Genes within 1Mb (chr1:55032521:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 231198 sc-eQTL 2.55e-01 -0.138 0.121 0.128 B L1
ENSG00000116133 DHCR24 145326 sc-eQTL 1.76e-01 -0.155 0.114 0.128 B L1
ENSG00000116205 TCEANC2 978937 sc-eQTL 4.58e-01 0.0734 0.0988 0.128 B L1
ENSG00000116209 TMEM59 979017 sc-eQTL 6.41e-02 -0.111 0.0598 0.128 B L1
ENSG00000116221 MRPL37 848480 sc-eQTL 9.85e-01 -0.0015 0.0788 0.128 B L1
ENSG00000157216 SSBP3 619042 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0731 0.0824 0.128 B L1
ENSG00000162402 USP24 -182843 sc-eQTL 2.01e-02 -0.162 0.069 0.128 B L1
ENSG00000215883 CYB5RL 832485 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0654 0.135 0.128 B L1
ENSG00000243725 TTC4 316660 sc-eQTL 3.86e-01 0.102 0.117 0.128 B L1
ENSG00000006555 TTC22 231198 sc-eQTL 4.47e-01 0.0721 0.0947 0.128 CD4T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 978937 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0476 0.0775 0.128 CD4T L1
ENSG00000116209 TMEM59 979017 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0659 0.0721 0.128 CD4T L1
ENSG00000116221 MRPL37 848480 sc-eQTL 7.16e-01 0.0363 0.0998 0.128 CD4T L1
ENSG00000157216 SSBP3 619042 sc-eQTL 3.31e-02 0.176 0.082 0.128 CD4T L1
ENSG00000162402 USP24 -182843 sc-eQTL 7.06e-01 0.0255 0.0675 0.128 CD4T L1
ENSG00000243725 TTC4 316660 sc-eQTL 5.37e-01 0.0628 0.102 0.128 CD4T L1
ENSG00000006555 TTC22 231198 sc-eQTL 6.74e-01 -0.035 0.0829 0.128 CD8T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 978937 sc-eQTL 3.56e-01 -0.0953 0.103 0.128 CD8T L1
ENSG00000116209 TMEM59 979017 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0201 0.0717 0.128 CD8T L1
ENSG00000116221 MRPL37 848480 sc-eQTL 5.67e-01 0.0565 0.0986 0.128 CD8T L1
ENSG00000157216 SSBP3 619042 sc-eQTL 5.36e-01 0.0439 0.0708 0.128 CD8T L1
ENSG00000162402 USP24 -182843 sc-eQTL 8.60e-01 0.0121 0.0686 0.128 CD8T L1
ENSG00000243725 TTC4 316660 sc-eQTL 6.39e-01 0.0558 0.119 0.128 CD8T L1
ENSG00000116133 DHCR24 145326 sc-eQTL 2.52e-01 0.124 0.108 0.131 DC L1
ENSG00000116205 TCEANC2 978937 sc-eQTL 9.98e-01 0.000271 0.122 0.131 DC L1
ENSG00000116209 TMEM59 979017 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0249 0.0957 0.131 DC L1
ENSG00000116221 MRPL37 848480 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0343 0.129 0.131 DC L1
ENSG00000157216 SSBP3 619042 sc-eQTL 6.66e-01 0.0495 0.115 0.131 DC L1
ENSG00000162390 ACOT11 490264 sc-eQTL 2.33e-01 0.131 0.11 0.131 DC L1
ENSG00000162402 USP24 -182843 sc-eQTL 3.80e-02 0.137 0.0658 0.131 DC L1
ENSG00000215883 CYB5RL 832485 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0506 0.12 0.131 DC L1
ENSG00000243725 TTC4 316660 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0418 0.129 0.131 DC L1
ENSG00000116133 DHCR24 145326 sc-eQTL 2.75e-01 0.0879 0.0803 0.128 Mono L1
ENSG00000116205 TCEANC2 978937 sc-eQTL 8.10e-01 0.0209 0.0869 0.128 Mono L1
ENSG00000116209 TMEM59 979017 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0368 0.0645 0.128 Mono L1
ENSG00000116221 MRPL37 848480 sc-eQTL 1.90e-01 0.142 0.108 0.128 Mono L1
ENSG00000157216 SSBP3 619042 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0396 0.124 0.128 Mono L1
ENSG00000162402 USP24 -182843 sc-eQTL 9.01e-01 -0.00921 0.0737 0.128 Mono L1
ENSG00000243725 TTC4 316660 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0837 0.13 0.128 Mono L1
ENSG00000006555 TTC22 231198 sc-eQTL 5.61e-01 0.0639 0.11 0.129 NK L1
ENSG00000116133 DHCR24 145326 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0248 0.111 0.129 NK L1
ENSG00000116205 TCEANC2 978937 sc-eQTL 8.06e-01 0.0268 0.109 0.129 NK L1
ENSG00000116209 TMEM59 979017 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0426 0.0855 0.129 NK L1
ENSG00000116221 MRPL37 848480 sc-eQTL 3.74e-01 -0.0946 0.106 0.129 NK L1
ENSG00000157216 SSBP3 619042 sc-eQTL 1.45e-01 0.134 0.0917 0.129 NK L1
ENSG00000162398 LEXM 226458 sc-eQTL 2.36e-02 0.233 0.102 0.129 NK L1
ENSG00000162402 USP24 -182843 sc-eQTL 1.27e-01 -0.0956 0.0624 0.129 NK L1
ENSG00000243725 TTC4 316660 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0707 0.119 0.129 NK L1
ENSG00000006555 TTC22 231198 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0377 0.0997 0.128 Other_T L1
ENSG00000116133 DHCR24 145326 sc-eQTL 7.08e-02 0.139 0.0768 0.128 Other_T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 978937 sc-eQTL 2.19e-01 -0.142 0.115 0.128 Other_T L1
ENSG00000116209 TMEM59 979017 sc-eQTL 9.56e-01 0.00443 0.0795 0.128 Other_T L1
ENSG00000116221 MRPL37 848480 sc-eQTL 2.51e-02 0.166 0.0736 0.128 Other_T L1
ENSG00000157216 SSBP3 619042 sc-eQTL 4.14e-02 0.175 0.0853 0.128 Other_T L1
ENSG00000162402 USP24 -182843 sc-eQTL 2.14e-01 0.114 0.0914 0.128 Other_T L1
ENSG00000215883 CYB5RL 832485 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0249 0.125 0.128 Other_T L1
ENSG00000243725 TTC4 316660 sc-eQTL 2.45e-01 -0.145 0.124 0.128 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 231198 sc-eQTL 4.24e-01 0.0862 0.108 0.117 B_Activated L2
ENSG00000116133 DHCR24 145326 sc-eQTL 4.66e-02 -0.251 0.125 0.117 B_Activated L2
ENSG00000116205 TCEANC2 978937 sc-eQTL 8.82e-01 0.0202 0.136 0.117 B_Activated L2
ENSG00000116209 TMEM59 979017 sc-eQTL 3.21e-01 -0.143 0.144 0.117 B_Activated L2
ENSG00000116221 MRPL37 848480 sc-eQTL 7.39e-01 0.052 0.156 0.117 B_Activated L2
ENSG00000157216 SSBP3 619042 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0152 0.141 0.117 B_Activated L2
ENSG00000162402 USP24 -182843 sc-eQTL 7.91e-02 -0.241 0.137 0.117 B_Activated L2
ENSG00000215883 CYB5RL 832485 sc-eQTL 3.79e-01 -0.107 0.121 0.117 B_Activated L2
ENSG00000243725 TTC4 316660 sc-eQTL 1.00e-01 0.216 0.131 0.117 B_Activated L2
ENSG00000006555 TTC22 231198 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0232 0.131 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000116133 DHCR24 145326 sc-eQTL 1.54e-01 -0.174 0.121 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000116205 TCEANC2 978937 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0489 0.121 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000116209 TMEM59 979017 sc-eQTL 8.46e-01 0.0202 0.104 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000116221 MRPL37 848480 sc-eQTL 7.67e-01 0.0362 0.122 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000157216 SSBP3 619042 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00439 0.114 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000162402 USP24 -182843 sc-eQTL 1.34e-01 -0.144 0.0958 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000215883 CYB5RL 832485 sc-eQTL 4.92e-01 0.0936 0.136 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000243725 TTC4 316660 sc-eQTL 7.16e-01 0.0451 0.124 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000006555 TTC22 231198 sc-eQTL 4.01e-01 -0.104 0.124 0.129 B_Memory L2
ENSG00000116133 DHCR24 145326 sc-eQTL 1.31e-01 -0.185 0.122 0.129 B_Memory L2
ENSG00000116205 TCEANC2 978937 sc-eQTL 6.38e-01 0.0619 0.131 0.129 B_Memory L2
ENSG00000116209 TMEM59 979017 sc-eQTL 7.13e-02 -0.197 0.109 0.129 B_Memory L2
ENSG00000116221 MRPL37 848480 sc-eQTL 3.42e-01 0.105 0.111 0.129 B_Memory L2
ENSG00000157216 SSBP3 619042 sc-eQTL 5.54e-01 0.0613 0.103 0.129 B_Memory L2
ENSG00000162402 USP24 -182843 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0758 0.101 0.129 B_Memory L2
ENSG00000215883 CYB5RL 832485 sc-eQTL 2.11e-01 -0.157 0.125 0.129 B_Memory L2
ENSG00000243725 TTC4 316660 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0824 0.13 0.129 B_Memory L2
ENSG00000006555 TTC22 231198 sc-eQTL 1.00e-01 -0.216 0.131 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000116133 DHCR24 145326 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0553 0.123 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 978937 sc-eQTL 2.44e-01 0.128 0.11 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000116209 TMEM59 979017 sc-eQTL 8.03e-01 -0.02 0.08 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000116221 MRPL37 848480 sc-eQTL 9.78e-01 0.00331 0.118 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000157216 SSBP3 619042 sc-eQTL 8.20e-01 0.0255 0.112 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000162402 USP24 -182843 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0767 0.0884 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 832485 sc-eQTL 9.61e-01 0.00647 0.134 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000243725 TTC4 316660 sc-eQTL 1.15e-01 0.19 0.12 0.128 B_Naive1 L2
ENSG00000006555 TTC22 231198 sc-eQTL 4.34e-01 0.103 0.132 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000116133 DHCR24 145326 sc-eQTL 8.37e-01 0.0237 0.115 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 978937 sc-eQTL 7.45e-01 0.0417 0.128 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000116209 TMEM59 979017 sc-eQTL 3.33e-01 0.102 0.105 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000116221 MRPL37 848480 sc-eQTL 4.04e-01 -0.103 0.124 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000157216 SSBP3 619042 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0838 0.122 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000162402 USP24 -182843 sc-eQTL 4.76e-01 -0.069 0.0965 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 832485 sc-eQTL 1.96e-01 -0.176 0.135 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000243725 TTC4 316660 sc-eQTL 7.18e-01 0.0512 0.142 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000006555 TTC22 231198 sc-eQTL 2.92e-02 0.263 0.12 0.13 CD4_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 978937 sc-eQTL 1.25e-01 0.191 0.124 0.13 CD4_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 979017 sc-eQTL 4.35e-01 0.0886 0.113 0.13 CD4_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 848480 sc-eQTL 2.36e-01 0.165 0.139 0.13 CD4_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 619042 sc-eQTL 7.31e-01 0.0295 0.0857 0.13 CD4_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -182843 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0261 0.118 0.13 CD4_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 316660 sc-eQTL 9.10e-01 0.0149 0.132 0.13 CD4_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 231198 sc-eQTL 6.57e-01 0.0496 0.111 0.128 CD4_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 978937 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00391 0.0848 0.128 CD4_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 979017 sc-eQTL 2.37e-01 -0.0976 0.0822 0.128 CD4_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 848480 sc-eQTL 7.44e-01 0.0347 0.106 0.128 CD4_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 619042 sc-eQTL 4.07e-02 0.173 0.084 0.128 CD4_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -182843 sc-eQTL 6.13e-01 -0.037 0.0732 0.128 CD4_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 316660 sc-eQTL 4.20e-01 0.0901 0.111 0.128 CD4_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 231198 sc-eQTL 4.70e-02 0.232 0.116 0.128 CD4_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 978937 sc-eQTL 9.19e-01 0.0116 0.114 0.128 CD4_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 979017 sc-eQTL 2.56e-01 -0.0977 0.0858 0.128 CD4_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 848480 sc-eQTL 4.90e-02 0.212 0.107 0.128 CD4_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 619042 sc-eQTL 9.38e-01 0.00829 0.106 0.128 CD4_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -182843 sc-eQTL 9.18e-01 0.0091 0.088 0.128 CD4_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 316660 sc-eQTL 9.96e-01 0.000649 0.127 0.128 CD4_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 231198 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0636 0.135 0.128 CD4_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 978937 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0771 0.128 0.128 CD4_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 979017 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0341 0.0993 0.128 CD4_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 848480 sc-eQTL 9.32e-01 -0.011 0.128 0.128 CD4_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 619042 sc-eQTL 4.77e-01 0.078 0.109 0.128 CD4_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -182843 sc-eQTL 6.17e-01 0.0498 0.0996 0.128 CD4_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 316660 sc-eQTL 5.04e-01 0.088 0.132 0.128 CD4_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 231198 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00838 0.11 0.128 CD8_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 978937 sc-eQTL 3.37e-02 -0.258 0.121 0.128 CD8_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 979017 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0379 0.106 0.128 CD8_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 848480 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0251 0.126 0.128 CD8_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 619042 sc-eQTL 7.89e-01 0.023 0.0859 0.128 CD8_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -182843 sc-eQTL 9.75e-01 0.00269 0.0854 0.128 CD8_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 316660 sc-eQTL 9.67e-01 0.00522 0.128 0.128 CD8_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 231198 sc-eQTL 1.15e-01 -0.188 0.119 0.128 CD8_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 978937 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0306 0.108 0.128 CD8_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 979017 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0131 0.106 0.128 CD8_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 848480 sc-eQTL 4.49e-01 0.0963 0.127 0.128 CD8_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 619042 sc-eQTL 6.75e-01 0.0404 0.0961 0.128 CD8_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -182843 sc-eQTL 9.75e-01 0.0028 0.0874 0.128 CD8_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 316660 sc-eQTL 8.24e-01 0.0284 0.128 0.128 CD8_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 231198 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0366 0.131 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 978937 sc-eQTL 3.44e-01 -0.125 0.131 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 979017 sc-eQTL 5.36e-01 0.0717 0.116 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 848480 sc-eQTL 4.59e-01 0.0972 0.131 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 619042 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0903 0.114 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -182843 sc-eQTL 6.08e-01 0.0568 0.11 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 316660 sc-eQTL 6.24e-02 -0.249 0.133 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 231198 sc-eQTL 4.93e-01 0.0891 0.13 0.13 CD8_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 978937 sc-eQTL 5.49e-01 0.0813 0.135 0.13 CD8_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 979017 sc-eQTL 5.02e-01 -0.088 0.131 0.13 CD8_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 848480 sc-eQTL 8.15e-01 0.031 0.133 0.13 CD8_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 619042 sc-eQTL 5.33e-01 0.0785 0.126 0.13 CD8_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -182843 sc-eQTL 7.36e-01 0.0447 0.132 0.13 CD8_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 316660 sc-eQTL 2.26e-01 0.163 0.134 0.13 CD8_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 231198 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0185 0.118 0.13 MAIT L2
ENSG00000116133 DHCR24 145326 sc-eQTL 5.73e-01 0.0495 0.0876 0.13 MAIT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 978937 sc-eQTL 2.90e-01 -0.13 0.123 0.13 MAIT L2
ENSG00000116209 TMEM59 979017 sc-eQTL 9.59e-01 0.00568 0.111 0.13 MAIT L2
ENSG00000116221 MRPL37 848480 sc-eQTL 4.09e-02 0.276 0.134 0.13 MAIT L2
ENSG00000157216 SSBP3 619042 sc-eQTL 8.96e-01 0.0156 0.12 0.13 MAIT L2
ENSG00000162402 USP24 -182843 sc-eQTL 5.85e-01 0.0583 0.107 0.13 MAIT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 832485 sc-eQTL 2.72e-01 -0.136 0.124 0.13 MAIT L2
ENSG00000243725 TTC4 316660 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0885 0.123 0.13 MAIT L2
ENSG00000006555 TTC22 231198 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0412 0.133 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000116133 DHCR24 145326 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0692 0.118 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000116205 TCEANC2 978937 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0412 0.125 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000116209 TMEM59 979017 sc-eQTL 1.17e-01 0.19 0.121 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000116221 MRPL37 848480 sc-eQTL 6.92e-02 0.246 0.135 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000157216 SSBP3 619042 sc-eQTL 8.15e-01 0.0239 0.102 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000162398 LEXM 226458 sc-eQTL 2.63e-01 0.135 0.12 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000162402 USP24 -182843 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0681 0.104 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000243725 TTC4 316660 sc-eQTL 1.52e-01 0.187 0.13 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000006555 TTC22 231198 sc-eQTL 4.20e-01 0.0897 0.111 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000116133 DHCR24 145326 sc-eQTL 2.73e-01 0.127 0.115 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000116205 TCEANC2 978937 sc-eQTL 6.03e-01 0.0654 0.125 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000116209 TMEM59 979017 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0796 0.0928 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000116221 MRPL37 848480 sc-eQTL 8.76e-02 -0.206 0.12 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000157216 SSBP3 619042 sc-eQTL 2.14e-01 0.123 0.0987 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000162398 LEXM 226458 sc-eQTL 6.30e-02 0.211 0.113 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000162402 USP24 -182843 sc-eQTL 4.66e-02 -0.143 0.0717 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000243725 TTC4 316660 sc-eQTL 1.85e-01 -0.164 0.123 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000006555 TTC22 231198 sc-eQTL 9.99e-01 0.000126 0.131 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000116133 DHCR24 145326 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0184 0.127 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000116205 TCEANC2 978937 sc-eQTL 5.14e-01 0.0804 0.123 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000116209 TMEM59 979017 sc-eQTL 5.49e-01 0.0733 0.122 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000116221 MRPL37 848480 sc-eQTL 6.03e-01 0.0701 0.135 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000157216 SSBP3 619042 sc-eQTL 2.81e-01 0.118 0.109 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000162398 LEXM 226458 sc-eQTL 4.17e-01 0.101 0.124 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000162402 USP24 -182843 sc-eQTL 3.04e-01 -0.0935 0.0907 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000243725 TTC4 316660 sc-eQTL 3.73e-01 0.121 0.135 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000006555 TTC22 231198 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00911 0.118 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000116133 DHCR24 145326 sc-eQTL 4.05e-01 -0.099 0.119 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000116205 TCEANC2 978937 sc-eQTL 2.98e-01 -0.123 0.118 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000116209 TMEM59 979017 sc-eQTL 2.55e-02 -0.213 0.0949 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000116221 MRPL37 848480 sc-eQTL 1.63e-01 -0.165 0.118 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000157216 SSBP3 619042 sc-eQTL 8.16e-02 0.172 0.0985 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000162398 LEXM 226458 sc-eQTL 6.45e-01 0.0572 0.124 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000162402 USP24 -182843 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0744 0.0844 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000243725 TTC4 316660 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0308 0.125 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000006555 TTC22 231198 sc-eQTL 4.53e-01 -0.111 0.147 0.13 PB L2
ENSG00000116133 DHCR24 145326 sc-eQTL 6.42e-01 0.0607 0.13 0.13 PB L2
ENSG00000116205 TCEANC2 978937 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0566 0.159 0.13 PB L2
ENSG00000116209 TMEM59 979017 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0169 0.0663 0.13 PB L2
ENSG00000116221 MRPL37 848480 sc-eQTL 2.35e-01 -0.143 0.12 0.13 PB L2
ENSG00000157216 SSBP3 619042 sc-eQTL 4.19e-01 -0.113 0.139 0.13 PB L2
ENSG00000162402 USP24 -182843 sc-eQTL 1.37e-01 -0.234 0.157 0.13 PB L2
ENSG00000215883 CYB5RL 832485 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0743 0.164 0.13 PB L2
ENSG00000243725 TTC4 316660 sc-eQTL 1.26e-01 0.233 0.151 0.13 PB L2
ENSG00000006555 TTC22 231198 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0226 0.121 0.128 Pro_T L2
ENSG00000116133 DHCR24 145326 sc-eQTL 5.77e-01 0.0573 0.103 0.128 Pro_T L2
ENSG00000116205 TCEANC2 978937 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0797 0.125 0.128 Pro_T L2
ENSG00000116209 TMEM59 979017 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0307 0.087 0.128 Pro_T L2
ENSG00000116221 MRPL37 848480 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0418 0.0851 0.128 Pro_T L2
ENSG00000157216 SSBP3 619042 sc-eQTL 7.47e-03 0.254 0.0939 0.128 Pro_T L2
ENSG00000162402 USP24 -182843 sc-eQTL 3.34e-01 0.113 0.116 0.128 Pro_T L2
ENSG00000215883 CYB5RL 832485 sc-eQTL 3.48e-02 0.242 0.114 0.128 Pro_T L2
ENSG00000243725 TTC4 316660 sc-eQTL 6.63e-01 0.0558 0.128 0.128 Pro_T L2
ENSG00000006555 TTC22 231198 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0264 0.119 0.128 Treg L2
ENSG00000116205 TCEANC2 978937 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0377 0.128 0.128 Treg L2
ENSG00000116209 TMEM59 979017 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0173 0.101 0.128 Treg L2
ENSG00000116221 MRPL37 848480 sc-eQTL 3.55e-01 -0.116 0.125 0.128 Treg L2
ENSG00000157216 SSBP3 619042 sc-eQTL 1.26e-01 0.171 0.111 0.128 Treg L2
ENSG00000162402 USP24 -182843 sc-eQTL 3.39e-01 -0.102 0.106 0.128 Treg L2
ENSG00000243725 TTC4 316660 sc-eQTL 5.28e-01 0.0846 0.134 0.128 Treg L2
ENSG00000116133 DHCR24 145326 sc-eQTL 4.82e-01 0.0757 0.107 0.127 cDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 978937 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0405 0.127 0.127 cDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 979017 sc-eQTL 3.84e-01 -0.094 0.108 0.127 cDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 848480 sc-eQTL 1.32e-01 -0.207 0.137 0.127 cDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 619042 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0663 0.127 0.127 cDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 490264 sc-eQTL 3.42e-01 0.112 0.118 0.127 cDC L2
ENSG00000162402 USP24 -182843 sc-eQTL 1.10e-01 0.212 0.132 0.127 cDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 832485 sc-eQTL 1.78e-01 0.153 0.113 0.127 cDC L2
ENSG00000243725 TTC4 316660 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0908 0.136 0.127 cDC L2
ENSG00000116133 DHCR24 145326 sc-eQTL 4.65e-01 0.0571 0.0781 0.128 cMono_IL1B L2
ENSG00000116205 TCEANC2 978937 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00356 0.109 0.128 cMono_IL1B L2
ENSG00000116209 TMEM59 979017 sc-eQTL 9.13e-01 0.00717 0.0659 0.128 cMono_IL1B L2
ENSG00000116221 MRPL37 848480 sc-eQTL 5.47e-02 0.225 0.116 0.128 cMono_IL1B L2
ENSG00000157216 SSBP3 619042 sc-eQTL 3.12e-01 -0.121 0.12 0.128 cMono_IL1B L2
ENSG00000162402 USP24 -182843 sc-eQTL 3.84e-01 0.0771 0.0883 0.128 cMono_IL1B L2
ENSG00000243725 TTC4 316660 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0128 0.135 0.128 cMono_IL1B L2
ENSG00000116133 DHCR24 145326 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00429 0.0731 0.128 cMono_S100A L2
ENSG00000116205 TCEANC2 978937 sc-eQTL 9.70e-01 0.00413 0.111 0.128 cMono_S100A L2
ENSG00000116209 TMEM59 979017 sc-eQTL 1.31e-01 -0.134 0.0887 0.128 cMono_S100A L2
ENSG00000116221 MRPL37 848480 sc-eQTL 3.01e-01 0.133 0.129 0.128 cMono_S100A L2
ENSG00000157216 SSBP3 619042 sc-eQTL 8.78e-01 0.0205 0.134 0.128 cMono_S100A L2
ENSG00000162402 USP24 -182843 sc-eQTL 8.30e-01 0.0232 0.108 0.128 cMono_S100A L2
ENSG00000243725 TTC4 316660 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00295 0.136 0.128 cMono_S100A L2
ENSG00000006555 TTC22 231198 sc-eQTL 3.12e-01 -0.124 0.122 0.133 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 145326 sc-eQTL 1.54e-01 0.195 0.136 0.133 gdT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 978937 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0957 0.137 0.133 gdT L2
ENSG00000116209 TMEM59 979017 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0178 0.139 0.133 gdT L2
ENSG00000116221 MRPL37 848480 sc-eQTL 6.19e-01 0.0795 0.16 0.133 gdT L2
ENSG00000157216 SSBP3 619042 sc-eQTL 7.57e-02 0.173 0.0968 0.133 gdT L2
ENSG00000162402 USP24 -182843 sc-eQTL 2.70e-01 0.145 0.131 0.133 gdT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 832485 sc-eQTL 9.71e-01 0.00504 0.137 0.133 gdT L2
ENSG00000243725 TTC4 316660 sc-eQTL 4.59e-02 -0.306 0.152 0.133 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 145326 sc-eQTL 8.10e-02 0.17 0.0972 0.129 intMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 978937 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0817 0.122 0.129 intMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 979017 sc-eQTL 7.34e-02 -0.16 0.0889 0.129 intMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 848480 sc-eQTL 6.60e-01 0.0602 0.137 0.129 intMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 619042 sc-eQTL 2.42e-01 -0.163 0.139 0.129 intMono L2
ENSG00000162402 USP24 -182843 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00939 0.125 0.129 intMono L2
ENSG00000243725 TTC4 316660 sc-eQTL 6.37e-01 0.0627 0.133 0.129 intMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 145326 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0138 0.0975 0.122 ncMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 978937 sc-eQTL 9.59e-01 0.00625 0.122 0.122 ncMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 979017 sc-eQTL 1.17e-01 -0.153 0.0969 0.122 ncMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 848480 sc-eQTL 5.73e-01 -0.071 0.126 0.122 ncMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 619042 sc-eQTL 2.54e-01 0.157 0.137 0.122 ncMono L2
ENSG00000162402 USP24 -182843 sc-eQTL 1.90e-02 -0.256 0.108 0.122 ncMono L2
ENSG00000243725 TTC4 316660 sc-eQTL 9.27e-01 0.012 0.13 0.122 ncMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 145326 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0418 0.124 0.119 pDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 978937 sc-eQTL 1.76e-01 -0.201 0.148 0.119 pDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 979017 sc-eQTL 2.12e-01 -0.148 0.118 0.119 pDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 848480 sc-eQTL 6.16e-02 0.294 0.156 0.119 pDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 619042 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0702 0.14 0.119 pDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 490264 sc-eQTL 9.16e-01 -0.00619 0.0589 0.119 pDC L2
ENSG00000162402 USP24 -182843 sc-eQTL 9.61e-01 -0.0049 0.0995 0.119 pDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 832485 sc-eQTL 1.46e-01 -0.197 0.135 0.119 pDC L2
ENSG00000243725 TTC4 316660 sc-eQTL 2.97e-01 0.164 0.156 0.119 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 231198 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0494 0.125 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 145326 sc-eQTL 4.27e-02 -0.253 0.124 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 978937 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0645 0.121 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 979017 sc-eQTL 2.87e-01 -0.1 0.094 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 848480 sc-eQTL 3.11e-01 0.114 0.113 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 619042 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0183 0.0982 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -182843 sc-eQTL 7.21e-02 -0.161 0.0889 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 832485 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0808 0.137 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 316660 sc-eQTL 5.94e-01 0.0659 0.123 0.128 B_Memory LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 231198 sc-eQTL 2.01e-01 -0.169 0.132 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 145326 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00676 0.119 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 978937 sc-eQTL 4.52e-01 0.0808 0.107 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 979017 sc-eQTL 8.57e-01 0.0138 0.0764 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 848480 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0519 0.11 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 619042 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00428 0.0982 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -182843 sc-eQTL 3.60e-01 -0.0771 0.0841 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 832485 sc-eQTL 4.30e-01 -0.105 0.133 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 316660 sc-eQTL 2.63e-01 0.14 0.125 0.128 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 145326 sc-eQTL 8.11e-01 0.0181 0.0756 0.128 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 978937 sc-eQTL 6.34e-01 0.0451 0.0946 0.128 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 979017 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0392 0.0652 0.128 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 848480 sc-eQTL 6.75e-02 0.211 0.115 0.128 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 619042 sc-eQTL 3.95e-01 -0.103 0.121 0.128 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -182843 sc-eQTL 5.36e-01 0.0512 0.0826 0.128 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 316660 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0189 0.137 0.128 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 145326 sc-eQTL 4.83e-02 0.185 0.0932 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 978937 sc-eQTL 9.24e-01 0.0118 0.124 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 979017 sc-eQTL 2.87e-01 -0.0978 0.0916 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 848480 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0673 0.126 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 619042 sc-eQTL 9.34e-01 -0.0111 0.134 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -182843 sc-eQTL 6.35e-02 -0.196 0.105 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 316660 sc-eQTL 6.44e-01 0.0614 0.133 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 231198 sc-eQTL 4.21e-01 0.0865 0.107 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 145326 sc-eQTL 8.53e-01 0.0208 0.112 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 978937 sc-eQTL 7.79e-01 0.0309 0.11 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 979017 sc-eQTL 2.08e-01 -0.107 0.0848 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 848480 sc-eQTL 7.15e-02 -0.205 0.113 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 619042 sc-eQTL 9.55e-02 0.156 0.0929 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162398 LEXM 226458 sc-eQTL 3.24e-02 0.225 0.104 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -182843 sc-eQTL 7.08e-02 -0.12 0.0663 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 316660 sc-eQTL 1.98e-01 -0.153 0.119 0.127 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000169174 PCSK9 -7027 pQTL 0.00241 -0.123 0.0403 0.0 0.0 0.132
ENSG00000169174 PCSK9 -7027 eQTL 0.00227 -0.0751 0.0245 0.0 0.0 0.13


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000184313 \N 390767 3.62e-07 4.93e-07 1.23e-07 2.66e-07 1.08e-07 8.45e-08 3.11e-07 5.56e-08 1.98e-07 1.11e-07 2.38e-07 1.37e-07 3.18e-07 8.26e-08 1.24e-07 1.01e-07 8.74e-08 2.83e-07 8.93e-08 6.58e-08 1.34e-07 2.15e-07 2.04e-07 4.91e-08 3.14e-07 1.56e-07 1.23e-07 1.46e-07 1.36e-07 1.81e-07 1.39e-07 7.03e-08 4.87e-08 9.72e-08 3.97e-08 5.05e-08 1.03e-07 7.49e-08 6.08e-08 5.54e-08 4.92e-08 2.5e-07 2.62e-08 2.05e-08 3.4e-08 8.31e-09 8.93e-08 2.13e-09 4.94e-08
ENSG00000215883 \N 832485 2.66e-07 1.11e-07 4.08e-08 1.78e-07 9.65e-08 9.13e-08 1.42e-07 5.21e-08 1.42e-07 4.24e-08 1.63e-07 7.58e-08 1.27e-07 6.21e-08 5.55e-08 8.01e-08 4.94e-08 1.1e-07 5.19e-08 3.89e-08 1.05e-07 1.3e-07 1.3e-07 4.53e-08 1.29e-07 1.13e-07 1.13e-07 8.71e-08 9.97e-08 1.11e-07 9.58e-08 4.07e-08 2.74e-08 8.25e-08 9.27e-08 3.99e-08 5.03e-08 9.35e-08 7.92e-08 3.55e-08 3.27e-08 1.36e-07 3.98e-08 2.48e-08 8.03e-08 1.75e-08 1.26e-07 4.33e-09 4.77e-08