logo

Genes within 1Mb (chr1:55026107:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 224784 sc-eQTL 7.82e-02 -0.203 0.115 0.15 B L1
ENSG00000116133 DHCR24 138912 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0132 0.109 0.15 B L1
ENSG00000116205 TCEANC2 972523 sc-eQTL 4.52e-01 0.071 0.0943 0.15 B L1
ENSG00000116209 TMEM59 972603 sc-eQTL 6.06e-01 0.0297 0.0575 0.15 B L1
ENSG00000116221 MRPL37 842066 sc-eQTL 7.09e-01 0.0281 0.0752 0.15 B L1
ENSG00000157216 SSBP3 612628 sc-eQTL 1.54e-03 -0.247 0.0769 0.15 B L1
ENSG00000162402 USP24 -189257 sc-eQTL 2.67e-01 -0.0741 0.0666 0.15 B L1
ENSG00000215883 CYB5RL 826071 sc-eQTL 5.92e-01 -0.069 0.128 0.15 B L1
ENSG00000243725 TTC4 310246 sc-eQTL 6.34e-01 0.0533 0.112 0.15 B L1
ENSG00000006555 TTC22 224784 sc-eQTL 7.66e-01 0.0271 0.0911 0.15 CD4T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 972523 sc-eQTL 6.48e-01 -0.034 0.0745 0.15 CD4T L1
ENSG00000116209 TMEM59 972603 sc-eQTL 7.40e-01 -0.023 0.0694 0.15 CD4T L1
ENSG00000116221 MRPL37 842066 sc-eQTL 6.14e-01 0.0485 0.0959 0.15 CD4T L1
ENSG00000157216 SSBP3 612628 sc-eQTL 2.96e-01 -0.0833 0.0795 0.15 CD4T L1
ENSG00000162402 USP24 -189257 sc-eQTL 2.40e-01 -0.0763 0.0647 0.15 CD4T L1
ENSG00000243725 TTC4 310246 sc-eQTL 3.69e-01 -0.0877 0.0975 0.15 CD4T L1
ENSG00000006555 TTC22 224784 sc-eQTL 4.65e-01 0.057 0.0778 0.15 CD8T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 972523 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0349 0.097 0.15 CD8T L1
ENSG00000116209 TMEM59 972603 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0306 0.0674 0.15 CD8T L1
ENSG00000116221 MRPL37 842066 sc-eQTL 3.75e-01 0.0823 0.0926 0.15 CD8T L1
ENSG00000157216 SSBP3 612628 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0558 0.0665 0.15 CD8T L1
ENSG00000162402 USP24 -189257 sc-eQTL 2.47e-01 -0.0745 0.0643 0.15 CD8T L1
ENSG00000243725 TTC4 310246 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0119 0.112 0.15 CD8T L1
ENSG00000116133 DHCR24 138912 sc-eQTL 6.25e-01 0.0524 0.107 0.149 DC L1
ENSG00000116205 TCEANC2 972523 sc-eQTL 1.68e-01 -0.166 0.119 0.149 DC L1
ENSG00000116209 TMEM59 972603 sc-eQTL 4.30e-01 0.0745 0.0942 0.149 DC L1
ENSG00000116221 MRPL37 842066 sc-eQTL 2.10e-01 0.159 0.126 0.149 DC L1
ENSG00000157216 SSBP3 612628 sc-eQTL 1.95e-01 -0.146 0.113 0.149 DC L1
ENSG00000162390 ACOT11 483850 sc-eQTL 3.88e-01 0.0938 0.108 0.149 DC L1
ENSG00000162402 USP24 -189257 sc-eQTL 2.38e-01 -0.0773 0.0654 0.149 DC L1
ENSG00000215883 CYB5RL 826071 sc-eQTL 5.54e-01 0.0702 0.118 0.149 DC L1
ENSG00000243725 TTC4 310246 sc-eQTL 1.22e-01 0.197 0.127 0.149 DC L1
ENSG00000116133 DHCR24 138912 sc-eQTL 5.17e-01 0.0495 0.0762 0.15 Mono L1
ENSG00000116205 TCEANC2 972523 sc-eQTL 5.80e-01 0.0455 0.0822 0.15 Mono L1
ENSG00000116209 TMEM59 972603 sc-eQTL 8.92e-03 0.159 0.0601 0.15 Mono L1
ENSG00000116221 MRPL37 842066 sc-eQTL 8.55e-01 0.0188 0.102 0.15 Mono L1
ENSG00000157216 SSBP3 612628 sc-eQTL 1.48e-01 0.169 0.117 0.15 Mono L1
ENSG00000162402 USP24 -189257 sc-eQTL 9.72e-02 -0.116 0.0694 0.15 Mono L1
ENSG00000243725 TTC4 310246 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0481 0.123 0.15 Mono L1
ENSG00000006555 TTC22 224784 sc-eQTL 1.59e-01 0.146 0.103 0.15 NK L1
ENSG00000116133 DHCR24 138912 sc-eQTL 2.25e-01 -0.127 0.104 0.15 NK L1
ENSG00000116205 TCEANC2 972523 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0488 0.103 0.15 NK L1
ENSG00000116209 TMEM59 972603 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0611 0.0807 0.15 NK L1
ENSG00000116221 MRPL37 842066 sc-eQTL 6.52e-01 0.0454 0.1 0.15 NK L1
ENSG00000157216 SSBP3 612628 sc-eQTL 5.02e-01 0.0585 0.087 0.15 NK L1
ENSG00000162398 LEXM 220044 sc-eQTL 4.63e-01 0.0717 0.0976 0.15 NK L1
ENSG00000162402 USP24 -189257 sc-eQTL 7.72e-02 -0.104 0.0588 0.15 NK L1
ENSG00000243725 TTC4 310246 sc-eQTL 1.86e-01 -0.148 0.112 0.15 NK L1
ENSG00000006555 TTC22 224784 sc-eQTL 9.14e-01 0.00998 0.0923 0.15 Other_T L1
ENSG00000116133 DHCR24 138912 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0317 0.0716 0.15 Other_T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 972523 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0332 0.107 0.15 Other_T L1
ENSG00000116209 TMEM59 972603 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0369 0.0735 0.15 Other_T L1
ENSG00000116221 MRPL37 842066 sc-eQTL 3.30e-02 0.146 0.0682 0.15 Other_T L1
ENSG00000157216 SSBP3 612628 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0443 0.0796 0.15 Other_T L1
ENSG00000162402 USP24 -189257 sc-eQTL 1.69e-01 0.117 0.0845 0.15 Other_T L1
ENSG00000215883 CYB5RL 826071 sc-eQTL 4.90e-01 0.0801 0.116 0.15 Other_T L1
ENSG00000243725 TTC4 310246 sc-eQTL 6.17e-02 -0.215 0.115 0.15 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 224784 sc-eQTL 2.67e-01 0.107 0.0961 0.148 B_Activated L2
ENSG00000116133 DHCR24 138912 sc-eQTL 7.18e-01 -0.041 0.113 0.148 B_Activated L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972523 sc-eQTL 3.92e-01 -0.104 0.121 0.148 B_Activated L2
ENSG00000116209 TMEM59 972603 sc-eQTL 4.25e-01 -0.103 0.129 0.148 B_Activated L2
ENSG00000116221 MRPL37 842066 sc-eQTL 7.86e-01 0.0379 0.14 0.148 B_Activated L2
ENSG00000157216 SSBP3 612628 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0201 0.126 0.148 B_Activated L2
ENSG00000162402 USP24 -189257 sc-eQTL 7.72e-01 0.0357 0.123 0.148 B_Activated L2
ENSG00000215883 CYB5RL 826071 sc-eQTL 2.02e-01 -0.139 0.108 0.148 B_Activated L2
ENSG00000243725 TTC4 310246 sc-eQTL 3.36e-01 0.114 0.118 0.148 B_Activated L2
ENSG00000006555 TTC22 224784 sc-eQTL 7.50e-01 0.0394 0.123 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000116133 DHCR24 138912 sc-eQTL 5.75e-01 0.0643 0.114 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972523 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0723 0.114 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000116209 TMEM59 972603 sc-eQTL 4.33e-01 0.0767 0.0975 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000116221 MRPL37 842066 sc-eQTL 1.50e-01 0.165 0.114 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000157216 SSBP3 612628 sc-eQTL 1.28e-01 -0.163 0.107 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000162402 USP24 -189257 sc-eQTL 2.36e-01 -0.107 0.0901 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000215883 CYB5RL 826071 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00756 0.128 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000243725 TTC4 310246 sc-eQTL 5.10e-01 0.0766 0.116 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000006555 TTC22 224784 sc-eQTL 1.74e-01 -0.16 0.117 0.151 B_Memory L2
ENSG00000116133 DHCR24 138912 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0541 0.117 0.151 B_Memory L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972523 sc-eQTL 7.16e-01 0.0456 0.125 0.151 B_Memory L2
ENSG00000116209 TMEM59 972603 sc-eQTL 3.16e-01 -0.105 0.104 0.151 B_Memory L2
ENSG00000116221 MRPL37 842066 sc-eQTL 1.81e-01 0.141 0.105 0.151 B_Memory L2
ENSG00000157216 SSBP3 612628 sc-eQTL 7.13e-02 -0.177 0.0979 0.151 B_Memory L2
ENSG00000162402 USP24 -189257 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00314 0.0965 0.151 B_Memory L2
ENSG00000215883 CYB5RL 826071 sc-eQTL 6.43e-03 -0.323 0.117 0.151 B_Memory L2
ENSG00000243725 TTC4 310246 sc-eQTL 2.20e-01 0.152 0.123 0.151 B_Memory L2
ENSG00000006555 TTC22 224784 sc-eQTL 1.04e-01 -0.2 0.123 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000116133 DHCR24 138912 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0367 0.116 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972523 sc-eQTL 1.56e-01 0.146 0.103 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000116209 TMEM59 972603 sc-eQTL 4.55e-01 0.056 0.0749 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000116221 MRPL37 842066 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0382 0.111 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000157216 SSBP3 612628 sc-eQTL 1.87e-01 -0.139 0.105 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000162402 USP24 -189257 sc-eQTL 7.48e-01 0.0267 0.0829 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 826071 sc-eQTL 6.97e-02 0.226 0.124 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000243725 TTC4 310246 sc-eQTL 6.95e-01 0.0443 0.113 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000006555 TTC22 224784 sc-eQTL 3.65e-01 -0.113 0.124 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000116133 DHCR24 138912 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00467 0.108 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972523 sc-eQTL 3.38e-01 0.115 0.12 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000116209 TMEM59 972603 sc-eQTL 2.23e-02 0.225 0.0978 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000116221 MRPL37 842066 sc-eQTL 8.05e-01 0.0288 0.117 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000157216 SSBP3 612628 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0158 0.115 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000162402 USP24 -189257 sc-eQTL 3.07e-01 -0.093 0.0907 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 826071 sc-eQTL 1.74e-01 -0.174 0.127 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000243725 TTC4 310246 sc-eQTL 9.07e-01 0.0156 0.133 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000006555 TTC22 224784 sc-eQTL 5.77e-01 0.0635 0.114 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972523 sc-eQTL 2.66e-01 0.13 0.117 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 972603 sc-eQTL 1.68e-01 0.146 0.106 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 842066 sc-eQTL 5.00e-02 0.255 0.129 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 612628 sc-eQTL 2.31e-01 -0.0962 0.0801 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -189257 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0567 0.11 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 310246 sc-eQTL 1.51e-01 0.177 0.123 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 224784 sc-eQTL 3.33e-01 0.104 0.107 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972523 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0548 0.0814 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 972603 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00432 0.0793 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 842066 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0113 0.102 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 612628 sc-eQTL 5.30e-01 0.0512 0.0815 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -189257 sc-eQTL 9.11e-01 -0.00787 0.0704 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 310246 sc-eQTL 1.87e-01 -0.142 0.107 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 224784 sc-eQTL 8.55e-01 0.0202 0.111 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972523 sc-eQTL 7.51e-01 0.0342 0.108 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 972603 sc-eQTL 7.99e-01 0.0207 0.0813 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 842066 sc-eQTL 3.27e-01 0.1 0.102 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 612628 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0868 0.1 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -189257 sc-eQTL 7.38e-02 -0.148 0.0825 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 310246 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0847 0.12 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 224784 sc-eQTL 8.19e-01 0.0289 0.127 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972523 sc-eQTL 1.02e-01 -0.196 0.119 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 972603 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00625 0.0929 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 842066 sc-eQTL 1.95e-01 0.155 0.119 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 612628 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0669 0.102 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -189257 sc-eQTL 2.06e-01 -0.118 0.0929 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 310246 sc-eQTL 3.25e-01 0.121 0.123 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 224784 sc-eQTL 7.19e-01 0.0365 0.102 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972523 sc-eQTL 2.64e-01 -0.126 0.112 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 972603 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0347 0.0978 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 842066 sc-eQTL 1.57e-01 0.164 0.115 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 612628 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0684 0.0791 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -189257 sc-eQTL 1.04e-01 -0.128 0.0783 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 310246 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0827 0.118 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 224784 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00577 0.112 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972523 sc-eQTL 7.88e-01 0.0274 0.102 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 972603 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0914 0.0993 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 842066 sc-eQTL 2.64e-01 0.133 0.119 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 612628 sc-eQTL 4.55e-01 0.0674 0.0901 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -189257 sc-eQTL 8.59e-01 0.0146 0.0821 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 310246 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0233 0.12 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 224784 sc-eQTL 4.32e-01 0.0957 0.122 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972523 sc-eQTL 3.50e-01 0.114 0.122 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 972603 sc-eQTL 5.02e-01 0.0724 0.108 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 842066 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0201 0.122 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 612628 sc-eQTL 1.01e-01 -0.174 0.105 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -189257 sc-eQTL 9.81e-01 0.00241 0.103 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 310246 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0788 0.125 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 224784 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0265 0.118 0.155 CD8_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972523 sc-eQTL 8.56e-01 0.0224 0.123 0.155 CD8_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 972603 sc-eQTL 8.22e-01 0.0269 0.119 0.155 CD8_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 842066 sc-eQTL 7.48e-01 0.0389 0.121 0.155 CD8_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 612628 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0495 0.114 0.155 CD8_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -189257 sc-eQTL 5.18e-01 0.0779 0.12 0.155 CD8_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 310246 sc-eQTL 2.36e-01 0.145 0.122 0.155 CD8_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 224784 sc-eQTL 4.61e-01 0.0805 0.109 0.152 MAIT L2
ENSG00000116133 DHCR24 138912 sc-eQTL 8.98e-01 0.0104 0.0808 0.152 MAIT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972523 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0369 0.114 0.152 MAIT L2
ENSG00000116209 TMEM59 972603 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00439 0.103 0.152 MAIT L2
ENSG00000116221 MRPL37 842066 sc-eQTL 2.56e-01 0.142 0.125 0.152 MAIT L2
ENSG00000157216 SSBP3 612628 sc-eQTL 6.18e-02 -0.206 0.11 0.152 MAIT L2
ENSG00000162402 USP24 -189257 sc-eQTL 2.14e-01 0.122 0.0979 0.152 MAIT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 826071 sc-eQTL 8.02e-01 0.0286 0.114 0.152 MAIT L2
ENSG00000243725 TTC4 310246 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0847 0.113 0.152 MAIT L2
ENSG00000006555 TTC22 224784 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0189 0.127 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000116133 DHCR24 138912 sc-eQTL 8.93e-01 0.0151 0.112 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972523 sc-eQTL 2.76e-01 0.129 0.118 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000116209 TMEM59 972603 sc-eQTL 8.44e-01 0.0228 0.115 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000116221 MRPL37 842066 sc-eQTL 1.05e-02 0.328 0.127 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000157216 SSBP3 612628 sc-eQTL 8.14e-02 -0.169 0.0965 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000162398 LEXM 220044 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0353 0.115 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000162402 USP24 -189257 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0551 0.0988 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000243725 TTC4 310246 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0535 0.125 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000006555 TTC22 224784 sc-eQTL 2.21e-01 0.128 0.104 0.151 NK_CD56dim L2
ENSG00000116133 DHCR24 138912 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0109 0.109 0.151 NK_CD56dim L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972523 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0244 0.118 0.151 NK_CD56dim L2
ENSG00000116209 TMEM59 972603 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0267 0.0875 0.151 NK_CD56dim L2
ENSG00000116221 MRPL37 842066 sc-eQTL 9.09e-01 -0.013 0.114 0.151 NK_CD56dim L2
ENSG00000157216 SSBP3 612628 sc-eQTL 3.63e-01 0.0847 0.093 0.151 NK_CD56dim L2
ENSG00000162398 LEXM 220044 sc-eQTL 6.35e-01 0.0508 0.107 0.151 NK_CD56dim L2
ENSG00000162402 USP24 -189257 sc-eQTL 2.90e-01 -0.072 0.0679 0.151 NK_CD56dim L2
ENSG00000243725 TTC4 310246 sc-eQTL 8.41e-02 -0.201 0.116 0.151 NK_CD56dim L2
ENSG00000006555 TTC22 224784 sc-eQTL 1.61e-02 0.31 0.128 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000116133 DHCR24 138912 sc-eQTL 5.49e-01 -0.076 0.126 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972523 sc-eQTL 2.96e-01 0.128 0.122 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000116209 TMEM59 972603 sc-eQTL 3.26e-01 0.119 0.121 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000116221 MRPL37 842066 sc-eQTL 2.72e-01 0.147 0.133 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000157216 SSBP3 612628 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0324 0.109 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000162398 LEXM 220044 sc-eQTL 8.00e-01 0.0312 0.123 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000162402 USP24 -189257 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0491 0.0901 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000243725 TTC4 310246 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0146 0.135 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000006555 TTC22 224784 sc-eQTL 5.26e-01 0.0704 0.111 0.151 NK_cytokine L2
ENSG00000116133 DHCR24 138912 sc-eQTL 9.99e-02 -0.184 0.111 0.151 NK_cytokine L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972523 sc-eQTL 5.06e-02 -0.217 0.11 0.151 NK_cytokine L2
ENSG00000116209 TMEM59 972603 sc-eQTL 2.73e-01 -0.0991 0.0902 0.151 NK_cytokine L2
ENSG00000116221 MRPL37 842066 sc-eQTL 5.96e-01 0.0591 0.111 0.151 NK_cytokine L2
ENSG00000157216 SSBP3 612628 sc-eQTL 7.57e-02 0.166 0.0928 0.151 NK_cytokine L2
ENSG00000162398 LEXM 220044 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00471 0.117 0.151 NK_cytokine L2
ENSG00000162402 USP24 -189257 sc-eQTL 1.01e-01 -0.13 0.0791 0.151 NK_cytokine L2
ENSG00000243725 TTC4 310246 sc-eQTL 3.64e-01 -0.107 0.118 0.151 NK_cytokine L2
ENSG00000006555 TTC22 224784 sc-eQTL 9.35e-01 -0.0113 0.138 0.144 PB L2
ENSG00000116133 DHCR24 138912 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0658 0.122 0.144 PB L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972523 sc-eQTL 3.36e-01 -0.144 0.149 0.144 PB L2
ENSG00000116209 TMEM59 972603 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0221 0.0624 0.144 PB L2
ENSG00000116221 MRPL37 842066 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0665 0.113 0.144 PB L2
ENSG00000157216 SSBP3 612628 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0697 0.131 0.144 PB L2
ENSG00000162402 USP24 -189257 sc-eQTL 6.28e-01 0.0723 0.149 0.144 PB L2
ENSG00000215883 CYB5RL 826071 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0942 0.154 0.144 PB L2
ENSG00000243725 TTC4 310246 sc-eQTL 2.76e-01 0.157 0.143 0.144 PB L2
ENSG00000006555 TTC22 224784 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0613 0.115 0.15 Pro_T L2
ENSG00000116133 DHCR24 138912 sc-eQTL 8.87e-01 0.0139 0.0977 0.15 Pro_T L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972523 sc-eQTL 9.37e-01 0.00948 0.119 0.15 Pro_T L2
ENSG00000116209 TMEM59 972603 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0125 0.0828 0.15 Pro_T L2
ENSG00000116221 MRPL37 842066 sc-eQTL 6.68e-02 0.148 0.0804 0.15 Pro_T L2
ENSG00000157216 SSBP3 612628 sc-eQTL 3.53e-01 0.0845 0.0907 0.15 Pro_T L2
ENSG00000162402 USP24 -189257 sc-eQTL 8.84e-01 0.0162 0.111 0.15 Pro_T L2
ENSG00000215883 CYB5RL 826071 sc-eQTL 2.71e-01 0.12 0.109 0.15 Pro_T L2
ENSG00000243725 TTC4 310246 sc-eQTL 2.49e-01 -0.14 0.121 0.15 Pro_T L2
ENSG00000006555 TTC22 224784 sc-eQTL 9.23e-01 0.0108 0.112 0.15 Treg L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972523 sc-eQTL 3.30e-01 0.117 0.12 0.15 Treg L2
ENSG00000116209 TMEM59 972603 sc-eQTL 2.72e-01 0.104 0.0947 0.15 Treg L2
ENSG00000116221 MRPL37 842066 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0111 0.118 0.15 Treg L2
ENSG00000157216 SSBP3 612628 sc-eQTL 2.85e-01 -0.112 0.105 0.15 Treg L2
ENSG00000162402 USP24 -189257 sc-eQTL 3.53e-01 -0.0929 0.0997 0.15 Treg L2
ENSG00000243725 TTC4 310246 sc-eQTL 6.46e-01 0.0579 0.126 0.15 Treg L2
ENSG00000116133 DHCR24 138912 sc-eQTL 7.28e-01 0.0361 0.103 0.146 cDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972523 sc-eQTL 1.69e-02 -0.29 0.12 0.146 cDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 972603 sc-eQTL 5.46e-01 0.0626 0.104 0.146 cDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 842066 sc-eQTL 5.92e-01 0.0712 0.133 0.146 cDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 612628 sc-eQTL 1.94e-01 -0.159 0.122 0.146 cDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 483850 sc-eQTL 4.50e-01 0.086 0.114 0.146 cDC L2
ENSG00000162402 USP24 -189257 sc-eQTL 5.30e-02 -0.246 0.126 0.146 cDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 826071 sc-eQTL 3.43e-01 0.104 0.109 0.146 cDC L2
ENSG00000243725 TTC4 310246 sc-eQTL 2.35e-01 0.155 0.13 0.146 cDC L2
ENSG00000116133 DHCR24 138912 sc-eQTL 6.93e-01 0.0292 0.0738 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972523 sc-eQTL 3.90e-01 0.0883 0.102 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000116209 TMEM59 972603 sc-eQTL 3.08e-01 0.0634 0.0621 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000116221 MRPL37 842066 sc-eQTL 9.42e-01 0.00808 0.111 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000157216 SSBP3 612628 sc-eQTL 8.92e-01 0.0154 0.113 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000162402 USP24 -189257 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0687 0.0835 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000243725 TTC4 310246 sc-eQTL 5.46e-01 0.0773 0.128 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000116133 DHCR24 138912 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0125 0.069 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972523 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0533 0.105 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000116209 TMEM59 972603 sc-eQTL 1.49e-02 0.204 0.0831 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000116221 MRPL37 842066 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00451 0.122 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000157216 SSBP3 612628 sc-eQTL 2.48e-01 0.146 0.126 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000162402 USP24 -189257 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00261 0.102 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000243725 TTC4 310246 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0706 0.128 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000006555 TTC22 224784 sc-eQTL 4.02e-01 -0.102 0.122 0.155 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 138912 sc-eQTL 2.31e-01 -0.163 0.135 0.155 gdT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972523 sc-eQTL 8.96e-01 0.0179 0.136 0.155 gdT L2
ENSG00000116209 TMEM59 972603 sc-eQTL 9.47e-01 0.00914 0.138 0.155 gdT L2
ENSG00000116221 MRPL37 842066 sc-eQTL 1.81e-01 0.212 0.158 0.155 gdT L2
ENSG00000157216 SSBP3 612628 sc-eQTL 6.72e-01 0.0411 0.0971 0.155 gdT L2
ENSG00000162402 USP24 -189257 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0467 0.131 0.155 gdT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 826071 sc-eQTL 4.66e-01 -0.099 0.135 0.155 gdT L2
ENSG00000243725 TTC4 310246 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0496 0.153 0.155 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 138912 sc-eQTL 8.89e-01 0.013 0.0928 0.147 intMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972523 sc-eQTL 4.87e-01 0.0803 0.115 0.147 intMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 972603 sc-eQTL 1.34e-01 0.127 0.0844 0.147 intMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 842066 sc-eQTL 7.58e-01 0.04 0.13 0.147 intMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 612628 sc-eQTL 3.09e-01 0.135 0.132 0.147 intMono L2
ENSG00000162402 USP24 -189257 sc-eQTL 9.15e-01 0.0126 0.118 0.147 intMono L2
ENSG00000243725 TTC4 310246 sc-eQTL 8.32e-01 0.0268 0.126 0.147 intMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 138912 sc-eQTL 6.67e-01 0.0403 0.0935 0.14 ncMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972523 sc-eQTL 7.78e-01 0.0331 0.117 0.14 ncMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 972603 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0379 0.0936 0.14 ncMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 842066 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0705 0.121 0.14 ncMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 612628 sc-eQTL 1.10e-01 0.211 0.131 0.14 ncMono L2
ENSG00000162402 USP24 -189257 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0855 0.105 0.14 ncMono L2
ENSG00000243725 TTC4 310246 sc-eQTL 8.18e-01 0.0288 0.125 0.14 ncMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 138912 sc-eQTL 2.41e-01 0.134 0.114 0.144 pDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 972523 sc-eQTL 8.16e-01 -0.032 0.138 0.144 pDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 972603 sc-eQTL 7.72e-01 0.0318 0.11 0.144 pDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 842066 sc-eQTL 5.33e-02 0.281 0.144 0.144 pDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 612628 sc-eQTL 1.30e-02 -0.319 0.127 0.144 pDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 483850 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0135 0.0545 0.144 pDC L2
ENSG00000162402 USP24 -189257 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0741 0.0919 0.144 pDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 826071 sc-eQTL 8.81e-01 0.0189 0.126 0.144 pDC L2
ENSG00000243725 TTC4 310246 sc-eQTL 7.48e-01 0.0467 0.145 0.144 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 224784 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0594 0.118 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 138912 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0275 0.119 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 972523 sc-eQTL 3.48e-01 -0.108 0.115 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 972603 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0446 0.0893 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 842066 sc-eQTL 3.59e-02 0.224 0.106 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 612628 sc-eQTL 1.42e-02 -0.227 0.0917 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -189257 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0602 0.0848 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 826071 sc-eQTL 7.38e-02 -0.232 0.129 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 310246 sc-eQTL 1.63e-01 0.163 0.117 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 224784 sc-eQTL 2.95e-02 -0.271 0.124 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 138912 sc-eQTL 9.77e-01 0.0032 0.113 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 972523 sc-eQTL 1.27e-01 0.155 0.101 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 972603 sc-eQTL 6.94e-02 0.131 0.0718 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 842066 sc-eQTL 9.13e-01 0.0113 0.104 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 612628 sc-eQTL 2.09e-01 -0.117 0.0927 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -189257 sc-eQTL 9.80e-01 0.002 0.0798 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 826071 sc-eQTL 6.67e-01 0.0544 0.126 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 310246 sc-eQTL 9.70e-01 0.00443 0.119 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 138912 sc-eQTL 8.76e-01 0.0112 0.0713 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 972523 sc-eQTL 5.02e-01 0.0599 0.0891 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 972603 sc-eQTL 6.78e-02 0.112 0.061 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 842066 sc-eQTL 8.01e-01 0.0275 0.109 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 612628 sc-eQTL 3.59e-01 0.105 0.114 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -189257 sc-eQTL 3.56e-01 -0.0719 0.0777 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 310246 sc-eQTL 6.37e-01 0.061 0.129 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 138912 sc-eQTL 4.03e-01 0.0749 0.0894 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 972523 sc-eQTL 1.62e-01 0.164 0.117 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 972603 sc-eQTL 3.37e-01 0.0841 0.0873 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 842066 sc-eQTL 9.46e-01 0.0081 0.12 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 612628 sc-eQTL 7.28e-02 0.229 0.127 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -189257 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0444 0.101 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 310246 sc-eQTL 6.87e-01 0.051 0.126 0.149 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 224784 sc-eQTL 9.92e-02 0.167 0.101 0.151 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 138912 sc-eQTL 3.05e-01 -0.109 0.106 0.151 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 972523 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0572 0.104 0.151 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 972603 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0728 0.0803 0.151 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 842066 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00273 0.108 0.151 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 612628 sc-eQTL 4.54e-01 0.0662 0.0883 0.151 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162398 LEXM 220044 sc-eQTL 3.76e-01 0.0882 0.0994 0.151 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -189257 sc-eQTL 4.69e-02 -0.125 0.0626 0.151 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 310246 sc-eQTL 1.86e-01 -0.149 0.112 0.151 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000162390 ACOT11 483850 eQTL 0.0487 0.0593 0.0301 0.0 0.0 0.161
ENSG00000169174 PCSK9 -13441 pQTL 0.000824 -0.122 0.0363 0.0 0.0 0.162
ENSG00000169174 PCSK9 -13441 eQTL 4.36e-09 -0.129 0.0217 0.327 0.173 0.161

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000169174 PCSK9 -13441 0.000174 1.25e-05 2.48e-06 9.77e-06 3.06e-06 2.06e-05 2.08e-05 2.09e-06 1.67e-05 6.67e-06 1.67e-05 7.38e-06 2.87e-05 4.48e-06 4.35e-06 1.43e-05 7.11e-06 2.79e-05 2.74e-06 2.8e-06 6.93e-06 1.91e-05 1.67e-05 4.01e-06 2.91e-05 5.51e-06 7.99e-06 5.34e-06 1.65e-05 1.38e-05 1.04e-05 9.62e-07 1.17e-06 3.52e-06 7.03e-06 2.82e-06 1.76e-06 1.94e-06 2.15e-06 1.4e-06 9.26e-07 2.01e-05 3.5e-06 1.87e-07 6.82e-07 1.72e-06 2.9e-06 6.21e-07 5.85e-07
ENSG00000215883 \N 826071 1.87e-06 1.53e-07 5.82e-08 2.26e-07 1.02e-07 4.35e-07 3.11e-07 5.37e-08 1.96e-07 8.53e-08 1.62e-07 1.23e-07 4.05e-07 8.54e-08 5.69e-08 1.33e-07 4.31e-08 3.73e-07 6.75e-08 4.23e-08 1.24e-07 2.24e-07 2.33e-07 3.42e-08 4.67e-07 2.07e-07 1.22e-07 1.04e-07 1.76e-07 1.33e-07 1.52e-07 3.71e-08 3.09e-08 8.11e-08 3.57e-08 2.95e-08 4.99e-08 8.93e-08 6.63e-08 3.18e-08 5.13e-08 7.54e-07 1.21e-08 1.52e-08 8.03e-08 1.92e-08 1e-07 4.04e-09 4.85e-08