 0.122 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000116221 MRPL37 860158 sc-eQTL 1.93e-01 0.178 0.136 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000157216 SSBP3 630720 sc-eQTL 6.20e-01 0.0511 0.103 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000162398 LEXM 238136 sc-eQTL 2.36e-01 0.144 0.121 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000162402 USP24 -171165 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0855 0.104 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000243725 TTC4 328338 sc-eQTL 6.76e-01 0.0551 0.132 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000006555 TTC22 242876 sc-eQTL 5.62e-01 0.065 0.112 0.142 NK_CD56dim L2
ENSG00000116133 DHCR24 157004 sc-eQTL 4.08e-01 0.0966 0.117 0.142 NK_CD56dim L2
ENSG00000116205 TCEANC2 990615 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0268 0.126 0.142 NK_CD56dim L2
ENSG00000116209 TMEM59 990695 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0408 0.0937 0.142 NK_CD56dim L2
ENSG00000116221 MRPL37 860158 sc-eQTL 3.53e-02 -0.255 0.121 0.142 NK_CD56dim L2
ENSG00000157216 SSBP3 630720 sc-eQTL 3.45e-01 0.0942 0.0996 0.142 NK_CD56dim L2
ENSG00000162398 LEXM 238136 sc-eQTL 1.70e-01 0.157 0.114 0.142 NK_CD56dim L2
ENSG00000162402 USP24 -171165 sc-eQTL 1.17e-01 -0.114 0.0725 0.142 NK_CD56dim L2
ENSG00000243725 TTC4 328338 sc-eQTL 2.18e-01 -0.154 0.124 0.142 NK_CD56dim L2
ENSG00000006555 TTC22 242876 sc-eQTL 4.18e-01 0.108 0.133 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000116133 DHCR24 157004 sc-eQTL 4.59e-01 0.0965 0.13 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000116205 TCEANC2 990615 sc-eQTL 9.18e-01 0.0129 0.126 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000116209 TMEM59 990695 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0756 0.125 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000116221 MRPL37 860158 sc-eQTL 4.57e-01 0.102 0.137 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000157216 SSBP3 630720 sc-eQTL 2.28e-01 0.135 0.112 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000162398 LEXM 238136 sc-eQTL 2.59e-01 0.143 0.126 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000162402 USP24 -171165 sc-eQTL 7.35e-01 0.0314 0.0928 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000243725 TTC4 328338 sc-eQTL 9.53e-01 0.00814 0.139 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000006555 TTC22 242876 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0457 0.119 0.142 NK_cytokine L2
ENSG00000116133 DHCR24 157004 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0255 0.12 0.142 NK_cytokine L2
ENSG00000116205 TCEANC2 990615 sc-eQTL 3.62e-01 -0.109 0.119 0.142 NK_cytokine L2
ENSG00000116209 TMEM59 990695 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0643 0.0969 0.142 NK_cytokine L2
ENSG00000116221 MRPL37 860158 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0833 0.119 0.142 NK_cytokine L2
ENSG00000157216 SSBP3 630720 sc-eQTL 1.02e-01 0.164 0.0996 0.142 NK_cytokine L2
ENSG00000162398 LEXM 238136 sc-eQTL 4.59e-01 0.0928 0.125 0.142 NK_cytokine L2
ENSG00000162402 USP24 -171165 sc-eQTL 2.45e-01 -0.0992 0.0851 0.142 NK_cytokine L2
ENSG00000243725 TTC4 328338 sc-eQTL 8.64e-01 0.0216 0.127 0.142 NK_cytokine L2
ENSG00000006555 TTC22 242876 sc-eQTL 3.49e-01 -0.137 0.146 0.152 PB L2
ENSG00000116133 DHCR24 157004 sc-eQTL 3.42e-01 0.124 0.129 0.152 PB L2
ENSG00000116205 TCEANC2 990615 sc-eQTL 9.13e-01 0.0174 0.158 0.152 PB L2
ENSG00000116209 TMEM59 990695 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0351 0.0661 0.152 PB L2
ENSG00000116221 MRPL37 860158 sc-eQTL 2.98e-01 -0.125 0.12 0.152 PB L2
ENSG00000157216 SSBP3 630720 sc-eQTL 7.27e-01 0.0487 0.139 0.152 PB L2
ENSG00000162402 USP24 -171165 sc-eQTL 2.47e-01 -0.182 0.157 0.152 PB L2
ENSG00000215883 CYB5RL 844163 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0455 0.163 0.152 PB L2
ENSG00000243725 TTC4 328338 sc-eQTL 7.31e-02 0.272 0.15 0.152 PB L2
ENSG00000006555 TTC22 242876 sc-eQTL 5.39e-01 -0.074 0.12 0.143 Pro_T L2
ENSG00000116133 DHCR24 157004 sc-eQTL 4.26e-01 0.0814 0.102 0.143 Pro_T L2
ENSG00000116205 TCEANC2 990615 sc-eQTL 5.57e-01 0.0735 0.125 0.143 Pro_T L2
ENSG00000116209 TMEM59 990695 sc-eQTL 5.86e-01 0.0473 0.0866 0.143 Pro_T L2
ENSG00000116221 MRPL37 860158 sc-eQTL 9.22e-01 0.00831 0.0849 0.143 Pro_T L2
ENSG00000157216 SSBP3 630720 sc-eQTL 9.48e-02 0.159 0.0945 0.143 Pro_T L2
ENSG00000162402 USP24 -171165 sc-eQTL 1.30e-01 0.176 0.115 0.143 Pro_T L2
ENSG00000215883 CYB5RL 844163 sc-eQTL 1.60e-02 0.274 0.113 0.143 Pro_T L2
ENSG00000243725 TTC4 328338 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0931 0.127 0.143 Pro_T L2
ENSG00000006555 TTC22 242876 sc-eQTL 9.71e-01 0.00442 0.121 0.141 Treg L2
ENSG00000116205 TCEANC2 990615 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0275 0.13 0.141 Treg L2
ENSG00000116209 TMEM59 990695 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0507 0.103 0.141 Treg L2
ENSG00000116221 MRPL37 860158 sc-eQTL 7.48e-01 -0.041 0.127 0.141 Treg L2
ENSG00000157216 SSBP3 630720 sc-eQTL 3.38e-01 0.109 0.113 0.141 Treg L2
ENSG00000162402 USP24 -171165 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0385 0.108 0.141 Treg L2
ENSG00000243725 TTC4 328338 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0558 0.136 0.141 Treg L2
ENSG00000116133 DHCR24 157004 sc-eQTL 4.43e-01 0.0836 0.109 0.141 cDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 990615 sc-eQTL 2.14e-01 -0.159 0.128 0.141 cDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 990695 sc-eQTL 1.33e-01 -0.163 0.108 0.141 cDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 860158 sc-eQTL 2.86e-02 -0.304 0.138 0.141 cDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 630720 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0674 0.129 0.141 cDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 501942 sc-eQTL 6.07e-01 0.0616 0.12 0.141 cDC L2
ENSG00000162402 USP24 -171165 sc-eQTL 4.18e-01 0.109 0.134 0.141 cDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 844163 sc-eQTL 3.02e-01 0.119 0.115 0.141 cDC L2
ENSG00000243725 TTC4 328338 sc-eQTL 2.20e-01 -0.169 0.137 0.141 cDC L2
ENSG00000116133 DHCR24 157004 sc-eQTL 4.05e-01 0.0651 0.078 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000116205 TCEANC2 990615 sc-eQTL 2.22e-01 -0.132 0.108 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000116209 TMEM59 990695 sc-eQTL 5.30e-01 0.0414 0.0657 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000116221 MRPL37 860158 sc-eQTL 3.45e-02 0.247 0.116 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000157216 SSBP3 630720 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0351 0.12 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000162402 USP24 -171165 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0329 0.0884 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000243725 TTC4 328338 sc-eQTL 4.57e-01 -0.101 0.135 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000116133 DHCR24 157004 sc-eQTL 2.61e-01 -0.0827 0.0734 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000116205 TCEANC2 990615 sc-eQTL 5.07e-01 0.0746 0.112 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000116209 TMEM59 990695 sc-eQTL 6.12e-01 0.0456 0.0899 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000116221 MRPL37 860158 sc-eQTL 2.22e-01 0.159 0.13 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000157216 SSBP3 630720 sc-eQTL 6.02e-01 0.0703 0.135 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000162402 USP24 -171165 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0491 0.109 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000243725 TTC4 328338 sc-eQTL 6.41e-01 0.0639 0.137 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000006555 TTC22 242876 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0949 0.128 0.139 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 157004 sc-eQTL 2.79e-01 0.154 0.142 0.139 gdT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 990615 sc-eQTL 3.54e-01 -0.133 0.143 0.139 gdT L2
ENSG00000116209 TMEM59 990695 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0509 0.145 0.139 gdT L2
ENSG00000116221 MRPL37 860158 sc-eQTL 7.39e-02 0.296 0.165 0.139 gdT L2
ENSG00000157216 SSBP3 630720 sc-eQTL 1.36e-01 0.152 0.101 0.139 gdT L2
ENSG00000162402 USP24 -171165 sc-eQTL 5.33e-01 0.0855 0.137 0.139 gdT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 844163 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0785 0.142 0.139 gdT L2
ENSG00000243725 TTC4 328338 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0983 0.16 0.139 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 157004 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0325 0.0985 0.14 intMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 990615 sc-eQTL 3.15e-01 -0.123 0.122 0.14 intMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 990695 sc-eQTL 3.21e-02 -0.192 0.0891 0.14 intMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 860158 sc-eQTL 4.90e-01 0.0951 0.138 0.14 intMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 630720 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0287 0.141 0.14 intMono L2
ENSG00000162402 USP24 -171165 sc-eQTL 8.84e-01 0.0183 0.125 0.14 intMono L2
ENSG00000243725 TTC4 328338 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0306 0.134 0.14 intMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 157004 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00862 0.0975 0.138 ncMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 990615 sc-eQTL 3.41e-01 0.116 0.122 0.138 ncMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 990695 sc-eQTL 2.53e-01 -0.111 0.0972 0.138 ncMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 860158 sc-eQTL 3.60e-02 -0.263 0.124 0.138 ncMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 630720 sc-eQTL 1.14e-01 0.217 0.137 0.138 ncMono L2
ENSG00000162402 USP24 -171165 sc-eQTL 1.44e-01 -0.16 0.109 0.138 ncMono L2
ENSG00000243725 TTC4 328338 sc-eQTL 1.96e-01 0.168 0.13 0.138 ncMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 157004 sc-eQTL 6.83e-01 -0.047 0.115 0.144 pDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 990615 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0774 0.138 0.144 pDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 990695 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0301 0.11 0.144 pDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 860158 sc-eQTL 1.30e-02 0.36 0.143 0.144 pDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 630720 sc-eQTL 3.26e-01 0.128 0.129 0.144 pDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 501942 sc-eQTL 5.64e-01 0.0315 0.0545 0.144 pDC L2
ENSG00000162402 USP24 -171165 sc-eQTL 4.65e-01 0.0674 0.092 0.144 pDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 844163 sc-eQTL 9.77e-02 -0.208 0.125 0.144 pDC L2
ENSG00000243725 TTC4 328338 sc-eQTL 5.16e-01 0.0946 0.145 0.144 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 242876 sc-eQTL 4.27e-01 0.0994 0.125 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 157004 sc-eQTL 1.13e-01 -0.198 0.125 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 990615 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0686 0.121 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 990695 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0494 0.0943 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 860158 sc-eQTL 2.08e-01 0.142 0.113 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 630720 sc-eQTL 7.29e-01 0.0341 0.0982 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -171165 sc-eQTL 2.14e-01 -0.111 0.0893 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 844163 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0922 0.138 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 328338 sc-eQTL 4.19e-01 0.1 0.123 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 242876 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0969 0.131 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 157004 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00475 0.118 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 990615 sc-eQTL 8.36e-01 0.0222 0.107 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 990695 sc-eQTL 3.56e-01 0.0702 0.0759 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 860158 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0172 0.109 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 630720 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00939 0.0977 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -171165 sc-eQTL 1.15e-01 -0.132 0.0834 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 844163 sc-eQTL 2.59e-01 -0.15 0.132 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 328338 sc-eQTL 9.14e-02 0.21 0.124 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 157004 sc-eQTL 9.75e-01 0.0024 0.0759 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 990615 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0297 0.0949 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 990695 sc-eQTL 4.63e-01 0.0481 0.0654 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 860158 sc-eQTL 3.69e-02 0.241 0.115 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 630720 sc-eQTL 9.36e-01 0.00972 0.121 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -171165 sc-eQTL 3.33e-01 -0.0803 0.0828 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 328338 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0291 0.137 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 157004 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0214 0.0934 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 990615 sc-eQTL 4.36e-01 0.0956 0.123 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 990695 sc-eQTL 1.51e-01 -0.131 0.0908 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 860158 sc-eQTL 1.41e-01 -0.184 0.124 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 630720 sc-eQTL 4.56e-01 0.0994 0.133 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -171165 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0888 0.105 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 328338 sc-eQTL 3.17e-01 0.132 0.131 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 242876 sc-eQTL 5.99e-01 0.0567 0.108 0.142 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 157004 sc-eQTL 8.40e-01 0.0228 0.112 0.142 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 990615 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0494 0.11 0.142 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 990695 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0312 0.0853 0.142 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 860158 sc-eQTL 1.15e-01 -0.18 0.114 0.142 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 630720 sc-eQTL 1.31e-01 0.141 0.0933 0.142 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162398 LEXM 238136 sc-eQTL 8.89e-02 0.179 0.105 0.142 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -171165 sc-eQTL 1.32e-01 -0.101 0.0667 0.142 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 328338 sc-eQTL 3.31e-01 -0.116 0.119 0.142 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000169174 PCSK9 4651 pQTL 6.34e-05 -0.157 0.0392 0.0 0.0 0.135
ENSG00000169174 PCSK9 4651 eQTL 0.00707 -0.0648 0.024 0.0 0.0 0.132
ENSG00000215883 CYB5RL 844163 eQTL 0.0453 0.0544 0.0271 0.0 0.0 0.132

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000215883 CYB5RL 844163 2.67e-07 1.19e-07 3.72e-08 1.82e-07 8.92e-08 9.61e-08 1.44e-07 5.19e-08 1.44e-07 4.57e-08 1.6e-07 7.78e-08 1.41e-07 6.56e-08 5.84e-08 7.17e-08 3.9e-08 1.18e-07 5.36e-08 4.21e-08 1.08e-07 1.23e-07 1.34e-07 3.79e-08 1.32e-07 1.14e-07 1.08e-07 9.36e-08 1.05e-07 1.12e-07 9.91e-08 3.94e-08 3.3e-08 8.65e-08 8.96e-08 3.77e-08 5.01e-08 9.62e-08 7.2e-08 3e-08 4.46e-08 1.35e-07 4.33e-08 1.2e-08 6.92e-08 1.83e-08 1.22e-07 3.95e-09 4.73e-08