logo

Genes within 1Mb (chr1:55033909:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 232586 sc-eQTL 2.44e-01 -0.14 0.12 0.13 B L1
ENSG00000116133 DHCR24 146714 sc-eQTL 1.92e-01 -0.149 0.114 0.13 B L1
ENSG00000116205 TCEANC2 980325 sc-eQTL 4.53e-01 0.0738 0.0983 0.13 B L1
ENSG00000116209 TMEM59 980405 sc-eQTL 6.30e-02 -0.111 0.0595 0.13 B L1
ENSG00000116221 MRPL37 849868 sc-eQTL 8.48e-01 0.015 0.0784 0.13 B L1
ENSG00000157216 SSBP3 620430 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0628 0.082 0.13 B L1
ENSG00000162402 USP24 -181455 sc-eQTL 2.72e-02 -0.153 0.0688 0.13 B L1
ENSG00000215883 CYB5RL 833873 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0707 0.134 0.13 B L1
ENSG00000243725 TTC4 318048 sc-eQTL 3.47e-01 0.11 0.116 0.13 B L1
ENSG00000006555 TTC22 232586 sc-eQTL 5.10e-01 0.062 0.094 0.13 CD4T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 980325 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0688 0.0768 0.13 CD4T L1
ENSG00000116209 TMEM59 980405 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0585 0.0716 0.13 CD4T L1
ENSG00000116221 MRPL37 849868 sc-eQTL 5.32e-01 0.0619 0.099 0.13 CD4T L1
ENSG00000157216 SSBP3 620430 sc-eQTL 3.58e-02 0.172 0.0814 0.13 CD4T L1
ENSG00000162402 USP24 -181455 sc-eQTL 6.45e-01 0.031 0.067 0.13 CD4T L1
ENSG00000243725 TTC4 318048 sc-eQTL 4.78e-01 0.0716 0.101 0.13 CD4T L1
ENSG00000006555 TTC22 232586 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0342 0.0823 0.13 CD8T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 980325 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0932 0.102 0.13 CD8T L1
ENSG00000116209 TMEM59 980405 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0118 0.0712 0.13 CD8T L1
ENSG00000116221 MRPL37 849868 sc-eQTL 5.28e-01 0.0619 0.0979 0.13 CD8T L1
ENSG00000157216 SSBP3 620430 sc-eQTL 5.56e-01 0.0415 0.0703 0.13 CD8T L1
ENSG00000162402 USP24 -181455 sc-eQTL 8.39e-01 0.0138 0.0681 0.13 CD8T L1
ENSG00000243725 TTC4 318048 sc-eQTL 5.20e-01 0.0761 0.118 0.13 CD8T L1
ENSG00000116133 DHCR24 146714 sc-eQTL 2.43e-01 0.126 0.108 0.133 DC L1
ENSG00000116205 TCEANC2 980325 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00614 0.121 0.133 DC L1
ENSG00000116209 TMEM59 980405 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0155 0.095 0.133 DC L1
ENSG00000116221 MRPL37 849868 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0226 0.128 0.133 DC L1
ENSG00000157216 SSBP3 620430 sc-eQTL 7.21e-01 0.0407 0.114 0.133 DC L1
ENSG00000162390 ACOT11 491652 sc-eQTL 2.41e-01 0.128 0.109 0.133 DC L1
ENSG00000162402 USP24 -181455 sc-eQTL 3.13e-02 0.142 0.0653 0.133 DC L1
ENSG00000215883 CYB5RL 833873 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0483 0.119 0.133 DC L1
ENSG00000243725 TTC4 318048 sc-eQTL 7.92e-01 -0.034 0.128 0.133 DC L1
ENSG00000116133 DHCR24 146714 sc-eQTL 2.46e-01 0.0927 0.0797 0.13 Mono L1
ENSG00000116205 TCEANC2 980325 sc-eQTL 8.97e-01 0.0112 0.0862 0.13 Mono L1
ENSG00000116209 TMEM59 980405 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0274 0.064 0.13 Mono L1
ENSG00000116221 MRPL37 849868 sc-eQTL 1.18e-01 0.167 0.107 0.13 Mono L1
ENSG00000157216 SSBP3 620430 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0128 0.123 0.13 Mono L1
ENSG00000162402 USP24 -181455 sc-eQTL 9.96e-01 0.000387 0.0732 0.13 Mono L1
ENSG00000243725 TTC4 318048 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0837 0.129 0.13 Mono L1
ENSG00000006555 TTC22 232586 sc-eQTL 5.25e-01 0.0692 0.109 0.131 NK L1
ENSG00000116133 DHCR24 146714 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00802 0.11 0.131 NK L1
ENSG00000116205 TCEANC2 980325 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00489 0.108 0.131 NK L1
ENSG00000116209 TMEM59 980405 sc-eQTL 6.80e-01 -0.035 0.0849 0.131 NK L1
ENSG00000116221 MRPL37 849868 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0535 0.105 0.131 NK L1
ENSG00000157216 SSBP3 620430 sc-eQTL 1.68e-01 0.126 0.0911 0.131 NK L1
ENSG00000162398 LEXM 227846 sc-eQTL 2.67e-02 0.227 0.101 0.131 NK L1
ENSG00000162402 USP24 -181455 sc-eQTL 1.51e-01 -0.0893 0.062 0.131 NK L1
ENSG00000243725 TTC4 318048 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0428 0.118 0.131 NK L1
ENSG00000006555 TTC22 232586 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0487 0.0993 0.13 Other_T L1
ENSG00000116133 DHCR24 146714 sc-eQTL 1.03e-01 0.125 0.0766 0.13 Other_T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 980325 sc-eQTL 1.95e-01 -0.149 0.115 0.13 Other_T L1
ENSG00000116209 TMEM59 980405 sc-eQTL 8.44e-01 0.0155 0.0792 0.13 Other_T L1
ENSG00000116221 MRPL37 849868 sc-eQTL 2.17e-02 0.169 0.0733 0.13 Other_T L1
ENSG00000157216 SSBP3 620430 sc-eQTL 4.70e-02 0.17 0.085 0.13 Other_T L1
ENSG00000162402 USP24 -181455 sc-eQTL 1.83e-01 0.121 0.091 0.13 Other_T L1
ENSG00000215883 CYB5RL 833873 sc-eQTL 9.67e-01 0.00525 0.125 0.13 Other_T L1
ENSG00000243725 TTC4 318048 sc-eQTL 2.43e-01 -0.145 0.124 0.13 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 232586 sc-eQTL 4.78e-01 0.0758 0.107 0.12 B_Activated L2
ENSG00000116133 DHCR24 146714 sc-eQTL 5.31e-02 -0.242 0.124 0.12 B_Activated L2
ENSG00000116205 TCEANC2 980325 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00218 0.135 0.12 B_Activated L2
ENSG00000116209 TMEM59 980405 sc-eQTL 3.84e-01 -0.125 0.143 0.12 B_Activated L2
ENSG00000116221 MRPL37 849868 sc-eQTL 4.91e-01 0.106 0.154 0.12 B_Activated L2
ENSG00000157216 SSBP3 620430 sc-eQTL 8.75e-01 -0.022 0.14 0.12 B_Activated L2
ENSG00000162402 USP24 -181455 sc-eQTL 7.88e-02 -0.239 0.135 0.12 B_Activated L2
ENSG00000215883 CYB5RL 833873 sc-eQTL 3.43e-01 -0.114 0.12 0.12 B_Activated L2
ENSG00000243725 TTC4 318048 sc-eQTL 8.07e-02 0.228 0.13 0.12 B_Activated L2
ENSG00000006555 TTC22 232586 sc-eQTL 7.30e-01 -0.045 0.13 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000116133 DHCR24 146714 sc-eQTL 1.38e-01 -0.179 0.12 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000116205 TCEANC2 980325 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0587 0.12 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000116209 TMEM59 980405 sc-eQTL 9.73e-01 0.0035 0.103 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000116221 MRPL37 849868 sc-eQTL 7.21e-01 0.0433 0.121 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000157216 SSBP3 620430 sc-eQTL 9.80e-01 0.00291 0.113 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000162402 USP24 -181455 sc-eQTL 1.50e-01 -0.137 0.0951 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000215883 CYB5RL 833873 sc-eQTL 3.95e-01 0.115 0.135 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000243725 TTC4 318048 sc-eQTL 5.46e-01 0.0743 0.123 0.129 B_Intermediate L2
ENSG00000006555 TTC22 232586 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0809 0.123 0.131 B_Memory L2
ENSG00000116133 DHCR24 146714 sc-eQTL 1.42e-01 -0.179 0.121 0.131 B_Memory L2
ENSG00000116205 TCEANC2 980325 sc-eQTL 5.14e-01 0.0851 0.13 0.131 B_Memory L2
ENSG00000116209 TMEM59 980405 sc-eQTL 8.37e-02 -0.188 0.108 0.131 B_Memory L2
ENSG00000116221 MRPL37 849868 sc-eQTL 3.48e-01 0.104 0.11 0.131 B_Memory L2
ENSG00000157216 SSBP3 620430 sc-eQTL 5.24e-01 0.0655 0.103 0.131 B_Memory L2
ENSG00000162402 USP24 -181455 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0661 0.101 0.131 B_Memory L2
ENSG00000215883 CYB5RL 833873 sc-eQTL 1.53e-01 -0.177 0.124 0.131 B_Memory L2
ENSG00000243725 TTC4 318048 sc-eQTL 4.26e-01 -0.103 0.129 0.131 B_Memory L2
ENSG00000006555 TTC22 232586 sc-eQTL 9.93e-02 -0.215 0.13 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000116133 DHCR24 146714 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0272 0.123 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 980325 sc-eQTL 3.05e-01 0.112 0.109 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000116209 TMEM59 980405 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0206 0.0795 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000116221 MRPL37 849868 sc-eQTL 8.02e-01 0.0295 0.117 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000157216 SSBP3 620430 sc-eQTL 7.70e-01 0.0326 0.112 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000162402 USP24 -181455 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0648 0.0878 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 833873 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00844 0.133 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000243725 TTC4 318048 sc-eQTL 1.09e-01 0.192 0.119 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000006555 TTC22 232586 sc-eQTL 4.44e-01 0.101 0.131 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000116133 DHCR24 146714 sc-eQTL 8.85e-01 0.0165 0.114 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 980325 sc-eQTL 7.02e-01 0.0486 0.127 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000116209 TMEM59 980405 sc-eQTL 2.74e-01 0.114 0.104 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000116221 MRPL37 849868 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0833 0.123 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000157216 SSBP3 620430 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0612 0.121 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000162402 USP24 -181455 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0622 0.0959 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 833873 sc-eQTL 2.39e-01 -0.159 0.135 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000243725 TTC4 318048 sc-eQTL 7.85e-01 0.0385 0.141 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000006555 TTC22 232586 sc-eQTL 3.06e-02 0.259 0.119 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 980325 sc-eQTL 8.22e-02 0.215 0.123 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 980405 sc-eQTL 3.73e-01 0.1 0.113 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 849868 sc-eQTL 3.02e-01 0.143 0.138 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 620430 sc-eQTL 7.96e-01 0.0221 0.0853 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -181455 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00787 0.117 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 318048 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00603 0.131 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 232586 sc-eQTL 7.82e-01 0.0306 0.111 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 980325 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0233 0.0842 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 980405 sc-eQTL 2.75e-01 -0.0894 0.0817 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 849868 sc-eQTL 5.56e-01 0.0622 0.105 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 620430 sc-eQTL 4.99e-02 0.165 0.0835 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -181455 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0336 0.0727 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 318048 sc-eQTL 3.96e-01 0.0942 0.111 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 232586 sc-eQTL 5.32e-02 0.225 0.116 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 980325 sc-eQTL 9.02e-01 -0.014 0.114 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 980405 sc-eQTL 2.80e-01 -0.0926 0.0854 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 849868 sc-eQTL 2.45e-02 0.241 0.106 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 620430 sc-eQTL 9.71e-01 0.00385 0.106 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -181455 sc-eQTL 8.97e-01 0.0113 0.0875 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 318048 sc-eQTL 9.25e-01 0.0118 0.126 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 232586 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0571 0.134 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 980325 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0898 0.127 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 980405 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0231 0.0987 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 849868 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0264 0.127 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 620430 sc-eQTL 4.09e-01 0.09 0.109 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -181455 sc-eQTL 5.02e-01 0.0666 0.099 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 318048 sc-eQTL 3.95e-01 0.112 0.131 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 232586 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0275 0.109 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 980325 sc-eQTL 1.80e-02 -0.284 0.119 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 980405 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00552 0.105 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 849868 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0241 0.124 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 620430 sc-eQTL 7.16e-01 0.031 0.085 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -181455 sc-eQTL 9.96e-01 0.000456 0.0845 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 318048 sc-eQTL 7.39e-01 0.0422 0.126 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 232586 sc-eQTL 1.20e-01 -0.185 0.118 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 980325 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0322 0.108 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 980405 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00422 0.105 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 849868 sc-eQTL 4.73e-01 0.0908 0.126 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 620430 sc-eQTL 7.44e-01 0.0312 0.0955 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -181455 sc-eQTL 8.93e-01 0.0117 0.0869 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 318048 sc-eQTL 7.70e-01 0.0372 0.127 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 232586 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0471 0.13 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 980325 sc-eQTL 3.85e-01 -0.113 0.13 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 980405 sc-eQTL 5.80e-01 0.0636 0.115 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 849868 sc-eQTL 4.05e-01 0.108 0.13 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 620430 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0958 0.113 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -181455 sc-eQTL 6.21e-01 0.0543 0.109 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 318048 sc-eQTL 6.38e-02 -0.246 0.132 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 232586 sc-eQTL 4.93e-01 0.0891 0.13 0.13 CD8_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 980325 sc-eQTL 5.49e-01 0.0813 0.135 0.13 CD8_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 980405 sc-eQTL 5.02e-01 -0.088 0.131 0.13 CD8_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 849868 sc-eQTL 8.15e-01 0.031 0.133 0.13 CD8_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 620430 sc-eQTL 5.33e-01 0.0785 0.126 0.13 CD8_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -181455 sc-eQTL 7.36e-01 0.0447 0.132 0.13 CD8_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 318048 sc-eQTL 2.26e-01 0.163 0.134 0.13 CD8_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 232586 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0445 0.118 0.132 MAIT L2
ENSG00000116133 DHCR24 146714 sc-eQTL 5.26e-01 0.0553 0.087 0.132 MAIT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 980325 sc-eQTL 2.27e-01 -0.148 0.122 0.132 MAIT L2
ENSG00000116209 TMEM59 980405 sc-eQTL 8.51e-01 0.0208 0.111 0.132 MAIT L2
ENSG00000116221 MRPL37 849868 sc-eQTL 3.09e-02 0.289 0.133 0.132 MAIT L2
ENSG00000157216 SSBP3 620430 sc-eQTL 8.45e-01 0.0233 0.119 0.132 MAIT L2
ENSG00000162402 USP24 -181455 sc-eQTL 5.12e-01 0.0695 0.106 0.132 MAIT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 833873 sc-eQTL 2.42e-01 -0.144 0.123 0.132 MAIT L2
ENSG00000243725 TTC4 318048 sc-eQTL 4.82e-01 -0.086 0.122 0.132 MAIT L2
ENSG00000006555 TTC22 232586 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0173 0.133 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000116133 DHCR24 146714 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0702 0.117 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000116205 TCEANC2 980325 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0422 0.124 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000116209 TMEM59 980405 sc-eQTL 1.06e-01 0.195 0.12 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000116221 MRPL37 849868 sc-eQTL 4.59e-02 0.268 0.133 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000157216 SSBP3 620430 sc-eQTL 7.20e-01 0.0364 0.102 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000162398 LEXM 227846 sc-eQTL 1.98e-01 0.154 0.119 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000162402 USP24 -181455 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0709 0.103 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000243725 TTC4 318048 sc-eQTL 6.42e-02 0.24 0.129 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000006555 TTC22 232586 sc-eQTL 4.15e-01 0.0898 0.11 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000116133 DHCR24 146714 sc-eQTL 2.80e-01 0.124 0.115 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000116205 TCEANC2 980325 sc-eQTL 7.65e-01 0.0373 0.124 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000116209 TMEM59 980405 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0613 0.0922 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000116221 MRPL37 849868 sc-eQTL 1.68e-01 -0.165 0.12 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000157216 SSBP3 620430 sc-eQTL 2.47e-01 0.114 0.098 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000162398 LEXM 227846 sc-eQTL 1.04e-01 0.184 0.112 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000162402 USP24 -181455 sc-eQTL 5.68e-02 -0.136 0.0712 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000243725 TTC4 318048 sc-eQTL 1.89e-01 -0.161 0.122 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000006555 TTC22 232586 sc-eQTL 8.30e-01 0.0279 0.13 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000116133 DHCR24 146714 sc-eQTL 7.93e-01 0.0332 0.126 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000116205 TCEANC2 980325 sc-eQTL 6.33e-01 0.0582 0.122 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000116209 TMEM59 980405 sc-eQTL 8.64e-01 0.0207 0.121 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000116221 MRPL37 849868 sc-eQTL 4.48e-01 0.101 0.133 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000157216 SSBP3 620430 sc-eQTL 2.75e-01 0.119 0.109 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000162398 LEXM 227846 sc-eQTL 5.11e-01 0.0807 0.123 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000162402 USP24 -181455 sc-eQTL 3.05e-01 -0.0925 0.0899 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000243725 TTC4 318048 sc-eQTL 5.13e-01 0.088 0.134 0.13 NK_HLA L2
ENSG00000006555 TTC22 232586 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00854 0.117 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000116133 DHCR24 146714 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0684 0.118 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000116205 TCEANC2 980325 sc-eQTL 1.91e-01 -0.154 0.117 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000116209 TMEM59 980405 sc-eQTL 4.97e-02 -0.187 0.0946 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000116221 MRPL37 849868 sc-eQTL 2.54e-01 -0.134 0.117 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000157216 SSBP3 620430 sc-eQTL 9.88e-02 0.163 0.0981 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000162398 LEXM 227846 sc-eQTL 4.76e-01 0.088 0.123 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000162402 USP24 -181455 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0624 0.084 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000243725 TTC4 318048 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0171 0.125 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000006555 TTC22 232586 sc-eQTL 4.39e-01 -0.113 0.146 0.133 PB L2
ENSG00000116133 DHCR24 146714 sc-eQTL 6.44e-01 0.0602 0.13 0.133 PB L2
ENSG00000116205 TCEANC2 980325 sc-eQTL 9.46e-01 -0.0107 0.158 0.133 PB L2
ENSG00000116209 TMEM59 980405 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0275 0.0661 0.133 PB L2
ENSG00000116221 MRPL37 849868 sc-eQTL 2.23e-01 -0.146 0.119 0.133 PB L2
ENSG00000157216 SSBP3 620430 sc-eQTL 4.30e-01 -0.109 0.138 0.133 PB L2
ENSG00000162402 USP24 -181455 sc-eQTL 1.93e-01 -0.205 0.156 0.133 PB L2
ENSG00000215883 CYB5RL 833873 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0888 0.163 0.133 PB L2
ENSG00000243725 TTC4 318048 sc-eQTL 2.42e-01 0.178 0.152 0.133 PB L2
ENSG00000006555 TTC22 232586 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0335 0.12 0.13 Pro_T L2
ENSG00000116133 DHCR24 146714 sc-eQTL 6.14e-01 0.0516 0.102 0.13 Pro_T L2
ENSG00000116205 TCEANC2 980325 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0936 0.124 0.13 Pro_T L2
ENSG00000116209 TMEM59 980405 sc-eQTL 9.63e-01 0.00396 0.0864 0.13 Pro_T L2
ENSG00000116221 MRPL37 849868 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0376 0.0846 0.13 Pro_T L2
ENSG00000157216 SSBP3 620430 sc-eQTL 7.03e-03 0.254 0.0932 0.13 Pro_T L2
ENSG00000162402 USP24 -181455 sc-eQTL 3.48e-01 0.109 0.115 0.13 Pro_T L2
ENSG00000215883 CYB5RL 833873 sc-eQTL 9.51e-03 0.294 0.112 0.13 Pro_T L2
ENSG00000243725 TTC4 318048 sc-eQTL 7.36e-01 0.043 0.127 0.13 Pro_T L2
ENSG00000006555 TTC22 232586 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0194 0.119 0.13 Treg L2
ENSG00000116205 TCEANC2 980325 sc-eQTL 6.43e-01 -0.059 0.127 0.13 Treg L2
ENSG00000116209 TMEM59 980405 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0203 0.101 0.13 Treg L2
ENSG00000116221 MRPL37 849868 sc-eQTL 3.45e-01 -0.118 0.124 0.13 Treg L2
ENSG00000157216 SSBP3 620430 sc-eQTL 1.51e-01 0.159 0.111 0.13 Treg L2
ENSG00000162402 USP24 -181455 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0861 0.106 0.13 Treg L2
ENSG00000243725 TTC4 318048 sc-eQTL 6.46e-01 0.0612 0.133 0.13 Treg L2
ENSG00000116133 DHCR24 146714 sc-eQTL 5.32e-01 0.0668 0.107 0.129 cDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 980325 sc-eQTL 6.63e-01 -0.055 0.126 0.129 cDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 980405 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0835 0.107 0.129 cDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 849868 sc-eQTL 1.23e-01 -0.21 0.136 0.129 cDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 620430 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0777 0.126 0.129 cDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 491652 sc-eQTL 3.28e-01 0.115 0.117 0.129 cDC L2
ENSG00000162402 USP24 -181455 sc-eQTL 1.09e-01 0.211 0.131 0.129 cDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 833873 sc-eQTL 1.42e-01 0.165 0.112 0.129 cDC L2
ENSG00000243725 TTC4 318048 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0732 0.135 0.129 cDC L2
ENSG00000116133 DHCR24 146714 sc-eQTL 4.22e-01 0.0624 0.0775 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000116205 TCEANC2 980325 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00657 0.108 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000116209 TMEM59 980405 sc-eQTL 8.69e-01 0.0108 0.0654 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000116221 MRPL37 849868 sc-eQTL 3.89e-02 0.24 0.115 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000157216 SSBP3 620430 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0929 0.119 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000162402 USP24 -181455 sc-eQTL 3.59e-01 0.0806 0.0877 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000243725 TTC4 318048 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0202 0.134 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000116133 DHCR24 146714 sc-eQTL 9.14e-01 0.0078 0.0725 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000116205 TCEANC2 980325 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00641 0.111 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000116209 TMEM59 980405 sc-eQTL 2.02e-01 -0.113 0.0882 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000116221 MRPL37 849868 sc-eQTL 1.98e-01 0.165 0.127 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000157216 SSBP3 620430 sc-eQTL 7.18e-01 0.0481 0.133 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000162402 USP24 -181455 sc-eQTL 7.22e-01 0.0384 0.107 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000243725 TTC4 318048 sc-eQTL 9.57e-01 -0.0072 0.135 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000006555 TTC22 232586 sc-eQTL 4.04e-01 -0.101 0.121 0.136 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 146714 sc-eQTL 1.49e-01 0.195 0.135 0.136 gdT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 980325 sc-eQTL 5.37e-01 -0.084 0.136 0.136 gdT L2
ENSG00000116209 TMEM59 980405 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0197 0.138 0.136 gdT L2
ENSG00000116221 MRPL37 849868 sc-eQTL 6.76e-01 0.0663 0.158 0.136 gdT L2
ENSG00000157216 SSBP3 620430 sc-eQTL 6.90e-02 0.176 0.0958 0.136 gdT L2
ENSG00000162402 USP24 -181455 sc-eQTL 2.24e-01 0.158 0.13 0.136 gdT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 833873 sc-eQTL 8.41e-01 0.0273 0.135 0.136 gdT L2
ENSG00000243725 TTC4 318048 sc-eQTL 5.30e-02 -0.294 0.151 0.136 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 146714 sc-eQTL 9.80e-02 0.16 0.0964 0.131 intMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 980325 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0642 0.121 0.131 intMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 980405 sc-eQTL 9.33e-02 -0.149 0.0882 0.131 intMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 849868 sc-eQTL 6.93e-01 0.0537 0.136 0.131 intMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 620430 sc-eQTL 3.13e-01 -0.14 0.138 0.131 intMono L2
ENSG00000162402 USP24 -181455 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000505 0.124 0.131 intMono L2
ENSG00000243725 TTC4 318048 sc-eQTL 5.95e-01 0.0701 0.132 0.131 intMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 146714 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0252 0.0967 0.124 ncMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 980325 sc-eQTL 9.64e-01 -0.0055 0.121 0.124 ncMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 980405 sc-eQTL 1.09e-01 -0.155 0.0961 0.124 ncMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 849868 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0678 0.125 0.124 ncMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 620430 sc-eQTL 2.67e-01 0.152 0.136 0.124 ncMono L2
ENSG00000162402 USP24 -181455 sc-eQTL 2.89e-02 -0.237 0.108 0.124 ncMono L2
ENSG00000243725 TTC4 318048 sc-eQTL 8.64e-01 0.0221 0.129 0.124 ncMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 146714 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0113 0.123 0.121 pDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 980325 sc-eQTL 1.32e-01 -0.222 0.147 0.121 pDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 980405 sc-eQTL 2.30e-01 -0.142 0.118 0.121 pDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 849868 sc-eQTL 2.70e-02 0.345 0.154 0.121 pDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 620430 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0223 0.139 0.121 pDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 491652 sc-eQTL 8.87e-01 -0.00831 0.0586 0.121 pDC L2
ENSG00000162402 USP24 -181455 sc-eQTL 7.87e-01 0.0268 0.0989 0.121 pDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 833873 sc-eQTL 1.56e-01 -0.192 0.134 0.121 pDC L2
ENSG00000243725 TTC4 318048 sc-eQTL 3.95e-01 0.133 0.156 0.121 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 232586 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0501 0.124 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 146714 sc-eQTL 4.40e-02 -0.25 0.123 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 980325 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0628 0.12 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 980405 sc-eQTL 2.72e-01 -0.103 0.0934 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 849868 sc-eQTL 2.57e-01 0.127 0.112 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 620430 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0168 0.0975 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -181455 sc-eQTL 8.45e-02 -0.153 0.0883 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 833873 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0821 0.137 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 318048 sc-eQTL 5.29e-01 0.0773 0.123 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 232586 sc-eQTL 2.06e-01 -0.166 0.131 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 146714 sc-eQTL 9.40e-01 0.00892 0.118 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 980325 sc-eQTL 4.91e-01 0.0737 0.107 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 980405 sc-eQTL 8.28e-01 0.0165 0.0759 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 849868 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0258 0.109 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 620430 sc-eQTL 8.91e-01 0.0134 0.0976 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -181455 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0659 0.0836 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 833873 sc-eQTL 4.32e-01 -0.104 0.132 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 318048 sc-eQTL 2.68e-01 0.138 0.124 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 146714 sc-eQTL 6.77e-01 0.0312 0.075 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 980325 sc-eQTL 7.06e-01 0.0354 0.0939 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 980405 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0262 0.0647 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 849868 sc-eQTL 3.77e-02 0.237 0.113 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 620430 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0686 0.12 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -181455 sc-eQTL 4.70e-01 0.0593 0.0819 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 318048 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0256 0.136 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 146714 sc-eQTL 6.59e-02 0.171 0.0925 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 980325 sc-eQTL 9.67e-01 0.00515 0.123 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 980405 sc-eQTL 2.95e-01 -0.0954 0.0909 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 849868 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0697 0.125 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 620430 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00462 0.133 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -181455 sc-eQTL 8.60e-02 -0.18 0.104 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 318048 sc-eQTL 5.95e-01 0.07 0.131 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 232586 sc-eQTL 4.25e-01 0.0851 0.107 0.129 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 146714 sc-eQTL 7.07e-01 0.0419 0.111 0.129 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 980325 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00516 0.109 0.129 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 980405 sc-eQTL 2.45e-01 -0.0983 0.0843 0.129 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 849868 sc-eQTL 1.59e-01 -0.159 0.113 0.129 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 620430 sc-eQTL 1.26e-01 0.142 0.0924 0.129 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162398 LEXM 227846 sc-eQTL 4.15e-02 0.213 0.104 0.129 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -181455 sc-eQTL 8.81e-02 -0.113 0.0659 0.129 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 318048 sc-eQTL 2.06e-01 -0.149 0.118 0.129 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000169174 PCSK9 -5639 pQTL 0.00372 -0.117 0.0402 0.0 0.0 0.135
ENSG00000169174 PCSK9 -5639 eQTL 0.0024 -0.0746 0.0245 0.0 0.0 0.13

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000184313 \N 392155 3.14e-07 2.3e-07 5.82e-08 2.92e-07 1.07e-07 1.03e-07 2.16e-07 6.12e-08 1.75e-07 9.35e-08 1.96e-07 1.52e-07 2.38e-07 8.66e-08 6.27e-08 8.71e-08 4.35e-08 1.64e-07 7.11e-08 7.05e-08 1.22e-07 1.7e-07 1.73e-07 4.27e-08 2.86e-07 1.31e-07 1.39e-07 1.44e-07 1.37e-07 1.46e-07 1.26e-07 4.47e-08 3.38e-08 1.02e-07 1.16e-07 3.3e-08 5.71e-08 7.25e-08 6.39e-08 8.09e-08 4.58e-08 1.64e-07 5.27e-08 1.84e-08 3.34e-08 6.53e-09 8.98e-08 2e-09 4.67e-08
ENSG00000215883 \N 833873 2.66e-07 1.06e-07 3.39e-08 1.78e-07 9.65e-08 9.32e-08 1.39e-07 5.21e-08 1.37e-07 4.23e-08 1.63e-07 8.02e-08 1.23e-07 6.07e-08 5.14e-08 7.87e-08 5.1e-08 1.07e-07 5.2e-08 3.89e-08 1.03e-07 1.31e-07 1.29e-07 4.82e-08 1.29e-07 1.13e-07 1.1e-07 8.71e-08 1.03e-07 1.1e-07 9.75e-08 3.84e-08 2.74e-08 8.25e-08 9.24e-08 3.93e-08 4.63e-08 9.13e-08 8.42e-08 3.03e-08 4.36e-08 1.37e-07 4.01e-08 1.42e-08 7.91e-08 1.74e-08 1.3e-07 4.41e-09 4.77e-08