logo

Genes within 1Mb (chr1:55028366:A:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 227043 sc-eQTL 3.44e-01 0.0943 0.0993 0.239 B L1
ENSG00000116133 DHCR24 141171 sc-eQTL 6.82e-01 0.0386 0.0941 0.239 B L1
ENSG00000116205 TCEANC2 974782 sc-eQTL 3.62e-01 0.074 0.0811 0.239 B L1
ENSG00000116209 TMEM59 974862 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00237 0.0495 0.239 B L1
ENSG00000116221 MRPL37 844325 sc-eQTL 8.20e-01 0.0148 0.0647 0.239 B L1
ENSG00000157216 SSBP3 614887 sc-eQTL 3.61e-01 0.0619 0.0677 0.239 B L1
ENSG00000162402 USP24 -186998 sc-eQTL 4.26e-01 0.0457 0.0574 0.239 B L1
ENSG00000215883 CYB5RL 828330 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0238 0.111 0.239 B L1
ENSG00000243725 TTC4 312505 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0555 0.0962 0.239 B L1
ENSG00000006555 TTC22 227043 sc-eQTL 9.61e-01 0.00383 0.0783 0.239 CD4T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 974782 sc-eQTL 4.68e-01 0.0465 0.0639 0.239 CD4T L1
ENSG00000116209 TMEM59 974862 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0314 0.0596 0.239 CD4T L1
ENSG00000116221 MRPL37 844325 sc-eQTL 6.51e-01 0.0373 0.0824 0.239 CD4T L1
ENSG00000157216 SSBP3 614887 sc-eQTL 3.03e-02 0.148 0.0677 0.239 CD4T L1
ENSG00000162402 USP24 -186998 sc-eQTL 5.49e-01 0.0335 0.0557 0.239 CD4T L1
ENSG00000243725 TTC4 312505 sc-eQTL 2.56e-01 -0.0953 0.0837 0.239 CD4T L1
ENSG00000006555 TTC22 227043 sc-eQTL 1.86e-01 -0.089 0.0671 0.239 CD8T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 974782 sc-eQTL 2.50e-01 0.0966 0.0837 0.239 CD8T L1
ENSG00000116209 TMEM59 974862 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0374 0.0582 0.239 CD8T L1
ENSG00000116221 MRPL37 844325 sc-eQTL 2.79e-01 0.0869 0.08 0.239 CD8T L1
ENSG00000157216 SSBP3 614887 sc-eQTL 2.90e-01 0.061 0.0575 0.239 CD8T L1
ENSG00000162402 USP24 -186998 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0216 0.0557 0.239 CD8T L1
ENSG00000243725 TTC4 312505 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0859 0.0965 0.239 CD8T L1
ENSG00000116133 DHCR24 141171 sc-eQTL 8.57e-01 0.0163 0.0903 0.241 DC L1
ENSG00000116205 TCEANC2 974782 sc-eQTL 8.67e-02 -0.173 0.1 0.241 DC L1
ENSG00000116209 TMEM59 974862 sc-eQTL 4.80e-01 0.0562 0.0794 0.241 DC L1
ENSG00000116221 MRPL37 844325 sc-eQTL 2.65e-01 -0.119 0.106 0.241 DC L1
ENSG00000157216 SSBP3 614887 sc-eQTL 6.28e-01 0.0461 0.0952 0.241 DC L1
ENSG00000162390 ACOT11 486109 sc-eQTL 1.54e-01 0.131 0.0911 0.241 DC L1
ENSG00000162402 USP24 -186998 sc-eQTL 3.23e-03 0.161 0.0541 0.241 DC L1
ENSG00000215883 CYB5RL 828330 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0878 0.0997 0.241 DC L1
ENSG00000243725 TTC4 312505 sc-eQTL 6.21e-01 0.0532 0.107 0.241 DC L1
ENSG00000116133 DHCR24 141171 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0167 0.0652 0.239 Mono L1
ENSG00000116205 TCEANC2 974782 sc-eQTL 1.31e-01 -0.106 0.07 0.239 Mono L1
ENSG00000116209 TMEM59 974862 sc-eQTL 8.93e-01 -0.00701 0.0523 0.239 Mono L1
ENSG00000116221 MRPL37 844325 sc-eQTL 5.43e-01 0.0532 0.0874 0.239 Mono L1
ENSG00000157216 SSBP3 614887 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0202 0.1 0.239 Mono L1
ENSG00000162402 USP24 -186998 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0543 0.0596 0.239 Mono L1
ENSG00000243725 TTC4 312505 sc-eQTL 2.12e-01 0.131 0.105 0.239 Mono L1
ENSG00000006555 TTC22 227043 sc-eQTL 2.92e-01 -0.0954 0.0902 0.238 NK L1
ENSG00000116133 DHCR24 141171 sc-eQTL 6.82e-02 0.166 0.0906 0.238 NK L1
ENSG00000116205 TCEANC2 974782 sc-eQTL 4.76e-01 0.0643 0.09 0.238 NK L1
ENSG00000116209 TMEM59 974862 sc-eQTL 4.45e-01 -0.054 0.0705 0.238 NK L1
ENSG00000116221 MRPL37 844325 sc-eQTL 2.74e-01 0.0959 0.0875 0.238 NK L1
ENSG00000157216 SSBP3 614887 sc-eQTL 3.82e-01 0.0665 0.0759 0.238 NK L1
ENSG00000162398 LEXM 222303 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0536 0.0853 0.238 NK L1
ENSG00000162402 USP24 -186998 sc-eQTL 4.18e-01 0.042 0.0517 0.238 NK L1
ENSG00000243725 TTC4 312505 sc-eQTL 7.07e-01 0.0368 0.0979 0.238 NK L1
ENSG00000006555 TTC22 227043 sc-eQTL 7.69e-01 0.0234 0.0796 0.239 Other_T L1
ENSG00000116133 DHCR24 141171 sc-eQTL 4.35e-02 0.124 0.0612 0.239 Other_T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 974782 sc-eQTL 4.85e-01 0.0646 0.0923 0.239 Other_T L1
ENSG00000116209 TMEM59 974862 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0292 0.0634 0.239 Other_T L1
ENSG00000116221 MRPL37 844325 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0404 0.0593 0.239 Other_T L1
ENSG00000157216 SSBP3 614887 sc-eQTL 9.83e-01 0.00147 0.0687 0.239 Other_T L1
ENSG00000162402 USP24 -186998 sc-eQTL 7.91e-02 -0.128 0.0726 0.239 Other_T L1
ENSG00000215883 CYB5RL 828330 sc-eQTL 9.19e-01 0.0102 0.1 0.239 Other_T L1
ENSG00000243725 TTC4 312505 sc-eQTL 6.84e-01 0.0406 0.0996 0.239 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 227043 sc-eQTL 2.38e-01 -0.0979 0.0827 0.235 B_Activated L2
ENSG00000116133 DHCR24 141171 sc-eQTL 4.79e-01 0.069 0.0974 0.235 B_Activated L2
ENSG00000116205 TCEANC2 974782 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0766 0.104 0.235 B_Activated L2
ENSG00000116209 TMEM59 974862 sc-eQTL 3.40e-01 0.106 0.111 0.235 B_Activated L2
ENSG00000116221 MRPL37 844325 sc-eQTL 2.82e-01 -0.129 0.12 0.235 B_Activated L2
ENSG00000157216 SSBP3 614887 sc-eQTL 5.39e-01 0.0668 0.109 0.235 B_Activated L2
ENSG00000162402 USP24 -186998 sc-eQTL 1.16e-02 0.266 0.104 0.235 B_Activated L2
ENSG00000215883 CYB5RL 828330 sc-eQTL 3.40e-01 0.0893 0.0934 0.235 B_Activated L2
ENSG00000243725 TTC4 312505 sc-eQTL 8.92e-01 0.0138 0.102 0.235 B_Activated L2
ENSG00000006555 TTC22 227043 sc-eQTL 8.06e-01 0.0263 0.107 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000116133 DHCR24 141171 sc-eQTL 7.48e-01 0.0319 0.0992 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000116205 TCEANC2 974782 sc-eQTL 3.43e-02 0.208 0.0978 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000116209 TMEM59 974862 sc-eQTL 5.83e-01 0.0465 0.0845 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000116221 MRPL37 844325 sc-eQTL 5.48e-01 0.0599 0.0994 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000157216 SSBP3 614887 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00567 0.093 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000162402 USP24 -186998 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00415 0.0783 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000215883 CYB5RL 828330 sc-eQTL 9.95e-01 0.000737 0.111 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000243725 TTC4 312505 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0701 0.101 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000006555 TTC22 227043 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0185 0.101 0.241 B_Memory L2
ENSG00000116133 DHCR24 141171 sc-eQTL 9.18e-01 0.0104 0.101 0.241 B_Memory L2
ENSG00000116205 TCEANC2 974782 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0446 0.108 0.241 B_Memory L2
ENSG00000116209 TMEM59 974862 sc-eQTL 4.98e-01 0.0608 0.0896 0.241 B_Memory L2
ENSG00000116221 MRPL37 844325 sc-eQTL 8.54e-01 0.0168 0.0909 0.241 B_Memory L2
ENSG00000157216 SSBP3 614887 sc-eQTL 9.61e-01 0.00413 0.0848 0.241 B_Memory L2
ENSG00000162402 USP24 -186998 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0532 0.0829 0.241 B_Memory L2
ENSG00000215883 CYB5RL 828330 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0898 0.102 0.241 B_Memory L2
ENSG00000243725 TTC4 312505 sc-eQTL 3.98e-01 -0.09 0.106 0.241 B_Memory L2
ENSG00000006555 TTC22 227043 sc-eQTL 2.96e-01 0.11 0.105 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000116133 DHCR24 141171 sc-eQTL 5.19e-01 0.0638 0.0988 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 974782 sc-eQTL 6.27e-01 0.0429 0.0881 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000116209 TMEM59 974862 sc-eQTL 1.26e-01 -0.098 0.0637 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000116221 MRPL37 844325 sc-eQTL 7.38e-01 0.0316 0.0945 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000157216 SSBP3 614887 sc-eQTL 6.15e-01 0.0453 0.0899 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000162402 USP24 -186998 sc-eQTL 1.81e-01 -0.0948 0.0706 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 828330 sc-eQTL 9.46e-02 -0.178 0.106 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000243725 TTC4 312505 sc-eQTL 8.33e-01 0.0204 0.0965 0.239 B_Naive1 L2
ENSG00000006555 TTC22 227043 sc-eQTL 4.88e-01 0.0738 0.106 0.24 B_Naive2 L2
ENSG00000116133 DHCR24 141171 sc-eQTL 1.98e-01 0.119 0.0923 0.24 B_Naive2 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 974782 sc-eQTL 9.44e-01 0.00717 0.103 0.24 B_Naive2 L2
ENSG00000116209 TMEM59 974862 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0395 0.0846 0.24 B_Naive2 L2
ENSG00000116221 MRPL37 844325 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0204 0.0997 0.24 B_Naive2 L2
ENSG00000157216 SSBP3 614887 sc-eQTL 7.07e-01 0.037 0.0981 0.24 B_Naive2 L2
ENSG00000162402 USP24 -186998 sc-eQTL 1.99e-01 0.0998 0.0775 0.24 B_Naive2 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 828330 sc-eQTL 4.70e-01 0.0791 0.109 0.24 B_Naive2 L2
ENSG00000243725 TTC4 312505 sc-eQTL 7.95e-01 0.0296 0.114 0.24 B_Naive2 L2
ENSG00000006555 TTC22 227043 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0866 0.102 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 974782 sc-eQTL 1.10e-01 0.167 0.104 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 974862 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0853 0.0952 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 844325 sc-eQTL 6.79e-02 0.214 0.116 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 614887 sc-eQTL 4.88e-01 0.0501 0.0721 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -186998 sc-eQTL 8.83e-01 0.0146 0.0991 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 312505 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00622 0.111 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 227043 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000859 0.0913 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 974782 sc-eQTL 4.96e-01 0.0473 0.0694 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 974862 sc-eQTL 2.22e-01 -0.0825 0.0673 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 844325 sc-eQTL 5.02e-01 0.0585 0.087 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 614887 sc-eQTL 1.48e-01 0.1 0.0691 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -186998 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0163 0.06 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 312505 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0803 0.0912 0.239 CD4_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 227043 sc-eQTL 6.72e-01 0.0407 0.0961 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 974782 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0792 0.0933 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 974862 sc-eQTL 9.20e-01 -0.00708 0.0705 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 844325 sc-eQTL 2.62e-01 -0.0995 0.0884 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 614887 sc-eQTL 1.72e-02 0.206 0.0858 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -186998 sc-eQTL 3.23e-01 0.0713 0.0719 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 312505 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0155 0.104 0.239 CD4_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 227043 sc-eQTL 2.29e-01 -0.132 0.11 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 974782 sc-eQTL 9.87e-01 0.00175 0.104 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 974862 sc-eQTL 6.54e-01 0.0362 0.0807 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 844325 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0522 0.104 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 614887 sc-eQTL 1.42e-01 0.131 0.0887 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -186998 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0172 0.0811 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 312505 sc-eQTL 7.77e-01 0.0304 0.107 0.239 CD4_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 227043 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0747 0.0889 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 974782 sc-eQTL 1.78e-01 0.133 0.0982 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 974862 sc-eQTL 9.68e-01 0.00345 0.0858 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 844325 sc-eQTL 1.43e-01 0.149 0.101 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 614887 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0171 0.0695 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -186998 sc-eQTL 1.67e-01 0.0953 0.0688 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 312505 sc-eQTL 8.21e-03 -0.271 0.102 0.239 CD8_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 227043 sc-eQTL 2.20e-02 -0.226 0.0979 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 974782 sc-eQTL 7.70e-01 0.0263 0.0897 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 974862 sc-eQTL 2.31e-01 -0.105 0.0874 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 844325 sc-eQTL 3.83e-01 0.0919 0.105 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 614887 sc-eQTL 3.50e-01 0.0744 0.0794 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -186998 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00484 0.0724 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 312505 sc-eQTL 3.51e-01 0.0987 0.106 0.239 CD8_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 227043 sc-eQTL 2.24e-01 0.133 0.109 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 974782 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0148 0.11 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 974862 sc-eQTL 1.91e-01 0.126 0.0962 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 844325 sc-eQTL 7.79e-01 0.0308 0.11 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 614887 sc-eQTL 4.12e-01 0.0781 0.0949 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -186998 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0413 0.0921 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 312505 sc-eQTL 1.89e-01 0.147 0.112 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 227043 sc-eQTL 9.84e-01 0.00204 0.103 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 974782 sc-eQTL 1.65e-01 -0.15 0.107 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 974862 sc-eQTL 1.78e-01 -0.141 0.104 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 844325 sc-eQTL 2.06e-01 0.134 0.105 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 614887 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0549 0.1 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -186998 sc-eQTL 3.47e-01 -0.0991 0.105 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 312505 sc-eQTL 1.49e-01 -0.154 0.107 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 227043 sc-eQTL 8.57e-01 0.0172 0.0953 0.238 MAIT L2
ENSG00000116133 DHCR24 141171 sc-eQTL 6.81e-01 -0.029 0.0705 0.238 MAIT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 974782 sc-eQTL 6.71e-01 0.0422 0.0992 0.238 MAIT L2
ENSG00000116209 TMEM59 974862 sc-eQTL 4.72e-01 0.0645 0.0896 0.238 MAIT L2
ENSG00000116221 MRPL37 844325 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0136 0.109 0.238 MAIT L2
ENSG00000157216 SSBP3 614887 sc-eQTL 5.85e-01 0.0528 0.0965 0.238 MAIT L2
ENSG00000162402 USP24 -186998 sc-eQTL 5.05e-02 -0.167 0.085 0.238 MAIT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 828330 sc-eQTL 6.70e-01 0.0425 0.0997 0.238 MAIT L2
ENSG00000243725 TTC4 312505 sc-eQTL 4.82e-01 0.0698 0.099 0.238 MAIT L2
ENSG00000006555 TTC22 227043 sc-eQTL 8.55e-01 -0.02 0.109 0.236 NK_CD56bright L2
ENSG00000116133 DHCR24 141171 sc-eQTL 7.19e-02 0.174 0.0959 0.236 NK_CD56bright L2
ENSG00000116205 TCEANC2 974782 sc-eQTL 2.68e-01 -0.113 0.102 0.236 NK_CD56bright L2
ENSG00000116209 TMEM59 974862 sc-eQTL 3.94e-01 -0.085 0.0995 0.236 NK_CD56bright L2
ENSG00000116221 MRPL37 844325 sc-eQTL 3.19e-01 0.111 0.111 0.236 NK_CD56bright L2
ENSG00000157216 SSBP3 614887 sc-eQTL 8.34e-01 0.0176 0.0839 0.236 NK_CD56bright L2
ENSG00000162398 LEXM 222303 sc-eQTL 3.15e-01 0.0995 0.0988 0.236 NK_CD56bright L2
ENSG00000162402 USP24 -186998 sc-eQTL 2.42e-01 -0.0998 0.085 0.236 NK_CD56bright L2
ENSG00000243725 TTC4 312505 sc-eQTL 6.03e-01 0.0561 0.107 0.236 NK_CD56bright L2
ENSG00000006555 TTC22 227043 sc-eQTL 2.06e-01 -0.115 0.0909 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000116133 DHCR24 141171 sc-eQTL 3.51e-01 0.0888 0.095 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000116205 TCEANC2 974782 sc-eQTL 4.39e-01 0.0799 0.103 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000116209 TMEM59 974862 sc-eQTL 6.04e-01 0.0397 0.0764 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000116221 MRPL37 844325 sc-eQTL 2.50e-01 0.114 0.0991 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000157216 SSBP3 614887 sc-eQTL 3.66e-01 0.0736 0.0813 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000162398 LEXM 222303 sc-eQTL 2.26e-01 -0.113 0.0933 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000162402 USP24 -186998 sc-eQTL 4.29e-01 0.047 0.0594 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000243725 TTC4 312505 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0936 0.102 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000006555 TTC22 227043 sc-eQTL 2.08e-01 -0.143 0.113 0.242 NK_HLA L2
ENSG00000116133 DHCR24 141171 sc-eQTL 2.92e-01 0.116 0.11 0.242 NK_HLA L2
ENSG00000116205 TCEANC2 974782 sc-eQTL 5.15e-01 0.0695 0.106 0.242 NK_HLA L2
ENSG00000116209 TMEM59 974862 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0549 0.106 0.242 NK_HLA L2
ENSG00000116221 MRPL37 844325 sc-eQTL 3.68e-01 0.105 0.116 0.242 NK_HLA L2
ENSG00000157216 SSBP3 614887 sc-eQTL 5.36e-01 0.0589 0.095 0.242 NK_HLA L2
ENSG00000162398 LEXM 222303 sc-eQTL 8.53e-01 0.0199 0.107 0.242 NK_HLA L2
ENSG00000162402 USP24 -186998 sc-eQTL 1.12e-01 0.125 0.0782 0.242 NK_HLA L2
ENSG00000243725 TTC4 312505 sc-eQTL 6.06e-01 0.0607 0.118 0.242 NK_HLA L2
ENSG00000006555 TTC22 227043 sc-eQTL 7.53e-01 0.0308 0.098 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000116133 DHCR24 141171 sc-eQTL 2.24e-01 0.12 0.0988 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000116205 TCEANC2 974782 sc-eQTL 3.45e-01 0.0929 0.0982 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000116209 TMEM59 974862 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0613 0.0799 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000116221 MRPL37 844325 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00654 0.0985 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000157216 SSBP3 614887 sc-eQTL 1.79e-01 0.111 0.0823 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000162398 LEXM 222303 sc-eQTL 8.56e-01 0.0187 0.103 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000162402 USP24 -186998 sc-eQTL 8.51e-01 0.0133 0.0704 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000243725 TTC4 312505 sc-eQTL 4.30e-01 0.0824 0.104 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000006555 TTC22 227043 sc-eQTL 9.22e-01 0.013 0.131 0.233 PB L2
ENSG00000116133 DHCR24 141171 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0499 0.116 0.233 PB L2
ENSG00000116205 TCEANC2 974782 sc-eQTL 8.06e-01 0.0348 0.142 0.233 PB L2
ENSG00000116209 TMEM59 974862 sc-eQTL 1.77e-01 0.0798 0.0588 0.233 PB L2
ENSG00000116221 MRPL37 844325 sc-eQTL 1.29e-01 -0.163 0.107 0.233 PB L2
ENSG00000157216 SSBP3 614887 sc-eQTL 9.22e-01 0.0122 0.124 0.233 PB L2
ENSG00000162402 USP24 -186998 sc-eQTL 8.19e-01 0.0325 0.141 0.233 PB L2
ENSG00000215883 CYB5RL 828330 sc-eQTL 2.83e-01 -0.157 0.146 0.233 PB L2
ENSG00000243725 TTC4 312505 sc-eQTL 9.77e-01 0.00391 0.137 0.233 PB L2
ENSG00000006555 TTC22 227043 sc-eQTL 2.66e-01 -0.11 0.0982 0.241 Pro_T L2
ENSG00000116133 DHCR24 141171 sc-eQTL 4.95e-03 0.233 0.0821 0.241 Pro_T L2
ENSG00000116205 TCEANC2 974782 sc-eQTL 3.82e-01 0.0893 0.102 0.241 Pro_T L2
ENSG00000116209 TMEM59 974862 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0538 0.0708 0.241 Pro_T L2
ENSG00000116221 MRPL37 844325 sc-eQTL 1.68e-01 -0.0956 0.0691 0.241 Pro_T L2
ENSG00000157216 SSBP3 614887 sc-eQTL 8.03e-02 -0.136 0.0773 0.241 Pro_T L2
ENSG00000162402 USP24 -186998 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0224 0.095 0.241 Pro_T L2
ENSG00000215883 CYB5RL 828330 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0185 0.0937 0.241 Pro_T L2
ENSG00000243725 TTC4 312505 sc-eQTL 5.14e-01 0.068 0.104 0.241 Pro_T L2
ENSG00000006555 TTC22 227043 sc-eQTL 3.79e-01 0.0854 0.0969 0.239 Treg L2
ENSG00000116205 TCEANC2 974782 sc-eQTL 7.37e-01 0.035 0.104 0.239 Treg L2
ENSG00000116209 TMEM59 974862 sc-eQTL 1.95e-01 -0.106 0.0819 0.239 Treg L2
ENSG00000116221 MRPL37 844325 sc-eQTL 7.81e-01 0.0283 0.102 0.239 Treg L2
ENSG00000157216 SSBP3 614887 sc-eQTL 9.28e-01 0.00822 0.0907 0.239 Treg L2
ENSG00000162402 USP24 -186998 sc-eQTL 4.14e-01 0.0706 0.0863 0.239 Treg L2
ENSG00000243725 TTC4 312505 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0717 0.109 0.239 Treg L2
ENSG00000116133 DHCR24 141171 sc-eQTL 5.83e-01 0.048 0.0874 0.246 cDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 974782 sc-eQTL 3.18e-01 -0.103 0.103 0.246 cDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 974862 sc-eQTL 3.50e-01 -0.082 0.0875 0.246 cDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 844325 sc-eQTL 5.40e-02 -0.215 0.111 0.246 cDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 614887 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00853 0.103 0.246 cDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 486109 sc-eQTL 1.06e-01 0.155 0.0955 0.246 cDC L2
ENSG00000162402 USP24 -186998 sc-eQTL 1.45e-01 0.157 0.107 0.246 cDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 828330 sc-eQTL 4.08e-02 -0.189 0.0916 0.246 cDC L2
ENSG00000243725 TTC4 312505 sc-eQTL 4.44e-01 0.0848 0.11 0.246 cDC L2
ENSG00000116133 DHCR24 141171 sc-eQTL 5.95e-02 -0.119 0.0626 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000116205 TCEANC2 974782 sc-eQTL 1.16e-01 -0.138 0.0872 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000116209 TMEM59 974862 sc-eQTL 3.63e-01 0.0485 0.0531 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000116221 MRPL37 844325 sc-eQTL 9.79e-01 0.00244 0.0948 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000157216 SSBP3 614887 sc-eQTL 9.32e-01 0.00822 0.0968 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000162402 USP24 -186998 sc-eQTL 1.52e-01 -0.102 0.0711 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000243725 TTC4 312505 sc-eQTL 1.53e-01 0.156 0.109 0.239 cMono_IL1B L2
ENSG00000116133 DHCR24 141171 sc-eQTL 1.08e-01 0.0953 0.059 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000116205 TCEANC2 974782 sc-eQTL 3.26e-01 -0.0889 0.0904 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000116209 TMEM59 974862 sc-eQTL 3.07e-01 -0.0741 0.0723 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000116221 MRPL37 844325 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0113 0.105 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000157216 SSBP3 614887 sc-eQTL 5.26e-01 -0.069 0.109 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000162402 USP24 -186998 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0207 0.088 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000243725 TTC4 312505 sc-eQTL 6.75e-01 0.0463 0.11 0.239 cMono_S100A L2
ENSG00000006555 TTC22 227043 sc-eQTL 8.93e-02 0.17 0.0993 0.23 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 141171 sc-eQTL 3.10e-01 0.113 0.111 0.23 gdT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 974782 sc-eQTL 3.73e-01 0.1 0.112 0.23 gdT L2
ENSG00000116209 TMEM59 974862 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0445 0.114 0.23 gdT L2
ENSG00000116221 MRPL37 844325 sc-eQTL 3.86e-01 0.113 0.13 0.23 gdT L2
ENSG00000157216 SSBP3 614887 sc-eQTL 5.58e-01 0.0469 0.0798 0.23 gdT L2
ENSG00000162402 USP24 -186998 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0159 0.107 0.23 gdT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 828330 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0332 0.112 0.23 gdT L2
ENSG00000243725 TTC4 312505 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0173 0.126 0.23 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 141171 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0275 0.0809 0.244 intMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 974782 sc-eQTL 2.78e-02 0.221 0.0996 0.244 intMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 974862 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0323 0.074 0.244 intMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 844325 sc-eQTL 3.30e-01 0.11 0.113 0.244 intMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 614887 sc-eQTL 7.87e-01 0.0313 0.116 0.244 intMono L2
ENSG00000162402 USP24 -186998 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00644 0.103 0.244 intMono L2
ENSG00000243725 TTC4 312505 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0653 0.11 0.244 intMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 141171 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0282 0.08 0.24 ncMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 974782 sc-eQTL 2.52e-01 -0.115 0.0998 0.24 ncMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 974862 sc-eQTL 9.20e-01 -0.00805 0.0801 0.24 ncMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 844325 sc-eQTL 3.19e-02 0.221 0.102 0.24 ncMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 614887 sc-eQTL 1.86e-01 -0.149 0.112 0.24 ncMono L2
ENSG00000162402 USP24 -186998 sc-eQTL 4.51e-01 0.0682 0.0902 0.24 ncMono L2
ENSG00000243725 TTC4 312505 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0175 0.107 0.24 ncMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 141171 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0206 0.093 0.251 pDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 974782 sc-eQTL 1.63e-02 -0.266 0.109 0.251 pDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 974862 sc-eQTL 9.72e-02 0.147 0.0883 0.251 pDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 844325 sc-eQTL 2.86e-01 0.126 0.118 0.251 pDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 614887 sc-eQTL 5.69e-01 0.0599 0.105 0.251 pDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 486109 sc-eQTL 4.46e-01 0.0337 0.0441 0.251 pDC L2
ENSG00000162402 USP24 -186998 sc-eQTL 1.67e-01 0.103 0.0742 0.251 pDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 828330 sc-eQTL 6.27e-01 0.0496 0.102 0.251 pDC L2
ENSG00000243725 TTC4 312505 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0429 0.118 0.251 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 227043 sc-eQTL 9.95e-01 0.000589 0.103 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 141171 sc-eQTL 5.95e-01 0.0547 0.103 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 974782 sc-eQTL 2.24e-01 0.121 0.0991 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 974862 sc-eQTL 4.17e-01 0.0629 0.0772 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 844325 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0128 0.0926 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 614887 sc-eQTL 6.43e-01 0.0374 0.0805 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -186998 sc-eQTL 5.17e-01 0.0477 0.0734 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 828330 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0641 0.113 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 312505 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0869 0.101 0.239 B_Memory LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 227043 sc-eQTL 1.34e-01 0.159 0.106 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 141171 sc-eQTL 3.34e-01 0.0926 0.0957 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 974782 sc-eQTL 7.90e-01 0.0231 0.0866 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 974862 sc-eQTL 1.83e-01 -0.0818 0.0613 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 844325 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00633 0.0885 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 614887 sc-eQTL 2.80e-01 0.0855 0.0789 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -186998 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0223 0.0679 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 828330 sc-eQTL 3.25e-01 -0.106 0.107 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 312505 sc-eQTL 8.82e-01 0.015 0.101 0.239 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 141171 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0436 0.0611 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 974782 sc-eQTL 2.80e-02 -0.167 0.0757 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 974862 sc-eQTL 9.41e-01 0.00393 0.0528 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 844325 sc-eQTL 7.96e-01 0.0242 0.0935 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 614887 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0181 0.0979 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -186998 sc-eQTL 2.38e-01 -0.0789 0.0667 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 312505 sc-eQTL 1.35e-01 0.166 0.11 0.239 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 141171 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0257 0.0766 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 974782 sc-eQTL 9.81e-01 0.00245 0.101 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 974862 sc-eQTL 9.59e-01 0.00381 0.0749 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 844325 sc-eQTL 3.39e-02 0.217 0.102 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 614887 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0659 0.109 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -186998 sc-eQTL 3.89e-01 0.0743 0.0861 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 312505 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0428 0.108 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 227043 sc-eQTL 3.16e-01 -0.089 0.0884 0.239 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 141171 sc-eQTL 1.80e-01 0.124 0.0922 0.239 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 974782 sc-eQTL 3.87e-01 0.0786 0.0906 0.239 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 974862 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0177 0.0702 0.239 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 844325 sc-eQTL 3.75e-01 0.0836 0.0939 0.239 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 614887 sc-eQTL 2.79e-01 0.0835 0.077 0.239 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162398 LEXM 222303 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0504 0.0869 0.239 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -186998 sc-eQTL 2.42e-01 0.0645 0.055 0.239 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 312505 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0117 0.0982 0.239 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000116133 \N 141171 7.7e-06 9.37e-06 1.3e-06 5.05e-06 1.93e-06 4.02e-06 9.57e-06 1.79e-06 7.93e-06 4.27e-06 1.06e-05 4.99e-06 1.21e-05 3.96e-06 1.83e-06 6.06e-06 3.75e-06 5.05e-06 2.23e-06 2.68e-06 4.52e-06 7.74e-06 6.91e-06 2.78e-06 1.11e-05 2.57e-06 4.54e-06 3.24e-06 7.04e-06 7.84e-06 4.51e-06 9.52e-07 8.97e-07 2.63e-06 3.62e-06 2.04e-06 1.55e-06 1.68e-06 1.46e-06 9.95e-07 7.78e-07 9.84e-06 1.38e-06 1.58e-07 6.86e-07 1.2e-06 9.55e-07 7.59e-07 5.43e-07
ENSG00000162402 \N -186998 4.9e-06 5.69e-06 6.25e-07 3.39e-06 1.62e-06 1.55e-06 6.29e-06 1.18e-06 4.86e-06 2.91e-06 6.44e-06 2.97e-06 7.82e-06 1.71e-06 1.11e-06 4.09e-06 2.72e-06 3.85e-06 1.55e-06 1.4e-06 2.84e-06 4.83e-06 4.6e-06 1.65e-06 7.14e-06 2.01e-06 2.22e-06 1.55e-06 4.46e-06 4.29e-06 2.62e-06 5.11e-07 5.2e-07 1.44e-06 2.06e-06 1.16e-06 9.95e-07 5e-07 9.5e-07 7.17e-07 4.41e-07 5.98e-06 8.3e-07 1.81e-07 6.07e-07 1.19e-06 1.11e-06 7.05e-07 4.83e-07