logo

Genes within 1Mb (chr1:55026178:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 224855 sc-eQTL 1.28e-01 -0.192 0.126 0.113 B L1
ENSG00000116133 DHCR24 138983 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0975 0.12 0.113 B L1
ENSG00000116205 TCEANC2 972594 sc-eQTL 5.73e-01 0.0583 0.103 0.113 B L1
ENSG00000116209 TMEM59 972674 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0348 0.0629 0.113 B L1
ENSG00000116221 MRPL37 842137 sc-eQTL 2.94e-01 0.0865 0.0822 0.113 B L1
ENSG00000157216 SSBP3 612699 sc-eQTL 1.69e-03 -0.268 0.0843 0.113 B L1
ENSG00000162402 USP24 -189186 sc-eQTL 2.30e-01 -0.0876 0.0728 0.113 B L1
ENSG00000215883 CYB5RL 826142 sc-eQTL 8.49e-01 0.0268 0.141 0.113 B L1
ENSG00000243725 TTC4 310317 sc-eQTL 6.38e-01 0.0577 0.122 0.113 B L1
ENSG00000006555 TTC22 224855 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0775 0.0985 0.113 CD4T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 972594 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0125 0.0806 0.113 CD4T L1
ENSG00000116209 TMEM59 972674 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0527 0.075 0.113 CD4T L1
ENSG00000116221 MRPL37 842137 sc-eQTL 3.59e-01 0.0952 0.104 0.113 CD4T L1
ENSG00000157216 SSBP3 612699 sc-eQTL 2.73e-01 -0.0945 0.086 0.113 CD4T L1
ENSG00000162402 USP24 -189186 sc-eQTL 2.22e-01 -0.0858 0.07 0.113 CD4T L1
ENSG00000243725 TTC4 310317 sc-eQTL 2.85e-01 -0.113 0.105 0.113 CD4T L1
ENSG00000006555 TTC22 224855 sc-eQTL 5.89e-01 0.0454 0.0839 0.113 CD8T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 972594 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0729 0.104 0.113 CD8T L1
ENSG00000116209 TMEM59 972674 sc-eQTL 3.21e-01 -0.0721 0.0724 0.113 CD8T L1
ENSG00000116221 MRPL37 842137 sc-eQTL 5.20e-01 0.0643 0.0998 0.113 CD8T L1
ENSG00000157216 SSBP3 612699 sc-eQTL 1.52e-01 -0.103 0.0714 0.113 CD8T L1
ENSG00000162402 USP24 -189186 sc-eQTL 1.81e-01 -0.0928 0.0691 0.113 CD8T L1
ENSG00000243725 TTC4 310317 sc-eQTL 8.40e-01 0.0244 0.12 0.113 CD8T L1
ENSG00000116133 DHCR24 138983 sc-eQTL 8.97e-01 0.0152 0.118 0.11 DC L1
ENSG00000116205 TCEANC2 972594 sc-eQTL 3.20e-01 -0.131 0.132 0.11 DC L1
ENSG00000116209 TMEM59 972674 sc-eQTL 1.84e-01 0.138 0.103 0.11 DC L1
ENSG00000116221 MRPL37 842137 sc-eQTL 9.20e-02 0.235 0.139 0.11 DC L1
ENSG00000157216 SSBP3 612699 sc-eQTL 1.19e-01 -0.194 0.124 0.11 DC L1
ENSG00000162390 ACOT11 483921 sc-eQTL 2.57e-01 0.135 0.119 0.11 DC L1
ENSG00000162402 USP24 -189186 sc-eQTL 1.57e-01 -0.102 0.0718 0.11 DC L1
ENSG00000215883 CYB5RL 826142 sc-eQTL 1.94e-01 0.17 0.13 0.11 DC L1
ENSG00000243725 TTC4 310317 sc-eQTL 6.90e-02 0.255 0.139 0.11 DC L1
ENSG00000116133 DHCR24 138983 sc-eQTL 3.76e-01 0.0742 0.0837 0.113 Mono L1
ENSG00000116205 TCEANC2 972594 sc-eQTL 9.15e-01 -0.00962 0.0904 0.113 Mono L1
ENSG00000116209 TMEM59 972674 sc-eQTL 4.48e-02 0.134 0.0665 0.113 Mono L1
ENSG00000116221 MRPL37 842137 sc-eQTL 9.03e-01 0.0136 0.112 0.113 Mono L1
ENSG00000157216 SSBP3 612699 sc-eQTL 4.15e-01 0.105 0.129 0.113 Mono L1
ENSG00000162402 USP24 -189186 sc-eQTL 7.31e-02 -0.137 0.0761 0.113 Mono L1
ENSG00000243725 TTC4 310317 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0577 0.135 0.113 Mono L1
ENSG00000006555 TTC22 224855 sc-eQTL 8.93e-02 0.19 0.111 0.114 NK L1
ENSG00000116133 DHCR24 138983 sc-eQTL 8.87e-02 -0.192 0.113 0.114 NK L1
ENSG00000116205 TCEANC2 972594 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0844 0.112 0.114 NK L1
ENSG00000116209 TMEM59 972674 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0299 0.0875 0.114 NK L1
ENSG00000116221 MRPL37 842137 sc-eQTL 7.67e-01 0.0323 0.109 0.114 NK L1
ENSG00000157216 SSBP3 612699 sc-eQTL 6.47e-01 0.0433 0.0943 0.114 NK L1
ENSG00000162398 LEXM 220115 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00288 0.106 0.114 NK L1
ENSG00000162402 USP24 -189186 sc-eQTL 1.90e-02 -0.15 0.0634 0.114 NK L1
ENSG00000243725 TTC4 310317 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0955 0.121 0.114 NK L1
ENSG00000006555 TTC22 224855 sc-eQTL 9.24e-01 0.00965 0.101 0.113 Other_T L1
ENSG00000116133 DHCR24 138983 sc-eQTL 1.92e-01 -0.102 0.0779 0.113 Other_T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 972594 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00732 0.117 0.113 Other_T L1
ENSG00000116209 TMEM59 972674 sc-eQTL 4.11e-01 -0.066 0.0802 0.113 Other_T L1
ENSG00000116221 MRPL37 842137 sc-eQTL 5.23e-02 0.146 0.0745 0.113 Other_T L1
ENSG00000157216 SSBP3 612699 sc-eQTL 2.98e-01 -0.0905 0.0868 0.113 Other_T L1
ENSG00000162402 USP24 -189186 sc-eQTL 6.34e-01 0.0441 0.0926 0.113 Other_T L1
ENSG00000215883 CYB5RL 826142 sc-eQTL 3.41e-01 0.121 0.126 0.113 Other_T L1
ENSG00000243725 TTC4 310317 sc-eQTL 8.99e-02 -0.213 0.125 0.113 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 224855 sc-eQTL 2.08e-01 0.129 0.102 0.112 B_Activated L2
ENSG00000116133 DHCR24 138983 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0856 0.12 0.112 B_Activated L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972594 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0846 0.129 0.112 B_Activated L2
ENSG00000116209 TMEM59 972674 sc-eQTL 3.50e-01 -0.129 0.137 0.112 B_Activated L2
ENSG00000116221 MRPL37 842137 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0272 0.149 0.112 B_Activated L2
ENSG00000157216 SSBP3 612699 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0574 0.134 0.112 B_Activated L2
ENSG00000162402 USP24 -189186 sc-eQTL 5.63e-01 0.076 0.131 0.112 B_Activated L2
ENSG00000215883 CYB5RL 826142 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0633 0.116 0.112 B_Activated L2
ENSG00000243725 TTC4 310317 sc-eQTL 6.48e-01 0.0575 0.126 0.112 B_Activated L2
ENSG00000006555 TTC22 224855 sc-eQTL 3.61e-01 0.122 0.134 0.114 B_Intermediate L2
ENSG00000116133 DHCR24 138983 sc-eQTL 9.92e-01 -0.0012 0.124 0.114 B_Intermediate L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972594 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0588 0.124 0.114 B_Intermediate L2
ENSG00000116209 TMEM59 972674 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0195 0.106 0.114 B_Intermediate L2
ENSG00000116221 MRPL37 842137 sc-eQTL 1.39e-01 0.184 0.124 0.114 B_Intermediate L2
ENSG00000157216 SSBP3 612699 sc-eQTL 3.63e-02 -0.243 0.115 0.114 B_Intermediate L2
ENSG00000162402 USP24 -189186 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0506 0.098 0.114 B_Intermediate L2
ENSG00000215883 CYB5RL 826142 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00489 0.139 0.114 B_Intermediate L2
ENSG00000243725 TTC4 310317 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0227 0.126 0.114 B_Intermediate L2
ENSG00000006555 TTC22 224855 sc-eQTL 1.28e-01 -0.198 0.13 0.114 B_Memory L2
ENSG00000116133 DHCR24 138983 sc-eQTL 2.44e-01 -0.151 0.129 0.114 B_Memory L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972594 sc-eQTL 7.75e-01 0.0396 0.138 0.114 B_Memory L2
ENSG00000116209 TMEM59 972674 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0137 0.115 0.114 B_Memory L2
ENSG00000116221 MRPL37 842137 sc-eQTL 1.08e-01 0.188 0.116 0.114 B_Memory L2
ENSG00000157216 SSBP3 612699 sc-eQTL 1.65e-01 -0.151 0.109 0.114 B_Memory L2
ENSG00000162402 USP24 -189186 sc-eQTL 6.71e-01 0.0453 0.107 0.114 B_Memory L2
ENSG00000215883 CYB5RL 826142 sc-eQTL 2.56e-02 -0.293 0.13 0.114 B_Memory L2
ENSG00000243725 TTC4 310317 sc-eQTL 2.70e-01 0.151 0.136 0.114 B_Memory L2
ENSG00000006555 TTC22 224855 sc-eQTL 5.88e-02 -0.251 0.132 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000116133 DHCR24 138983 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0376 0.125 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972594 sc-eQTL 5.79e-01 0.0618 0.111 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000116209 TMEM59 972674 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0613 0.0807 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000116221 MRPL37 842137 sc-eQTL 8.97e-01 0.0154 0.119 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000157216 SSBP3 612699 sc-eQTL 1.07e-01 -0.183 0.113 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000162402 USP24 -189186 sc-eQTL 8.29e-01 0.0193 0.0894 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 826142 sc-eQTL 7.57e-02 0.239 0.134 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000243725 TTC4 310317 sc-eQTL 7.14e-01 0.0447 0.122 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000006555 TTC22 224855 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0953 0.135 0.114 B_Naive2 L2
ENSG00000116133 DHCR24 138983 sc-eQTL 3.92e-01 -0.101 0.117 0.114 B_Naive2 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972594 sc-eQTL 2.17e-01 0.161 0.13 0.114 B_Naive2 L2
ENSG00000116209 TMEM59 972674 sc-eQTL 7.44e-02 0.191 0.107 0.114 B_Naive2 L2
ENSG00000116221 MRPL37 842137 sc-eQTL 3.77e-01 0.112 0.126 0.114 B_Naive2 L2
ENSG00000157216 SSBP3 612699 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0149 0.125 0.114 B_Naive2 L2
ENSG00000162402 USP24 -189186 sc-eQTL 1.30e-01 -0.149 0.0982 0.114 B_Naive2 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 826142 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0915 0.139 0.114 B_Naive2 L2
ENSG00000243725 TTC4 310317 sc-eQTL 7.15e-01 0.0529 0.145 0.114 B_Naive2 L2
ENSG00000006555 TTC22 224855 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00237 0.123 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972594 sc-eQTL 5.77e-01 0.0708 0.127 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 972674 sc-eQTL 2.65e-01 0.129 0.115 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 842137 sc-eQTL 8.96e-02 0.24 0.141 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 612699 sc-eQTL 1.88e-01 -0.115 0.0869 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -189186 sc-eQTL 1.16e-01 -0.188 0.119 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 310317 sc-eQTL 3.82e-01 0.117 0.134 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 224855 sc-eQTL 6.21e-01 0.0572 0.116 0.113 CD4_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972594 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0406 0.088 0.113 CD4_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 972674 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0187 0.0856 0.113 CD4_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 842137 sc-eQTL 7.47e-01 0.0356 0.11 0.113 CD4_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 612699 sc-eQTL 4.10e-01 0.0727 0.088 0.113 CD4_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -189186 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0332 0.076 0.113 CD4_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 310317 sc-eQTL 2.55e-01 -0.132 0.116 0.113 CD4_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 224855 sc-eQTL 7.21e-01 -0.043 0.12 0.113 CD4_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972594 sc-eQTL 7.27e-01 0.0407 0.117 0.113 CD4_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 972674 sc-eQTL 8.12e-01 -0.021 0.0881 0.113 CD4_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 842137 sc-eQTL 5.04e-01 0.0741 0.111 0.113 CD4_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 612699 sc-eQTL 3.17e-01 -0.109 0.108 0.113 CD4_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -189186 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0557 0.0899 0.113 CD4_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 310317 sc-eQTL 1.56e-01 -0.184 0.129 0.113 CD4_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 224855 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0679 0.136 0.113 CD4_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972594 sc-eQTL 3.87e-01 -0.112 0.129 0.113 CD4_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 972674 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00556 0.1 0.113 CD4_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 842137 sc-eQTL 2.84e-01 0.138 0.129 0.113 CD4_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 612699 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0445 0.111 0.113 CD4_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -189186 sc-eQTL 2.45e-01 -0.117 0.1 0.113 CD4_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 310317 sc-eQTL 4.22e-01 0.107 0.133 0.113 CD4_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 224855 sc-eQTL 9.78e-01 0.003 0.11 0.113 CD8_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972594 sc-eQTL 2.46e-01 -0.141 0.121 0.113 CD8_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 972674 sc-eQTL 8.58e-01 -0.019 0.106 0.113 CD8_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 842137 sc-eQTL 2.03e-01 0.159 0.125 0.113 CD8_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 612699 sc-eQTL 2.54e-01 -0.0979 0.0855 0.113 CD8_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -189186 sc-eQTL 7.16e-03 -0.228 0.0838 0.113 CD8_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 310317 sc-eQTL 8.13e-01 0.0302 0.128 0.113 CD8_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 224855 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0398 0.121 0.113 CD8_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972594 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0589 0.11 0.113 CD8_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 972674 sc-eQTL 1.53e-01 -0.153 0.107 0.113 CD8_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 842137 sc-eQTL 6.59e-01 0.0569 0.129 0.113 CD8_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 612699 sc-eQTL 3.01e-01 0.101 0.0972 0.113 CD8_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -189186 sc-eQTL 4.20e-01 0.0715 0.0885 0.113 CD8_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 310317 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0516 0.13 0.113 CD8_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 224855 sc-eQTL 8.18e-01 0.0305 0.132 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972594 sc-eQTL 2.97e-01 0.139 0.133 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 972674 sc-eQTL 2.69e-01 0.13 0.117 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 842137 sc-eQTL 7.82e-01 0.0367 0.133 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 612699 sc-eQTL 2.51e-01 -0.132 0.115 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -189186 sc-eQTL 8.95e-01 0.0148 0.112 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 310317 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0398 0.136 0.116 CD8_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 224855 sc-eQTL 6.49e-01 -0.058 0.127 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972594 sc-eQTL 2.95e-01 0.139 0.133 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 972674 sc-eQTL 8.53e-01 0.0238 0.129 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 842137 sc-eQTL 3.90e-01 0.112 0.13 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 612699 sc-eQTL 9.12e-01 0.0136 0.123 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -189186 sc-eQTL 2.84e-01 0.139 0.13 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 310317 sc-eQTL 4.45e-01 0.101 0.132 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 224855 sc-eQTL 1.94e-01 0.154 0.118 0.115 MAIT L2
ENSG00000116133 DHCR24 138983 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0155 0.0878 0.115 MAIT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972594 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0557 0.124 0.115 MAIT L2
ENSG00000116209 TMEM59 972674 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0106 0.112 0.115 MAIT L2
ENSG00000116221 MRPL37 842137 sc-eQTL 2.73e-01 0.149 0.135 0.115 MAIT L2
ENSG00000157216 SSBP3 612699 sc-eQTL 2.96e-02 -0.26 0.119 0.115 MAIT L2
ENSG00000162402 USP24 -189186 sc-eQTL 4.69e-01 0.0775 0.107 0.115 MAIT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 826142 sc-eQTL 3.61e-01 0.113 0.124 0.115 MAIT L2
ENSG00000243725 TTC4 310317 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0762 0.123 0.115 MAIT L2
ENSG00000006555 TTC22 224855 sc-eQTL 9.10e-01 0.0155 0.137 0.111 NK_CD56bright L2
ENSG00000116133 DHCR24 138983 sc-eQTL 9.81e-01 0.00291 0.121 0.111 NK_CD56bright L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972594 sc-eQTL 1.74e-01 0.174 0.127 0.111 NK_CD56bright L2
ENSG00000116209 TMEM59 972674 sc-eQTL 8.45e-01 0.0244 0.125 0.111 NK_CD56bright L2
ENSG00000116221 MRPL37 842137 sc-eQTL 2.47e-02 0.311 0.138 0.111 NK_CD56bright L2
ENSG00000157216 SSBP3 612699 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0936 0.105 0.111 NK_CD56bright L2
ENSG00000162398 LEXM 220115 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0729 0.124 0.111 NK_CD56bright L2
ENSG00000162402 USP24 -189186 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0929 0.106 0.111 NK_CD56bright L2
ENSG00000243725 TTC4 310317 sc-eQTL 8.80e-01 0.0203 0.134 0.111 NK_CD56bright L2
ENSG00000006555 TTC22 224855 sc-eQTL 3.56e-02 0.238 0.112 0.114 NK_CD56dim L2
ENSG00000116133 DHCR24 138983 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0826 0.118 0.114 NK_CD56dim L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972594 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0672 0.128 0.114 NK_CD56dim L2
ENSG00000116209 TMEM59 972674 sc-eQTL 6.67e-01 -0.041 0.0951 0.114 NK_CD56dim L2
ENSG00000116221 MRPL37 842137 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0231 0.124 0.114 NK_CD56dim L2
ENSG00000157216 SSBP3 612699 sc-eQTL 4.93e-01 0.0695 0.101 0.114 NK_CD56dim L2
ENSG00000162398 LEXM 220115 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0719 0.116 0.114 NK_CD56dim L2
ENSG00000162402 USP24 -189186 sc-eQTL 2.39e-01 -0.0871 0.0738 0.114 NK_CD56dim L2
ENSG00000243725 TTC4 310317 sc-eQTL 1.26e-01 -0.194 0.126 0.114 NK_CD56dim L2
ENSG00000006555 TTC22 224855 sc-eQTL 4.15e-02 0.289 0.141 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000116133 DHCR24 138983 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0978 0.139 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972594 sc-eQTL 6.73e-01 0.0566 0.134 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000116209 TMEM59 972674 sc-eQTL 5.18e-01 0.0862 0.133 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000116221 MRPL37 842137 sc-eQTL 5.52e-01 0.0874 0.147 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000157216 SSBP3 612699 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0232 0.12 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000162398 LEXM 220115 sc-eQTL 7.25e-01 0.0476 0.135 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000162402 USP24 -189186 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0624 0.099 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000243725 TTC4 310317 sc-eQTL 9.08e-01 0.0171 0.148 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000006555 TTC22 224855 sc-eQTL 5.97e-01 0.0636 0.12 0.114 NK_cytokine L2
ENSG00000116133 DHCR24 138983 sc-eQTL 5.15e-02 -0.236 0.121 0.114 NK_cytokine L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972594 sc-eQTL 4.74e-02 -0.239 0.12 0.114 NK_cytokine L2
ENSG00000116209 TMEM59 972674 sc-eQTL 5.77e-01 0.0548 0.0981 0.114 NK_cytokine L2
ENSG00000116221 MRPL37 842137 sc-eQTL 4.43e-01 0.0929 0.121 0.114 NK_cytokine L2
ENSG00000157216 SSBP3 612699 sc-eQTL 8.71e-02 0.173 0.101 0.114 NK_cytokine L2
ENSG00000162398 LEXM 220115 sc-eQTL 7.93e-01 0.0333 0.127 0.114 NK_cytokine L2
ENSG00000162402 USP24 -189186 sc-eQTL 5.01e-03 -0.241 0.0848 0.114 NK_cytokine L2
ENSG00000243725 TTC4 310317 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0548 0.128 0.114 NK_cytokine L2
ENSG00000006555 TTC22 224855 sc-eQTL 8.48e-01 -0.028 0.146 0.115 PB L2
ENSG00000116133 DHCR24 138983 sc-eQTL 2.28e-01 -0.156 0.129 0.115 PB L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972594 sc-eQTL 1.07e-01 -0.253 0.156 0.115 PB L2
ENSG00000116209 TMEM59 972674 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00317 0.0658 0.115 PB L2
ENSG00000116221 MRPL37 842137 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0342 0.12 0.115 PB L2
ENSG00000157216 SSBP3 612699 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0731 0.138 0.115 PB L2
ENSG00000162402 USP24 -189186 sc-eQTL 9.75e-01 0.00492 0.157 0.115 PB L2
ENSG00000215883 CYB5RL 826142 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0414 0.163 0.115 PB L2
ENSG00000243725 TTC4 310317 sc-eQTL 2.71e-01 0.167 0.151 0.115 PB L2
ENSG00000006555 TTC22 224855 sc-eQTL 3.75e-01 -0.111 0.125 0.113 Pro_T L2
ENSG00000116133 DHCR24 138983 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0908 0.106 0.113 Pro_T L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972594 sc-eQTL 3.98e-01 0.109 0.129 0.113 Pro_T L2
ENSG00000116209 TMEM59 972674 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0528 0.0898 0.113 Pro_T L2
ENSG00000116221 MRPL37 842137 sc-eQTL 2.91e-02 0.191 0.0871 0.113 Pro_T L2
ENSG00000157216 SSBP3 612699 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00299 0.0988 0.113 Pro_T L2
ENSG00000162402 USP24 -189186 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0194 0.12 0.113 Pro_T L2
ENSG00000215883 CYB5RL 826142 sc-eQTL 6.20e-01 0.0591 0.119 0.113 Pro_T L2
ENSG00000243725 TTC4 310317 sc-eQTL 1.78e-01 -0.178 0.132 0.113 Pro_T L2
ENSG00000006555 TTC22 224855 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0166 0.121 0.113 Treg L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972594 sc-eQTL 4.21e-01 0.104 0.13 0.113 Treg L2
ENSG00000116209 TMEM59 972674 sc-eQTL 5.72e-01 0.058 0.102 0.113 Treg L2
ENSG00000116221 MRPL37 842137 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0386 0.127 0.113 Treg L2
ENSG00000157216 SSBP3 612699 sc-eQTL 2.45e-01 -0.131 0.113 0.113 Treg L2
ENSG00000162402 USP24 -189186 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0919 0.108 0.113 Treg L2
ENSG00000243725 TTC4 310317 sc-eQTL 4.40e-01 0.105 0.136 0.113 Treg L2
ENSG00000116133 DHCR24 138983 sc-eQTL 5.26e-01 0.0725 0.114 0.107 cDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972594 sc-eQTL 3.90e-02 -0.277 0.133 0.107 cDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 972674 sc-eQTL 3.30e-01 0.112 0.114 0.107 cDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 842137 sc-eQTL 4.60e-01 0.108 0.146 0.107 cDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 612699 sc-eQTL 4.05e-01 -0.113 0.135 0.107 cDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 483921 sc-eQTL 3.62e-01 0.114 0.125 0.107 cDC L2
ENSG00000162402 USP24 -189186 sc-eQTL 2.19e-02 -0.321 0.139 0.107 cDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 826142 sc-eQTL 2.23e-01 0.147 0.12 0.107 cDC L2
ENSG00000243725 TTC4 310317 sc-eQTL 1.90e-01 0.189 0.144 0.107 cDC L2
ENSG00000116133 DHCR24 138983 sc-eQTL 6.09e-01 0.0413 0.0806 0.113 cMono_IL1B L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972594 sc-eQTL 4.05e-01 0.0933 0.112 0.113 cMono_IL1B L2
ENSG00000116209 TMEM59 972674 sc-eQTL 5.49e-01 0.0408 0.0679 0.113 cMono_IL1B L2
ENSG00000116221 MRPL37 842137 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0416 0.121 0.113 cMono_IL1B L2
ENSG00000157216 SSBP3 612699 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0274 0.124 0.113 cMono_IL1B L2
ENSG00000162402 USP24 -189186 sc-eQTL 3.45e-01 -0.0863 0.0911 0.113 cMono_IL1B L2
ENSG00000243725 TTC4 310317 sc-eQTL 8.37e-01 0.0288 0.14 0.113 cMono_IL1B L2
ENSG00000116133 DHCR24 138983 sc-eQTL 9.59e-01 0.00394 0.0759 0.113 cMono_S100A L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972594 sc-eQTL 2.38e-01 -0.136 0.115 0.113 cMono_S100A L2
ENSG00000116209 TMEM59 972674 sc-eQTL 4.38e-02 0.186 0.0918 0.113 cMono_S100A L2
ENSG00000116221 MRPL37 842137 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0255 0.134 0.113 cMono_S100A L2
ENSG00000157216 SSBP3 612699 sc-eQTL 8.13e-01 0.033 0.139 0.113 cMono_S100A L2
ENSG00000162402 USP24 -189186 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0934 0.112 0.113 cMono_S100A L2
ENSG00000243725 TTC4 310317 sc-eQTL 9.22e-01 0.0137 0.141 0.113 cMono_S100A L2
ENSG00000006555 TTC22 224855 sc-eQTL 3.09e-01 -0.138 0.135 0.121 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 138983 sc-eQTL 2.98e-01 -0.157 0.151 0.121 gdT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972594 sc-eQTL 7.43e-01 0.0499 0.152 0.121 gdT L2
ENSG00000116209 TMEM59 972674 sc-eQTL 6.11e-01 0.0785 0.154 0.121 gdT L2
ENSG00000116221 MRPL37 842137 sc-eQTL 2.70e-01 0.195 0.176 0.121 gdT L2
ENSG00000157216 SSBP3 612699 sc-eQTL 2.29e-01 0.13 0.108 0.121 gdT L2
ENSG00000162402 USP24 -189186 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0519 0.145 0.121 gdT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 826142 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0242 0.151 0.121 gdT L2
ENSG00000243725 TTC4 310317 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0627 0.17 0.121 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 138983 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0316 0.102 0.109 intMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972594 sc-eQTL 2.68e-01 0.14 0.126 0.109 intMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 972674 sc-eQTL 7.63e-01 0.0281 0.0932 0.109 intMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 842137 sc-eQTL 6.33e-01 0.0682 0.142 0.109 intMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 612699 sc-eQTL 1.48e-01 0.21 0.145 0.109 intMono L2
ENSG00000162402 USP24 -189186 sc-eQTL 3.06e-01 0.133 0.129 0.109 intMono L2
ENSG00000243725 TTC4 310317 sc-eQTL 8.98e-01 0.0177 0.138 0.109 intMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 138983 sc-eQTL 6.24e-01 0.0502 0.102 0.104 ncMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972594 sc-eQTL 8.66e-01 0.0217 0.128 0.104 ncMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 972674 sc-eQTL 9.44e-01 0.00722 0.102 0.104 ncMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 842137 sc-eQTL 9.72e-01 0.00463 0.132 0.104 ncMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 612699 sc-eQTL 3.21e-01 0.143 0.144 0.104 ncMono L2
ENSG00000162402 USP24 -189186 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0409 0.115 0.104 ncMono L2
ENSG00000243725 TTC4 310317 sc-eQTL 8.75e-01 0.0215 0.137 0.104 ncMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 138983 sc-eQTL 5.99e-01 0.0652 0.124 0.11 pDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972594 sc-eQTL 1.00e+00 -4.26e-05 0.149 0.11 pDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 972674 sc-eQTL 9.00e-01 -0.015 0.119 0.11 pDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 842137 sc-eQTL 5.49e-02 0.301 0.156 0.11 pDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 612699 sc-eQTL 2.61e-03 -0.416 0.136 0.11 pDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 483921 sc-eQTL 3.77e-01 -0.052 0.0587 0.11 pDC L2
ENSG00000162402 USP24 -189186 sc-eQTL 2.68e-01 -0.11 0.099 0.11 pDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 826142 sc-eQTL 5.14e-01 0.0889 0.136 0.11 pDC L2
ENSG00000243725 TTC4 310317 sc-eQTL 6.59e-01 0.0694 0.157 0.11 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 224855 sc-eQTL 9.82e-01 -0.0029 0.13 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 138983 sc-eQTL 3.63e-01 -0.119 0.13 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 972594 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0737 0.126 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 972674 sc-eQTL 3.14e-01 -0.099 0.098 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 842137 sc-eQTL 2.22e-02 0.268 0.116 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 612699 sc-eQTL 1.31e-02 -0.252 0.101 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -189186 sc-eQTL 9.94e-01 0.000697 0.0933 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 826142 sc-eQTL 1.69e-01 -0.197 0.143 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 310317 sc-eQTL 3.71e-01 0.115 0.128 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 224855 sc-eQTL 3.19e-02 -0.29 0.134 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 138983 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0748 0.122 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 972594 sc-eQTL 2.86e-01 0.118 0.11 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 972674 sc-eQTL 7.15e-01 0.0287 0.0784 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 842137 sc-eQTL 5.63e-01 0.0653 0.113 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 612699 sc-eQTL 2.17e-01 -0.124 0.1 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -189186 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0266 0.0865 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 826142 sc-eQTL 2.68e-01 0.152 0.137 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 310317 sc-eQTL 8.12e-01 0.0308 0.129 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 138983 sc-eQTL 6.25e-01 0.0381 0.0778 0.113 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 972594 sc-eQTL 9.41e-01 0.00723 0.0974 0.113 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 972674 sc-eQTL 1.44e-01 0.098 0.0668 0.113 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 842137 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0181 0.119 0.113 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 612699 sc-eQTL 7.71e-01 0.0362 0.124 0.113 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -189186 sc-eQTL 1.39e-01 -0.126 0.0846 0.113 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 310317 sc-eQTL 7.08e-01 0.0529 0.141 0.113 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 138983 sc-eQTL 5.74e-01 0.0552 0.0979 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 972594 sc-eQTL 2.35e-01 0.153 0.128 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 972674 sc-eQTL 6.05e-01 0.0496 0.0957 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 842137 sc-eQTL 2.92e-01 0.138 0.131 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 612699 sc-eQTL 1.11e-01 0.223 0.139 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -189186 sc-eQTL 8.31e-01 0.0236 0.11 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 310317 sc-eQTL 7.14e-01 0.0507 0.138 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 224855 sc-eQTL 3.33e-02 0.234 0.109 0.114 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 138983 sc-eQTL 1.09e-01 -0.185 0.115 0.114 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 972594 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0962 0.113 0.114 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 972674 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0379 0.0874 0.114 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 842137 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0253 0.117 0.114 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 612699 sc-eQTL 5.17e-01 0.0624 0.096 0.114 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162398 LEXM 220115 sc-eQTL 8.56e-01 0.0196 0.108 0.114 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -189186 sc-eQTL 9.49e-03 -0.177 0.0676 0.114 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 310317 sc-eQTL 3.06e-01 -0.125 0.122 0.114 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000116205 TCEANC2 972594 eQTL 0.0136 -0.0609 0.0246 0.00229 0.0 0.111
ENSG00000169174 PCSK9 -13370 pQTL 0.0187 -0.0994 0.0422 0.0 0.0 0.112
ENSG00000169174 PCSK9 -13370 eQTL 6.71e-08 -0.138 0.0254 0.0231 0.0332 0.111

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000169174 PCSK9 -13370 0.000384 1.32e-05 3.07e-06 5.09e-06 1.6e-06 2.15e-05 1.57e-05 9.93e-07 9.51e-06 5.11e-06 1.19e-05 3.55e-06 1.7e-05 3.99e-06 3.64e-06 9.23e-06 6.68e-06 1.83e-05 2.68e-06 1.16e-06 5.14e-06 1.39e-05 1.24e-05 2.78e-06 1.02e-05 3.33e-06 4.65e-06 1.78e-06 1.25e-05 8.58e-06 7.11e-06 4.9e-07 7.26e-07 2.69e-06 1.95e-06 1.16e-06 9.24e-07 4.76e-07 9.13e-07 3.61e-07 1.96e-07 1.73e-05 2.48e-06 1.1e-08 7.49e-07 1.32e-06 9.29e-07 2.41e-07 1.63e-07
ENSG00000215883 \N 826142 2.66e-07 1.16e-07 3.41e-08 1.66e-07 1.03e-07 9.14e-08 1.31e-07 5.29e-08 1.33e-07 3.99e-08 1.55e-07 7.4e-08 1.19e-07 6.1e-08 4.48e-08 7.4e-08 5.2e-08 1.02e-07 4.91e-08 2.93e-08 1.04e-07 1.31e-07 1.31e-07 5.23e-08 1.32e-07 1.03e-07 1.12e-07 8.27e-08 1.04e-07 1.08e-07 9.43e-08 3.29e-08 2.6e-08 8.21e-08 1.06e-07 4.32e-08 3.84e-08 8e-08 8.39e-08 3.96e-08 2.6e-08 1.43e-07 4.51e-08 0.0 1.15e-07 1.86e-08 1.47e-07 4.96e-09 4.72e-08