logo

Genes within 1Mb (chr1:55038913:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 237590 sc-eQTL 3.70e-01 -0.11 0.122 0.139 B L1
ENSG00000116133 DHCR24 151718 sc-eQTL 7.03e-02 -0.208 0.115 0.139 B L1
ENSG00000116205 TCEANC2 985329 sc-eQTL 6.38e-01 0.0469 0.0995 0.139 B L1
ENSG00000116209 TMEM59 985409 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00126 0.0607 0.139 B L1
ENSG00000116221 MRPL37 854872 sc-eQTL 4.37e-01 0.0617 0.0793 0.139 B L1
ENSG00000157216 SSBP3 625434 sc-eQTL 6.92e-01 -0.033 0.0831 0.139 B L1
ENSG00000162402 USP24 -176451 sc-eQTL 1.18e-02 -0.176 0.0694 0.139 B L1
ENSG00000215883 CYB5RL 838877 sc-eQTL 3.31e-01 -0.132 0.135 0.139 B L1
ENSG00000243725 TTC4 323052 sc-eQTL 7.23e-02 0.211 0.117 0.139 B L1
ENSG00000006555 TTC22 237590 sc-eQTL 6.71e-01 0.0411 0.0965 0.139 CD4T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 985329 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0487 0.0789 0.139 CD4T L1
ENSG00000116209 TMEM59 985409 sc-eQTL 2.79e-01 -0.0795 0.0733 0.139 CD4T L1
ENSG00000116221 MRPL37 854872 sc-eQTL 1.92e-01 0.133 0.101 0.139 CD4T L1
ENSG00000157216 SSBP3 625434 sc-eQTL 6.12e-02 0.158 0.0837 0.139 CD4T L1
ENSG00000162402 USP24 -176451 sc-eQTL 5.32e-01 -0.043 0.0687 0.139 CD4T L1
ENSG00000243725 TTC4 323052 sc-eQTL 8.06e-01 0.0254 0.103 0.139 CD4T L1
ENSG00000006555 TTC22 237590 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0183 0.0847 0.139 CD8T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 985329 sc-eQTL 4.37e-01 -0.082 0.105 0.139 CD8T L1
ENSG00000116209 TMEM59 985409 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0153 0.0732 0.139 CD8T L1
ENSG00000116221 MRPL37 854872 sc-eQTL 3.74e-02 0.209 0.0998 0.139 CD8T L1
ENSG00000157216 SSBP3 625434 sc-eQTL 2.04e-01 0.092 0.0722 0.139 CD8T L1
ENSG00000162402 USP24 -176451 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0547 0.07 0.139 CD8T L1
ENSG00000243725 TTC4 323052 sc-eQTL 3.28e-01 0.119 0.121 0.139 CD8T L1
ENSG00000116133 DHCR24 151718 sc-eQTL 7.88e-01 0.03 0.112 0.14 DC L1
ENSG00000116205 TCEANC2 985329 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0358 0.125 0.14 DC L1
ENSG00000116209 TMEM59 985409 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0728 0.0982 0.14 DC L1
ENSG00000116221 MRPL37 854872 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0653 0.132 0.14 DC L1
ENSG00000157216 SSBP3 625434 sc-eQTL 4.34e-01 0.0922 0.118 0.14 DC L1
ENSG00000162390 ACOT11 496656 sc-eQTL 7.30e-01 0.0391 0.113 0.14 DC L1
ENSG00000162402 USP24 -176451 sc-eQTL 2.25e-01 0.0828 0.0681 0.14 DC L1
ENSG00000215883 CYB5RL 838877 sc-eQTL 5.55e-01 -0.073 0.123 0.14 DC L1
ENSG00000243725 TTC4 323052 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0731 0.133 0.14 DC L1
ENSG00000116133 DHCR24 151718 sc-eQTL 8.12e-01 0.0193 0.0809 0.139 Mono L1
ENSG00000116205 TCEANC2 985329 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0291 0.0873 0.139 Mono L1
ENSG00000116209 TMEM59 985409 sc-eQTL 6.96e-01 0.0254 0.0648 0.139 Mono L1
ENSG00000116221 MRPL37 854872 sc-eQTL 1.99e-01 0.139 0.108 0.139 Mono L1
ENSG00000157216 SSBP3 625434 sc-eQTL 4.01e-01 0.104 0.124 0.139 Mono L1
ENSG00000162402 USP24 -176451 sc-eQTL 1.43e-01 -0.108 0.0737 0.139 Mono L1
ENSG00000243725 TTC4 323052 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00182 0.13 0.139 Mono L1
ENSG00000006555 TTC22 237590 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00575 0.11 0.139 NK L1
ENSG00000116133 DHCR24 151718 sc-eQTL 9.19e-01 0.0113 0.111 0.139 NK L1
ENSG00000116205 TCEANC2 985329 sc-eQTL 7.92e-01 -0.029 0.11 0.139 NK L1
ENSG00000116209 TMEM59 985409 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00125 0.0862 0.139 NK L1
ENSG00000116221 MRPL37 854872 sc-eQTL 4.11e-01 -0.088 0.107 0.139 NK L1
ENSG00000157216 SSBP3 625434 sc-eQTL 2.51e-01 0.107 0.0926 0.139 NK L1
ENSG00000162398 LEXM 232850 sc-eQTL 4.61e-02 0.207 0.103 0.139 NK L1
ENSG00000162402 USP24 -176451 sc-eQTL 3.70e-01 -0.0566 0.0631 0.139 NK L1
ENSG00000243725 TTC4 323052 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0226 0.12 0.139 NK L1
ENSG00000006555 TTC22 237590 sc-eQTL 8.43e-01 -0.02 0.101 0.139 Other_T L1
ENSG00000116133 DHCR24 151718 sc-eQTL 1.94e-01 0.101 0.0777 0.139 Other_T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 985329 sc-eQTL 3.97e-02 -0.239 0.116 0.139 Other_T L1
ENSG00000116209 TMEM59 985409 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0274 0.0801 0.139 Other_T L1
ENSG00000116221 MRPL37 854872 sc-eQTL 2.71e-02 0.165 0.0742 0.139 Other_T L1
ENSG00000157216 SSBP3 625434 sc-eQTL 6.13e-03 0.236 0.0853 0.139 Other_T L1
ENSG00000162402 USP24 -176451 sc-eQTL 6.03e-02 0.173 0.0917 0.139 Other_T L1
ENSG00000215883 CYB5RL 838877 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0824 0.126 0.139 Other_T L1
ENSG00000243725 TTC4 323052 sc-eQTL 5.60e-02 -0.24 0.125 0.139 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 237590 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0211 0.102 0.143 B_Activated L2
ENSG00000116133 DHCR24 151718 sc-eQTL 1.61e-01 -0.168 0.12 0.143 B_Activated L2
ENSG00000116205 TCEANC2 985329 sc-eQTL 9.37e-01 -0.0102 0.129 0.143 B_Activated L2
ENSG00000116209 TMEM59 985409 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0721 0.137 0.143 B_Activated L2
ENSG00000116221 MRPL37 854872 sc-eQTL 1.00e-01 0.243 0.147 0.143 B_Activated L2
ENSG00000157216 SSBP3 625434 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0474 0.134 0.143 B_Activated L2
ENSG00000162402 USP24 -176451 sc-eQTL 2.35e-02 -0.295 0.129 0.143 B_Activated L2
ENSG00000215883 CYB5RL 838877 sc-eQTL 7.82e-01 -0.032 0.115 0.143 B_Activated L2
ENSG00000243725 TTC4 323052 sc-eQTL 3.93e-01 0.107 0.125 0.143 B_Activated L2
ENSG00000006555 TTC22 237590 sc-eQTL 4.17e-01 0.108 0.133 0.137 B_Intermediate L2
ENSG00000116133 DHCR24 151718 sc-eQTL 1.39e-01 -0.182 0.123 0.137 B_Intermediate L2
ENSG00000116205 TCEANC2 985329 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0411 0.123 0.137 B_Intermediate L2
ENSG00000116209 TMEM59 985409 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0294 0.105 0.137 B_Intermediate L2
ENSG00000116221 MRPL37 854872 sc-eQTL 8.32e-01 0.0262 0.124 0.137 B_Intermediate L2
ENSG00000157216 SSBP3 625434 sc-eQTL 3.91e-01 -0.099 0.115 0.137 B_Intermediate L2
ENSG00000162402 USP24 -176451 sc-eQTL 2.71e-01 -0.107 0.0969 0.137 B_Intermediate L2
ENSG00000215883 CYB5RL 838877 sc-eQTL 2.20e-01 0.169 0.137 0.137 B_Intermediate L2
ENSG00000243725 TTC4 323052 sc-eQTL 5.06e-01 0.0832 0.125 0.137 B_Intermediate L2
ENSG00000006555 TTC22 237590 sc-eQTL 4.56e-01 0.0942 0.126 0.14 B_Memory L2
ENSG00000116133 DHCR24 151718 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0575 0.125 0.14 B_Memory L2
ENSG00000116205 TCEANC2 985329 sc-eQTL 4.97e-01 0.091 0.134 0.14 B_Memory L2
ENSG00000116209 TMEM59 985409 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0657 0.112 0.14 B_Memory L2
ENSG00000116221 MRPL37 854872 sc-eQTL 4.40e-01 0.0874 0.113 0.14 B_Memory L2
ENSG00000157216 SSBP3 625434 sc-eQTL 3.81e-01 0.0926 0.105 0.14 B_Memory L2
ENSG00000162402 USP24 -176451 sc-eQTL 9.86e-01 0.00183 0.103 0.14 B_Memory L2
ENSG00000215883 CYB5RL 838877 sc-eQTL 8.14e-02 -0.222 0.127 0.14 B_Memory L2
ENSG00000243725 TTC4 323052 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0391 0.132 0.14 B_Memory L2
ENSG00000006555 TTC22 237590 sc-eQTL 4.12e-01 -0.108 0.131 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000116133 DHCR24 151718 sc-eQTL 6.49e-01 -0.056 0.123 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 985329 sc-eQTL 7.13e-01 0.0403 0.11 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000116209 TMEM59 985409 sc-eQTL 7.09e-01 0.0297 0.0797 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000116221 MRPL37 854872 sc-eQTL 5.55e-01 0.0694 0.117 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000157216 SSBP3 625434 sc-eQTL 9.49e-01 -0.0071 0.112 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000162402 USP24 -176451 sc-eQTL 2.82e-01 -0.0949 0.0879 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 838877 sc-eQTL 3.99e-01 -0.112 0.133 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000243725 TTC4 323052 sc-eQTL 5.32e-02 0.231 0.119 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000006555 TTC22 237590 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00141 0.132 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000116133 DHCR24 151718 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0156 0.115 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 985329 sc-eQTL 6.63e-01 0.0555 0.127 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000116209 TMEM59 985409 sc-eQTL 2.87e-02 0.229 0.104 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000116221 MRPL37 854872 sc-eQTL 3.03e-01 -0.127 0.123 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000157216 SSBP3 625434 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0454 0.122 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000162402 USP24 -176451 sc-eQTL 2.10e-01 -0.121 0.0961 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 838877 sc-eQTL 2.87e-01 -0.144 0.135 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000243725 TTC4 323052 sc-eQTL 3.33e-01 0.137 0.141 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000006555 TTC22 237590 sc-eQTL 9.24e-03 0.319 0.121 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 985329 sc-eQTL 7.01e-01 0.0488 0.127 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 985409 sc-eQTL 8.92e-01 0.0157 0.116 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 854872 sc-eQTL 3.73e-01 0.127 0.142 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 625434 sc-eQTL 6.34e-01 0.0417 0.0874 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -176451 sc-eQTL 7.12e-01 0.0444 0.12 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 323052 sc-eQTL 9.89e-01 0.0018 0.134 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 237590 sc-eQTL 7.24e-01 0.0402 0.113 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 985329 sc-eQTL 8.82e-01 0.0128 0.0864 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 985409 sc-eQTL 1.92e-01 -0.11 0.0837 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 854872 sc-eQTL 2.56e-01 0.123 0.108 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 625434 sc-eQTL 1.39e-01 0.128 0.086 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -176451 sc-eQTL 2.41e-01 -0.0874 0.0743 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 323052 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000119 0.114 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 237590 sc-eQTL 2.96e-01 0.126 0.12 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 985329 sc-eQTL 8.41e-01 0.0234 0.117 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 985409 sc-eQTL 2.80e-01 -0.0954 0.088 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 854872 sc-eQTL 1.73e-01 0.151 0.11 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 625434 sc-eQTL 3.30e-01 0.106 0.109 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -176451 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0346 0.0901 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 323052 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0233 0.13 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 237590 sc-eQTL 9.93e-01 0.00117 0.138 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 985329 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0199 0.131 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 985409 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0252 0.101 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 854872 sc-eQTL 1.28e-01 0.198 0.129 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 625434 sc-eQTL 6.19e-02 0.208 0.111 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -176451 sc-eQTL 9.83e-01 -0.0022 0.102 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 323052 sc-eQTL 6.45e-02 0.247 0.133 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 237590 sc-eQTL 6.27e-01 0.0538 0.111 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 985329 sc-eQTL 5.02e-02 -0.239 0.122 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 985409 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0106 0.107 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 854872 sc-eQTL 4.15e-01 0.103 0.126 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 625434 sc-eQTL 3.70e-01 0.0775 0.0863 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -176451 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0678 0.0858 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 323052 sc-eQTL 3.94e-01 0.11 0.128 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 237590 sc-eQTL 4.22e-02 -0.249 0.122 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 985329 sc-eQTL 3.46e-01 -0.105 0.111 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 985409 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0224 0.109 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 854872 sc-eQTL 9.08e-02 0.22 0.13 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 625434 sc-eQTL 3.00e-01 0.102 0.0985 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -176451 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0743 0.0897 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 323052 sc-eQTL 6.03e-01 0.0684 0.131 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 237590 sc-eQTL 3.57e-01 -0.128 0.139 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 985329 sc-eQTL 1.13e-01 -0.221 0.139 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 985409 sc-eQTL 9.95e-01 0.000843 0.123 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 854872 sc-eQTL 9.63e-01 0.00641 0.14 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 625434 sc-eQTL 3.75e-01 0.107 0.121 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -176451 sc-eQTL 9.30e-01 0.0103 0.117 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 323052 sc-eQTL 4.30e-01 -0.113 0.142 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 237590 sc-eQTL 1.78e-01 0.176 0.13 0.139 CD8_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 985329 sc-eQTL 1.18e-01 0.212 0.135 0.139 CD8_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 985409 sc-eQTL 3.73e-01 -0.117 0.132 0.139 CD8_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 854872 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0304 0.134 0.139 CD8_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 625434 sc-eQTL 2.52e-01 0.145 0.126 0.139 CD8_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -176451 sc-eQTL 5.11e-01 0.0876 0.133 0.139 CD8_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 323052 sc-eQTL 4.58e-01 0.101 0.135 0.139 CD8_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 237590 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0139 0.119 0.139 MAIT L2
ENSG00000116133 DHCR24 151718 sc-eQTL 6.09e-02 0.165 0.0876 0.139 MAIT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 985329 sc-eQTL 1.45e-02 -0.302 0.123 0.139 MAIT L2
ENSG00000116209 TMEM59 985409 sc-eQTL 8.87e-01 -0.016 0.112 0.139 MAIT L2
ENSG00000116221 MRPL37 854872 sc-eQTL 1.15e-01 0.215 0.136 0.139 MAIT L2
ENSG00000157216 SSBP3 625434 sc-eQTL 1.54e-01 0.172 0.12 0.139 MAIT L2
ENSG00000162402 USP24 -176451 sc-eQTL 5.24e-01 0.0685 0.107 0.139 MAIT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 838877 sc-eQTL 5.43e-01 -0.076 0.125 0.139 MAIT L2
ENSG00000243725 TTC4 323052 sc-eQTL 1.79e-01 -0.166 0.124 0.139 MAIT L2
ENSG00000006555 TTC22 237590 sc-eQTL 7.90e-01 0.0361 0.135 0.138 NK_CD56bright L2
ENSG00000116133 DHCR24 151718 sc-eQTL 7.35e-01 0.0406 0.12 0.138 NK_CD56bright L2
ENSG00000116205 TCEANC2 985329 sc-eQTL 9.29e-01 -0.0112 0.126 0.138 NK_CD56bright L2
ENSG00000116209 TMEM59 985409 sc-eQTL 1.50e-01 0.177 0.123 0.138 NK_CD56bright L2
ENSG00000116221 MRPL37 854872 sc-eQTL 1.75e-01 0.187 0.137 0.138 NK_CD56bright L2
ENSG00000157216 SSBP3 625434 sc-eQTL 6.02e-01 0.0542 0.104 0.138 NK_CD56bright L2
ENSG00000162398 LEXM 232850 sc-eQTL 1.96e-01 0.158 0.122 0.138 NK_CD56bright L2
ENSG00000162402 USP24 -176451 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0729 0.105 0.138 NK_CD56bright L2
ENSG00000243725 TTC4 323052 sc-eQTL 5.44e-01 0.0807 0.133 0.138 NK_CD56bright L2
ENSG00000006555 TTC22 237590 sc-eQTL 5.69e-01 0.0642 0.113 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000116133 DHCR24 151718 sc-eQTL 3.29e-01 0.115 0.117 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000116205 TCEANC2 985329 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0148 0.127 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000116209 TMEM59 985409 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0548 0.0944 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000116221 MRPL37 854872 sc-eQTL 3.81e-02 -0.254 0.122 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000157216 SSBP3 625434 sc-eQTL 2.58e-01 0.114 0.1 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000162398 LEXM 232850 sc-eQTL 1.71e-01 0.158 0.115 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000162402 USP24 -176451 sc-eQTL 1.82e-01 -0.0981 0.0732 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000243725 TTC4 323052 sc-eQTL 1.59e-01 -0.177 0.125 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000006555 TTC22 237590 sc-eQTL 4.28e-01 0.107 0.134 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000116133 DHCR24 151718 sc-eQTL 4.58e-01 0.0974 0.131 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000116205 TCEANC2 985329 sc-eQTL 9.70e-01 0.0048 0.126 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000116209 TMEM59 985409 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0626 0.125 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000116221 MRPL37 854872 sc-eQTL 5.29e-01 0.0871 0.138 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000157216 SSBP3 625434 sc-eQTL 1.89e-01 0.148 0.112 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000162398 LEXM 232850 sc-eQTL 2.29e-01 0.153 0.127 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000162402 USP24 -176451 sc-eQTL 6.90e-01 0.0373 0.0934 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000243725 TTC4 323052 sc-eQTL 8.46e-01 0.0271 0.14 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000006555 TTC22 237590 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0673 0.12 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000116133 DHCR24 151718 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0106 0.121 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000116205 TCEANC2 985329 sc-eQTL 3.18e-01 -0.12 0.12 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000116209 TMEM59 985409 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0643 0.0976 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000116221 MRPL37 854872 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0804 0.12 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000157216 SSBP3 625434 sc-eQTL 8.84e-02 0.172 0.1 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000162398 LEXM 232850 sc-eQTL 3.95e-01 0.107 0.126 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000162402 USP24 -176451 sc-eQTL 3.01e-01 -0.089 0.0858 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000243725 TTC4 323052 sc-eQTL 9.53e-01 0.0076 0.128 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000006555 TTC22 237590 sc-eQTL 3.77e-01 -0.131 0.147 0.148 PB L2
ENSG00000116133 DHCR24 151718 sc-eQTL 2.96e-01 0.137 0.13 0.148 PB L2
ENSG00000116205 TCEANC2 985329 sc-eQTL 7.14e-01 0.0585 0.159 0.148 PB L2
ENSG00000116209 TMEM59 985409 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0195 0.0666 0.148 PB L2
ENSG00000116221 MRPL37 854872 sc-eQTL 2.82e-01 -0.13 0.12 0.148 PB L2
ENSG00000157216 SSBP3 625434 sc-eQTL 9.90e-01 0.00174 0.14 0.148 PB L2
ENSG00000162402 USP24 -176451 sc-eQTL 3.19e-01 -0.158 0.158 0.148 PB L2
ENSG00000215883 CYB5RL 838877 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0328 0.165 0.148 PB L2
ENSG00000243725 TTC4 323052 sc-eQTL 9.85e-02 0.253 0.152 0.148 PB L2
ENSG00000006555 TTC22 237590 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0805 0.121 0.141 Pro_T L2
ENSG00000116133 DHCR24 151718 sc-eQTL 4.15e-01 0.084 0.103 0.141 Pro_T L2
ENSG00000116205 TCEANC2 985329 sc-eQTL 8.06e-01 0.0309 0.126 0.141 Pro_T L2
ENSG00000116209 TMEM59 985409 sc-eQTL 4.74e-01 0.0625 0.0871 0.141 Pro_T L2
ENSG00000116221 MRPL37 854872 sc-eQTL 9.54e-01 0.00489 0.0854 0.141 Pro_T L2
ENSG00000157216 SSBP3 625434 sc-eQTL 4.70e-02 0.19 0.0948 0.141 Pro_T L2
ENSG00000162402 USP24 -176451 sc-eQTL 1.23e-01 0.18 0.116 0.141 Pro_T L2
ENSG00000215883 CYB5RL 838877 sc-eQTL 2.35e-02 0.26 0.114 0.141 Pro_T L2
ENSG00000243725 TTC4 323052 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0831 0.128 0.141 Pro_T L2
ENSG00000006555 TTC22 237590 sc-eQTL 8.24e-01 0.0272 0.122 0.139 Treg L2
ENSG00000116205 TCEANC2 985329 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0338 0.131 0.139 Treg L2
ENSG00000116209 TMEM59 985409 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0662 0.103 0.139 Treg L2
ENSG00000116221 MRPL37 854872 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0181 0.128 0.139 Treg L2
ENSG00000157216 SSBP3 625434 sc-eQTL 2.65e-01 0.127 0.114 0.139 Treg L2
ENSG00000162402 USP24 -176451 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0291 0.109 0.139 Treg L2
ENSG00000243725 TTC4 323052 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0572 0.137 0.139 Treg L2
ENSG00000116133 DHCR24 151718 sc-eQTL 6.86e-01 0.0444 0.11 0.139 cDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 985329 sc-eQTL 2.98e-01 -0.134 0.129 0.139 cDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 985409 sc-eQTL 1.68e-01 -0.151 0.109 0.139 cDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 854872 sc-eQTL 3.93e-02 -0.288 0.139 0.139 cDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 625434 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0381 0.13 0.139 cDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 496656 sc-eQTL 7.09e-01 0.0451 0.12 0.139 cDC L2
ENSG00000162402 USP24 -176451 sc-eQTL 3.25e-01 0.133 0.135 0.139 cDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 838877 sc-eQTL 2.60e-01 0.131 0.116 0.139 cDC L2
ENSG00000243725 TTC4 323052 sc-eQTL 1.30e-01 -0.21 0.138 0.139 cDC L2
ENSG00000116133 DHCR24 151718 sc-eQTL 3.20e-01 0.0782 0.0784 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000116205 TCEANC2 985329 sc-eQTL 2.50e-01 -0.126 0.109 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000116209 TMEM59 985409 sc-eQTL 4.84e-01 0.0463 0.0661 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000116221 MRPL37 854872 sc-eQTL 6.82e-02 0.214 0.117 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000157216 SSBP3 625434 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00332 0.12 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000162402 USP24 -176451 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0451 0.0889 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000243725 TTC4 323052 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0704 0.136 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000116133 DHCR24 151718 sc-eQTL 2.42e-01 -0.0867 0.0739 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000116205 TCEANC2 985329 sc-eQTL 4.68e-01 0.082 0.113 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000116209 TMEM59 985409 sc-eQTL 7.57e-01 0.0281 0.0905 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000116221 MRPL37 854872 sc-eQTL 2.09e-01 0.164 0.13 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000157216 SSBP3 625434 sc-eQTL 4.78e-01 0.0963 0.135 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000162402 USP24 -176451 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0674 0.11 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000243725 TTC4 323052 sc-eQTL 6.39e-01 0.0646 0.137 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000006555 TTC22 237590 sc-eQTL 4.22e-01 -0.104 0.129 0.136 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 151718 sc-eQTL 2.94e-01 0.151 0.143 0.136 gdT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 985329 sc-eQTL 3.67e-01 -0.13 0.144 0.136 gdT L2
ENSG00000116209 TMEM59 985409 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0524 0.146 0.136 gdT L2
ENSG00000116221 MRPL37 854872 sc-eQTL 7.53e-02 0.298 0.166 0.136 gdT L2
ENSG00000157216 SSBP3 625434 sc-eQTL 9.62e-02 0.171 0.102 0.136 gdT L2
ENSG00000162402 USP24 -176451 sc-eQTL 5.12e-01 0.0907 0.138 0.136 gdT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 838877 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0538 0.144 0.136 gdT L2
ENSG00000243725 TTC4 323052 sc-eQTL 4.42e-01 -0.124 0.161 0.136 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 151718 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0155 0.0992 0.138 intMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 985329 sc-eQTL 1.98e-01 -0.159 0.123 0.138 intMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 985409 sc-eQTL 4.59e-02 -0.18 0.0899 0.138 intMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 854872 sc-eQTL 3.59e-01 0.127 0.139 0.138 intMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 625434 sc-eQTL 9.81e-01 0.00339 0.142 0.138 intMono L2
ENSG00000162402 USP24 -176451 sc-eQTL 8.19e-01 0.0289 0.126 0.138 intMono L2
ENSG00000243725 TTC4 323052 sc-eQTL 9.93e-01 -0.00121 0.135 0.138 intMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 151718 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0101 0.0979 0.136 ncMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 985329 sc-eQTL 3.79e-01 0.108 0.122 0.136 ncMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 985409 sc-eQTL 2.06e-01 -0.124 0.0976 0.136 ncMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 854872 sc-eQTL 4.69e-02 -0.25 0.125 0.136 ncMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 625434 sc-eQTL 8.98e-02 0.234 0.137 0.136 ncMono L2
ENSG00000162402 USP24 -176451 sc-eQTL 1.77e-01 -0.149 0.11 0.136 ncMono L2
ENSG00000243725 TTC4 323052 sc-eQTL 2.45e-01 0.152 0.13 0.136 ncMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 151718 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0452 0.116 0.141 pDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 985329 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0668 0.139 0.141 pDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 985409 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0361 0.111 0.141 pDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 854872 sc-eQTL 6.86e-03 0.395 0.144 0.141 pDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 625434 sc-eQTL 2.46e-01 0.152 0.13 0.141 pDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 496656 sc-eQTL 5.44e-01 0.0335 0.055 0.141 pDC L2
ENSG00000162402 USP24 -176451 sc-eQTL 6.62e-01 0.0407 0.093 0.141 pDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 838877 sc-eQTL 1.33e-01 -0.191 0.126 0.141 pDC L2
ENSG00000243725 TTC4 323052 sc-eQTL 5.42e-01 0.0896 0.147 0.141 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 237590 sc-eQTL 4.52e-01 0.0946 0.126 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 151718 sc-eQTL 1.42e-01 -0.185 0.126 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 985329 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0579 0.122 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 985409 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0601 0.0948 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 854872 sc-eQTL 1.62e-01 0.159 0.113 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 625434 sc-eQTL 8.78e-01 0.0152 0.0989 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -176451 sc-eQTL 1.56e-01 -0.128 0.0897 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 838877 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0973 0.138 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 323052 sc-eQTL 4.33e-01 0.0975 0.124 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 237590 sc-eQTL 3.96e-01 -0.112 0.132 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 151718 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00637 0.119 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 985329 sc-eQTL 7.30e-01 0.0372 0.108 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 985409 sc-eQTL 2.73e-01 0.0838 0.0762 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 854872 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0249 0.11 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 625434 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0195 0.0983 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -176451 sc-eQTL 1.42e-01 -0.124 0.0839 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 838877 sc-eQTL 2.05e-01 -0.169 0.133 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 323052 sc-eQTL 7.64e-02 0.222 0.125 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 151718 sc-eQTL 8.77e-01 0.0119 0.0763 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 985329 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0188 0.0955 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 985409 sc-eQTL 4.88e-01 0.0457 0.0658 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 854872 sc-eQTL 5.55e-02 0.223 0.116 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 625434 sc-eQTL 7.32e-01 0.0419 0.122 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -176451 sc-eQTL 2.40e-01 -0.0981 0.0832 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 323052 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00708 0.138 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 151718 sc-eQTL 8.73e-01 -0.015 0.0938 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 985329 sc-eQTL 5.62e-01 0.0715 0.123 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 985409 sc-eQTL 1.35e-01 -0.137 0.0912 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 854872 sc-eQTL 1.97e-01 -0.162 0.125 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 625434 sc-eQTL 3.62e-01 0.122 0.134 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -176451 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0747 0.105 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 323052 sc-eQTL 3.38e-01 0.127 0.132 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 237590 sc-eQTL 6.67e-01 0.0467 0.108 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 151718 sc-eQTL 7.26e-01 0.0397 0.113 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 985329 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0489 0.111 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 985409 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0364 0.0859 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 854872 sc-eQTL 1.15e-01 -0.181 0.114 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 625434 sc-eQTL 9.59e-02 0.157 0.0938 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162398 LEXM 232850 sc-eQTL 8.44e-02 0.183 0.106 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -176451 sc-eQTL 1.96e-01 -0.0872 0.0672 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 323052 sc-eQTL 2.60e-01 -0.135 0.12 0.14 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000169174 PCSK9 -635 pQTL 9.25e-05 -0.154 0.0393 0.0 0.0 0.133
ENSG00000169174 PCSK9 -635 eQTL 0.0058 -0.0667 0.0241 0.0 0.0 0.131
ENSG00000215883 CYB5RL 838877 eQTL 0.0324 0.0584 0.0272 0.0 0.0 0.131

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000215883 CYB5RL 838877 2.76e-07 1.33e-07 6.42e-08 2.44e-07 9.87e-08 7.75e-08 2.24e-07 5.62e-08 1.45e-07 6.4e-08 1.61e-07 1.08e-07 1.79e-07 8.66e-08 6.25e-08 7.97e-08 4.45e-08 1.77e-07 7.16e-08 8.69e-08 1.22e-07 1.47e-07 1.69e-07 3.58e-08 2.37e-07 1.26e-07 1.17e-07 1.26e-07 1.34e-07 9.49e-08 1.14e-07 8.48e-08 4.86e-08 9.08e-08 1.16e-07 3.49e-08 5.76e-08 7.51e-08 6.21e-08 6.92e-08 3.6e-08 1.59e-07 3.4e-08 5.7e-08 3.42e-08 1.3e-08 8.61e-08 2.02e-09 4.9e-08