logo

Genes within 1Mb (chr1:55030975:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 229652 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0565 0.138 0.103 B L1
ENSG00000116133 DHCR24 143780 sc-eQTL 3.76e-01 -0.116 0.13 0.103 B L1
ENSG00000116205 TCEANC2 977391 sc-eQTL 3.19e-01 -0.112 0.112 0.103 B L1
ENSG00000116209 TMEM59 977471 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0402 0.0685 0.103 B L1
ENSG00000116221 MRPL37 846934 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0418 0.0897 0.103 B L1
ENSG00000157216 SSBP3 617496 sc-eQTL 2.06e-01 -0.119 0.0936 0.103 B L1
ENSG00000162402 USP24 -184389 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0243 0.0796 0.103 B L1
ENSG00000215883 CYB5RL 830939 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0802 0.153 0.103 B L1
ENSG00000243725 TTC4 315114 sc-eQTL 6.87e-02 0.242 0.132 0.103 B L1
ENSG00000006555 TTC22 229652 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0479 0.107 0.103 CD4T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 977391 sc-eQTL 8.38e-01 0.018 0.0876 0.103 CD4T L1
ENSG00000116209 TMEM59 977471 sc-eQTL 3.37e-01 -0.0784 0.0814 0.103 CD4T L1
ENSG00000116221 MRPL37 846934 sc-eQTL 3.02e-01 0.116 0.112 0.103 CD4T L1
ENSG00000157216 SSBP3 617496 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0605 0.0935 0.103 CD4T L1
ENSG00000162402 USP24 -184389 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0629 0.0762 0.103 CD4T L1
ENSG00000243725 TTC4 315114 sc-eQTL 2.03e-01 -0.146 0.114 0.103 CD4T L1
ENSG00000006555 TTC22 229652 sc-eQTL 3.91e-01 0.0793 0.0923 0.103 CD8T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 977391 sc-eQTL 8.69e-01 0.019 0.115 0.103 CD8T L1
ENSG00000116209 TMEM59 977471 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0597 0.0799 0.103 CD8T L1
ENSG00000116221 MRPL37 846934 sc-eQTL 5.63e-01 0.0637 0.11 0.103 CD8T L1
ENSG00000157216 SSBP3 617496 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0491 0.079 0.103 CD8T L1
ENSG00000162402 USP24 -184389 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0588 0.0764 0.103 CD8T L1
ENSG00000243725 TTC4 315114 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0225 0.133 0.103 CD8T L1
ENSG00000116133 DHCR24 143780 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00501 0.124 0.101 DC L1
ENSG00000116205 TCEANC2 977391 sc-eQTL 3.54e-01 -0.129 0.138 0.101 DC L1
ENSG00000116209 TMEM59 977471 sc-eQTL 4.69e-01 0.079 0.109 0.101 DC L1
ENSG00000116221 MRPL37 846934 sc-eQTL 3.58e-01 0.135 0.146 0.101 DC L1
ENSG00000157216 SSBP3 617496 sc-eQTL 1.23e-01 -0.201 0.13 0.101 DC L1
ENSG00000162390 ACOT11 488718 sc-eQTL 1.66e-01 0.174 0.125 0.101 DC L1
ENSG00000162402 USP24 -184389 sc-eQTL 3.25e-01 -0.0746 0.0756 0.101 DC L1
ENSG00000215883 CYB5RL 830939 sc-eQTL 7.16e-01 0.05 0.137 0.101 DC L1
ENSG00000243725 TTC4 315114 sc-eQTL 1.22e-01 0.227 0.147 0.101 DC L1
ENSG00000116133 DHCR24 143780 sc-eQTL 2.66e-01 0.0995 0.0893 0.103 Mono L1
ENSG00000116205 TCEANC2 977391 sc-eQTL 1.62e-01 -0.135 0.0962 0.103 Mono L1
ENSG00000116209 TMEM59 977471 sc-eQTL 4.06e-02 0.146 0.071 0.103 Mono L1
ENSG00000116221 MRPL37 846934 sc-eQTL 7.00e-01 0.0463 0.12 0.103 Mono L1
ENSG00000157216 SSBP3 617496 sc-eQTL 2.62e-01 0.154 0.137 0.103 Mono L1
ENSG00000162402 USP24 -184389 sc-eQTL 6.80e-02 -0.149 0.0813 0.103 Mono L1
ENSG00000243725 TTC4 315114 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0529 0.144 0.103 Mono L1
ENSG00000006555 TTC22 229652 sc-eQTL 8.23e-02 0.218 0.125 0.101 NK L1
ENSG00000116133 DHCR24 143780 sc-eQTL 6.27e-02 -0.235 0.126 0.101 NK L1
ENSG00000116205 TCEANC2 977391 sc-eQTL 3.24e-01 0.123 0.125 0.101 NK L1
ENSG00000116209 TMEM59 977471 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0784 0.0978 0.101 NK L1
ENSG00000116221 MRPL37 846934 sc-eQTL 1.57e-01 0.172 0.121 0.101 NK L1
ENSG00000157216 SSBP3 617496 sc-eQTL 6.44e-01 0.0488 0.106 0.101 NK L1
ENSG00000162398 LEXM 224912 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0367 0.118 0.101 NK L1
ENSG00000162402 USP24 -184389 sc-eQTL 5.50e-02 -0.137 0.0712 0.101 NK L1
ENSG00000243725 TTC4 315114 sc-eQTL 1.56e-01 -0.193 0.135 0.101 NK L1
ENSG00000006555 TTC22 229652 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00146 0.11 0.103 Other_T L1
ENSG00000116133 DHCR24 143780 sc-eQTL 3.14e-01 -0.0859 0.0852 0.103 Other_T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 977391 sc-eQTL 6.60e-01 0.0563 0.128 0.103 Other_T L1
ENSG00000116209 TMEM59 977471 sc-eQTL 8.50e-01 0.0166 0.0877 0.103 Other_T L1
ENSG00000116221 MRPL37 846934 sc-eQTL 2.84e-01 0.0879 0.0819 0.103 Other_T L1
ENSG00000157216 SSBP3 617496 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0699 0.0949 0.103 Other_T L1
ENSG00000162402 USP24 -184389 sc-eQTL 3.61e-01 -0.0923 0.101 0.103 Other_T L1
ENSG00000215883 CYB5RL 830939 sc-eQTL 4.18e-01 0.112 0.138 0.103 Other_T L1
ENSG00000243725 TTC4 315114 sc-eQTL 2.26e-01 -0.167 0.137 0.103 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 229652 sc-eQTL 2.50e-01 0.13 0.113 0.102 B_Activated L2
ENSG00000116133 DHCR24 143780 sc-eQTL 2.13e-01 -0.166 0.132 0.102 B_Activated L2
ENSG00000116205 TCEANC2 977391 sc-eQTL 5.84e-02 -0.269 0.141 0.102 B_Activated L2
ENSG00000116209 TMEM59 977471 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0322 0.152 0.102 B_Activated L2
ENSG00000116221 MRPL37 846934 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0475 0.164 0.102 B_Activated L2
ENSG00000157216 SSBP3 617496 sc-eQTL 7.79e-01 0.0418 0.148 0.102 B_Activated L2
ENSG00000162402 USP24 -184389 sc-eQTL 3.02e-01 0.149 0.144 0.102 B_Activated L2
ENSG00000215883 CYB5RL 830939 sc-eQTL 6.86e-01 0.0518 0.128 0.102 B_Activated L2
ENSG00000243725 TTC4 315114 sc-eQTL 6.91e-01 0.0553 0.139 0.102 B_Activated L2
ENSG00000006555 TTC22 229652 sc-eQTL 2.71e-01 0.162 0.147 0.103 B_Intermediate L2
ENSG00000116133 DHCR24 143780 sc-eQTL 5.73e-01 -0.077 0.136 0.103 B_Intermediate L2
ENSG00000116205 TCEANC2 977391 sc-eQTL 9.87e-01 0.00224 0.136 0.103 B_Intermediate L2
ENSG00000116209 TMEM59 977471 sc-eQTL 6.65e-02 0.213 0.115 0.103 B_Intermediate L2
ENSG00000116221 MRPL37 846934 sc-eQTL 6.55e-01 0.0612 0.137 0.103 B_Intermediate L2
ENSG00000157216 SSBP3 617496 sc-eQTL 3.64e-02 -0.267 0.127 0.103 B_Intermediate L2
ENSG00000162402 USP24 -184389 sc-eQTL 6.03e-01 0.056 0.108 0.103 B_Intermediate L2
ENSG00000215883 CYB5RL 830939 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0437 0.153 0.103 B_Intermediate L2
ENSG00000243725 TTC4 315114 sc-eQTL 6.53e-01 0.0624 0.139 0.103 B_Intermediate L2
ENSG00000006555 TTC22 229652 sc-eQTL 2.73e-01 -0.151 0.137 0.103 B_Memory L2
ENSG00000116133 DHCR24 143780 sc-eQTL 9.54e-01 0.0079 0.137 0.103 B_Memory L2
ENSG00000116205 TCEANC2 977391 sc-eQTL 1.77e-01 -0.197 0.145 0.103 B_Memory L2
ENSG00000116209 TMEM59 977471 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0942 0.122 0.103 B_Memory L2
ENSG00000116221 MRPL37 846934 sc-eQTL 7.96e-02 0.216 0.122 0.103 B_Memory L2
ENSG00000157216 SSBP3 617496 sc-eQTL 2.71e-01 0.127 0.115 0.103 B_Memory L2
ENSG00000162402 USP24 -184389 sc-eQTL 3.85e-01 0.0978 0.112 0.103 B_Memory L2
ENSG00000215883 CYB5RL 830939 sc-eQTL 3.31e-02 -0.295 0.138 0.103 B_Memory L2
ENSG00000243725 TTC4 315114 sc-eQTL 9.08e-03 0.374 0.142 0.103 B_Memory L2
ENSG00000006555 TTC22 229652 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00806 0.147 0.103 B_Naive1 L2
ENSG00000116133 DHCR24 143780 sc-eQTL 2.83e-01 -0.148 0.137 0.103 B_Naive1 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 977391 sc-eQTL 8.08e-01 0.0298 0.123 0.103 B_Naive1 L2
ENSG00000116209 TMEM59 977471 sc-eQTL 2.92e-01 -0.0938 0.0888 0.103 B_Naive1 L2
ENSG00000116221 MRPL37 846934 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0605 0.131 0.103 B_Naive1 L2
ENSG00000157216 SSBP3 617496 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0984 0.125 0.103 B_Naive1 L2
ENSG00000162402 USP24 -184389 sc-eQTL 3.94e-01 -0.084 0.0984 0.103 B_Naive1 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 830939 sc-eQTL 2.59e-01 0.168 0.148 0.103 B_Naive1 L2
ENSG00000243725 TTC4 315114 sc-eQTL 7.55e-01 0.042 0.134 0.103 B_Naive1 L2
ENSG00000006555 TTC22 229652 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0928 0.149 0.103 B_Naive2 L2
ENSG00000116133 DHCR24 143780 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0267 0.13 0.103 B_Naive2 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 977391 sc-eQTL 9.34e-01 -0.0119 0.144 0.103 B_Naive2 L2
ENSG00000116209 TMEM59 977471 sc-eQTL 9.69e-01 0.00459 0.119 0.103 B_Naive2 L2
ENSG00000116221 MRPL37 846934 sc-eQTL 4.52e-01 -0.105 0.139 0.103 B_Naive2 L2
ENSG00000157216 SSBP3 617496 sc-eQTL 8.44e-01 0.0271 0.137 0.103 B_Naive2 L2
ENSG00000162402 USP24 -184389 sc-eQTL 2.51e-01 -0.125 0.109 0.103 B_Naive2 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 830939 sc-eQTL 3.46e-01 -0.144 0.153 0.103 B_Naive2 L2
ENSG00000243725 TTC4 315114 sc-eQTL 1.86e-01 0.211 0.159 0.103 B_Naive2 L2
ENSG00000006555 TTC22 229652 sc-eQTL 8.94e-01 0.0185 0.139 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 977391 sc-eQTL 9.05e-01 0.0172 0.144 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 977471 sc-eQTL 8.80e-01 0.0197 0.131 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 846934 sc-eQTL 2.62e-01 0.18 0.16 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 617496 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0906 0.0985 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -184389 sc-eQTL 2.23e-01 -0.165 0.135 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 315114 sc-eQTL 5.72e-02 0.288 0.15 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 229652 sc-eQTL 1.88e-01 0.167 0.126 0.103 CD4_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 977391 sc-eQTL 8.49e-01 0.0183 0.0963 0.103 CD4_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 977471 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0276 0.0936 0.103 CD4_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 846934 sc-eQTL 6.94e-01 0.0476 0.121 0.103 CD4_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 617496 sc-eQTL 4.04e-01 0.0804 0.0962 0.103 CD4_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -184389 sc-eQTL 9.80e-01 0.00208 0.0831 0.103 CD4_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 315114 sc-eQTL 1.02e-01 -0.207 0.126 0.103 CD4_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 229652 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0524 0.133 0.103 CD4_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 977391 sc-eQTL 9.73e-01 0.00432 0.13 0.103 CD4_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 977471 sc-eQTL 6.70e-01 0.0417 0.0977 0.103 CD4_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 846934 sc-eQTL 3.23e-01 0.121 0.123 0.103 CD4_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 617496 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0298 0.12 0.103 CD4_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -184389 sc-eQTL 3.48e-01 -0.0936 0.0996 0.103 CD4_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 315114 sc-eQTL 3.86e-01 -0.125 0.144 0.103 CD4_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 229652 sc-eQTL 1.37e-01 -0.222 0.149 0.103 CD4_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 977391 sc-eQTL 2.18e-01 -0.174 0.141 0.103 CD4_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 977471 sc-eQTL 1.33e-01 -0.165 0.109 0.103 CD4_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 846934 sc-eQTL 9.19e-01 0.0143 0.141 0.103 CD4_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 617496 sc-eQTL 9.51e-01 0.0075 0.121 0.103 CD4_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -184389 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0739 0.11 0.103 CD4_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 315114 sc-eQTL 6.34e-01 0.0694 0.146 0.103 CD4_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 229652 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0122 0.12 0.103 CD8_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 977391 sc-eQTL 6.22e-01 0.0657 0.133 0.103 CD8_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 977471 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0288 0.116 0.103 CD8_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 846934 sc-eQTL 1.32e-01 0.206 0.136 0.103 CD8_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 617496 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00677 0.0938 0.103 CD8_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -184389 sc-eQTL 2.35e-01 -0.111 0.0929 0.103 CD8_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 315114 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0533 0.139 0.103 CD8_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 229652 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0936 0.134 0.103 CD8_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 977391 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0254 0.121 0.103 CD8_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 977471 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0679 0.119 0.103 CD8_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 846934 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0377 0.142 0.103 CD8_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 617496 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00207 0.108 0.103 CD8_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -184389 sc-eQTL 8.95e-01 0.013 0.0979 0.103 CD8_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 315114 sc-eQTL 3.98e-01 -0.121 0.143 0.103 CD8_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 229652 sc-eQTL 1.29e-01 0.217 0.142 0.111 CD8_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 977391 sc-eQTL 4.11e-01 0.118 0.144 0.111 CD8_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 977471 sc-eQTL 5.99e-02 0.237 0.125 0.111 CD8_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 846934 sc-eQTL 2.20e-01 -0.176 0.143 0.111 CD8_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 617496 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0429 0.125 0.111 CD8_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -184389 sc-eQTL 3.18e-01 0.121 0.12 0.111 CD8_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 315114 sc-eQTL 9.55e-01 0.00835 0.147 0.111 CD8_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 229652 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0314 0.139 0.11 CD8_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 977391 sc-eQTL 6.52e-01 0.0657 0.145 0.11 CD8_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 977471 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0491 0.141 0.11 CD8_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 846934 sc-eQTL 2.62e-01 0.16 0.142 0.11 CD8_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 617496 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0247 0.135 0.11 CD8_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -184389 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0684 0.142 0.11 CD8_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 315114 sc-eQTL 2.85e-01 0.154 0.144 0.11 CD8_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 229652 sc-eQTL 6.39e-01 0.061 0.13 0.104 MAIT L2
ENSG00000116133 DHCR24 143780 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0461 0.096 0.104 MAIT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 977391 sc-eQTL 5.34e-01 0.0841 0.135 0.104 MAIT L2
ENSG00000116209 TMEM59 977471 sc-eQTL 6.17e-01 0.0611 0.122 0.104 MAIT L2
ENSG00000116221 MRPL37 846934 sc-eQTL 9.42e-01 -0.0109 0.148 0.104 MAIT L2
ENSG00000157216 SSBP3 617496 sc-eQTL 8.91e-02 -0.223 0.131 0.104 MAIT L2
ENSG00000162402 USP24 -184389 sc-eQTL 9.28e-01 0.0106 0.117 0.104 MAIT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 830939 sc-eQTL 7.67e-01 0.0403 0.136 0.104 MAIT L2
ENSG00000243725 TTC4 315114 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0171 0.135 0.104 MAIT L2
ENSG00000006555 TTC22 229652 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0703 0.148 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000116133 DHCR24 143780 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0293 0.131 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000116205 TCEANC2 977391 sc-eQTL 2.10e-01 0.174 0.138 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000116209 TMEM59 977471 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0156 0.135 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000116221 MRPL37 846934 sc-eQTL 7.84e-03 0.399 0.148 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000157216 SSBP3 617496 sc-eQTL 4.24e-02 -0.23 0.113 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000162398 LEXM 224912 sc-eQTL 1.27e-01 -0.205 0.134 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000162402 USP24 -184389 sc-eQTL 1.60e-01 -0.163 0.115 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000243725 TTC4 315114 sc-eQTL 2.95e-01 -0.153 0.146 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000006555 TTC22 229652 sc-eQTL 7.07e-02 0.229 0.126 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000116133 DHCR24 143780 sc-eQTL 2.67e-01 -0.147 0.132 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000116205 TCEANC2 977391 sc-eQTL 4.60e-01 0.106 0.143 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000116209 TMEM59 977471 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0328 0.106 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000116221 MRPL37 846934 sc-eQTL 7.72e-01 0.0402 0.138 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000157216 SSBP3 617496 sc-eQTL 6.02e-01 0.059 0.113 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000162398 LEXM 224912 sc-eQTL 2.02e-01 -0.166 0.13 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000162402 USP24 -184389 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0643 0.0825 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000243725 TTC4 315114 sc-eQTL 4.36e-02 -0.285 0.14 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000006555 TTC22 229652 sc-eQTL 7.17e-02 0.277 0.153 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000116133 DHCR24 143780 sc-eQTL 4.72e-01 -0.108 0.15 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000116205 TCEANC2 977391 sc-eQTL 6.73e-01 0.0614 0.145 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000116209 TMEM59 977471 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0155 0.144 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000116221 MRPL37 846934 sc-eQTL 3.65e-02 0.331 0.157 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000157216 SSBP3 617496 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0297 0.13 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000162398 LEXM 224912 sc-eQTL 2.15e-01 0.181 0.146 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000162402 USP24 -184389 sc-eQTL 4.37e-01 0.0835 0.107 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000243725 TTC4 315114 sc-eQTL 2.68e-01 0.177 0.16 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000006555 TTC22 229652 sc-eQTL 5.24e-01 0.0849 0.133 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000116133 DHCR24 143780 sc-eQTL 1.25e-01 -0.206 0.134 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000116205 TCEANC2 977391 sc-eQTL 4.29e-01 -0.106 0.134 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000116209 TMEM59 977471 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0547 0.109 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000116221 MRPL37 846934 sc-eQTL 1.01e-01 0.219 0.133 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000157216 SSBP3 617496 sc-eQTL 1.92e-01 0.147 0.112 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000162398 LEXM 224912 sc-eQTL 5.22e-01 0.0901 0.14 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000162402 USP24 -184389 sc-eQTL 5.54e-02 -0.183 0.0949 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000243725 TTC4 315114 sc-eQTL 1.00e+00 -3.52e-05 0.142 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000006555 TTC22 229652 sc-eQTL 8.74e-01 0.0262 0.165 0.096 PB L2
ENSG00000116133 DHCR24 143780 sc-eQTL 4.47e-01 -0.112 0.146 0.096 PB L2
ENSG00000116205 TCEANC2 977391 sc-eQTL 1.04e-01 -0.289 0.176 0.096 PB L2
ENSG00000116209 TMEM59 977471 sc-eQTL 4.30e-01 0.059 0.0744 0.096 PB L2
ENSG00000116221 MRPL37 846934 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0901 0.135 0.096 PB L2
ENSG00000157216 SSBP3 617496 sc-eQTL 2.28e-01 -0.189 0.156 0.096 PB L2
ENSG00000162402 USP24 -184389 sc-eQTL 3.02e-01 0.183 0.177 0.096 PB L2
ENSG00000215883 CYB5RL 830939 sc-eQTL 4.57e-01 -0.137 0.184 0.096 PB L2
ENSG00000243725 TTC4 315114 sc-eQTL 8.95e-01 0.0228 0.172 0.096 PB L2
ENSG00000006555 TTC22 229652 sc-eQTL 7.28e-02 -0.238 0.132 0.102 Pro_T L2
ENSG00000116133 DHCR24 143780 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0401 0.113 0.102 Pro_T L2
ENSG00000116205 TCEANC2 977391 sc-eQTL 5.46e-01 0.0834 0.138 0.102 Pro_T L2
ENSG00000116209 TMEM59 977471 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0817 0.0956 0.102 Pro_T L2
ENSG00000116221 MRPL37 846934 sc-eQTL 1.94e-01 0.122 0.0934 0.102 Pro_T L2
ENSG00000157216 SSBP3 617496 sc-eQTL 2.20e-01 -0.129 0.105 0.102 Pro_T L2
ENSG00000162402 USP24 -184389 sc-eQTL 1.32e-01 -0.193 0.128 0.102 Pro_T L2
ENSG00000215883 CYB5RL 830939 sc-eQTL 2.88e-01 0.135 0.126 0.102 Pro_T L2
ENSG00000243725 TTC4 315114 sc-eQTL 1.45e-01 -0.205 0.14 0.102 Pro_T L2
ENSG00000006555 TTC22 229652 sc-eQTL 9.58e-01 0.00704 0.134 0.103 Treg L2
ENSG00000116205 TCEANC2 977391 sc-eQTL 1.26e-01 0.219 0.142 0.103 Treg L2
ENSG00000116209 TMEM59 977471 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0395 0.113 0.103 Treg L2
ENSG00000116221 MRPL37 846934 sc-eQTL 5.31e-01 0.0879 0.14 0.103 Treg L2
ENSG00000157216 SSBP3 617496 sc-eQTL 1.28e-01 -0.19 0.124 0.103 Treg L2
ENSG00000162402 USP24 -184389 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00611 0.119 0.103 Treg L2
ENSG00000243725 TTC4 315114 sc-eQTL 9.14e-01 0.0162 0.15 0.103 Treg L2
ENSG00000116133 DHCR24 143780 sc-eQTL 7.38e-01 0.0408 0.122 0.1 cDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 977391 sc-eQTL 4.77e-02 -0.283 0.142 0.1 cDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 977471 sc-eQTL 9.60e-01 0.00618 0.122 0.1 cDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 846934 sc-eQTL 9.02e-01 0.0192 0.156 0.1 cDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 617496 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0625 0.144 0.1 cDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 488718 sc-eQTL 1.98e-01 0.172 0.133 0.1 cDC L2
ENSG00000162402 USP24 -184389 sc-eQTL 1.92e-01 -0.196 0.149 0.1 cDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 830939 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0289 0.129 0.1 cDC L2
ENSG00000243725 TTC4 315114 sc-eQTL 4.12e-01 0.127 0.154 0.1 cDC L2
ENSG00000116133 DHCR24 143780 sc-eQTL 5.69e-01 0.0495 0.0867 0.103 cMono_IL1B L2
ENSG00000116205 TCEANC2 977391 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00472 0.121 0.103 cMono_IL1B L2
ENSG00000116209 TMEM59 977471 sc-eQTL 4.18e-01 0.0592 0.073 0.103 cMono_IL1B L2
ENSG00000116221 MRPL37 846934 sc-eQTL 7.40e-01 0.0432 0.13 0.103 cMono_IL1B L2
ENSG00000157216 SSBP3 617496 sc-eQTL 6.07e-01 0.0685 0.133 0.103 cMono_IL1B L2
ENSG00000162402 USP24 -184389 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0836 0.0981 0.103 cMono_IL1B L2
ENSG00000243725 TTC4 315114 sc-eQTL 7.67e-01 0.0445 0.15 0.103 cMono_IL1B L2
ENSG00000116133 DHCR24 143780 sc-eQTL 9.23e-01 0.00788 0.0816 0.103 cMono_S100A L2
ENSG00000116205 TCEANC2 977391 sc-eQTL 3.11e-02 -0.267 0.123 0.103 cMono_S100A L2
ENSG00000116209 TMEM59 977471 sc-eQTL 4.64e-02 0.198 0.0988 0.103 cMono_S100A L2
ENSG00000116221 MRPL37 846934 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0386 0.144 0.103 cMono_S100A L2
ENSG00000157216 SSBP3 617496 sc-eQTL 5.86e-01 0.0816 0.149 0.103 cMono_S100A L2
ENSG00000162402 USP24 -184389 sc-eQTL 2.96e-01 -0.127 0.121 0.103 cMono_S100A L2
ENSG00000243725 TTC4 315114 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0826 0.151 0.103 cMono_S100A L2
ENSG00000006555 TTC22 229652 sc-eQTL 4.17e-01 -0.117 0.144 0.109 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 143780 sc-eQTL 2.15e-01 -0.2 0.16 0.109 gdT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 977391 sc-eQTL 9.52e-01 0.00971 0.162 0.109 gdT L2
ENSG00000116209 TMEM59 977471 sc-eQTL 4.67e-01 0.12 0.164 0.109 gdT L2
ENSG00000116221 MRPL37 846934 sc-eQTL 2.37e-01 0.223 0.188 0.109 gdT L2
ENSG00000157216 SSBP3 617496 sc-eQTL 1.13e-01 0.182 0.114 0.109 gdT L2
ENSG00000162402 USP24 -184389 sc-eQTL 3.73e-01 -0.138 0.155 0.109 gdT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 830939 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0736 0.161 0.109 gdT L2
ENSG00000243725 TTC4 315114 sc-eQTL 4.78e-01 -0.129 0.181 0.109 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 143780 sc-eQTL 4.91e-01 0.0755 0.109 0.1 intMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 977391 sc-eQTL 5.28e-01 0.0862 0.136 0.1 intMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 977471 sc-eQTL 6.47e-01 0.046 0.1 0.1 intMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 846934 sc-eQTL 3.25e-01 0.151 0.153 0.1 intMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 617496 sc-eQTL 1.70e-01 0.215 0.156 0.1 intMono L2
ENSG00000162402 USP24 -184389 sc-eQTL 7.75e-02 0.246 0.138 0.1 intMono L2
ENSG00000243725 TTC4 315114 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0578 0.148 0.1 intMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 143780 sc-eQTL 2.37e-01 0.126 0.106 0.1 ncMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 977391 sc-eQTL 4.84e-01 0.0934 0.133 0.1 ncMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 977471 sc-eQTL 7.32e-01 0.0365 0.107 0.1 ncMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 846934 sc-eQTL 8.65e-01 0.0235 0.138 0.1 ncMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 617496 sc-eQTL 3.07e-01 0.154 0.15 0.1 ncMono L2
ENSG00000162402 USP24 -184389 sc-eQTL 2.56e-01 -0.137 0.12 0.1 ncMono L2
ENSG00000243725 TTC4 315114 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0605 0.142 0.1 ncMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 143780 sc-eQTL 4.51e-01 0.0976 0.129 0.102 pDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 977391 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0623 0.155 0.102 pDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 977471 sc-eQTL 6.98e-01 0.048 0.124 0.102 pDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 846934 sc-eQTL 3.52e-02 0.345 0.162 0.102 pDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 617496 sc-eQTL 2.75e-02 -0.32 0.144 0.102 pDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 488718 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0476 0.0613 0.102 pDC L2
ENSG00000162402 USP24 -184389 sc-eQTL 1.62e-01 -0.145 0.103 0.102 pDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 830939 sc-eQTL 8.41e-01 0.0285 0.142 0.102 pDC L2
ENSG00000243725 TTC4 315114 sc-eQTL 4.81e-01 0.116 0.164 0.102 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 229652 sc-eQTL 7.59e-01 0.0431 0.14 0.103 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 143780 sc-eQTL 4.53e-01 -0.106 0.14 0.103 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 977391 sc-eQTL 2.04e-01 -0.173 0.135 0.103 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 977471 sc-eQTL 6.77e-01 0.044 0.106 0.103 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 846934 sc-eQTL 2.11e-01 0.158 0.126 0.103 B_Memory LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 617496 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0643 0.11 0.103 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -184389 sc-eQTL 5.71e-01 0.0569 0.1 0.103 B_Memory LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 830939 sc-eQTL 7.39e-02 -0.275 0.153 0.103 B_Memory LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 315114 sc-eQTL 4.04e-02 0.283 0.137 0.103 B_Memory LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 229652 sc-eQTL 6.30e-01 -0.072 0.149 0.103 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 143780 sc-eQTL 3.63e-01 -0.122 0.134 0.103 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 977391 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0188 0.121 0.103 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 977471 sc-eQTL 3.19e-01 -0.086 0.0861 0.103 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 846934 sc-eQTL 3.81e-01 -0.109 0.124 0.103 B_Naive LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 617496 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0623 0.111 0.103 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -184389 sc-eQTL 2.45e-01 -0.111 0.0949 0.103 B_Naive LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 830939 sc-eQTL 7.53e-01 0.0474 0.151 0.103 B_Naive LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 315114 sc-eQTL 5.15e-01 0.0924 0.142 0.103 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 143780 sc-eQTL 4.99e-01 0.0566 0.0836 0.103 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 977391 sc-eQTL 1.59e-01 -0.147 0.104 0.103 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 977471 sc-eQTL 1.19e-01 0.112 0.0718 0.103 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 846934 sc-eQTL 6.48e-01 0.0584 0.128 0.103 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 617496 sc-eQTL 3.09e-01 0.136 0.133 0.103 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -184389 sc-eQTL 8.59e-02 -0.157 0.0908 0.103 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 315114 sc-eQTL 9.66e-01 0.00645 0.152 0.103 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 143780 sc-eQTL 1.76e-01 0.14 0.103 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 977391 sc-eQTL 2.22e-01 0.166 0.136 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 977471 sc-eQTL 7.19e-01 0.0365 0.101 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 846934 sc-eQTL 2.44e-01 0.162 0.138 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 617496 sc-eQTL 9.34e-02 0.248 0.147 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -184389 sc-eQTL 5.28e-01 0.0737 0.117 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 315114 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0526 0.146 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 229652 sc-eQTL 4.37e-02 0.247 0.122 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 143780 sc-eQTL 9.24e-02 -0.216 0.128 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 977391 sc-eQTL 2.93e-01 0.132 0.126 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 977471 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0769 0.0973 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 846934 sc-eQTL 3.02e-01 0.135 0.13 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 617496 sc-eQTL 6.10e-01 0.0547 0.107 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162398 LEXM 224912 sc-eQTL 9.74e-01 0.00399 0.121 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -184389 sc-eQTL 1.00e-01 -0.126 0.0761 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 315114 sc-eQTL 3.62e-01 -0.124 0.136 0.101 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000169174 PCSK9 -8573 eQTL 8.26e-05 -0.106 0.0268 0.0 0.0 0.102

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000169174 PCSK9 -8573 2.66e-05 2.85e-05 5.11e-06 1.39e-05 4.7e-06 1.23e-05 3.71e-05 3.8e-06 2.47e-05 1.25e-05 3.19e-05 1.35e-05 4.23e-05 1.15e-05 6.04e-06 1.45e-05 1.44e-05 2.11e-05 7.41e-06 5.66e-06 1.24e-05 2.64e-05 2.66e-05 8.06e-06 3.79e-05 6.51e-06 1.06e-05 1.04e-05 2.73e-05 2.4e-05 1.65e-05 1.6e-06 2.31e-06 6.43e-06 1.01e-05 5.31e-06 2.77e-06 2.99e-06 4.29e-06 3.13e-06 1.67e-06 3.29e-05 2.81e-06 3.62e-07 2.1e-06 3.29e-06 3.8e-06 1.47e-06 1.55e-06