Genes within 1Mb (chr1:55033309:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 231986 sc-eQTL 2.28e-01 -0.148 0.122 0.128 B L1
ENSG00000116133 DHCR24 146114 sc-eQTL 1.35e-01 -0.173 0.115 0.128 B L1
ENSG00000116205 TCEANC2 979725 sc-eQTL 4.31e-01 0.0788 0.1 0.128 B L1
ENSG00000116209 TMEM59 979805 sc-eQTL 5.55e-02 -0.116 0.0605 0.128 B L1
ENSG00000116221 MRPL37 849268 sc-eQTL 8.96e-01 0.0105 0.0798 0.128 B L1
ENSG00000157216 SSBP3 619830 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0551 0.0835 0.128 B L1
ENSG00000162402 USP24 -182055 sc-eQTL 2.21e-02 -0.161 0.0699 0.128 B L1
ENSG00000215883 CYB5RL 833273 sc-eQTL 6.87e-01 -0.055 0.136 0.128 B L1
ENSG00000243725 TTC4 317448 sc-eQTL 2.91e-01 0.125 0.118 0.128 B L1
ENSG00000006555 TTC22 231986 sc-eQTL 5.41e-01 0.0589 0.0961 0.128 CD4T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 979725 sc-eQTL 3.25e-01 -0.0773 0.0784 0.128 CD4T L1
ENSG00000116209 TMEM59 979805 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0558 0.0731 0.128 CD4T L1
ENSG00000116221 MRPL37 849268 sc-eQTL 5.74e-01 0.0569 0.101 0.128 CD4T L1
ENSG00000157216 SSBP3 619830 sc-eQTL 4.34e-02 0.169 0.0832 0.128 CD4T L1
ENSG00000162402 USP24 -182055 sc-eQTL 6.49e-01 0.0312 0.0685 0.128 CD4T L1
ENSG00000243725 TTC4 317448 sc-eQTL 4.43e-01 0.079 0.103 0.128 CD4T L1
ENSG00000006555 TTC22 231986 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0375 0.0841 0.128 CD8T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 979725 sc-eQTL 3.61e-01 -0.0957 0.105 0.128 CD8T L1
ENSG00000116209 TMEM59 979805 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0132 0.0727 0.128 CD8T L1
ENSG00000116221 MRPL37 849268 sc-eQTL 5.66e-01 0.0575 0.1 0.128 CD8T L1
ENSG00000157216 SSBP3 619830 sc-eQTL 5.98e-01 0.038 0.0719 0.128 CD8T L1
ENSG00000162402 USP24 -182055 sc-eQTL 7.67e-01 0.0206 0.0696 0.128 CD8T L1
ENSG00000243725 TTC4 317448 sc-eQTL 4.55e-01 0.0902 0.121 0.128 CD8T L1
ENSG00000116133 DHCR24 146114 sc-eQTL 2.10e-01 0.138 0.11 0.131 DC L1
ENSG00000116205 TCEANC2 979725 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0176 0.124 0.131 DC L1
ENSG00000116209 TMEM59 979805 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0135 0.0971 0.131 DC L1
ENSG00000116221 MRPL37 849268 sc-eQTL 9.91e-01 0.00148 0.13 0.131 DC L1
ENSG00000157216 SSBP3 619830 sc-eQTL 7.36e-01 0.0392 0.116 0.131 DC L1
ENSG00000162390 ACOT11 491052 sc-eQTL 2.44e-01 0.13 0.111 0.131 DC L1
ENSG00000162402 USP24 -182055 sc-eQTL 3.23e-02 0.144 0.0667 0.131 DC L1
ENSG00000215883 CYB5RL 833273 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0595 0.122 0.131 DC L1
ENSG00000243725 TTC4 317448 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0358 0.131 0.131 DC L1
ENSG00000116133 DHCR24 146114 sc-eQTL 2.66e-01 0.0903 0.0811 0.128 Mono L1
ENSG00000116205 TCEANC2 979725 sc-eQTL 7.97e-01 0.0226 0.0877 0.128 Mono L1
ENSG00000116209 TMEM59 979805 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0155 0.0651 0.128 Mono L1
ENSG00000116221 MRPL37 849268 sc-eQTL 1.27e-01 0.166 0.108 0.128 Mono L1
ENSG00000157216 SSBP3 619830 sc-eQTL 9.50e-01 0.00789 0.125 0.128 Mono L1
ENSG00000162402 USP24 -182055 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0138 0.0744 0.128 Mono L1
ENSG00000243725 TTC4 317448 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0933 0.131 0.128 Mono L1
ENSG00000006555 TTC22 231986 sc-eQTL 4.53e-01 0.0832 0.111 0.129 NK L1
ENSG00000116133 DHCR24 146114 sc-eQTL 9.76e-01 0.00332 0.112 0.129 NK L1
ENSG00000116205 TCEANC2 979725 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0319 0.11 0.129 NK L1
ENSG00000116209 TMEM59 979805 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0283 0.0864 0.129 NK L1
ENSG00000116221 MRPL37 849268 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0614 0.107 0.129 NK L1
ENSG00000157216 SSBP3 619830 sc-eQTL 1.28e-01 0.142 0.0927 0.129 NK L1
ENSG00000162398 LEXM 227246 sc-eQTL 3.80e-02 0.216 0.103 0.129 NK L1
ENSG00000162402 USP24 -182055 sc-eQTL 1.80e-01 -0.085 0.0631 0.129 NK L1
ENSG00000243725 TTC4 317448 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0587 0.12 0.129 NK L1
ENSG00000006555 TTC22 231986 sc-eQTL 6.30e-01 -0.049 0.102 0.128 Other_T L1
ENSG00000116133 DHCR24 146114 sc-eQTL 9.03e-02 0.133 0.0783 0.128 Other_T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 979725 sc-eQTL 1.60e-01 -0.165 0.117 0.128 Other_T L1
ENSG00000116209 TMEM59 979805 sc-eQTL 8.15e-01 0.019 0.0809 0.128 Other_T L1
ENSG00000116221 MRPL37 849268 sc-eQTL 1.85e-02 0.178 0.0748 0.128 Other_T L1
ENSG00000157216 SSBP3 619830 sc-eQTL 4.31e-02 0.177 0.0869 0.128 Other_T L1
ENSG00000162402 USP24 -182055 sc-eQTL 1.33e-01 0.14 0.0929 0.128 Other_T L1
ENSG00000215883 CYB5RL 833273 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0139 0.128 0.128 Other_T L1
ENSG00000243725 TTC4 317448 sc-eQTL 1.88e-01 -0.167 0.127 0.128 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 231986 sc-eQTL 4.78e-01 0.0758 0.107 0.12 B_Activated L2
ENSG00000116133 DHCR24 146114 sc-eQTL 5.31e-02 -0.242 0.124 0.12 B_Activated L2
ENSG00000116205 TCEANC2 979725 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00218 0.135 0.12 B_Activated L2
ENSG00000116209 TMEM59 979805 sc-eQTL 3.84e-01 -0.125 0.143 0.12 B_Activated L2
ENSG00000116221 MRPL37 849268 sc-eQTL 4.91e-01 0.106 0.154 0.12 B_Activated L2
ENSG00000157216 SSBP3 619830 sc-eQTL 8.75e-01 -0.022 0.14 0.12 B_Activated L2
ENSG00000162402 USP24 -182055 sc-eQTL 7.88e-02 -0.239 0.135 0.12 B_Activated L2
ENSG00000215883 CYB5RL 833273 sc-eQTL 3.43e-01 -0.114 0.12 0.12 B_Activated L2
ENSG00000243725 TTC4 317448 sc-eQTL 8.07e-02 0.228 0.13 0.12 B_Activated L2
ENSG00000006555 TTC22 231986 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0641 0.133 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000116133 DHCR24 146114 sc-eQTL 1.07e-01 -0.199 0.123 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000116205 TCEANC2 979725 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0748 0.123 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000116209 TMEM59 979805 sc-eQTL 9.66e-01 0.00451 0.105 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000116221 MRPL37 849268 sc-eQTL 7.07e-01 0.0467 0.124 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000157216 SSBP3 619830 sc-eQTL 9.66e-01 0.0049 0.116 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000162402 USP24 -182055 sc-eQTL 1.47e-01 -0.141 0.0972 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000215883 CYB5RL 833273 sc-eQTL 3.30e-01 0.135 0.138 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000243725 TTC4 317448 sc-eQTL 4.68e-01 0.0913 0.126 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000006555 TTC22 231986 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0591 0.125 0.129 B_Memory L2
ENSG00000116133 DHCR24 146114 sc-eQTL 1.52e-01 -0.178 0.124 0.129 B_Memory L2
ENSG00000116205 TCEANC2 979725 sc-eQTL 5.21e-01 0.0855 0.133 0.129 B_Memory L2
ENSG00000116209 TMEM59 979805 sc-eQTL 8.45e-02 -0.191 0.11 0.129 B_Memory L2
ENSG00000116221 MRPL37 849268 sc-eQTL 2.42e-01 0.131 0.112 0.129 B_Memory L2
ENSG00000157216 SSBP3 619830 sc-eQTL 5.58e-01 0.0615 0.105 0.129 B_Memory L2
ENSG00000162402 USP24 -182055 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0616 0.103 0.129 B_Memory L2
ENSG00000215883 CYB5RL 833273 sc-eQTL 1.86e-01 -0.167 0.126 0.129 B_Memory L2
ENSG00000243725 TTC4 317448 sc-eQTL 3.72e-01 -0.117 0.131 0.129 B_Memory L2
ENSG00000006555 TTC22 231986 sc-eQTL 1.09e-01 -0.213 0.132 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000116133 DHCR24 146114 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0419 0.125 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 979725 sc-eQTL 3.66e-01 0.101 0.111 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000116209 TMEM59 979805 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0203 0.0807 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000116221 MRPL37 849268 sc-eQTL 8.95e-01 0.0157 0.119 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000157216 SSBP3 619830 sc-eQTL 8.12e-01 0.027 0.113 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000162402 USP24 -182055 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0808 0.0892 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 833273 sc-eQTL 9.29e-01 -0.0121 0.135 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000243725 TTC4 317448 sc-eQTL 7.25e-02 0.218 0.121 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000006555 TTC22 231986 sc-eQTL 4.73e-01 0.0959 0.133 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000116133 DHCR24 146114 sc-eQTL 8.19e-01 0.0267 0.116 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 979725 sc-eQTL 6.21e-01 0.0639 0.129 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000116209 TMEM59 979805 sc-eQTL 2.31e-01 0.127 0.106 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000116221 MRPL37 849268 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0622 0.125 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000157216 SSBP3 619830 sc-eQTL 5.87e-01 -0.067 0.123 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000162402 USP24 -182055 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0625 0.0976 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 833273 sc-eQTL 3.07e-01 -0.14 0.137 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000243725 TTC4 317448 sc-eQTL 8.69e-01 0.0237 0.143 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000006555 TTC22 231986 sc-eQTL 3.18e-02 0.263 0.122 0.13 CD4_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 979725 sc-eQTL 1.10e-01 0.202 0.126 0.13 CD4_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 979805 sc-eQTL 4.06e-01 0.0957 0.115 0.13 CD4_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 849268 sc-eQTL 2.96e-01 0.148 0.141 0.13 CD4_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 619830 sc-eQTL 8.44e-01 0.0172 0.087 0.13 CD4_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -182055 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00447 0.12 0.13 CD4_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 317448 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0177 0.134 0.13 CD4_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 231986 sc-eQTL 8.74e-01 0.018 0.113 0.128 CD4_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 979725 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0329 0.0861 0.128 CD4_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 979805 sc-eQTL 3.31e-01 -0.0814 0.0836 0.128 CD4_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 849268 sc-eQTL 6.31e-01 0.0519 0.108 0.128 CD4_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 619830 sc-eQTL 5.79e-02 0.163 0.0855 0.128 CD4_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -182055 sc-eQTL 6.10e-01 -0.038 0.0743 0.128 CD4_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 317448 sc-eQTL 3.98e-01 0.0958 0.113 0.128 CD4_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 231986 sc-eQTL 5.05e-02 0.232 0.118 0.128 CD4_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 979725 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00402 0.116 0.128 CD4_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 979805 sc-eQTL 3.10e-01 -0.0888 0.0873 0.128 CD4_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 849268 sc-eQTL 3.34e-02 0.233 0.109 0.128 CD4_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 619830 sc-eQTL 9.69e-01 0.00419 0.108 0.128 CD4_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -182055 sc-eQTL 8.67e-01 0.015 0.0894 0.128 CD4_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 317448 sc-eQTL 9.06e-01 0.0152 0.129 0.128 CD4_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 231986 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0549 0.137 0.128 CD4_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 979725 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0974 0.13 0.128 CD4_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 979805 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0353 0.101 0.128 CD4_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 849268 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0357 0.13 0.128 CD4_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 619830 sc-eQTL 3.75e-01 0.0987 0.111 0.128 CD4_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -182055 sc-eQTL 4.66e-01 0.0738 0.101 0.128 CD4_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 317448 sc-eQTL 3.62e-01 0.122 0.133 0.128 CD4_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 231986 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0461 0.111 0.128 CD8_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 979725 sc-eQTL 1.83e-02 -0.289 0.122 0.128 CD8_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 979805 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00572 0.107 0.128 CD8_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 849268 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0511 0.127 0.128 CD8_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 619830 sc-eQTL 7.56e-01 0.0269 0.0868 0.128 CD8_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -182055 sc-eQTL 9.06e-01 0.0102 0.0863 0.128 CD8_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 317448 sc-eQTL 7.54e-01 0.0405 0.129 0.128 CD8_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 231986 sc-eQTL 1.68e-01 -0.167 0.121 0.128 CD8_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 979725 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0416 0.11 0.128 CD8_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 979805 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00129 0.108 0.128 CD8_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 849268 sc-eQTL 5.10e-01 0.0852 0.129 0.128 CD8_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 619830 sc-eQTL 8.46e-01 0.019 0.0976 0.128 CD8_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -182055 sc-eQTL 8.02e-01 0.0223 0.0888 0.128 CD8_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 317448 sc-eQTL 6.70e-01 0.0554 0.13 0.128 CD8_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 231986 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0403 0.133 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 979725 sc-eQTL 3.96e-01 -0.113 0.133 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 979805 sc-eQTL 6.33e-01 0.0562 0.117 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 849268 sc-eQTL 2.45e-01 0.155 0.133 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 619830 sc-eQTL 3.72e-01 -0.103 0.115 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -182055 sc-eQTL 6.09e-01 0.0574 0.112 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 317448 sc-eQTL 9.11e-02 -0.23 0.135 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 231986 sc-eQTL 7.64e-01 0.0395 0.132 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 979725 sc-eQTL 4.78e-01 0.0975 0.137 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 979805 sc-eQTL 4.02e-01 -0.111 0.133 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 849268 sc-eQTL 7.58e-01 0.0415 0.135 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 619830 sc-eQTL 6.47e-01 0.0583 0.127 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -182055 sc-eQTL 8.99e-01 0.0171 0.134 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 317448 sc-eQTL 2.74e-01 0.149 0.136 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 231986 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0481 0.12 0.13 MAIT L2
ENSG00000116133 DHCR24 146114 sc-eQTL 4.52e-01 0.0667 0.0886 0.13 MAIT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 979725 sc-eQTL 1.97e-01 -0.161 0.124 0.13 MAIT L2
ENSG00000116209 TMEM59 979805 sc-eQTL 8.74e-01 0.0179 0.113 0.13 MAIT L2
ENSG00000116221 MRPL37 849268 sc-eQTL 2.13e-02 0.314 0.135 0.13 MAIT L2
ENSG00000157216 SSBP3 619830 sc-eQTL 8.36e-01 0.0252 0.121 0.13 MAIT L2
ENSG00000162402 USP24 -182055 sc-eQTL 4.25e-01 0.0861 0.108 0.13 MAIT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 833273 sc-eQTL 1.82e-01 -0.167 0.125 0.13 MAIT L2
ENSG00000243725 TTC4 317448 sc-eQTL 4.18e-01 -0.101 0.124 0.13 MAIT L2
ENSG00000006555 TTC22 231986 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00163 0.135 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000116133 DHCR24 146114 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0516 0.119 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000116205 TCEANC2 979725 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0274 0.126 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000116209 TMEM59 979805 sc-eQTL 8.72e-02 0.21 0.122 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000116221 MRPL37 849268 sc-eQTL 8.26e-02 0.238 0.136 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000157216 SSBP3 619830 sc-eQTL 6.37e-01 0.0489 0.103 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000162398 LEXM 227246 sc-eQTL 2.27e-01 0.148 0.122 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000162402 USP24 -182055 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0724 0.105 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000243725 TTC4 317448 sc-eQTL 4.53e-02 0.264 0.131 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000006555 TTC22 231986 sc-eQTL 4.22e-01 0.0903 0.112 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000116133 DHCR24 146114 sc-eQTL 2.09e-01 0.147 0.117 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000116205 TCEANC2 979725 sc-eQTL 9.47e-01 0.0085 0.127 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000116209 TMEM59 979805 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0562 0.094 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000116221 MRPL37 849268 sc-eQTL 1.59e-01 -0.172 0.122 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000157216 SSBP3 619830 sc-eQTL 2.01e-01 0.128 0.0998 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000162398 LEXM 227246 sc-eQTL 1.05e-01 0.186 0.114 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000162402 USP24 -182055 sc-eQTL 6.36e-02 -0.135 0.0726 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000243725 TTC4 317448 sc-eQTL 1.25e-01 -0.192 0.125 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000006555 TTC22 231986 sc-eQTL 6.97e-01 0.0516 0.132 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000116133 DHCR24 146114 sc-eQTL 6.70e-01 0.0551 0.129 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000116205 TCEANC2 979725 sc-eQTL 7.47e-01 0.0402 0.124 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000116209 TMEM59 979805 sc-eQTL 8.91e-01 0.0169 0.124 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000116221 MRPL37 849268 sc-eQTL 4.89e-01 0.0943 0.136 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000157216 SSBP3 619830 sc-eQTL 2.49e-01 0.128 0.111 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000162398 LEXM 227246 sc-eQTL 7.26e-01 0.044 0.125 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000162402 USP24 -182055 sc-eQTL 2.78e-01 -0.0998 0.0918 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000243725 TTC4 317448 sc-eQTL 5.33e-01 0.0858 0.137 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000006555 TTC22 231986 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00198 0.119 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000116133 DHCR24 146114 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0819 0.121 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000116205 TCEANC2 979725 sc-eQTL 1.67e-01 -0.166 0.119 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000116209 TMEM59 979805 sc-eQTL 5.55e-02 -0.186 0.0967 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000116221 MRPL37 849268 sc-eQTL 2.53e-01 -0.137 0.12 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000157216 SSBP3 619830 sc-eQTL 8.86e-02 0.171 0.1 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000162398 LEXM 227246 sc-eQTL 5.64e-01 0.0727 0.126 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000162402 USP24 -182055 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0625 0.0858 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000243725 TTC4 317448 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0302 0.127 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000006555 TTC22 231986 sc-eQTL 4.28e-01 -0.12 0.151 0.13 PB L2
ENSG00000116133 DHCR24 146114 sc-eQTL 6.24e-01 0.0661 0.134 0.13 PB L2
ENSG00000116205 TCEANC2 979725 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0399 0.164 0.13 PB L2
ENSG00000116209 TMEM59 979805 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0285 0.0684 0.13 PB L2
ENSG00000116221 MRPL37 849268 sc-eQTL 2.79e-01 -0.135 0.124 0.13 PB L2
ENSG00000157216 SSBP3 619830 sc-eQTL 4.11e-01 -0.118 0.143 0.13 PB L2
ENSG00000162402 USP24 -182055 sc-eQTL 2.12e-01 -0.203 0.162 0.13 PB L2
ENSG00000215883 CYB5RL 833273 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0827 0.169 0.13 PB L2
ENSG00000243725 TTC4 317448 sc-eQTL 1.94e-01 0.205 0.157 0.13 PB L2
ENSG00000006555 TTC22 231986 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0422 0.122 0.128 Pro_T L2
ENSG00000116133 DHCR24 146114 sc-eQTL 6.31e-01 0.05 0.104 0.128 Pro_T L2
ENSG00000116205 TCEANC2 979725 sc-eQTL 3.91e-01 -0.109 0.127 0.128 Pro_T L2
ENSG00000116209 TMEM59 979805 sc-eQTL 8.75e-01 0.0139 0.0881 0.128 Pro_T L2
ENSG00000116221 MRPL37 849268 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0305 0.0863 0.128 Pro_T L2
ENSG00000157216 SSBP3 619830 sc-eQTL 7.46e-03 0.257 0.0951 0.128 Pro_T L2
ENSG00000162402 USP24 -182055 sc-eQTL 3.14e-01 0.119 0.118 0.128 Pro_T L2
ENSG00000215883 CYB5RL 833273 sc-eQTL 1.01e-02 0.298 0.115 0.128 Pro_T L2
ENSG00000243725 TTC4 317448 sc-eQTL 7.38e-01 0.0435 0.13 0.128 Pro_T L2
ENSG00000006555 TTC22 231986 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0324 0.121 0.128 Treg L2
ENSG00000116205 TCEANC2 979725 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0446 0.13 0.128 Treg L2
ENSG00000116209 TMEM59 979805 sc-eQTL 7.41e-01 -0.034 0.103 0.128 Treg L2
ENSG00000116221 MRPL37 849268 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0949 0.127 0.128 Treg L2
ENSG00000157216 SSBP3 619830 sc-eQTL 1.55e-01 0.161 0.113 0.128 Treg L2
ENSG00000162402 USP24 -182055 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0837 0.108 0.128 Treg L2
ENSG00000243725 TTC4 317448 sc-eQTL 6.07e-01 0.0702 0.136 0.128 Treg L2
ENSG00000116133 DHCR24 146114 sc-eQTL 5.34e-01 0.068 0.109 0.127 cDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 979725 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0637 0.129 0.127 cDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 979805 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0833 0.109 0.127 cDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 849268 sc-eQTL 1.59e-01 -0.197 0.139 0.127 cDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 619830 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0605 0.129 0.127 cDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 491052 sc-eQTL 3.26e-01 0.118 0.12 0.127 cDC L2
ENSG00000162402 USP24 -182055 sc-eQTL 7.92e-02 0.236 0.133 0.127 cDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 833273 sc-eQTL 2.03e-01 0.147 0.115 0.127 cDC L2
ENSG00000243725 TTC4 317448 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0534 0.138 0.127 cDC L2
ENSG00000116133 DHCR24 146114 sc-eQTL 4.23e-01 0.0632 0.0788 0.128 cMono_IL1B L2
ENSG00000116205 TCEANC2 979725 sc-eQTL 9.03e-01 0.0133 0.11 0.128 cMono_IL1B L2
ENSG00000116209 TMEM59 979805 sc-eQTL 7.54e-01 0.0209 0.0665 0.128 cMono_IL1B L2
ENSG00000116221 MRPL37 849268 sc-eQTL 3.43e-02 0.25 0.117 0.128 cMono_IL1B L2
ENSG00000157216 SSBP3 619830 sc-eQTL 5.30e-01 -0.076 0.121 0.128 cMono_IL1B L2
ENSG00000162402 USP24 -182055 sc-eQTL 4.21e-01 0.0719 0.0892 0.128 cMono_IL1B L2
ENSG00000243725 TTC4 317448 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0226 0.137 0.128 cMono_IL1B L2
ENSG00000116133 DHCR24 146114 sc-eQTL 9.97e-01 0.000288 0.0738 0.128 cMono_S100A L2
ENSG00000116205 TCEANC2 979725 sc-eQTL 9.95e-01 0.000698 0.113 0.128 cMono_S100A L2
ENSG00000116209 TMEM59 979805 sc-eQTL 2.78e-01 -0.0978 0.0898 0.128 cMono_S100A L2
ENSG00000116221 MRPL37 849268 sc-eQTL 2.32e-01 0.156 0.13 0.128 cMono_S100A L2
ENSG00000157216 SSBP3 619830 sc-eQTL 6.25e-01 0.0661 0.135 0.128 cMono_S100A L2
ENSG00000162402 USP24 -182055 sc-eQTL 8.73e-01 0.0176 0.109 0.128 cMono_S100A L2
ENSG00000243725 TTC4 317448 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0153 0.137 0.128 cMono_S100A L2
ENSG00000006555 TTC22 231986 sc-eQTL 4.17e-01 -0.1 0.123 0.133 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 146114 sc-eQTL 9.43e-02 0.229 0.136 0.133 gdT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 979725 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0958 0.138 0.133 gdT L2
ENSG00000116209 TMEM59 979805 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00981 0.14 0.133 gdT L2
ENSG00000116221 MRPL37 849268 sc-eQTL 7.47e-01 0.0519 0.16 0.133 gdT L2
ENSG00000157216 SSBP3 619830 sc-eQTL 2.79e-02 0.214 0.0965 0.133 gdT L2
ENSG00000162402 USP24 -182055 sc-eQTL 2.29e-01 0.158 0.131 0.133 gdT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 833273 sc-eQTL 7.52e-01 0.0434 0.137 0.133 gdT L2
ENSG00000243725 TTC4 317448 sc-eQTL 1.05e-01 -0.25 0.153 0.133 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 146114 sc-eQTL 1.77e-01 0.133 0.0983 0.129 intMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 979725 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0869 0.123 0.129 intMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 979805 sc-eQTL 1.07e-01 -0.145 0.0898 0.129 intMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 849268 sc-eQTL 6.88e-01 0.0556 0.138 0.129 intMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 619830 sc-eQTL 3.19e-01 -0.141 0.141 0.129 intMono L2
ENSG00000162402 USP24 -182055 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00619 0.126 0.129 intMono L2
ENSG00000243725 TTC4 317448 sc-eQTL 6.72e-01 0.0568 0.134 0.129 intMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 146114 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00928 0.0987 0.122 ncMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 979725 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0279 0.123 0.122 ncMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 979805 sc-eQTL 1.23e-01 -0.152 0.0981 0.122 ncMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 849268 sc-eQTL 4.38e-01 -0.099 0.127 0.122 ncMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 619830 sc-eQTL 1.95e-01 0.181 0.139 0.122 ncMono L2
ENSG00000162402 USP24 -182055 sc-eQTL 3.22e-02 -0.237 0.11 0.122 ncMono L2
ENSG00000243725 TTC4 317448 sc-eQTL 7.44e-01 0.0431 0.132 0.122 ncMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 146114 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0125 0.126 0.119 pDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 979725 sc-eQTL 1.03e-01 -0.246 0.15 0.119 pDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 979805 sc-eQTL 3.21e-01 -0.12 0.121 0.119 pDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 849268 sc-eQTL 1.59e-02 0.385 0.158 0.119 pDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 619830 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0253 0.143 0.119 pDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 491052 sc-eQTL 9.13e-01 -0.00656 0.06 0.119 pDC L2
ENSG00000162402 USP24 -182055 sc-eQTL 8.13e-01 0.0241 0.101 0.119 pDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 833273 sc-eQTL 1.48e-01 -0.2 0.138 0.119 pDC L2
ENSG00000243725 TTC4 317448 sc-eQTL 4.48e-01 0.122 0.16 0.119 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 231986 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0362 0.127 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 146114 sc-eQTL 3.79e-02 -0.263 0.126 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 979725 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0754 0.123 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 979805 sc-eQTL 2.39e-01 -0.112 0.0952 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 849268 sc-eQTL 1.83e-01 0.152 0.114 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 619830 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0159 0.0995 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -182055 sc-eQTL 8.90e-02 -0.154 0.0901 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 833273 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0692 0.139 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 317448 sc-eQTL 4.57e-01 0.0932 0.125 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 231986 sc-eQTL 2.11e-01 -0.167 0.133 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 146114 sc-eQTL 9.58e-01 0.00633 0.12 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 979725 sc-eQTL 4.89e-01 0.0752 0.108 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 979805 sc-eQTL 8.22e-01 0.0174 0.0772 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 849268 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0251 0.111 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 619830 sc-eQTL 9.90e-01 0.00122 0.0993 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -182055 sc-eQTL 3.45e-01 -0.0804 0.085 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 833273 sc-eQTL 4.53e-01 -0.101 0.135 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 317448 sc-eQTL 2.35e-01 0.151 0.126 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 146114 sc-eQTL 6.89e-01 0.0306 0.0763 0.128 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 979725 sc-eQTL 5.85e-01 0.0522 0.0954 0.128 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 979805 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0141 0.0658 0.128 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 849268 sc-eQTL 3.88e-02 0.24 0.115 0.128 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 619830 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0505 0.122 0.128 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -182055 sc-eQTL 5.86e-01 0.0454 0.0833 0.128 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 317448 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0317 0.138 0.128 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 146114 sc-eQTL 9.65e-02 0.157 0.0942 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 979725 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0254 0.125 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 979805 sc-eQTL 3.51e-01 -0.0864 0.0925 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 849268 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0905 0.127 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 619830 sc-eQTL 9.47e-01 0.0091 0.135 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -182055 sc-eQTL 8.80e-02 -0.182 0.106 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 317448 sc-eQTL 5.83e-01 0.0734 0.134 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 231986 sc-eQTL 3.76e-01 0.0963 0.109 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 146114 sc-eQTL 6.45e-01 0.0524 0.113 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 979725 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0359 0.111 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 979805 sc-eQTL 2.62e-01 -0.0966 0.0859 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 849268 sc-eQTL 1.49e-01 -0.166 0.115 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 619830 sc-eQTL 1.03e-01 0.154 0.0941 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162398 LEXM 227246 sc-eQTL 5.91e-02 0.201 0.106 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -182055 sc-eQTL 1.02e-01 -0.11 0.0672 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 317448 sc-eQTL 1.70e-01 -0.165 0.12 0.127 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000169174 PCSK9 -6239 pQTL 0.00247 -0.124 0.0408 0.0 0.0 0.131
ENSG00000169174 PCSK9 -6239 eQTL 0.0017 -0.0783 0.0249 0.0 0.0 0.128


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000184313 \N 391555 1.24e-06 8.72e-07 1.63e-07 4.03e-07 1.07e-07 4.02e-07 7.32e-07 2.21e-07 7.08e-07 2.98e-07 1.09e-06 5.28e-07 1.23e-06 2.33e-07 3.56e-07 2.89e-07 6.15e-07 4.16e-07 3.64e-07 3.09e-07 2.61e-07 5.5e-07 4.96e-07 3.01e-07 1.69e-06 2.56e-07 5.04e-07 3.9e-07 6.33e-07 8.5e-07 4.39e-07 4.44e-08 8.37e-08 2.72e-07 3.42e-07 1.94e-07 2.9e-07 1.18e-07 1.23e-07 9.67e-09 1.22e-07 9.49e-07 6.3e-08 1.06e-07 1.94e-07 3.54e-08 1.26e-07 4.47e-08 6.32e-08
ENSG00000215883 \N 833273 2.67e-07 1.35e-07 5.49e-08 2.09e-07 9.8e-08 8.33e-08 1.67e-07 5.48e-08 1.45e-07 5.42e-08 1.57e-07 9e-08 1.59e-07 7.64e-08 6.18e-08 7.53e-08 4.09e-08 1.33e-07 6.75e-08 4.8e-08 1.21e-07 1.24e-07 1.44e-07 2.79e-08 1.68e-07 1.14e-07 1.13e-07 9.74e-08 1.2e-07 1.05e-07 1.06e-07 3.55e-08 3.73e-08 8.7e-08 2.97e-08 3.28e-08 5.74e-08 8.72e-08 6.71e-08 3.6e-08 5.54e-08 1.46e-07 5.2e-08 1.99e-08 3.81e-08 1.92e-08 1.22e-07 1.9e-09 4.99e-08