logo

Genes within 1Mb (chr1:55019425:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 218102 sc-eQTL 8.57e-02 -0.196 0.114 0.16 B L1
ENSG00000116133 DHCR24 132230 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0755 0.108 0.16 B L1
ENSG00000116205 TCEANC2 965841 sc-eQTL 7.86e-01 0.0254 0.0934 0.16 B L1
ENSG00000116209 TMEM59 965921 sc-eQTL 6.63e-01 0.0248 0.0569 0.16 B L1
ENSG00000116221 MRPL37 835384 sc-eQTL 4.05e-01 0.062 0.0743 0.16 B L1
ENSG00000157216 SSBP3 605946 sc-eQTL 1.53e-03 -0.244 0.0761 0.16 B L1
ENSG00000162402 USP24 -195939 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0408 0.066 0.16 B L1
ENSG00000215883 CYB5RL 819389 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0433 0.127 0.16 B L1
ENSG00000243725 TTC4 303564 sc-eQTL 7.65e-01 0.033 0.111 0.16 B L1
ENSG00000006555 TTC22 218102 sc-eQTL 8.22e-01 0.0202 0.0897 0.16 CD4T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 965841 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0333 0.0733 0.16 CD4T L1
ENSG00000116209 TMEM59 965921 sc-eQTL 9.60e-01 0.0034 0.0684 0.16 CD4T L1
ENSG00000116221 MRPL37 835384 sc-eQTL 4.91e-01 0.0651 0.0944 0.16 CD4T L1
ENSG00000157216 SSBP3 605946 sc-eQTL 4.52e-01 -0.059 0.0783 0.16 CD4T L1
ENSG00000162402 USP24 -195939 sc-eQTL 1.84e-01 -0.0848 0.0637 0.16 CD4T L1
ENSG00000243725 TTC4 303564 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0176 0.0962 0.16 CD4T L1
ENSG00000006555 TTC22 218102 sc-eQTL 3.59e-01 0.0703 0.0764 0.16 CD8T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 965841 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0515 0.0953 0.16 CD8T L1
ENSG00000116209 TMEM59 965921 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0257 0.0662 0.16 CD8T L1
ENSG00000116221 MRPL37 835384 sc-eQTL 3.41e-01 0.0869 0.091 0.16 CD8T L1
ENSG00000157216 SSBP3 605946 sc-eQTL 5.02e-01 -0.044 0.0654 0.16 CD8T L1
ENSG00000162402 USP24 -195939 sc-eQTL 3.18e-01 -0.0633 0.0632 0.16 CD8T L1
ENSG00000243725 TTC4 303564 sc-eQTL 6.91e-01 0.0437 0.11 0.16 CD8T L1
ENSG00000116133 DHCR24 132230 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000558 0.106 0.16 DC L1
ENSG00000116205 TCEANC2 965841 sc-eQTL 2.36e-01 -0.141 0.119 0.16 DC L1
ENSG00000116209 TMEM59 965921 sc-eQTL 3.76e-01 0.083 0.0935 0.16 DC L1
ENSG00000116221 MRPL37 835384 sc-eQTL 2.75e-01 0.137 0.125 0.16 DC L1
ENSG00000157216 SSBP3 605946 sc-eQTL 9.03e-02 -0.19 0.111 0.16 DC L1
ENSG00000162390 ACOT11 477168 sc-eQTL 6.87e-01 0.0436 0.108 0.16 DC L1
ENSG00000162402 USP24 -195939 sc-eQTL 1.95e-01 -0.0842 0.0648 0.16 DC L1
ENSG00000215883 CYB5RL 819389 sc-eQTL 6.55e-01 0.0525 0.118 0.16 DC L1
ENSG00000243725 TTC4 303564 sc-eQTL 7.26e-02 0.227 0.126 0.16 DC L1
ENSG00000116133 DHCR24 132230 sc-eQTL 6.96e-01 0.0296 0.0757 0.16 Mono L1
ENSG00000116205 TCEANC2 965841 sc-eQTL 3.05e-01 0.0838 0.0814 0.16 Mono L1
ENSG00000116209 TMEM59 965921 sc-eQTL 3.37e-03 0.176 0.0594 0.16 Mono L1
ENSG00000116221 MRPL37 835384 sc-eQTL 8.37e-01 0.0209 0.101 0.16 Mono L1
ENSG00000157216 SSBP3 605946 sc-eQTL 1.81e-01 0.155 0.116 0.16 Mono L1
ENSG00000162402 USP24 -195939 sc-eQTL 3.43e-02 -0.146 0.0685 0.16 Mono L1
ENSG00000243725 TTC4 303564 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0481 0.122 0.16 Mono L1
ENSG00000006555 TTC22 218102 sc-eQTL 9.11e-02 0.172 0.101 0.161 NK L1
ENSG00000116133 DHCR24 132230 sc-eQTL 1.76e-01 -0.139 0.102 0.161 NK L1
ENSG00000116205 TCEANC2 965841 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0182 0.102 0.161 NK L1
ENSG00000116209 TMEM59 965921 sc-eQTL 4.28e-01 -0.063 0.0794 0.161 NK L1
ENSG00000116221 MRPL37 835384 sc-eQTL 8.34e-01 0.0207 0.0989 0.161 NK L1
ENSG00000157216 SSBP3 605946 sc-eQTL 1.96e-01 0.111 0.0854 0.161 NK L1
ENSG00000162398 LEXM 213362 sc-eQTL 1.73e-01 0.131 0.0958 0.161 NK L1
ENSG00000162402 USP24 -195939 sc-eQTL 3.41e-02 -0.123 0.0577 0.161 NK L1
ENSG00000243725 TTC4 303564 sc-eQTL 3.49e-01 -0.103 0.11 0.161 NK L1
ENSG00000006555 TTC22 218102 sc-eQTL 9.92e-01 -0.000896 0.0916 0.16 Other_T L1
ENSG00000116133 DHCR24 132230 sc-eQTL 3.35e-01 -0.0685 0.0709 0.16 Other_T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 965841 sc-eQTL 9.10e-01 0.012 0.106 0.16 Other_T L1
ENSG00000116209 TMEM59 965921 sc-eQTL 2.74e-01 -0.0799 0.0728 0.16 Other_T L1
ENSG00000116221 MRPL37 835384 sc-eQTL 1.53e-01 0.0975 0.068 0.16 Other_T L1
ENSG00000157216 SSBP3 605946 sc-eQTL 9.68e-01 0.00313 0.0791 0.16 Other_T L1
ENSG00000162402 USP24 -195939 sc-eQTL 3.59e-01 0.0773 0.084 0.16 Other_T L1
ENSG00000215883 CYB5RL 819389 sc-eQTL 3.02e-01 0.119 0.115 0.16 Other_T L1
ENSG00000243725 TTC4 303564 sc-eQTL 1.72e-02 -0.272 0.113 0.16 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 218102 sc-eQTL 2.86e-01 0.102 0.0953 0.163 B_Activated L2
ENSG00000116133 DHCR24 132230 sc-eQTL 2.88e-01 -0.119 0.112 0.163 B_Activated L2
ENSG00000116205 TCEANC2 965841 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0768 0.12 0.163 B_Activated L2
ENSG00000116209 TMEM59 965921 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0821 0.128 0.163 B_Activated L2
ENSG00000116221 MRPL37 835384 sc-eQTL 4.68e-01 -0.101 0.138 0.163 B_Activated L2
ENSG00000157216 SSBP3 605946 sc-eQTL 1.00e+00 1.93e-05 0.125 0.163 B_Activated L2
ENSG00000162402 USP24 -195939 sc-eQTL 7.60e-01 0.0374 0.122 0.163 B_Activated L2
ENSG00000215883 CYB5RL 819389 sc-eQTL 2.53e-01 -0.123 0.108 0.163 B_Activated L2
ENSG00000243725 TTC4 303564 sc-eQTL 3.87e-01 0.101 0.117 0.163 B_Activated L2
ENSG00000006555 TTC22 218102 sc-eQTL 8.12e-01 0.0291 0.122 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000116133 DHCR24 132230 sc-eQTL 9.96e-01 0.000636 0.113 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000116205 TCEANC2 965841 sc-eQTL 3.31e-01 -0.11 0.113 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000116209 TMEM59 965921 sc-eQTL 4.76e-01 0.0689 0.0965 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000116221 MRPL37 835384 sc-eQTL 1.92e-01 0.148 0.113 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000157216 SSBP3 605946 sc-eQTL 1.14e-01 -0.168 0.106 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000162402 USP24 -195939 sc-eQTL 2.20e-01 -0.11 0.0891 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000215883 CYB5RL 819389 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0521 0.127 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000243725 TTC4 303564 sc-eQTL 4.81e-01 0.0811 0.115 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000006555 TTC22 218102 sc-eQTL 2.28e-01 -0.14 0.116 0.162 B_Memory L2
ENSG00000116133 DHCR24 132230 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0702 0.115 0.162 B_Memory L2
ENSG00000116205 TCEANC2 965841 sc-eQTL 7.25e-01 0.0435 0.124 0.162 B_Memory L2
ENSG00000116209 TMEM59 965921 sc-eQTL 3.40e-01 -0.0982 0.103 0.162 B_Memory L2
ENSG00000116221 MRPL37 835384 sc-eQTL 1.37e-01 0.155 0.104 0.162 B_Memory L2
ENSG00000157216 SSBP3 605946 sc-eQTL 5.81e-02 -0.184 0.0966 0.162 B_Memory L2
ENSG00000162402 USP24 -195939 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00146 0.0953 0.162 B_Memory L2
ENSG00000215883 CYB5RL 819389 sc-eQTL 4.68e-03 -0.33 0.116 0.162 B_Memory L2
ENSG00000243725 TTC4 303564 sc-eQTL 2.45e-01 0.142 0.122 0.162 B_Memory L2
ENSG00000006555 TTC22 218102 sc-eQTL 1.55e-01 -0.173 0.121 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000116133 DHCR24 132230 sc-eQTL 9.30e-01 -0.01 0.114 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 965841 sc-eQTL 4.08e-01 0.0842 0.102 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000116209 TMEM59 965921 sc-eQTL 4.77e-01 0.0526 0.0739 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000116221 MRPL37 835384 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000745 0.109 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000157216 SSBP3 605946 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0979 0.104 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000162402 USP24 -195939 sc-eQTL 4.61e-01 0.0603 0.0817 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 819389 sc-eQTL 6.13e-02 0.23 0.122 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000243725 TTC4 303564 sc-eQTL 8.67e-01 0.0187 0.111 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000006555 TTC22 218102 sc-eQTL 3.61e-01 -0.112 0.122 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000116133 DHCR24 132230 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0179 0.107 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 965841 sc-eQTL 4.89e-01 0.0819 0.118 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000116209 TMEM59 965921 sc-eQTL 3.80e-02 0.202 0.0965 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000116221 MRPL37 835384 sc-eQTL 5.80e-01 0.0635 0.115 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000157216 SSBP3 605946 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0356 0.113 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000162402 USP24 -195939 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0547 0.0895 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 819389 sc-eQTL 4.00e-01 -0.106 0.126 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000243725 TTC4 303564 sc-eQTL 7.03e-01 -0.05 0.131 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000006555 TTC22 218102 sc-eQTL 3.13e-01 0.113 0.112 0.164 CD4_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 965841 sc-eQTL 4.25e-01 0.0922 0.115 0.164 CD4_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 965921 sc-eQTL 1.22e-01 0.162 0.104 0.164 CD4_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 835384 sc-eQTL 7.44e-02 0.23 0.128 0.164 CD4_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 605946 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0639 0.0793 0.164 CD4_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -195939 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0734 0.109 0.164 CD4_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 303564 sc-eQTL 9.65e-02 0.202 0.121 0.164 CD4_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 218102 sc-eQTL 3.08e-01 0.108 0.105 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 965841 sc-eQTL 5.26e-01 -0.051 0.0803 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 965921 sc-eQTL 7.97e-01 0.0202 0.0782 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 835384 sc-eQTL 9.46e-01 0.00686 0.101 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 605946 sc-eQTL 4.47e-01 0.0612 0.0803 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -195939 sc-eQTL 9.90e-01 0.000845 0.0694 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 303564 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0861 0.106 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 218102 sc-eQTL 6.57e-01 0.0488 0.11 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 965841 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0339 0.107 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 965921 sc-eQTL 5.20e-01 0.0519 0.0805 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 835384 sc-eQTL 1.79e-01 0.136 0.101 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 605946 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0642 0.0992 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -195939 sc-eQTL 1.09e-01 -0.132 0.0818 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 303564 sc-eQTL 6.92e-01 -0.047 0.119 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 218102 sc-eQTL 9.19e-01 0.0127 0.125 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 965841 sc-eQTL 1.53e-01 -0.169 0.118 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 965921 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0106 0.0915 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 835384 sc-eQTL 1.64e-01 0.164 0.117 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 605946 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0813 0.101 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -195939 sc-eQTL 7.01e-02 -0.166 0.0911 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 303564 sc-eQTL 3.55e-01 0.112 0.121 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 218102 sc-eQTL 7.76e-01 0.0284 0.0997 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 965841 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0661 0.11 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 965921 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0314 0.096 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 835384 sc-eQTL 1.28e-01 0.173 0.113 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 605946 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0253 0.0778 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -195939 sc-eQTL 1.52e-01 -0.111 0.077 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 303564 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0331 0.116 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 218102 sc-eQTL 8.02e-01 0.0279 0.111 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 965841 sc-eQTL 7.89e-01 -0.027 0.1 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 965921 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0862 0.0981 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 835384 sc-eQTL 2.73e-01 0.129 0.118 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 605946 sc-eQTL 3.79e-01 0.0786 0.089 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -195939 sc-eQTL 7.04e-01 0.0309 0.0811 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 303564 sc-eQTL 9.34e-01 0.0099 0.119 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 218102 sc-eQTL 4.55e-01 0.09 0.12 0.167 CD8_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 965841 sc-eQTL 3.05e-01 0.124 0.121 0.167 CD8_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 965921 sc-eQTL 4.17e-01 0.0865 0.106 0.167 CD8_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 835384 sc-eQTL 9.90e-01 0.00147 0.121 0.167 CD8_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 605946 sc-eQTL 1.29e-01 -0.159 0.104 0.167 CD8_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -195939 sc-eQTL 8.49e-01 0.0194 0.102 0.167 CD8_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 303564 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0557 0.123 0.167 CD8_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 218102 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0471 0.116 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 965841 sc-eQTL 5.38e-01 0.0743 0.121 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 965921 sc-eQTL 6.15e-01 0.0587 0.117 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 835384 sc-eQTL 6.68e-01 0.0508 0.118 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 605946 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0426 0.112 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -195939 sc-eQTL 6.27e-01 0.0573 0.118 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 303564 sc-eQTL 5.86e-02 0.226 0.119 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 218102 sc-eQTL 5.34e-01 0.0666 0.107 0.162 MAIT L2
ENSG00000116133 DHCR24 132230 sc-eQTL 8.70e-01 0.013 0.0793 0.162 MAIT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 965841 sc-eQTL 8.65e-01 -0.019 0.112 0.162 MAIT L2
ENSG00000116209 TMEM59 965921 sc-eQTL 5.86e-01 -0.055 0.101 0.162 MAIT L2
ENSG00000116221 MRPL37 835384 sc-eQTL 2.93e-01 0.129 0.122 0.162 MAIT L2
ENSG00000157216 SSBP3 605946 sc-eQTL 1.61e-01 -0.152 0.108 0.162 MAIT L2
ENSG00000162402 USP24 -195939 sc-eQTL 9.78e-01 0.00264 0.0964 0.162 MAIT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 819389 sc-eQTL 5.97e-01 0.0592 0.112 0.162 MAIT L2
ENSG00000243725 TTC4 303564 sc-eQTL 2.32e-01 -0.133 0.111 0.162 MAIT L2
ENSG00000006555 TTC22 218102 sc-eQTL 6.78e-01 0.0517 0.124 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000116133 DHCR24 132230 sc-eQTL 3.70e-01 0.0986 0.11 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000116205 TCEANC2 965841 sc-eQTL 4.24e-01 0.0928 0.116 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000116209 TMEM59 965921 sc-eQTL 4.87e-01 0.0787 0.113 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000116221 MRPL37 835384 sc-eQTL 1.31e-02 0.312 0.125 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000157216 SSBP3 605946 sc-eQTL 2.68e-01 -0.106 0.0951 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000162398 LEXM 213362 sc-eQTL 7.47e-01 0.0363 0.113 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000162402 USP24 -195939 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0604 0.0969 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000243725 TTC4 303564 sc-eQTL 7.38e-01 -0.041 0.122 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000006555 TTC22 218102 sc-eQTL 2.56e-01 0.117 0.103 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000116133 DHCR24 132230 sc-eQTL 9.65e-01 0.00471 0.107 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000116205 TCEANC2 965841 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00126 0.116 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000116209 TMEM59 965921 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0472 0.0861 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000116221 MRPL37 835384 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0434 0.112 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000157216 SSBP3 605946 sc-eQTL 2.66e-01 0.102 0.0915 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000162398 LEXM 213362 sc-eQTL 4.14e-01 0.0862 0.105 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000162402 USP24 -195939 sc-eQTL 1.32e-01 -0.101 0.0667 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000243725 TTC4 303564 sc-eQTL 1.61e-01 -0.161 0.114 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000006555 TTC22 218102 sc-eQTL 1.02e-02 0.323 0.125 0.153 NK_HLA L2
ENSG00000116133 DHCR24 132230 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0854 0.124 0.153 NK_HLA L2
ENSG00000116205 TCEANC2 965841 sc-eQTL 2.69e-01 0.132 0.119 0.153 NK_HLA L2
ENSG00000116209 TMEM59 965921 sc-eQTL 4.05e-01 0.0988 0.118 0.153 NK_HLA L2
ENSG00000116221 MRPL37 835384 sc-eQTL 2.97e-01 0.136 0.13 0.153 NK_HLA L2
ENSG00000157216 SSBP3 605946 sc-eQTL 7.64e-01 0.0321 0.107 0.153 NK_HLA L2
ENSG00000162398 LEXM 213362 sc-eQTL 2.91e-01 0.127 0.12 0.153 NK_HLA L2
ENSG00000162402 USP24 -195939 sc-eQTL 2.61e-01 -0.099 0.0879 0.153 NK_HLA L2
ENSG00000243725 TTC4 303564 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0347 0.132 0.153 NK_HLA L2
ENSG00000006555 TTC22 218102 sc-eQTL 3.08e-01 0.111 0.109 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000116133 DHCR24 132230 sc-eQTL 4.28e-02 -0.222 0.109 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000116205 TCEANC2 965841 sc-eQTL 1.07e-01 -0.176 0.109 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000116209 TMEM59 965921 sc-eQTL 3.19e-01 -0.0885 0.0886 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000116221 MRPL37 835384 sc-eQTL 4.87e-01 0.0762 0.109 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000157216 SSBP3 605946 sc-eQTL 1.56e-02 0.221 0.0905 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000162398 LEXM 213362 sc-eQTL 8.51e-01 0.0216 0.115 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000162402 USP24 -195939 sc-eQTL 5.72e-02 -0.148 0.0775 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000243725 TTC4 303564 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0616 0.116 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000006555 TTC22 218102 sc-eQTL 6.46e-01 0.0632 0.138 0.148 PB L2
ENSG00000116133 DHCR24 132230 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0545 0.122 0.148 PB L2
ENSG00000116205 TCEANC2 965841 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0743 0.148 0.148 PB L2
ENSG00000116209 TMEM59 965921 sc-eQTL 5.84e-01 -0.034 0.062 0.148 PB L2
ENSG00000116221 MRPL37 835384 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0583 0.113 0.148 PB L2
ENSG00000157216 SSBP3 605946 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0889 0.13 0.148 PB L2
ENSG00000162402 USP24 -195939 sc-eQTL 6.62e-01 0.0649 0.148 0.148 PB L2
ENSG00000215883 CYB5RL 819389 sc-eQTL 5.14e-01 -0.1 0.153 0.148 PB L2
ENSG00000243725 TTC4 303564 sc-eQTL 2.80e-01 0.155 0.142 0.148 PB L2
ENSG00000006555 TTC22 218102 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0285 0.115 0.161 Pro_T L2
ENSG00000116133 DHCR24 132230 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0631 0.0976 0.161 Pro_T L2
ENSG00000116205 TCEANC2 965841 sc-eQTL 2.70e-01 0.131 0.119 0.161 Pro_T L2
ENSG00000116209 TMEM59 965921 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0709 0.0826 0.161 Pro_T L2
ENSG00000116221 MRPL37 835384 sc-eQTL 2.09e-01 0.102 0.0807 0.161 Pro_T L2
ENSG00000157216 SSBP3 605946 sc-eQTL 2.46e-01 0.105 0.0906 0.161 Pro_T L2
ENSG00000162402 USP24 -195939 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0272 0.111 0.161 Pro_T L2
ENSG00000215883 CYB5RL 819389 sc-eQTL 1.46e-01 0.159 0.109 0.161 Pro_T L2
ENSG00000243725 TTC4 303564 sc-eQTL 1.09e-01 -0.194 0.121 0.161 Pro_T L2
ENSG00000006555 TTC22 218102 sc-eQTL 7.82e-01 0.0306 0.111 0.16 Treg L2
ENSG00000116205 TCEANC2 965841 sc-eQTL 1.86e-01 0.157 0.118 0.16 Treg L2
ENSG00000116209 TMEM59 965921 sc-eQTL 2.44e-01 0.109 0.0935 0.16 Treg L2
ENSG00000116221 MRPL37 835384 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0248 0.116 0.16 Treg L2
ENSG00000157216 SSBP3 605946 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0472 0.103 0.16 Treg L2
ENSG00000162402 USP24 -195939 sc-eQTL 3.31e-01 -0.0959 0.0984 0.16 Treg L2
ENSG00000243725 TTC4 303564 sc-eQTL 5.75e-01 0.0697 0.124 0.16 Treg L2
ENSG00000116133 DHCR24 132230 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0215 0.103 0.159 cDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 965841 sc-eQTL 1.65e-02 -0.289 0.119 0.159 cDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 965921 sc-eQTL 3.25e-01 0.101 0.103 0.159 cDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 835384 sc-eQTL 5.28e-01 0.0832 0.132 0.159 cDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 605946 sc-eQTL 5.14e-02 -0.236 0.12 0.159 cDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 477168 sc-eQTL 6.74e-01 0.0476 0.113 0.159 cDC L2
ENSG00000162402 USP24 -195939 sc-eQTL 2.52e-02 -0.282 0.125 0.159 cDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 819389 sc-eQTL 3.63e-01 0.099 0.108 0.159 cDC L2
ENSG00000243725 TTC4 303564 sc-eQTL 2.07e-01 0.164 0.129 0.159 cDC L2
ENSG00000116133 DHCR24 132230 sc-eQTL 8.69e-01 0.0121 0.0732 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000116205 TCEANC2 965841 sc-eQTL 1.25e-01 0.156 0.101 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000116209 TMEM59 965921 sc-eQTL 1.85e-01 0.0817 0.0615 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000116221 MRPL37 835384 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00558 0.11 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000157216 SSBP3 605946 sc-eQTL 6.82e-01 0.046 0.112 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000162402 USP24 -195939 sc-eQTL 2.65e-01 -0.0923 0.0827 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000243725 TTC4 303564 sc-eQTL 8.56e-01 0.0231 0.127 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000116133 DHCR24 132230 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0457 0.0683 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000116205 TCEANC2 965841 sc-eQTL 9.27e-01 0.00961 0.104 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000116209 TMEM59 965921 sc-eQTL 2.84e-02 0.182 0.0825 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000116221 MRPL37 835384 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0343 0.121 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000157216 SSBP3 605946 sc-eQTL 3.65e-01 0.114 0.125 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000162402 USP24 -195939 sc-eQTL 8.69e-01 0.0167 0.101 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000243725 TTC4 303564 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0269 0.127 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000006555 TTC22 218102 sc-eQTL 4.12e-01 -0.099 0.12 0.164 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 132230 sc-eQTL 1.88e-01 -0.177 0.134 0.164 gdT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 965841 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0433 0.135 0.164 gdT L2
ENSG00000116209 TMEM59 965921 sc-eQTL 5.59e-01 0.0801 0.137 0.164 gdT L2
ENSG00000116221 MRPL37 835384 sc-eQTL 6.69e-01 0.0672 0.157 0.164 gdT L2
ENSG00000157216 SSBP3 605946 sc-eQTL 5.78e-01 0.0536 0.0961 0.164 gdT L2
ENSG00000162402 USP24 -195939 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0167 0.129 0.164 gdT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 819389 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0523 0.134 0.164 gdT L2
ENSG00000243725 TTC4 303564 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0995 0.151 0.164 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 132230 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0216 0.092 0.158 intMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 965841 sc-eQTL 7.95e-01 0.0297 0.115 0.158 intMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 965921 sc-eQTL 1.99e-01 0.108 0.0838 0.158 intMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 835384 sc-eQTL 5.66e-01 0.074 0.129 0.158 intMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 605946 sc-eQTL 6.84e-01 0.0535 0.131 0.158 intMono L2
ENSG00000162402 USP24 -195939 sc-eQTL 9.14e-01 0.0127 0.117 0.158 intMono L2
ENSG00000243725 TTC4 303564 sc-eQTL 5.56e-01 0.0736 0.125 0.158 intMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 132230 sc-eQTL 5.17e-01 0.06 0.0923 0.152 ncMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 965841 sc-eQTL 8.61e-01 0.0202 0.116 0.152 ncMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 965921 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0201 0.0925 0.152 ncMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 835384 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0774 0.119 0.152 ncMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 605946 sc-eQTL 1.62e-01 0.182 0.13 0.152 ncMono L2
ENSG00000162402 USP24 -195939 sc-eQTL 8.16e-02 -0.181 0.103 0.152 ncMono L2
ENSG00000243725 TTC4 303564 sc-eQTL 8.48e-01 0.0237 0.123 0.152 ncMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 132230 sc-eQTL 2.08e-01 0.14 0.111 0.158 pDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 965841 sc-eQTL 8.64e-01 -0.023 0.134 0.158 pDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 965921 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0399 0.107 0.158 pDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 835384 sc-eQTL 9.31e-02 0.237 0.14 0.158 pDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 605946 sc-eQTL 1.73e-02 -0.297 0.124 0.158 pDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 477168 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0144 0.0529 0.158 pDC L2
ENSG00000162402 USP24 -195939 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0622 0.0892 0.158 pDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 819389 sc-eQTL 9.43e-01 0.00876 0.122 0.158 pDC L2
ENSG00000243725 TTC4 303564 sc-eQTL 8.70e-01 0.0232 0.141 0.158 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 218102 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0667 0.117 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 132230 sc-eQTL 4.16e-01 -0.096 0.118 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 965841 sc-eQTL 2.39e-01 -0.134 0.114 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 965921 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0215 0.0886 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 835384 sc-eQTL 5.49e-02 0.203 0.105 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 605946 sc-eQTL 1.20e-02 -0.23 0.0909 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -195939 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0484 0.0841 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 819389 sc-eQTL 3.55e-02 -0.271 0.128 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 303564 sc-eQTL 1.18e-01 0.181 0.115 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 218102 sc-eQTL 3.36e-02 -0.261 0.122 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 132230 sc-eQTL 9.44e-01 0.00783 0.111 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 965841 sc-eQTL 2.71e-01 0.11 0.1 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 965921 sc-eQTL 1.28e-01 0.108 0.0709 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 835384 sc-eQTL 5.60e-01 0.0598 0.102 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 605946 sc-eQTL 2.93e-01 -0.0964 0.0914 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -195939 sc-eQTL 6.00e-01 0.0413 0.0786 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 819389 sc-eQTL 4.30e-01 0.0983 0.124 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 303564 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0568 0.117 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 132230 sc-eQTL 8.98e-01 -0.00906 0.0707 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 965841 sc-eQTL 1.60e-01 0.124 0.088 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 965921 sc-eQTL 3.46e-02 0.128 0.0603 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 835384 sc-eQTL 9.68e-01 0.00431 0.108 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 605946 sc-eQTL 3.08e-01 0.115 0.113 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -195939 sc-eQTL 2.89e-01 -0.0818 0.077 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 303564 sc-eQTL 7.88e-01 0.0345 0.128 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 132230 sc-eQTL 5.59e-01 0.0516 0.0883 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 965841 sc-eQTL 3.67e-01 0.105 0.116 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 965921 sc-eQTL 2.59e-01 0.0975 0.086 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 835384 sc-eQTL 7.63e-01 0.0357 0.118 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 605946 sc-eQTL 1.40e-01 0.186 0.125 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -195939 sc-eQTL 1.68e-01 -0.137 0.099 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 303564 sc-eQTL 4.80e-01 0.088 0.124 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 218102 sc-eQTL 7.49e-02 0.177 0.0992 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 132230 sc-eQTL 2.18e-01 -0.128 0.104 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 965841 sc-eQTL 7.62e-01 -0.031 0.102 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 965921 sc-eQTL 3.26e-01 -0.0777 0.079 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 835384 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0225 0.106 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 605946 sc-eQTL 2.06e-01 0.11 0.0867 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162398 LEXM 213362 sc-eQTL 1.37e-01 0.146 0.0976 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -195939 sc-eQTL 1.58e-02 -0.149 0.0613 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 303564 sc-eQTL 3.53e-01 -0.103 0.111 0.162 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000162390 ACOT11 477168 eQTL 0.0149 0.073 0.0299 0.0 0.0 0.17
ENSG00000169174 PCSK9 -20123 pQTL 0.000702 -0.123 0.0363 0.0 0.0 0.169
ENSG00000169174 PCSK9 -20123 eQTL 1.67e-08 -0.124 0.0217 0.0658 0.0522 0.17

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000169174 PCSK9 -20123 1.36e-05 1.38e-05 3.01e-06 8.64e-06 3.06e-06 6.95e-06 2.07e-05 2.78e-06 1.49e-05 7.35e-06 1.87e-05 6.94e-06 2.75e-05 5.53e-06 4.71e-06 9.17e-06 8.14e-06 1.33e-05 4.82e-06 4.28e-06 7.95e-06 1.4e-05 1.54e-05 5.74e-06 2.49e-05 5.26e-06 7.69e-06 6.67e-06 1.75e-05 1.93e-05 1.01e-05 1.33e-06 2.04e-06 5.43e-06 6.33e-06 4.46e-06 2.37e-06 2.71e-06 3.64e-06 2.69e-06 1.7e-06 1.85e-05 2.27e-06 3.99e-07 1.95e-06 2.52e-06 2.9e-06 1.36e-06 1.11e-06
ENSG00000198711 \N 782985 2.76e-07 1.34e-07 5.03e-08 1.83e-07 9.87e-08 9.91e-08 1.67e-07 5.66e-08 1.45e-07 6.08e-08 1.63e-07 1.05e-07 1.59e-07 7.37e-08 6.25e-08 7.23e-08 4.24e-08 1.44e-07 6.07e-08 4.21e-08 1.26e-07 1.26e-07 1.44e-07 2.79e-08 1.63e-07 1.22e-07 1.1e-07 9.92e-08 1.22e-07 9.49e-08 1.06e-07 2.93e-08 4.02e-08 8.56e-08 5.99e-08 3.04e-08 5.29e-08 8.63e-08 6.86e-08 4.55e-08 5.03e-08 1.46e-07 5.2e-08 1.52e-08 3.83e-08 1.87e-08 1.21e-07 1.88e-09 4.99e-08