logo

Genes within 1Mb (chr1:55030366:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 229043 sc-eQTL 1.37e-02 -0.405 0.163 0.06 B L1
ENSG00000116133 DHCR24 143171 sc-eQTL 7.84e-02 -0.274 0.155 0.06 B L1
ENSG00000116205 TCEANC2 976782 sc-eQTL 2.88e-01 0.143 0.134 0.06 B L1
ENSG00000116209 TMEM59 976862 sc-eQTL 2.56e-01 -0.0933 0.0818 0.06 B L1
ENSG00000116221 MRPL37 846325 sc-eQTL 1.77e-01 0.145 0.107 0.06 B L1
ENSG00000157216 SSBP3 616887 sc-eQTL 1.33e-02 -0.277 0.111 0.06 B L1
ENSG00000162402 USP24 -184998 sc-eQTL 1.34e-01 -0.143 0.0948 0.06 B L1
ENSG00000215883 CYB5RL 830330 sc-eQTL 5.28e-01 0.116 0.183 0.06 B L1
ENSG00000243725 TTC4 314505 sc-eQTL 8.56e-01 0.029 0.16 0.06 B L1
ENSG00000006555 TTC22 229043 sc-eQTL 2.86e-01 -0.139 0.13 0.06 CD4T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 976782 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0566 0.106 0.06 CD4T L1
ENSG00000116209 TMEM59 976862 sc-eQTL 6.85e-01 0.0403 0.0992 0.06 CD4T L1
ENSG00000116221 MRPL37 846325 sc-eQTL 5.26e-01 -0.087 0.137 0.06 CD4T L1
ENSG00000157216 SSBP3 616887 sc-eQTL 2.52e-01 0.13 0.114 0.06 CD4T L1
ENSG00000162402 USP24 -184998 sc-eQTL 8.98e-01 0.0119 0.0928 0.06 CD4T L1
ENSG00000243725 TTC4 314505 sc-eQTL 9.31e-01 0.012 0.14 0.06 CD4T L1
ENSG00000006555 TTC22 229043 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0536 0.111 0.06 CD8T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 976782 sc-eQTL 4.24e-01 -0.111 0.138 0.06 CD8T L1
ENSG00000116209 TMEM59 976862 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0286 0.0962 0.06 CD8T L1
ENSG00000116221 MRPL37 846325 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0172 0.132 0.06 CD8T L1
ENSG00000157216 SSBP3 616887 sc-eQTL 6.44e-01 -0.044 0.0951 0.06 CD8T L1
ENSG00000162402 USP24 -184998 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0667 0.0919 0.06 CD8T L1
ENSG00000243725 TTC4 314505 sc-eQTL 9.71e-01 0.00586 0.16 0.06 CD8T L1
ENSG00000116133 DHCR24 143171 sc-eQTL 8.10e-01 0.039 0.162 0.059 DC L1
ENSG00000116205 TCEANC2 976782 sc-eQTL 7.40e-01 0.0604 0.182 0.059 DC L1
ENSG00000116209 TMEM59 976862 sc-eQTL 1.83e-01 0.19 0.142 0.059 DC L1
ENSG00000116221 MRPL37 846325 sc-eQTL 9.43e-01 0.0137 0.192 0.059 DC L1
ENSG00000157216 SSBP3 616887 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0916 0.171 0.059 DC L1
ENSG00000162390 ACOT11 488109 sc-eQTL 6.48e-01 0.0752 0.164 0.059 DC L1
ENSG00000162402 USP24 -184998 sc-eQTL 1.87e-01 0.131 0.0988 0.059 DC L1
ENSG00000215883 CYB5RL 830330 sc-eQTL 3.65e-01 0.163 0.179 0.059 DC L1
ENSG00000243725 TTC4 314505 sc-eQTL 6.92e-02 0.35 0.191 0.059 DC L1
ENSG00000116133 DHCR24 143171 sc-eQTL 4.43e-01 0.0846 0.11 0.06 Mono L1
ENSG00000116205 TCEANC2 976782 sc-eQTL 4.96e-01 0.081 0.119 0.06 Mono L1
ENSG00000116209 TMEM59 976862 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00812 0.0883 0.06 Mono L1
ENSG00000116221 MRPL37 846325 sc-eQTL 3.62e-01 0.135 0.147 0.06 Mono L1
ENSG00000157216 SSBP3 616887 sc-eQTL 9.27e-01 0.0156 0.169 0.06 Mono L1
ENSG00000162402 USP24 -184998 sc-eQTL 1.48e-01 -0.146 0.1 0.06 Mono L1
ENSG00000243725 TTC4 314505 sc-eQTL 8.92e-01 0.0242 0.177 0.06 Mono L1
ENSG00000006555 TTC22 229043 sc-eQTL 3.48e-01 0.14 0.149 0.06 NK L1
ENSG00000116133 DHCR24 143171 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0558 0.151 0.06 NK L1
ENSG00000116205 TCEANC2 976782 sc-eQTL 5.13e-02 -0.289 0.147 0.06 NK L1
ENSG00000116209 TMEM59 976862 sc-eQTL 2.74e-01 0.127 0.116 0.06 NK L1
ENSG00000116221 MRPL37 846325 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0393 0.145 0.06 NK L1
ENSG00000157216 SSBP3 616887 sc-eQTL 6.24e-01 0.0616 0.126 0.06 NK L1
ENSG00000162398 LEXM 224303 sc-eQTL 5.03e-01 0.0945 0.141 0.06 NK L1
ENSG00000162402 USP24 -184998 sc-eQTL 1.66e-01 -0.118 0.0851 0.06 NK L1
ENSG00000243725 TTC4 314505 sc-eQTL 4.52e-01 -0.122 0.161 0.06 NK L1
ENSG00000006555 TTC22 229043 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0486 0.132 0.06 Other_T L1
ENSG00000116133 DHCR24 143171 sc-eQTL 6.43e-01 0.0475 0.102 0.06 Other_T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 976782 sc-eQTL 4.36e-01 -0.119 0.153 0.06 Other_T L1
ENSG00000116209 TMEM59 976862 sc-eQTL 8.64e-01 -0.018 0.105 0.06 Other_T L1
ENSG00000116221 MRPL37 846325 sc-eQTL 7.25e-02 0.176 0.0977 0.06 Other_T L1
ENSG00000157216 SSBP3 616887 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000622 0.114 0.06 Other_T L1
ENSG00000162402 USP24 -184998 sc-eQTL 5.12e-02 0.236 0.12 0.06 Other_T L1
ENSG00000215883 CYB5RL 830330 sc-eQTL 1.18e-01 0.259 0.165 0.06 Other_T L1
ENSG00000243725 TTC4 314505 sc-eQTL 9.52e-02 -0.275 0.164 0.06 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 229043 sc-eQTL 7.27e-01 0.0501 0.143 0.054 B_Activated L2
ENSG00000116133 DHCR24 143171 sc-eQTL 4.49e-01 -0.127 0.168 0.054 B_Activated L2
ENSG00000116205 TCEANC2 976782 sc-eQTL 7.00e-01 0.0696 0.18 0.054 B_Activated L2
ENSG00000116209 TMEM59 976862 sc-eQTL 1.64e-01 -0.267 0.191 0.054 B_Activated L2
ENSG00000116221 MRPL37 846325 sc-eQTL 9.51e-01 -0.0128 0.207 0.054 B_Activated L2
ENSG00000157216 SSBP3 616887 sc-eQTL 4.60e-01 -0.139 0.187 0.054 B_Activated L2
ENSG00000162402 USP24 -184998 sc-eQTL 3.25e-01 -0.18 0.183 0.054 B_Activated L2
ENSG00000215883 CYB5RL 830330 sc-eQTL 3.97e-01 -0.137 0.161 0.054 B_Activated L2
ENSG00000243725 TTC4 314505 sc-eQTL 1.42e-01 0.257 0.174 0.054 B_Activated L2
ENSG00000006555 TTC22 229043 sc-eQTL 4.27e-01 -0.141 0.177 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000116133 DHCR24 143171 sc-eQTL 9.70e-01 0.00613 0.165 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000116205 TCEANC2 976782 sc-eQTL 3.60e-01 -0.15 0.164 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000116209 TMEM59 976862 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0597 0.14 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000116221 MRPL37 846325 sc-eQTL 2.46e-01 0.192 0.165 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000157216 SSBP3 616887 sc-eQTL 1.03e-01 -0.251 0.153 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000162402 USP24 -184998 sc-eQTL 1.07e-01 -0.209 0.129 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000215883 CYB5RL 830330 sc-eQTL 4.96e-01 0.126 0.184 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000243725 TTC4 314505 sc-eQTL 5.96e-01 -0.089 0.167 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000006555 TTC22 229043 sc-eQTL 1.20e-01 -0.271 0.174 0.06 B_Memory L2
ENSG00000116133 DHCR24 143171 sc-eQTL 1.56e-02 -0.417 0.171 0.06 B_Memory L2
ENSG00000116205 TCEANC2 976782 sc-eQTL 8.46e-02 0.319 0.184 0.06 B_Memory L2
ENSG00000116209 TMEM59 976862 sc-eQTL 2.32e-01 -0.184 0.154 0.06 B_Memory L2
ENSG00000116221 MRPL37 846325 sc-eQTL 1.86e-01 0.207 0.156 0.06 B_Memory L2
ENSG00000157216 SSBP3 616887 sc-eQTL 3.97e-01 -0.124 0.146 0.06 B_Memory L2
ENSG00000162402 USP24 -184998 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0572 0.143 0.06 B_Memory L2
ENSG00000215883 CYB5RL 830330 sc-eQTL 1.15e-01 -0.278 0.176 0.06 B_Memory L2
ENSG00000243725 TTC4 314505 sc-eQTL 8.20e-01 0.0418 0.183 0.06 B_Memory L2
ENSG00000006555 TTC22 229043 sc-eQTL 6.02e-02 -0.327 0.173 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000116133 DHCR24 143171 sc-eQTL 2.68e-01 -0.181 0.163 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 976782 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0301 0.146 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000116209 TMEM59 976862 sc-eQTL 6.81e-01 0.0437 0.106 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000116221 MRPL37 846325 sc-eQTL 7.35e-01 0.053 0.156 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000157216 SSBP3 616887 sc-eQTL 1.24e-01 -0.229 0.148 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000162402 USP24 -184998 sc-eQTL 6.25e-01 0.0574 0.117 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 830330 sc-eQTL 1.84e-01 0.235 0.176 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000243725 TTC4 314505 sc-eQTL 3.38e-01 0.153 0.159 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000006555 TTC22 229043 sc-eQTL 4.01e-01 -0.148 0.176 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000116133 DHCR24 143171 sc-eQTL 9.56e-02 -0.255 0.152 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 976782 sc-eQTL 3.33e-02 0.361 0.168 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000116209 TMEM59 976862 sc-eQTL 4.09e-02 0.285 0.139 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000116221 MRPL37 846325 sc-eQTL 2.99e-01 0.171 0.165 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000157216 SSBP3 616887 sc-eQTL 6.53e-01 -0.073 0.162 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000162402 USP24 -184998 sc-eQTL 2.49e-01 -0.148 0.128 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 830330 sc-eQTL 4.74e-01 -0.13 0.181 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000243725 TTC4 314505 sc-eQTL 5.66e-01 0.108 0.188 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000006555 TTC22 229043 sc-eQTL 4.60e-01 0.122 0.165 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 976782 sc-eQTL 2.50e-01 0.196 0.17 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 976862 sc-eQTL 1.23e-01 0.238 0.154 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 846325 sc-eQTL 8.25e-02 0.33 0.189 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 616887 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0675 0.117 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -184998 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0675 0.161 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 314505 sc-eQTL 3.77e-01 -0.159 0.18 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 229043 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0953 0.152 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 976782 sc-eQTL 2.95e-01 -0.121 0.116 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 976862 sc-eQTL 8.14e-01 0.0266 0.113 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 846325 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0781 0.145 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 616887 sc-eQTL 1.02e-02 0.296 0.114 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -184998 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0321 0.1 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 314505 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000945 0.153 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 229043 sc-eQTL 7.73e-01 0.0459 0.159 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 976782 sc-eQTL 3.61e-01 0.141 0.155 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 976862 sc-eQTL 9.35e-01 -0.0095 0.117 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 846325 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0745 0.147 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 616887 sc-eQTL 9.36e-01 0.0115 0.144 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -184998 sc-eQTL 3.38e-01 0.114 0.119 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 314505 sc-eQTL 1.59e-01 -0.242 0.171 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 229043 sc-eQTL 9.16e-01 0.0194 0.183 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 976782 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0323 0.174 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 976862 sc-eQTL 1.86e-01 0.178 0.134 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 846325 sc-eQTL 1.91e-01 0.226 0.172 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 616887 sc-eQTL 7.27e-01 0.0518 0.148 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -184998 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0882 0.135 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 314505 sc-eQTL 5.05e-01 0.119 0.178 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 229043 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0162 0.145 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 976782 sc-eQTL 3.28e-02 -0.342 0.159 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 976862 sc-eQTL 4.42e-01 -0.108 0.14 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 846325 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0261 0.166 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 616887 sc-eQTL 1.76e-01 -0.153 0.113 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -184998 sc-eQTL 3.43e-01 -0.107 0.113 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 314505 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0509 0.169 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 229043 sc-eQTL 1.08e-01 -0.259 0.161 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 976782 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0308 0.146 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 976862 sc-eQTL 9.34e-01 0.0118 0.143 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 846325 sc-eQTL 3.28e-01 0.168 0.171 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 616887 sc-eQTL 3.11e-02 0.279 0.128 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -184998 sc-eQTL 5.93e-01 0.0633 0.118 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 314505 sc-eQTL 9.82e-01 -0.0038 0.173 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 229043 sc-eQTL 9.97e-01 0.000784 0.18 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 976782 sc-eQTL 9.48e-01 0.0118 0.181 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 976862 sc-eQTL 3.43e-01 0.151 0.159 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 846325 sc-eQTL 6.46e-01 0.083 0.181 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 616887 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0485 0.157 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -184998 sc-eQTL 9.67e-01 0.00626 0.152 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 314505 sc-eQTL 1.78e-01 -0.249 0.184 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 229043 sc-eQTL 8.13e-01 0.0401 0.17 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 976782 sc-eQTL 5.52e-01 0.105 0.177 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 976862 sc-eQTL 4.24e-01 0.137 0.171 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 846325 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0447 0.173 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 616887 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00258 0.164 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -184998 sc-eQTL 6.88e-01 0.0694 0.173 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 314505 sc-eQTL 3.75e-01 0.156 0.175 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 229043 sc-eQTL 3.89e-01 0.135 0.157 0.061 MAIT L2
ENSG00000116133 DHCR24 143171 sc-eQTL 7.06e-02 0.21 0.115 0.061 MAIT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 976782 sc-eQTL 1.07e-01 -0.263 0.163 0.061 MAIT L2
ENSG00000116209 TMEM59 976862 sc-eQTL 5.19e-01 0.0954 0.148 0.061 MAIT L2
ENSG00000116221 MRPL37 846325 sc-eQTL 1.75e-01 0.244 0.179 0.061 MAIT L2
ENSG00000157216 SSBP3 616887 sc-eQTL 4.67e-01 -0.116 0.159 0.061 MAIT L2
ENSG00000162402 USP24 -184998 sc-eQTL 1.96e-01 0.183 0.141 0.061 MAIT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 830330 sc-eQTL 1.49e-01 0.237 0.164 0.061 MAIT L2
ENSG00000243725 TTC4 314505 sc-eQTL 3.96e-01 -0.139 0.163 0.061 MAIT L2
ENSG00000006555 TTC22 229043 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0249 0.189 0.058 NK_CD56bright L2
ENSG00000116133 DHCR24 143171 sc-eQTL 9.83e-01 -0.0035 0.167 0.058 NK_CD56bright L2
ENSG00000116205 TCEANC2 976782 sc-eQTL 4.12e-01 0.144 0.176 0.058 NK_CD56bright L2
ENSG00000116209 TMEM59 976862 sc-eQTL 2.08e-01 0.216 0.171 0.058 NK_CD56bright L2
ENSG00000116221 MRPL37 846325 sc-eQTL 7.84e-03 0.506 0.188 0.058 NK_CD56bright L2
ENSG00000157216 SSBP3 616887 sc-eQTL 6.70e-01 0.0616 0.144 0.058 NK_CD56bright L2
ENSG00000162398 LEXM 224303 sc-eQTL 7.31e-01 0.0587 0.171 0.058 NK_CD56bright L2
ENSG00000162402 USP24 -184998 sc-eQTL 1.68e-01 -0.202 0.146 0.058 NK_CD56bright L2
ENSG00000243725 TTC4 314505 sc-eQTL 4.09e-01 0.153 0.185 0.058 NK_CD56bright L2
ENSG00000006555 TTC22 229043 sc-eQTL 1.91e-01 0.197 0.15 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000116133 DHCR24 143171 sc-eQTL 4.65e-01 0.115 0.157 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000116205 TCEANC2 976782 sc-eQTL 1.37e-01 -0.253 0.169 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000116209 TMEM59 976862 sc-eQTL 6.80e-01 0.052 0.126 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000116221 MRPL37 846325 sc-eQTL 2.64e-01 -0.183 0.163 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000157216 SSBP3 616887 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00429 0.134 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000162398 LEXM 224303 sc-eQTL 6.56e-01 0.0688 0.154 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000162402 USP24 -184998 sc-eQTL 3.29e-01 -0.0957 0.0979 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000243725 TTC4 314505 sc-eQTL 1.00e-01 -0.276 0.167 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000006555 TTC22 229043 sc-eQTL 1.68e-01 0.264 0.191 0.057 NK_HLA L2
ENSG00000116133 DHCR24 143171 sc-eQTL 4.12e-01 -0.153 0.186 0.057 NK_HLA L2
ENSG00000116205 TCEANC2 976782 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0449 0.18 0.057 NK_HLA L2
ENSG00000116209 TMEM59 976862 sc-eQTL 5.29e-01 0.113 0.179 0.057 NK_HLA L2
ENSG00000116221 MRPL37 846325 sc-eQTL 1.72e-01 -0.269 0.196 0.057 NK_HLA L2
ENSG00000157216 SSBP3 616887 sc-eQTL 6.35e-01 0.0764 0.161 0.057 NK_HLA L2
ENSG00000162398 LEXM 224303 sc-eQTL 4.65e-01 0.133 0.181 0.057 NK_HLA L2
ENSG00000162402 USP24 -184998 sc-eQTL 2.92e-01 -0.14 0.133 0.057 NK_HLA L2
ENSG00000243725 TTC4 314505 sc-eQTL 8.26e-01 0.0438 0.199 0.057 NK_HLA L2
ENSG00000006555 TTC22 229043 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0875 0.161 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000116133 DHCR24 143171 sc-eQTL 2.45e-01 -0.19 0.162 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000116205 TCEANC2 976782 sc-eQTL 3.98e-02 -0.331 0.16 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000116209 TMEM59 976862 sc-eQTL 1.60e-01 0.185 0.131 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000116221 MRPL37 846325 sc-eQTL 6.98e-01 0.0629 0.162 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000157216 SSBP3 616887 sc-eQTL 1.20e-01 0.211 0.135 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000162398 LEXM 224303 sc-eQTL 8.50e-01 0.0322 0.17 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000162402 USP24 -184998 sc-eQTL 1.69e-01 -0.159 0.115 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000243725 TTC4 314505 sc-eQTL 3.72e-01 -0.153 0.171 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000006555 TTC22 229043 sc-eQTL 2.33e-01 -0.208 0.173 0.074 PB L2
ENSG00000116133 DHCR24 143171 sc-eQTL 8.98e-01 -0.02 0.155 0.074 PB L2
ENSG00000116205 TCEANC2 976782 sc-eQTL 1.63e-01 -0.262 0.187 0.074 PB L2
ENSG00000116209 TMEM59 976862 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0242 0.0787 0.074 PB L2
ENSG00000116221 MRPL37 846325 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0556 0.143 0.074 PB L2
ENSG00000157216 SSBP3 616887 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0232 0.165 0.074 PB L2
ENSG00000162402 USP24 -184998 sc-eQTL 2.99e-01 -0.195 0.187 0.074 PB L2
ENSG00000215883 CYB5RL 830330 sc-eQTL 8.77e-01 0.0303 0.194 0.074 PB L2
ENSG00000243725 TTC4 314505 sc-eQTL 6.37e-01 0.0857 0.181 0.074 PB L2
ENSG00000006555 TTC22 229043 sc-eQTL 7.30e-01 -0.057 0.165 0.061 Pro_T L2
ENSG00000116133 DHCR24 143171 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0579 0.14 0.061 Pro_T L2
ENSG00000116205 TCEANC2 976782 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0212 0.171 0.061 Pro_T L2
ENSG00000116209 TMEM59 976862 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0357 0.119 0.061 Pro_T L2
ENSG00000116221 MRPL37 846325 sc-eQTL 5.15e-01 0.0756 0.116 0.061 Pro_T L2
ENSG00000157216 SSBP3 616887 sc-eQTL 3.53e-01 0.121 0.13 0.061 Pro_T L2
ENSG00000162402 USP24 -184998 sc-eQTL 5.78e-01 0.0885 0.159 0.061 Pro_T L2
ENSG00000215883 CYB5RL 830330 sc-eQTL 4.75e-01 0.112 0.157 0.061 Pro_T L2
ENSG00000243725 TTC4 314505 sc-eQTL 7.13e-01 0.0643 0.174 0.061 Pro_T L2
ENSG00000006555 TTC22 229043 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0503 0.159 0.06 Treg L2
ENSG00000116205 TCEANC2 976782 sc-eQTL 4.47e-01 -0.13 0.17 0.06 Treg L2
ENSG00000116209 TMEM59 976862 sc-eQTL 4.00e-01 0.114 0.135 0.06 Treg L2
ENSG00000116221 MRPL37 846325 sc-eQTL 7.93e-02 -0.292 0.166 0.06 Treg L2
ENSG00000157216 SSBP3 616887 sc-eQTL 7.31e-01 0.0513 0.149 0.06 Treg L2
ENSG00000162402 USP24 -184998 sc-eQTL 2.13e-01 -0.177 0.141 0.06 Treg L2
ENSG00000243725 TTC4 314505 sc-eQTL 8.98e-02 0.303 0.178 0.06 Treg L2
ENSG00000116133 DHCR24 143171 sc-eQTL 5.52e-01 0.0943 0.158 0.056 cDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 976782 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0919 0.187 0.056 cDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 976862 sc-eQTL 2.27e-01 0.192 0.158 0.056 cDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 846325 sc-eQTL 2.38e-01 -0.239 0.202 0.056 cDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 616887 sc-eQTL 5.91e-01 -0.101 0.187 0.056 cDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 488109 sc-eQTL 8.71e-01 0.0282 0.174 0.056 cDC L2
ENSG00000162402 USP24 -184998 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0346 0.195 0.056 cDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 830330 sc-eQTL 2.53e-01 0.191 0.167 0.056 cDC L2
ENSG00000243725 TTC4 314505 sc-eQTL 4.22e-01 0.161 0.2 0.056 cDC L2
ENSG00000116133 DHCR24 143171 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0114 0.107 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000116205 TCEANC2 976782 sc-eQTL 2.72e-01 0.163 0.148 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000116209 TMEM59 976862 sc-eQTL 7.30e-01 0.0311 0.09 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000116221 MRPL37 846325 sc-eQTL 4.77e-01 0.114 0.16 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000157216 SSBP3 616887 sc-eQTL 4.06e-01 -0.136 0.163 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000162402 USP24 -184998 sc-eQTL 4.03e-01 -0.101 0.121 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000243725 TTC4 314505 sc-eQTL 5.46e-01 0.112 0.185 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000116133 DHCR24 143171 sc-eQTL 9.59e-01 -0.0052 0.101 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000116205 TCEANC2 976782 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0921 0.153 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000116209 TMEM59 976862 sc-eQTL 3.52e-01 -0.114 0.123 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000116221 MRPL37 846325 sc-eQTL 7.13e-01 0.0654 0.177 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000157216 SSBP3 616887 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0367 0.184 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000162402 USP24 -184998 sc-eQTL 3.39e-01 -0.143 0.149 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000243725 TTC4 314505 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0348 0.187 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000006555 TTC22 229043 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0571 0.182 0.055 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 143171 sc-eQTL 8.79e-01 0.0309 0.203 0.055 gdT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 976782 sc-eQTL 7.23e-01 0.0725 0.204 0.055 gdT L2
ENSG00000116209 TMEM59 976862 sc-eQTL 7.60e-01 0.0635 0.207 0.055 gdT L2
ENSG00000116221 MRPL37 846325 sc-eQTL 4.57e-01 0.177 0.237 0.055 gdT L2
ENSG00000157216 SSBP3 616887 sc-eQTL 6.04e-01 0.0755 0.145 0.055 gdT L2
ENSG00000162402 USP24 -184998 sc-eQTL 1.13e-01 0.309 0.194 0.055 gdT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 830330 sc-eQTL 7.97e-01 0.0524 0.203 0.055 gdT L2
ENSG00000243725 TTC4 314505 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0867 0.229 0.055 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 143171 sc-eQTL 5.78e-01 0.0759 0.136 0.058 intMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 976782 sc-eQTL 9.93e-01 0.00145 0.17 0.058 intMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 976862 sc-eQTL 2.88e-01 -0.132 0.124 0.058 intMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 846325 sc-eQTL 2.10e-01 -0.239 0.19 0.058 intMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 616887 sc-eQTL 4.20e-01 0.157 0.194 0.058 intMono L2
ENSG00000162402 USP24 -184998 sc-eQTL 2.48e-01 0.2 0.173 0.058 intMono L2
ENSG00000243725 TTC4 314505 sc-eQTL 1.27e-01 0.282 0.184 0.058 intMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 143171 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0149 0.169 0.054 pDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 976782 sc-eQTL 5.24e-01 -0.129 0.202 0.054 pDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 976862 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0849 0.162 0.054 pDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 846325 sc-eQTL 1.46e-01 0.312 0.213 0.054 pDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 616887 sc-eQTL 9.68e-02 -0.316 0.189 0.054 pDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 488109 sc-eQTL 3.43e-01 -0.0761 0.08 0.054 pDC L2
ENSG00000162402 USP24 -184998 sc-eQTL 6.92e-01 0.0537 0.135 0.054 pDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 830330 sc-eQTL 9.40e-01 0.014 0.185 0.054 pDC L2
ENSG00000243725 TTC4 314505 sc-eQTL 2.09e-01 0.268 0.213 0.054 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 229043 sc-eQTL 1.26e-01 -0.263 0.172 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 143171 sc-eQTL 1.23e-01 -0.266 0.172 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 976782 sc-eQTL 9.61e-01 0.00821 0.167 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 976862 sc-eQTL 3.89e-02 -0.268 0.129 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 846325 sc-eQTL 2.36e-02 0.351 0.154 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 616887 sc-eQTL 8.21e-02 -0.235 0.135 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -184998 sc-eQTL 3.24e-01 -0.122 0.123 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 830330 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0946 0.19 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 314505 sc-eQTL 2.85e-01 0.182 0.17 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 229043 sc-eQTL 3.62e-02 -0.369 0.175 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 143171 sc-eQTL 1.37e-01 -0.236 0.158 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 976782 sc-eQTL 2.41e-01 0.169 0.143 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 976862 sc-eQTL 2.22e-01 0.125 0.102 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 846325 sc-eQTL 5.35e-01 0.0912 0.147 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 616887 sc-eQTL 1.71e-01 -0.18 0.131 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -184998 sc-eQTL 9.31e-01 0.00981 0.113 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 830330 sc-eQTL 4.26e-01 0.142 0.178 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 314505 sc-eQTL 4.84e-01 0.118 0.168 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 143171 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0325 0.103 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 976782 sc-eQTL 3.14e-01 0.13 0.129 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 976862 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0185 0.0893 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 846325 sc-eQTL 4.99e-01 0.107 0.158 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 616887 sc-eQTL 4.74e-01 -0.118 0.165 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -184998 sc-eQTL 2.08e-01 -0.142 0.113 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 314505 sc-eQTL 6.64e-01 0.0815 0.187 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 143171 sc-eQTL 9.04e-02 0.225 0.132 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 976782 sc-eQTL 7.02e-01 0.0671 0.175 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 976862 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0563 0.13 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 846325 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0592 0.178 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 616887 sc-eQTL 5.24e-01 0.122 0.19 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -184998 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0434 0.15 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 314505 sc-eQTL 3.27e-01 0.185 0.188 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 229043 sc-eQTL 1.93e-01 0.19 0.146 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 143171 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0632 0.153 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 976782 sc-eQTL 2.73e-02 -0.329 0.148 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 976862 sc-eQTL 4.96e-01 0.0789 0.116 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 846325 sc-eQTL 2.17e-01 -0.192 0.155 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 616887 sc-eQTL 6.51e-01 0.0578 0.127 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162398 LEXM 224303 sc-eQTL 3.71e-01 0.129 0.143 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -184998 sc-eQTL 1.08e-01 -0.146 0.0905 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 314505 sc-eQTL 1.80e-01 -0.217 0.161 0.06 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000169174 PCSK9 -9182 eQTL 0.0145 -0.0847 0.0346 0.0 0.0 0.0579
ENSG00000215883 CYB5RL 830330 eQTL 0.0411 0.0798 0.039 0.0 0.0 0.0579
ENSG00000234810 AL603840.1 -298922 eQTL 0.0393 -0.131 0.0636 0.0 0.0 0.0579
ENSG00000243725 TTC4 314505 eQTL 0.0138 -0.0889 0.036 0.0 0.0 0.0579

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000215883 CYB5RL 830330 2.8e-07 1.34e-07 5.64e-08 1.9e-07 1.03e-07 9.05e-08 1.67e-07 5.66e-08 1.5e-07 6.4e-08 1.63e-07 1.11e-07 1.69e-07 7.64e-08 5.72e-08 7.23e-08 4.24e-08 1.44e-07 6.32e-08 5.07e-08 1.25e-07 1.25e-07 1.44e-07 3.17e-08 1.63e-07 1.22e-07 1.18e-07 1.04e-07 1.23e-07 9.88e-08 1.06e-07 3.66e-08 3.43e-08 8.89e-08 3.52e-08 3.22e-08 5.3e-08 8.51e-08 6.71e-08 4.55e-08 5.48e-08 1.4e-07 5.08e-08 1.28e-08 3.07e-08 1.65e-08 1.11e-07 1.96e-09 4.8e-08