logo

Genes within 1Mb (chr1:55017925:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 216602 sc-eQTL 3.64e-01 0.0916 0.101 0.237 B L1
ENSG00000116133 DHCR24 130730 sc-eQTL 6.96e-01 0.0374 0.0954 0.237 B L1
ENSG00000116205 TCEANC2 964341 sc-eQTL 7.53e-01 0.026 0.0823 0.237 B L1
ENSG00000116209 TMEM59 964421 sc-eQTL 9.48e-01 0.0033 0.0502 0.237 B L1
ENSG00000116221 MRPL37 833884 sc-eQTL 9.70e-01 0.00251 0.0656 0.237 B L1
ENSG00000157216 SSBP3 604446 sc-eQTL 1.28e-01 0.104 0.0683 0.237 B L1
ENSG00000162402 USP24 -197439 sc-eQTL 9.72e-01 0.00202 0.0582 0.237 B L1
ENSG00000215883 CYB5RL 817889 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00891 0.112 0.237 B L1
ENSG00000243725 TTC4 302064 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0121 0.0976 0.237 B L1
ENSG00000006555 TTC22 216602 sc-eQTL 4.01e-01 0.0664 0.0789 0.237 CD4T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 964341 sc-eQTL 4.43e-01 0.0496 0.0646 0.237 CD4T L1
ENSG00000116209 TMEM59 964421 sc-eQTL 4.03e-01 0.0504 0.0601 0.237 CD4T L1
ENSG00000116221 MRPL37 833884 sc-eQTL 7.54e-01 0.0261 0.0832 0.237 CD4T L1
ENSG00000157216 SSBP3 604446 sc-eQTL 3.77e-02 0.143 0.0684 0.237 CD4T L1
ENSG00000162402 USP24 -197439 sc-eQTL 6.25e-01 0.0275 0.0563 0.237 CD4T L1
ENSG00000243725 TTC4 302064 sc-eQTL 1.15e-01 -0.133 0.0842 0.237 CD4T L1
ENSG00000006555 TTC22 216602 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0432 0.068 0.237 CD8T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 964341 sc-eQTL 1.69e-01 0.116 0.0844 0.237 CD8T L1
ENSG00000116209 TMEM59 964421 sc-eQTL 9.23e-01 -0.00571 0.0589 0.237 CD8T L1
ENSG00000116221 MRPL37 833884 sc-eQTL 2.73e-01 0.0887 0.0808 0.237 CD8T L1
ENSG00000157216 SSBP3 604446 sc-eQTL 1.90e-01 0.0762 0.058 0.237 CD8T L1
ENSG00000162402 USP24 -197439 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0187 0.0563 0.237 CD8T L1
ENSG00000243725 TTC4 302064 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0517 0.0976 0.237 CD8T L1
ENSG00000116133 DHCR24 130730 sc-eQTL 9.87e-01 0.00145 0.0916 0.239 DC L1
ENSG00000116205 TCEANC2 964341 sc-eQTL 9.82e-02 -0.169 0.102 0.239 DC L1
ENSG00000116209 TMEM59 964421 sc-eQTL 4.25e-01 0.0644 0.0806 0.239 DC L1
ENSG00000116221 MRPL37 833884 sc-eQTL 2.22e-01 -0.132 0.108 0.239 DC L1
ENSG00000157216 SSBP3 604446 sc-eQTL 4.64e-01 0.0708 0.0965 0.239 DC L1
ENSG00000162390 ACOT11 475668 sc-eQTL 1.20e-01 0.144 0.0924 0.239 DC L1
ENSG00000162402 USP24 -197439 sc-eQTL 1.15e-03 0.18 0.0546 0.239 DC L1
ENSG00000215883 CYB5RL 817889 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0575 0.101 0.239 DC L1
ENSG00000243725 TTC4 302064 sc-eQTL 7.23e-01 0.0387 0.109 0.239 DC L1
ENSG00000116133 DHCR24 130730 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0171 0.0659 0.237 Mono L1
ENSG00000116205 TCEANC2 964341 sc-eQTL 9.31e-02 -0.119 0.0706 0.237 Mono L1
ENSG00000116209 TMEM59 964421 sc-eQTL 6.09e-01 0.0271 0.0528 0.237 Mono L1
ENSG00000116221 MRPL37 833884 sc-eQTL 4.43e-01 0.0679 0.0882 0.237 Mono L1
ENSG00000157216 SSBP3 604446 sc-eQTL 7.16e-01 0.0369 0.101 0.237 Mono L1
ENSG00000162402 USP24 -197439 sc-eQTL 2.84e-01 -0.0646 0.0602 0.237 Mono L1
ENSG00000243725 TTC4 302064 sc-eQTL 5.09e-01 0.0701 0.106 0.237 Mono L1
ENSG00000006555 TTC22 216602 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0862 0.0905 0.236 NK L1
ENSG00000116133 DHCR24 130730 sc-eQTL 2.80e-01 0.099 0.0913 0.236 NK L1
ENSG00000116205 TCEANC2 964341 sc-eQTL 9.66e-01 0.00381 0.0903 0.236 NK L1
ENSG00000116209 TMEM59 964421 sc-eQTL 8.80e-01 0.0107 0.0708 0.236 NK L1
ENSG00000116221 MRPL37 833884 sc-eQTL 5.76e-01 0.0493 0.0879 0.236 NK L1
ENSG00000157216 SSBP3 604446 sc-eQTL 6.00e-01 0.04 0.0763 0.236 NK L1
ENSG00000162398 LEXM 211862 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0357 0.0856 0.236 NK L1
ENSG00000162402 USP24 -197439 sc-eQTL 2.63e-01 0.0581 0.0518 0.236 NK L1
ENSG00000243725 TTC4 302064 sc-eQTL 9.98e-01 0.000206 0.0982 0.236 NK L1
ENSG00000006555 TTC22 216602 sc-eQTL 4.49e-01 0.0612 0.0806 0.237 Other_T L1
ENSG00000116133 DHCR24 130730 sc-eQTL 9.32e-02 0.105 0.0622 0.237 Other_T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 964341 sc-eQTL 8.43e-01 0.0186 0.0937 0.237 Other_T L1
ENSG00000116209 TMEM59 964421 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0579 0.0641 0.237 Other_T L1
ENSG00000116221 MRPL37 833884 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0336 0.0602 0.237 Other_T L1
ENSG00000157216 SSBP3 604446 sc-eQTL 8.75e-01 -0.011 0.0696 0.237 Other_T L1
ENSG00000162402 USP24 -197439 sc-eQTL 8.77e-02 -0.126 0.0736 0.237 Other_T L1
ENSG00000215883 CYB5RL 817889 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0359 0.101 0.237 Other_T L1
ENSG00000243725 TTC4 302064 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0156 0.101 0.237 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 216602 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0266 0.0861 0.227 B_Activated L2
ENSG00000116133 DHCR24 130730 sc-eQTL 5.66e-01 0.0581 0.101 0.227 B_Activated L2
ENSG00000116205 TCEANC2 964341 sc-eQTL 4.34e-01 -0.085 0.108 0.227 B_Activated L2
ENSG00000116209 TMEM59 964421 sc-eQTL 1.60e-01 0.162 0.115 0.227 B_Activated L2
ENSG00000116221 MRPL37 833884 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0456 0.125 0.227 B_Activated L2
ENSG00000157216 SSBP3 604446 sc-eQTL 4.04e-01 0.0941 0.113 0.227 B_Activated L2
ENSG00000162402 USP24 -197439 sc-eQTL 2.11e-02 0.253 0.108 0.227 B_Activated L2
ENSG00000215883 CYB5RL 817889 sc-eQTL 4.97e-01 0.0661 0.0971 0.227 B_Activated L2
ENSG00000243725 TTC4 302064 sc-eQTL 8.63e-01 0.0183 0.105 0.227 B_Activated L2
ENSG00000006555 TTC22 216602 sc-eQTL 4.83e-01 0.0766 0.109 0.236 B_Intermediate L2
ENSG00000116133 DHCR24 130730 sc-eQTL 7.21e-01 0.0362 0.101 0.236 B_Intermediate L2
ENSG00000116205 TCEANC2 964341 sc-eQTL 9.49e-02 0.168 0.1 0.236 B_Intermediate L2
ENSG00000116209 TMEM59 964421 sc-eQTL 2.23e-01 0.105 0.0861 0.236 B_Intermediate L2
ENSG00000116221 MRPL37 833884 sc-eQTL 8.21e-01 -0.023 0.102 0.236 B_Intermediate L2
ENSG00000157216 SSBP3 604446 sc-eQTL 6.31e-01 0.0456 0.0949 0.236 B_Intermediate L2
ENSG00000162402 USP24 -197439 sc-eQTL 7.34e-01 0.0272 0.0799 0.236 B_Intermediate L2
ENSG00000215883 CYB5RL 817889 sc-eQTL 3.63e-01 0.103 0.113 0.236 B_Intermediate L2
ENSG00000243725 TTC4 302064 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0613 0.103 0.236 B_Intermediate L2
ENSG00000006555 TTC22 216602 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0136 0.103 0.239 B_Memory L2
ENSG00000116133 DHCR24 130730 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0432 0.103 0.239 B_Memory L2
ENSG00000116205 TCEANC2 964341 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0138 0.11 0.239 B_Memory L2
ENSG00000116209 TMEM59 964421 sc-eQTL 2.51e-01 0.105 0.0912 0.239 B_Memory L2
ENSG00000116221 MRPL37 833884 sc-eQTL 6.60e-01 0.0408 0.0926 0.239 B_Memory L2
ENSG00000157216 SSBP3 604446 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0166 0.0865 0.239 B_Memory L2
ENSG00000162402 USP24 -197439 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0701 0.0844 0.239 B_Memory L2
ENSG00000215883 CYB5RL 817889 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0545 0.105 0.239 B_Memory L2
ENSG00000243725 TTC4 302064 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0812 0.108 0.239 B_Memory L2
ENSG00000006555 TTC22 216602 sc-eQTL 4.11e-01 0.0881 0.107 0.237 B_Naive1 L2
ENSG00000116133 DHCR24 130730 sc-eQTL 8.00e-01 0.0254 0.1 0.237 B_Naive1 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 964341 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0167 0.0895 0.237 B_Naive1 L2
ENSG00000116209 TMEM59 964421 sc-eQTL 1.93e-01 -0.0847 0.0648 0.237 B_Naive1 L2
ENSG00000116221 MRPL37 833884 sc-eQTL 8.34e-01 0.0201 0.0959 0.237 B_Naive1 L2
ENSG00000157216 SSBP3 604446 sc-eQTL 1.79e-01 0.123 0.091 0.237 B_Naive1 L2
ENSG00000162402 USP24 -197439 sc-eQTL 8.69e-02 -0.123 0.0715 0.237 B_Naive1 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 817889 sc-eQTL 2.87e-01 -0.116 0.108 0.237 B_Naive1 L2
ENSG00000243725 TTC4 302064 sc-eQTL 6.02e-01 0.0512 0.098 0.237 B_Naive1 L2
ENSG00000006555 TTC22 216602 sc-eQTL 2.99e-01 0.112 0.107 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000116133 DHCR24 130730 sc-eQTL 1.16e-01 0.147 0.0933 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 964341 sc-eQTL 8.58e-01 0.0186 0.104 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000116209 TMEM59 964421 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0197 0.0857 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000116221 MRPL37 833884 sc-eQTL 7.98e-01 0.0259 0.101 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000157216 SSBP3 604446 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0315 0.0994 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000162402 USP24 -197439 sc-eQTL 7.67e-01 0.0234 0.0788 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 817889 sc-eQTL 8.58e-01 0.0198 0.111 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000243725 TTC4 302064 sc-eQTL 5.51e-01 0.0689 0.115 0.238 B_Naive2 L2
ENSG00000006555 TTC22 216602 sc-eQTL 8.23e-01 -0.023 0.103 0.239 CD4_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 964341 sc-eQTL 8.59e-02 0.181 0.105 0.239 CD4_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 964421 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0789 0.0961 0.239 CD4_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 833884 sc-eQTL 3.30e-01 0.115 0.118 0.239 CD4_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 604446 sc-eQTL 6.49e-01 0.0332 0.0728 0.239 CD4_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -197439 sc-eQTL 3.78e-01 0.0883 0.0998 0.239 CD4_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 302064 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0783 0.112 0.239 CD4_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 216602 sc-eQTL 8.30e-01 0.0199 0.0926 0.237 CD4_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 964341 sc-eQTL 5.88e-01 0.0382 0.0704 0.237 CD4_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 964421 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0168 0.0685 0.237 CD4_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 833884 sc-eQTL 4.50e-01 0.0668 0.0882 0.237 CD4_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 604446 sc-eQTL 2.22e-01 0.086 0.0702 0.237 CD4_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -197439 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0292 0.0608 0.237 CD4_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 302064 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0841 0.0925 0.237 CD4_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 216602 sc-eQTL 4.28e-01 0.0774 0.0974 0.237 CD4_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 964341 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0493 0.0948 0.237 CD4_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 964421 sc-eQTL 4.86e-01 0.0499 0.0715 0.237 CD4_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 833884 sc-eQTL 1.32e-01 -0.135 0.0896 0.237 CD4_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 604446 sc-eQTL 3.07e-02 0.19 0.0873 0.237 CD4_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -197439 sc-eQTL 5.73e-01 0.0412 0.0731 0.237 CD4_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 302064 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0544 0.105 0.237 CD4_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 216602 sc-eQTL 2.98e-01 -0.116 0.111 0.237 CD4_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 964341 sc-eQTL 5.61e-01 0.0615 0.106 0.237 CD4_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 964421 sc-eQTL 2.40e-01 0.096 0.0816 0.237 CD4_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 833884 sc-eQTL 7.90e-01 0.0281 0.105 0.237 CD4_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 604446 sc-eQTL 8.70e-02 0.154 0.0897 0.237 CD4_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -197439 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0162 0.0822 0.237 CD4_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 302064 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0278 0.109 0.237 CD4_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 216602 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0494 0.0895 0.237 CD8_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 964341 sc-eQTL 4.81e-01 0.0699 0.099 0.237 CD8_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 964421 sc-eQTL 6.28e-01 0.0418 0.0862 0.237 CD8_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 833884 sc-eQTL 8.88e-02 0.173 0.101 0.237 CD8_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 604446 sc-eQTL 8.31e-01 0.0149 0.0698 0.237 CD8_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -197439 sc-eQTL 4.29e-01 0.055 0.0693 0.237 CD8_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 302064 sc-eQTL 7.03e-02 -0.188 0.103 0.237 CD8_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 216602 sc-eQTL 3.28e-02 -0.213 0.0993 0.237 CD8_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 964341 sc-eQTL 3.53e-01 0.0843 0.0906 0.237 CD8_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 964421 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0449 0.0888 0.237 CD8_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 833884 sc-eQTL 7.27e-01 0.0372 0.107 0.237 CD8_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 604446 sc-eQTL 6.23e-01 0.0396 0.0806 0.237 CD8_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -197439 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0459 0.0733 0.237 CD8_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 302064 sc-eQTL 3.73e-01 0.0956 0.107 0.237 CD8_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 216602 sc-eQTL 1.46e-01 0.16 0.109 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 964341 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00866 0.111 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 964421 sc-eQTL 1.43e-01 0.143 0.0969 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 833884 sc-eQTL 8.28e-01 0.0241 0.111 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 604446 sc-eQTL 3.47e-01 0.0901 0.0957 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -197439 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0434 0.0929 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 302064 sc-eQTL 2.94e-01 0.119 0.113 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 216602 sc-eQTL 5.73e-01 0.0589 0.104 0.231 CD8_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 964341 sc-eQTL 1.36e-01 -0.162 0.108 0.231 CD8_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 964421 sc-eQTL 4.81e-02 -0.207 0.104 0.231 CD8_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 833884 sc-eQTL 5.42e-01 0.0651 0.107 0.231 CD8_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 604446 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00237 0.101 0.231 CD8_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -197439 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0483 0.106 0.231 CD8_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 302064 sc-eQTL 9.39e-02 -0.181 0.107 0.231 CD8_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 216602 sc-eQTL 9.33e-01 0.00807 0.0962 0.234 MAIT L2
ENSG00000116133 DHCR24 130730 sc-eQTL 8.94e-01 -0.00946 0.0712 0.234 MAIT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 964341 sc-eQTL 9.92e-01 0.000985 0.1 0.234 MAIT L2
ENSG00000116209 TMEM59 964421 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0312 0.0905 0.234 MAIT L2
ENSG00000116221 MRPL37 833884 sc-eQTL 6.89e-01 0.0441 0.11 0.234 MAIT L2
ENSG00000157216 SSBP3 604446 sc-eQTL 3.51e-01 0.0909 0.0973 0.234 MAIT L2
ENSG00000162402 USP24 -197439 sc-eQTL 1.01e-01 -0.142 0.0861 0.234 MAIT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 817889 sc-eQTL 6.27e-01 0.049 0.101 0.234 MAIT L2
ENSG00000243725 TTC4 302064 sc-eQTL 6.35e-01 0.0476 0.1 0.234 MAIT L2
ENSG00000006555 TTC22 216602 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00897 0.111 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000116133 DHCR24 130730 sc-eQTL 1.07e-01 0.158 0.0973 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000116205 TCEANC2 964341 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0996 0.103 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000116209 TMEM59 964421 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00907 0.101 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000116221 MRPL37 833884 sc-eQTL 5.63e-01 0.0653 0.113 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000157216 SSBP3 604446 sc-eQTL 3.36e-01 0.0818 0.0847 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000162398 LEXM 211862 sc-eQTL 3.84e-01 0.0874 0.1 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000162402 USP24 -197439 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0809 0.0861 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000243725 TTC4 302064 sc-eQTL 7.61e-01 0.0332 0.109 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000006555 TTC22 216602 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0782 0.0917 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000116133 DHCR24 130730 sc-eQTL 5.52e-01 0.057 0.0957 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000116205 TCEANC2 964341 sc-eQTL 8.16e-01 0.0241 0.104 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000116209 TMEM59 964421 sc-eQTL 4.79e-01 0.0544 0.0768 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000116221 MRPL37 833884 sc-eQTL 4.35e-01 0.0782 0.0999 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000157216 SSBP3 604446 sc-eQTL 5.72e-01 0.0463 0.0818 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000162398 LEXM 211862 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0749 0.094 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000162402 USP24 -197439 sc-eQTL 5.87e-01 0.0326 0.0598 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000243725 TTC4 302064 sc-eQTL 2.58e-01 -0.116 0.102 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000006555 TTC22 216602 sc-eQTL 2.16e-01 -0.138 0.111 0.242 NK_HLA L2
ENSG00000116133 DHCR24 130730 sc-eQTL 6.73e-01 0.046 0.109 0.242 NK_HLA L2
ENSG00000116205 TCEANC2 964341 sc-eQTL 8.13e-01 0.0249 0.105 0.242 NK_HLA L2
ENSG00000116209 TMEM59 964421 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0471 0.104 0.242 NK_HLA L2
ENSG00000116221 MRPL37 833884 sc-eQTL 2.80e-01 0.124 0.115 0.242 NK_HLA L2
ENSG00000157216 SSBP3 604446 sc-eQTL 8.76e-01 0.0147 0.0938 0.242 NK_HLA L2
ENSG00000162398 LEXM 211862 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0441 0.106 0.242 NK_HLA L2
ENSG00000162402 USP24 -197439 sc-eQTL 5.24e-02 0.15 0.0769 0.242 NK_HLA L2
ENSG00000243725 TTC4 302064 sc-eQTL 6.64e-01 0.0505 0.116 0.242 NK_HLA L2
ENSG00000006555 TTC22 216602 sc-eQTL 5.31e-01 0.0619 0.0988 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000116133 DHCR24 130730 sc-eQTL 3.18e-01 0.0999 0.0998 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000116205 TCEANC2 964341 sc-eQTL 8.02e-01 0.025 0.0993 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000116209 TMEM59 964421 sc-eQTL 9.64e-01 0.00367 0.0807 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000116221 MRPL37 833884 sc-eQTL 2.16e-01 -0.123 0.0991 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000157216 SSBP3 604446 sc-eQTL 3.11e-01 0.0845 0.0832 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000162398 LEXM 211862 sc-eQTL 7.88e-01 0.028 0.104 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000162402 USP24 -197439 sc-eQTL 7.60e-01 0.0217 0.071 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000243725 TTC4 302064 sc-eQTL 8.31e-01 0.0225 0.105 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000006555 TTC22 216602 sc-eQTL 6.07e-01 0.0707 0.137 0.237 PB L2
ENSG00000116133 DHCR24 130730 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0661 0.122 0.237 PB L2
ENSG00000116205 TCEANC2 964341 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0502 0.148 0.237 PB L2
ENSG00000116209 TMEM59 964421 sc-eQTL 1.12e-01 0.0981 0.0612 0.237 PB L2
ENSG00000116221 MRPL37 833884 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0965 0.112 0.237 PB L2
ENSG00000157216 SSBP3 604446 sc-eQTL 7.39e-01 0.0434 0.13 0.237 PB L2
ENSG00000162402 USP24 -197439 sc-eQTL 9.51e-01 -0.009 0.148 0.237 PB L2
ENSG00000215883 CYB5RL 817889 sc-eQTL 2.80e-01 -0.165 0.152 0.237 PB L2
ENSG00000243725 TTC4 302064 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00461 0.143 0.237 PB L2
ENSG00000006555 TTC22 216602 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0795 0.099 0.239 Pro_T L2
ENSG00000116133 DHCR24 130730 sc-eQTL 8.74e-03 0.219 0.0829 0.239 Pro_T L2
ENSG00000116205 TCEANC2 964341 sc-eQTL 4.98e-01 0.0697 0.103 0.239 Pro_T L2
ENSG00000116209 TMEM59 964421 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0488 0.0713 0.239 Pro_T L2
ENSG00000116221 MRPL37 833884 sc-eQTL 8.95e-02 -0.118 0.0694 0.239 Pro_T L2
ENSG00000157216 SSBP3 604446 sc-eQTL 5.21e-02 -0.152 0.0777 0.239 Pro_T L2
ENSG00000162402 USP24 -197439 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0126 0.0956 0.239 Pro_T L2
ENSG00000215883 CYB5RL 817889 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0616 0.0943 0.239 Pro_T L2
ENSG00000243725 TTC4 302064 sc-eQTL 8.88e-01 0.0149 0.105 0.239 Pro_T L2
ENSG00000006555 TTC22 216602 sc-eQTL 1.61e-01 0.138 0.0977 0.237 Treg L2
ENSG00000116205 TCEANC2 964341 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0281 0.105 0.237 Treg L2
ENSG00000116209 TMEM59 964421 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0504 0.0831 0.237 Treg L2
ENSG00000116221 MRPL37 833884 sc-eQTL 6.94e-01 0.0406 0.103 0.237 Treg L2
ENSG00000157216 SSBP3 604446 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0112 0.0918 0.237 Treg L2
ENSG00000162402 USP24 -197439 sc-eQTL 6.58e-01 0.0388 0.0874 0.237 Treg L2
ENSG00000243725 TTC4 302064 sc-eQTL 3.52e-01 -0.103 0.11 0.237 Treg L2
ENSG00000116133 DHCR24 130730 sc-eQTL 8.73e-01 0.0142 0.0887 0.241 cDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 964341 sc-eQTL 3.48e-01 -0.0981 0.104 0.241 cDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 964421 sc-eQTL 3.21e-01 -0.0881 0.0886 0.241 cDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 833884 sc-eQTL 3.56e-02 -0.238 0.112 0.241 cDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 604446 sc-eQTL 8.24e-01 0.0233 0.105 0.241 cDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 475668 sc-eQTL 1.33e-01 0.146 0.0968 0.241 cDC L2
ENSG00000162402 USP24 -197439 sc-eQTL 1.86e-01 0.144 0.109 0.241 cDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 817889 sc-eQTL 2.24e-01 -0.114 0.0934 0.241 cDC L2
ENSG00000243725 TTC4 302064 sc-eQTL 4.38e-01 0.0869 0.112 0.241 cDC L2
ENSG00000116133 DHCR24 130730 sc-eQTL 4.92e-02 -0.125 0.063 0.237 cMono_IL1B L2
ENSG00000116205 TCEANC2 964341 sc-eQTL 7.12e-02 -0.159 0.0877 0.237 cMono_IL1B L2
ENSG00000116209 TMEM59 964421 sc-eQTL 1.28e-01 0.0814 0.0533 0.237 cMono_IL1B L2
ENSG00000116221 MRPL37 833884 sc-eQTL 7.55e-01 0.0298 0.0955 0.237 cMono_IL1B L2
ENSG00000157216 SSBP3 604446 sc-eQTL 7.34e-01 0.0332 0.0975 0.237 cMono_IL1B L2
ENSG00000162402 USP24 -197439 sc-eQTL 1.04e-01 -0.117 0.0716 0.237 cMono_IL1B L2
ENSG00000243725 TTC4 302064 sc-eQTL 2.51e-01 0.126 0.11 0.237 cMono_IL1B L2
ENSG00000116133 DHCR24 130730 sc-eQTL 2.80e-01 0.0643 0.0595 0.237 cMono_S100A L2
ENSG00000116205 TCEANC2 964341 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0756 0.0908 0.237 cMono_S100A L2
ENSG00000116209 TMEM59 964421 sc-eQTL 4.42e-01 -0.056 0.0727 0.237 cMono_S100A L2
ENSG00000116221 MRPL37 833884 sc-eQTL 9.01e-01 0.0131 0.105 0.237 cMono_S100A L2
ENSG00000157216 SSBP3 604446 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0225 0.109 0.237 cMono_S100A L2
ENSG00000162402 USP24 -197439 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0204 0.0884 0.237 cMono_S100A L2
ENSG00000243725 TTC4 302064 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0591 0.111 0.237 cMono_S100A L2
ENSG00000006555 TTC22 216602 sc-eQTL 1.28e-01 0.154 0.1 0.23 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 130730 sc-eQTL 3.69e-01 0.101 0.112 0.23 gdT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 964341 sc-eQTL 6.71e-01 0.0482 0.113 0.23 gdT L2
ENSG00000116209 TMEM59 964421 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00146 0.115 0.23 gdT L2
ENSG00000116221 MRPL37 833884 sc-eQTL 3.09e-01 0.134 0.131 0.23 gdT L2
ENSG00000157216 SSBP3 604446 sc-eQTL 6.66e-01 0.0349 0.0806 0.23 gdT L2
ENSG00000162402 USP24 -197439 sc-eQTL 8.39e-01 0.022 0.108 0.23 gdT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 817889 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0335 0.113 0.23 gdT L2
ENSG00000243725 TTC4 302064 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00372 0.127 0.23 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 130730 sc-eQTL 8.46e-01 0.0157 0.0807 0.242 intMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 964341 sc-eQTL 6.48e-02 0.185 0.0996 0.242 intMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 964421 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0141 0.0738 0.242 intMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 833884 sc-eQTL 3.06e-01 0.116 0.113 0.242 intMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 604446 sc-eQTL 5.06e-01 0.0766 0.115 0.242 intMono L2
ENSG00000162402 USP24 -197439 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00577 0.103 0.242 intMono L2
ENSG00000243725 TTC4 302064 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0583 0.109 0.242 intMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 130730 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0295 0.0804 0.238 ncMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 964341 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0891 0.1 0.238 ncMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 964421 sc-eQTL 7.95e-01 0.021 0.0805 0.238 ncMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 833884 sc-eQTL 8.80e-02 0.177 0.103 0.238 ncMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 604446 sc-eQTL 2.76e-01 -0.124 0.113 0.238 ncMono L2
ENSG00000162402 USP24 -197439 sc-eQTL 2.08e-01 0.114 0.0904 0.238 ncMono L2
ENSG00000243725 TTC4 302064 sc-eQTL 9.43e-01 0.0077 0.107 0.238 ncMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 130730 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0392 0.0935 0.246 pDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 964341 sc-eQTL 4.13e-02 -0.228 0.111 0.246 pDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 964421 sc-eQTL 6.47e-02 0.165 0.0886 0.246 pDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 833884 sc-eQTL 5.44e-01 0.0723 0.119 0.246 pDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 604446 sc-eQTL 5.07e-01 0.0702 0.106 0.246 pDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 475668 sc-eQTL 4.37e-01 0.0346 0.0443 0.246 pDC L2
ENSG00000162402 USP24 -197439 sc-eQTL 4.64e-02 0.149 0.0741 0.246 pDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 817889 sc-eQTL 8.89e-01 0.0144 0.103 0.246 pDC L2
ENSG00000243725 TTC4 302064 sc-eQTL 6.19e-01 -0.059 0.118 0.246 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 216602 sc-eQTL 4.62e-01 0.0774 0.105 0.237 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 130730 sc-eQTL 9.03e-01 0.0128 0.105 0.237 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 964341 sc-eQTL 2.31e-01 0.122 0.102 0.237 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 964421 sc-eQTL 1.34e-01 0.119 0.0789 0.237 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 833884 sc-eQTL 8.91e-01 -0.013 0.0949 0.237 B_Memory LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 604446 sc-eQTL 3.18e-01 0.0825 0.0824 0.237 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -197439 sc-eQTL 6.50e-01 0.0342 0.0753 0.237 B_Memory LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 817889 sc-eQTL 8.79e-01 0.0176 0.116 0.237 B_Memory LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 302064 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0868 0.104 0.237 B_Memory LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 216602 sc-eQTL 1.02e-01 0.176 0.107 0.237 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 130730 sc-eQTL 3.00e-01 0.101 0.0969 0.237 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 964341 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0304 0.0877 0.237 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 964421 sc-eQTL 2.17e-01 -0.077 0.0621 0.237 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 833884 sc-eQTL 9.38e-01 0.00693 0.0897 0.237 B_Naive LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 604446 sc-eQTL 1.68e-01 0.111 0.0799 0.237 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -197439 sc-eQTL 2.37e-01 -0.0813 0.0686 0.237 B_Naive LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 817889 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0691 0.109 0.237 B_Naive LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 302064 sc-eQTL 4.35e-01 0.08 0.102 0.237 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 130730 sc-eQTL 3.29e-01 -0.0602 0.0615 0.237 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 964341 sc-eQTL 2.66e-02 -0.17 0.0763 0.237 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 964421 sc-eQTL 5.33e-01 0.0332 0.0532 0.237 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 833884 sc-eQTL 6.72e-01 0.04 0.0942 0.237 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 604446 sc-eQTL 7.77e-01 0.0279 0.0986 0.237 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -197439 sc-eQTL 2.02e-01 -0.0859 0.0672 0.237 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 302064 sc-eQTL 4.26e-01 0.0889 0.112 0.237 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 130730 sc-eQTL 8.20e-01 0.0174 0.0765 0.235 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 964341 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0116 0.1 0.235 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 964421 sc-eQTL 6.46e-01 0.0343 0.0747 0.235 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 833884 sc-eQTL 4.32e-02 0.206 0.101 0.235 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 604446 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0295 0.109 0.235 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -197439 sc-eQTL 3.04e-01 0.0884 0.0858 0.235 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 302064 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0458 0.108 0.235 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 216602 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0628 0.0889 0.237 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 130730 sc-eQTL 4.61e-01 0.0686 0.0929 0.237 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 964341 sc-eQTL 9.20e-01 -0.00921 0.0912 0.237 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 964421 sc-eQTL 6.44e-01 0.0327 0.0705 0.237 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 833884 sc-eQTL 7.60e-01 0.0289 0.0945 0.237 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 604446 sc-eQTL 4.77e-01 0.0551 0.0775 0.237 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162398 LEXM 211862 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0347 0.0874 0.237 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -197439 sc-eQTL 2.80e-01 0.0599 0.0553 0.237 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 302064 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0566 0.0986 0.237 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000116133 \N 130730 5.07e-06 4.87e-06 3.08e-07 2.59e-06 4.75e-07 1.03e-06 3e-06 6.39e-07 2.33e-06 1.09e-06 3.21e-06 1.66e-06 4.08e-06 1.38e-06 9.89e-07 1.7e-06 1.59e-06 2.12e-06 9.64e-07 1.36e-06 7.78e-07 3.14e-06 3.25e-06 1.01e-06 4.5e-06 1.08e-06 1.75e-06 1.4e-06 3.41e-06 2.23e-06 1.92e-06 4.17e-07 4.19e-07 1.21e-06 1.72e-06 5.58e-07 8.07e-07 3.25e-07 9.49e-07 3.97e-07 3.02e-07 4.1e-06 5.91e-07 1.75e-07 3.87e-07 3.67e-07 5.48e-07 6.05e-08 1.47e-07
ENSG00000162402 \N -197439 2.08e-06 1.81e-06 3.48e-07 1.27e-06 2.05e-07 6.45e-07 1.43e-06 3.43e-07 1.49e-06 4.48e-07 2.03e-06 6.45e-07 2.29e-06 2.81e-07 4.96e-07 8.25e-07 1.03e-06 8.82e-07 6.68e-07 6.46e-07 3.87e-07 1.63e-06 8.95e-07 6.37e-07 2.38e-06 4.17e-07 9.89e-07 6.89e-07 1.47e-06 1.29e-06 7.58e-07 2.63e-07 2.33e-07 6.9e-07 5.64e-07 3e-07 7.46e-07 1.37e-07 3.18e-07 2.97e-07 2.8e-07 1.66e-06 9.6e-08 4.13e-08 1.81e-07 1.11e-07 2.41e-07 3.09e-08 5.13e-08