logo

Genes within 1Mb (chr1:55020569:T:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 219246 sc-eQTL 5.64e-01 0.0863 0.149 0.09 B L1
ENSG00000116133 DHCR24 133374 sc-eQTL 9.64e-01 0.00631 0.141 0.09 B L1
ENSG00000116205 TCEANC2 966985 sc-eQTL 8.36e-01 0.0252 0.122 0.09 B L1
ENSG00000116209 TMEM59 967065 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0681 0.0741 0.09 B L1
ENSG00000116221 MRPL37 836528 sc-eQTL 2.64e-02 -0.215 0.096 0.09 B L1
ENSG00000157216 SSBP3 607090 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0708 0.102 0.09 B L1
ENSG00000162402 USP24 -194795 sc-eQTL 8.25e-01 0.0191 0.0861 0.09 B L1
ENSG00000215883 CYB5RL 820533 sc-eQTL 2.26e-01 0.201 0.165 0.09 B L1
ENSG00000243725 TTC4 304708 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0685 0.144 0.09 B L1
ENSG00000006555 TTC22 219246 sc-eQTL 1.15e-01 -0.18 0.113 0.09 CD4T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 966985 sc-eQTL 3.03e-01 0.0962 0.0931 0.09 CD4T L1
ENSG00000116209 TMEM59 967065 sc-eQTL 1.00e+00 3.47e-05 0.0869 0.09 CD4T L1
ENSG00000116221 MRPL37 836528 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0501 0.12 0.09 CD4T L1
ENSG00000157216 SSBP3 607090 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0241 0.0998 0.09 CD4T L1
ENSG00000162402 USP24 -194795 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0233 0.0813 0.09 CD4T L1
ENSG00000243725 TTC4 304708 sc-eQTL 5.15e-02 -0.237 0.121 0.09 CD4T L1
ENSG00000006555 TTC22 219246 sc-eQTL 1.30e-01 -0.152 0.0998 0.09 CD8T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 966985 sc-eQTL 2.34e-01 0.149 0.125 0.09 CD8T L1
ENSG00000116209 TMEM59 967065 sc-eQTL 8.84e-02 0.148 0.0862 0.09 CD8T L1
ENSG00000116221 MRPL37 836528 sc-eQTL 2.64e-01 -0.134 0.119 0.09 CD8T L1
ENSG00000157216 SSBP3 607090 sc-eQTL 2.94e-01 -0.0901 0.0856 0.09 CD8T L1
ENSG00000162402 USP24 -194795 sc-eQTL 5.12e-01 0.0545 0.083 0.09 CD8T L1
ENSG00000243725 TTC4 304708 sc-eQTL 2.42e-01 -0.168 0.144 0.09 CD8T L1
ENSG00000116133 DHCR24 133374 sc-eQTL 4.81e-01 0.0923 0.131 0.095 DC L1
ENSG00000116205 TCEANC2 966985 sc-eQTL 5.91e-01 0.0789 0.147 0.095 DC L1
ENSG00000116209 TMEM59 967065 sc-eQTL 8.02e-01 -0.029 0.115 0.095 DC L1
ENSG00000116221 MRPL37 836528 sc-eQTL 2.01e-01 0.198 0.154 0.095 DC L1
ENSG00000157216 SSBP3 607090 sc-eQTL 2.21e-02 -0.315 0.136 0.095 DC L1
ENSG00000162390 ACOT11 478312 sc-eQTL 1.50e-01 -0.191 0.132 0.095 DC L1
ENSG00000162402 USP24 -194795 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0241 0.0802 0.095 DC L1
ENSG00000215883 CYB5RL 820533 sc-eQTL 3.77e-02 0.3 0.143 0.095 DC L1
ENSG00000243725 TTC4 304708 sc-eQTL 1.64e-01 -0.217 0.155 0.095 DC L1
ENSG00000116133 DHCR24 133374 sc-eQTL 9.33e-01 0.00808 0.0957 0.09 Mono L1
ENSG00000116205 TCEANC2 966985 sc-eQTL 9.93e-01 0.000867 0.103 0.09 Mono L1
ENSG00000116209 TMEM59 967065 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0383 0.0766 0.09 Mono L1
ENSG00000116221 MRPL37 836528 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00209 0.128 0.09 Mono L1
ENSG00000157216 SSBP3 607090 sc-eQTL 6.30e-02 0.272 0.146 0.09 Mono L1
ENSG00000162402 USP24 -194795 sc-eQTL 2.85e-01 0.0935 0.0873 0.09 Mono L1
ENSG00000243725 TTC4 304708 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0758 0.154 0.09 Mono L1
ENSG00000006555 TTC22 219246 sc-eQTL 6.77e-02 -0.243 0.132 0.09 NK L1
ENSG00000116133 DHCR24 133374 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0475 0.134 0.09 NK L1
ENSG00000116205 TCEANC2 966985 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0898 0.133 0.09 NK L1
ENSG00000116209 TMEM59 967065 sc-eQTL 3.92e-01 0.0889 0.104 0.09 NK L1
ENSG00000116221 MRPL37 836528 sc-eQTL 3.56e-02 -0.27 0.128 0.09 NK L1
ENSG00000157216 SSBP3 607090 sc-eQTL 2.05e-01 0.142 0.112 0.09 NK L1
ENSG00000162398 LEXM 214506 sc-eQTL 1.12e-01 -0.199 0.125 0.09 NK L1
ENSG00000162402 USP24 -194795 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0279 0.0762 0.09 NK L1
ENSG00000243725 TTC4 304708 sc-eQTL 4.89e-01 0.0998 0.144 0.09 NK L1
ENSG00000006555 TTC22 219246 sc-eQTL 1.94e-02 -0.279 0.118 0.09 Other_T L1
ENSG00000116133 DHCR24 133374 sc-eQTL 1.45e-01 -0.135 0.0925 0.09 Other_T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 966985 sc-eQTL 6.67e-01 -0.06 0.139 0.09 Other_T L1
ENSG00000116209 TMEM59 967065 sc-eQTL 4.49e-02 0.191 0.0946 0.09 Other_T L1
ENSG00000116221 MRPL37 836528 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00646 0.0894 0.09 Other_T L1
ENSG00000157216 SSBP3 607090 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00341 0.103 0.09 Other_T L1
ENSG00000162402 USP24 -194795 sc-eQTL 9.97e-01 0.000435 0.11 0.09 Other_T L1
ENSG00000215883 CYB5RL 820533 sc-eQTL 8.85e-01 0.0217 0.151 0.09 Other_T L1
ENSG00000243725 TTC4 304708 sc-eQTL 2.04e-01 0.191 0.149 0.09 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 219246 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0194 0.125 0.087 B_Activated L2
ENSG00000116133 DHCR24 133374 sc-eQTL 5.97e-01 0.0776 0.147 0.087 B_Activated L2
ENSG00000116205 TCEANC2 966985 sc-eQTL 2.04e-01 0.2 0.157 0.087 B_Activated L2
ENSG00000116209 TMEM59 967065 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0674 0.167 0.087 B_Activated L2
ENSG00000116221 MRPL37 836528 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0546 0.181 0.087 B_Activated L2
ENSG00000157216 SSBP3 607090 sc-eQTL 7.46e-01 0.053 0.164 0.087 B_Activated L2
ENSG00000162402 USP24 -194795 sc-eQTL 1.63e-01 -0.223 0.159 0.087 B_Activated L2
ENSG00000215883 CYB5RL 820533 sc-eQTL 7.78e-02 -0.248 0.14 0.087 B_Activated L2
ENSG00000243725 TTC4 304708 sc-eQTL 2.72e-01 -0.168 0.152 0.087 B_Activated L2
ENSG00000006555 TTC22 219246 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0754 0.158 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000116133 DHCR24 133374 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0638 0.147 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000116205 TCEANC2 966985 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0461 0.146 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000116209 TMEM59 967065 sc-eQTL 6.49e-01 0.057 0.125 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000116221 MRPL37 836528 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0838 0.147 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000157216 SSBP3 607090 sc-eQTL 4.68e-02 -0.272 0.136 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000162402 USP24 -194795 sc-eQTL 1.40e-02 0.283 0.114 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000215883 CYB5RL 820533 sc-eQTL 2.51e-01 -0.188 0.163 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000243725 TTC4 304708 sc-eQTL 6.70e-01 0.0634 0.149 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000006555 TTC22 219246 sc-eQTL 2.48e-02 0.339 0.15 0.088 B_Memory L2
ENSG00000116133 DHCR24 133374 sc-eQTL 4.44e-01 -0.115 0.15 0.088 B_Memory L2
ENSG00000116205 TCEANC2 966985 sc-eQTL 4.16e-01 -0.131 0.161 0.088 B_Memory L2
ENSG00000116209 TMEM59 967065 sc-eQTL 1.93e-01 0.174 0.134 0.088 B_Memory L2
ENSG00000116221 MRPL37 836528 sc-eQTL 6.06e-02 -0.254 0.135 0.088 B_Memory L2
ENSG00000157216 SSBP3 607090 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0499 0.127 0.088 B_Memory L2
ENSG00000162402 USP24 -194795 sc-eQTL 1.92e-01 -0.162 0.124 0.088 B_Memory L2
ENSG00000215883 CYB5RL 820533 sc-eQTL 2.40e-01 0.18 0.153 0.088 B_Memory L2
ENSG00000243725 TTC4 304708 sc-eQTL 6.22e-01 0.0784 0.159 0.088 B_Memory L2
ENSG00000006555 TTC22 219246 sc-eQTL 9.12e-01 0.0176 0.159 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000116133 DHCR24 133374 sc-eQTL 8.64e-01 0.0254 0.149 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 966985 sc-eQTL 3.18e-01 0.132 0.132 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000116209 TMEM59 967065 sc-eQTL 3.25e-01 -0.0948 0.0961 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000116221 MRPL37 836528 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0661 0.142 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000157216 SSBP3 607090 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0504 0.135 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000162402 USP24 -194795 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0912 0.106 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 820533 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0213 0.161 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000243725 TTC4 304708 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0908 0.145 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000006555 TTC22 219246 sc-eQTL 8.21e-01 0.0364 0.161 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000116133 DHCR24 133374 sc-eQTL 8.78e-01 0.0215 0.14 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 966985 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0665 0.156 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000116209 TMEM59 967065 sc-eQTL 4.22e-01 0.103 0.128 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000116221 MRPL37 836528 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0769 0.151 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000157216 SSBP3 607090 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0493 0.149 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000162402 USP24 -194795 sc-eQTL 2.92e-01 0.124 0.118 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 820533 sc-eQTL 6.58e-02 0.304 0.165 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000243725 TTC4 304708 sc-eQTL 9.44e-01 0.0122 0.173 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000006555 TTC22 219246 sc-eQTL 6.30e-02 -0.283 0.151 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 966985 sc-eQTL 5.76e-01 0.0879 0.157 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 967065 sc-eQTL 3.97e-01 -0.121 0.142 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 836528 sc-eQTL 6.40e-01 0.0823 0.175 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 607090 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0807 0.108 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -194795 sc-eQTL 9.67e-01 0.00609 0.148 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 304708 sc-eQTL 9.21e-01 0.0164 0.166 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 219246 sc-eQTL 1.72e-02 -0.317 0.132 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 966985 sc-eQTL 4.51e-01 0.0768 0.102 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 967065 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0295 0.0991 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 836528 sc-eQTL 4.49e-01 0.0967 0.128 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 607090 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0518 0.102 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -194795 sc-eQTL 7.30e-01 0.0304 0.0879 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 304708 sc-eQTL 1.49e-01 -0.193 0.133 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 219246 sc-eQTL 3.23e-01 0.14 0.142 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 966985 sc-eQTL 2.81e-01 0.149 0.138 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 967065 sc-eQTL 7.30e-01 0.036 0.104 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 836528 sc-eQTL 5.37e-01 -0.081 0.131 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 607090 sc-eQTL 5.14e-01 -0.084 0.128 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -194795 sc-eQTL 9.12e-01 0.0119 0.107 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 304708 sc-eQTL 1.65e-01 -0.213 0.153 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 219246 sc-eQTL 3.92e-01 0.14 0.163 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 966985 sc-eQTL 4.56e-01 -0.115 0.154 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 967065 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0765 0.12 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 836528 sc-eQTL 2.70e-02 -0.339 0.152 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 607090 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0893 0.132 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -194795 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0393 0.12 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 304708 sc-eQTL 1.30e-01 -0.241 0.158 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 219246 sc-eQTL 1.96e-01 -0.169 0.131 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 966985 sc-eQTL 9.67e-01 0.00603 0.145 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 967065 sc-eQTL 7.30e-02 0.226 0.125 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 836528 sc-eQTL 1.29e-01 -0.227 0.149 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 607090 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0518 0.102 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -194795 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00698 0.102 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 304708 sc-eQTL 1.48e-01 0.22 0.151 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 219246 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0517 0.147 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 966985 sc-eQTL 4.39e-01 0.103 0.133 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 967065 sc-eQTL 4.03e-01 0.109 0.13 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 836528 sc-eQTL 4.45e-01 -0.119 0.156 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 607090 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0906 0.118 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -194795 sc-eQTL 8.75e-02 0.183 0.107 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 304708 sc-eQTL 1.08e-01 -0.252 0.156 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 219246 sc-eQTL 9.57e-01 0.00871 0.163 0.086 CD8_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 966985 sc-eQTL 8.54e-02 0.28 0.162 0.086 CD8_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 967065 sc-eQTL 7.73e-01 0.0415 0.144 0.086 CD8_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 836528 sc-eQTL 1.30e-01 0.246 0.162 0.086 CD8_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 607090 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00151 0.142 0.086 CD8_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -194795 sc-eQTL 4.37e-01 0.107 0.137 0.086 CD8_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 304708 sc-eQTL 9.28e-01 -0.0151 0.167 0.086 CD8_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 219246 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0552 0.154 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 966985 sc-eQTL 3.47e-01 0.151 0.16 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 967065 sc-eQTL 9.39e-01 0.0119 0.155 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 836528 sc-eQTL 3.60e-02 -0.328 0.156 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 607090 sc-eQTL 2.86e-01 -0.159 0.148 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -194795 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0568 0.157 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 304708 sc-eQTL 2.67e-01 -0.177 0.159 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 219246 sc-eQTL 3.83e-02 -0.298 0.143 0.087 MAIT L2
ENSG00000116133 DHCR24 133374 sc-eQTL 2.58e-01 0.121 0.107 0.087 MAIT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 966985 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0908 0.15 0.087 MAIT L2
ENSG00000116209 TMEM59 967065 sc-eQTL 3.78e-01 0.12 0.136 0.087 MAIT L2
ENSG00000116221 MRPL37 836528 sc-eQTL 2.76e-01 0.18 0.165 0.087 MAIT L2
ENSG00000157216 SSBP3 607090 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0722 0.146 0.087 MAIT L2
ENSG00000162402 USP24 -194795 sc-eQTL 9.93e-01 -0.00114 0.13 0.087 MAIT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 820533 sc-eQTL 3.59e-01 -0.139 0.151 0.087 MAIT L2
ENSG00000243725 TTC4 304708 sc-eQTL 5.48e-01 0.0905 0.15 0.087 MAIT L2
ENSG00000006555 TTC22 219246 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0496 0.161 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000116133 DHCR24 133374 sc-eQTL 4.91e-01 0.0984 0.142 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000116205 TCEANC2 966985 sc-eQTL 6.90e-01 0.0602 0.151 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000116209 TMEM59 967065 sc-eQTL 5.69e-01 0.0838 0.147 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000116221 MRPL37 836528 sc-eQTL 7.87e-01 0.0445 0.164 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000157216 SSBP3 607090 sc-eQTL 8.67e-02 0.211 0.123 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000162398 LEXM 214506 sc-eQTL 4.63e-01 -0.107 0.146 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000162402 USP24 -194795 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0135 0.126 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000243725 TTC4 304708 sc-eQTL 5.93e-01 0.085 0.159 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000006555 TTC22 219246 sc-eQTL 2.71e-02 -0.294 0.132 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000116133 DHCR24 133374 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0651 0.14 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000116205 TCEANC2 966985 sc-eQTL 2.17e-01 -0.187 0.151 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000116209 TMEM59 967065 sc-eQTL 2.96e-01 -0.117 0.112 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000116221 MRPL37 836528 sc-eQTL 2.29e-01 -0.175 0.145 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000157216 SSBP3 607090 sc-eQTL 9.57e-02 0.198 0.119 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000162398 LEXM 214506 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0305 0.137 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000162402 USP24 -194795 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0176 0.0872 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000243725 TTC4 304708 sc-eQTL 2.06e-01 0.189 0.149 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000006555 TTC22 219246 sc-eQTL 1.21e-01 -0.246 0.158 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000116133 DHCR24 133374 sc-eQTL 3.55e-01 -0.143 0.154 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000116205 TCEANC2 966985 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0245 0.149 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000116209 TMEM59 967065 sc-eQTL 8.55e-01 0.0271 0.148 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000116221 MRPL37 836528 sc-eQTL 4.06e-01 -0.136 0.163 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000157216 SSBP3 607090 sc-eQTL 5.16e-01 0.0867 0.133 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000162398 LEXM 214506 sc-eQTL 2.23e-01 -0.183 0.15 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000162402 USP24 -194795 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00589 0.11 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000243725 TTC4 304708 sc-eQTL 2.39e-01 0.194 0.164 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000006555 TTC22 219246 sc-eQTL 3.32e-01 -0.139 0.143 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000116133 DHCR24 133374 sc-eQTL 8.21e-01 0.0329 0.145 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000116205 TCEANC2 966985 sc-eQTL 2.17e-01 0.178 0.144 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000116209 TMEM59 967065 sc-eQTL 2.09e-01 0.147 0.117 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000116221 MRPL37 836528 sc-eQTL 3.37e-02 -0.306 0.143 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000157216 SSBP3 607090 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0381 0.121 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000162398 LEXM 214506 sc-eQTL 9.74e-03 -0.389 0.149 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000162402 USP24 -194795 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0327 0.103 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000243725 TTC4 304708 sc-eQTL 7.34e-02 -0.274 0.152 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000006555 TTC22 219246 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00272 0.17 0.111 PB L2
ENSG00000116133 DHCR24 133374 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0801 0.151 0.111 PB L2
ENSG00000116205 TCEANC2 966985 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0641 0.184 0.111 PB L2
ENSG00000116209 TMEM59 967065 sc-eQTL 6.77e-01 0.0321 0.0768 0.111 PB L2
ENSG00000116221 MRPL37 836528 sc-eQTL 1.66e-01 -0.193 0.138 0.111 PB L2
ENSG00000157216 SSBP3 607090 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0996 0.161 0.111 PB L2
ENSG00000162402 USP24 -194795 sc-eQTL 2.23e-01 0.223 0.182 0.111 PB L2
ENSG00000215883 CYB5RL 820533 sc-eQTL 6.18e-04 0.634 0.18 0.111 PB L2
ENSG00000243725 TTC4 304708 sc-eQTL 8.95e-01 0.0235 0.177 0.111 PB L2
ENSG00000006555 TTC22 219246 sc-eQTL 1.28e-01 -0.224 0.146 0.085 Pro_T L2
ENSG00000116133 DHCR24 133374 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0412 0.125 0.085 Pro_T L2
ENSG00000116205 TCEANC2 966985 sc-eQTL 3.22e-01 -0.151 0.152 0.085 Pro_T L2
ENSG00000116209 TMEM59 967065 sc-eQTL 7.71e-01 0.0308 0.106 0.085 Pro_T L2
ENSG00000116221 MRPL37 836528 sc-eQTL 2.20e-01 0.127 0.103 0.085 Pro_T L2
ENSG00000157216 SSBP3 607090 sc-eQTL 9.78e-01 0.00327 0.116 0.085 Pro_T L2
ENSG00000162402 USP24 -194795 sc-eQTL 6.86e-01 0.0573 0.142 0.085 Pro_T L2
ENSG00000215883 CYB5RL 820533 sc-eQTL 3.73e-01 -0.125 0.14 0.085 Pro_T L2
ENSG00000243725 TTC4 304708 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0205 0.156 0.085 Pro_T L2
ENSG00000006555 TTC22 219246 sc-eQTL 3.02e-01 -0.149 0.144 0.09 Treg L2
ENSG00000116205 TCEANC2 966985 sc-eQTL 2.02e-01 -0.197 0.154 0.09 Treg L2
ENSG00000116209 TMEM59 967065 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0224 0.122 0.09 Treg L2
ENSG00000116221 MRPL37 836528 sc-eQTL 2.23e-02 -0.344 0.15 0.09 Treg L2
ENSG00000157216 SSBP3 607090 sc-eQTL 7.82e-01 0.0375 0.135 0.09 Treg L2
ENSG00000162402 USP24 -194795 sc-eQTL 7.27e-01 0.045 0.129 0.09 Treg L2
ENSG00000243725 TTC4 304708 sc-eQTL 6.72e-01 0.0687 0.162 0.09 Treg L2
ENSG00000116133 DHCR24 133374 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0833 0.131 0.093 cDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 966985 sc-eQTL 2.49e-01 0.179 0.155 0.093 cDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 967065 sc-eQTL 3.43e-01 0.125 0.131 0.093 cDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 836528 sc-eQTL 5.28e-01 0.107 0.168 0.093 cDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 607090 sc-eQTL 1.55e-01 -0.221 0.155 0.093 cDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 478312 sc-eQTL 1.09e-01 -0.231 0.144 0.093 cDC L2
ENSG00000162402 USP24 -194795 sc-eQTL 6.80e-01 -0.067 0.162 0.093 cDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 820533 sc-eQTL 1.08e-01 0.223 0.138 0.093 cDC L2
ENSG00000243725 TTC4 304708 sc-eQTL 6.23e-01 0.0818 0.166 0.093 cDC L2
ENSG00000116133 DHCR24 133374 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0105 0.0919 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000116205 TCEANC2 966985 sc-eQTL 8.95e-01 0.0169 0.128 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000116209 TMEM59 967065 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0213 0.0774 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000116221 MRPL37 836528 sc-eQTL 4.05e-01 0.115 0.138 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000157216 SSBP3 607090 sc-eQTL 2.49e-02 0.314 0.139 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000162402 USP24 -194795 sc-eQTL 1.67e-01 0.143 0.104 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000243725 TTC4 304708 sc-eQTL 1.94e-01 -0.206 0.158 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000116133 DHCR24 133374 sc-eQTL 2.13e-01 0.109 0.0873 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000116205 TCEANC2 966985 sc-eQTL 2.01e-01 -0.171 0.133 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000116209 TMEM59 967065 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0454 0.107 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000116221 MRPL37 836528 sc-eQTL 4.94e-01 -0.106 0.154 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000157216 SSBP3 607090 sc-eQTL 7.65e-02 0.284 0.159 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000162402 USP24 -194795 sc-eQTL 1.76e-01 0.176 0.129 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000243725 TTC4 304708 sc-eQTL 8.06e-01 0.04 0.163 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000006555 TTC22 219246 sc-eQTL 4.59e-01 -0.12 0.162 0.076 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 133374 sc-eQTL 4.23e-01 -0.145 0.18 0.076 gdT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 966985 sc-eQTL 5.07e-01 0.121 0.181 0.076 gdT L2
ENSG00000116209 TMEM59 967065 sc-eQTL 3.85e-01 0.16 0.184 0.076 gdT L2
ENSG00000116221 MRPL37 836528 sc-eQTL 4.33e-01 0.166 0.211 0.076 gdT L2
ENSG00000157216 SSBP3 607090 sc-eQTL 1.85e-01 0.171 0.129 0.076 gdT L2
ENSG00000162402 USP24 -194795 sc-eQTL 9.48e-01 -0.0113 0.174 0.076 gdT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 820533 sc-eQTL 2.07e-01 0.228 0.18 0.076 gdT L2
ENSG00000243725 TTC4 304708 sc-eQTL 1.05e-01 0.329 0.202 0.076 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 133374 sc-eQTL 9.77e-01 -0.0034 0.115 0.089 intMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 966985 sc-eQTL 1.09e-01 0.23 0.143 0.089 intMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 967065 sc-eQTL 7.65e-02 0.186 0.105 0.089 intMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 836528 sc-eQTL 2.77e-01 -0.175 0.161 0.089 intMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 607090 sc-eQTL 7.45e-01 0.0535 0.165 0.089 intMono L2
ENSG00000162402 USP24 -194795 sc-eQTL 8.93e-02 0.249 0.146 0.089 intMono L2
ENSG00000243725 TTC4 304708 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0262 0.156 0.089 intMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 133374 sc-eQTL 5.52e-01 0.0687 0.115 0.088 ncMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 966985 sc-eQTL 6.81e-01 0.0594 0.144 0.088 ncMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 967065 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0566 0.115 0.088 ncMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 836528 sc-eQTL 2.47e-01 0.172 0.148 0.088 ncMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 607090 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0908 0.163 0.088 ncMono L2
ENSG00000162402 USP24 -194795 sc-eQTL 3.81e-01 -0.114 0.13 0.088 ncMono L2
ENSG00000243725 TTC4 304708 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0392 0.154 0.088 ncMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 133374 sc-eQTL 3.71e-01 -0.131 0.146 0.085 pDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 966985 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0203 0.175 0.085 pDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 967065 sc-eQTL 3.56e-01 -0.129 0.139 0.085 pDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 836528 sc-eQTL 7.55e-01 -0.058 0.186 0.085 pDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 607090 sc-eQTL 1.69e-01 -0.227 0.164 0.085 pDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 478312 sc-eQTL 6.52e-01 0.0313 0.0693 0.085 pDC L2
ENSG00000162402 USP24 -194795 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0526 0.117 0.085 pDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 820533 sc-eQTL 5.30e-02 0.309 0.158 0.085 pDC L2
ENSG00000243725 TTC4 304708 sc-eQTL 2.53e-01 -0.212 0.184 0.085 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 219246 sc-eQTL 4.92e-01 0.104 0.151 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 133374 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0944 0.152 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 966985 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0294 0.147 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 967065 sc-eQTL 3.91e-01 0.0981 0.114 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 836528 sc-eQTL 1.48e-01 -0.198 0.136 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 607090 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0869 0.119 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -194795 sc-eQTL 9.40e-01 0.00822 0.109 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 820533 sc-eQTL 8.98e-01 0.0215 0.167 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 304708 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0153 0.15 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 219246 sc-eQTL 8.47e-01 0.0311 0.161 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 133374 sc-eQTL 8.32e-01 0.0308 0.145 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 966985 sc-eQTL 5.84e-01 0.0718 0.131 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 967065 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0161 0.093 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 836528 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0945 0.134 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 607090 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0589 0.12 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -194795 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0105 0.103 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 820533 sc-eQTL 9.19e-02 0.273 0.161 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 304708 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0505 0.153 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 133374 sc-eQTL 6.18e-01 0.0449 0.0898 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 966985 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0819 0.112 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 967065 sc-eQTL 3.27e-01 -0.076 0.0774 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 836528 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00257 0.137 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 607090 sc-eQTL 4.25e-02 0.29 0.142 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -194795 sc-eQTL 1.13e-01 0.155 0.0976 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 304708 sc-eQTL 5.29e-01 -0.102 0.163 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 133374 sc-eQTL 9.53e-01 0.00646 0.109 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 966985 sc-eQTL 1.18e-01 0.224 0.143 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 967065 sc-eQTL 6.68e-01 0.0459 0.107 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 836528 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00976 0.146 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 607090 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00794 0.156 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -194795 sc-eQTL 7.63e-01 0.0371 0.123 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 304708 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0254 0.154 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 219246 sc-eQTL 4.68e-02 -0.259 0.129 0.088 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 133374 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0979 0.136 0.088 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 966985 sc-eQTL 4.50e-01 -0.101 0.134 0.088 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 967065 sc-eQTL 8.14e-01 0.0244 0.104 0.088 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 836528 sc-eQTL 2.42e-02 -0.311 0.137 0.088 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 607090 sc-eQTL 2.26e-01 0.138 0.113 0.088 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162398 LEXM 214506 sc-eQTL 7.48e-02 -0.228 0.127 0.088 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -194795 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0466 0.0813 0.088 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 304708 sc-eQTL 6.47e-01 0.0663 0.145 0.088 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000116205 TCEANC2 966985 eQTL 0.00302 0.0945 0.0318 0.0118 0.00229 0.0736
ENSG00000234810 AL603840.1 -308719 eQTL 0.0315 -0.131 0.061 0.0 0.0 0.0736

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000234810 AL603840.1 -308719 1.25e-06 9.34e-07 3.27e-07 4.88e-07 2.79e-07 4.67e-07 1.13e-06 3.5e-07 1.2e-06 3.99e-07 1.35e-06 6.08e-07 1.73e-06 2.72e-07 4.48e-07 7.3e-07 8.43e-07 5.55e-07 5.7e-07 7.04e-07 4.19e-07 1.2e-06 7.76e-07 6.23e-07 1.92e-06 3.79e-07 7.06e-07 6.51e-07 1.05e-06 1.11e-06 5.26e-07 1.56e-07 2.36e-07 5.78e-07 4.49e-07 4.66e-07 4.26e-07 1.58e-07 2.95e-07 1.17e-07 2.88e-07 1.3e-06 5.53e-08 1.27e-08 1.66e-07 1.01e-07 2.38e-07 8.18e-08 9.59e-08