logo

Genes within 1Mb (chr1:55029009:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 227686 sc-eQTL 3.28e-01 0.0972 0.0992 0.237 B L1
ENSG00000116133 DHCR24 141814 sc-eQTL 6.76e-01 0.0394 0.094 0.237 B L1
ENSG00000116205 TCEANC2 975425 sc-eQTL 3.88e-01 0.0701 0.081 0.237 B L1
ENSG00000116209 TMEM59 975505 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00131 0.0494 0.237 B L1
ENSG00000116221 MRPL37 844968 sc-eQTL 7.73e-01 0.0187 0.0647 0.237 B L1
ENSG00000157216 SSBP3 615530 sc-eQTL 4.69e-01 0.0491 0.0676 0.237 B L1
ENSG00000162402 USP24 -186355 sc-eQTL 4.79e-01 0.0406 0.0573 0.237 B L1
ENSG00000215883 CYB5RL 828973 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0367 0.11 0.237 B L1
ENSG00000243725 TTC4 313148 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0287 0.0961 0.237 B L1
ENSG00000006555 TTC22 227686 sc-eQTL 9.04e-01 0.00946 0.0783 0.237 CD4T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 975425 sc-eQTL 4.29e-01 0.0506 0.0639 0.237 CD4T L1
ENSG00000116209 TMEM59 975505 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0243 0.0596 0.237 CD4T L1
ENSG00000116221 MRPL37 844968 sc-eQTL 6.82e-01 0.0338 0.0824 0.237 CD4T L1
ENSG00000157216 SSBP3 615530 sc-eQTL 2.85e-02 0.149 0.0676 0.237 CD4T L1
ENSG00000162402 USP24 -186355 sc-eQTL 4.91e-01 0.0384 0.0557 0.237 CD4T L1
ENSG00000243725 TTC4 313148 sc-eQTL 2.49e-01 -0.0967 0.0836 0.237 CD4T L1
ENSG00000006555 TTC22 227686 sc-eQTL 2.43e-01 -0.0785 0.067 0.237 CD8T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 975425 sc-eQTL 2.31e-01 0.1 0.0835 0.237 CD8T L1
ENSG00000116209 TMEM59 975505 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0457 0.0581 0.237 CD8T L1
ENSG00000116221 MRPL37 844968 sc-eQTL 2.20e-01 0.0981 0.0798 0.237 CD8T L1
ENSG00000157216 SSBP3 615530 sc-eQTL 2.99e-01 0.0598 0.0574 0.237 CD8T L1
ENSG00000162402 USP24 -186355 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0161 0.0556 0.237 CD8T L1
ENSG00000243725 TTC4 313148 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0783 0.0964 0.237 CD8T L1
ENSG00000116133 DHCR24 141814 sc-eQTL 9.00e-01 0.0113 0.0902 0.239 DC L1
ENSG00000116205 TCEANC2 975425 sc-eQTL 9.01e-02 -0.171 0.1 0.239 DC L1
ENSG00000116209 TMEM59 975505 sc-eQTL 4.97e-01 0.054 0.0794 0.239 DC L1
ENSG00000116221 MRPL37 844968 sc-eQTL 2.92e-01 -0.113 0.106 0.239 DC L1
ENSG00000157216 SSBP3 615530 sc-eQTL 6.33e-01 0.0454 0.0952 0.239 DC L1
ENSG00000162390 ACOT11 486752 sc-eQTL 1.45e-01 0.133 0.0911 0.239 DC L1
ENSG00000162402 USP24 -186355 sc-eQTL 2.15e-03 0.168 0.0539 0.239 DC L1
ENSG00000215883 CYB5RL 828973 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0921 0.0996 0.239 DC L1
ENSG00000243725 TTC4 313148 sc-eQTL 5.64e-01 0.0621 0.107 0.239 DC L1
ENSG00000116133 DHCR24 141814 sc-eQTL 9.18e-01 -0.00669 0.0651 0.237 Mono L1
ENSG00000116205 TCEANC2 975425 sc-eQTL 1.37e-01 -0.104 0.0698 0.237 Mono L1
ENSG00000116209 TMEM59 975505 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0125 0.0521 0.237 Mono L1
ENSG00000116221 MRPL37 844968 sc-eQTL 4.96e-01 0.0594 0.0871 0.237 Mono L1
ENSG00000157216 SSBP3 615530 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0118 0.0999 0.237 Mono L1
ENSG00000162402 USP24 -186355 sc-eQTL 3.48e-01 -0.0559 0.0594 0.237 Mono L1
ENSG00000243725 TTC4 313148 sc-eQTL 2.36e-01 0.124 0.105 0.237 Mono L1
ENSG00000006555 TTC22 227686 sc-eQTL 3.23e-01 -0.0891 0.09 0.236 NK L1
ENSG00000116133 DHCR24 141814 sc-eQTL 6.16e-02 0.17 0.0903 0.236 NK L1
ENSG00000116205 TCEANC2 975425 sc-eQTL 4.40e-01 0.0694 0.0897 0.236 NK L1
ENSG00000116209 TMEM59 975505 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0524 0.0703 0.236 NK L1
ENSG00000116221 MRPL37 844968 sc-eQTL 2.36e-01 0.104 0.0872 0.236 NK L1
ENSG00000157216 SSBP3 615530 sc-eQTL 4.17e-01 0.0616 0.0758 0.236 NK L1
ENSG00000162398 LEXM 222946 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0467 0.0851 0.236 NK L1
ENSG00000162402 USP24 -186355 sc-eQTL 3.74e-01 0.046 0.0516 0.236 NK L1
ENSG00000243725 TTC4 313148 sc-eQTL 6.76e-01 0.0408 0.0976 0.236 NK L1
ENSG00000006555 TTC22 227686 sc-eQTL 7.17e-01 0.0288 0.0795 0.237 Other_T L1
ENSG00000116133 DHCR24 141814 sc-eQTL 3.27e-02 0.131 0.061 0.237 Other_T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 975425 sc-eQTL 4.81e-01 0.0651 0.0922 0.237 Other_T L1
ENSG00000116209 TMEM59 975505 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0281 0.0633 0.237 Other_T L1
ENSG00000116221 MRPL37 844968 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0379 0.0593 0.237 Other_T L1
ENSG00000157216 SSBP3 615530 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00216 0.0686 0.237 Other_T L1
ENSG00000162402 USP24 -186355 sc-eQTL 9.50e-02 -0.122 0.0726 0.237 Other_T L1
ENSG00000215883 CYB5RL 828973 sc-eQTL 9.11e-01 0.0112 0.0999 0.237 Other_T L1
ENSG00000243725 TTC4 313148 sc-eQTL 7.17e-01 0.0361 0.0995 0.237 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 227686 sc-eQTL 2.30e-01 -0.099 0.0823 0.232 B_Activated L2
ENSG00000116133 DHCR24 141814 sc-eQTL 6.29e-01 0.047 0.097 0.232 B_Activated L2
ENSG00000116205 TCEANC2 975425 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0749 0.104 0.232 B_Activated L2
ENSG00000116209 TMEM59 975505 sc-eQTL 3.22e-01 0.11 0.11 0.232 B_Activated L2
ENSG00000116221 MRPL37 844968 sc-eQTL 3.74e-01 -0.106 0.119 0.232 B_Activated L2
ENSG00000157216 SSBP3 615530 sc-eQTL 5.38e-01 0.0668 0.108 0.232 B_Activated L2
ENSG00000162402 USP24 -186355 sc-eQTL 1.09e-02 0.267 0.104 0.232 B_Activated L2
ENSG00000215883 CYB5RL 828973 sc-eQTL 3.28e-01 0.0913 0.093 0.232 B_Activated L2
ENSG00000243725 TTC4 313148 sc-eQTL 8.47e-01 0.0196 0.101 0.232 B_Activated L2
ENSG00000006555 TTC22 227686 sc-eQTL 7.32e-01 0.0366 0.107 0.236 B_Intermediate L2
ENSG00000116133 DHCR24 141814 sc-eQTL 6.80e-01 0.041 0.0992 0.236 B_Intermediate L2
ENSG00000116205 TCEANC2 975425 sc-eQTL 5.53e-02 0.189 0.098 0.236 B_Intermediate L2
ENSG00000116209 TMEM59 975505 sc-eQTL 6.23e-01 0.0416 0.0846 0.236 B_Intermediate L2
ENSG00000116221 MRPL37 844968 sc-eQTL 5.70e-01 0.0567 0.0995 0.236 B_Intermediate L2
ENSG00000157216 SSBP3 615530 sc-eQTL 9.79e-01 0.00247 0.093 0.236 B_Intermediate L2
ENSG00000162402 USP24 -186355 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0141 0.0783 0.236 B_Intermediate L2
ENSG00000215883 CYB5RL 828973 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00524 0.111 0.236 B_Intermediate L2
ENSG00000243725 TTC4 313148 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0654 0.101 0.236 B_Intermediate L2
ENSG00000006555 TTC22 227686 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0283 0.101 0.239 B_Memory L2
ENSG00000116133 DHCR24 141814 sc-eQTL 9.40e-01 0.00764 0.101 0.239 B_Memory L2
ENSG00000116205 TCEANC2 975425 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0401 0.108 0.239 B_Memory L2
ENSG00000116209 TMEM59 975505 sc-eQTL 4.58e-01 0.0667 0.0897 0.239 B_Memory L2
ENSG00000116221 MRPL37 844968 sc-eQTL 8.54e-01 0.0167 0.0909 0.239 B_Memory L2
ENSG00000157216 SSBP3 615530 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0145 0.0849 0.239 B_Memory L2
ENSG00000162402 USP24 -186355 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0499 0.0829 0.239 B_Memory L2
ENSG00000215883 CYB5RL 828973 sc-eQTL 4.36e-01 -0.08 0.103 0.239 B_Memory L2
ENSG00000243725 TTC4 313148 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0821 0.106 0.239 B_Memory L2
ENSG00000006555 TTC22 227686 sc-eQTL 3.00e-01 0.109 0.105 0.237 B_Naive1 L2
ENSG00000116133 DHCR24 141814 sc-eQTL 4.51e-01 0.0745 0.0986 0.237 B_Naive1 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 975425 sc-eQTL 6.67e-01 0.038 0.088 0.237 B_Naive1 L2
ENSG00000116209 TMEM59 975505 sc-eQTL 1.54e-01 -0.0911 0.0637 0.237 B_Naive1 L2
ENSG00000116221 MRPL37 844968 sc-eQTL 7.44e-01 0.0309 0.0943 0.237 B_Naive1 L2
ENSG00000157216 SSBP3 615530 sc-eQTL 6.73e-01 0.038 0.0898 0.237 B_Naive1 L2
ENSG00000162402 USP24 -186355 sc-eQTL 1.70e-01 -0.0971 0.0705 0.237 B_Naive1 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 828973 sc-eQTL 5.65e-02 -0.203 0.106 0.237 B_Naive1 L2
ENSG00000243725 TTC4 313148 sc-eQTL 7.00e-01 0.0372 0.0964 0.237 B_Naive1 L2
ENSG00000006555 TTC22 227686 sc-eQTL 4.18e-01 0.0862 0.106 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000116133 DHCR24 141814 sc-eQTL 1.76e-01 0.125 0.0922 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 975425 sc-eQTL 9.98e-01 0.00028 0.103 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000116209 TMEM59 975505 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0256 0.0846 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000116221 MRPL37 844968 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000874 0.0996 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000157216 SSBP3 615530 sc-eQTL 9.11e-01 0.011 0.0981 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000162402 USP24 -186355 sc-eQTL 2.65e-01 0.0865 0.0775 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 828973 sc-eQTL 5.05e-01 0.073 0.109 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000243725 TTC4 313148 sc-eQTL 7.39e-01 0.0379 0.114 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000006555 TTC22 227686 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0796 0.102 0.241 CD4_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 975425 sc-eQTL 9.56e-02 0.174 0.104 0.241 CD4_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 975505 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0876 0.0951 0.241 CD4_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 844968 sc-eQTL 5.67e-02 0.223 0.116 0.241 CD4_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 615530 sc-eQTL 5.83e-01 0.0396 0.072 0.241 CD4_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -186355 sc-eQTL 7.89e-01 0.0265 0.099 0.241 CD4_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 313148 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0255 0.111 0.241 CD4_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 227686 sc-eQTL 9.87e-01 0.00152 0.0913 0.237 CD4_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 975425 sc-eQTL 4.61e-01 0.0512 0.0693 0.237 CD4_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 975505 sc-eQTL 2.51e-01 -0.0775 0.0673 0.237 CD4_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 844968 sc-eQTL 4.97e-01 0.0591 0.0869 0.237 CD4_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 615530 sc-eQTL 1.34e-01 0.104 0.0691 0.237 CD4_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -186355 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0132 0.0599 0.237 CD4_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 313148 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0728 0.0912 0.237 CD4_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 227686 sc-eQTL 6.83e-01 0.0392 0.0961 0.237 CD4_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 975425 sc-eQTL 4.67e-01 -0.068 0.0934 0.237 CD4_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 975505 sc-eQTL 1.00e+00 -3.18e-05 0.0705 0.237 CD4_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 844968 sc-eQTL 2.58e-01 -0.1 0.0885 0.237 CD4_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 615530 sc-eQTL 2.03e-02 0.201 0.0859 0.237 CD4_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -186355 sc-eQTL 3.31e-01 0.0701 0.0719 0.237 CD4_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 313148 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0108 0.104 0.237 CD4_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 227686 sc-eQTL 2.28e-01 -0.133 0.11 0.237 CD4_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 975425 sc-eQTL 9.93e-01 0.000917 0.104 0.237 CD4_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 975505 sc-eQTL 6.74e-01 0.034 0.0807 0.237 CD4_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 844968 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0579 0.104 0.237 CD4_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 615530 sc-eQTL 1.72e-01 0.121 0.0887 0.237 CD4_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -186355 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0227 0.081 0.237 CD4_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 313148 sc-eQTL 8.09e-01 0.026 0.107 0.237 CD4_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 227686 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0635 0.0889 0.237 CD8_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 975425 sc-eQTL 1.67e-01 0.136 0.0981 0.237 CD8_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 975505 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00697 0.0857 0.237 CD8_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 844968 sc-eQTL 1.06e-01 0.164 0.101 0.237 CD8_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 615530 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0139 0.0694 0.237 CD8_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -186355 sc-eQTL 1.59e-01 0.0971 0.0687 0.237 CD8_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 313148 sc-eQTL 1.17e-02 -0.259 0.102 0.237 CD8_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 227686 sc-eQTL 2.77e-02 -0.217 0.098 0.237 CD8_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 975425 sc-eQTL 7.38e-01 0.03 0.0896 0.237 CD8_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 975505 sc-eQTL 2.27e-01 -0.106 0.0874 0.237 CD8_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 844968 sc-eQTL 3.50e-01 0.0984 0.105 0.237 CD8_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 615530 sc-eQTL 3.49e-01 0.0746 0.0794 0.237 CD8_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -186355 sc-eQTL 9.99e-01 0.000118 0.0724 0.237 CD8_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 313148 sc-eQTL 3.38e-01 0.101 0.106 0.237 CD8_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 227686 sc-eQTL 1.92e-01 0.142 0.109 0.245 CD8_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 975425 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0126 0.11 0.245 CD8_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 975505 sc-eQTL 2.08e-01 0.122 0.0962 0.245 CD8_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 844968 sc-eQTL 7.38e-01 0.0367 0.11 0.245 CD8_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 615530 sc-eQTL 3.94e-01 0.081 0.0949 0.245 CD8_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -186355 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0428 0.0921 0.245 CD8_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 313148 sc-eQTL 2.04e-01 0.142 0.112 0.245 CD8_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 227686 sc-eQTL 9.66e-01 0.00441 0.103 0.233 CD8_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 975425 sc-eQTL 1.77e-01 -0.145 0.107 0.233 CD8_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 975505 sc-eQTL 9.88e-02 -0.172 0.104 0.233 CD8_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 844968 sc-eQTL 2.31e-01 0.127 0.105 0.233 CD8_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 615530 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0621 0.0999 0.233 CD8_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -186355 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0902 0.105 0.233 CD8_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 313148 sc-eQTL 1.72e-01 -0.146 0.107 0.233 CD8_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 227686 sc-eQTL 8.09e-01 0.0231 0.0952 0.236 MAIT L2
ENSG00000116133 DHCR24 141814 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0275 0.0705 0.236 MAIT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 975425 sc-eQTL 7.24e-01 0.0351 0.0992 0.236 MAIT L2
ENSG00000116209 TMEM59 975505 sc-eQTL 4.93e-01 0.0615 0.0896 0.236 MAIT L2
ENSG00000116221 MRPL37 844968 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0166 0.109 0.236 MAIT L2
ENSG00000157216 SSBP3 615530 sc-eQTL 6.57e-01 0.043 0.0965 0.236 MAIT L2
ENSG00000162402 USP24 -186355 sc-eQTL 5.70e-02 -0.163 0.085 0.236 MAIT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 828973 sc-eQTL 6.07e-01 0.0513 0.0996 0.236 MAIT L2
ENSG00000243725 TTC4 313148 sc-eQTL 5.21e-01 0.0636 0.099 0.236 MAIT L2
ENSG00000006555 TTC22 227686 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0196 0.109 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000116133 DHCR24 141814 sc-eQTL 5.18e-02 0.187 0.0957 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000116205 TCEANC2 975425 sc-eQTL 3.16e-01 -0.102 0.102 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000116209 TMEM59 975505 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0887 0.0993 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000116221 MRPL37 844968 sc-eQTL 3.06e-01 0.114 0.111 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000157216 SSBP3 615530 sc-eQTL 7.68e-01 0.0247 0.0838 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000162398 LEXM 222946 sc-eQTL 3.35e-01 0.0954 0.0987 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000162402 USP24 -186355 sc-eQTL 3.12e-01 -0.0861 0.0849 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000243725 TTC4 313148 sc-eQTL 5.92e-01 0.0576 0.107 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000006555 TTC22 227686 sc-eQTL 2.05e-01 -0.115 0.0907 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000116133 DHCR24 141814 sc-eQTL 3.38e-01 0.0909 0.0947 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000116205 TCEANC2 975425 sc-eQTL 4.01e-01 0.0864 0.103 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000116209 TMEM59 975505 sc-eQTL 5.38e-01 0.047 0.0762 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000116221 MRPL37 844968 sc-eQTL 2.29e-01 0.119 0.0988 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000157216 SSBP3 615530 sc-eQTL 3.75e-01 0.072 0.081 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000162398 LEXM 222946 sc-eQTL 2.38e-01 -0.11 0.093 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000162402 USP24 -186355 sc-eQTL 3.78e-01 0.0523 0.0592 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000243725 TTC4 313148 sc-eQTL 3.76e-01 -0.09 0.101 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000006555 TTC22 227686 sc-eQTL 2.28e-01 -0.136 0.113 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000116133 DHCR24 141814 sc-eQTL 2.78e-01 0.12 0.11 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000116205 TCEANC2 975425 sc-eQTL 4.85e-01 0.0742 0.106 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000116209 TMEM59 975505 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0567 0.105 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000116221 MRPL37 844968 sc-eQTL 3.44e-01 0.11 0.116 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000157216 SSBP3 615530 sc-eQTL 4.85e-01 0.0662 0.0948 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000162398 LEXM 222946 sc-eQTL 7.56e-01 0.0334 0.107 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000162402 USP24 -186355 sc-eQTL 1.08e-01 0.126 0.078 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000243725 TTC4 313148 sc-eQTL 6.91e-01 0.0467 0.117 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000006555 TTC22 227686 sc-eQTL 6.48e-01 0.0446 0.0977 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000116133 DHCR24 141814 sc-eQTL 2.21e-01 0.121 0.0985 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000116205 TCEANC2 975425 sc-eQTL 3.46e-01 0.0926 0.098 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000116209 TMEM59 975505 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0601 0.0797 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000116221 MRPL37 844968 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00179 0.0983 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000157216 SSBP3 615530 sc-eQTL 2.24e-01 0.1 0.0822 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000162398 LEXM 222946 sc-eQTL 8.29e-01 0.0223 0.103 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000162402 USP24 -186355 sc-eQTL 7.94e-01 0.0184 0.0703 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000243725 TTC4 313148 sc-eQTL 4.04e-01 0.0869 0.104 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000006555 TTC22 227686 sc-eQTL 9.22e-01 0.013 0.131 0.233 PB L2
ENSG00000116133 DHCR24 141814 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0499 0.116 0.233 PB L2
ENSG00000116205 TCEANC2 975425 sc-eQTL 8.06e-01 0.0348 0.142 0.233 PB L2
ENSG00000116209 TMEM59 975505 sc-eQTL 1.77e-01 0.0798 0.0588 0.233 PB L2
ENSG00000116221 MRPL37 844968 sc-eQTL 1.29e-01 -0.163 0.107 0.233 PB L2
ENSG00000157216 SSBP3 615530 sc-eQTL 9.22e-01 0.0122 0.124 0.233 PB L2
ENSG00000162402 USP24 -186355 sc-eQTL 8.19e-01 0.0325 0.141 0.233 PB L2
ENSG00000215883 CYB5RL 828973 sc-eQTL 2.83e-01 -0.157 0.146 0.233 PB L2
ENSG00000243725 TTC4 313148 sc-eQTL 9.77e-01 0.00391 0.137 0.233 PB L2
ENSG00000006555 TTC22 227686 sc-eQTL 2.67e-01 -0.109 0.0982 0.239 Pro_T L2
ENSG00000116133 DHCR24 141814 sc-eQTL 4.43e-03 0.236 0.0821 0.239 Pro_T L2
ENSG00000116205 TCEANC2 975425 sc-eQTL 3.92e-01 0.0875 0.102 0.239 Pro_T L2
ENSG00000116209 TMEM59 975505 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0516 0.0708 0.239 Pro_T L2
ENSG00000116221 MRPL37 844968 sc-eQTL 1.73e-01 -0.0945 0.0691 0.239 Pro_T L2
ENSG00000157216 SSBP3 615530 sc-eQTL 7.27e-02 -0.139 0.0773 0.239 Pro_T L2
ENSG00000162402 USP24 -186355 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0221 0.095 0.239 Pro_T L2
ENSG00000215883 CYB5RL 828973 sc-eQTL 9.16e-01 -0.00989 0.0937 0.239 Pro_T L2
ENSG00000243725 TTC4 313148 sc-eQTL 5.04e-01 0.0697 0.104 0.239 Pro_T L2
ENSG00000006555 TTC22 227686 sc-eQTL 3.18e-01 0.0969 0.0968 0.237 Treg L2
ENSG00000116205 TCEANC2 975425 sc-eQTL 6.71e-01 0.0442 0.104 0.237 Treg L2
ENSG00000116209 TMEM59 975505 sc-eQTL 2.30e-01 -0.0987 0.0819 0.237 Treg L2
ENSG00000116221 MRPL37 844968 sc-eQTL 9.00e-01 0.0128 0.102 0.237 Treg L2
ENSG00000157216 SSBP3 615530 sc-eQTL 9.32e-01 0.00776 0.0907 0.237 Treg L2
ENSG00000162402 USP24 -186355 sc-eQTL 3.29e-01 0.0843 0.0862 0.237 Treg L2
ENSG00000243725 TTC4 313148 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0934 0.109 0.237 Treg L2
ENSG00000116133 DHCR24 141814 sc-eQTL 6.43e-01 0.0406 0.0874 0.244 cDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 975425 sc-eQTL 3.08e-01 -0.105 0.103 0.244 cDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 975505 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0756 0.0874 0.244 cDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 844968 sc-eQTL 7.08e-02 -0.202 0.111 0.244 cDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 615530 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00565 0.103 0.244 cDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 486752 sc-eQTL 9.87e-02 0.158 0.0954 0.244 cDC L2
ENSG00000162402 USP24 -186355 sc-eQTL 1.47e-01 0.156 0.107 0.244 cDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 828973 sc-eQTL 3.78e-02 -0.191 0.0914 0.244 cDC L2
ENSG00000243725 TTC4 313148 sc-eQTL 4.14e-01 0.0903 0.11 0.244 cDC L2
ENSG00000116133 DHCR24 141814 sc-eQTL 7.16e-02 -0.113 0.0626 0.237 cMono_IL1B L2
ENSG00000116205 TCEANC2 975425 sc-eQTL 1.04e-01 -0.142 0.0871 0.237 cMono_IL1B L2
ENSG00000116209 TMEM59 975505 sc-eQTL 4.14e-01 0.0434 0.0531 0.237 cMono_IL1B L2
ENSG00000116221 MRPL37 844968 sc-eQTL 9.37e-01 0.00745 0.0947 0.237 cMono_IL1B L2
ENSG00000157216 SSBP3 615530 sc-eQTL 8.56e-01 0.0176 0.0966 0.237 cMono_IL1B L2
ENSG00000162402 USP24 -186355 sc-eQTL 1.43e-01 -0.104 0.071 0.237 cMono_IL1B L2
ENSG00000243725 TTC4 313148 sc-eQTL 1.72e-01 0.149 0.109 0.237 cMono_IL1B L2
ENSG00000116133 DHCR24 141814 sc-eQTL 1.02e-01 0.0968 0.0589 0.237 cMono_S100A L2
ENSG00000116205 TCEANC2 975425 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0853 0.0903 0.237 cMono_S100A L2
ENSG00000116209 TMEM59 975505 sc-eQTL 2.81e-01 -0.0781 0.0722 0.237 cMono_S100A L2
ENSG00000116221 MRPL37 844968 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000854 0.105 0.237 cMono_S100A L2
ENSG00000157216 SSBP3 615530 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0587 0.109 0.237 cMono_S100A L2
ENSG00000162402 USP24 -186355 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0218 0.0879 0.237 cMono_S100A L2
ENSG00000243725 TTC4 313148 sc-eQTL 6.72e-01 0.0466 0.11 0.237 cMono_S100A L2
ENSG00000006555 TTC22 227686 sc-eQTL 8.14e-02 0.174 0.0991 0.227 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 141814 sc-eQTL 2.46e-01 0.129 0.111 0.227 gdT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 975425 sc-eQTL 3.27e-01 0.11 0.112 0.227 gdT L2
ENSG00000116209 TMEM59 975505 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0326 0.114 0.227 gdT L2
ENSG00000116221 MRPL37 844968 sc-eQTL 3.51e-01 0.122 0.13 0.227 gdT L2
ENSG00000157216 SSBP3 615530 sc-eQTL 5.58e-01 0.0469 0.0798 0.227 gdT L2
ENSG00000162402 USP24 -186355 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00499 0.107 0.227 gdT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 828973 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0449 0.111 0.227 gdT L2
ENSG00000243725 TTC4 313148 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0165 0.126 0.227 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 141814 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0224 0.0808 0.242 intMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 975425 sc-eQTL 1.96e-02 0.234 0.0994 0.242 intMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 975505 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0351 0.0739 0.242 intMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 844968 sc-eQTL 3.18e-01 0.113 0.113 0.242 intMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 615530 sc-eQTL 7.70e-01 0.0338 0.115 0.242 intMono L2
ENSG00000162402 USP24 -186355 sc-eQTL 9.40e-01 0.00781 0.103 0.242 intMono L2
ENSG00000243725 TTC4 313148 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0706 0.11 0.242 intMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 141814 sc-eQTL 7.93e-01 -0.021 0.0799 0.238 ncMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 975425 sc-eQTL 2.63e-01 -0.112 0.0996 0.238 ncMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 975505 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0156 0.0799 0.238 ncMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 844968 sc-eQTL 3.32e-02 0.219 0.102 0.238 ncMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 615530 sc-eQTL 2.19e-01 -0.138 0.112 0.238 ncMono L2
ENSG00000162402 USP24 -186355 sc-eQTL 4.81e-01 0.0636 0.09 0.238 ncMono L2
ENSG00000243725 TTC4 313148 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0153 0.107 0.238 ncMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 141814 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0158 0.0927 0.249 pDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 975425 sc-eQTL 1.68e-02 -0.264 0.109 0.249 pDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 975505 sc-eQTL 1.13e-01 0.141 0.0881 0.249 pDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 844968 sc-eQTL 2.83e-01 0.127 0.118 0.249 pDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 615530 sc-eQTL 5.85e-01 0.0573 0.105 0.249 pDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 486752 sc-eQTL 4.24e-01 0.0352 0.044 0.249 pDC L2
ENSG00000162402 USP24 -186355 sc-eQTL 1.12e-01 0.118 0.0738 0.249 pDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 828973 sc-eQTL 7.06e-01 0.0384 0.102 0.249 pDC L2
ENSG00000243725 TTC4 313148 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0361 0.117 0.249 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 227686 sc-eQTL 9.92e-01 0.00107 0.103 0.237 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 141814 sc-eQTL 6.25e-01 0.0504 0.103 0.237 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 975425 sc-eQTL 2.55e-01 0.113 0.0992 0.237 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 975505 sc-eQTL 3.82e-01 0.0676 0.0773 0.237 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 844968 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0106 0.0927 0.237 B_Memory LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 615530 sc-eQTL 7.39e-01 0.0268 0.0806 0.237 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -186355 sc-eQTL 5.52e-01 0.0437 0.0735 0.237 B_Memory LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 828973 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0619 0.113 0.237 B_Memory LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 313148 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0744 0.101 0.237 B_Memory LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 227686 sc-eQTL 1.16e-01 0.167 0.106 0.237 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 141814 sc-eQTL 2.63e-01 0.107 0.0954 0.237 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 975425 sc-eQTL 8.50e-01 0.0164 0.0865 0.237 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 975505 sc-eQTL 2.25e-01 -0.0745 0.0612 0.237 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 844968 sc-eQTL 9.82e-01 0.00198 0.0884 0.237 B_Naive LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 615530 sc-eQTL 3.97e-01 0.067 0.0789 0.237 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -186355 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0301 0.0678 0.237 B_Naive LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 828973 sc-eQTL 2.15e-01 -0.133 0.107 0.237 B_Naive LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 313148 sc-eQTL 7.30e-01 0.0349 0.101 0.237 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 141814 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0376 0.061 0.237 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 975425 sc-eQTL 2.68e-02 -0.168 0.0756 0.237 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 975505 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00178 0.0527 0.237 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 844968 sc-eQTL 7.45e-01 0.0304 0.0933 0.237 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 615530 sc-eQTL 9.19e-01 -0.00997 0.0977 0.237 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -186355 sc-eQTL 2.37e-01 -0.079 0.0666 0.237 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 313148 sc-eQTL 1.50e-01 0.159 0.11 0.237 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 141814 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0186 0.0765 0.235 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 975425 sc-eQTL 9.19e-01 0.0103 0.101 0.235 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 975505 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00251 0.0748 0.235 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 844968 sc-eQTL 3.71e-02 0.213 0.101 0.235 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 615530 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0609 0.109 0.235 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -186355 sc-eQTL 3.92e-01 0.0738 0.086 0.235 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 313148 sc-eQTL 6.64e-01 -0.047 0.108 0.235 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 227686 sc-eQTL 3.53e-01 -0.0822 0.0883 0.237 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 141814 sc-eQTL 1.74e-01 0.126 0.092 0.237 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 975425 sc-eQTL 3.70e-01 0.0813 0.0904 0.237 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 975505 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0148 0.0701 0.237 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 844968 sc-eQTL 3.23e-01 0.0928 0.0937 0.237 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 615530 sc-eQTL 3.06e-01 0.0789 0.0768 0.237 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162398 LEXM 222946 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0419 0.0868 0.237 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -186355 sc-eQTL 2.14e-01 0.0684 0.0549 0.237 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 313148 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0097 0.098 0.237 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000116133 \N 141814 3.31e-06 3.29e-06 5.33e-07 1.94e-06 6.12e-07 8.17e-07 2.47e-06 6.3e-07 2.29e-06 1.21e-06 2.9e-06 1.4e-06 4.79e-06 1.41e-06 9.33e-07 1.74e-06 1.58e-06 2.15e-06 1.48e-06 1.31e-06 1.38e-06 3.14e-06 2.69e-06 1.17e-06 4.06e-06 1.13e-06 1.42e-06 1.77e-06 2.66e-06 3.08e-06 2.05e-06 3.26e-07 5.81e-07 1.27e-06 1.45e-06 9.72e-07 8.57e-07 4.65e-07 1.22e-06 3.46e-07 1.96e-07 3.93e-06 6.51e-07 1.68e-07 3.51e-07 3.34e-07 7.4e-07 2.22e-07 1.55e-07
ENSG00000162402 \N -186355 1.61e-06 2.2e-06 2.99e-07 1.43e-06 4.72e-07 6.38e-07 1.27e-06 4.39e-07 1.73e-06 7.04e-07 1.91e-06 1.13e-06 2.86e-06 7.13e-07 3.66e-07 1.01e-06 1.07e-06 1.27e-06 5.23e-07 5.06e-07 6.18e-07 1.95e-06 1.54e-06 7.64e-07 2.51e-06 8.38e-07 1.05e-06 9.59e-07 1.68e-06 1.63e-06 7.39e-07 2.31e-07 3.71e-07 6.66e-07 7.4e-07 6.12e-07 7.3e-07 3.94e-07 7.16e-07 2.18e-07 3.58e-07 2.62e-06 4.1e-07 1.99e-07 3.89e-07 2.03e-07 2.59e-07 1.97e-07 2.87e-07