Genes within 1Mb (chr1:55026242:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 224919 sc-eQTL 2.12e-01 -0.158 0.127 0.115 B L1
ENSG00000116133 DHCR24 139047 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0685 0.12 0.115 B L1
ENSG00000116205 TCEANC2 972658 sc-eQTL 5.15e-01 0.0675 0.104 0.115 B L1
ENSG00000116209 TMEM59 972738 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0345 0.0631 0.115 B L1
ENSG00000116221 MRPL37 842201 sc-eQTL 4.71e-01 0.0596 0.0825 0.115 B L1
ENSG00000157216 SSBP3 612763 sc-eQTL 1.03e-03 -0.281 0.0843 0.115 B L1
ENSG00000162402 USP24 -189122 sc-eQTL 1.52e-01 -0.105 0.0729 0.115 B L1
ENSG00000215883 CYB5RL 826206 sc-eQTL 8.86e-01 0.0203 0.141 0.115 B L1
ENSG00000243725 TTC4 310381 sc-eQTL 4.01e-01 0.103 0.123 0.115 B L1
ENSG00000006555 TTC22 224919 sc-eQTL 3.56e-01 -0.0911 0.0984 0.115 CD4T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 972658 sc-eQTL 9.41e-01 0.00602 0.0806 0.115 CD4T L1
ENSG00000116209 TMEM59 972738 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0351 0.075 0.115 CD4T L1
ENSG00000116221 MRPL37 842201 sc-eQTL 5.16e-01 0.0674 0.104 0.115 CD4T L1
ENSG00000157216 SSBP3 612763 sc-eQTL 2.82e-01 -0.0926 0.0859 0.115 CD4T L1
ENSG00000162402 USP24 -189122 sc-eQTL 1.73e-01 -0.0955 0.0699 0.115 CD4T L1
ENSG00000243725 TTC4 310381 sc-eQTL 2.27e-01 -0.127 0.105 0.115 CD4T L1
ENSG00000006555 TTC22 224919 sc-eQTL 4.59e-01 0.062 0.0837 0.115 CD8T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 972658 sc-eQTL 5.15e-01 -0.068 0.104 0.115 CD8T L1
ENSG00000116209 TMEM59 972738 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0393 0.0724 0.115 CD8T L1
ENSG00000116221 MRPL37 842201 sc-eQTL 5.79e-01 0.0554 0.0997 0.115 CD8T L1
ENSG00000157216 SSBP3 612763 sc-eQTL 1.14e-01 -0.113 0.0712 0.115 CD8T L1
ENSG00000162402 USP24 -189122 sc-eQTL 1.76e-01 -0.0936 0.069 0.115 CD8T L1
ENSG00000243725 TTC4 310381 sc-eQTL 9.78e-01 0.00333 0.12 0.115 CD8T L1
ENSG00000116133 DHCR24 139047 sc-eQTL 7.75e-01 0.0332 0.116 0.115 DC L1
ENSG00000116205 TCEANC2 972658 sc-eQTL 2.73e-01 -0.143 0.13 0.115 DC L1
ENSG00000116209 TMEM59 972738 sc-eQTL 2.10e-01 0.128 0.102 0.115 DC L1
ENSG00000116221 MRPL37 842201 sc-eQTL 8.44e-02 0.237 0.137 0.115 DC L1
ENSG00000157216 SSBP3 612763 sc-eQTL 1.01e-01 -0.201 0.122 0.115 DC L1
ENSG00000162390 ACOT11 483985 sc-eQTL 2.79e-01 0.128 0.118 0.115 DC L1
ENSG00000162402 USP24 -189122 sc-eQTL 2.95e-01 -0.0746 0.071 0.115 DC L1
ENSG00000215883 CYB5RL 826206 sc-eQTL 3.08e-01 0.131 0.128 0.115 DC L1
ENSG00000243725 TTC4 310381 sc-eQTL 6.83e-02 0.252 0.137 0.115 DC L1
ENSG00000116133 DHCR24 139047 sc-eQTL 7.39e-01 0.0279 0.0837 0.115 Mono L1
ENSG00000116205 TCEANC2 972658 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0403 0.0902 0.115 Mono L1
ENSG00000116209 TMEM59 972738 sc-eQTL 6.82e-02 0.122 0.0665 0.115 Mono L1
ENSG00000116221 MRPL37 842201 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0154 0.112 0.115 Mono L1
ENSG00000157216 SSBP3 612763 sc-eQTL 3.10e-01 0.13 0.128 0.115 Mono L1
ENSG00000162402 USP24 -189122 sc-eQTL 5.09e-02 -0.149 0.0759 0.115 Mono L1
ENSG00000243725 TTC4 310381 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0824 0.135 0.115 Mono L1
ENSG00000006555 TTC22 224919 sc-eQTL 9.40e-02 0.188 0.112 0.116 NK L1
ENSG00000116133 DHCR24 139047 sc-eQTL 1.25e-01 -0.174 0.113 0.116 NK L1
ENSG00000116205 TCEANC2 972658 sc-eQTL 4.97e-01 -0.076 0.112 0.116 NK L1
ENSG00000116209 TMEM59 972738 sc-eQTL 6.16e-01 -0.044 0.0877 0.116 NK L1
ENSG00000116221 MRPL37 842201 sc-eQTL 7.80e-01 0.0305 0.109 0.116 NK L1
ENSG00000157216 SSBP3 612763 sc-eQTL 7.28e-01 0.0329 0.0946 0.116 NK L1
ENSG00000162398 LEXM 220179 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0374 0.106 0.116 NK L1
ENSG00000162402 USP24 -189122 sc-eQTL 3.82e-02 -0.133 0.0637 0.116 NK L1
ENSG00000243725 TTC4 310381 sc-eQTL 3.91e-01 -0.105 0.121 0.116 NK L1
ENSG00000006555 TTC22 224919 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0264 0.1 0.115 Other_T L1
ENSG00000116133 DHCR24 139047 sc-eQTL 2.94e-01 -0.0818 0.0777 0.115 Other_T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 972658 sc-eQTL 9.40e-01 0.00882 0.117 0.115 Other_T L1
ENSG00000116209 TMEM59 972738 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0456 0.0799 0.115 Other_T L1
ENSG00000116221 MRPL37 842201 sc-eQTL 4.20e-02 0.152 0.0742 0.115 Other_T L1
ENSG00000157216 SSBP3 612763 sc-eQTL 3.35e-01 -0.0836 0.0865 0.115 Other_T L1
ENSG00000162402 USP24 -189122 sc-eQTL 4.17e-01 0.0749 0.0921 0.115 Other_T L1
ENSG00000215883 CYB5RL 826206 sc-eQTL 3.45e-01 0.119 0.126 0.115 Other_T L1
ENSG00000243725 TTC4 310381 sc-eQTL 1.27e-01 -0.192 0.125 0.115 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 224919 sc-eQTL 1.91e-01 0.134 0.102 0.115 B_Activated L2
ENSG00000116133 DHCR24 139047 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0663 0.121 0.115 B_Activated L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972658 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0765 0.13 0.115 B_Activated L2
ENSG00000116209 TMEM59 972738 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0828 0.138 0.115 B_Activated L2
ENSG00000116221 MRPL37 842201 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0606 0.149 0.115 B_Activated L2
ENSG00000157216 SSBP3 612763 sc-eQTL 4.27e-01 -0.107 0.135 0.115 B_Activated L2
ENSG00000162402 USP24 -189122 sc-eQTL 6.54e-01 0.059 0.132 0.115 B_Activated L2
ENSG00000215883 CYB5RL 826206 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0637 0.116 0.115 B_Activated L2
ENSG00000243725 TTC4 310381 sc-eQTL 5.16e-01 0.082 0.126 0.115 B_Activated L2
ENSG00000006555 TTC22 224919 sc-eQTL 2.87e-01 0.143 0.134 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000116133 DHCR24 139047 sc-eQTL 7.57e-01 0.0386 0.124 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972658 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0541 0.124 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000116209 TMEM59 972738 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00427 0.106 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000116221 MRPL37 842201 sc-eQTL 1.16e-01 0.196 0.124 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000157216 SSBP3 612763 sc-eQTL 5.87e-02 -0.22 0.116 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000162402 USP24 -189122 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0601 0.0981 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000215883 CYB5RL 826206 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0576 0.139 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000243725 TTC4 310381 sc-eQTL 7.68e-01 0.0373 0.126 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000006555 TTC22 224919 sc-eQTL 1.81e-01 -0.174 0.13 0.116 B_Memory L2
ENSG00000116133 DHCR24 139047 sc-eQTL 3.45e-01 -0.122 0.129 0.116 B_Memory L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972658 sc-eQTL 7.08e-01 0.0518 0.138 0.116 B_Memory L2
ENSG00000116209 TMEM59 972738 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0611 0.115 0.116 B_Memory L2
ENSG00000116221 MRPL37 842201 sc-eQTL 1.16e-01 0.183 0.116 0.116 B_Memory L2
ENSG00000157216 SSBP3 612763 sc-eQTL 3.16e-01 -0.109 0.109 0.116 B_Memory L2
ENSG00000162402 USP24 -189122 sc-eQTL 7.85e-01 0.0291 0.107 0.116 B_Memory L2
ENSG00000215883 CYB5RL 826206 sc-eQTL 3.61e-02 -0.275 0.131 0.116 B_Memory L2
ENSG00000243725 TTC4 310381 sc-eQTL 1.44e-01 0.2 0.136 0.116 B_Memory L2
ENSG00000006555 TTC22 224919 sc-eQTL 8.92e-02 -0.225 0.132 0.115 B_Naive1 L2
ENSG00000116133 DHCR24 139047 sc-eQTL 6.95e-01 -0.049 0.125 0.115 B_Naive1 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972658 sc-eQTL 6.22e-01 0.0549 0.111 0.115 B_Naive1 L2
ENSG00000116209 TMEM59 972738 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0397 0.0808 0.115 B_Naive1 L2
ENSG00000116221 MRPL37 842201 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0178 0.119 0.115 B_Naive1 L2
ENSG00000157216 SSBP3 612763 sc-eQTL 1.83e-01 -0.151 0.113 0.115 B_Naive1 L2
ENSG00000162402 USP24 -189122 sc-eQTL 9.80e-01 0.00226 0.0894 0.115 B_Naive1 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 826206 sc-eQTL 4.49e-02 0.27 0.134 0.115 B_Naive1 L2
ENSG00000243725 TTC4 310381 sc-eQTL 8.67e-01 0.0204 0.122 0.115 B_Naive1 L2
ENSG00000006555 TTC22 224919 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0975 0.134 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000116133 DHCR24 139047 sc-eQTL 2.98e-01 -0.122 0.117 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972658 sc-eQTL 1.57e-01 0.183 0.129 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000116209 TMEM59 972738 sc-eQTL 1.50e-01 0.154 0.106 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000116221 MRPL37 842201 sc-eQTL 5.97e-01 0.0666 0.126 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000157216 SSBP3 612763 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0418 0.124 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000162402 USP24 -189122 sc-eQTL 8.08e-02 -0.171 0.0975 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 826206 sc-eQTL 3.83e-01 -0.121 0.138 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000243725 TTC4 310381 sc-eQTL 4.81e-01 0.101 0.144 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000006555 TTC22 224919 sc-eQTL 6.04e-01 0.0641 0.123 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972658 sc-eQTL 8.31e-01 0.0271 0.127 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 972738 sc-eQTL 1.64e-01 0.161 0.115 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 842201 sc-eQTL 8.13e-02 0.247 0.141 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 612763 sc-eQTL 1.79e-01 -0.117 0.087 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -189122 sc-eQTL 2.47e-01 -0.139 0.12 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 310381 sc-eQTL 4.06e-01 0.112 0.134 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 224919 sc-eQTL 6.81e-01 0.0477 0.116 0.115 CD4_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972658 sc-eQTL 7.68e-01 -0.026 0.0881 0.115 CD4_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 972738 sc-eQTL 9.19e-01 -0.00876 0.0857 0.115 CD4_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 842201 sc-eQTL 8.93e-01 0.0149 0.11 0.115 CD4_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 612763 sc-eQTL 3.09e-01 0.0896 0.0879 0.115 CD4_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -189122 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0385 0.076 0.115 CD4_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 310381 sc-eQTL 2.40e-01 -0.136 0.116 0.115 CD4_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 224919 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0859 0.12 0.115 CD4_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972658 sc-eQTL 4.85e-01 0.082 0.117 0.115 CD4_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 972738 sc-eQTL 9.38e-01 0.00685 0.0884 0.115 CD4_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 842201 sc-eQTL 7.54e-01 0.0348 0.111 0.115 CD4_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 612763 sc-eQTL 3.32e-01 -0.106 0.109 0.115 CD4_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -189122 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0761 0.0902 0.115 CD4_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 310381 sc-eQTL 9.99e-02 -0.214 0.129 0.115 CD4_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 224919 sc-eQTL 4.49e-01 -0.103 0.136 0.115 CD4_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972658 sc-eQTL 2.70e-01 -0.142 0.129 0.115 CD4_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 972738 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0399 0.1 0.115 CD4_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 842201 sc-eQTL 3.69e-01 0.116 0.128 0.115 CD4_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 612763 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0653 0.11 0.115 CD4_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -189122 sc-eQTL 2.51e-01 -0.115 0.1 0.115 CD4_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 310381 sc-eQTL 5.93e-01 0.071 0.133 0.115 CD4_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 224919 sc-eQTL 6.26e-01 0.0535 0.109 0.115 CD8_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972658 sc-eQTL 2.42e-01 -0.142 0.121 0.115 CD8_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 972738 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0159 0.105 0.115 CD8_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 842201 sc-eQTL 2.88e-01 0.133 0.125 0.115 CD8_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 612763 sc-eQTL 2.78e-01 -0.0927 0.0852 0.115 CD8_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -189122 sc-eQTL 4.10e-02 -0.173 0.0841 0.115 CD8_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 310381 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00992 0.127 0.115 CD8_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 224919 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0579 0.121 0.115 CD8_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972658 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0635 0.11 0.115 CD8_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 972738 sc-eQTL 3.52e-01 -0.1 0.107 0.115 CD8_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 842201 sc-eQTL 5.60e-01 0.0752 0.129 0.115 CD8_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 612763 sc-eQTL 3.18e-01 0.0973 0.0973 0.115 CD8_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -189122 sc-eQTL 4.65e-01 0.0649 0.0886 0.115 CD8_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 310381 sc-eQTL 6.83e-01 -0.053 0.13 0.115 CD8_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 224919 sc-eQTL 6.00e-01 0.0696 0.132 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972658 sc-eQTL 2.26e-01 0.161 0.133 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 972738 sc-eQTL 1.99e-01 0.15 0.117 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 842201 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0761 0.133 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 612763 sc-eQTL 3.44e-01 -0.109 0.115 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -189122 sc-eQTL 9.85e-01 -0.0021 0.112 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 310381 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0759 0.136 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 224919 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0491 0.127 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972658 sc-eQTL 4.21e-01 0.107 0.132 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 972738 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000825 0.128 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 842201 sc-eQTL 8.09e-01 0.0314 0.13 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 612763 sc-eQTL 9.51e-01 0.0075 0.123 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -189122 sc-eQTL 6.69e-01 0.0552 0.129 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 310381 sc-eQTL 4.72e-01 0.0945 0.131 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 224919 sc-eQTL 4.37e-01 0.092 0.118 0.117 MAIT L2
ENSG00000116133 DHCR24 139047 sc-eQTL 9.67e-01 0.00365 0.0875 0.117 MAIT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972658 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0548 0.123 0.117 MAIT L2
ENSG00000116209 TMEM59 972738 sc-eQTL 9.25e-01 0.0105 0.111 0.117 MAIT L2
ENSG00000116221 MRPL37 842201 sc-eQTL 1.96e-01 0.175 0.135 0.117 MAIT L2
ENSG00000157216 SSBP3 612763 sc-eQTL 2.22e-02 -0.273 0.118 0.117 MAIT L2
ENSG00000162402 USP24 -189122 sc-eQTL 3.26e-01 0.104 0.106 0.117 MAIT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 826206 sc-eQTL 2.74e-01 0.135 0.123 0.117 MAIT L2
ENSG00000243725 TTC4 310381 sc-eQTL 3.78e-01 -0.109 0.123 0.117 MAIT L2
ENSG00000006555 TTC22 224919 sc-eQTL 8.79e-01 0.0208 0.137 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000116133 DHCR24 139047 sc-eQTL 8.87e-01 0.0171 0.121 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972658 sc-eQTL 3.00e-01 0.132 0.127 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000116209 TMEM59 972738 sc-eQTL 7.78e-01 0.035 0.124 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000116221 MRPL37 842201 sc-eQTL 1.03e-02 0.354 0.137 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000157216 SSBP3 612763 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0814 0.105 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000162398 LEXM 220179 sc-eQTL 3.05e-01 -0.127 0.123 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000162402 USP24 -189122 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0871 0.106 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000243725 TTC4 310381 sc-eQTL 7.51e-01 0.0425 0.134 0.113 NK_CD56bright L2
ENSG00000006555 TTC22 224919 sc-eQTL 5.56e-02 0.217 0.113 0.116 NK_CD56dim L2
ENSG00000116133 DHCR24 139047 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0536 0.118 0.116 NK_CD56dim L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972658 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0372 0.128 0.116 NK_CD56dim L2
ENSG00000116209 TMEM59 972738 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0405 0.0951 0.116 NK_CD56dim L2
ENSG00000116221 MRPL37 842201 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0639 0.124 0.116 NK_CD56dim L2
ENSG00000157216 SSBP3 612763 sc-eQTL 6.31e-01 0.0488 0.101 0.116 NK_CD56dim L2
ENSG00000162398 LEXM 220179 sc-eQTL 4.00e-01 -0.098 0.116 0.116 NK_CD56dim L2
ENSG00000162402 USP24 -189122 sc-eQTL 3.16e-01 -0.0742 0.0739 0.116 NK_CD56dim L2
ENSG00000243725 TTC4 310381 sc-eQTL 9.40e-02 -0.212 0.126 0.116 NK_CD56dim L2
ENSG00000006555 TTC22 224919 sc-eQTL 1.24e-02 0.354 0.14 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000116133 DHCR24 139047 sc-eQTL 3.76e-01 -0.123 0.139 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972658 sc-eQTL 6.55e-01 0.06 0.134 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000116209 TMEM59 972738 sc-eQTL 8.48e-01 0.0256 0.133 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000116221 MRPL37 842201 sc-eQTL 6.35e-01 0.0697 0.147 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000157216 SSBP3 612763 sc-eQTL 9.33e-01 0.01 0.12 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000162398 LEXM 220179 sc-eQTL 5.66e-01 0.0776 0.135 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000162402 USP24 -189122 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0145 0.0991 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000243725 TTC4 310381 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0354 0.148 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000006555 TTC22 224919 sc-eQTL 6.61e-01 0.0528 0.12 0.116 NK_cytokine L2
ENSG00000116133 DHCR24 139047 sc-eQTL 7.53e-02 -0.216 0.121 0.116 NK_cytokine L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972658 sc-eQTL 3.79e-02 -0.249 0.119 0.116 NK_cytokine L2
ENSG00000116209 TMEM59 972738 sc-eQTL 7.14e-01 0.036 0.098 0.116 NK_cytokine L2
ENSG00000116221 MRPL37 842201 sc-eQTL 3.42e-01 0.115 0.121 0.116 NK_cytokine L2
ENSG00000157216 SSBP3 612763 sc-eQTL 9.20e-02 0.17 0.101 0.116 NK_cytokine L2
ENSG00000162398 LEXM 220179 sc-eQTL 9.59e-01 -0.0065 0.127 0.116 NK_cytokine L2
ENSG00000162402 USP24 -189122 sc-eQTL 1.02e-02 -0.22 0.085 0.116 NK_cytokine L2
ENSG00000243725 TTC4 310381 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0234 0.128 0.116 NK_cytokine L2
ENSG00000006555 TTC22 224919 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0322 0.147 0.115 PB L2
ENSG00000116133 DHCR24 139047 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0722 0.13 0.115 PB L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972658 sc-eQTL 1.39e-01 -0.234 0.157 0.115 PB L2
ENSG00000116209 TMEM59 972738 sc-eQTL 8.81e-01 -0.00993 0.0662 0.115 PB L2
ENSG00000116221 MRPL37 842201 sc-eQTL 6.61e-01 -0.053 0.12 0.115 PB L2
ENSG00000157216 SSBP3 612763 sc-eQTL 2.68e-01 -0.154 0.138 0.115 PB L2
ENSG00000162402 USP24 -189122 sc-eQTL 9.18e-01 0.0163 0.158 0.115 PB L2
ENSG00000215883 CYB5RL 826206 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0565 0.164 0.115 PB L2
ENSG00000243725 TTC4 310381 sc-eQTL 2.05e-01 0.194 0.152 0.115 PB L2
ENSG00000006555 TTC22 224919 sc-eQTL 3.15e-01 -0.125 0.124 0.115 Pro_T L2
ENSG00000116133 DHCR24 139047 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0605 0.106 0.115 Pro_T L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972658 sc-eQTL 6.25e-01 0.0632 0.129 0.115 Pro_T L2
ENSG00000116209 TMEM59 972738 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0673 0.0894 0.115 Pro_T L2
ENSG00000116221 MRPL37 842201 sc-eQTL 7.69e-02 0.155 0.087 0.115 Pro_T L2
ENSG00000157216 SSBP3 612763 sc-eQTL 9.23e-01 0.00946 0.0984 0.115 Pro_T L2
ENSG00000162402 USP24 -189122 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0534 0.12 0.115 Pro_T L2
ENSG00000215883 CYB5RL 826206 sc-eQTL 6.64e-01 0.0515 0.118 0.115 Pro_T L2
ENSG00000243725 TTC4 310381 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0853 0.132 0.115 Pro_T L2
ENSG00000006555 TTC22 224919 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0337 0.121 0.115 Treg L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972658 sc-eQTL 2.29e-01 0.156 0.129 0.115 Treg L2
ENSG00000116209 TMEM59 972738 sc-eQTL 4.09e-01 0.0848 0.102 0.115 Treg L2
ENSG00000116221 MRPL37 842201 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0612 0.127 0.115 Treg L2
ENSG00000157216 SSBP3 612763 sc-eQTL 1.78e-01 -0.153 0.113 0.115 Treg L2
ENSG00000162402 USP24 -189122 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0595 0.108 0.115 Treg L2
ENSG00000243725 TTC4 310381 sc-eQTL 5.43e-01 0.0828 0.136 0.115 Treg L2
ENSG00000116133 DHCR24 139047 sc-eQTL 4.48e-01 0.0858 0.113 0.112 cDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972658 sc-eQTL 4.90e-02 -0.261 0.132 0.112 cDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 972738 sc-eQTL 3.51e-01 0.106 0.113 0.112 cDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 842201 sc-eQTL 6.40e-01 0.0677 0.145 0.112 cDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 612763 sc-eQTL 4.13e-01 -0.109 0.133 0.112 cDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 483985 sc-eQTL 4.00e-01 0.104 0.124 0.112 cDC L2
ENSG00000162402 USP24 -189122 sc-eQTL 4.33e-02 -0.28 0.138 0.112 cDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 826206 sc-eQTL 3.16e-01 0.12 0.119 0.112 cDC L2
ENSG00000243725 TTC4 310381 sc-eQTL 1.70e-01 0.196 0.142 0.112 cDC L2
ENSG00000116133 DHCR24 139047 sc-eQTL 9.37e-01 0.00643 0.0807 0.115 cMono_IL1B L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972658 sc-eQTL 5.24e-01 0.0714 0.112 0.115 cMono_IL1B L2
ENSG00000116209 TMEM59 972738 sc-eQTL 3.92e-01 0.0582 0.0679 0.115 cMono_IL1B L2
ENSG00000116221 MRPL37 842201 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0193 0.121 0.115 cMono_IL1B L2
ENSG00000157216 SSBP3 612763 sc-eQTL 8.54e-01 0.0227 0.124 0.115 cMono_IL1B L2
ENSG00000162402 USP24 -189122 sc-eQTL 2.74e-01 -0.0999 0.0911 0.115 cMono_IL1B L2
ENSG00000243725 TTC4 310381 sc-eQTL 9.69e-01 0.00549 0.14 0.115 cMono_IL1B L2
ENSG00000116133 DHCR24 139047 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0317 0.0758 0.115 cMono_S100A L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972658 sc-eQTL 1.18e-01 -0.181 0.115 0.115 cMono_S100A L2
ENSG00000116209 TMEM59 972738 sc-eQTL 1.02e-01 0.151 0.092 0.115 cMono_S100A L2
ENSG00000116221 MRPL37 842201 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0964 0.134 0.115 cMono_S100A L2
ENSG00000157216 SSBP3 612763 sc-eQTL 7.75e-01 0.0397 0.139 0.115 cMono_S100A L2
ENSG00000162402 USP24 -189122 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0558 0.112 0.115 cMono_S100A L2
ENSG00000243725 TTC4 310381 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0355 0.141 0.115 cMono_S100A L2
ENSG00000006555 TTC22 224919 sc-eQTL 2.74e-01 -0.147 0.134 0.124 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 139047 sc-eQTL 3.01e-01 -0.155 0.149 0.124 gdT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972658 sc-eQTL 7.31e-01 0.0519 0.15 0.124 gdT L2
ENSG00000116209 TMEM59 972738 sc-eQTL 6.22e-01 0.0754 0.153 0.124 gdT L2
ENSG00000116221 MRPL37 842201 sc-eQTL 2.13e-01 0.218 0.174 0.124 gdT L2
ENSG00000157216 SSBP3 612763 sc-eQTL 2.63e-01 0.12 0.107 0.124 gdT L2
ENSG00000162402 USP24 -189122 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0294 0.144 0.124 gdT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 826206 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0176 0.15 0.124 gdT L2
ENSG00000243725 TTC4 310381 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0639 0.169 0.124 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 139047 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0476 0.101 0.113 intMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972658 sc-eQTL 4.20e-01 0.101 0.125 0.113 intMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 972738 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0108 0.0921 0.113 intMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 842201 sc-eQTL 7.39e-01 0.0471 0.141 0.113 intMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 612763 sc-eQTL 2.27e-01 0.174 0.143 0.113 intMono L2
ENSG00000162402 USP24 -189122 sc-eQTL 2.81e-01 0.138 0.128 0.113 intMono L2
ENSG00000243725 TTC4 310381 sc-eQTL 7.51e-01 0.0433 0.137 0.113 intMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 139047 sc-eQTL 6.12e-01 0.0514 0.101 0.109 ncMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972658 sc-eQTL 6.18e-01 0.0633 0.127 0.109 ncMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 972738 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00391 0.101 0.109 ncMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 842201 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0306 0.131 0.109 ncMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 612763 sc-eQTL 4.12e-01 0.117 0.143 0.109 ncMono L2
ENSG00000162402 USP24 -189122 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0913 0.114 0.109 ncMono L2
ENSG00000243725 TTC4 310381 sc-eQTL 9.44e-01 0.00959 0.135 0.109 ncMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 139047 sc-eQTL 5.83e-01 0.0667 0.121 0.116 pDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972658 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0454 0.146 0.116 pDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 972738 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0174 0.116 0.116 pDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 842201 sc-eQTL 3.15e-02 0.331 0.152 0.116 pDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 612763 sc-eQTL 1.78e-03 -0.423 0.133 0.116 pDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 483985 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0526 0.0576 0.116 pDC L2
ENSG00000162402 USP24 -189122 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0774 0.0973 0.116 pDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 826206 sc-eQTL 7.10e-01 0.0497 0.133 0.116 pDC L2
ENSG00000243725 TTC4 310381 sc-eQTL 7.43e-01 0.0506 0.154 0.116 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 224919 sc-eQTL 9.16e-01 0.0137 0.131 0.115 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 139047 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0771 0.131 0.115 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 972658 sc-eQTL 5.97e-01 -0.067 0.127 0.115 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 972738 sc-eQTL 3.25e-01 -0.097 0.0984 0.115 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 842201 sc-eQTL 1.87e-02 0.276 0.117 0.115 B_Memory LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 612763 sc-eQTL 2.71e-02 -0.226 0.101 0.115 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -189122 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0267 0.0936 0.115 B_Memory LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 826206 sc-eQTL 1.07e-01 -0.232 0.143 0.115 B_Memory LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 310381 sc-eQTL 1.15e-01 0.203 0.128 0.115 B_Memory LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 224919 sc-eQTL 5.58e-02 -0.258 0.134 0.115 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 139047 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0958 0.122 0.115 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 972658 sc-eQTL 3.01e-01 0.114 0.11 0.115 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 972738 sc-eQTL 7.21e-01 0.028 0.0782 0.115 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 842201 sc-eQTL 9.02e-01 0.0139 0.112 0.115 B_Naive LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 612763 sc-eQTL 2.77e-01 -0.109 0.1 0.115 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -189122 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0442 0.0862 0.115 B_Naive LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 826206 sc-eQTL 2.53e-01 0.156 0.136 0.115 B_Naive LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 310381 sc-eQTL 7.81e-01 0.0358 0.128 0.115 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 139047 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00662 0.0778 0.115 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 972658 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0192 0.0974 0.115 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 972738 sc-eQTL 1.67e-01 0.0928 0.0669 0.115 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 842201 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0364 0.119 0.115 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 612763 sc-eQTL 5.52e-01 0.0741 0.124 0.115 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -189122 sc-eQTL 1.44e-01 -0.124 0.0846 0.115 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 310381 sc-eQTL 9.59e-01 0.00726 0.141 0.115 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 139047 sc-eQTL 6.91e-01 0.0385 0.0969 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 972658 sc-eQTL 2.22e-01 0.155 0.127 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 972738 sc-eQTL 8.32e-01 0.0201 0.0947 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 842201 sc-eQTL 4.74e-01 0.0929 0.13 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 612763 sc-eQTL 1.50e-01 0.199 0.138 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -189122 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00322 0.109 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 310381 sc-eQTL 6.53e-01 0.0615 0.137 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 224919 sc-eQTL 4.97e-02 0.216 0.109 0.116 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 139047 sc-eQTL 1.78e-01 -0.155 0.115 0.116 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 972658 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0769 0.113 0.116 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 972738 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0574 0.0873 0.116 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 842201 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0333 0.117 0.116 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 612763 sc-eQTL 6.30e-01 0.0463 0.096 0.116 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162398 LEXM 220179 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00621 0.108 0.116 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -189122 sc-eQTL 2.50e-02 -0.153 0.0678 0.116 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 310381 sc-eQTL 2.87e-01 -0.13 0.122 0.116 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000169174 \N -13306 1.95e-05 2.63e-05 3.08e-06 1.21e-05 3.2e-06 8.4e-06 2.59e-05 3.4e-06 1.88e-05 9.47e-06 2.74e-05 8.78e-06 3.56e-05 8.91e-06 5.22e-06 1.14e-05 9.2e-06 1.59e-05 5.69e-06 4.17e-06 8.72e-06 2e-05 1.93e-05 4.97e-06 3.11e-05 5.37e-06 8.52e-06 8.12e-06 1.95e-05 1.63e-05 1.46e-05 1.17e-06 1.42e-06 4.49e-06 7.96e-06 3.83e-06 1.79e-06 2.72e-06 2.65e-06 2.69e-06 1.07e-06 2.92e-05 2.7e-06 2.52e-07 1.55e-06 2.68e-06 2.95e-06 9.54e-07 9.75e-07