logo

Genes within 1Mb (chr1:55028001:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 226678 sc-eQTL 5.68e-01 0.0592 0.103 0.197 B L1
ENSG00000116133 DHCR24 140806 sc-eQTL 4.07e-01 0.0813 0.0978 0.197 B L1
ENSG00000116205 TCEANC2 974417 sc-eQTL 2.25e-01 0.103 0.0842 0.197 B L1
ENSG00000116209 TMEM59 974497 sc-eQTL 8.62e-01 -0.00897 0.0515 0.197 B L1
ENSG00000116221 MRPL37 843960 sc-eQTL 5.79e-01 0.0374 0.0673 0.197 B L1
ENSG00000157216 SSBP3 614522 sc-eQTL 8.89e-01 0.00983 0.0705 0.197 B L1
ENSG00000162402 USP24 -187363 sc-eQTL 9.68e-01 0.00241 0.0598 0.197 B L1
ENSG00000215883 CYB5RL 827965 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00489 0.115 0.197 B L1
ENSG00000243725 TTC4 312140 sc-eQTL 6.97e-01 0.039 0.1 0.197 B L1
ENSG00000006555 TTC22 226678 sc-eQTL 5.07e-01 0.0544 0.0819 0.197 CD4T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 974417 sc-eQTL 5.50e-01 0.0401 0.067 0.197 CD4T L1
ENSG00000116209 TMEM59 974497 sc-eQTL 5.01e-01 -0.042 0.0624 0.197 CD4T L1
ENSG00000116221 MRPL37 843960 sc-eQTL 9.02e-01 0.0106 0.0863 0.197 CD4T L1
ENSG00000157216 SSBP3 614522 sc-eQTL 1.10e-01 0.114 0.0712 0.197 CD4T L1
ENSG00000162402 USP24 -187363 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0151 0.0584 0.197 CD4T L1
ENSG00000243725 TTC4 312140 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0739 0.0877 0.197 CD4T L1
ENSG00000006555 TTC22 226678 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0193 0.0701 0.197 CD8T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 974417 sc-eQTL 2.43e-01 0.102 0.0871 0.197 CD8T L1
ENSG00000116209 TMEM59 974497 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0437 0.0606 0.197 CD8T L1
ENSG00000116221 MRPL37 843960 sc-eQTL 6.80e-01 0.0345 0.0835 0.197 CD8T L1
ENSG00000157216 SSBP3 614522 sc-eQTL 1.20e-01 0.0931 0.0596 0.197 CD8T L1
ENSG00000162402 USP24 -187363 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0382 0.058 0.197 CD8T L1
ENSG00000243725 TTC4 312140 sc-eQTL 6.19e-02 -0.187 0.0998 0.197 CD8T L1
ENSG00000116133 DHCR24 140806 sc-eQTL 9.85e-01 0.0018 0.0946 0.196 DC L1
ENSG00000116205 TCEANC2 974417 sc-eQTL 1.10e-01 -0.169 0.105 0.196 DC L1
ENSG00000116209 TMEM59 974497 sc-eQTL 3.24e-01 0.0822 0.0832 0.196 DC L1
ENSG00000116221 MRPL37 843960 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0677 0.112 0.196 DC L1
ENSG00000157216 SSBP3 614522 sc-eQTL 5.22e-01 0.064 0.0997 0.196 DC L1
ENSG00000162390 ACOT11 485744 sc-eQTL 5.95e-02 0.18 0.0951 0.196 DC L1
ENSG00000162402 USP24 -187363 sc-eQTL 1.36e-02 0.142 0.057 0.196 DC L1
ENSG00000215883 CYB5RL 827965 sc-eQTL 7.86e-01 0.0284 0.105 0.196 DC L1
ENSG00000243725 TTC4 312140 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0215 0.113 0.196 DC L1
ENSG00000116133 DHCR24 140806 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0381 0.068 0.197 Mono L1
ENSG00000116205 TCEANC2 974417 sc-eQTL 2.70e-01 -0.081 0.0732 0.197 Mono L1
ENSG00000116209 TMEM59 974497 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00153 0.0545 0.197 Mono L1
ENSG00000116221 MRPL37 843960 sc-eQTL 8.44e-01 0.018 0.0912 0.197 Mono L1
ENSG00000157216 SSBP3 614522 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0323 0.105 0.197 Mono L1
ENSG00000162402 USP24 -187363 sc-eQTL 1.83e-01 -0.0828 0.062 0.197 Mono L1
ENSG00000243725 TTC4 312140 sc-eQTL 2.68e-01 0.121 0.109 0.197 Mono L1
ENSG00000006555 TTC22 226678 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0611 0.0949 0.195 NK L1
ENSG00000116133 DHCR24 140806 sc-eQTL 7.38e-02 0.171 0.0951 0.195 NK L1
ENSG00000116205 TCEANC2 974417 sc-eQTL 2.54e-01 0.108 0.0943 0.195 NK L1
ENSG00000116209 TMEM59 974497 sc-eQTL 3.14e-01 -0.0746 0.0739 0.195 NK L1
ENSG00000116221 MRPL37 843960 sc-eQTL 6.00e-01 0.0484 0.092 0.195 NK L1
ENSG00000157216 SSBP3 614522 sc-eQTL 2.97e-01 0.0833 0.0797 0.195 NK L1
ENSG00000162398 LEXM 221938 sc-eQTL 3.08e-01 -0.0914 0.0894 0.195 NK L1
ENSG00000162402 USP24 -187363 sc-eQTL 3.60e-01 0.0497 0.0542 0.195 NK L1
ENSG00000243725 TTC4 312140 sc-eQTL 5.28e-01 0.0649 0.103 0.195 NK L1
ENSG00000006555 TTC22 226678 sc-eQTL 5.28e-01 0.0522 0.0826 0.197 Other_T L1
ENSG00000116133 DHCR24 140806 sc-eQTL 2.15e-02 0.147 0.0634 0.197 Other_T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 974417 sc-eQTL 5.62e-01 0.0557 0.0959 0.197 Other_T L1
ENSG00000116209 TMEM59 974497 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0485 0.0658 0.197 Other_T L1
ENSG00000116221 MRPL37 843960 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0411 0.0617 0.197 Other_T L1
ENSG00000157216 SSBP3 614522 sc-eQTL 6.89e-01 0.0286 0.0714 0.197 Other_T L1
ENSG00000162402 USP24 -187363 sc-eQTL 7.61e-02 -0.134 0.0754 0.197 Other_T L1
ENSG00000215883 CYB5RL 827965 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0397 0.104 0.197 Other_T L1
ENSG00000243725 TTC4 312140 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00584 0.104 0.197 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 226678 sc-eQTL 1.53e-01 -0.124 0.0861 0.189 B_Activated L2
ENSG00000116133 DHCR24 140806 sc-eQTL 2.93e-01 0.107 0.101 0.189 B_Activated L2
ENSG00000116205 TCEANC2 974417 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0935 0.109 0.189 B_Activated L2
ENSG00000116209 TMEM59 974497 sc-eQTL 5.49e-01 0.0697 0.116 0.189 B_Activated L2
ENSG00000116221 MRPL37 843960 sc-eQTL 2.43e-01 -0.146 0.125 0.189 B_Activated L2
ENSG00000157216 SSBP3 614522 sc-eQTL 7.03e-01 0.0433 0.113 0.189 B_Activated L2
ENSG00000162402 USP24 -187363 sc-eQTL 2.24e-01 0.134 0.11 0.189 B_Activated L2
ENSG00000215883 CYB5RL 827965 sc-eQTL 3.69e-01 0.0878 0.0975 0.189 B_Activated L2
ENSG00000243725 TTC4 312140 sc-eQTL 1.56e-01 0.15 0.105 0.189 B_Activated L2
ENSG00000006555 TTC22 226678 sc-eQTL 5.91e-01 0.0601 0.112 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000116133 DHCR24 140806 sc-eQTL 9.43e-01 0.00747 0.104 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000116205 TCEANC2 974417 sc-eQTL 6.63e-02 0.189 0.102 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000116209 TMEM59 974497 sc-eQTL 5.88e-01 0.048 0.0884 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000116221 MRPL37 843960 sc-eQTL 2.05e-01 0.132 0.104 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000157216 SSBP3 614522 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0217 0.0972 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000162402 USP24 -187363 sc-eQTL 9.23e-01 0.00795 0.0819 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000215883 CYB5RL 827965 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0497 0.116 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000243725 TTC4 312140 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0175 0.105 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000006555 TTC22 226678 sc-eQTL 7.34e-01 -0.036 0.106 0.198 B_Memory L2
ENSG00000116133 DHCR24 140806 sc-eQTL 3.45e-01 0.0991 0.105 0.198 B_Memory L2
ENSG00000116205 TCEANC2 974417 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0404 0.112 0.198 B_Memory L2
ENSG00000116209 TMEM59 974497 sc-eQTL 5.14e-01 0.061 0.0935 0.198 B_Memory L2
ENSG00000116221 MRPL37 843960 sc-eQTL 8.60e-01 0.0168 0.0948 0.198 B_Memory L2
ENSG00000157216 SSBP3 614522 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0482 0.0884 0.198 B_Memory L2
ENSG00000162402 USP24 -187363 sc-eQTL 1.52e-01 -0.124 0.0861 0.198 B_Memory L2
ENSG00000215883 CYB5RL 827965 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0225 0.107 0.198 B_Memory L2
ENSG00000243725 TTC4 312140 sc-eQTL 9.64e-01 0.00505 0.111 0.198 B_Memory L2
ENSG00000006555 TTC22 226678 sc-eQTL 4.47e-01 0.084 0.11 0.197 B_Naive1 L2
ENSG00000116133 DHCR24 140806 sc-eQTL 6.51e-01 0.0468 0.103 0.197 B_Naive1 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 974417 sc-eQTL 2.51e-01 0.106 0.092 0.197 B_Naive1 L2
ENSG00000116209 TMEM59 974497 sc-eQTL 2.57e-01 -0.0759 0.0668 0.197 B_Naive1 L2
ENSG00000116221 MRPL37 843960 sc-eQTL 7.10e-01 0.0368 0.0988 0.197 B_Naive1 L2
ENSG00000157216 SSBP3 614522 sc-eQTL 7.72e-01 0.0273 0.0941 0.197 B_Naive1 L2
ENSG00000162402 USP24 -187363 sc-eQTL 2.99e-01 -0.0769 0.074 0.197 B_Naive1 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 827965 sc-eQTL 1.00e-01 -0.184 0.111 0.197 B_Naive1 L2
ENSG00000243725 TTC4 312140 sc-eQTL 6.85e-01 0.041 0.101 0.197 B_Naive1 L2
ENSG00000006555 TTC22 226678 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0692 0.112 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000116133 DHCR24 140806 sc-eQTL 1.72e-01 0.133 0.0968 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 974417 sc-eQTL 1.00e+00 1.2e-05 0.108 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000116209 TMEM59 974497 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0321 0.0888 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000116221 MRPL37 843960 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00407 0.105 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000157216 SSBP3 614522 sc-eQTL 7.74e-01 0.0296 0.103 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000162402 USP24 -187363 sc-eQTL 8.91e-01 0.0112 0.0816 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 827965 sc-eQTL 3.70e-01 0.103 0.115 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000243725 TTC4 312140 sc-eQTL 6.22e-01 0.059 0.119 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000006555 TTC22 226678 sc-eQTL 4.18e-01 -0.086 0.106 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 974417 sc-eQTL 3.21e-01 0.108 0.109 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 974497 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0479 0.0993 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 843960 sc-eQTL 6.04e-03 0.333 0.12 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 614522 sc-eQTL 6.68e-01 0.0322 0.0751 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -187363 sc-eQTL 5.86e-01 0.0562 0.103 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 312140 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00939 0.116 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 226678 sc-eQTL 4.73e-01 0.0686 0.0954 0.197 CD4_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 974417 sc-eQTL 8.58e-01 0.013 0.0726 0.197 CD4_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 974497 sc-eQTL 2.08e-01 -0.0889 0.0704 0.197 CD4_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 843960 sc-eQTL 9.29e-01 0.00815 0.0911 0.197 CD4_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 614522 sc-eQTL 2.57e-01 0.0824 0.0725 0.197 CD4_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -187363 sc-eQTL 2.22e-01 -0.0765 0.0625 0.197 CD4_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 312140 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0665 0.0955 0.197 CD4_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 226678 sc-eQTL 7.63e-01 0.0304 0.101 0.197 CD4_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 974417 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0219 0.0978 0.197 CD4_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 974497 sc-eQTL 8.45e-01 0.0145 0.0738 0.197 CD4_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 843960 sc-eQTL 2.86e-01 -0.099 0.0926 0.197 CD4_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 614522 sc-eQTL 6.44e-02 0.168 0.0902 0.197 CD4_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -187363 sc-eQTL 3.70e-01 0.0676 0.0753 0.197 CD4_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 312140 sc-eQTL 9.19e-01 0.011 0.109 0.197 CD4_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 226678 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0702 0.115 0.197 CD4_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 974417 sc-eQTL 9.92e-01 0.00106 0.109 0.197 CD4_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 974497 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0263 0.0844 0.197 CD4_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 843960 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0921 0.108 0.197 CD4_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 614522 sc-eQTL 5.07e-01 0.0618 0.093 0.197 CD4_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -187363 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0285 0.0847 0.197 CD4_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 312140 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0226 0.112 0.197 CD4_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 226678 sc-eQTL 9.21e-01 0.00928 0.0932 0.197 CD8_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 974417 sc-eQTL 8.46e-02 0.178 0.103 0.197 CD8_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 974497 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00104 0.0898 0.197 CD8_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 843960 sc-eQTL 1.97e-01 0.137 0.106 0.197 CD8_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 614522 sc-eQTL 6.50e-01 -0.033 0.0727 0.197 CD8_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -187363 sc-eQTL 2.36e-01 0.0856 0.0721 0.197 CD8_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 312140 sc-eQTL 7.62e-03 -0.287 0.106 0.197 CD8_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 226678 sc-eQTL 1.27e-01 -0.158 0.103 0.197 CD8_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 974417 sc-eQTL 5.45e-01 0.0569 0.0938 0.197 CD8_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 974497 sc-eQTL 2.55e-01 -0.105 0.0916 0.197 CD8_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 843960 sc-eQTL 4.37e-01 0.0857 0.11 0.197 CD8_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 614522 sc-eQTL 2.28e-01 0.101 0.0831 0.197 CD8_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -187363 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0212 0.0758 0.197 CD8_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 312140 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00973 0.111 0.197 CD8_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 226678 sc-eQTL 1.07e-01 0.185 0.114 0.201 CD8_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 974417 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00885 0.116 0.201 CD8_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 974497 sc-eQTL 1.17e-01 0.159 0.101 0.201 CD8_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 843960 sc-eQTL 5.55e-01 0.0683 0.115 0.201 CD8_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 614522 sc-eQTL 7.72e-01 0.0291 0.1 0.201 CD8_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -187363 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0511 0.0971 0.201 CD8_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 312140 sc-eQTL 2.44e-01 0.138 0.118 0.201 CD8_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 226678 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0428 0.108 0.196 CD8_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 974417 sc-eQTL 8.03e-02 -0.198 0.112 0.196 CD8_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 974497 sc-eQTL 1.91e-01 -0.143 0.109 0.196 CD8_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 843960 sc-eQTL 1.34e-01 0.166 0.11 0.196 CD8_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 614522 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0929 0.105 0.196 CD8_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -187363 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0945 0.11 0.196 CD8_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 312140 sc-eQTL 4.34e-02 -0.226 0.111 0.196 CD8_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 226678 sc-eQTL 6.08e-01 0.0515 0.1 0.195 MAIT L2
ENSG00000116133 DHCR24 140806 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0392 0.0741 0.195 MAIT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 974417 sc-eQTL 8.98e-01 0.0133 0.104 0.195 MAIT L2
ENSG00000116209 TMEM59 974497 sc-eQTL 7.11e-01 0.035 0.0943 0.195 MAIT L2
ENSG00000116221 MRPL37 843960 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0286 0.115 0.195 MAIT L2
ENSG00000157216 SSBP3 614522 sc-eQTL 7.24e-01 0.0359 0.102 0.195 MAIT L2
ENSG00000162402 USP24 -187363 sc-eQTL 4.49e-02 -0.18 0.0894 0.195 MAIT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 827965 sc-eQTL 8.87e-01 0.0149 0.105 0.195 MAIT L2
ENSG00000243725 TTC4 312140 sc-eQTL 7.62e-01 0.0316 0.104 0.195 MAIT L2
ENSG00000006555 TTC22 226678 sc-eQTL 8.17e-01 0.0266 0.115 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000116133 DHCR24 140806 sc-eQTL 3.66e-02 0.211 0.1 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000116205 TCEANC2 974417 sc-eQTL 6.47e-01 -0.049 0.107 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000116209 TMEM59 974497 sc-eQTL 1.48e-01 -0.151 0.104 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000116221 MRPL37 843960 sc-eQTL 5.87e-01 0.0634 0.116 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000157216 SSBP3 614522 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00796 0.0878 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000162398 LEXM 221938 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0322 0.104 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000162402 USP24 -187363 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0151 0.0892 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000243725 TTC4 312140 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0106 0.113 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000006555 TTC22 226678 sc-eQTL 2.25e-01 -0.116 0.0953 0.196 NK_CD56dim L2
ENSG00000116133 DHCR24 140806 sc-eQTL 4.41e-01 0.0768 0.0996 0.196 NK_CD56dim L2
ENSG00000116205 TCEANC2 974417 sc-eQTL 3.94e-01 0.092 0.108 0.196 NK_CD56dim L2
ENSG00000116209 TMEM59 974497 sc-eQTL 7.16e-01 0.0292 0.0801 0.196 NK_CD56dim L2
ENSG00000116221 MRPL37 843960 sc-eQTL 4.72e-01 0.075 0.104 0.196 NK_CD56dim L2
ENSG00000157216 SSBP3 614522 sc-eQTL 1.59e-01 0.12 0.0849 0.196 NK_CD56dim L2
ENSG00000162398 LEXM 221938 sc-eQTL 2.33e-01 -0.117 0.0977 0.196 NK_CD56dim L2
ENSG00000162402 USP24 -187363 sc-eQTL 4.38e-01 0.0483 0.0622 0.196 NK_CD56dim L2
ENSG00000243725 TTC4 312140 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0469 0.107 0.196 NK_CD56dim L2
ENSG00000006555 TTC22 226678 sc-eQTL 3.80e-01 -0.103 0.117 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000116133 DHCR24 140806 sc-eQTL 1.65e-01 0.158 0.113 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000116205 TCEANC2 974417 sc-eQTL 4.52e-01 0.0828 0.11 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000116209 TMEM59 974497 sc-eQTL 9.28e-01 0.00988 0.109 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000116221 MRPL37 843960 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0756 0.12 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000157216 SSBP3 614522 sc-eQTL 8.39e-01 0.02 0.0982 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000162398 LEXM 221938 sc-eQTL 8.26e-01 0.0244 0.111 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000162402 USP24 -187363 sc-eQTL 1.43e-01 0.119 0.0809 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000243725 TTC4 312140 sc-eQTL 6.01e-01 0.0636 0.121 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000006555 TTC22 226678 sc-eQTL 8.15e-01 0.0241 0.103 0.196 NK_cytokine L2
ENSG00000116133 DHCR24 140806 sc-eQTL 4.27e-01 0.0827 0.104 0.196 NK_cytokine L2
ENSG00000116205 TCEANC2 974417 sc-eQTL 1.83e-01 0.138 0.103 0.196 NK_cytokine L2
ENSG00000116209 TMEM59 974497 sc-eQTL 1.66e-01 -0.116 0.0837 0.196 NK_cytokine L2
ENSG00000116221 MRPL37 843960 sc-eQTL 8.67e-01 0.0173 0.104 0.196 NK_cytokine L2
ENSG00000157216 SSBP3 614522 sc-eQTL 2.93e-01 0.0914 0.0866 0.196 NK_cytokine L2
ENSG00000162398 LEXM 221938 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0351 0.109 0.196 NK_cytokine L2
ENSG00000162402 USP24 -187363 sc-eQTL 6.77e-01 0.0309 0.074 0.196 NK_cytokine L2
ENSG00000243725 TTC4 312140 sc-eQTL 5.49e-01 0.0658 0.11 0.196 NK_cytokine L2
ENSG00000006555 TTC22 226678 sc-eQTL 5.70e-01 0.0765 0.134 0.204 PB L2
ENSG00000116133 DHCR24 140806 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0202 0.119 0.204 PB L2
ENSG00000116205 TCEANC2 974417 sc-eQTL 8.64e-01 0.0248 0.145 0.204 PB L2
ENSG00000116209 TMEM59 974497 sc-eQTL 3.69e-01 0.0545 0.0604 0.204 PB L2
ENSG00000116221 MRPL37 843960 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0739 0.11 0.204 PB L2
ENSG00000157216 SSBP3 614522 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0154 0.127 0.204 PB L2
ENSG00000162402 USP24 -187363 sc-eQTL 6.71e-01 0.0616 0.144 0.204 PB L2
ENSG00000215883 CYB5RL 827965 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0893 0.15 0.204 PB L2
ENSG00000243725 TTC4 312140 sc-eQTL 7.07e-01 0.0527 0.14 0.204 PB L2
ENSG00000006555 TTC22 226678 sc-eQTL 7.20e-01 -0.037 0.103 0.198 Pro_T L2
ENSG00000116133 DHCR24 140806 sc-eQTL 6.08e-03 0.238 0.086 0.198 Pro_T L2
ENSG00000116205 TCEANC2 974417 sc-eQTL 5.84e-01 0.0587 0.107 0.198 Pro_T L2
ENSG00000116209 TMEM59 974497 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0331 0.0742 0.198 Pro_T L2
ENSG00000116221 MRPL37 843960 sc-eQTL 1.65e-01 -0.101 0.0723 0.198 Pro_T L2
ENSG00000157216 SSBP3 614522 sc-eQTL 1.82e-01 -0.109 0.0812 0.198 Pro_T L2
ENSG00000162402 USP24 -187363 sc-eQTL 9.80e-01 0.00251 0.0994 0.198 Pro_T L2
ENSG00000215883 CYB5RL 827965 sc-eQTL 1.23e-01 -0.151 0.0976 0.198 Pro_T L2
ENSG00000243725 TTC4 312140 sc-eQTL 7.09e-01 0.0408 0.109 0.198 Pro_T L2
ENSG00000006555 TTC22 226678 sc-eQTL 2.45e-01 0.118 0.101 0.197 Treg L2
ENSG00000116205 TCEANC2 974417 sc-eQTL 3.78e-01 0.0958 0.109 0.197 Treg L2
ENSG00000116209 TMEM59 974497 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0759 0.0858 0.197 Treg L2
ENSG00000116221 MRPL37 843960 sc-eQTL 7.48e-01 0.0342 0.106 0.197 Treg L2
ENSG00000157216 SSBP3 614522 sc-eQTL 7.44e-01 0.0311 0.0949 0.197 Treg L2
ENSG00000162402 USP24 -187363 sc-eQTL 3.53e-01 0.0839 0.0902 0.197 Treg L2
ENSG00000243725 TTC4 312140 sc-eQTL 3.42e-01 -0.108 0.114 0.197 Treg L2
ENSG00000116133 DHCR24 140806 sc-eQTL 8.59e-01 0.0163 0.0917 0.2 cDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 974417 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0483 0.108 0.2 cDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 974497 sc-eQTL 7.61e-01 -0.028 0.0919 0.2 cDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 843960 sc-eQTL 4.14e-01 -0.096 0.117 0.2 cDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 614522 sc-eQTL 6.21e-01 0.0537 0.108 0.2 cDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 485744 sc-eQTL 3.20e-02 0.215 0.0995 0.2 cDC L2
ENSG00000162402 USP24 -187363 sc-eQTL 1.05e-01 0.183 0.112 0.2 cDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 827965 sc-eQTL 1.02e-01 -0.158 0.0963 0.2 cDC L2
ENSG00000243725 TTC4 312140 sc-eQTL 9.75e-01 0.0036 0.116 0.2 cDC L2
ENSG00000116133 DHCR24 140806 sc-eQTL 7.86e-02 -0.116 0.0655 0.197 cMono_IL1B L2
ENSG00000116205 TCEANC2 974417 sc-eQTL 1.91e-01 -0.12 0.0913 0.197 cMono_IL1B L2
ENSG00000116209 TMEM59 974497 sc-eQTL 6.29e-01 0.0268 0.0556 0.197 cMono_IL1B L2
ENSG00000116221 MRPL37 843960 sc-eQTL 9.38e-01 -0.0077 0.099 0.197 cMono_IL1B L2
ENSG00000157216 SSBP3 614522 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0121 0.101 0.197 cMono_IL1B L2
ENSG00000162402 USP24 -187363 sc-eQTL 6.21e-02 -0.139 0.0741 0.197 cMono_IL1B L2
ENSG00000243725 TTC4 312140 sc-eQTL 8.82e-02 0.194 0.113 0.197 cMono_IL1B L2
ENSG00000116133 DHCR24 140806 sc-eQTL 1.23e-01 0.0957 0.0619 0.197 cMono_S100A L2
ENSG00000116205 TCEANC2 974417 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0678 0.0948 0.197 cMono_S100A L2
ENSG00000116209 TMEM59 974497 sc-eQTL 3.35e-01 -0.0732 0.0758 0.197 cMono_S100A L2
ENSG00000116221 MRPL37 843960 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0812 0.11 0.197 cMono_S100A L2
ENSG00000157216 SSBP3 614522 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0926 0.114 0.197 cMono_S100A L2
ENSG00000162402 USP24 -187363 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0321 0.0922 0.197 cMono_S100A L2
ENSG00000243725 TTC4 312140 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0161 0.115 0.197 cMono_S100A L2
ENSG00000006555 TTC22 226678 sc-eQTL 5.20e-02 0.207 0.105 0.179 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 140806 sc-eQTL 2.62e-01 0.134 0.119 0.179 gdT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 974417 sc-eQTL 4.29e-01 0.0947 0.119 0.179 gdT L2
ENSG00000116209 TMEM59 974497 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0734 0.121 0.179 gdT L2
ENSG00000116221 MRPL37 843960 sc-eQTL 4.38e-01 0.108 0.139 0.179 gdT L2
ENSG00000157216 SSBP3 614522 sc-eQTL 7.90e-01 0.0228 0.0852 0.179 gdT L2
ENSG00000162402 USP24 -187363 sc-eQTL 8.56e-01 0.0208 0.114 0.179 gdT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 827965 sc-eQTL 4.47e-01 0.0905 0.119 0.179 gdT L2
ENSG00000243725 TTC4 312140 sc-eQTL 7.74e-01 0.0386 0.134 0.179 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 140806 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0732 0.0844 0.2 intMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 974417 sc-eQTL 1.78e-01 0.142 0.105 0.2 intMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 974497 sc-eQTL 9.88e-01 0.00119 0.0774 0.2 intMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 843960 sc-eQTL 2.70e-01 0.13 0.118 0.2 intMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 614522 sc-eQTL 8.44e-01 0.0238 0.121 0.2 intMono L2
ENSG00000162402 USP24 -187363 sc-eQTL 6.25e-01 0.0528 0.108 0.2 intMono L2
ENSG00000243725 TTC4 312140 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0563 0.115 0.2 intMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 140806 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0403 0.0838 0.195 ncMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 974417 sc-eQTL 3.69e-01 -0.0942 0.105 0.195 ncMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 974497 sc-eQTL 7.46e-01 0.0272 0.0839 0.195 ncMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 843960 sc-eQTL 6.65e-02 0.198 0.107 0.195 ncMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 614522 sc-eQTL 2.59e-01 -0.134 0.118 0.195 ncMono L2
ENSG00000162402 USP24 -187363 sc-eQTL 6.95e-01 0.0372 0.0946 0.195 ncMono L2
ENSG00000243725 TTC4 312140 sc-eQTL 7.98e-01 0.0287 0.112 0.195 ncMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 140806 sc-eQTL 9.01e-01 0.0122 0.0979 0.201 pDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 974417 sc-eQTL 1.68e-02 -0.279 0.115 0.201 pDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 974497 sc-eQTL 1.04e-01 0.152 0.093 0.201 pDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 843960 sc-eQTL 6.85e-01 0.0507 0.125 0.201 pDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 614522 sc-eQTL 8.95e-01 0.0146 0.111 0.201 pDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 485744 sc-eQTL 1.68e-01 0.0641 0.0462 0.201 pDC L2
ENSG00000162402 USP24 -187363 sc-eQTL 1.72e-01 0.107 0.0781 0.201 pDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 827965 sc-eQTL 3.27e-01 0.105 0.107 0.201 pDC L2
ENSG00000243725 TTC4 312140 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0983 0.124 0.201 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 226678 sc-eQTL 8.99e-01 0.0136 0.107 0.197 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 140806 sc-eQTL 3.89e-01 0.0923 0.107 0.197 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 974417 sc-eQTL 2.74e-01 0.113 0.103 0.197 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 974497 sc-eQTL 5.29e-01 0.0507 0.0805 0.197 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 843960 sc-eQTL 7.58e-01 0.0298 0.0965 0.197 B_Memory LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 614522 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0207 0.0839 0.197 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -187363 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0083 0.0765 0.197 B_Memory LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 827965 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0498 0.117 0.197 B_Memory LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 312140 sc-eQTL 6.43e-01 0.049 0.106 0.197 B_Memory LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 226678 sc-eQTL 5.72e-01 0.063 0.111 0.197 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 140806 sc-eQTL 3.02e-01 0.103 0.1 0.197 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 974417 sc-eQTL 4.96e-01 0.0617 0.0905 0.197 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 974497 sc-eQTL 2.89e-01 -0.0682 0.0642 0.197 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 843960 sc-eQTL 9.84e-01 0.00182 0.0925 0.197 B_Naive LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 614522 sc-eQTL 5.84e-01 0.0453 0.0827 0.197 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -187363 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0528 0.0709 0.197 B_Naive LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 827965 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0973 0.112 0.197 B_Naive LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 312140 sc-eQTL 6.13e-01 0.0536 0.106 0.197 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 140806 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0392 0.0639 0.197 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 974417 sc-eQTL 9.34e-02 -0.134 0.0795 0.197 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 974497 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0121 0.0552 0.197 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 843960 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0134 0.0978 0.197 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 614522 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0305 0.102 0.197 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -187363 sc-eQTL 1.13e-01 -0.111 0.0695 0.197 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 312140 sc-eQTL 1.40e-01 0.171 0.115 0.197 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 140806 sc-eQTL 2.49e-01 -0.0922 0.0798 0.194 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 974417 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0163 0.105 0.194 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 974497 sc-eQTL 6.78e-01 0.0325 0.0782 0.194 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 843960 sc-eQTL 8.35e-02 0.185 0.106 0.194 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 614522 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0503 0.114 0.194 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -187363 sc-eQTL 4.09e-01 0.0744 0.0899 0.194 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 312140 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00769 0.113 0.194 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 226678 sc-eQTL 4.08e-01 -0.077 0.0928 0.196 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 140806 sc-eQTL 2.34e-01 0.115 0.0967 0.196 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 974417 sc-eQTL 2.23e-01 0.116 0.0948 0.196 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 974497 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0438 0.0736 0.196 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 843960 sc-eQTL 6.55e-01 0.0441 0.0986 0.196 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 614522 sc-eQTL 2.40e-01 0.095 0.0807 0.196 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162398 LEXM 221938 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0651 0.0911 0.196 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -187363 sc-eQTL 2.65e-01 0.0644 0.0577 0.196 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 312140 sc-eQTL 5.99e-01 0.0542 0.103 0.196 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000116209 TMEM59 974497 eQTL 0.0486 0.0238 0.0121 0.00107 0.0 0.173
ENSG00000162402 USP24 -187363 eQTL 0.0105 0.0406 0.0158 0.00121 0.0 0.173

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000116133 \N 140806 4.26e-06 4.77e-06 8.7e-07 2.64e-06 8.73e-07 1.56e-06 4.56e-06 9.93e-07 4.96e-06 2.43e-06 4.96e-06 3.31e-06 7.25e-06 2.17e-06 1.3e-06 2.56e-06 1.82e-06 3.19e-06 1.41e-06 9.74e-07 2.49e-06 4.77e-06 3.6e-06 1.82e-06 6.5e-06 1.29e-06 2.55e-06 1.43e-06 4.45e-06 4.02e-06 2.7e-06 4.72e-07 6.64e-07 1.7e-06 2.22e-06 9.36e-07 8.91e-07 4.76e-07 1.1e-06 4.17e-07 2.8e-07 5.64e-06 4.91e-07 1.82e-07 3.61e-07 3.54e-07 8.08e-07 2.62e-07 1.74e-07
ENSG00000162402 USP24 -187363 2.66e-06 2.63e-06 3.28e-07 2.07e-06 4.74e-07 8.44e-07 2.28e-06 5.91e-07 2.02e-06 1.2e-06 2.49e-06 1.44e-06 3.83e-06 1.38e-06 5.7e-07 1.5e-06 1.63e-06 2.2e-06 1.22e-06 8.39e-07 1.12e-06 3.18e-06 2.3e-06 9.82e-07 4.14e-06 1.23e-06 1.39e-06 1.38e-06 2.69e-06 2.13e-06 1.97e-06 2.83e-07 3.61e-07 1.1e-06 1.33e-06 6.66e-07 7.56e-07 4.19e-07 9.49e-07 2.76e-07 2.88e-07 4.04e-06 4.8e-07 1.68e-07 2.99e-07 2.98e-07 7.71e-07 2.44e-07 2.84e-07
ENSG00000184313 \N 386247 6.97e-07 4.63e-07 1.14e-07 3.48e-07 1.07e-07 2.08e-07 5.01e-07 7.46e-08 3.03e-07 2.26e-07 5.29e-07 2.8e-07 6.27e-07 1.48e-07 1.48e-07 1.63e-07 3.13e-07 3.56e-07 2.42e-07 7.05e-08 1.91e-07 3.71e-07 3.03e-07 7.36e-08 6.87e-07 2.2e-07 2.43e-07 1.85e-07 3.27e-07 5.82e-07 2.73e-07 5.08e-08 4.16e-08 1.21e-07 2.61e-07 6.73e-08 1e-07 6.56e-08 5.77e-08 7.55e-08 4.79e-08 4.95e-07 5.91e-08 5.93e-09 8.24e-08 9.49e-09 9.68e-08 3.09e-09 5.71e-08