logo

Genes within 1Mb (chr1:55024287:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 222964 sc-eQTL 8.75e-02 -0.203 0.118 0.13 B L1
ENSG00000116133 DHCR24 137092 sc-eQTL 4.39e-01 -0.087 0.112 0.13 B L1
ENSG00000116205 TCEANC2 970703 sc-eQTL 1.89e-01 0.127 0.0966 0.13 B L1
ENSG00000116209 TMEM59 970783 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0213 0.0591 0.13 B L1
ENSG00000116221 MRPL37 840246 sc-eQTL 8.42e-01 0.0154 0.0773 0.13 B L1
ENSG00000157216 SSBP3 610808 sc-eQTL 2.37e-02 -0.182 0.08 0.13 B L1
ENSG00000162402 USP24 -191077 sc-eQTL 2.64e-01 -0.0766 0.0684 0.13 B L1
ENSG00000215883 CYB5RL 824251 sc-eQTL 7.80e-01 -0.037 0.132 0.13 B L1
ENSG00000243725 TTC4 308426 sc-eQTL 8.24e-01 0.0255 0.115 0.13 B L1
ENSG00000006555 TTC22 222964 sc-eQTL 8.67e-01 0.0157 0.0939 0.13 CD4T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 970703 sc-eQTL 1.49e-01 0.111 0.0764 0.13 CD4T L1
ENSG00000116209 TMEM59 970783 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0571 0.0715 0.13 CD4T L1
ENSG00000116221 MRPL37 840246 sc-eQTL 1.88e-01 0.13 0.0985 0.13 CD4T L1
ENSG00000157216 SSBP3 610808 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0185 0.0821 0.13 CD4T L1
ENSG00000162402 USP24 -191077 sc-eQTL 2.58e-01 -0.0756 0.0667 0.13 CD4T L1
ENSG00000243725 TTC4 308426 sc-eQTL 2.99e-01 -0.105 0.1 0.13 CD4T L1
ENSG00000006555 TTC22 222964 sc-eQTL 8.74e-01 0.0126 0.0795 0.13 CD8T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 970703 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0623 0.0989 0.13 CD8T L1
ENSG00000116209 TMEM59 970783 sc-eQTL 4.32e-01 -0.054 0.0686 0.13 CD8T L1
ENSG00000116221 MRPL37 840246 sc-eQTL 3.80e-01 0.083 0.0944 0.13 CD8T L1
ENSG00000157216 SSBP3 610808 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0345 0.0679 0.13 CD8T L1
ENSG00000162402 USP24 -191077 sc-eQTL 2.60e-01 -0.0741 0.0655 0.13 CD8T L1
ENSG00000243725 TTC4 308426 sc-eQTL 1.76e-01 -0.154 0.114 0.13 CD8T L1
ENSG00000116133 DHCR24 137092 sc-eQTL 8.18e-01 0.0253 0.11 0.131 DC L1
ENSG00000116205 TCEANC2 970703 sc-eQTL 1.26e-01 -0.187 0.122 0.131 DC L1
ENSG00000116209 TMEM59 970783 sc-eQTL 9.97e-02 0.159 0.0959 0.131 DC L1
ENSG00000116221 MRPL37 840246 sc-eQTL 1.20e-01 0.201 0.129 0.131 DC L1
ENSG00000157216 SSBP3 610808 sc-eQTL 8.42e-02 -0.199 0.115 0.131 DC L1
ENSG00000162390 ACOT11 482030 sc-eQTL 3.69e-01 0.1 0.111 0.131 DC L1
ENSG00000162402 USP24 -191077 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0172 0.0671 0.131 DC L1
ENSG00000215883 CYB5RL 824251 sc-eQTL 5.43e-02 0.233 0.12 0.131 DC L1
ENSG00000243725 TTC4 308426 sc-eQTL 8.98e-01 0.0168 0.131 0.131 DC L1
ENSG00000116133 DHCR24 137092 sc-eQTL 6.56e-01 0.0346 0.0777 0.13 Mono L1
ENSG00000116205 TCEANC2 970703 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0565 0.0837 0.13 Mono L1
ENSG00000116209 TMEM59 970783 sc-eQTL 2.16e-01 0.077 0.062 0.13 Mono L1
ENSG00000116221 MRPL37 840246 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0172 0.104 0.13 Mono L1
ENSG00000157216 SSBP3 610808 sc-eQTL 5.23e-01 0.0763 0.119 0.13 Mono L1
ENSG00000162402 USP24 -191077 sc-eQTL 3.69e-01 -0.0639 0.071 0.13 Mono L1
ENSG00000243725 TTC4 308426 sc-eQTL 4.63e-01 0.0919 0.125 0.13 Mono L1
ENSG00000006555 TTC22 222964 sc-eQTL 4.05e-01 0.0885 0.106 0.131 NK L1
ENSG00000116133 DHCR24 137092 sc-eQTL 2.29e-01 -0.129 0.107 0.131 NK L1
ENSG00000116205 TCEANC2 970703 sc-eQTL 3.74e-01 -0.0941 0.106 0.131 NK L1
ENSG00000116209 TMEM59 970783 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0305 0.0829 0.131 NK L1
ENSG00000116221 MRPL37 840246 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0956 0.103 0.131 NK L1
ENSG00000157216 SSBP3 610808 sc-eQTL 4.66e-01 0.0651 0.0893 0.131 NK L1
ENSG00000162398 LEXM 218224 sc-eQTL 6.39e-01 0.0471 0.1 0.131 NK L1
ENSG00000162402 USP24 -191077 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0505 0.0607 0.131 NK L1
ENSG00000243725 TTC4 308426 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0635 0.115 0.131 NK L1
ENSG00000006555 TTC22 222964 sc-eQTL 9.94e-01 0.000749 0.0946 0.13 Other_T L1
ENSG00000116133 DHCR24 137092 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0174 0.0734 0.13 Other_T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 970703 sc-eQTL 7.16e-01 0.0401 0.11 0.13 Other_T L1
ENSG00000116209 TMEM59 970783 sc-eQTL 8.36e-01 0.0156 0.0753 0.13 Other_T L1
ENSG00000116221 MRPL37 840246 sc-eQTL 8.90e-02 0.12 0.0701 0.13 Other_T L1
ENSG00000157216 SSBP3 610808 sc-eQTL 8.98e-01 0.0105 0.0816 0.13 Other_T L1
ENSG00000162402 USP24 -191077 sc-eQTL 5.48e-01 0.0522 0.0869 0.13 Other_T L1
ENSG00000215883 CYB5RL 824251 sc-eQTL 1.58e-01 0.168 0.118 0.13 Other_T L1
ENSG00000243725 TTC4 308426 sc-eQTL 2.70e-02 -0.261 0.117 0.13 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 222964 sc-eQTL 2.25e-01 0.123 0.101 0.125 B_Activated L2
ENSG00000116133 DHCR24 137092 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0572 0.119 0.125 B_Activated L2
ENSG00000116205 TCEANC2 970703 sc-eQTL 2.78e-01 -0.139 0.128 0.125 B_Activated L2
ENSG00000116209 TMEM59 970783 sc-eQTL 2.82e-01 -0.147 0.136 0.125 B_Activated L2
ENSG00000116221 MRPL37 840246 sc-eQTL 1.96e-01 -0.19 0.146 0.125 B_Activated L2
ENSG00000157216 SSBP3 610808 sc-eQTL 9.52e-02 -0.222 0.132 0.125 B_Activated L2
ENSG00000162402 USP24 -191077 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0281 0.13 0.125 B_Activated L2
ENSG00000215883 CYB5RL 824251 sc-eQTL 7.87e-01 -0.031 0.115 0.125 B_Activated L2
ENSG00000243725 TTC4 308426 sc-eQTL 5.92e-01 0.0668 0.124 0.125 B_Activated L2
ENSG00000006555 TTC22 222964 sc-eQTL 2.70e-01 0.14 0.126 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000116133 DHCR24 137092 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0381 0.118 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000116205 TCEANC2 970703 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0251 0.117 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000116209 TMEM59 970783 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0286 0.1 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000116221 MRPL37 840246 sc-eQTL 9.86e-01 0.00213 0.118 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000157216 SSBP3 610808 sc-eQTL 1.82e-01 -0.147 0.11 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000162402 USP24 -191077 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0328 0.0928 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000215883 CYB5RL 824251 sc-eQTL 9.96e-01 0.000697 0.131 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000243725 TTC4 308426 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0188 0.119 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000006555 TTC22 222964 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0781 0.123 0.131 B_Memory L2
ENSG00000116133 DHCR24 137092 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0447 0.122 0.131 B_Memory L2
ENSG00000116205 TCEANC2 970703 sc-eQTL 1.34e-01 0.195 0.13 0.131 B_Memory L2
ENSG00000116209 TMEM59 970783 sc-eQTL 3.00e-01 -0.113 0.108 0.131 B_Memory L2
ENSG00000116221 MRPL37 840246 sc-eQTL 1.80e-01 0.147 0.11 0.131 B_Memory L2
ENSG00000157216 SSBP3 610808 sc-eQTL 6.61e-01 0.045 0.103 0.131 B_Memory L2
ENSG00000162402 USP24 -191077 sc-eQTL 9.32e-01 0.00863 0.1 0.131 B_Memory L2
ENSG00000215883 CYB5RL 824251 sc-eQTL 1.33e-01 -0.186 0.123 0.131 B_Memory L2
ENSG00000243725 TTC4 308426 sc-eQTL 4.32e-01 0.101 0.128 0.131 B_Memory L2
ENSG00000006555 TTC22 222964 sc-eQTL 1.18e-02 -0.316 0.124 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000116133 DHCR24 137092 sc-eQTL 3.59e-01 -0.109 0.118 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 970703 sc-eQTL 6.46e-01 0.0486 0.106 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000116209 TMEM59 970783 sc-eQTL 5.84e-01 0.042 0.0767 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000116221 MRPL37 840246 sc-eQTL 7.39e-01 0.0377 0.113 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000157216 SSBP3 610808 sc-eQTL 2.26e-01 -0.13 0.107 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000162402 USP24 -191077 sc-eQTL 8.11e-01 0.0203 0.0849 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 824251 sc-eQTL 5.62e-01 0.0744 0.128 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000243725 TTC4 308426 sc-eQTL 6.21e-01 0.0572 0.116 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000006555 TTC22 222964 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0464 0.127 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000116133 DHCR24 137092 sc-eQTL 2.48e-01 -0.127 0.11 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 970703 sc-eQTL 9.49e-02 0.204 0.122 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000116209 TMEM59 970783 sc-eQTL 9.97e-02 0.166 0.1 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000116221 MRPL37 840246 sc-eQTL 3.08e-01 -0.121 0.118 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000157216 SSBP3 610808 sc-eQTL 7.37e-01 0.0393 0.117 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000162402 USP24 -191077 sc-eQTL 4.58e-02 -0.184 0.0917 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 824251 sc-eQTL 2.72e-01 -0.143 0.13 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000243725 TTC4 308426 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00799 0.136 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000006555 TTC22 222964 sc-eQTL 4.08e-01 0.099 0.119 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 970703 sc-eQTL 8.03e-01 0.0308 0.123 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 970783 sc-eQTL 9.19e-01 0.0114 0.112 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 840246 sc-eQTL 6.65e-03 0.371 0.135 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 610808 sc-eQTL 2.24e-01 -0.103 0.0843 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -191077 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0881 0.116 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 308426 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0692 0.13 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 222964 sc-eQTL 2.25e-01 0.135 0.111 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 970703 sc-eQTL 2.49e-01 0.0972 0.0841 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 970783 sc-eQTL 2.36e-01 -0.0972 0.0818 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 840246 sc-eQTL 2.78e-01 0.115 0.105 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 610808 sc-eQTL 9.61e-02 0.14 0.0839 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -191077 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0272 0.0728 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 308426 sc-eQTL 3.69e-01 -0.0998 0.111 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 222964 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0709 0.115 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 970703 sc-eQTL 2.04e-01 0.142 0.111 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 970783 sc-eQTL 9.09e-01 0.00963 0.0842 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 840246 sc-eQTL 5.38e-01 0.0653 0.106 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 610808 sc-eQTL 6.10e-01 0.053 0.104 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -191077 sc-eQTL 7.90e-01 0.023 0.086 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 308426 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0647 0.124 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 222964 sc-eQTL 8.75e-01 0.0206 0.13 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 970703 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0897 0.123 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 970783 sc-eQTL 9.61e-01 0.00464 0.0958 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 840246 sc-eQTL 5.61e-01 0.0718 0.123 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 610808 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000917 0.106 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -191077 sc-eQTL 3.30e-01 -0.0936 0.096 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 308426 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0183 0.127 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 222964 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00751 0.104 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 970703 sc-eQTL 9.32e-02 -0.193 0.115 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 970783 sc-eQTL 5.91e-01 -0.054 0.1 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 840246 sc-eQTL 2.65e-01 0.132 0.118 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 610808 sc-eQTL 5.97e-01 -0.043 0.0812 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -191077 sc-eQTL 2.44e-01 -0.0941 0.0805 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 308426 sc-eQTL 3.41e-01 -0.115 0.121 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 222964 sc-eQTL 2.31e-01 -0.138 0.115 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 970703 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0818 0.105 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 970783 sc-eQTL 1.61e-01 -0.143 0.102 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 840246 sc-eQTL 4.19e-01 0.0993 0.123 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 610808 sc-eQTL 1.19e-01 0.145 0.0924 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -191077 sc-eQTL 5.31e-01 0.053 0.0845 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 308426 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0829 0.124 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 222964 sc-eQTL 4.99e-01 0.087 0.128 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 970703 sc-eQTL 7.78e-02 0.227 0.128 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 970783 sc-eQTL 3.46e-02 0.24 0.113 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 840246 sc-eQTL 7.31e-01 0.0444 0.129 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 610808 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0236 0.112 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -191077 sc-eQTL 8.54e-01 0.0201 0.109 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 308426 sc-eQTL 4.19e-01 -0.107 0.132 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 222964 sc-eQTL 6.11e-01 0.0617 0.121 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 970703 sc-eQTL 8.24e-01 0.0281 0.126 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 970783 sc-eQTL 6.24e-01 0.0601 0.122 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 840246 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0914 0.124 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 610808 sc-eQTL 7.73e-01 0.0339 0.117 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -191077 sc-eQTL 9.46e-01 0.00836 0.124 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 308426 sc-eQTL 8.82e-01 0.0186 0.126 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 222964 sc-eQTL 2.05e-01 0.143 0.113 0.132 MAIT L2
ENSG00000116133 DHCR24 137092 sc-eQTL 7.84e-01 0.023 0.0836 0.132 MAIT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 970703 sc-eQTL 3.65e-01 -0.107 0.117 0.132 MAIT L2
ENSG00000116209 TMEM59 970783 sc-eQTL 3.50e-01 0.0995 0.106 0.132 MAIT L2
ENSG00000116221 MRPL37 840246 sc-eQTL 1.57e-01 0.183 0.129 0.132 MAIT L2
ENSG00000157216 SSBP3 610808 sc-eQTL 5.76e-02 -0.217 0.114 0.132 MAIT L2
ENSG00000162402 USP24 -191077 sc-eQTL 1.90e-01 0.133 0.101 0.132 MAIT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 824251 sc-eQTL 4.72e-01 0.085 0.118 0.132 MAIT L2
ENSG00000243725 TTC4 308426 sc-eQTL 7.99e-02 -0.205 0.117 0.132 MAIT L2
ENSG00000006555 TTC22 222964 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00231 0.131 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000116133 DHCR24 137092 sc-eQTL 7.57e-01 0.0359 0.116 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000116205 TCEANC2 970703 sc-eQTL 1.76e-01 0.165 0.122 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000116209 TMEM59 970783 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0155 0.119 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000116221 MRPL37 840246 sc-eQTL 8.05e-02 0.232 0.132 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000157216 SSBP3 610808 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0666 0.1 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000162398 LEXM 218224 sc-eQTL 1.76e-01 -0.16 0.118 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000162402 USP24 -191077 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0605 0.102 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000243725 TTC4 308426 sc-eQTL 5.69e-01 0.0734 0.129 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000006555 TTC22 222964 sc-eQTL 3.57e-01 0.099 0.107 0.131 NK_CD56dim L2
ENSG00000116133 DHCR24 137092 sc-eQTL 8.72e-01 0.0181 0.112 0.131 NK_CD56dim L2
ENSG00000116205 TCEANC2 970703 sc-eQTL 2.52e-01 -0.139 0.121 0.131 NK_CD56dim L2
ENSG00000116209 TMEM59 970783 sc-eQTL 6.18e-01 -0.045 0.09 0.131 NK_CD56dim L2
ENSG00000116221 MRPL37 840246 sc-eQTL 2.62e-01 -0.131 0.117 0.131 NK_CD56dim L2
ENSG00000157216 SSBP3 610808 sc-eQTL 3.72e-01 0.0857 0.0957 0.131 NK_CD56dim L2
ENSG00000162398 LEXM 218224 sc-eQTL 8.74e-01 0.0175 0.11 0.131 NK_CD56dim L2
ENSG00000162402 USP24 -191077 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00385 0.0701 0.131 NK_CD56dim L2
ENSG00000243725 TTC4 308426 sc-eQTL 1.54e-01 -0.171 0.119 0.131 NK_CD56dim L2
ENSG00000006555 TTC22 222964 sc-eQTL 3.98e-02 0.268 0.13 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000116133 DHCR24 137092 sc-eQTL 4.07e-01 -0.106 0.128 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000116205 TCEANC2 970703 sc-eQTL 1.11e-01 0.196 0.122 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000116209 TMEM59 970783 sc-eQTL 5.00e-01 0.0827 0.122 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000116221 MRPL37 840246 sc-eQTL 3.04e-01 -0.139 0.135 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000157216 SSBP3 610808 sc-eQTL 2.80e-01 0.119 0.11 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000162398 LEXM 218224 sc-eQTL 6.16e-01 0.0624 0.124 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000162402 USP24 -191077 sc-eQTL 7.34e-01 0.0309 0.091 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000243725 TTC4 308426 sc-eQTL 3.52e-01 0.127 0.136 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000006555 TTC22 222964 sc-eQTL 9.59e-01 0.00584 0.114 0.131 NK_cytokine L2
ENSG00000116133 DHCR24 137092 sc-eQTL 2.05e-02 -0.266 0.114 0.131 NK_cytokine L2
ENSG00000116205 TCEANC2 970703 sc-eQTL 8.38e-02 -0.198 0.114 0.131 NK_cytokine L2
ENSG00000116209 TMEM59 970783 sc-eQTL 8.31e-01 0.0198 0.0931 0.131 NK_cytokine L2
ENSG00000116221 MRPL37 840246 sc-eQTL 9.40e-01 0.0086 0.115 0.131 NK_cytokine L2
ENSG00000157216 SSBP3 610808 sc-eQTL 5.88e-02 0.181 0.0954 0.131 NK_cytokine L2
ENSG00000162398 LEXM 218224 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00454 0.12 0.131 NK_cytokine L2
ENSG00000162402 USP24 -191077 sc-eQTL 9.99e-02 -0.135 0.0814 0.131 NK_cytokine L2
ENSG00000243725 TTC4 308426 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0837 0.121 0.131 NK_cytokine L2
ENSG00000006555 TTC22 222964 sc-eQTL 1.50e-01 -0.205 0.141 0.133 PB L2
ENSG00000116133 DHCR24 137092 sc-eQTL 9.95e-01 0.000831 0.126 0.133 PB L2
ENSG00000116205 TCEANC2 970703 sc-eQTL 1.15e-01 -0.241 0.152 0.133 PB L2
ENSG00000116209 TMEM59 970783 sc-eQTL 9.37e-01 0.0051 0.0643 0.133 PB L2
ENSG00000116221 MRPL37 840246 sc-eQTL 8.21e-01 0.0265 0.117 0.133 PB L2
ENSG00000157216 SSBP3 610808 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0832 0.135 0.133 PB L2
ENSG00000162402 USP24 -191077 sc-eQTL 7.86e-01 0.0416 0.153 0.133 PB L2
ENSG00000215883 CYB5RL 824251 sc-eQTL 6.12e-01 0.0808 0.159 0.133 PB L2
ENSG00000243725 TTC4 308426 sc-eQTL 4.99e-01 0.1 0.148 0.133 PB L2
ENSG00000006555 TTC22 222964 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0889 0.116 0.13 Pro_T L2
ENSG00000116133 DHCR24 137092 sc-eQTL 7.04e-01 0.0377 0.0988 0.13 Pro_T L2
ENSG00000116205 TCEANC2 970703 sc-eQTL 8.67e-01 0.0202 0.121 0.13 Pro_T L2
ENSG00000116209 TMEM59 970783 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0552 0.0836 0.13 Pro_T L2
ENSG00000116221 MRPL37 840246 sc-eQTL 5.43e-01 0.0499 0.0819 0.13 Pro_T L2
ENSG00000157216 SSBP3 610808 sc-eQTL 1.28e-01 0.14 0.0915 0.13 Pro_T L2
ENSG00000162402 USP24 -191077 sc-eQTL 5.51e-01 -0.067 0.112 0.13 Pro_T L2
ENSG00000215883 CYB5RL 824251 sc-eQTL 3.41e-01 0.105 0.11 0.13 Pro_T L2
ENSG00000243725 TTC4 308426 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0668 0.123 0.13 Pro_T L2
ENSG00000006555 TTC22 222964 sc-eQTL 5.87e-01 0.0623 0.115 0.13 Treg L2
ENSG00000116205 TCEANC2 970703 sc-eQTL 3.91e-01 0.106 0.123 0.13 Treg L2
ENSG00000116209 TMEM59 970783 sc-eQTL 4.90e-01 0.0672 0.0971 0.13 Treg L2
ENSG00000116221 MRPL37 840246 sc-eQTL 8.25e-01 0.0266 0.12 0.13 Treg L2
ENSG00000157216 SSBP3 610808 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00187 0.107 0.13 Treg L2
ENSG00000162402 USP24 -191077 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0825 0.102 0.13 Treg L2
ENSG00000243725 TTC4 308426 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0829 0.129 0.13 Treg L2
ENSG00000116133 DHCR24 137092 sc-eQTL 2.44e-01 0.124 0.106 0.132 cDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 970703 sc-eQTL 4.26e-02 -0.253 0.124 0.132 cDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 970783 sc-eQTL 3.13e-01 0.107 0.106 0.132 cDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 840246 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0676 0.136 0.132 cDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 610808 sc-eQTL 4.12e-01 -0.103 0.125 0.132 cDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 482030 sc-eQTL 2.45e-01 0.136 0.116 0.132 cDC L2
ENSG00000162402 USP24 -191077 sc-eQTL 2.04e-01 -0.166 0.13 0.132 cDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 824251 sc-eQTL 6.46e-02 0.207 0.111 0.132 cDC L2
ENSG00000243725 TTC4 308426 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0331 0.134 0.132 cDC L2
ENSG00000116133 DHCR24 137092 sc-eQTL 8.11e-01 0.018 0.075 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000116205 TCEANC2 970703 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0154 0.104 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000116209 TMEM59 970783 sc-eQTL 4.25e-01 0.0505 0.0631 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000116221 MRPL37 840246 sc-eQTL 8.60e-01 0.0199 0.113 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000157216 SSBP3 610808 sc-eQTL 8.03e-01 0.0287 0.115 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000162402 USP24 -191077 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0213 0.0849 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000243725 TTC4 308426 sc-eQTL 5.60e-01 0.0756 0.13 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000116133 DHCR24 137092 sc-eQTL 2.34e-01 -0.0846 0.0709 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000116205 TCEANC2 970703 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0961 0.108 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000116209 TMEM59 970783 sc-eQTL 2.87e-01 0.0925 0.0866 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000116221 MRPL37 840246 sc-eQTL 3.95e-01 -0.107 0.125 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000157216 SSBP3 610808 sc-eQTL 6.87e-01 0.0525 0.13 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000162402 USP24 -191077 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0208 0.105 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000243725 TTC4 308426 sc-eQTL 5.25e-01 0.084 0.132 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000006555 TTC22 222964 sc-eQTL 3.73e-01 -0.111 0.124 0.133 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 137092 sc-eQTL 3.65e-01 -0.126 0.138 0.133 gdT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 970703 sc-eQTL 7.32e-01 0.0478 0.139 0.133 gdT L2
ENSG00000116209 TMEM59 970783 sc-eQTL 2.76e-01 0.154 0.141 0.133 gdT L2
ENSG00000116221 MRPL37 840246 sc-eQTL 2.14e-01 0.201 0.161 0.133 gdT L2
ENSG00000157216 SSBP3 610808 sc-eQTL 5.51e-02 0.189 0.098 0.133 gdT L2
ENSG00000162402 USP24 -191077 sc-eQTL 3.93e-01 -0.114 0.133 0.133 gdT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 824251 sc-eQTL 7.66e-01 0.0413 0.139 0.133 gdT L2
ENSG00000243725 TTC4 308426 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0835 0.156 0.133 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 137092 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0852 0.094 0.129 intMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 970703 sc-eQTL 9.77e-01 0.00332 0.117 0.129 intMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 970783 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0375 0.0861 0.129 intMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 840246 sc-eQTL 7.21e-01 -0.047 0.132 0.129 intMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 610808 sc-eQTL 8.07e-01 0.0329 0.134 0.129 intMono L2
ENSG00000162402 USP24 -191077 sc-eQTL 1.16e-01 0.188 0.119 0.129 intMono L2
ENSG00000243725 TTC4 308426 sc-eQTL 3.79e-01 0.112 0.128 0.129 intMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 137092 sc-eQTL 3.57e-01 0.0878 0.0952 0.124 ncMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 970703 sc-eQTL 3.73e-01 0.106 0.119 0.124 ncMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 970783 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0843 0.0952 0.124 ncMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 840246 sc-eQTL 8.57e-01 0.0223 0.123 0.124 ncMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 610808 sc-eQTL 9.43e-01 0.00965 0.135 0.124 ncMono L2
ENSG00000162402 USP24 -191077 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0905 0.107 0.124 ncMono L2
ENSG00000243725 TTC4 308426 sc-eQTL 8.76e-02 0.217 0.126 0.124 ncMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 137092 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0159 0.113 0.127 pDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 970703 sc-eQTL 3.16e-01 -0.136 0.135 0.127 pDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 970783 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00193 0.108 0.127 pDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 840246 sc-eQTL 1.08e-02 0.362 0.14 0.127 pDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 610808 sc-eQTL 7.31e-02 -0.227 0.126 0.127 pDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 482030 sc-eQTL 8.53e-01 -0.00994 0.0535 0.127 pDC L2
ENSG00000162402 USP24 -191077 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0235 0.0903 0.127 pDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 824251 sc-eQTL 4.04e-01 0.103 0.123 0.127 pDC L2
ENSG00000243725 TTC4 308426 sc-eQTL 7.28e-01 0.0497 0.143 0.127 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 222964 sc-eQTL 7.15e-01 0.0447 0.122 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 137092 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0434 0.123 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 970703 sc-eQTL 8.27e-01 0.026 0.119 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 970783 sc-eQTL 9.98e-02 -0.152 0.0918 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 840246 sc-eQTL 3.48e-01 0.104 0.11 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 610808 sc-eQTL 3.27e-01 -0.0943 0.096 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -191077 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0339 0.0877 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 824251 sc-eQTL 3.82e-01 -0.118 0.135 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 308426 sc-eQTL 4.52e-01 0.0911 0.121 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 222964 sc-eQTL 1.57e-02 -0.307 0.126 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 137092 sc-eQTL 2.12e-01 -0.143 0.115 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 970703 sc-eQTL 2.42e-01 0.122 0.104 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 970783 sc-eQTL 2.45e-01 0.086 0.0737 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 840246 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0444 0.106 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 610808 sc-eQTL 3.60e-01 -0.087 0.0949 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -191077 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0399 0.0815 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 824251 sc-eQTL 9.65e-01 0.00566 0.129 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 308426 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00691 0.121 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 137092 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0124 0.0728 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 970703 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0413 0.0911 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 970783 sc-eQTL 2.77e-01 0.0684 0.0627 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 840246 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0237 0.111 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 610808 sc-eQTL 7.02e-01 0.0446 0.116 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -191077 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0503 0.0796 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 308426 sc-eQTL 3.23e-01 0.13 0.132 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 137092 sc-eQTL 7.84e-01 0.025 0.091 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 970703 sc-eQTL 2.55e-01 0.136 0.119 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 970783 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0182 0.089 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 840246 sc-eQTL 8.48e-01 0.0233 0.122 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 610808 sc-eQTL 6.22e-01 0.0642 0.13 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -191077 sc-eQTL 7.31e-01 0.0352 0.102 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 308426 sc-eQTL 7.30e-02 0.23 0.127 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 222964 sc-eQTL 2.70e-01 0.115 0.104 0.131 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 137092 sc-eQTL 2.41e-01 -0.128 0.108 0.131 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 970703 sc-eQTL 3.69e-01 -0.0959 0.107 0.131 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 970783 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0318 0.0825 0.131 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 840246 sc-eQTL 1.84e-01 -0.147 0.11 0.131 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 610808 sc-eQTL 2.89e-01 0.0962 0.0905 0.131 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162398 LEXM 218224 sc-eQTL 4.73e-01 0.0734 0.102 0.131 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -191077 sc-eQTL 2.95e-01 -0.068 0.0647 0.131 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 308426 sc-eQTL 3.27e-01 -0.113 0.115 0.131 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000169174 \N -15261 2.43e-05 2.65e-05 4.42e-06 1.32e-05 3.99e-06 1.02e-05 3.22e-05 3.72e-06 2.34e-05 1.12e-05 2.99e-05 1.29e-05 3.8e-05 1.16e-05 5.26e-06 1.39e-05 1.3e-05 2.03e-05 6.61e-06 5.11e-06 9.96e-06 2.36e-05 2.47e-05 6.56e-06 4.15e-05 5.98e-06 1.02e-05 8.71e-06 2.33e-05 2.05e-05 1.53e-05 1.65e-06 1.71e-06 5.41e-06 9.92e-06 4.4e-06 2.27e-06 2.76e-06 3.61e-06 2.49e-06 1.67e-06 3.18e-05 2.75e-06 3.73e-07 1.95e-06 2.69e-06 3.36e-06 1.35e-06 1.24e-06