logo

Genes within 1Mb (chr1:55023869:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 222546 sc-eQTL 8.94e-02 -0.212 0.124 0.12 B L1
ENSG00000116133 DHCR24 136674 sc-eQTL 3.18e-01 -0.118 0.118 0.12 B L1
ENSG00000116205 TCEANC2 970285 sc-eQTL 6.61e-01 0.0449 0.102 0.12 B L1
ENSG00000116209 TMEM59 970365 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0309 0.0622 0.12 B L1
ENSG00000116221 MRPL37 839828 sc-eQTL 2.94e-01 0.0855 0.0813 0.12 B L1
ENSG00000157216 SSBP3 610390 sc-eQTL 3.17e-04 -0.303 0.0827 0.12 B L1
ENSG00000162402 USP24 -191495 sc-eQTL 2.87e-01 -0.0769 0.0721 0.12 B L1
ENSG00000215883 CYB5RL 823833 sc-eQTL 8.91e-01 0.0191 0.139 0.12 B L1
ENSG00000243725 TTC4 308008 sc-eQTL 5.23e-01 0.0775 0.121 0.12 B L1
ENSG00000006555 TTC22 222546 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0771 0.0971 0.12 CD4T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 970285 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00437 0.0795 0.12 CD4T L1
ENSG00000116209 TMEM59 970365 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0558 0.074 0.12 CD4T L1
ENSG00000116221 MRPL37 839828 sc-eQTL 3.92e-01 0.0877 0.102 0.12 CD4T L1
ENSG00000157216 SSBP3 610390 sc-eQTL 2.17e-01 -0.105 0.0847 0.12 CD4T L1
ENSG00000162402 USP24 -191495 sc-eQTL 1.77e-01 -0.0935 0.069 0.12 CD4T L1
ENSG00000243725 TTC4 308008 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0965 0.104 0.12 CD4T L1
ENSG00000006555 TTC22 222546 sc-eQTL 5.34e-01 0.0516 0.0828 0.12 CD8T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 970285 sc-eQTL 4.44e-01 -0.079 0.103 0.12 CD8T L1
ENSG00000116209 TMEM59 970365 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0661 0.0715 0.12 CD8T L1
ENSG00000116221 MRPL37 839828 sc-eQTL 2.79e-01 0.107 0.0984 0.12 CD8T L1
ENSG00000157216 SSBP3 610390 sc-eQTL 1.11e-01 -0.113 0.0705 0.12 CD8T L1
ENSG00000162402 USP24 -191495 sc-eQTL 1.85e-01 -0.0908 0.0683 0.12 CD8T L1
ENSG00000243725 TTC4 308008 sc-eQTL 9.33e-01 -0.0101 0.119 0.12 CD8T L1
ENSG00000116133 DHCR24 136674 sc-eQTL 7.61e-01 0.0353 0.116 0.117 DC L1
ENSG00000116205 TCEANC2 970285 sc-eQTL 2.52e-01 -0.149 0.13 0.117 DC L1
ENSG00000116209 TMEM59 970365 sc-eQTL 2.11e-01 0.128 0.102 0.117 DC L1
ENSG00000116221 MRPL37 839828 sc-eQTL 9.07e-02 0.232 0.136 0.117 DC L1
ENSG00000157216 SSBP3 610390 sc-eQTL 9.63e-02 -0.203 0.122 0.117 DC L1
ENSG00000162390 ACOT11 481612 sc-eQTL 2.72e-01 0.129 0.117 0.117 DC L1
ENSG00000162402 USP24 -191495 sc-eQTL 2.95e-01 -0.0744 0.0709 0.117 DC L1
ENSG00000215883 CYB5RL 823833 sc-eQTL 2.94e-01 0.135 0.128 0.117 DC L1
ENSG00000243725 TTC4 308008 sc-eQTL 6.00e-02 0.259 0.137 0.117 DC L1
ENSG00000116133 DHCR24 136674 sc-eQTL 5.19e-01 0.0539 0.0834 0.12 Mono L1
ENSG00000116205 TCEANC2 970285 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0171 0.0901 0.12 Mono L1
ENSG00000116209 TMEM59 970365 sc-eQTL 3.41e-02 0.141 0.0662 0.12 Mono L1
ENSG00000116221 MRPL37 839828 sc-eQTL 9.59e-01 0.00581 0.112 0.12 Mono L1
ENSG00000157216 SSBP3 610390 sc-eQTL 4.61e-01 0.0946 0.128 0.12 Mono L1
ENSG00000162402 USP24 -191495 sc-eQTL 5.10e-02 -0.149 0.0757 0.12 Mono L1
ENSG00000243725 TTC4 308008 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0632 0.134 0.12 Mono L1
ENSG00000006555 TTC22 222546 sc-eQTL 9.52e-02 0.186 0.111 0.12 NK L1
ENSG00000116133 DHCR24 136674 sc-eQTL 2.80e-01 -0.122 0.112 0.12 NK L1
ENSG00000116205 TCEANC2 970285 sc-eQTL 5.58e-01 -0.065 0.111 0.12 NK L1
ENSG00000116209 TMEM59 970365 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0748 0.0868 0.12 NK L1
ENSG00000116221 MRPL37 839828 sc-eQTL 6.26e-01 0.0527 0.108 0.12 NK L1
ENSG00000157216 SSBP3 610390 sc-eQTL 6.30e-01 0.0452 0.0937 0.12 NK L1
ENSG00000162398 LEXM 217806 sc-eQTL 8.56e-01 0.0191 0.105 0.12 NK L1
ENSG00000162402 USP24 -191495 sc-eQTL 3.26e-02 -0.136 0.0631 0.12 NK L1
ENSG00000243725 TTC4 308008 sc-eQTL 4.31e-01 -0.095 0.12 0.12 NK L1
ENSG00000006555 TTC22 222546 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0236 0.1 0.12 Other_T L1
ENSG00000116133 DHCR24 136674 sc-eQTL 2.96e-01 -0.0812 0.0775 0.12 Other_T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 970285 sc-eQTL 9.76e-01 0.00345 0.116 0.12 Other_T L1
ENSG00000116209 TMEM59 970365 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0534 0.0797 0.12 Other_T L1
ENSG00000116221 MRPL37 839828 sc-eQTL 3.03e-02 0.161 0.0739 0.12 Other_T L1
ENSG00000157216 SSBP3 610390 sc-eQTL 2.68e-01 -0.0957 0.0862 0.12 Other_T L1
ENSG00000162402 USP24 -191495 sc-eQTL 6.16e-01 0.0462 0.092 0.12 Other_T L1
ENSG00000215883 CYB5RL 823833 sc-eQTL 1.99e-01 0.161 0.125 0.12 Other_T L1
ENSG00000243725 TTC4 308008 sc-eQTL 1.29e-01 -0.19 0.125 0.12 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 222546 sc-eQTL 1.85e-01 0.134 0.101 0.12 B_Activated L2
ENSG00000116133 DHCR24 136674 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0951 0.119 0.12 B_Activated L2
ENSG00000116205 TCEANC2 970285 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0596 0.128 0.12 B_Activated L2
ENSG00000116209 TMEM59 970365 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0746 0.136 0.12 B_Activated L2
ENSG00000116221 MRPL37 839828 sc-eQTL 4.44e-01 -0.112 0.146 0.12 B_Activated L2
ENSG00000157216 SSBP3 610390 sc-eQTL 3.78e-01 -0.117 0.133 0.12 B_Activated L2
ENSG00000162402 USP24 -191495 sc-eQTL 5.72e-01 0.0734 0.13 0.12 B_Activated L2
ENSG00000215883 CYB5RL 823833 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0847 0.114 0.12 B_Activated L2
ENSG00000243725 TTC4 308008 sc-eQTL 6.12e-01 0.0631 0.124 0.12 B_Activated L2
ENSG00000006555 TTC22 222546 sc-eQTL 4.20e-01 0.107 0.132 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000116133 DHCR24 136674 sc-eQTL 9.67e-01 0.00505 0.123 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000116205 TCEANC2 970285 sc-eQTL 5.09e-01 -0.081 0.122 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000116209 TMEM59 970365 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0182 0.105 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000116221 MRPL37 839828 sc-eQTL 1.97e-01 0.159 0.123 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000157216 SSBP3 610390 sc-eQTL 1.81e-02 -0.271 0.114 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000162402 USP24 -191495 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0787 0.0969 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000215883 CYB5RL 823833 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0338 0.137 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000243725 TTC4 308008 sc-eQTL 9.60e-01 0.00634 0.125 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000006555 TTC22 222546 sc-eQTL 1.04e-01 -0.208 0.127 0.121 B_Memory L2
ENSG00000116133 DHCR24 136674 sc-eQTL 2.78e-01 -0.138 0.127 0.121 B_Memory L2
ENSG00000116205 TCEANC2 970285 sc-eQTL 6.72e-01 0.0576 0.136 0.121 B_Memory L2
ENSG00000116209 TMEM59 970365 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0879 0.113 0.121 B_Memory L2
ENSG00000116221 MRPL37 839828 sc-eQTL 1.21e-01 0.178 0.114 0.121 B_Memory L2
ENSG00000157216 SSBP3 610390 sc-eQTL 1.53e-01 -0.153 0.107 0.121 B_Memory L2
ENSG00000162402 USP24 -191495 sc-eQTL 6.88e-01 0.0422 0.105 0.121 B_Memory L2
ENSG00000215883 CYB5RL 823833 sc-eQTL 1.77e-02 -0.306 0.128 0.121 B_Memory L2
ENSG00000243725 TTC4 308008 sc-eQTL 1.56e-01 0.19 0.134 0.121 B_Memory L2
ENSG00000006555 TTC22 222546 sc-eQTL 6.22e-02 -0.244 0.13 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000116133 DHCR24 136674 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0662 0.123 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 970285 sc-eQTL 8.25e-01 0.0243 0.11 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000116209 TMEM59 970365 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0421 0.0797 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000116221 MRPL37 839828 sc-eQTL 9.46e-01 0.00803 0.118 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000157216 SSBP3 610390 sc-eQTL 8.75e-02 -0.191 0.111 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000162402 USP24 -191495 sc-eQTL 9.54e-01 0.00504 0.0882 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 823833 sc-eQTL 5.67e-02 0.253 0.132 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000243725 TTC4 308008 sc-eQTL 7.74e-01 0.0345 0.12 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000006555 TTC22 222546 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0977 0.132 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000116133 DHCR24 136674 sc-eQTL 3.82e-01 -0.101 0.115 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 970285 sc-eQTL 2.05e-01 0.162 0.128 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000116209 TMEM59 970365 sc-eQTL 7.37e-02 0.188 0.105 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000116221 MRPL37 839828 sc-eQTL 4.31e-01 0.0979 0.124 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000157216 SSBP3 610390 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0622 0.122 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000162402 USP24 -191495 sc-eQTL 1.08e-01 -0.155 0.0963 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 823833 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0968 0.136 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000243725 TTC4 308008 sc-eQTL 6.24e-01 0.0696 0.142 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000006555 TTC22 222546 sc-eQTL 6.16e-01 0.0616 0.123 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 970285 sc-eQTL 6.79e-01 0.0522 0.126 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 970365 sc-eQTL 2.41e-01 0.134 0.114 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 839828 sc-eQTL 5.67e-02 0.268 0.14 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 610390 sc-eQTL 1.73e-01 -0.118 0.0864 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -191495 sc-eQTL 2.32e-01 -0.143 0.119 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 308008 sc-eQTL 3.76e-01 0.118 0.133 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 222546 sc-eQTL 4.44e-01 0.0877 0.114 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 970285 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0306 0.0871 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 970365 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0149 0.0847 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 839828 sc-eQTL 7.74e-01 0.0314 0.109 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 610390 sc-eQTL 2.54e-01 0.0994 0.0869 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -191495 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0323 0.0752 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 308008 sc-eQTL 2.62e-01 -0.128 0.114 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 222546 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0815 0.119 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 970285 sc-eQTL 6.23e-01 0.0571 0.116 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 970365 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0114 0.0877 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 839828 sc-eQTL 5.00e-01 0.0745 0.11 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 610390 sc-eQTL 2.66e-01 -0.12 0.108 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -191495 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0626 0.0895 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 308008 sc-eQTL 1.67e-01 -0.178 0.129 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 222546 sc-eQTL 4.49e-01 -0.102 0.135 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 970285 sc-eQTL 1.21e-01 -0.198 0.127 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 970365 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0182 0.0991 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 839828 sc-eQTL 2.60e-01 0.144 0.127 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 610390 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0724 0.109 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -191495 sc-eQTL 2.05e-01 -0.126 0.0992 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 308008 sc-eQTL 6.27e-01 0.064 0.132 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 222546 sc-eQTL 8.22e-01 0.0244 0.108 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 970285 sc-eQTL 3.82e-01 -0.105 0.12 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 970365 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0589 0.104 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 839828 sc-eQTL 1.77e-01 0.167 0.123 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 610390 sc-eQTL 2.26e-01 -0.102 0.0842 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -191495 sc-eQTL 3.74e-02 -0.174 0.0831 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 308008 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0434 0.126 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 222546 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0795 0.121 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 970285 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0822 0.109 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 970365 sc-eQTL 1.85e-01 -0.142 0.107 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 839828 sc-eQTL 3.21e-01 0.127 0.128 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 610390 sc-eQTL 3.78e-01 0.0856 0.0969 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -191495 sc-eQTL 4.54e-01 0.0662 0.0882 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 308008 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0515 0.129 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 222546 sc-eQTL 4.27e-01 0.104 0.131 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 970285 sc-eQTL 3.58e-01 0.121 0.132 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 970365 sc-eQTL 1.18e-01 0.182 0.115 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 839828 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0228 0.132 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 610390 sc-eQTL 2.15e-01 -0.142 0.114 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -191495 sc-eQTL 6.93e-01 0.0438 0.111 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 308008 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0585 0.135 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 222546 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0759 0.126 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 970285 sc-eQTL 4.10e-01 0.108 0.131 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 970365 sc-eQTL 7.38e-01 0.0425 0.127 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 839828 sc-eQTL 5.69e-01 0.0732 0.128 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 610390 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0402 0.122 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -191495 sc-eQTL 5.85e-01 0.07 0.128 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 308008 sc-eQTL 3.86e-01 0.113 0.13 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 222546 sc-eQTL 2.63e-01 0.13 0.116 0.121 MAIT L2
ENSG00000116133 DHCR24 136674 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00164 0.0861 0.121 MAIT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 970285 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0504 0.121 0.121 MAIT L2
ENSG00000116209 TMEM59 970365 sc-eQTL 8.34e-01 0.023 0.11 0.121 MAIT L2
ENSG00000116221 MRPL37 839828 sc-eQTL 1.81e-01 0.178 0.133 0.121 MAIT L2
ENSG00000157216 SSBP3 610390 sc-eQTL 2.45e-02 -0.264 0.117 0.121 MAIT L2
ENSG00000162402 USP24 -191495 sc-eQTL 7.14e-01 0.0384 0.105 0.121 MAIT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 823833 sc-eQTL 3.35e-01 0.117 0.122 0.121 MAIT L2
ENSG00000243725 TTC4 308008 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0702 0.121 0.121 MAIT L2
ENSG00000006555 TTC22 222546 sc-eQTL 8.20e-01 0.0306 0.134 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000116133 DHCR24 136674 sc-eQTL 4.62e-01 0.0875 0.119 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000116205 TCEANC2 970285 sc-eQTL 3.12e-01 0.127 0.125 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000116209 TMEM59 970365 sc-eQTL 7.57e-01 0.038 0.122 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000116221 MRPL37 839828 sc-eQTL 8.13e-03 0.359 0.134 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000157216 SSBP3 610390 sc-eQTL 3.09e-01 -0.105 0.103 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000162398 LEXM 217806 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0666 0.122 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000162402 USP24 -191495 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0972 0.105 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000243725 TTC4 308008 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00192 0.132 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000006555 TTC22 222546 sc-eQTL 8.45e-02 0.194 0.112 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000116133 DHCR24 136674 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0127 0.118 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000116205 TCEANC2 970285 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0338 0.127 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000116209 TMEM59 970365 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0725 0.0943 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000116221 MRPL37 839828 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0164 0.123 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000157216 SSBP3 610390 sc-eQTL 5.28e-01 0.0634 0.1 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000162398 LEXM 217806 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0636 0.116 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000162402 USP24 -191495 sc-eQTL 3.22e-01 -0.0728 0.0733 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000243725 TTC4 308008 sc-eQTL 8.68e-02 -0.215 0.125 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000006555 TTC22 222546 sc-eQTL 1.57e-02 0.337 0.138 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000116133 DHCR24 136674 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0739 0.137 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000116205 TCEANC2 970285 sc-eQTL 4.14e-01 0.108 0.132 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000116209 TMEM59 970365 sc-eQTL 8.25e-01 0.029 0.131 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000116221 MRPL37 839828 sc-eQTL 3.68e-01 0.13 0.144 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000157216 SSBP3 610390 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00354 0.118 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000162398 LEXM 217806 sc-eQTL 4.65e-01 0.0972 0.133 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000162402 USP24 -191495 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0753 0.0974 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000243725 TTC4 308008 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0261 0.146 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000006555 TTC22 222546 sc-eQTL 4.11e-01 0.0978 0.119 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000116133 DHCR24 136674 sc-eQTL 1.17e-01 -0.188 0.12 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000116205 TCEANC2 970285 sc-eQTL 3.15e-02 -0.256 0.118 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000116209 TMEM59 970365 sc-eQTL 8.49e-01 0.0185 0.097 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000116221 MRPL37 839828 sc-eQTL 3.75e-01 0.106 0.119 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000157216 SSBP3 610390 sc-eQTL 8.15e-02 0.174 0.0996 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000162398 LEXM 217806 sc-eQTL 6.38e-01 0.059 0.125 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000162402 USP24 -191495 sc-eQTL 1.13e-02 -0.215 0.0841 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000243725 TTC4 308008 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0228 0.127 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000006555 TTC22 222546 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0552 0.144 0.122 PB L2
ENSG00000116133 DHCR24 136674 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0972 0.127 0.122 PB L2
ENSG00000116205 TCEANC2 970285 sc-eQTL 1.19e-01 -0.241 0.153 0.122 PB L2
ENSG00000116209 TMEM59 970365 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00074 0.0648 0.122 PB L2
ENSG00000116221 MRPL37 839828 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0221 0.118 0.122 PB L2
ENSG00000157216 SSBP3 610390 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0825 0.136 0.122 PB L2
ENSG00000162402 USP24 -191495 sc-eQTL 8.88e-01 0.0219 0.154 0.122 PB L2
ENSG00000215883 CYB5RL 823833 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0155 0.16 0.122 PB L2
ENSG00000243725 TTC4 308008 sc-eQTL 2.71e-01 0.165 0.149 0.122 PB L2
ENSG00000006555 TTC22 222546 sc-eQTL 3.24e-01 -0.122 0.123 0.12 Pro_T L2
ENSG00000116133 DHCR24 136674 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0753 0.105 0.12 Pro_T L2
ENSG00000116205 TCEANC2 970285 sc-eQTL 5.90e-01 0.0692 0.128 0.12 Pro_T L2
ENSG00000116209 TMEM59 970365 sc-eQTL 4.00e-01 -0.075 0.0889 0.12 Pro_T L2
ENSG00000116221 MRPL37 839828 sc-eQTL 5.06e-02 0.17 0.0865 0.12 Pro_T L2
ENSG00000157216 SSBP3 610390 sc-eQTL 9.20e-01 -0.00979 0.0979 0.12 Pro_T L2
ENSG00000162402 USP24 -191495 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0597 0.119 0.12 Pro_T L2
ENSG00000215883 CYB5RL 823833 sc-eQTL 5.36e-01 0.073 0.118 0.12 Pro_T L2
ENSG00000243725 TTC4 308008 sc-eQTL 4.16e-01 -0.107 0.131 0.12 Pro_T L2
ENSG00000006555 TTC22 222546 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0178 0.12 0.12 Treg L2
ENSG00000116205 TCEANC2 970285 sc-eQTL 3.30e-01 0.126 0.129 0.12 Treg L2
ENSG00000116209 TMEM59 970365 sc-eQTL 4.94e-01 0.0698 0.102 0.12 Treg L2
ENSG00000116221 MRPL37 839828 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0715 0.126 0.12 Treg L2
ENSG00000157216 SSBP3 610390 sc-eQTL 1.30e-01 -0.17 0.112 0.12 Treg L2
ENSG00000162402 USP24 -191495 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0938 0.107 0.12 Treg L2
ENSG00000243725 TTC4 308008 sc-eQTL 4.90e-01 0.0933 0.135 0.12 Treg L2
ENSG00000116133 DHCR24 136674 sc-eQTL 4.45e-01 0.0864 0.113 0.115 cDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 970285 sc-eQTL 3.53e-02 -0.279 0.132 0.115 cDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 970365 sc-eQTL 3.36e-01 0.109 0.113 0.115 cDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 839828 sc-eQTL 6.83e-01 0.0593 0.145 0.115 cDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 610390 sc-eQTL 3.41e-01 -0.127 0.133 0.115 cDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 481612 sc-eQTL 3.73e-01 0.111 0.124 0.115 cDC L2
ENSG00000162402 USP24 -191495 sc-eQTL 4.42e-02 -0.279 0.138 0.115 cDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 823833 sc-eQTL 2.91e-01 0.126 0.119 0.115 cDC L2
ENSG00000243725 TTC4 308008 sc-eQTL 1.48e-01 0.206 0.142 0.115 cDC L2
ENSG00000116133 DHCR24 136674 sc-eQTL 7.46e-01 0.026 0.0802 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000116205 TCEANC2 970285 sc-eQTL 3.51e-01 0.104 0.111 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000116209 TMEM59 970365 sc-eQTL 3.76e-01 0.0599 0.0674 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000116221 MRPL37 839828 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0121 0.12 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000157216 SSBP3 610390 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0173 0.123 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000162402 USP24 -191495 sc-eQTL 2.96e-01 -0.0949 0.0905 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000243725 TTC4 308008 sc-eQTL 7.11e-01 0.0515 0.139 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000116133 DHCR24 136674 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00613 0.0751 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000116205 TCEANC2 970285 sc-eQTL 1.60e-01 -0.161 0.114 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000116209 TMEM59 970365 sc-eQTL 6.70e-02 0.168 0.091 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000116221 MRPL37 839828 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0628 0.133 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000157216 SSBP3 610390 sc-eQTL 9.09e-01 0.0157 0.138 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000162402 USP24 -191495 sc-eQTL 5.42e-01 -0.068 0.111 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000243725 TTC4 308008 sc-eQTL 9.64e-01 0.00633 0.14 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000006555 TTC22 222546 sc-eQTL 2.74e-01 -0.147 0.134 0.124 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 136674 sc-eQTL 3.01e-01 -0.155 0.149 0.124 gdT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 970285 sc-eQTL 7.31e-01 0.0519 0.15 0.124 gdT L2
ENSG00000116209 TMEM59 970365 sc-eQTL 6.22e-01 0.0754 0.153 0.124 gdT L2
ENSG00000116221 MRPL37 839828 sc-eQTL 2.13e-01 0.218 0.174 0.124 gdT L2
ENSG00000157216 SSBP3 610390 sc-eQTL 2.63e-01 0.12 0.107 0.124 gdT L2
ENSG00000162402 USP24 -191495 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0294 0.144 0.124 gdT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 823833 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0176 0.15 0.124 gdT L2
ENSG00000243725 TTC4 308008 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0639 0.169 0.124 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 136674 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0364 0.101 0.116 intMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 970285 sc-eQTL 4.67e-01 0.0912 0.125 0.116 intMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 970365 sc-eQTL 9.94e-01 0.00069 0.0921 0.116 intMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 839828 sc-eQTL 8.83e-01 0.0208 0.141 0.116 intMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 610390 sc-eQTL 2.16e-01 0.178 0.143 0.116 intMono L2
ENSG00000162402 USP24 -191495 sc-eQTL 3.23e-01 0.127 0.128 0.116 intMono L2
ENSG00000243725 TTC4 308008 sc-eQTL 9.21e-01 0.0135 0.137 0.116 intMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 136674 sc-eQTL 4.76e-01 0.0722 0.101 0.111 ncMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 970285 sc-eQTL 6.12e-01 0.0643 0.126 0.111 ncMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 970365 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00268 0.101 0.111 ncMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 839828 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0351 0.131 0.111 ncMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 610390 sc-eQTL 4.87e-01 0.0994 0.143 0.111 ncMono L2
ENSG00000162402 USP24 -191495 sc-eQTL 3.36e-01 -0.11 0.114 0.111 ncMono L2
ENSG00000243725 TTC4 308008 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0187 0.135 0.111 ncMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 136674 sc-eQTL 5.34e-01 0.0751 0.121 0.119 pDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 970285 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0422 0.145 0.119 pDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 970365 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0222 0.116 0.119 pDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 839828 sc-eQTL 2.89e-02 0.334 0.151 0.119 pDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 610390 sc-eQTL 1.92e-03 -0.417 0.132 0.119 pDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 481612 sc-eQTL 3.56e-01 -0.053 0.0572 0.119 pDC L2
ENSG00000162402 USP24 -191495 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0746 0.0967 0.119 pDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 823833 sc-eQTL 6.31e-01 0.0637 0.132 0.119 pDC L2
ENSG00000243725 TTC4 308008 sc-eQTL 7.47e-01 0.0493 0.153 0.119 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 222546 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0327 0.129 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 136674 sc-eQTL 3.75e-01 -0.115 0.129 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 970285 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0741 0.125 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 970365 sc-eQTL 2.64e-01 -0.108 0.0969 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 839828 sc-eQTL 5.78e-02 0.22 0.115 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 610390 sc-eQTL 7.64e-03 -0.268 0.0995 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -191495 sc-eQTL 9.05e-01 -0.011 0.0923 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 823833 sc-eQTL 9.87e-02 -0.234 0.141 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 308008 sc-eQTL 2.17e-01 0.157 0.127 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 222546 sc-eQTL 3.35e-02 -0.283 0.132 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 136674 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0984 0.12 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 970285 sc-eQTL 4.47e-01 0.0828 0.109 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 970365 sc-eQTL 6.32e-01 0.0371 0.0772 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 839828 sc-eQTL 6.23e-01 0.0548 0.111 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 610390 sc-eQTL 1.35e-01 -0.148 0.0989 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -191495 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0361 0.0852 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 823833 sc-eQTL 2.49e-01 0.156 0.135 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 308008 sc-eQTL 8.12e-01 0.0302 0.127 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 136674 sc-eQTL 7.82e-01 0.0214 0.0773 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 970285 sc-eQTL 9.85e-01 0.00186 0.0968 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 970365 sc-eQTL 1.08e-01 0.107 0.0664 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 839828 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0148 0.118 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 610390 sc-eQTL 7.53e-01 0.039 0.124 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -191495 sc-eQTL 1.37e-01 -0.125 0.0841 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 308008 sc-eQTL 6.44e-01 0.0648 0.14 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 136674 sc-eQTL 5.74e-01 0.0545 0.0967 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 970285 sc-eQTL 2.43e-01 0.148 0.127 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 970365 sc-eQTL 7.42e-01 0.0312 0.0946 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 839828 sc-eQTL 5.37e-01 0.0801 0.129 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 610390 sc-eQTL 1.62e-01 0.193 0.138 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -191495 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0267 0.109 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 308008 sc-eQTL 8.69e-01 0.0225 0.137 0.119 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 222546 sc-eQTL 4.09e-02 0.223 0.109 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 136674 sc-eQTL 3.11e-01 -0.116 0.114 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 970285 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0657 0.112 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 970365 sc-eQTL 3.50e-01 -0.0812 0.0867 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 839828 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00832 0.116 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 610390 sc-eQTL 5.04e-01 0.0638 0.0953 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162398 LEXM 217806 sc-eQTL 6.75e-01 0.0451 0.108 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -191495 sc-eQTL 1.82e-02 -0.16 0.0673 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 308008 sc-eQTL 3.11e-01 -0.123 0.121 0.121 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000116205 TCEANC2 970285 eQTL 0.018 -0.0604 0.0255 0.00218 0.0 0.106
ENSG00000169174 PCSK9 -15679 pQTL 0.0243 -0.0993 0.044 0.0 0.0 0.105
ENSG00000169174 PCSK9 -15679 eQTL 2.67e-08 -0.147 0.0262 0.0557 0.101 0.106

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000169174 PCSK9 -15679 2.02e-05 2.03e-05 4.32e-06 1.24e-05 3.99e-06 1.04e-05 2.88e-05 3.72e-06 1.87e-05 9.72e-06 2.52e-05 9.59e-06 3.65e-05 8.91e-06 5.35e-06 1.17e-05 1.17e-05 1.88e-05 6.64e-06 5.81e-06 1.07e-05 2.11e-05 2.15e-05 8.47e-06 3.17e-05 5.96e-06 8.33e-06 8.54e-06 2.28e-05 2.61e-05 1.29e-05 1.58e-06 2.48e-06 6.95e-06 8.71e-06 5.22e-06 3.13e-06 2.99e-06 4.58e-06 3.36e-06 1.66e-06 2.7e-05 2.67e-06 4.43e-07 2.23e-06 2.98e-06 3.49e-06 1.49e-06 1.53e-06