logo

Genes within 1Mb (chr1:55028344:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 227021 sc-eQTL 1.37e-02 -0.405 0.163 0.06 B L1
ENSG00000116133 DHCR24 141149 sc-eQTL 7.84e-02 -0.274 0.155 0.06 B L1
ENSG00000116205 TCEANC2 974760 sc-eQTL 2.88e-01 0.143 0.134 0.06 B L1
ENSG00000116209 TMEM59 974840 sc-eQTL 2.56e-01 -0.0933 0.0818 0.06 B L1
ENSG00000116221 MRPL37 844303 sc-eQTL 1.77e-01 0.145 0.107 0.06 B L1
ENSG00000157216 SSBP3 614865 sc-eQTL 1.33e-02 -0.277 0.111 0.06 B L1
ENSG00000162402 USP24 -187020 sc-eQTL 1.34e-01 -0.143 0.0948 0.06 B L1
ENSG00000215883 CYB5RL 828308 sc-eQTL 5.28e-01 0.116 0.183 0.06 B L1
ENSG00000243725 TTC4 312483 sc-eQTL 8.56e-01 0.029 0.16 0.06 B L1
ENSG00000006555 TTC22 227021 sc-eQTL 2.86e-01 -0.139 0.13 0.06 CD4T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 974760 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0566 0.106 0.06 CD4T L1
ENSG00000116209 TMEM59 974840 sc-eQTL 6.85e-01 0.0403 0.0992 0.06 CD4T L1
ENSG00000116221 MRPL37 844303 sc-eQTL 5.26e-01 -0.087 0.137 0.06 CD4T L1
ENSG00000157216 SSBP3 614865 sc-eQTL 2.52e-01 0.13 0.114 0.06 CD4T L1
ENSG00000162402 USP24 -187020 sc-eQTL 8.98e-01 0.0119 0.0928 0.06 CD4T L1
ENSG00000243725 TTC4 312483 sc-eQTL 9.31e-01 0.012 0.14 0.06 CD4T L1
ENSG00000006555 TTC22 227021 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0536 0.111 0.06 CD8T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 974760 sc-eQTL 4.24e-01 -0.111 0.138 0.06 CD8T L1
ENSG00000116209 TMEM59 974840 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0286 0.0962 0.06 CD8T L1
ENSG00000116221 MRPL37 844303 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0172 0.132 0.06 CD8T L1
ENSG00000157216 SSBP3 614865 sc-eQTL 6.44e-01 -0.044 0.0951 0.06 CD8T L1
ENSG00000162402 USP24 -187020 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0667 0.0919 0.06 CD8T L1
ENSG00000243725 TTC4 312483 sc-eQTL 9.71e-01 0.00586 0.16 0.06 CD8T L1
ENSG00000116133 DHCR24 141149 sc-eQTL 8.10e-01 0.039 0.162 0.059 DC L1
ENSG00000116205 TCEANC2 974760 sc-eQTL 7.40e-01 0.0604 0.182 0.059 DC L1
ENSG00000116209 TMEM59 974840 sc-eQTL 1.83e-01 0.19 0.142 0.059 DC L1
ENSG00000116221 MRPL37 844303 sc-eQTL 9.43e-01 0.0137 0.192 0.059 DC L1
ENSG00000157216 SSBP3 614865 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0916 0.171 0.059 DC L1
ENSG00000162390 ACOT11 486087 sc-eQTL 6.48e-01 0.0752 0.164 0.059 DC L1
ENSG00000162402 USP24 -187020 sc-eQTL 1.87e-01 0.131 0.0988 0.059 DC L1
ENSG00000215883 CYB5RL 828308 sc-eQTL 3.65e-01 0.163 0.179 0.059 DC L1
ENSG00000243725 TTC4 312483 sc-eQTL 6.92e-02 0.35 0.191 0.059 DC L1
ENSG00000116133 DHCR24 141149 sc-eQTL 4.43e-01 0.0846 0.11 0.06 Mono L1
ENSG00000116205 TCEANC2 974760 sc-eQTL 4.96e-01 0.081 0.119 0.06 Mono L1
ENSG00000116209 TMEM59 974840 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00812 0.0883 0.06 Mono L1
ENSG00000116221 MRPL37 844303 sc-eQTL 3.62e-01 0.135 0.147 0.06 Mono L1
ENSG00000157216 SSBP3 614865 sc-eQTL 9.27e-01 0.0156 0.169 0.06 Mono L1
ENSG00000162402 USP24 -187020 sc-eQTL 1.48e-01 -0.146 0.1 0.06 Mono L1
ENSG00000243725 TTC4 312483 sc-eQTL 8.92e-01 0.0242 0.177 0.06 Mono L1
ENSG00000006555 TTC22 227021 sc-eQTL 3.48e-01 0.14 0.149 0.06 NK L1
ENSG00000116133 DHCR24 141149 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0558 0.151 0.06 NK L1
ENSG00000116205 TCEANC2 974760 sc-eQTL 5.13e-02 -0.289 0.147 0.06 NK L1
ENSG00000116209 TMEM59 974840 sc-eQTL 2.74e-01 0.127 0.116 0.06 NK L1
ENSG00000116221 MRPL37 844303 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0393 0.145 0.06 NK L1
ENSG00000157216 SSBP3 614865 sc-eQTL 6.24e-01 0.0616 0.126 0.06 NK L1
ENSG00000162398 LEXM 222281 sc-eQTL 5.03e-01 0.0945 0.141 0.06 NK L1
ENSG00000162402 USP24 -187020 sc-eQTL 1.66e-01 -0.118 0.0851 0.06 NK L1
ENSG00000243725 TTC4 312483 sc-eQTL 4.52e-01 -0.122 0.161 0.06 NK L1
ENSG00000006555 TTC22 227021 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0486 0.132 0.06 Other_T L1
ENSG00000116133 DHCR24 141149 sc-eQTL 6.43e-01 0.0475 0.102 0.06 Other_T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 974760 sc-eQTL 4.36e-01 -0.119 0.153 0.06 Other_T L1
ENSG00000116209 TMEM59 974840 sc-eQTL 8.64e-01 -0.018 0.105 0.06 Other_T L1
ENSG00000116221 MRPL37 844303 sc-eQTL 7.25e-02 0.176 0.0977 0.06 Other_T L1
ENSG00000157216 SSBP3 614865 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000622 0.114 0.06 Other_T L1
ENSG00000162402 USP24 -187020 sc-eQTL 5.12e-02 0.236 0.12 0.06 Other_T L1
ENSG00000215883 CYB5RL 828308 sc-eQTL 1.18e-01 0.259 0.165 0.06 Other_T L1
ENSG00000243725 TTC4 312483 sc-eQTL 9.52e-02 -0.275 0.164 0.06 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 227021 sc-eQTL 7.27e-01 0.0501 0.143 0.054 B_Activated L2
ENSG00000116133 DHCR24 141149 sc-eQTL 4.49e-01 -0.127 0.168 0.054 B_Activated L2
ENSG00000116205 TCEANC2 974760 sc-eQTL 7.00e-01 0.0696 0.18 0.054 B_Activated L2
ENSG00000116209 TMEM59 974840 sc-eQTL 1.64e-01 -0.267 0.191 0.054 B_Activated L2
ENSG00000116221 MRPL37 844303 sc-eQTL 9.51e-01 -0.0128 0.207 0.054 B_Activated L2
ENSG00000157216 SSBP3 614865 sc-eQTL 4.60e-01 -0.139 0.187 0.054 B_Activated L2
ENSG00000162402 USP24 -187020 sc-eQTL 3.25e-01 -0.18 0.183 0.054 B_Activated L2
ENSG00000215883 CYB5RL 828308 sc-eQTL 3.97e-01 -0.137 0.161 0.054 B_Activated L2
ENSG00000243725 TTC4 312483 sc-eQTL 1.42e-01 0.257 0.174 0.054 B_Activated L2
ENSG00000006555 TTC22 227021 sc-eQTL 4.27e-01 -0.141 0.177 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000116133 DHCR24 141149 sc-eQTL 9.70e-01 0.00613 0.165 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000116205 TCEANC2 974760 sc-eQTL 3.60e-01 -0.15 0.164 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000116209 TMEM59 974840 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0597 0.14 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000116221 MRPL37 844303 sc-eQTL 2.46e-01 0.192 0.165 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000157216 SSBP3 614865 sc-eQTL 1.03e-01 -0.251 0.153 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000162402 USP24 -187020 sc-eQTL 1.07e-01 -0.209 0.129 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000215883 CYB5RL 828308 sc-eQTL 4.96e-01 0.126 0.184 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000243725 TTC4 312483 sc-eQTL 5.96e-01 -0.089 0.167 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000006555 TTC22 227021 sc-eQTL 1.20e-01 -0.271 0.174 0.06 B_Memory L2
ENSG00000116133 DHCR24 141149 sc-eQTL 1.56e-02 -0.417 0.171 0.06 B_Memory L2
ENSG00000116205 TCEANC2 974760 sc-eQTL 8.46e-02 0.319 0.184 0.06 B_Memory L2
ENSG00000116209 TMEM59 974840 sc-eQTL 2.32e-01 -0.184 0.154 0.06 B_Memory L2
ENSG00000116221 MRPL37 844303 sc-eQTL 1.86e-01 0.207 0.156 0.06 B_Memory L2
ENSG00000157216 SSBP3 614865 sc-eQTL 3.97e-01 -0.124 0.146 0.06 B_Memory L2
ENSG00000162402 USP24 -187020 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0572 0.143 0.06 B_Memory L2
ENSG00000215883 CYB5RL 828308 sc-eQTL 1.15e-01 -0.278 0.176 0.06 B_Memory L2
ENSG00000243725 TTC4 312483 sc-eQTL 8.20e-01 0.0418 0.183 0.06 B_Memory L2
ENSG00000006555 TTC22 227021 sc-eQTL 6.02e-02 -0.327 0.173 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000116133 DHCR24 141149 sc-eQTL 2.68e-01 -0.181 0.163 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 974760 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0301 0.146 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000116209 TMEM59 974840 sc-eQTL 6.81e-01 0.0437 0.106 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000116221 MRPL37 844303 sc-eQTL 7.35e-01 0.053 0.156 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000157216 SSBP3 614865 sc-eQTL 1.24e-01 -0.229 0.148 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000162402 USP24 -187020 sc-eQTL 6.25e-01 0.0574 0.117 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 828308 sc-eQTL 1.84e-01 0.235 0.176 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000243725 TTC4 312483 sc-eQTL 3.38e-01 0.153 0.159 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000006555 TTC22 227021 sc-eQTL 4.01e-01 -0.148 0.176 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000116133 DHCR24 141149 sc-eQTL 9.56e-02 -0.255 0.152 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 974760 sc-eQTL 3.33e-02 0.361 0.168 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000116209 TMEM59 974840 sc-eQTL 4.09e-02 0.285 0.139 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000116221 MRPL37 844303 sc-eQTL 2.99e-01 0.171 0.165 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000157216 SSBP3 614865 sc-eQTL 6.53e-01 -0.073 0.162 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000162402 USP24 -187020 sc-eQTL 2.49e-01 -0.148 0.128 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 828308 sc-eQTL 4.74e-01 -0.13 0.181 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000243725 TTC4 312483 sc-eQTL 5.66e-01 0.108 0.188 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000006555 TTC22 227021 sc-eQTL 4.60e-01 0.122 0.165 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 974760 sc-eQTL 2.50e-01 0.196 0.17 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 974840 sc-eQTL 1.23e-01 0.238 0.154 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 844303 sc-eQTL 8.25e-02 0.33 0.189 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 614865 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0675 0.117 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -187020 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0675 0.161 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 312483 sc-eQTL 3.77e-01 -0.159 0.18 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 227021 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0953 0.152 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 974760 sc-eQTL 2.95e-01 -0.121 0.116 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 974840 sc-eQTL 8.14e-01 0.0266 0.113 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 844303 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0781 0.145 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 614865 sc-eQTL 1.02e-02 0.296 0.114 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -187020 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0321 0.1 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 312483 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000945 0.153 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 227021 sc-eQTL 7.73e-01 0.0459 0.159 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 974760 sc-eQTL 3.61e-01 0.141 0.155 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 974840 sc-eQTL 9.35e-01 -0.0095 0.117 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 844303 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0745 0.147 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 614865 sc-eQTL 9.36e-01 0.0115 0.144 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -187020 sc-eQTL 3.38e-01 0.114 0.119 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 312483 sc-eQTL 1.59e-01 -0.242 0.171 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 227021 sc-eQTL 9.16e-01 0.0194 0.183 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 974760 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0323 0.174 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 974840 sc-eQTL 1.86e-01 0.178 0.134 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 844303 sc-eQTL 1.91e-01 0.226 0.172 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 614865 sc-eQTL 7.27e-01 0.0518 0.148 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -187020 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0882 0.135 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 312483 sc-eQTL 5.05e-01 0.119 0.178 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 227021 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0162 0.145 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 974760 sc-eQTL 3.28e-02 -0.342 0.159 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 974840 sc-eQTL 4.42e-01 -0.108 0.14 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 844303 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0261 0.166 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 614865 sc-eQTL 1.76e-01 -0.153 0.113 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -187020 sc-eQTL 3.43e-01 -0.107 0.113 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 312483 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0509 0.169 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 227021 sc-eQTL 1.08e-01 -0.259 0.161 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 974760 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0308 0.146 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 974840 sc-eQTL 9.34e-01 0.0118 0.143 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 844303 sc-eQTL 3.28e-01 0.168 0.171 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 614865 sc-eQTL 3.11e-02 0.279 0.128 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -187020 sc-eQTL 5.93e-01 0.0633 0.118 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 312483 sc-eQTL 9.82e-01 -0.0038 0.173 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 227021 sc-eQTL 9.97e-01 0.000784 0.18 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 974760 sc-eQTL 9.48e-01 0.0118 0.181 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 974840 sc-eQTL 3.43e-01 0.151 0.159 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 844303 sc-eQTL 6.46e-01 0.083 0.181 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 614865 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0485 0.157 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -187020 sc-eQTL 9.67e-01 0.00626 0.152 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 312483 sc-eQTL 1.78e-01 -0.249 0.184 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 227021 sc-eQTL 8.13e-01 0.0401 0.17 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 974760 sc-eQTL 5.52e-01 0.105 0.177 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 974840 sc-eQTL 4.24e-01 0.137 0.171 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 844303 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0447 0.173 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 614865 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00258 0.164 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -187020 sc-eQTL 6.88e-01 0.0694 0.173 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 312483 sc-eQTL 3.75e-01 0.156 0.175 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 227021 sc-eQTL 3.89e-01 0.135 0.157 0.061 MAIT L2
ENSG00000116133 DHCR24 141149 sc-eQTL 7.06e-02 0.21 0.115 0.061 MAIT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 974760 sc-eQTL 1.07e-01 -0.263 0.163 0.061 MAIT L2
ENSG00000116209 TMEM59 974840 sc-eQTL 5.19e-01 0.0954 0.148 0.061 MAIT L2
ENSG00000116221 MRPL37 844303 sc-eQTL 1.75e-01 0.244 0.179 0.061 MAIT L2
ENSG00000157216 SSBP3 614865 sc-eQTL 4.67e-01 -0.116 0.159 0.061 MAIT L2
ENSG00000162402 USP24 -187020 sc-eQTL 1.96e-01 0.183 0.141 0.061 MAIT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 828308 sc-eQTL 1.49e-01 0.237 0.164 0.061 MAIT L2
ENSG00000243725 TTC4 312483 sc-eQTL 3.96e-01 -0.139 0.163 0.061 MAIT L2
ENSG00000006555 TTC22 227021 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0249 0.189 0.058 NK_CD56bright L2
ENSG00000116133 DHCR24 141149 sc-eQTL 9.83e-01 -0.0035 0.167 0.058 NK_CD56bright L2
ENSG00000116205 TCEANC2 974760 sc-eQTL 4.12e-01 0.144 0.176 0.058 NK_CD56bright L2
ENSG00000116209 TMEM59 974840 sc-eQTL 2.08e-01 0.216 0.171 0.058 NK_CD56bright L2
ENSG00000116221 MRPL37 844303 sc-eQTL 7.84e-03 0.506 0.188 0.058 NK_CD56bright L2
ENSG00000157216 SSBP3 614865 sc-eQTL 6.70e-01 0.0616 0.144 0.058 NK_CD56bright L2
ENSG00000162398 LEXM 222281 sc-eQTL 7.31e-01 0.0587 0.171 0.058 NK_CD56bright L2
ENSG00000162402 USP24 -187020 sc-eQTL 1.68e-01 -0.202 0.146 0.058 NK_CD56bright L2
ENSG00000243725 TTC4 312483 sc-eQTL 4.09e-01 0.153 0.185 0.058 NK_CD56bright L2
ENSG00000006555 TTC22 227021 sc-eQTL 1.91e-01 0.197 0.15 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000116133 DHCR24 141149 sc-eQTL 4.65e-01 0.115 0.157 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000116205 TCEANC2 974760 sc-eQTL 1.37e-01 -0.253 0.169 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000116209 TMEM59 974840 sc-eQTL 6.80e-01 0.052 0.126 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000116221 MRPL37 844303 sc-eQTL 2.64e-01 -0.183 0.163 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000157216 SSBP3 614865 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00429 0.134 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000162398 LEXM 222281 sc-eQTL 6.56e-01 0.0688 0.154 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000162402 USP24 -187020 sc-eQTL 3.29e-01 -0.0957 0.0979 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000243725 TTC4 312483 sc-eQTL 1.00e-01 -0.276 0.167 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000006555 TTC22 227021 sc-eQTL 1.68e-01 0.264 0.191 0.057 NK_HLA L2
ENSG00000116133 DHCR24 141149 sc-eQTL 4.12e-01 -0.153 0.186 0.057 NK_HLA L2
ENSG00000116205 TCEANC2 974760 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0449 0.18 0.057 NK_HLA L2
ENSG00000116209 TMEM59 974840 sc-eQTL 5.29e-01 0.113 0.179 0.057 NK_HLA L2
ENSG00000116221 MRPL37 844303 sc-eQTL 1.72e-01 -0.269 0.196 0.057 NK_HLA L2
ENSG00000157216 SSBP3 614865 sc-eQTL 6.35e-01 0.0764 0.161 0.057 NK_HLA L2
ENSG00000162398 LEXM 222281 sc-eQTL 4.65e-01 0.133 0.181 0.057 NK_HLA L2
ENSG00000162402 USP24 -187020 sc-eQTL 2.92e-01 -0.14 0.133 0.057 NK_HLA L2
ENSG00000243725 TTC4 312483 sc-eQTL 8.26e-01 0.0438 0.199 0.057 NK_HLA L2
ENSG00000006555 TTC22 227021 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0875 0.161 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000116133 DHCR24 141149 sc-eQTL 2.45e-01 -0.19 0.162 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000116205 TCEANC2 974760 sc-eQTL 3.98e-02 -0.331 0.16 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000116209 TMEM59 974840 sc-eQTL 1.60e-01 0.185 0.131 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000116221 MRPL37 844303 sc-eQTL 6.98e-01 0.0629 0.162 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000157216 SSBP3 614865 sc-eQTL 1.20e-01 0.211 0.135 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000162398 LEXM 222281 sc-eQTL 8.50e-01 0.0322 0.17 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000162402 USP24 -187020 sc-eQTL 1.69e-01 -0.159 0.115 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000243725 TTC4 312483 sc-eQTL 3.72e-01 -0.153 0.171 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000006555 TTC22 227021 sc-eQTL 2.33e-01 -0.208 0.173 0.074 PB L2
ENSG00000116133 DHCR24 141149 sc-eQTL 8.98e-01 -0.02 0.155 0.074 PB L2
ENSG00000116205 TCEANC2 974760 sc-eQTL 1.63e-01 -0.262 0.187 0.074 PB L2
ENSG00000116209 TMEM59 974840 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0242 0.0787 0.074 PB L2
ENSG00000116221 MRPL37 844303 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0556 0.143 0.074 PB L2
ENSG00000157216 SSBP3 614865 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0232 0.165 0.074 PB L2
ENSG00000162402 USP24 -187020 sc-eQTL 2.99e-01 -0.195 0.187 0.074 PB L2
ENSG00000215883 CYB5RL 828308 sc-eQTL 8.77e-01 0.0303 0.194 0.074 PB L2
ENSG00000243725 TTC4 312483 sc-eQTL 6.37e-01 0.0857 0.181 0.074 PB L2
ENSG00000006555 TTC22 227021 sc-eQTL 7.30e-01 -0.057 0.165 0.061 Pro_T L2
ENSG00000116133 DHCR24 141149 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0579 0.14 0.061 Pro_T L2
ENSG00000116205 TCEANC2 974760 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0212 0.171 0.061 Pro_T L2
ENSG00000116209 TMEM59 974840 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0357 0.119 0.061 Pro_T L2
ENSG00000116221 MRPL37 844303 sc-eQTL 5.15e-01 0.0756 0.116 0.061 Pro_T L2
ENSG00000157216 SSBP3 614865 sc-eQTL 3.53e-01 0.121 0.13 0.061 Pro_T L2
ENSG00000162402 USP24 -187020 sc-eQTL 5.78e-01 0.0885 0.159 0.061 Pro_T L2
ENSG00000215883 CYB5RL 828308 sc-eQTL 4.75e-01 0.112 0.157 0.061 Pro_T L2
ENSG00000243725 TTC4 312483 sc-eQTL 7.13e-01 0.0643 0.174 0.061 Pro_T L2
ENSG00000006555 TTC22 227021 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0503 0.159 0.06 Treg L2
ENSG00000116205 TCEANC2 974760 sc-eQTL 4.47e-01 -0.13 0.17 0.06 Treg L2
ENSG00000116209 TMEM59 974840 sc-eQTL 4.00e-01 0.114 0.135 0.06 Treg L2
ENSG00000116221 MRPL37 844303 sc-eQTL 7.93e-02 -0.292 0.166 0.06 Treg L2
ENSG00000157216 SSBP3 614865 sc-eQTL 7.31e-01 0.0513 0.149 0.06 Treg L2
ENSG00000162402 USP24 -187020 sc-eQTL 2.13e-01 -0.177 0.141 0.06 Treg L2
ENSG00000243725 TTC4 312483 sc-eQTL 8.98e-02 0.303 0.178 0.06 Treg L2
ENSG00000116133 DHCR24 141149 sc-eQTL 5.52e-01 0.0943 0.158 0.056 cDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 974760 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0919 0.187 0.056 cDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 974840 sc-eQTL 2.27e-01 0.192 0.158 0.056 cDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 844303 sc-eQTL 2.38e-01 -0.239 0.202 0.056 cDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 614865 sc-eQTL 5.91e-01 -0.101 0.187 0.056 cDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 486087 sc-eQTL 8.71e-01 0.0282 0.174 0.056 cDC L2
ENSG00000162402 USP24 -187020 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0346 0.195 0.056 cDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 828308 sc-eQTL 2.53e-01 0.191 0.167 0.056 cDC L2
ENSG00000243725 TTC4 312483 sc-eQTL 4.22e-01 0.161 0.2 0.056 cDC L2
ENSG00000116133 DHCR24 141149 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0114 0.107 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000116205 TCEANC2 974760 sc-eQTL 2.72e-01 0.163 0.148 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000116209 TMEM59 974840 sc-eQTL 7.30e-01 0.0311 0.09 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000116221 MRPL37 844303 sc-eQTL 4.77e-01 0.114 0.16 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000157216 SSBP3 614865 sc-eQTL 4.06e-01 -0.136 0.163 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000162402 USP24 -187020 sc-eQTL 4.03e-01 -0.101 0.121 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000243725 TTC4 312483 sc-eQTL 5.46e-01 0.112 0.185 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000116133 DHCR24 141149 sc-eQTL 9.59e-01 -0.0052 0.101 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000116205 TCEANC2 974760 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0921 0.153 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000116209 TMEM59 974840 sc-eQTL 3.52e-01 -0.114 0.123 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000116221 MRPL37 844303 sc-eQTL 7.13e-01 0.0654 0.177 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000157216 SSBP3 614865 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0367 0.184 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000162402 USP24 -187020 sc-eQTL 3.39e-01 -0.143 0.149 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000243725 TTC4 312483 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0348 0.187 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000006555 TTC22 227021 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0571 0.182 0.055 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 141149 sc-eQTL 8.79e-01 0.0309 0.203 0.055 gdT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 974760 sc-eQTL 7.23e-01 0.0725 0.204 0.055 gdT L2
ENSG00000116209 TMEM59 974840 sc-eQTL 7.60e-01 0.0635 0.207 0.055 gdT L2
ENSG00000116221 MRPL37 844303 sc-eQTL 4.57e-01 0.177 0.237 0.055 gdT L2
ENSG00000157216 SSBP3 614865 sc-eQTL 6.04e-01 0.0755 0.145 0.055 gdT L2
ENSG00000162402 USP24 -187020 sc-eQTL 1.13e-01 0.309 0.194 0.055 gdT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 828308 sc-eQTL 7.97e-01 0.0524 0.203 0.055 gdT L2
ENSG00000243725 TTC4 312483 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0867 0.229 0.055 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 141149 sc-eQTL 5.78e-01 0.0759 0.136 0.058 intMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 974760 sc-eQTL 9.93e-01 0.00145 0.17 0.058 intMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 974840 sc-eQTL 2.88e-01 -0.132 0.124 0.058 intMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 844303 sc-eQTL 2.10e-01 -0.239 0.19 0.058 intMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 614865 sc-eQTL 4.20e-01 0.157 0.194 0.058 intMono L2
ENSG00000162402 USP24 -187020 sc-eQTL 2.48e-01 0.2 0.173 0.058 intMono L2
ENSG00000243725 TTC4 312483 sc-eQTL 1.27e-01 0.282 0.184 0.058 intMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 141149 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0149 0.169 0.054 pDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 974760 sc-eQTL 5.24e-01 -0.129 0.202 0.054 pDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 974840 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0849 0.162 0.054 pDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 844303 sc-eQTL 1.46e-01 0.312 0.213 0.054 pDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 614865 sc-eQTL 9.68e-02 -0.316 0.189 0.054 pDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 486087 sc-eQTL 3.43e-01 -0.0761 0.08 0.054 pDC L2
ENSG00000162402 USP24 -187020 sc-eQTL 6.92e-01 0.0537 0.135 0.054 pDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 828308 sc-eQTL 9.40e-01 0.014 0.185 0.054 pDC L2
ENSG00000243725 TTC4 312483 sc-eQTL 2.09e-01 0.268 0.213 0.054 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 227021 sc-eQTL 1.26e-01 -0.263 0.172 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 141149 sc-eQTL 1.23e-01 -0.266 0.172 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 974760 sc-eQTL 9.61e-01 0.00821 0.167 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 974840 sc-eQTL 3.89e-02 -0.268 0.129 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 844303 sc-eQTL 2.36e-02 0.351 0.154 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 614865 sc-eQTL 8.21e-02 -0.235 0.135 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -187020 sc-eQTL 3.24e-01 -0.122 0.123 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 828308 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0946 0.19 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 312483 sc-eQTL 2.85e-01 0.182 0.17 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 227021 sc-eQTL 3.62e-02 -0.369 0.175 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 141149 sc-eQTL 1.37e-01 -0.236 0.158 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 974760 sc-eQTL 2.41e-01 0.169 0.143 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 974840 sc-eQTL 2.22e-01 0.125 0.102 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 844303 sc-eQTL 5.35e-01 0.0912 0.147 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 614865 sc-eQTL 1.71e-01 -0.18 0.131 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -187020 sc-eQTL 9.31e-01 0.00981 0.113 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 828308 sc-eQTL 4.26e-01 0.142 0.178 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 312483 sc-eQTL 4.84e-01 0.118 0.168 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 141149 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0325 0.103 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 974760 sc-eQTL 3.14e-01 0.13 0.129 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 974840 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0185 0.0893 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 844303 sc-eQTL 4.99e-01 0.107 0.158 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 614865 sc-eQTL 4.74e-01 -0.118 0.165 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -187020 sc-eQTL 2.08e-01 -0.142 0.113 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 312483 sc-eQTL 6.64e-01 0.0815 0.187 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 141149 sc-eQTL 9.04e-02 0.225 0.132 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 974760 sc-eQTL 7.02e-01 0.0671 0.175 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 974840 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0563 0.13 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 844303 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0592 0.178 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 614865 sc-eQTL 5.24e-01 0.122 0.19 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -187020 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0434 0.15 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 312483 sc-eQTL 3.27e-01 0.185 0.188 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 227021 sc-eQTL 1.93e-01 0.19 0.146 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 141149 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0632 0.153 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 974760 sc-eQTL 2.73e-02 -0.329 0.148 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 974840 sc-eQTL 4.96e-01 0.0789 0.116 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 844303 sc-eQTL 2.17e-01 -0.192 0.155 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 614865 sc-eQTL 6.51e-01 0.0578 0.127 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162398 LEXM 222281 sc-eQTL 3.71e-01 0.129 0.143 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -187020 sc-eQTL 1.08e-01 -0.146 0.0905 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 312483 sc-eQTL 1.80e-01 -0.217 0.161 0.06 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000169174 PCSK9 -11204 eQTL 0.0115 -0.0879 0.0347 0.0 0.0 0.0579
ENSG00000215883 CYB5RL 828308 eQTL 0.0459 0.0784 0.0392 0.0 0.0 0.0579
ENSG00000234810 AL603840.1 -300944 eQTL 0.0381 -0.133 0.0639 0.0 0.0 0.0579
ENSG00000243725 TTC4 312483 eQTL 0.0156 -0.0876 0.0362 0.0 0.0 0.0579

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000215883 CYB5RL 828308 2.64e-07 1.3e-07 3.72e-08 2.05e-07 8.83e-08 9.87e-08 1.38e-07 5.37e-08 1.4e-07 4.4e-08 1.62e-07 7.75e-08 1.33e-07 6.56e-08 5.99e-08 7.26e-08 3.87e-08 1.21e-07 5.36e-08 4.45e-08 1.13e-07 1.23e-07 1.32e-07 3.42e-08 1.37e-07 1.14e-07 1.08e-07 9.57e-08 1.02e-07 1.12e-07 9.91e-08 4.22e-08 3.28e-08 8e-08 4.84e-08 3.2e-08 5.37e-08 9.61e-08 6.78e-08 3.55e-08 4.68e-08 1.35e-07 4.33e-08 1.52e-08 6.92e-08 1.99e-08 1.22e-07 3.92e-09 4.73e-08