logo

Genes within 1Mb (chr1:55026180:A:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 224857 sc-eQTL 1.28e-01 -0.192 0.126 0.113 B L1
ENSG00000116133 DHCR24 138985 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0975 0.12 0.113 B L1
ENSG00000116205 TCEANC2 972596 sc-eQTL 5.73e-01 0.0583 0.103 0.113 B L1
ENSG00000116209 TMEM59 972676 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0348 0.0629 0.113 B L1
ENSG00000116221 MRPL37 842139 sc-eQTL 2.94e-01 0.0865 0.0822 0.113 B L1
ENSG00000157216 SSBP3 612701 sc-eQTL 1.69e-03 -0.268 0.0843 0.113 B L1
ENSG00000162402 USP24 -189184 sc-eQTL 2.30e-01 -0.0876 0.0728 0.113 B L1
ENSG00000215883 CYB5RL 826144 sc-eQTL 8.49e-01 0.0268 0.141 0.113 B L1
ENSG00000243725 TTC4 310319 sc-eQTL 6.38e-01 0.0577 0.122 0.113 B L1
ENSG00000006555 TTC22 224857 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0775 0.0985 0.113 CD4T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 972596 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0125 0.0806 0.113 CD4T L1
ENSG00000116209 TMEM59 972676 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0527 0.075 0.113 CD4T L1
ENSG00000116221 MRPL37 842139 sc-eQTL 3.59e-01 0.0952 0.104 0.113 CD4T L1
ENSG00000157216 SSBP3 612701 sc-eQTL 2.73e-01 -0.0945 0.086 0.113 CD4T L1
ENSG00000162402 USP24 -189184 sc-eQTL 2.22e-01 -0.0858 0.07 0.113 CD4T L1
ENSG00000243725 TTC4 310319 sc-eQTL 2.85e-01 -0.113 0.105 0.113 CD4T L1
ENSG00000006555 TTC22 224857 sc-eQTL 5.89e-01 0.0454 0.0839 0.113 CD8T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 972596 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0729 0.104 0.113 CD8T L1
ENSG00000116209 TMEM59 972676 sc-eQTL 3.21e-01 -0.0721 0.0724 0.113 CD8T L1
ENSG00000116221 MRPL37 842139 sc-eQTL 5.20e-01 0.0643 0.0998 0.113 CD8T L1
ENSG00000157216 SSBP3 612701 sc-eQTL 1.52e-01 -0.103 0.0714 0.113 CD8T L1
ENSG00000162402 USP24 -189184 sc-eQTL 1.81e-01 -0.0928 0.0691 0.113 CD8T L1
ENSG00000243725 TTC4 310319 sc-eQTL 8.40e-01 0.0244 0.12 0.113 CD8T L1
ENSG00000116133 DHCR24 138985 sc-eQTL 8.97e-01 0.0152 0.118 0.11 DC L1
ENSG00000116205 TCEANC2 972596 sc-eQTL 3.20e-01 -0.131 0.132 0.11 DC L1
ENSG00000116209 TMEM59 972676 sc-eQTL 1.84e-01 0.138 0.103 0.11 DC L1
ENSG00000116221 MRPL37 842139 sc-eQTL 9.20e-02 0.235 0.139 0.11 DC L1
ENSG00000157216 SSBP3 612701 sc-eQTL 1.19e-01 -0.194 0.124 0.11 DC L1
ENSG00000162390 ACOT11 483923 sc-eQTL 2.57e-01 0.135 0.119 0.11 DC L1
ENSG00000162402 USP24 -189184 sc-eQTL 1.57e-01 -0.102 0.0718 0.11 DC L1
ENSG00000215883 CYB5RL 826144 sc-eQTL 1.94e-01 0.17 0.13 0.11 DC L1
ENSG00000243725 TTC4 310319 sc-eQTL 6.90e-02 0.255 0.139 0.11 DC L1
ENSG00000116133 DHCR24 138985 sc-eQTL 3.76e-01 0.0742 0.0837 0.113 Mono L1
ENSG00000116205 TCEANC2 972596 sc-eQTL 9.15e-01 -0.00962 0.0904 0.113 Mono L1
ENSG00000116209 TMEM59 972676 sc-eQTL 4.48e-02 0.134 0.0665 0.113 Mono L1
ENSG00000116221 MRPL37 842139 sc-eQTL 9.03e-01 0.0136 0.112 0.113 Mono L1
ENSG00000157216 SSBP3 612701 sc-eQTL 4.15e-01 0.105 0.129 0.113 Mono L1
ENSG00000162402 USP24 -189184 sc-eQTL 7.31e-02 -0.137 0.0761 0.113 Mono L1
ENSG00000243725 TTC4 310319 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0577 0.135 0.113 Mono L1
ENSG00000006555 TTC22 224857 sc-eQTL 8.93e-02 0.19 0.111 0.114 NK L1
ENSG00000116133 DHCR24 138985 sc-eQTL 8.87e-02 -0.192 0.113 0.114 NK L1
ENSG00000116205 TCEANC2 972596 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0844 0.112 0.114 NK L1
ENSG00000116209 TMEM59 972676 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0299 0.0875 0.114 NK L1
ENSG00000116221 MRPL37 842139 sc-eQTL 7.67e-01 0.0323 0.109 0.114 NK L1
ENSG00000157216 SSBP3 612701 sc-eQTL 6.47e-01 0.0433 0.0943 0.114 NK L1
ENSG00000162398 LEXM 220117 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00288 0.106 0.114 NK L1
ENSG00000162402 USP24 -189184 sc-eQTL 1.90e-02 -0.15 0.0634 0.114 NK L1
ENSG00000243725 TTC4 310319 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0955 0.121 0.114 NK L1
ENSG00000006555 TTC22 224857 sc-eQTL 9.24e-01 0.00965 0.101 0.113 Other_T L1
ENSG00000116133 DHCR24 138985 sc-eQTL 1.92e-01 -0.102 0.0779 0.113 Other_T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 972596 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00732 0.117 0.113 Other_T L1
ENSG00000116209 TMEM59 972676 sc-eQTL 4.11e-01 -0.066 0.0802 0.113 Other_T L1
ENSG00000116221 MRPL37 842139 sc-eQTL 5.23e-02 0.146 0.0745 0.113 Other_T L1
ENSG00000157216 SSBP3 612701 sc-eQTL 2.98e-01 -0.0905 0.0868 0.113 Other_T L1
ENSG00000162402 USP24 -189184 sc-eQTL 6.34e-01 0.0441 0.0926 0.113 Other_T L1
ENSG00000215883 CYB5RL 826144 sc-eQTL 3.41e-01 0.121 0.126 0.113 Other_T L1
ENSG00000243725 TTC4 310319 sc-eQTL 8.99e-02 -0.213 0.125 0.113 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 224857 sc-eQTL 2.08e-01 0.129 0.102 0.112 B_Activated L2
ENSG00000116133 DHCR24 138985 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0856 0.12 0.112 B_Activated L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972596 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0846 0.129 0.112 B_Activated L2
ENSG00000116209 TMEM59 972676 sc-eQTL 3.50e-01 -0.129 0.137 0.112 B_Activated L2
ENSG00000116221 MRPL37 842139 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0272 0.149 0.112 B_Activated L2
ENSG00000157216 SSBP3 612701 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0574 0.134 0.112 B_Activated L2
ENSG00000162402 USP24 -189184 sc-eQTL 5.63e-01 0.076 0.131 0.112 B_Activated L2
ENSG00000215883 CYB5RL 826144 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0633 0.116 0.112 B_Activated L2
ENSG00000243725 TTC4 310319 sc-eQTL 6.48e-01 0.0575 0.126 0.112 B_Activated L2
ENSG00000006555 TTC22 224857 sc-eQTL 3.61e-01 0.122 0.134 0.114 B_Intermediate L2
ENSG00000116133 DHCR24 138985 sc-eQTL 9.92e-01 -0.0012 0.124 0.114 B_Intermediate L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972596 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0588 0.124 0.114 B_Intermediate L2
ENSG00000116209 TMEM59 972676 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0195 0.106 0.114 B_Intermediate L2
ENSG00000116221 MRPL37 842139 sc-eQTL 1.39e-01 0.184 0.124 0.114 B_Intermediate L2
ENSG00000157216 SSBP3 612701 sc-eQTL 3.63e-02 -0.243 0.115 0.114 B_Intermediate L2
ENSG00000162402 USP24 -189184 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0506 0.098 0.114 B_Intermediate L2
ENSG00000215883 CYB5RL 826144 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00489 0.139 0.114 B_Intermediate L2
ENSG00000243725 TTC4 310319 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0227 0.126 0.114 B_Intermediate L2
ENSG00000006555 TTC22 224857 sc-eQTL 1.28e-01 -0.198 0.13 0.114 B_Memory L2
ENSG00000116133 DHCR24 138985 sc-eQTL 2.44e-01 -0.151 0.129 0.114 B_Memory L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972596 sc-eQTL 7.75e-01 0.0396 0.138 0.114 B_Memory L2
ENSG00000116209 TMEM59 972676 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0137 0.115 0.114 B_Memory L2
ENSG00000116221 MRPL37 842139 sc-eQTL 1.08e-01 0.188 0.116 0.114 B_Memory L2
ENSG00000157216 SSBP3 612701 sc-eQTL 1.65e-01 -0.151 0.109 0.114 B_Memory L2
ENSG00000162402 USP24 -189184 sc-eQTL 6.71e-01 0.0453 0.107 0.114 B_Memory L2
ENSG00000215883 CYB5RL 826144 sc-eQTL 2.56e-02 -0.293 0.13 0.114 B_Memory L2
ENSG00000243725 TTC4 310319 sc-eQTL 2.70e-01 0.151 0.136 0.114 B_Memory L2
ENSG00000006555 TTC22 224857 sc-eQTL 5.88e-02 -0.251 0.132 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000116133 DHCR24 138985 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0376 0.125 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972596 sc-eQTL 5.79e-01 0.0618 0.111 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000116209 TMEM59 972676 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0613 0.0807 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000116221 MRPL37 842139 sc-eQTL 8.97e-01 0.0154 0.119 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000157216 SSBP3 612701 sc-eQTL 1.07e-01 -0.183 0.113 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000162402 USP24 -189184 sc-eQTL 8.29e-01 0.0193 0.0894 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 826144 sc-eQTL 7.57e-02 0.239 0.134 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000243725 TTC4 310319 sc-eQTL 7.14e-01 0.0447 0.122 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000006555 TTC22 224857 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0953 0.135 0.114 B_Naive2 L2
ENSG00000116133 DHCR24 138985 sc-eQTL 3.92e-01 -0.101 0.117 0.114 B_Naive2 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972596 sc-eQTL 2.17e-01 0.161 0.13 0.114 B_Naive2 L2
ENSG00000116209 TMEM59 972676 sc-eQTL 7.44e-02 0.191 0.107 0.114 B_Naive2 L2
ENSG00000116221 MRPL37 842139 sc-eQTL 3.77e-01 0.112 0.126 0.114 B_Naive2 L2
ENSG00000157216 SSBP3 612701 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0149 0.125 0.114 B_Naive2 L2
ENSG00000162402 USP24 -189184 sc-eQTL 1.30e-01 -0.149 0.0982 0.114 B_Naive2 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 826144 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0915 0.139 0.114 B_Naive2 L2
ENSG00000243725 TTC4 310319 sc-eQTL 7.15e-01 0.0529 0.145 0.114 B_Naive2 L2
ENSG00000006555 TTC22 224857 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00237 0.123 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972596 sc-eQTL 5.77e-01 0.0708 0.127 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 972676 sc-eQTL 2.65e-01 0.129 0.115 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 842139 sc-eQTL 8.96e-02 0.24 0.141 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 612701 sc-eQTL 1.88e-01 -0.115 0.0869 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -189184 sc-eQTL 1.16e-01 -0.188 0.119 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 310319 sc-eQTL 3.82e-01 0.117 0.134 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 224857 sc-eQTL 6.21e-01 0.0572 0.116 0.113 CD4_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972596 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0406 0.088 0.113 CD4_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 972676 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0187 0.0856 0.113 CD4_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 842139 sc-eQTL 7.47e-01 0.0356 0.11 0.113 CD4_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 612701 sc-eQTL 4.10e-01 0.0727 0.088 0.113 CD4_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -189184 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0332 0.076 0.113 CD4_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 310319 sc-eQTL 2.55e-01 -0.132 0.116 0.113 CD4_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 224857 sc-eQTL 7.21e-01 -0.043 0.12 0.113 CD4_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972596 sc-eQTL 7.27e-01 0.0407 0.117 0.113 CD4_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 972676 sc-eQTL 8.12e-01 -0.021 0.0881 0.113 CD4_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 842139 sc-eQTL 5.04e-01 0.0741 0.111 0.113 CD4_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 612701 sc-eQTL 3.17e-01 -0.109 0.108 0.113 CD4_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -189184 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0557 0.0899 0.113 CD4_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 310319 sc-eQTL 1.56e-01 -0.184 0.129 0.113 CD4_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 224857 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0679 0.136 0.113 CD4_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972596 sc-eQTL 3.87e-01 -0.112 0.129 0.113 CD4_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 972676 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00556 0.1 0.113 CD4_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 842139 sc-eQTL 2.84e-01 0.138 0.129 0.113 CD4_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 612701 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0445 0.111 0.113 CD4_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -189184 sc-eQTL 2.45e-01 -0.117 0.1 0.113 CD4_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 310319 sc-eQTL 4.22e-01 0.107 0.133 0.113 CD4_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 224857 sc-eQTL 9.78e-01 0.003 0.11 0.113 CD8_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972596 sc-eQTL 2.46e-01 -0.141 0.121 0.113 CD8_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 972676 sc-eQTL 8.58e-01 -0.019 0.106 0.113 CD8_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 842139 sc-eQTL 2.03e-01 0.159 0.125 0.113 CD8_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 612701 sc-eQTL 2.54e-01 -0.0979 0.0855 0.113 CD8_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -189184 sc-eQTL 7.16e-03 -0.228 0.0838 0.113 CD8_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 310319 sc-eQTL 8.13e-01 0.0302 0.128 0.113 CD8_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 224857 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0398 0.121 0.113 CD8_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972596 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0589 0.11 0.113 CD8_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 972676 sc-eQTL 1.53e-01 -0.153 0.107 0.113 CD8_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 842139 sc-eQTL 6.59e-01 0.0569 0.129 0.113 CD8_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 612701 sc-eQTL 3.01e-01 0.101 0.0972 0.113 CD8_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -189184 sc-eQTL 4.20e-01 0.0715 0.0885 0.113 CD8_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 310319 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0516 0.13 0.113 CD8_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 224857 sc-eQTL 8.18e-01 0.0305 0.132 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972596 sc-eQTL 2.97e-01 0.139 0.133 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 972676 sc-eQTL 2.69e-01 0.13 0.117 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 842139 sc-eQTL 7.82e-01 0.0367 0.133 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 612701 sc-eQTL 2.51e-01 -0.132 0.115 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -189184 sc-eQTL 8.95e-01 0.0148 0.112 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 310319 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0398 0.136 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 224857 sc-eQTL 6.49e-01 -0.058 0.127 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972596 sc-eQTL 2.95e-01 0.139 0.133 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 972676 sc-eQTL 8.53e-01 0.0238 0.129 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 842139 sc-eQTL 3.90e-01 0.112 0.13 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 612701 sc-eQTL 9.12e-01 0.0136 0.123 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -189184 sc-eQTL 2.84e-01 0.139 0.13 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 310319 sc-eQTL 4.45e-01 0.101 0.132 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 224857 sc-eQTL 1.94e-01 0.154 0.118 0.115 MAIT L2
ENSG00000116133 DHCR24 138985 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0155 0.0878 0.115 MAIT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972596 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0557 0.124 0.115 MAIT L2
ENSG00000116209 TMEM59 972676 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0106 0.112 0.115 MAIT L2
ENSG00000116221 MRPL37 842139 sc-eQTL 2.73e-01 0.149 0.135 0.115 MAIT L2
ENSG00000157216 SSBP3 612701 sc-eQTL 2.96e-02 -0.26 0.119 0.115 MAIT L2
ENSG00000162402 USP24 -189184 sc-eQTL 4.69e-01 0.0775 0.107 0.115 MAIT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 826144 sc-eQTL 3.61e-01 0.113 0.124 0.115 MAIT L2
ENSG00000243725 TTC4 310319 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0762 0.123 0.115 MAIT L2
ENSG00000006555 TTC22 224857 sc-eQTL 9.10e-01 0.0155 0.137 0.111 NK_CD56bright L2
ENSG00000116133 DHCR24 138985 sc-eQTL 9.81e-01 0.00291 0.121 0.111 NK_CD56bright L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972596 sc-eQTL 1.74e-01 0.174 0.127 0.111 NK_CD56bright L2
ENSG00000116209 TMEM59 972676 sc-eQTL 8.45e-01 0.0244 0.125 0.111 NK_CD56bright L2
ENSG00000116221 MRPL37 842139 sc-eQTL 2.47e-02 0.311 0.138 0.111 NK_CD56bright L2
ENSG00000157216 SSBP3 612701 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0936 0.105 0.111 NK_CD56bright L2
ENSG00000162398 LEXM 220117 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0729 0.124 0.111 NK_CD56bright L2
ENSG00000162402 USP24 -189184 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0929 0.106 0.111 NK_CD56bright L2
ENSG00000243725 TTC4 310319 sc-eQTL 8.80e-01 0.0203 0.134 0.111 NK_CD56bright L2
ENSG00000006555 TTC22 224857 sc-eQTL 3.56e-02 0.238 0.112 0.114 NK_CD56dim L2
ENSG00000116133 DHCR24 138985 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0826 0.118 0.114 NK_CD56dim L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972596 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0672 0.128 0.114 NK_CD56dim L2
ENSG00000116209 TMEM59 972676 sc-eQTL 6.67e-01 -0.041 0.0951 0.114 NK_CD56dim L2
ENSG00000116221 MRPL37 842139 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0231 0.124 0.114 NK_CD56dim L2
ENSG00000157216 SSBP3 612701 sc-eQTL 4.93e-01 0.0695 0.101 0.114 NK_CD56dim L2
ENSG00000162398 LEXM 220117 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0719 0.116 0.114 NK_CD56dim L2
ENSG00000162402 USP24 -189184 sc-eQTL 2.39e-01 -0.0871 0.0738 0.114 NK_CD56dim L2
ENSG00000243725 TTC4 310319 sc-eQTL 1.26e-01 -0.194 0.126 0.114 NK_CD56dim L2
ENSG00000006555 TTC22 224857 sc-eQTL 4.15e-02 0.289 0.141 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000116133 DHCR24 138985 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0978 0.139 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972596 sc-eQTL 6.73e-01 0.0566 0.134 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000116209 TMEM59 972676 sc-eQTL 5.18e-01 0.0862 0.133 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000116221 MRPL37 842139 sc-eQTL 5.52e-01 0.0874 0.147 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000157216 SSBP3 612701 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0232 0.12 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000162398 LEXM 220117 sc-eQTL 7.25e-01 0.0476 0.135 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000162402 USP24 -189184 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0624 0.099 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000243725 TTC4 310319 sc-eQTL 9.08e-01 0.0171 0.148 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000006555 TTC22 224857 sc-eQTL 5.97e-01 0.0636 0.12 0.114 NK_cytokine L2
ENSG00000116133 DHCR24 138985 sc-eQTL 5.15e-02 -0.236 0.121 0.114 NK_cytokine L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972596 sc-eQTL 4.74e-02 -0.239 0.12 0.114 NK_cytokine L2
ENSG00000116209 TMEM59 972676 sc-eQTL 5.77e-01 0.0548 0.0981 0.114 NK_cytokine L2
ENSG00000116221 MRPL37 842139 sc-eQTL 4.43e-01 0.0929 0.121 0.114 NK_cytokine L2
ENSG00000157216 SSBP3 612701 sc-eQTL 8.71e-02 0.173 0.101 0.114 NK_cytokine L2
ENSG00000162398 LEXM 220117 sc-eQTL 7.93e-01 0.0333 0.127 0.114 NK_cytokine L2
ENSG00000162402 USP24 -189184 sc-eQTL 5.01e-03 -0.241 0.0848 0.114 NK_cytokine L2
ENSG00000243725 TTC4 310319 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0548 0.128 0.114 NK_cytokine L2
ENSG00000006555 TTC22 224857 sc-eQTL 8.48e-01 -0.028 0.146 0.115 PB L2
ENSG00000116133 DHCR24 138985 sc-eQTL 2.28e-01 -0.156 0.129 0.115 PB L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972596 sc-eQTL 1.07e-01 -0.253 0.156 0.115 PB L2
ENSG00000116209 TMEM59 972676 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00317 0.0658 0.115 PB L2
ENSG00000116221 MRPL37 842139 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0342 0.12 0.115 PB L2
ENSG00000157216 SSBP3 612701 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0731 0.138 0.115 PB L2
ENSG00000162402 USP24 -189184 sc-eQTL 9.75e-01 0.00492 0.157 0.115 PB L2
ENSG00000215883 CYB5RL 826144 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0414 0.163 0.115 PB L2
ENSG00000243725 TTC4 310319 sc-eQTL 2.71e-01 0.167 0.151 0.115 PB L2
ENSG00000006555 TTC22 224857 sc-eQTL 3.75e-01 -0.111 0.125 0.113 Pro_T L2
ENSG00000116133 DHCR24 138985 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0908 0.106 0.113 Pro_T L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972596 sc-eQTL 3.98e-01 0.109 0.129 0.113 Pro_T L2
ENSG00000116209 TMEM59 972676 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0528 0.0898 0.113 Pro_T L2
ENSG00000116221 MRPL37 842139 sc-eQTL 2.91e-02 0.191 0.0871 0.113 Pro_T L2
ENSG00000157216 SSBP3 612701 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00299 0.0988 0.113 Pro_T L2
ENSG00000162402 USP24 -189184 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0194 0.12 0.113 Pro_T L2
ENSG00000215883 CYB5RL 826144 sc-eQTL 6.20e-01 0.0591 0.119 0.113 Pro_T L2
ENSG00000243725 TTC4 310319 sc-eQTL 1.78e-01 -0.178 0.132 0.113 Pro_T L2
ENSG00000006555 TTC22 224857 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0166 0.121 0.113 Treg L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972596 sc-eQTL 4.21e-01 0.104 0.13 0.113 Treg L2
ENSG00000116209 TMEM59 972676 sc-eQTL 5.72e-01 0.058 0.102 0.113 Treg L2
ENSG00000116221 MRPL37 842139 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0386 0.127 0.113 Treg L2
ENSG00000157216 SSBP3 612701 sc-eQTL 2.45e-01 -0.131 0.113 0.113 Treg L2
ENSG00000162402 USP24 -189184 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0919 0.108 0.113 Treg L2
ENSG00000243725 TTC4 310319 sc-eQTL 4.40e-01 0.105 0.136 0.113 Treg L2
ENSG00000116133 DHCR24 138985 sc-eQTL 5.26e-01 0.0725 0.114 0.107 cDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972596 sc-eQTL 3.90e-02 -0.277 0.133 0.107 cDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 972676 sc-eQTL 3.30e-01 0.112 0.114 0.107 cDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 842139 sc-eQTL 4.60e-01 0.108 0.146 0.107 cDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 612701 sc-eQTL 4.05e-01 -0.113 0.135 0.107 cDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 483923 sc-eQTL 3.62e-01 0.114 0.125 0.107 cDC L2
ENSG00000162402 USP24 -189184 sc-eQTL 2.19e-02 -0.321 0.139 0.107 cDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 826144 sc-eQTL 2.23e-01 0.147 0.12 0.107 cDC L2
ENSG00000243725 TTC4 310319 sc-eQTL 1.90e-01 0.189 0.144 0.107 cDC L2
ENSG00000116133 DHCR24 138985 sc-eQTL 6.09e-01 0.0413 0.0806 0.113 cMono_IL1B L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972596 sc-eQTL 4.05e-01 0.0933 0.112 0.113 cMono_IL1B L2
ENSG00000116209 TMEM59 972676 sc-eQTL 5.49e-01 0.0408 0.0679 0.113 cMono_IL1B L2
ENSG00000116221 MRPL37 842139 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0416 0.121 0.113 cMono_IL1B L2
ENSG00000157216 SSBP3 612701 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0274 0.124 0.113 cMono_IL1B L2
ENSG00000162402 USP24 -189184 sc-eQTL 3.45e-01 -0.0863 0.0911 0.113 cMono_IL1B L2
ENSG00000243725 TTC4 310319 sc-eQTL 8.37e-01 0.0288 0.14 0.113 cMono_IL1B L2
ENSG00000116133 DHCR24 138985 sc-eQTL 9.59e-01 0.00394 0.0759 0.113 cMono_S100A L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972596 sc-eQTL 2.38e-01 -0.136 0.115 0.113 cMono_S100A L2
ENSG00000116209 TMEM59 972676 sc-eQTL 4.38e-02 0.186 0.0918 0.113 cMono_S100A L2
ENSG00000116221 MRPL37 842139 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0255 0.134 0.113 cMono_S100A L2
ENSG00000157216 SSBP3 612701 sc-eQTL 8.13e-01 0.033 0.139 0.113 cMono_S100A L2
ENSG00000162402 USP24 -189184 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0934 0.112 0.113 cMono_S100A L2
ENSG00000243725 TTC4 310319 sc-eQTL 9.22e-01 0.0137 0.141 0.113 cMono_S100A L2
ENSG00000006555 TTC22 224857 sc-eQTL 3.09e-01 -0.138 0.135 0.121 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 138985 sc-eQTL 2.98e-01 -0.157 0.151 0.121 gdT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972596 sc-eQTL 7.43e-01 0.0499 0.152 0.121 gdT L2
ENSG00000116209 TMEM59 972676 sc-eQTL 6.11e-01 0.0785 0.154 0.121 gdT L2
ENSG00000116221 MRPL37 842139 sc-eQTL 2.70e-01 0.195 0.176 0.121 gdT L2
ENSG00000157216 SSBP3 612701 sc-eQTL 2.29e-01 0.13 0.108 0.121 gdT L2
ENSG00000162402 USP24 -189184 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0519 0.145 0.121 gdT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 826144 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0242 0.151 0.121 gdT L2
ENSG00000243725 TTC4 310319 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0627 0.17 0.121 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 138985 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0316 0.102 0.109 intMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972596 sc-eQTL 2.68e-01 0.14 0.126 0.109 intMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 972676 sc-eQTL 7.63e-01 0.0281 0.0932 0.109 intMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 842139 sc-eQTL 6.33e-01 0.0682 0.142 0.109 intMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 612701 sc-eQTL 1.48e-01 0.21 0.145 0.109 intMono L2
ENSG00000162402 USP24 -189184 sc-eQTL 3.06e-01 0.133 0.129 0.109 intMono L2
ENSG00000243725 TTC4 310319 sc-eQTL 8.98e-01 0.0177 0.138 0.109 intMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 138985 sc-eQTL 6.24e-01 0.0502 0.102 0.104 ncMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972596 sc-eQTL 8.66e-01 0.0217 0.128 0.104 ncMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 972676 sc-eQTL 9.44e-01 0.00722 0.102 0.104 ncMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 842139 sc-eQTL 9.72e-01 0.00463 0.132 0.104 ncMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 612701 sc-eQTL 3.21e-01 0.143 0.144 0.104 ncMono L2
ENSG00000162402 USP24 -189184 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0409 0.115 0.104 ncMono L2
ENSG00000243725 TTC4 310319 sc-eQTL 8.75e-01 0.0215 0.137 0.104 ncMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 138985 sc-eQTL 5.99e-01 0.0652 0.124 0.11 pDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972596 sc-eQTL 1.00e+00 -4.26e-05 0.149 0.11 pDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 972676 sc-eQTL 9.00e-01 -0.015 0.119 0.11 pDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 842139 sc-eQTL 5.49e-02 0.301 0.156 0.11 pDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 612701 sc-eQTL 2.61e-03 -0.416 0.136 0.11 pDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 483923 sc-eQTL 3.77e-01 -0.052 0.0587 0.11 pDC L2
ENSG00000162402 USP24 -189184 sc-eQTL 2.68e-01 -0.11 0.099 0.11 pDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 826144 sc-eQTL 5.14e-01 0.0889 0.136 0.11 pDC L2
ENSG00000243725 TTC4 310319 sc-eQTL 6.59e-01 0.0694 0.157 0.11 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 224857 sc-eQTL 9.82e-01 -0.0029 0.13 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 138985 sc-eQTL 3.63e-01 -0.119 0.13 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 972596 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0737 0.126 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 972676 sc-eQTL 3.14e-01 -0.099 0.098 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 842139 sc-eQTL 2.22e-02 0.268 0.116 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 612701 sc-eQTL 1.31e-02 -0.252 0.101 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -189184 sc-eQTL 9.94e-01 0.000697 0.0933 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 826144 sc-eQTL 1.69e-01 -0.197 0.143 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 310319 sc-eQTL 3.71e-01 0.115 0.128 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 224857 sc-eQTL 3.19e-02 -0.29 0.134 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 138985 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0748 0.122 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 972596 sc-eQTL 2.86e-01 0.118 0.11 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 972676 sc-eQTL 7.15e-01 0.0287 0.0784 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 842139 sc-eQTL 5.63e-01 0.0653 0.113 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 612701 sc-eQTL 2.17e-01 -0.124 0.1 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -189184 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0266 0.0865 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 826144 sc-eQTL 2.68e-01 0.152 0.137 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 310319 sc-eQTL 8.12e-01 0.0308 0.129 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 138985 sc-eQTL 6.25e-01 0.0381 0.0778 0.113 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 972596 sc-eQTL 9.41e-01 0.00723 0.0974 0.113 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 972676 sc-eQTL 1.44e-01 0.098 0.0668 0.113 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 842139 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0181 0.119 0.113 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 612701 sc-eQTL 7.71e-01 0.0362 0.124 0.113 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -189184 sc-eQTL 1.39e-01 -0.126 0.0846 0.113 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 310319 sc-eQTL 7.08e-01 0.0529 0.141 0.113 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 138985 sc-eQTL 5.74e-01 0.0552 0.0979 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 972596 sc-eQTL 2.35e-01 0.153 0.128 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 972676 sc-eQTL 6.05e-01 0.0496 0.0957 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 842139 sc-eQTL 2.92e-01 0.138 0.131 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 612701 sc-eQTL 1.11e-01 0.223 0.139 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -189184 sc-eQTL 8.31e-01 0.0236 0.11 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 310319 sc-eQTL 7.14e-01 0.0507 0.138 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 224857 sc-eQTL 3.33e-02 0.234 0.109 0.114 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 138985 sc-eQTL 1.09e-01 -0.185 0.115 0.114 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 972596 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0962 0.113 0.114 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 972676 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0379 0.0874 0.114 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 842139 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0253 0.117 0.114 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 612701 sc-eQTL 5.17e-01 0.0624 0.096 0.114 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162398 LEXM 220117 sc-eQTL 8.56e-01 0.0196 0.108 0.114 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -189184 sc-eQTL 9.49e-03 -0.177 0.0676 0.114 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 310319 sc-eQTL 3.06e-01 -0.125 0.122 0.114 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000116205 TCEANC2 972596 eQTL 0.0136 -0.0609 0.0246 0.00229 0.0 0.111
ENSG00000169174 PCSK9 -13368 pQTL 0.0186 -0.0994 0.0422 0.0 0.0 0.112
ENSG00000169174 PCSK9 -13368 eQTL 6.68e-08 -0.138 0.0253 0.0232 0.0333 0.111

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000169174 PCSK9 -13368 0.000241 1.73e-05 3.39e-06 8.01e-06 2.48e-06 2.64e-05 2.59e-05 1.31e-06 1.41e-05 6.27e-06 1.54e-05 6.14e-06 2.97e-05 6.35e-06 4.98e-06 1.01e-05 8.14e-06 2.25e-05 4.18e-06 2.83e-06 7.66e-06 2.15e-05 1.77e-05 4.81e-06 1.95e-05 4.26e-06 7.19e-06 4.8e-06 1.91e-05 1.69e-05 1.05e-05 9.92e-07 1.25e-06 3.76e-06 4.54e-06 2.18e-06 1.71e-06 1.3e-06 2.18e-06 1.2e-06 9.82e-07 2.15e-05 2.79e-06 1.32e-07 1.59e-06 1.32e-06 2.05e-06 7.58e-07 4.82e-07
ENSG00000215883 \N 826144 2.6e-07 1.16e-07 3.41e-08 1.67e-07 1.03e-07 8.95e-08 1.31e-07 5.29e-08 1.33e-07 3.99e-08 1.55e-07 7.4e-08 1.19e-07 6.1e-08 4.48e-08 7.4e-08 5.2e-08 1.02e-07 4.91e-08 2.93e-08 1.04e-07 1.31e-07 1.31e-07 5.23e-08 1.32e-07 1.03e-07 1.12e-07 8.27e-08 1.04e-07 1.08e-07 9.43e-08 3.29e-08 2.6e-08 8.21e-08 1.06e-07 4.32e-08 3.84e-08 8e-08 8.39e-08 3.96e-08 2.71e-08 1.43e-07 4.51e-08 0.0 1.15e-07 1.86e-08 1.47e-07 4.96e-09 4.72e-08