Genes within 1Mb (chr1:55032073:T:TG):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 230750 sc-eQTL 2.19e-01 -0.146 0.119 0.137 B L1
ENSG00000116133 DHCR24 144878 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0827 0.113 0.137 B L1
ENSG00000116205 TCEANC2 978489 sc-eQTL 6.68e-03 0.262 0.0955 0.137 B L1
ENSG00000116209 TMEM59 978569 sc-eQTL 4.97e-01 0.0402 0.0591 0.137 B L1
ENSG00000116221 MRPL37 848032 sc-eQTL 1.26e-02 0.192 0.0763 0.137 B L1
ENSG00000157216 SSBP3 618594 sc-eQTL 1.17e-01 -0.127 0.0806 0.137 B L1
ENSG00000162402 USP24 -183291 sc-eQTL 4.19e-01 0.0555 0.0686 0.137 B L1
ENSG00000215883 CYB5RL 832037 sc-eQTL 4.49e-01 0.1 0.132 0.137 B L1
ENSG00000243725 TTC4 316212 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0949 0.115 0.137 B L1
ENSG00000006555 TTC22 230750 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00179 0.0938 0.137 CD4T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 978489 sc-eQTL 5.66e-01 0.0441 0.0766 0.137 CD4T L1
ENSG00000116209 TMEM59 978569 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0446 0.0714 0.137 CD4T L1
ENSG00000116221 MRPL37 848032 sc-eQTL 6.23e-01 0.0485 0.0987 0.137 CD4T L1
ENSG00000157216 SSBP3 618594 sc-eQTL 2.19e-01 0.101 0.0817 0.137 CD4T L1
ENSG00000162402 USP24 -183291 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0533 0.0667 0.137 CD4T L1
ENSG00000243725 TTC4 316212 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0933 0.1 0.137 CD4T L1
ENSG00000006555 TTC22 230750 sc-eQTL 3.12e-01 0.0821 0.0811 0.137 CD8T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 978489 sc-eQTL 7.00e-01 -0.039 0.101 0.137 CD8T L1
ENSG00000116209 TMEM59 978569 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0441 0.0702 0.137 CD8T L1
ENSG00000116221 MRPL37 848032 sc-eQTL 2.55e-01 0.11 0.0964 0.137 CD8T L1
ENSG00000157216 SSBP3 618594 sc-eQTL 4.05e-01 0.0578 0.0694 0.137 CD8T L1
ENSG00000162402 USP24 -183291 sc-eQTL 5.70e-02 -0.128 0.0666 0.137 CD8T L1
ENSG00000243725 TTC4 316212 sc-eQTL 6.57e-03 -0.314 0.115 0.137 CD8T L1
ENSG00000116133 DHCR24 144878 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0302 0.108 0.14 DC L1
ENSG00000116205 TCEANC2 978489 sc-eQTL 1.69e-01 -0.166 0.12 0.14 DC L1
ENSG00000116209 TMEM59 978569 sc-eQTL 1.73e-01 0.13 0.0946 0.14 DC L1
ENSG00000116221 MRPL37 848032 sc-eQTL 2.33e-01 0.152 0.127 0.14 DC L1
ENSG00000157216 SSBP3 618594 sc-eQTL 2.27e-01 0.138 0.113 0.14 DC L1
ENSG00000162390 ACOT11 489816 sc-eQTL 2.51e-01 0.126 0.109 0.14 DC L1
ENSG00000162402 USP24 -183291 sc-eQTL 9.21e-02 0.111 0.0656 0.14 DC L1
ENSG00000215883 CYB5RL 832037 sc-eQTL 5.41e-02 0.229 0.118 0.14 DC L1
ENSG00000243725 TTC4 316212 sc-eQTL 2.43e-01 -0.15 0.128 0.14 DC L1
ENSG00000116133 DHCR24 144878 sc-eQTL 3.35e-01 0.0758 0.0784 0.137 Mono L1
ENSG00000116205 TCEANC2 978489 sc-eQTL 3.46e-01 0.0799 0.0846 0.137 Mono L1
ENSG00000116209 TMEM59 978569 sc-eQTL 8.19e-01 0.0145 0.063 0.137 Mono L1
ENSG00000116221 MRPL37 848032 sc-eQTL 9.00e-01 0.0132 0.105 0.137 Mono L1
ENSG00000157216 SSBP3 618594 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0874 0.121 0.137 Mono L1
ENSG00000162402 USP24 -183291 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0321 0.0719 0.137 Mono L1
ENSG00000243725 TTC4 316212 sc-eQTL 4.11e-01 -0.104 0.126 0.137 Mono L1
ENSG00000006555 TTC22 230750 sc-eQTL 1.19e-01 0.167 0.107 0.137 NK L1
ENSG00000116133 DHCR24 144878 sc-eQTL 8.71e-01 0.0176 0.108 0.137 NK L1
ENSG00000116205 TCEANC2 978489 sc-eQTL 7.36e-01 0.036 0.107 0.137 NK L1
ENSG00000116209 TMEM59 978569 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0397 0.0836 0.137 NK L1
ENSG00000116221 MRPL37 848032 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0411 0.104 0.137 NK L1
ENSG00000157216 SSBP3 618594 sc-eQTL 1.56e-01 0.128 0.0897 0.137 NK L1
ENSG00000162398 LEXM 226010 sc-eQTL 3.18e-01 0.101 0.101 0.137 NK L1
ENSG00000162402 USP24 -183291 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0386 0.0613 0.137 NK L1
ENSG00000243725 TTC4 316212 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00362 0.116 0.137 NK L1
ENSG00000006555 TTC22 230750 sc-eQTL 8.57e-01 0.0174 0.096 0.137 Other_T L1
ENSG00000116133 DHCR24 144878 sc-eQTL 3.43e-01 0.0706 0.0744 0.137 Other_T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 978489 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0408 0.111 0.137 Other_T L1
ENSG00000116209 TMEM59 978569 sc-eQTL 1.88e-01 0.101 0.0762 0.137 Other_T L1
ENSG00000116221 MRPL37 848032 sc-eQTL 2.42e-01 0.0838 0.0715 0.137 Other_T L1
ENSG00000157216 SSBP3 618594 sc-eQTL 2.23e-01 0.101 0.0826 0.137 Other_T L1
ENSG00000162402 USP24 -183291 sc-eQTL 2.74e-01 -0.0966 0.088 0.137 Other_T L1
ENSG00000215883 CYB5RL 832037 sc-eQTL 6.61e-01 -0.053 0.121 0.137 Other_T L1
ENSG00000243725 TTC4 316212 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0652 0.12 0.137 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 230750 sc-eQTL 3.19e-01 0.101 0.101 0.135 B_Activated L2
ENSG00000116133 DHCR24 144878 sc-eQTL 7.03e-02 0.214 0.118 0.135 B_Activated L2
ENSG00000116205 TCEANC2 978489 sc-eQTL 1.70e-01 -0.175 0.127 0.135 B_Activated L2
ENSG00000116209 TMEM59 978569 sc-eQTL 7.10e-01 0.0505 0.135 0.135 B_Activated L2
ENSG00000116221 MRPL37 848032 sc-eQTL 9.90e-01 0.00186 0.146 0.135 B_Activated L2
ENSG00000157216 SSBP3 618594 sc-eQTL 1.19e-01 -0.206 0.132 0.135 B_Activated L2
ENSG00000162402 USP24 -183291 sc-eQTL 1.14e-01 0.204 0.128 0.135 B_Activated L2
ENSG00000215883 CYB5RL 832037 sc-eQTL 2.54e-01 -0.13 0.114 0.135 B_Activated L2
ENSG00000243725 TTC4 316212 sc-eQTL 4.50e-01 0.0936 0.124 0.135 B_Activated L2
ENSG00000006555 TTC22 230750 sc-eQTL 5.97e-01 0.0673 0.127 0.135 B_Intermediate L2
ENSG00000116133 DHCR24 144878 sc-eQTL 2.24e-01 -0.143 0.118 0.135 B_Intermediate L2
ENSG00000116205 TCEANC2 978489 sc-eQTL 3.96e-01 0.0997 0.117 0.135 B_Intermediate L2
ENSG00000116209 TMEM59 978569 sc-eQTL 5.52e-01 0.0599 0.1 0.135 B_Intermediate L2
ENSG00000116221 MRPL37 848032 sc-eQTL 6.53e-01 0.0533 0.118 0.135 B_Intermediate L2
ENSG00000157216 SSBP3 618594 sc-eQTL 6.17e-01 0.0553 0.11 0.135 B_Intermediate L2
ENSG00000162402 USP24 -183291 sc-eQTL 1.53e-01 0.133 0.0926 0.135 B_Intermediate L2
ENSG00000215883 CYB5RL 832037 sc-eQTL 9.58e-01 0.007 0.132 0.135 B_Intermediate L2
ENSG00000243725 TTC4 316212 sc-eQTL 1.03e-02 -0.305 0.118 0.135 B_Intermediate L2
ENSG00000006555 TTC22 230750 sc-eQTL 1.88e-02 -0.288 0.122 0.138 B_Memory L2
ENSG00000116133 DHCR24 144878 sc-eQTL 6.53e-02 0.225 0.121 0.138 B_Memory L2
ENSG00000116205 TCEANC2 978489 sc-eQTL 2.03e-01 -0.166 0.13 0.138 B_Memory L2
ENSG00000116209 TMEM59 978569 sc-eQTL 5.35e-01 0.0677 0.109 0.138 B_Memory L2
ENSG00000116221 MRPL37 848032 sc-eQTL 3.48e-01 0.104 0.11 0.138 B_Memory L2
ENSG00000157216 SSBP3 618594 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0405 0.103 0.138 B_Memory L2
ENSG00000162402 USP24 -183291 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0772 0.101 0.138 B_Memory L2
ENSG00000215883 CYB5RL 832037 sc-eQTL 2.48e-01 -0.144 0.124 0.138 B_Memory L2
ENSG00000243725 TTC4 316212 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0664 0.129 0.138 B_Memory L2
ENSG00000006555 TTC22 230750 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0524 0.127 0.137 B_Naive1 L2
ENSG00000116133 DHCR24 144878 sc-eQTL 2.46e-01 -0.138 0.118 0.137 B_Naive1 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 978489 sc-eQTL 7.32e-04 0.353 0.103 0.137 B_Naive1 L2
ENSG00000116209 TMEM59 978569 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0445 0.0769 0.137 B_Naive1 L2
ENSG00000116221 MRPL37 848032 sc-eQTL 1.16e-01 0.178 0.113 0.137 B_Naive1 L2
ENSG00000157216 SSBP3 618594 sc-eQTL 1.29e-01 -0.164 0.108 0.137 B_Naive1 L2
ENSG00000162402 USP24 -183291 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0534 0.0851 0.137 B_Naive1 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 832037 sc-eQTL 3.80e-01 0.113 0.128 0.137 B_Naive1 L2
ENSG00000243725 TTC4 316212 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0572 0.116 0.137 B_Naive1 L2
ENSG00000006555 TTC22 230750 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0482 0.128 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000116133 DHCR24 144878 sc-eQTL 2.72e-01 0.123 0.111 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 978489 sc-eQTL 1.83e-01 0.165 0.123 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000116209 TMEM59 978569 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0389 0.102 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000116221 MRPL37 848032 sc-eQTL 1.42e-01 0.176 0.12 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000157216 SSBP3 618594 sc-eQTL 9.03e-01 0.0144 0.118 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000162402 USP24 -183291 sc-eQTL 4.47e-01 0.0713 0.0937 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 832037 sc-eQTL 9.77e-01 0.00373 0.132 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000243725 TTC4 316212 sc-eQTL 4.28e-01 -0.109 0.137 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000006555 TTC22 230750 sc-eQTL 1.85e-02 0.283 0.119 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 978489 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0135 0.124 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 978569 sc-eQTL 1.48e-01 0.163 0.113 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 848032 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0264 0.139 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 618594 sc-eQTL 4.31e-02 0.172 0.0847 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -183291 sc-eQTL 2.03e-01 0.15 0.117 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 316212 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0174 0.132 0.143 CD4_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 230750 sc-eQTL 9.62e-01 0.00526 0.109 0.137 CD4_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 978489 sc-eQTL 7.00e-01 0.0319 0.0828 0.137 CD4_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 978569 sc-eQTL 1.50e-01 -0.116 0.0802 0.137 CD4_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 848032 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00277 0.104 0.137 CD4_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 618594 sc-eQTL 1.10e-01 0.132 0.0824 0.137 CD4_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -183291 sc-eQTL 2.34e-01 -0.085 0.0713 0.137 CD4_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 316212 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0794 0.109 0.137 CD4_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 230750 sc-eQTL 3.16e-01 -0.117 0.117 0.137 CD4_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 978489 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0536 0.114 0.137 CD4_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 978569 sc-eQTL 7.04e-01 0.0327 0.0859 0.137 CD4_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 848032 sc-eQTL 5.94e-01 0.0577 0.108 0.137 CD4_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 618594 sc-eQTL 4.65e-01 0.0774 0.106 0.137 CD4_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -183291 sc-eQTL 3.10e-01 -0.0891 0.0876 0.137 CD4_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 316212 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0238 0.126 0.137 CD4_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 230750 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0456 0.135 0.137 CD4_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 978489 sc-eQTL 4.98e-01 0.0869 0.128 0.137 CD4_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 978569 sc-eQTL 7.46e-01 0.0323 0.0993 0.137 CD4_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 848032 sc-eQTL 3.12e-01 0.129 0.128 0.137 CD4_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 618594 sc-eQTL 2.01e-01 0.14 0.109 0.137 CD4_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -183291 sc-eQTL 4.52e-01 0.0751 0.0996 0.137 CD4_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 316212 sc-eQTL 2.05e-01 -0.167 0.131 0.137 CD4_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 230750 sc-eQTL 2.99e-01 0.11 0.106 0.137 CD8_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 978489 sc-eQTL 5.72e-01 0.0664 0.117 0.137 CD8_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 978569 sc-eQTL 7.37e-01 0.0343 0.102 0.137 CD8_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 848032 sc-eQTL 1.18e-01 0.188 0.12 0.137 CD8_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 618594 sc-eQTL 5.79e-01 0.0459 0.0825 0.137 CD8_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -183291 sc-eQTL 1.06e-01 -0.133 0.0816 0.137 CD8_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 316212 sc-eQTL 1.71e-02 -0.291 0.121 0.137 CD8_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 230750 sc-eQTL 3.09e-01 -0.12 0.118 0.137 CD8_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 978489 sc-eQTL 1.93e-01 -0.139 0.106 0.137 CD8_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 978569 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0929 0.104 0.137 CD8_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 848032 sc-eQTL 6.05e-01 0.0648 0.125 0.137 CD8_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 618594 sc-eQTL 1.76e-01 0.128 0.0942 0.137 CD8_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -183291 sc-eQTL 5.39e-01 -0.053 0.086 0.137 CD8_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 316212 sc-eQTL 2.77e-01 -0.137 0.126 0.137 CD8_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 230750 sc-eQTL 2.31e-01 0.151 0.126 0.144 CD8_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 978489 sc-eQTL 2.55e-01 -0.145 0.127 0.144 CD8_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 978569 sc-eQTL 1.80e-01 0.15 0.111 0.144 CD8_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 848032 sc-eQTL 1.50e-01 0.183 0.126 0.144 CD8_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 618594 sc-eQTL 2.49e-01 0.127 0.11 0.144 CD8_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -183291 sc-eQTL 3.58e-01 0.0982 0.107 0.144 CD8_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 316212 sc-eQTL 5.09e-01 0.0858 0.13 0.144 CD8_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 230750 sc-eQTL 5.93e-01 0.069 0.129 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 978489 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00589 0.134 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 978569 sc-eQTL 7.65e-01 0.039 0.13 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 848032 sc-eQTL 7.21e-01 0.0472 0.132 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 618594 sc-eQTL 6.60e-01 0.0549 0.125 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -183291 sc-eQTL 8.08e-01 0.0319 0.131 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 316212 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0183 0.133 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 230750 sc-eQTL 4.96e-01 0.077 0.113 0.139 MAIT L2
ENSG00000116133 DHCR24 144878 sc-eQTL 4.97e-01 0.0569 0.0837 0.139 MAIT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 978489 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0131 0.118 0.139 MAIT L2
ENSG00000116209 TMEM59 978569 sc-eQTL 3.80e-01 0.0936 0.106 0.139 MAIT L2
ENSG00000116221 MRPL37 848032 sc-eQTL 6.44e-01 0.0599 0.129 0.139 MAIT L2
ENSG00000157216 SSBP3 618594 sc-eQTL 2.38e-01 0.135 0.114 0.139 MAIT L2
ENSG00000162402 USP24 -183291 sc-eQTL 2.51e-03 -0.305 0.0997 0.139 MAIT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 832037 sc-eQTL 5.31e-01 0.0743 0.118 0.139 MAIT L2
ENSG00000243725 TTC4 316212 sc-eQTL 7.22e-01 0.042 0.118 0.139 MAIT L2
ENSG00000006555 TTC22 230750 sc-eQTL 6.80e-01 0.0545 0.132 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000116133 DHCR24 144878 sc-eQTL 8.09e-01 0.0283 0.117 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000116205 TCEANC2 978489 sc-eQTL 5.80e-01 0.0684 0.123 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000116209 TMEM59 978569 sc-eQTL 9.84e-01 0.00244 0.12 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000116221 MRPL37 848032 sc-eQTL 3.72e-01 -0.12 0.134 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000157216 SSBP3 618594 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0537 0.101 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000162398 LEXM 226010 sc-eQTL 1.94e-01 0.155 0.119 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000162402 USP24 -183291 sc-eQTL 5.80e-01 -0.057 0.103 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000243725 TTC4 316212 sc-eQTL 1.65e-01 0.18 0.129 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000006555 TTC22 230750 sc-eQTL 1.78e-01 0.144 0.106 0.138 NK_CD56dim L2
ENSG00000116133 DHCR24 144878 sc-eQTL 9.60e-01 -0.0056 0.112 0.138 NK_CD56dim L2
ENSG00000116205 TCEANC2 978489 sc-eQTL 7.33e-01 0.0413 0.121 0.138 NK_CD56dim L2
ENSG00000116209 TMEM59 978569 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0308 0.0895 0.138 NK_CD56dim L2
ENSG00000116221 MRPL37 848032 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0284 0.116 0.138 NK_CD56dim L2
ENSG00000157216 SSBP3 618594 sc-eQTL 2.03e-01 0.121 0.095 0.138 NK_CD56dim L2
ENSG00000162398 LEXM 226010 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00121 0.11 0.138 NK_CD56dim L2
ENSG00000162402 USP24 -183291 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0501 0.0696 0.138 NK_CD56dim L2
ENSG00000243725 TTC4 316212 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0988 0.119 0.138 NK_CD56dim L2
ENSG00000006555 TTC22 230750 sc-eQTL 2.23e-01 0.157 0.129 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000116133 DHCR24 144878 sc-eQTL 2.89e-01 0.133 0.126 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000116205 TCEANC2 978489 sc-eQTL 8.35e-01 0.0253 0.121 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000116209 TMEM59 978569 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0441 0.121 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000116221 MRPL37 848032 sc-eQTL 5.61e-01 0.0773 0.133 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000157216 SSBP3 618594 sc-eQTL 1.55e-01 0.154 0.108 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000162398 LEXM 226010 sc-eQTL 1.75e-01 0.166 0.122 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000162402 USP24 -183291 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0511 0.0897 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000243725 TTC4 316212 sc-eQTL 2.09e-01 -0.168 0.134 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000006555 TTC22 230750 sc-eQTL 6.93e-01 0.0454 0.115 0.138 NK_cytokine L2
ENSG00000116133 DHCR24 144878 sc-eQTL 6.30e-01 0.056 0.116 0.138 NK_cytokine L2
ENSG00000116205 TCEANC2 978489 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0569 0.115 0.138 NK_cytokine L2
ENSG00000116209 TMEM59 978569 sc-eQTL 1.06e-01 -0.151 0.093 0.138 NK_cytokine L2
ENSG00000116221 MRPL37 848032 sc-eQTL 7.02e-01 0.0442 0.115 0.138 NK_cytokine L2
ENSG00000157216 SSBP3 618594 sc-eQTL 8.34e-02 0.167 0.0961 0.138 NK_cytokine L2
ENSG00000162398 LEXM 226010 sc-eQTL 1.11e-01 0.193 0.12 0.138 NK_cytokine L2
ENSG00000162402 USP24 -183291 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0462 0.0824 0.138 NK_cytokine L2
ENSG00000243725 TTC4 316212 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000719 0.122 0.138 NK_cytokine L2
ENSG00000006555 TTC22 230750 sc-eQTL 2.66e-01 0.168 0.15 0.137 PB L2
ENSG00000116133 DHCR24 144878 sc-eQTL 9.40e-01 0.01 0.134 0.137 PB L2
ENSG00000116205 TCEANC2 978489 sc-eQTL 4.54e-02 0.324 0.16 0.137 PB L2
ENSG00000116209 TMEM59 978569 sc-eQTL 3.49e-02 0.142 0.0667 0.137 PB L2
ENSG00000116221 MRPL37 848032 sc-eQTL 2.19e-01 0.152 0.123 0.137 PB L2
ENSG00000157216 SSBP3 618594 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0934 0.143 0.137 PB L2
ENSG00000162402 USP24 -183291 sc-eQTL 9.28e-01 -0.0146 0.162 0.137 PB L2
ENSG00000215883 CYB5RL 832037 sc-eQTL 4.29e-01 -0.133 0.168 0.137 PB L2
ENSG00000243725 TTC4 316212 sc-eQTL 4.27e-01 0.125 0.157 0.137 PB L2
ENSG00000006555 TTC22 230750 sc-eQTL 7.61e-01 0.0362 0.119 0.139 Pro_T L2
ENSG00000116133 DHCR24 144878 sc-eQTL 2.51e-01 0.116 0.1 0.139 Pro_T L2
ENSG00000116205 TCEANC2 978489 sc-eQTL 3.24e-01 -0.121 0.123 0.139 Pro_T L2
ENSG00000116209 TMEM59 978569 sc-eQTL 9.24e-01 0.00819 0.0854 0.139 Pro_T L2
ENSG00000116221 MRPL37 848032 sc-eQTL 8.30e-01 -0.018 0.0836 0.139 Pro_T L2
ENSG00000157216 SSBP3 618594 sc-eQTL 2.13e-01 -0.117 0.0934 0.139 Pro_T L2
ENSG00000162402 USP24 -183291 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0511 0.114 0.139 Pro_T L2
ENSG00000215883 CYB5RL 832037 sc-eQTL 1.12e-01 -0.179 0.112 0.139 Pro_T L2
ENSG00000243725 TTC4 316212 sc-eQTL 4.99e-01 0.085 0.125 0.139 Pro_T L2
ENSG00000006555 TTC22 230750 sc-eQTL 5.27e-01 0.0745 0.118 0.137 Treg L2
ENSG00000116205 TCEANC2 978489 sc-eQTL 8.43e-01 0.0249 0.126 0.137 Treg L2
ENSG00000116209 TMEM59 978569 sc-eQTL 9.22e-01 0.00977 0.0996 0.137 Treg L2
ENSG00000116221 MRPL37 848032 sc-eQTL 7.30e-01 0.0426 0.123 0.137 Treg L2
ENSG00000157216 SSBP3 618594 sc-eQTL 5.78e-01 0.0613 0.11 0.137 Treg L2
ENSG00000162402 USP24 -183291 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0747 0.105 0.137 Treg L2
ENSG00000243725 TTC4 316212 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0415 0.132 0.137 Treg L2
ENSG00000116133 DHCR24 144878 sc-eQTL 5.51e-01 0.0642 0.108 0.137 cDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 978489 sc-eQTL 6.17e-02 -0.236 0.126 0.137 cDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 978569 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0637 0.108 0.137 cDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 848032 sc-eQTL 5.37e-01 0.0853 0.138 0.137 cDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 618594 sc-eQTL 5.89e-01 0.0688 0.127 0.137 cDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 489816 sc-eQTL 5.49e-01 0.0709 0.118 0.137 cDC L2
ENSG00000162402 USP24 -183291 sc-eQTL 1.80e-01 -0.178 0.132 0.137 cDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 832037 sc-eQTL 1.71e-01 0.156 0.113 0.137 cDC L2
ENSG00000243725 TTC4 316212 sc-eQTL 2.83e-02 -0.297 0.134 0.137 cDC L2
ENSG00000116133 DHCR24 144878 sc-eQTL 2.71e-01 0.0842 0.0763 0.137 cMono_IL1B L2
ENSG00000116205 TCEANC2 978489 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0688 0.106 0.137 cMono_IL1B L2
ENSG00000116209 TMEM59 978569 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0215 0.0645 0.137 cMono_IL1B L2
ENSG00000116221 MRPL37 848032 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0314 0.115 0.137 cMono_IL1B L2
ENSG00000157216 SSBP3 618594 sc-eQTL 2.55e-01 -0.134 0.117 0.137 cMono_IL1B L2
ENSG00000162402 USP24 -183291 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0354 0.0866 0.137 cMono_IL1B L2
ENSG00000243725 TTC4 316212 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0485 0.132 0.137 cMono_IL1B L2
ENSG00000116133 DHCR24 144878 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0312 0.0721 0.137 cMono_S100A L2
ENSG00000116205 TCEANC2 978489 sc-eQTL 2.87e-02 0.24 0.109 0.137 cMono_S100A L2
ENSG00000116209 TMEM59 978569 sc-eQTL 5.06e-01 0.0586 0.088 0.137 cMono_S100A L2
ENSG00000116221 MRPL37 848032 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0667 0.127 0.137 cMono_S100A L2
ENSG00000157216 SSBP3 618594 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0551 0.132 0.137 cMono_S100A L2
ENSG00000162402 USP24 -183291 sc-eQTL 6.24e-01 0.0525 0.107 0.137 cMono_S100A L2
ENSG00000243725 TTC4 316212 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0808 0.134 0.137 cMono_S100A L2
ENSG00000006555 TTC22 230750 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0236 0.12 0.148 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 144878 sc-eQTL 9.98e-02 -0.22 0.133 0.148 gdT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 978489 sc-eQTL 2.40e-01 0.158 0.134 0.148 gdT L2
ENSG00000116209 TMEM59 978569 sc-eQTL 9.85e-01 0.00256 0.137 0.148 gdT L2
ENSG00000116221 MRPL37 848032 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0752 0.157 0.148 gdT L2
ENSG00000157216 SSBP3 618594 sc-eQTL 6.86e-01 0.0389 0.096 0.148 gdT L2
ENSG00000162402 USP24 -183291 sc-eQTL 3.84e-01 0.112 0.129 0.148 gdT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 832037 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0149 0.134 0.148 gdT L2
ENSG00000243725 TTC4 316212 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0763 0.151 0.148 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 144878 sc-eQTL 2.97e-01 0.101 0.0969 0.138 intMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 978489 sc-eQTL 3.63e-01 0.11 0.121 0.138 intMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 978569 sc-eQTL 1.79e-01 0.119 0.0885 0.138 intMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 848032 sc-eQTL 1.05e-01 0.22 0.135 0.138 intMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 618594 sc-eQTL 6.17e-01 0.0695 0.139 0.138 intMono L2
ENSG00000162402 USP24 -183291 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0981 0.124 0.138 intMono L2
ENSG00000243725 TTC4 316212 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0588 0.132 0.138 intMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 144878 sc-eQTL 6.78e-01 0.0409 0.0985 0.133 ncMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 978489 sc-eQTL 6.30e-01 0.0593 0.123 0.133 ncMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 978569 sc-eQTL 6.97e-01 0.0384 0.0985 0.133 ncMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 848032 sc-eQTL 3.79e-01 -0.112 0.127 0.133 ncMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 618594 sc-eQTL 6.94e-01 0.0548 0.139 0.133 ncMono L2
ENSG00000162402 USP24 -183291 sc-eQTL 6.98e-01 0.0432 0.111 0.133 ncMono L2
ENSG00000243725 TTC4 316212 sc-eQTL 9.36e-01 0.0106 0.131 0.133 ncMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 144878 sc-eQTL 4.96e-01 0.0789 0.116 0.136 pDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 978489 sc-eQTL 1.51e-01 -0.199 0.138 0.136 pDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 978569 sc-eQTL 1.93e-01 0.144 0.11 0.136 pDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 848032 sc-eQTL 1.64e-01 0.205 0.147 0.136 pDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 618594 sc-eQTL 2.84e-01 0.14 0.13 0.136 pDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 489816 sc-eQTL 5.96e-01 0.0292 0.055 0.136 pDC L2
ENSG00000162402 USP24 -183291 sc-eQTL 9.61e-03 0.239 0.091 0.136 pDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 832037 sc-eQTL 4.45e-01 0.0971 0.127 0.136 pDC L2
ENSG00000243725 TTC4 316212 sc-eQTL 8.00e-01 0.0373 0.147 0.136 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 230750 sc-eQTL 4.07e-01 -0.101 0.122 0.137 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 144878 sc-eQTL 1.18e-01 0.191 0.122 0.137 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 978489 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0435 0.118 0.137 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 978569 sc-eQTL 6.16e-01 0.0461 0.0919 0.137 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 848032 sc-eQTL 3.20e-01 0.109 0.11 0.137 B_Memory LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 618594 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0668 0.0956 0.137 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -183291 sc-eQTL 1.27e-01 0.133 0.0868 0.137 B_Memory LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 832037 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0895 0.134 0.137 B_Memory LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 316212 sc-eQTL 2.32e-02 -0.272 0.119 0.137 B_Memory LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 230750 sc-eQTL 4.20e-01 -0.103 0.128 0.137 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 144878 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0402 0.115 0.137 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 978489 sc-eQTL 9.88e-04 0.339 0.102 0.137 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 978569 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0284 0.074 0.137 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 848032 sc-eQTL 6.51e-02 0.196 0.106 0.137 B_Naive LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 618594 sc-eQTL 2.19e-01 -0.117 0.0949 0.137 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -183291 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0187 0.0817 0.137 B_Naive LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 832037 sc-eQTL 8.64e-01 0.0221 0.129 0.137 B_Naive LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 316212 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0733 0.122 0.137 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 144878 sc-eQTL 5.29e-01 0.047 0.0747 0.137 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 978489 sc-eQTL 5.76e-01 0.0523 0.0934 0.137 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 978569 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00348 0.0645 0.137 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 848032 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0183 0.114 0.137 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 618594 sc-eQTL 2.48e-01 -0.138 0.119 0.137 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -183291 sc-eQTL 9.67e-01 0.00334 0.0817 0.137 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 316212 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0734 0.135 0.137 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 144878 sc-eQTL 8.81e-01 0.0137 0.0913 0.136 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 978489 sc-eQTL 4.54e-01 0.0899 0.12 0.136 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 978569 sc-eQTL 8.91e-02 0.151 0.0886 0.136 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 848032 sc-eQTL 7.17e-01 0.0443 0.122 0.136 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 618594 sc-eQTL 8.27e-01 0.0285 0.13 0.136 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -183291 sc-eQTL 4.84e-01 -0.072 0.103 0.136 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 316212 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0822 0.129 0.136 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 230750 sc-eQTL 2.18e-01 0.129 0.105 0.138 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 144878 sc-eQTL 7.09e-01 0.0411 0.11 0.138 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 978489 sc-eQTL 8.99e-01 0.0138 0.108 0.138 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 978569 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0485 0.0834 0.138 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 848032 sc-eQTL 9.65e-01 -0.0049 0.112 0.138 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 618594 sc-eQTL 1.19e-01 0.143 0.0911 0.138 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162398 LEXM 226010 sc-eQTL 2.74e-01 0.113 0.103 0.138 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -183291 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0303 0.0655 0.138 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 316212 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0537 0.117 0.138 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000116221 MRPL37 848032 eQTL 0.0117 -0.0505 0.02 0.0014 0.0 0.114
ENSG00000162399 BSND 33880 pQTL 0.0272 -0.106 0.048 0.00123 0.0 0.12


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000243725 \N 316212 1.01e-06 5.18e-07 6.45e-08 3.57e-07 1.07e-07 4.49e-07 7.22e-07 5.62e-08 3.94e-07 1.28e-07 1.07e-06 5.22e-07 8.34e-07 1.6e-07 5.69e-08 1.14e-07 1.35e-07 3.67e-07 1.36e-07 5.87e-08 2.61e-07 4.99e-07 4.12e-07 4.34e-08 6.65e-07 2.7e-07 1.29e-07 1.52e-07 3.58e-07 7.42e-07 2.19e-07 4.07e-08 5.64e-08 1.01e-07 1.97e-07 5.23e-08 5.76e-08 6.11e-08 4.72e-08 4.47e-08 3.89e-08 4.95e-07 2.92e-08 1.33e-07 3.84e-08 6.39e-09 7e-08 3.8e-09 4.79e-08