logo

Genes within 1Mb (chr1:55021975:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 220652 sc-eQTL 8.99e-03 -0.425 0.161 0.062 B L1
ENSG00000116133 DHCR24 134780 sc-eQTL 6.04e-02 -0.29 0.154 0.062 B L1
ENSG00000116205 TCEANC2 968391 sc-eQTL 3.45e-01 0.126 0.133 0.062 B L1
ENSG00000116209 TMEM59 968471 sc-eQTL 3.16e-01 -0.0816 0.0812 0.062 B L1
ENSG00000116221 MRPL37 837934 sc-eQTL 9.31e-02 0.178 0.106 0.062 B L1
ENSG00000157216 SSBP3 608496 sc-eQTL 8.16e-03 -0.293 0.11 0.062 B L1
ENSG00000162402 USP24 -193389 sc-eQTL 1.69e-01 -0.13 0.094 0.062 B L1
ENSG00000215883 CYB5RL 821939 sc-eQTL 5.27e-01 0.115 0.182 0.062 B L1
ENSG00000243725 TTC4 306114 sc-eQTL 7.57e-01 0.049 0.158 0.062 B L1
ENSG00000006555 TTC22 220652 sc-eQTL 2.34e-01 -0.154 0.129 0.062 CD4T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 968391 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0661 0.106 0.062 CD4T L1
ENSG00000116209 TMEM59 968471 sc-eQTL 9.43e-01 0.00708 0.0986 0.062 CD4T L1
ENSG00000116221 MRPL37 837934 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0637 0.136 0.062 CD4T L1
ENSG00000157216 SSBP3 608496 sc-eQTL 2.96e-01 0.118 0.113 0.062 CD4T L1
ENSG00000162402 USP24 -193389 sc-eQTL 9.40e-01 0.00692 0.0922 0.062 CD4T L1
ENSG00000243725 TTC4 306114 sc-eQTL 8.61e-01 0.0243 0.139 0.062 CD4T L1
ENSG00000006555 TTC22 220652 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0505 0.11 0.062 CD8T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 968391 sc-eQTL 4.06e-01 -0.114 0.137 0.062 CD8T L1
ENSG00000116209 TMEM59 968471 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0532 0.0951 0.062 CD8T L1
ENSG00000116221 MRPL37 837934 sc-eQTL 7.13e-01 0.0482 0.131 0.062 CD8T L1
ENSG00000157216 SSBP3 608496 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0421 0.0941 0.062 CD8T L1
ENSG00000162402 USP24 -193389 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0678 0.0909 0.062 CD8T L1
ENSG00000243725 TTC4 306114 sc-eQTL 9.11e-01 0.0177 0.158 0.062 CD8T L1
ENSG00000116133 DHCR24 134780 sc-eQTL 7.91e-01 0.0429 0.161 0.061 DC L1
ENSG00000116205 TCEANC2 968391 sc-eQTL 7.92e-01 0.0477 0.181 0.061 DC L1
ENSG00000116209 TMEM59 968471 sc-eQTL 1.86e-01 0.188 0.142 0.061 DC L1
ENSG00000116221 MRPL37 837934 sc-eQTL 9.78e-01 0.00521 0.191 0.061 DC L1
ENSG00000157216 SSBP3 608496 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0968 0.17 0.061 DC L1
ENSG00000162390 ACOT11 479718 sc-eQTL 6.34e-01 0.0781 0.164 0.061 DC L1
ENSG00000162402 USP24 -193389 sc-eQTL 1.89e-01 0.13 0.0984 0.061 DC L1
ENSG00000215883 CYB5RL 821939 sc-eQTL 3.45e-01 0.169 0.178 0.061 DC L1
ENSG00000243725 TTC4 306114 sc-eQTL 5.82e-02 0.363 0.191 0.061 DC L1
ENSG00000116133 DHCR24 134780 sc-eQTL 3.35e-01 0.106 0.11 0.062 Mono L1
ENSG00000116205 TCEANC2 968391 sc-eQTL 5.89e-01 0.0644 0.119 0.062 Mono L1
ENSG00000116209 TMEM59 968471 sc-eQTL 7.52e-01 0.028 0.0885 0.062 Mono L1
ENSG00000116221 MRPL37 837934 sc-eQTL 4.04e-01 0.124 0.148 0.062 Mono L1
ENSG00000157216 SSBP3 608496 sc-eQTL 9.83e-01 0.00353 0.17 0.062 Mono L1
ENSG00000162402 USP24 -193389 sc-eQTL 1.11e-01 -0.161 0.101 0.062 Mono L1
ENSG00000243725 TTC4 306114 sc-eQTL 8.18e-01 0.0409 0.178 0.062 Mono L1
ENSG00000006555 TTC22 220652 sc-eQTL 3.16e-01 0.149 0.148 0.062 NK L1
ENSG00000116133 DHCR24 134780 sc-eQTL 8.74e-01 0.0238 0.15 0.062 NK L1
ENSG00000116205 TCEANC2 968391 sc-eQTL 1.34e-01 -0.221 0.147 0.062 NK L1
ENSG00000116209 TMEM59 968471 sc-eQTL 5.05e-01 0.0772 0.116 0.062 NK L1
ENSG00000116221 MRPL37 837934 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00893 0.144 0.062 NK L1
ENSG00000157216 SSBP3 608496 sc-eQTL 5.29e-01 0.0786 0.125 0.062 NK L1
ENSG00000162398 LEXM 215912 sc-eQTL 3.17e-01 0.14 0.14 0.062 NK L1
ENSG00000162402 USP24 -193389 sc-eQTL 1.55e-01 -0.121 0.0846 0.062 NK L1
ENSG00000243725 TTC4 306114 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0985 0.161 0.062 NK L1
ENSG00000006555 TTC22 220652 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0527 0.131 0.062 Other_T L1
ENSG00000116133 DHCR24 134780 sc-eQTL 6.30e-01 0.0491 0.102 0.062 Other_T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 968391 sc-eQTL 4.84e-01 -0.107 0.152 0.062 Other_T L1
ENSG00000116209 TMEM59 968471 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0259 0.105 0.062 Other_T L1
ENSG00000116221 MRPL37 837934 sc-eQTL 7.24e-02 0.176 0.0973 0.062 Other_T L1
ENSG00000157216 SSBP3 608496 sc-eQTL 8.74e-01 0.018 0.113 0.062 Other_T L1
ENSG00000162402 USP24 -193389 sc-eQTL 6.22e-02 0.224 0.12 0.062 Other_T L1
ENSG00000215883 CYB5RL 821939 sc-eQTL 9.40e-02 0.276 0.164 0.062 Other_T L1
ENSG00000243725 TTC4 306114 sc-eQTL 1.08e-01 -0.264 0.163 0.062 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 220652 sc-eQTL 5.95e-01 0.075 0.141 0.056 B_Activated L2
ENSG00000116133 DHCR24 134780 sc-eQTL 3.43e-01 -0.157 0.165 0.056 B_Activated L2
ENSG00000116205 TCEANC2 968391 sc-eQTL 6.63e-01 0.0775 0.178 0.056 B_Activated L2
ENSG00000116209 TMEM59 968471 sc-eQTL 2.22e-01 -0.23 0.188 0.056 B_Activated L2
ENSG00000116221 MRPL37 837934 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0653 0.204 0.056 B_Activated L2
ENSG00000157216 SSBP3 608496 sc-eQTL 4.15e-01 -0.151 0.184 0.056 B_Activated L2
ENSG00000162402 USP24 -193389 sc-eQTL 3.32e-01 -0.175 0.18 0.056 B_Activated L2
ENSG00000215883 CYB5RL 821939 sc-eQTL 3.37e-01 -0.153 0.159 0.056 B_Activated L2
ENSG00000243725 TTC4 306114 sc-eQTL 1.49e-01 0.249 0.172 0.056 B_Activated L2
ENSG00000006555 TTC22 220652 sc-eQTL 3.85e-01 -0.153 0.176 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000116133 DHCR24 134780 sc-eQTL 9.35e-01 -0.0134 0.164 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000116205 TCEANC2 968391 sc-eQTL 2.52e-01 -0.187 0.162 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000116209 TMEM59 968471 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0869 0.139 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000116221 MRPL37 837934 sc-eQTL 2.16e-01 0.203 0.164 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000157216 SSBP3 608496 sc-eQTL 5.94e-02 -0.288 0.152 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000162402 USP24 -193389 sc-eQTL 1.05e-01 -0.209 0.128 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000215883 CYB5RL 821939 sc-eQTL 6.27e-01 0.0889 0.183 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000243725 TTC4 306114 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0992 0.166 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000006555 TTC22 220652 sc-eQTL 9.22e-02 -0.289 0.171 0.062 B_Memory L2
ENSG00000116133 DHCR24 134780 sc-eQTL 1.91e-02 -0.398 0.169 0.062 B_Memory L2
ENSG00000116205 TCEANC2 968391 sc-eQTL 1.04e-01 0.297 0.182 0.062 B_Memory L2
ENSG00000116209 TMEM59 968471 sc-eQTL 1.70e-01 -0.209 0.152 0.062 B_Memory L2
ENSG00000116221 MRPL37 837934 sc-eQTL 1.84e-01 0.205 0.154 0.062 B_Memory L2
ENSG00000157216 SSBP3 608496 sc-eQTL 3.47e-01 -0.135 0.144 0.062 B_Memory L2
ENSG00000162402 USP24 -193389 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0771 0.141 0.062 B_Memory L2
ENSG00000215883 CYB5RL 821939 sc-eQTL 8.29e-02 -0.301 0.173 0.062 B_Memory L2
ENSG00000243725 TTC4 306114 sc-eQTL 6.78e-01 0.075 0.18 0.062 B_Memory L2
ENSG00000006555 TTC22 220652 sc-eQTL 5.09e-02 -0.336 0.171 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000116133 DHCR24 134780 sc-eQTL 2.88e-01 -0.172 0.161 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 968391 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0538 0.144 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000116209 TMEM59 968471 sc-eQTL 6.32e-01 0.0502 0.105 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000116221 MRPL37 837934 sc-eQTL 7.47e-01 0.0499 0.155 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000157216 SSBP3 608496 sc-eQTL 9.19e-02 -0.248 0.146 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000162402 USP24 -193389 sc-eQTL 6.81e-01 0.0477 0.116 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 821939 sc-eQTL 1.76e-01 0.236 0.174 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000243725 TTC4 306114 sc-eQTL 3.41e-01 0.15 0.158 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000006555 TTC22 220652 sc-eQTL 4.46e-01 -0.133 0.174 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000116133 DHCR24 134780 sc-eQTL 1.60e-01 -0.212 0.151 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 968391 sc-eQTL 4.69e-02 0.333 0.167 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000116209 TMEM59 968471 sc-eQTL 2.73e-02 0.304 0.137 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000116221 MRPL37 837934 sc-eQTL 2.91e-01 0.172 0.163 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000157216 SSBP3 608496 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0793 0.16 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000162402 USP24 -193389 sc-eQTL 2.08e-01 -0.16 0.127 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 821939 sc-eQTL 4.57e-01 -0.133 0.179 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000243725 TTC4 306114 sc-eQTL 5.32e-01 0.116 0.186 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000006555 TTC22 220652 sc-eQTL 4.58e-01 0.123 0.165 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 968391 sc-eQTL 2.30e-01 0.204 0.169 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 968471 sc-eQTL 1.77e-01 0.209 0.154 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 837934 sc-eQTL 7.62e-02 0.336 0.189 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 608496 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0591 0.117 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -193389 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0702 0.161 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 306114 sc-eQTL 5.49e-01 -0.108 0.18 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 220652 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0871 0.151 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 968391 sc-eQTL 2.53e-01 -0.131 0.115 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 968471 sc-eQTL 9.60e-01 0.00565 0.112 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 837934 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0676 0.144 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 608496 sc-eQTL 7.10e-03 0.307 0.113 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -193389 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0271 0.0993 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 306114 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0139 0.151 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 220652 sc-eQTL 8.21e-01 0.0359 0.159 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 968391 sc-eQTL 4.04e-01 0.129 0.154 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 968471 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0294 0.117 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 837934 sc-eQTL 8.22e-01 -0.033 0.147 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 608496 sc-eQTL 9.58e-01 0.00766 0.144 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -193389 sc-eQTL 3.06e-01 0.122 0.119 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 306114 sc-eQTL 2.03e-01 -0.218 0.171 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 220652 sc-eQTL 9.40e-01 -0.0138 0.182 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 968391 sc-eQTL 6.05e-01 -0.089 0.172 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 968471 sc-eQTL 1.70e-01 0.183 0.133 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 837934 sc-eQTL 1.58e-01 0.242 0.171 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 608496 sc-eQTL 7.32e-01 0.0505 0.147 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -193389 sc-eQTL 4.74e-01 -0.096 0.134 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 306114 sc-eQTL 7.66e-01 0.0527 0.177 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 220652 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0242 0.144 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 968391 sc-eQTL 6.54e-02 -0.294 0.159 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 968471 sc-eQTL 3.38e-01 -0.133 0.139 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 837934 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00599 0.165 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 608496 sc-eQTL 1.79e-01 -0.151 0.112 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -193389 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0839 0.112 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 306114 sc-eQTL 5.25e-01 -0.107 0.167 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 220652 sc-eQTL 5.48e-02 -0.308 0.159 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 968391 sc-eQTL 6.95e-01 -0.057 0.145 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 968471 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0333 0.142 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 837934 sc-eQTL 1.72e-01 0.233 0.17 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 608496 sc-eQTL 2.95e-02 0.28 0.128 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -193389 sc-eQTL 5.85e-01 0.0641 0.117 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 306114 sc-eQTL 9.60e-01 0.00856 0.172 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 220652 sc-eQTL 7.17e-01 0.0648 0.179 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 968391 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0234 0.18 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 968471 sc-eQTL 2.01e-01 0.202 0.158 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 837934 sc-eQTL 5.01e-01 0.121 0.179 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 608496 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0603 0.156 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -193389 sc-eQTL 7.85e-01 0.0413 0.151 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 306114 sc-eQTL 2.13e-01 -0.228 0.183 0.06 CD8_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 220652 sc-eQTL 9.40e-01 0.0127 0.168 0.066 CD8_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 968391 sc-eQTL 3.75e-01 0.156 0.175 0.066 CD8_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 968471 sc-eQTL 2.75e-01 0.185 0.169 0.066 CD8_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 837934 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0206 0.172 0.066 CD8_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 608496 sc-eQTL 9.49e-01 -0.0105 0.163 0.066 CD8_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -193389 sc-eQTL 7.47e-01 0.0554 0.172 0.066 CD8_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 306114 sc-eQTL 2.17e-01 0.215 0.174 0.066 CD8_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 220652 sc-eQTL 3.67e-01 0.14 0.155 0.063 MAIT L2
ENSG00000116133 DHCR24 134780 sc-eQTL 7.73e-02 0.203 0.114 0.063 MAIT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 968391 sc-eQTL 6.29e-02 -0.3 0.16 0.063 MAIT L2
ENSG00000116209 TMEM59 968471 sc-eQTL 4.82e-01 0.103 0.146 0.063 MAIT L2
ENSG00000116221 MRPL37 837934 sc-eQTL 1.28e-01 0.27 0.177 0.063 MAIT L2
ENSG00000157216 SSBP3 608496 sc-eQTL 4.79e-01 -0.112 0.157 0.063 MAIT L2
ENSG00000162402 USP24 -193389 sc-eQTL 4.19e-01 0.113 0.14 0.063 MAIT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 821939 sc-eQTL 1.52e-01 0.233 0.162 0.063 MAIT L2
ENSG00000243725 TTC4 306114 sc-eQTL 3.90e-01 -0.139 0.161 0.063 MAIT L2
ENSG00000006555 TTC22 220652 sc-eQTL 8.50e-01 0.0353 0.186 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000116133 DHCR24 134780 sc-eQTL 5.50e-01 0.0983 0.164 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000116205 TCEANC2 968391 sc-eQTL 5.47e-01 0.105 0.174 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000116209 TMEM59 968471 sc-eQTL 1.78e-01 0.228 0.169 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000116221 MRPL37 837934 sc-eQTL 1.16e-02 0.475 0.186 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000157216 SSBP3 608496 sc-eQTL 6.30e-01 0.0689 0.143 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000162398 LEXM 215912 sc-eQTL 4.66e-01 0.123 0.168 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000162402 USP24 -193389 sc-eQTL 1.02e-01 -0.237 0.144 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000243725 TTC4 306114 sc-eQTL 6.52e-01 0.0825 0.183 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000006555 TTC22 220652 sc-eQTL 2.41e-01 0.175 0.149 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000116133 DHCR24 134780 sc-eQTL 2.23e-01 0.19 0.155 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000116205 TCEANC2 968391 sc-eQTL 2.77e-01 -0.184 0.168 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000116209 TMEM59 968471 sc-eQTL 9.41e-01 0.00928 0.125 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000116221 MRPL37 837934 sc-eQTL 3.72e-01 -0.146 0.163 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000157216 SSBP3 608496 sc-eQTL 8.79e-01 0.0203 0.133 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000162398 LEXM 215912 sc-eQTL 5.67e-01 0.0879 0.153 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000162402 USP24 -193389 sc-eQTL 3.35e-01 -0.094 0.0972 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000243725 TTC4 306114 sc-eQTL 1.22e-01 -0.257 0.166 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000006555 TTC22 220652 sc-eQTL 9.49e-02 0.314 0.187 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000116133 DHCR24 134780 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0753 0.184 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000116205 TCEANC2 968391 sc-eQTL 7.31e-01 0.061 0.177 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000116209 TMEM59 968471 sc-eQTL 5.89e-01 0.0952 0.176 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000116221 MRPL37 837934 sc-eQTL 3.97e-01 -0.164 0.194 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000157216 SSBP3 608496 sc-eQTL 6.59e-01 0.07 0.158 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000162398 LEXM 215912 sc-eQTL 3.01e-01 0.185 0.178 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000162402 USP24 -193389 sc-eQTL 1.64e-01 -0.182 0.13 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000243725 TTC4 306114 sc-eQTL 9.23e-01 -0.019 0.196 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000006555 TTC22 220652 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0395 0.16 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000116133 DHCR24 134780 sc-eQTL 4.21e-01 -0.13 0.161 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000116205 TCEANC2 968391 sc-eQTL 4.87e-02 -0.315 0.159 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000116209 TMEM59 968471 sc-eQTL 2.26e-01 0.158 0.13 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000116221 MRPL37 837934 sc-eQTL 7.27e-01 0.0561 0.16 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000157216 SSBP3 608496 sc-eQTL 1.02e-01 0.22 0.134 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000162398 LEXM 215912 sc-eQTL 5.88e-01 0.0912 0.168 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000162402 USP24 -193389 sc-eQTL 2.12e-01 -0.143 0.114 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000243725 TTC4 306114 sc-eQTL 5.69e-01 -0.097 0.17 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000006555 TTC22 220652 sc-eQTL 2.65e-01 -0.191 0.171 0.078 PB L2
ENSG00000116133 DHCR24 134780 sc-eQTL 9.29e-01 -0.0136 0.152 0.078 PB L2
ENSG00000116205 TCEANC2 968391 sc-eQTL 2.13e-01 -0.23 0.184 0.078 PB L2
ENSG00000116209 TMEM59 968471 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0175 0.0774 0.078 PB L2
ENSG00000116221 MRPL37 837934 sc-eQTL 8.21e-01 -0.032 0.141 0.078 PB L2
ENSG00000157216 SSBP3 608496 sc-eQTL 9.37e-01 -0.0128 0.162 0.078 PB L2
ENSG00000162402 USP24 -193389 sc-eQTL 2.80e-01 -0.199 0.184 0.078 PB L2
ENSG00000215883 CYB5RL 821939 sc-eQTL 9.05e-01 0.0229 0.191 0.078 PB L2
ENSG00000243725 TTC4 306114 sc-eQTL 5.70e-01 0.102 0.178 0.078 PB L2
ENSG00000006555 TTC22 220652 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0489 0.163 0.063 Pro_T L2
ENSG00000116133 DHCR24 134780 sc-eQTL 6.55e-01 -0.062 0.139 0.063 Pro_T L2
ENSG00000116205 TCEANC2 968391 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00502 0.169 0.063 Pro_T L2
ENSG00000116209 TMEM59 968471 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0503 0.117 0.063 Pro_T L2
ENSG00000116221 MRPL37 837934 sc-eQTL 4.76e-01 0.082 0.115 0.063 Pro_T L2
ENSG00000157216 SSBP3 608496 sc-eQTL 3.01e-01 0.133 0.129 0.063 Pro_T L2
ENSG00000162402 USP24 -193389 sc-eQTL 6.40e-01 0.0737 0.157 0.063 Pro_T L2
ENSG00000215883 CYB5RL 821939 sc-eQTL 4.60e-01 0.115 0.155 0.063 Pro_T L2
ENSG00000243725 TTC4 306114 sc-eQTL 7.37e-01 0.058 0.173 0.063 Pro_T L2
ENSG00000006555 TTC22 220652 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0249 0.159 0.062 Treg L2
ENSG00000116205 TCEANC2 968391 sc-eQTL 4.27e-01 -0.135 0.17 0.062 Treg L2
ENSG00000116209 TMEM59 968471 sc-eQTL 4.15e-01 0.11 0.134 0.062 Treg L2
ENSG00000116221 MRPL37 837934 sc-eQTL 5.41e-02 -0.32 0.165 0.062 Treg L2
ENSG00000157216 SSBP3 608496 sc-eQTL 7.60e-01 0.0454 0.148 0.062 Treg L2
ENSG00000162402 USP24 -193389 sc-eQTL 1.97e-01 -0.183 0.141 0.062 Treg L2
ENSG00000243725 TTC4 306114 sc-eQTL 1.02e-01 0.291 0.177 0.062 Treg L2
ENSG00000116133 DHCR24 134780 sc-eQTL 5.49e-01 0.095 0.158 0.059 cDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 968391 sc-eQTL 4.99e-01 -0.126 0.186 0.059 cDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 968471 sc-eQTL 2.12e-01 0.198 0.158 0.059 cDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 837934 sc-eQTL 2.07e-01 -0.256 0.202 0.059 cDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 608496 sc-eQTL 4.70e-01 -0.135 0.187 0.059 cDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 479718 sc-eQTL 8.20e-01 0.0396 0.174 0.059 cDC L2
ENSG00000162402 USP24 -193389 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0314 0.195 0.059 cDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 821939 sc-eQTL 2.24e-01 0.203 0.167 0.059 cDC L2
ENSG00000243725 TTC4 306114 sc-eQTL 3.67e-01 0.181 0.2 0.059 cDC L2
ENSG00000116133 DHCR24 134780 sc-eQTL 8.82e-01 0.0158 0.107 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000116205 TCEANC2 968391 sc-eQTL 3.16e-01 0.149 0.148 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000116209 TMEM59 968471 sc-eQTL 4.97e-01 0.0612 0.0899 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000116221 MRPL37 837934 sc-eQTL 5.12e-01 0.105 0.16 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000157216 SSBP3 608496 sc-eQTL 4.05e-01 -0.136 0.163 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000162402 USP24 -193389 sc-eQTL 3.61e-01 -0.11 0.121 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000243725 TTC4 306114 sc-eQTL 4.15e-01 0.151 0.185 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000116133 DHCR24 134780 sc-eQTL 9.93e-01 0.000824 0.1 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000116205 TCEANC2 968391 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0984 0.153 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000116209 TMEM59 968471 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0909 0.122 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000116221 MRPL37 837934 sc-eQTL 7.63e-01 0.0535 0.177 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000157216 SSBP3 608496 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0575 0.184 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000162402 USP24 -193389 sc-eQTL 3.37e-01 -0.143 0.149 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000243725 TTC4 306114 sc-eQTL 9.89e-01 0.00249 0.186 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000006555 TTC22 220652 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0571 0.182 0.055 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 134780 sc-eQTL 8.79e-01 0.0309 0.203 0.055 gdT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 968391 sc-eQTL 7.23e-01 0.0725 0.204 0.055 gdT L2
ENSG00000116209 TMEM59 968471 sc-eQTL 7.60e-01 0.0635 0.207 0.055 gdT L2
ENSG00000116221 MRPL37 837934 sc-eQTL 4.57e-01 0.177 0.237 0.055 gdT L2
ENSG00000157216 SSBP3 608496 sc-eQTL 6.04e-01 0.0755 0.145 0.055 gdT L2
ENSG00000162402 USP24 -193389 sc-eQTL 1.13e-01 0.309 0.194 0.055 gdT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 821939 sc-eQTL 7.97e-01 0.0524 0.203 0.055 gdT L2
ENSG00000243725 TTC4 306114 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0867 0.229 0.055 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 134780 sc-eQTL 4.79e-01 0.0966 0.136 0.06 intMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 968391 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0165 0.17 0.06 intMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 968471 sc-eQTL 3.71e-01 -0.112 0.124 0.06 intMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 837934 sc-eQTL 1.31e-01 -0.287 0.19 0.06 intMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 608496 sc-eQTL 3.96e-01 0.165 0.194 0.06 intMono L2
ENSG00000162402 USP24 -193389 sc-eQTL 3.01e-01 0.18 0.173 0.06 intMono L2
ENSG00000243725 TTC4 306114 sc-eQTL 2.18e-01 0.228 0.184 0.06 intMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 134780 sc-eQTL 3.91e-01 0.122 0.142 0.052 ncMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 968391 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0626 0.178 0.052 ncMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 968471 sc-eQTL 3.93e-01 -0.122 0.142 0.052 ncMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 837934 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00194 0.183 0.052 ncMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 608496 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0227 0.201 0.052 ncMono L2
ENSG00000162402 USP24 -193389 sc-eQTL 3.80e-01 -0.141 0.16 0.052 ncMono L2
ENSG00000243725 TTC4 306114 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00285 0.19 0.052 ncMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 134780 sc-eQTL 9.85e-01 0.00311 0.166 0.056 pDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 968391 sc-eQTL 5.46e-01 -0.121 0.199 0.056 pDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 968471 sc-eQTL 5.64e-01 -0.092 0.159 0.056 pDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 837934 sc-eQTL 1.33e-01 0.317 0.21 0.056 pDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 608496 sc-eQTL 1.01e-01 -0.307 0.187 0.056 pDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 479718 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0761 0.0789 0.056 pDC L2
ENSG00000162402 USP24 -193389 sc-eQTL 6.78e-01 0.0555 0.133 0.056 pDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 821939 sc-eQTL 8.20e-01 0.0415 0.183 0.056 pDC L2
ENSG00000243725 TTC4 306114 sc-eQTL 2.18e-01 0.26 0.21 0.056 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 220652 sc-eQTL 9.35e-02 -0.286 0.17 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 134780 sc-eQTL 1.12e-01 -0.272 0.171 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 968391 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0216 0.166 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 968471 sc-eQTL 3.10e-02 -0.277 0.128 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 837934 sc-eQTL 3.04e-02 0.333 0.153 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 608496 sc-eQTL 5.15e-02 -0.261 0.133 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -193389 sc-eQTL 3.13e-01 -0.124 0.122 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 821939 sc-eQTL 4.90e-01 -0.13 0.188 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 306114 sc-eQTL 2.71e-01 0.186 0.169 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 220652 sc-eQTL 3.08e-02 -0.376 0.173 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 134780 sc-eQTL 1.91e-01 -0.206 0.157 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 968391 sc-eQTL 3.44e-01 0.135 0.142 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 968471 sc-eQTL 1.89e-01 0.133 0.101 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 837934 sc-eQTL 5.37e-01 0.0898 0.145 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 608496 sc-eQTL 1.46e-01 -0.189 0.129 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -193389 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00113 0.112 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 821939 sc-eQTL 4.27e-01 0.14 0.176 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 306114 sc-eQTL 4.64e-01 0.122 0.166 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 134780 sc-eQTL 9.46e-01 -0.007 0.103 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 968391 sc-eQTL 3.65e-01 0.117 0.129 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 968471 sc-eQTL 8.74e-01 0.0142 0.0892 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 837934 sc-eQTL 5.49e-01 0.0948 0.158 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 608496 sc-eQTL 4.62e-01 -0.122 0.165 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -193389 sc-eQTL 1.74e-01 -0.153 0.113 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 306114 sc-eQTL 4.81e-01 0.132 0.187 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 134780 sc-eQTL 5.45e-02 0.255 0.132 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 968391 sc-eQTL 7.55e-01 0.0546 0.175 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 968471 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0351 0.13 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 837934 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0828 0.178 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 608496 sc-eQTL 5.57e-01 0.112 0.19 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -193389 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0877 0.15 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 306114 sc-eQTL 5.56e-01 0.111 0.188 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 220652 sc-eQTL 1.74e-01 0.198 0.145 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 134780 sc-eQTL 9.07e-01 0.0178 0.152 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 968391 sc-eQTL 9.07e-02 -0.252 0.148 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 968471 sc-eQTL 7.62e-01 0.0349 0.115 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 837934 sc-eQTL 3.19e-01 -0.154 0.154 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 608496 sc-eQTL 5.29e-01 0.0798 0.127 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162398 LEXM 215912 sc-eQTL 2.26e-01 0.173 0.142 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -193389 sc-eQTL 1.04e-01 -0.147 0.09 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 306114 sc-eQTL 2.37e-01 -0.191 0.161 0.062 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000169174 PCSK9 -17573 eQTL 0.00519 -0.102 0.0364 0.0 0.0 0.0559
ENSG00000234810 AL603840.1 -307313 eQTL 0.0471 -0.133 0.067 0.0 0.0 0.0559

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000198711 \N 785535 2.67e-07 1.25e-07 3.65e-08 1.84e-07 8.92e-08 9.71e-08 1.42e-07 5.33e-08 1.4e-07 4.4e-08 1.56e-07 8.14e-08 1.33e-07 6.56e-08 6.17e-08 7.26e-08 3.98e-08 1.14e-07 5.21e-08 4.07e-08 1.04e-07 1.26e-07 1.34e-07 4.16e-08 1.37e-07 1.19e-07 1.06e-07 9.65e-08 1.05e-07 1.12e-07 9.73e-08 3.64e-08 3.28e-08 8.55e-08 8.96e-08 3.76e-08 4.99e-08 9.62e-08 7.23e-08 3.55e-08 4.41e-08 1.33e-07 5.2e-08 1.08e-08 6.38e-08 1.84e-08 1.23e-07 3.8e-09 4.85e-08
ENSG00000215883 \N 821939 2.64e-07 1.19e-07 3.69e-08 1.82e-07 9.02e-08 9.57e-08 1.38e-07 5.33e-08 1.41e-07 4.4e-08 1.59e-07 7.78e-08 1.3e-07 6.38e-08 5.99e-08 7.5e-08 3.94e-08 1.14e-07 5.21e-08 4.21e-08 1.05e-07 1.26e-07 1.32e-07 4.26e-08 1.32e-07 1.15e-07 1.08e-07 9.57e-08 1.05e-07 1.12e-07 9.58e-08 3.87e-08 3.26e-08 8.68e-08 8.82e-08 3.77e-08 5.08e-08 9.65e-08 7.52e-08 3.18e-08 4.57e-08 1.33e-07 5.22e-08 1.43e-08 6.92e-08 1.83e-08 1.22e-07 3.81e-09 5.09e-08