Genes within 1Mb (chr1:55031188:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 229865 sc-eQTL 1.04e-01 -0.277 0.169 0.06 B L1
ENSG00000116133 DHCR24 143993 sc-eQTL 9.33e-02 0.27 0.16 0.06 B L1
ENSG00000116205 TCEANC2 977604 sc-eQTL 1.19e-01 0.216 0.138 0.06 B L1
ENSG00000116209 TMEM59 977684 sc-eQTL 9.23e-01 -0.00818 0.0848 0.06 B L1
ENSG00000116221 MRPL37 847147 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0144 0.111 0.06 B L1
ENSG00000157216 SSBP3 617709 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00516 0.116 0.06 B L1
ENSG00000162402 USP24 -184176 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0363 0.0983 0.06 B L1
ENSG00000215883 CYB5RL 831152 sc-eQTL 7.77e-01 0.0538 0.189 0.06 B L1
ENSG00000243725 TTC4 315327 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0812 0.165 0.06 B L1
ENSG00000006555 TTC22 229865 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0144 0.134 0.06 CD4T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 977604 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0813 0.11 0.06 CD4T L1
ENSG00000116209 TMEM59 977684 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0492 0.102 0.06 CD4T L1
ENSG00000116221 MRPL37 847147 sc-eQTL 1.05e-01 0.229 0.14 0.06 CD4T L1
ENSG00000157216 SSBP3 617709 sc-eQTL 9.06e-01 0.0139 0.117 0.06 CD4T L1
ENSG00000162402 USP24 -184176 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0542 0.0956 0.06 CD4T L1
ENSG00000243725 TTC4 315327 sc-eQTL 1.24e-01 -0.221 0.143 0.06 CD4T L1
ENSG00000006555 TTC22 229865 sc-eQTL 2.87e-01 0.123 0.116 0.06 CD8T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 977604 sc-eQTL 8.39e-01 0.0293 0.145 0.06 CD8T L1
ENSG00000116209 TMEM59 977684 sc-eQTL 3.82e-01 0.0879 0.1 0.06 CD8T L1
ENSG00000116221 MRPL37 847147 sc-eQTL 4.66e-01 0.101 0.138 0.06 CD8T L1
ENSG00000157216 SSBP3 617709 sc-eQTL 2.34e-01 0.118 0.0989 0.06 CD8T L1
ENSG00000162402 USP24 -184176 sc-eQTL 6.82e-02 -0.175 0.0952 0.06 CD8T L1
ENSG00000243725 TTC4 315327 sc-eQTL 2.56e-01 -0.189 0.166 0.06 CD8T L1
ENSG00000116133 DHCR24 143993 sc-eQTL 4.95e-01 0.103 0.151 0.063 DC L1
ENSG00000116205 TCEANC2 977604 sc-eQTL 7.98e-02 -0.297 0.169 0.063 DC L1
ENSG00000116209 TMEM59 977684 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0874 0.133 0.063 DC L1
ENSG00000116221 MRPL37 847147 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0314 0.179 0.063 DC L1
ENSG00000157216 SSBP3 617709 sc-eQTL 2.93e-02 0.347 0.158 0.063 DC L1
ENSG00000162390 ACOT11 488931 sc-eQTL 3.95e-01 -0.131 0.153 0.063 DC L1
ENSG00000162402 USP24 -184176 sc-eQTL 5.44e-01 0.0564 0.0927 0.063 DC L1
ENSG00000215883 CYB5RL 831152 sc-eQTL 8.13e-01 0.0398 0.168 0.063 DC L1
ENSG00000243725 TTC4 315327 sc-eQTL 4.08e-01 -0.149 0.18 0.063 DC L1
ENSG00000116133 DHCR24 143993 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0756 0.11 0.06 Mono L1
ENSG00000116205 TCEANC2 977604 sc-eQTL 2.29e-01 0.143 0.118 0.06 Mono L1
ENSG00000116209 TMEM59 977684 sc-eQTL 5.74e-02 0.167 0.0874 0.06 Mono L1
ENSG00000116221 MRPL37 847147 sc-eQTL 1.84e-01 -0.196 0.147 0.06 Mono L1
ENSG00000157216 SSBP3 617709 sc-eQTL 4.38e-01 0.131 0.169 0.06 Mono L1
ENSG00000162402 USP24 -184176 sc-eQTL 8.62e-01 0.0175 0.101 0.06 Mono L1
ENSG00000243725 TTC4 315327 sc-eQTL 8.53e-01 0.0329 0.177 0.06 Mono L1
ENSG00000006555 TTC22 229865 sc-eQTL 3.30e-01 0.149 0.152 0.06 NK L1
ENSG00000116133 DHCR24 143993 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000825 0.154 0.06 NK L1
ENSG00000116205 TCEANC2 977604 sc-eQTL 6.84e-01 0.0619 0.152 0.06 NK L1
ENSG00000116209 TMEM59 977684 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0421 0.119 0.06 NK L1
ENSG00000116221 MRPL37 847147 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00961 0.148 0.06 NK L1
ENSG00000157216 SSBP3 617709 sc-eQTL 9.13e-01 0.014 0.129 0.06 NK L1
ENSG00000162398 LEXM 225125 sc-eQTL 4.31e-01 0.113 0.144 0.06 NK L1
ENSG00000162402 USP24 -184176 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0393 0.0874 0.06 NK L1
ENSG00000243725 TTC4 315327 sc-eQTL 2.40e-02 -0.371 0.163 0.06 NK L1
ENSG00000006555 TTC22 229865 sc-eQTL 5.01e-01 0.0913 0.135 0.06 Other_T L1
ENSG00000116133 DHCR24 143993 sc-eQTL 9.60e-01 0.00526 0.105 0.06 Other_T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 977604 sc-eQTL 7.45e-01 0.0512 0.157 0.06 Other_T L1
ENSG00000116209 TMEM59 977684 sc-eQTL 8.32e-01 0.0229 0.108 0.06 Other_T L1
ENSG00000116221 MRPL37 847147 sc-eQTL 8.52e-02 0.174 0.1 0.06 Other_T L1
ENSG00000157216 SSBP3 617709 sc-eQTL 5.08e-02 0.228 0.116 0.06 Other_T L1
ENSG00000162402 USP24 -184176 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0613 0.124 0.06 Other_T L1
ENSG00000215883 CYB5RL 831152 sc-eQTL 4.62e-01 -0.125 0.17 0.06 Other_T L1
ENSG00000243725 TTC4 315327 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00998 0.169 0.06 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 229865 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0265 0.144 0.064 B_Activated L2
ENSG00000116133 DHCR24 143993 sc-eQTL 5.86e-01 0.092 0.169 0.064 B_Activated L2
ENSG00000116205 TCEANC2 977604 sc-eQTL 3.68e-01 -0.163 0.181 0.064 B_Activated L2
ENSG00000116209 TMEM59 977684 sc-eQTL 1.15e-01 -0.303 0.191 0.064 B_Activated L2
ENSG00000116221 MRPL37 847147 sc-eQTL 5.20e-01 -0.134 0.208 0.064 B_Activated L2
ENSG00000157216 SSBP3 617709 sc-eQTL 9.33e-01 -0.0159 0.188 0.064 B_Activated L2
ENSG00000162402 USP24 -184176 sc-eQTL 8.51e-01 0.0345 0.184 0.064 B_Activated L2
ENSG00000215883 CYB5RL 831152 sc-eQTL 4.48e-01 -0.123 0.162 0.064 B_Activated L2
ENSG00000243725 TTC4 315327 sc-eQTL 1.65e-01 0.244 0.175 0.064 B_Activated L2
ENSG00000006555 TTC22 229865 sc-eQTL 4.93e-02 -0.357 0.181 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000116133 DHCR24 143993 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0889 0.169 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000116205 TCEANC2 977604 sc-eQTL 7.48e-01 0.0541 0.168 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000116209 TMEM59 977684 sc-eQTL 3.60e-01 0.132 0.144 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000116221 MRPL37 847147 sc-eQTL 5.52e-01 -0.101 0.169 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000157216 SSBP3 617709 sc-eQTL 3.19e-01 0.158 0.158 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000162402 USP24 -184176 sc-eQTL 1.83e-01 0.177 0.133 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000215883 CYB5RL 831152 sc-eQTL 8.49e-01 0.036 0.189 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000243725 TTC4 315327 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0898 0.172 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000006555 TTC22 229865 sc-eQTL 5.53e-01 -0.102 0.172 0.06 B_Memory L2
ENSG00000116133 DHCR24 143993 sc-eQTL 7.32e-03 0.455 0.168 0.06 B_Memory L2
ENSG00000116205 TCEANC2 977604 sc-eQTL 4.33e-01 -0.143 0.182 0.06 B_Memory L2
ENSG00000116209 TMEM59 977684 sc-eQTL 2.66e-01 -0.169 0.152 0.06 B_Memory L2
ENSG00000116221 MRPL37 847147 sc-eQTL 7.12e-02 0.278 0.153 0.06 B_Memory L2
ENSG00000157216 SSBP3 617709 sc-eQTL 2.42e-01 -0.168 0.144 0.06 B_Memory L2
ENSG00000162402 USP24 -184176 sc-eQTL 8.70e-01 0.0231 0.141 0.06 B_Memory L2
ENSG00000215883 CYB5RL 831152 sc-eQTL 3.05e-01 -0.179 0.174 0.06 B_Memory L2
ENSG00000243725 TTC4 315327 sc-eQTL 4.13e-01 -0.148 0.18 0.06 B_Memory L2
ENSG00000006555 TTC22 229865 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0269 0.18 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000116133 DHCR24 143993 sc-eQTL 4.20e-01 0.136 0.169 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 977604 sc-eQTL 4.53e-02 0.301 0.149 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000116209 TMEM59 977684 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0314 0.11 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000116221 MRPL37 847147 sc-eQTL 8.23e-01 0.0362 0.162 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000157216 SSBP3 617709 sc-eQTL 2.99e-01 0.16 0.153 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000162402 USP24 -184176 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0202 0.121 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 831152 sc-eQTL 3.26e-01 0.179 0.182 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000243725 TTC4 315327 sc-eQTL 1.28e-01 -0.251 0.164 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000006555 TTC22 229865 sc-eQTL 3.85e-01 -0.157 0.18 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000116133 DHCR24 143993 sc-eQTL 4.49e-01 0.119 0.157 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 977604 sc-eQTL 5.44e-01 0.106 0.174 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000116209 TMEM59 977684 sc-eQTL 5.59e-01 0.0839 0.143 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000116221 MRPL37 847147 sc-eQTL 2.48e-01 -0.195 0.168 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000157216 SSBP3 617709 sc-eQTL 6.87e-01 0.067 0.166 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000162402 USP24 -184176 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0783 0.132 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 831152 sc-eQTL 5.19e-01 -0.12 0.185 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000243725 TTC4 315327 sc-eQTL 8.10e-01 0.0465 0.193 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000006555 TTC22 229865 sc-eQTL 1.01e-01 0.278 0.168 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 977604 sc-eQTL 7.72e-01 0.0506 0.174 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 977684 sc-eQTL 3.55e-01 0.147 0.158 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 847147 sc-eQTL 6.38e-01 0.0919 0.195 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 617709 sc-eQTL 8.70e-01 0.0197 0.12 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -184176 sc-eQTL 8.07e-02 0.287 0.164 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 315327 sc-eQTL 9.58e-01 0.00975 0.184 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 229865 sc-eQTL 4.91e-01 -0.108 0.156 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 977604 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0982 0.119 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 977684 sc-eQTL 8.47e-01 0.0224 0.116 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 847147 sc-eQTL 1.00e+00 -1.86e-06 0.149 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 617709 sc-eQTL 7.64e-01 0.0358 0.119 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -184176 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0891 0.103 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 315327 sc-eQTL 3.66e-01 -0.142 0.156 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 229865 sc-eQTL 4.92e-01 -0.113 0.164 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 977604 sc-eQTL 7.93e-01 0.042 0.16 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 977684 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0483 0.121 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 847147 sc-eQTL 8.42e-04 0.501 0.148 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 617709 sc-eQTL 6.69e-01 0.0637 0.149 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -184176 sc-eQTL 6.86e-02 -0.224 0.122 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 315327 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0213 0.178 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 229865 sc-eQTL 9.47e-01 -0.0126 0.187 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 977604 sc-eQTL 3.12e-01 -0.179 0.177 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 977684 sc-eQTL 3.15e-01 -0.138 0.137 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 847147 sc-eQTL 3.04e-01 0.182 0.177 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 617709 sc-eQTL 9.95e-01 -0.0009 0.152 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -184176 sc-eQTL 6.47e-01 0.0633 0.138 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 315327 sc-eQTL 2.50e-01 -0.21 0.182 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 229865 sc-eQTL 8.71e-01 0.0248 0.153 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 977604 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0524 0.169 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 977684 sc-eQTL 1.79e-01 0.198 0.147 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 847147 sc-eQTL 6.53e-01 0.0786 0.174 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 617709 sc-eQTL 6.07e-01 0.0614 0.119 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -184176 sc-eQTL 9.05e-02 -0.2 0.118 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 315327 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0983 0.177 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 229865 sc-eQTL 9.67e-01 0.00701 0.169 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 977604 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0843 0.153 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 977684 sc-eQTL 9.01e-01 0.0185 0.149 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 847147 sc-eQTL 7.36e-01 0.0605 0.179 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 617709 sc-eQTL 5.45e-01 0.0821 0.135 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -184176 sc-eQTL 6.09e-02 -0.23 0.122 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 315327 sc-eQTL 3.39e-01 -0.172 0.18 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 229865 sc-eQTL 6.73e-01 0.0754 0.179 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 977604 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0396 0.18 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 977684 sc-eQTL 1.51e-01 0.227 0.157 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 847147 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0171 0.179 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 617709 sc-eQTL 3.06e-01 -0.159 0.155 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -184176 sc-eQTL 2.17e-02 0.344 0.149 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 315327 sc-eQTL 3.20e-01 -0.182 0.183 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 229865 sc-eQTL 8.98e-01 -0.023 0.18 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 977604 sc-eQTL 3.84e-01 0.163 0.187 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 977684 sc-eQTL 8.54e-01 0.0333 0.181 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 847147 sc-eQTL 4.96e-01 0.125 0.184 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 617709 sc-eQTL 3.86e-01 0.151 0.173 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -184176 sc-eQTL 1.80e-01 -0.245 0.182 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 315327 sc-eQTL 1.51e-01 0.267 0.185 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 229865 sc-eQTL 6.10e-01 0.0827 0.162 0.061 MAIT L2
ENSG00000116133 DHCR24 143993 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0616 0.12 0.061 MAIT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 977604 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0367 0.169 0.061 MAIT L2
ENSG00000116209 TMEM59 977684 sc-eQTL 7.04e-01 0.0579 0.152 0.061 MAIT L2
ENSG00000116221 MRPL37 847147 sc-eQTL 7.14e-01 0.0679 0.185 0.061 MAIT L2
ENSG00000157216 SSBP3 617709 sc-eQTL 4.68e-02 0.325 0.162 0.061 MAIT L2
ENSG00000162402 USP24 -184176 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0883 0.146 0.061 MAIT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 831152 sc-eQTL 5.27e-01 -0.107 0.169 0.061 MAIT L2
ENSG00000243725 TTC4 315327 sc-eQTL 8.93e-01 0.0228 0.168 0.061 MAIT L2
ENSG00000006555 TTC22 229865 sc-eQTL 8.79e-01 -0.028 0.184 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000116133 DHCR24 143993 sc-eQTL 4.60e-01 -0.12 0.163 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000116205 TCEANC2 977604 sc-eQTL 5.35e-01 -0.107 0.172 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000116209 TMEM59 977684 sc-eQTL 3.21e-01 0.166 0.167 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000116221 MRPL37 847147 sc-eQTL 7.62e-01 0.0568 0.187 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000157216 SSBP3 617709 sc-eQTL 2.72e-01 -0.155 0.141 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000162398 LEXM 225125 sc-eQTL 3.37e-01 0.16 0.166 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000162402 USP24 -184176 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0411 0.143 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000243725 TTC4 315327 sc-eQTL 5.52e-02 -0.346 0.179 0.062 NK_CD56bright L2
ENSG00000006555 TTC22 229865 sc-eQTL 4.43e-01 0.117 0.153 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000116133 DHCR24 143993 sc-eQTL 8.85e-01 0.0231 0.16 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000116205 TCEANC2 977604 sc-eQTL 4.22e-01 0.139 0.173 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000116209 TMEM59 977684 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0558 0.128 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000116221 MRPL37 847147 sc-eQTL 7.03e-01 0.0637 0.167 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000157216 SSBP3 617709 sc-eQTL 8.60e-01 0.024 0.137 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000162398 LEXM 225125 sc-eQTL 4.78e-01 0.112 0.157 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000162402 USP24 -184176 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0617 0.0997 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000243725 TTC4 315327 sc-eQTL 1.07e-01 -0.275 0.17 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000006555 TTC22 229865 sc-eQTL 8.78e-02 0.311 0.181 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000116133 DHCR24 143993 sc-eQTL 7.23e-01 0.0633 0.178 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000116205 TCEANC2 977604 sc-eQTL 1.07e-01 0.277 0.171 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000116209 TMEM59 977684 sc-eQTL 6.08e-01 0.0876 0.171 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000116221 MRPL37 847147 sc-eQTL 1.90e-01 0.246 0.187 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000157216 SSBP3 617709 sc-eQTL 8.91e-01 -0.021 0.154 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000162398 LEXM 225125 sc-eQTL 1.79e-01 0.233 0.172 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000162402 USP24 -184176 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0937 0.127 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000243725 TTC4 315327 sc-eQTL 3.72e-01 -0.17 0.189 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000006555 TTC22 229865 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00693 0.162 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000116133 DHCR24 143993 sc-eQTL 9.45e-01 -0.0113 0.164 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000116205 TCEANC2 977604 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0618 0.163 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000116209 TMEM59 977684 sc-eQTL 7.03e-02 -0.239 0.131 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000116221 MRPL37 847147 sc-eQTL 2.46e-01 -0.189 0.163 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000157216 SSBP3 617709 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0622 0.137 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000162398 LEXM 225125 sc-eQTL 4.03e-01 -0.143 0.171 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000162402 USP24 -184176 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0343 0.117 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000243725 TTC4 315327 sc-eQTL 4.75e-01 -0.124 0.173 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000006555 TTC22 229865 sc-eQTL 5.18e-01 0.139 0.214 0.052 PB L2
ENSG00000116133 DHCR24 143993 sc-eQTL 3.93e-01 0.162 0.189 0.052 PB L2
ENSG00000116205 TCEANC2 977604 sc-eQTL 5.58e-01 0.135 0.231 0.052 PB L2
ENSG00000116209 TMEM59 977684 sc-eQTL 6.29e-01 0.0467 0.0964 0.052 PB L2
ENSG00000116221 MRPL37 847147 sc-eQTL 4.16e-02 0.355 0.172 0.052 PB L2
ENSG00000157216 SSBP3 617709 sc-eQTL 3.88e-01 0.175 0.202 0.052 PB L2
ENSG00000162402 USP24 -184176 sc-eQTL 7.00e-02 0.415 0.227 0.052 PB L2
ENSG00000215883 CYB5RL 831152 sc-eQTL 9.92e-01 0.00235 0.238 0.052 PB L2
ENSG00000243725 TTC4 315327 sc-eQTL 4.04e-01 0.186 0.222 0.052 PB L2
ENSG00000006555 TTC22 229865 sc-eQTL 5.58e-01 0.0982 0.168 0.061 Pro_T L2
ENSG00000116133 DHCR24 143993 sc-eQTL 4.02e-01 0.12 0.142 0.061 Pro_T L2
ENSG00000116205 TCEANC2 977604 sc-eQTL 9.42e-01 0.0127 0.174 0.061 Pro_T L2
ENSG00000116209 TMEM59 977684 sc-eQTL 8.93e-01 0.0163 0.121 0.061 Pro_T L2
ENSG00000116221 MRPL37 847147 sc-eQTL 6.92e-01 0.0469 0.118 0.061 Pro_T L2
ENSG00000157216 SSBP3 617709 sc-eQTL 7.71e-01 0.0386 0.133 0.061 Pro_T L2
ENSG00000162402 USP24 -184176 sc-eQTL 1.98e-01 -0.208 0.161 0.061 Pro_T L2
ENSG00000215883 CYB5RL 831152 sc-eQTL 9.44e-01 -0.0112 0.16 0.061 Pro_T L2
ENSG00000243725 TTC4 315327 sc-eQTL 6.66e-01 0.0768 0.178 0.061 Pro_T L2
ENSG00000006555 TTC22 229865 sc-eQTL 2.26e-01 0.202 0.166 0.06 Treg L2
ENSG00000116205 TCEANC2 977604 sc-eQTL 1.50e-01 0.257 0.178 0.06 Treg L2
ENSG00000116209 TMEM59 977684 sc-eQTL 5.91e-01 0.0758 0.141 0.06 Treg L2
ENSG00000116221 MRPL37 847147 sc-eQTL 3.34e-01 0.169 0.174 0.06 Treg L2
ENSG00000157216 SSBP3 617709 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0864 0.156 0.06 Treg L2
ENSG00000162402 USP24 -184176 sc-eQTL 9.82e-01 0.00333 0.148 0.06 Treg L2
ENSG00000243725 TTC4 315327 sc-eQTL 1.71e-01 -0.255 0.186 0.06 Treg L2
ENSG00000116133 DHCR24 143993 sc-eQTL 8.63e-01 0.0248 0.143 0.068 cDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 977604 sc-eQTL 2.20e-02 -0.384 0.166 0.068 cDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 977684 sc-eQTL 4.57e-01 -0.107 0.143 0.068 cDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 847147 sc-eQTL 8.64e-01 0.0314 0.183 0.068 cDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 617709 sc-eQTL 1.98e-01 0.217 0.168 0.068 cDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 488931 sc-eQTL 4.58e-01 -0.117 0.157 0.068 cDC L2
ENSG00000162402 USP24 -184176 sc-eQTL 8.79e-01 0.0269 0.176 0.068 cDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 831152 sc-eQTL 3.56e-01 0.14 0.151 0.068 cDC L2
ENSG00000243725 TTC4 315327 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0219 0.181 0.068 cDC L2
ENSG00000116133 DHCR24 143993 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0645 0.107 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000116205 TCEANC2 977604 sc-eQTL 2.32e-01 -0.178 0.148 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000116209 TMEM59 977684 sc-eQTL 6.04e-01 0.0469 0.0902 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000116221 MRPL37 847147 sc-eQTL 2.28e-01 -0.194 0.16 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000157216 SSBP3 617709 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0152 0.164 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000162402 USP24 -184176 sc-eQTL 6.83e-01 0.0495 0.121 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000243725 TTC4 315327 sc-eQTL 4.51e-01 0.14 0.185 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000116133 DHCR24 143993 sc-eQTL 2.63e-01 -0.112 0.1 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000116205 TCEANC2 977604 sc-eQTL 5.09e-03 0.426 0.15 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000116209 TMEM59 977684 sc-eQTL 9.96e-03 0.314 0.121 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000116221 MRPL37 847147 sc-eQTL 4.24e-01 -0.142 0.177 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000157216 SSBP3 617709 sc-eQTL 8.68e-02 0.314 0.183 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000162402 USP24 -184176 sc-eQTL 3.48e-01 0.14 0.149 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000243725 TTC4 315327 sc-eQTL 3.23e-01 -0.184 0.186 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000006555 TTC22 229865 sc-eQTL 3.05e-01 -0.164 0.16 0.07 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 143993 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0829 0.179 0.07 gdT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 977604 sc-eQTL 4.13e-01 -0.147 0.179 0.07 gdT L2
ENSG00000116209 TMEM59 977684 sc-eQTL 6.95e-01 0.0714 0.182 0.07 gdT L2
ENSG00000116221 MRPL37 847147 sc-eQTL 4.81e-01 0.147 0.208 0.07 gdT L2
ENSG00000157216 SSBP3 617709 sc-eQTL 8.58e-01 0.0228 0.128 0.07 gdT L2
ENSG00000162402 USP24 -184176 sc-eQTL 3.13e-01 -0.173 0.171 0.07 gdT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 831152 sc-eQTL 1.40e-01 -0.263 0.177 0.07 gdT L2
ENSG00000243725 TTC4 315327 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0651 0.201 0.07 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 143993 sc-eQTL 6.55e-01 0.0595 0.133 0.062 intMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 977604 sc-eQTL 3.95e-01 0.141 0.165 0.062 intMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 977684 sc-eQTL 7.61e-03 0.322 0.119 0.062 intMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 847147 sc-eQTL 3.63e-01 0.169 0.186 0.062 intMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 617709 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0366 0.19 0.062 intMono L2
ENSG00000162402 USP24 -184176 sc-eQTL 3.39e-01 -0.162 0.169 0.062 intMono L2
ENSG00000243725 TTC4 315327 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0906 0.18 0.062 intMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 143993 sc-eQTL 5.64e-01 0.0784 0.136 0.061 ncMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 977604 sc-eQTL 6.90e-01 -0.068 0.17 0.061 ncMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 977684 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0957 0.136 0.061 ncMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 847147 sc-eQTL 4.32e-01 -0.138 0.175 0.061 ncMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 617709 sc-eQTL 5.00e-01 0.129 0.192 0.061 ncMono L2
ENSG00000162402 USP24 -184176 sc-eQTL 4.92e-01 -0.105 0.153 0.061 ncMono L2
ENSG00000243725 TTC4 315327 sc-eQTL 1.56e-01 0.257 0.181 0.061 ncMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 143993 sc-eQTL 7.45e-01 0.0562 0.173 0.056 pDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 977604 sc-eQTL 6.92e-01 -0.082 0.207 0.056 pDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 977684 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0248 0.165 0.056 pDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 847147 sc-eQTL 7.41e-01 0.0726 0.22 0.056 pDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 617709 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0236 0.195 0.056 pDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 488931 sc-eQTL 5.21e-01 0.0527 0.0819 0.056 pDC L2
ENSG00000162402 USP24 -184176 sc-eQTL 8.08e-01 0.0337 0.138 0.056 pDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 831152 sc-eQTL 3.81e-01 -0.166 0.189 0.056 pDC L2
ENSG00000243725 TTC4 315327 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0765 0.219 0.056 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 229865 sc-eQTL 1.40e-01 -0.254 0.171 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 143993 sc-eQTL 3.95e-02 0.355 0.171 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 977604 sc-eQTL 5.12e-01 -0.11 0.167 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 977684 sc-eQTL 6.67e-01 -0.056 0.13 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 847147 sc-eQTL 8.68e-01 0.0258 0.156 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 617709 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0742 0.135 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -184176 sc-eQTL 2.61e-01 0.139 0.123 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 831152 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0934 0.19 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 315327 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0849 0.17 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 229865 sc-eQTL 3.40e-01 -0.174 0.182 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 143993 sc-eQTL 4.04e-01 0.137 0.164 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 977604 sc-eQTL 9.90e-02 0.244 0.147 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 977684 sc-eQTL 8.72e-01 0.017 0.105 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 847147 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0395 0.151 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 617709 sc-eQTL 6.34e-01 0.0646 0.135 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -184176 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0618 0.116 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 831152 sc-eQTL 9.45e-01 0.0127 0.184 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 315327 sc-eQTL 3.13e-01 -0.175 0.173 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 143993 sc-eQTL 2.66e-01 -0.116 0.104 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 977604 sc-eQTL 2.28e-01 0.157 0.13 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 977684 sc-eQTL 1.34e-01 0.134 0.0892 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 847147 sc-eQTL 2.30e-01 -0.191 0.158 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 617709 sc-eQTL 4.59e-01 0.123 0.166 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -184176 sc-eQTL 3.61e-01 0.104 0.113 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 315327 sc-eQTL 9.25e-01 0.0178 0.188 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 143993 sc-eQTL 6.70e-01 0.0541 0.127 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 977604 sc-eQTL 9.58e-01 0.00881 0.167 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 977684 sc-eQTL 2.69e-01 0.137 0.124 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 847147 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0758 0.17 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 617709 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0265 0.181 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -184176 sc-eQTL 2.80e-01 -0.154 0.142 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 315327 sc-eQTL 3.06e-01 0.183 0.179 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 229865 sc-eQTL 4.63e-01 0.111 0.15 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 143993 sc-eQTL 6.21e-01 0.0778 0.157 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 977604 sc-eQTL 5.86e-01 0.0842 0.154 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 977684 sc-eQTL 5.41e-01 -0.073 0.119 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 847147 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0157 0.16 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 617709 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00247 0.131 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162398 LEXM 225125 sc-eQTL 6.51e-01 0.067 0.148 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -184176 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0664 0.0936 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 315327 sc-eQTL 8.16e-02 -0.29 0.166 0.06 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000169174 PCSK9 -8360 pQTL 0.048 -0.11 0.0557 0.0 0.0 0.065
ENSG00000169174 PCSK9 -8360 eQTL 0.00285 -0.103 0.0344 0.0 0.0 0.0653
ENSG00000198711 SSBP3-AS1 794748 eQTL 2.99e-02 0.0871 0.0401 0.0 0.0 0.0653


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina