Genes within 1Mb (chr1:55016159:G:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 214836 sc-eQTL 4.51e-02 -0.247 0.123 0.122 B L1
ENSG00000116133 DHCR24 128964 sc-eQTL 4.18e-01 -0.095 0.117 0.122 B L1
ENSG00000116205 TCEANC2 962575 sc-eQTL 6.12e-01 0.0514 0.101 0.122 B L1
ENSG00000116209 TMEM59 962655 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00266 0.0616 0.122 B L1
ENSG00000116221 MRPL37 832118 sc-eQTL 3.45e-01 0.0761 0.0804 0.122 B L1
ENSG00000157216 SSBP3 602680 sc-eQTL 1.06e-04 -0.322 0.0814 0.122 B L1
ENSG00000162402 USP24 -199205 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0324 0.0715 0.122 B L1
ENSG00000215883 CYB5RL 816123 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00262 0.138 0.122 B L1
ENSG00000243725 TTC4 300298 sc-eQTL 6.06e-01 0.0618 0.12 0.122 B L1
ENSG00000006555 TTC22 214836 sc-eQTL 4.94e-01 -0.066 0.0963 0.122 CD4T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 962575 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0278 0.0788 0.122 CD4T L1
ENSG00000116209 TMEM59 962655 sc-eQTL 3.51e-01 -0.0685 0.0733 0.122 CD4T L1
ENSG00000116221 MRPL37 832118 sc-eQTL 5.45e-01 0.0615 0.101 0.122 CD4T L1
ENSG00000157216 SSBP3 602680 sc-eQTL 3.30e-01 -0.0822 0.0841 0.122 CD4T L1
ENSG00000162402 USP24 -199205 sc-eQTL 2.14e-01 -0.0852 0.0684 0.122 CD4T L1
ENSG00000243725 TTC4 300298 sc-eQTL 1.47e-01 -0.149 0.103 0.122 CD4T L1
ENSG00000006555 TTC22 214836 sc-eQTL 5.99e-01 0.0435 0.0825 0.122 CD8T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 962575 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0969 0.103 0.122 CD8T L1
ENSG00000116209 TMEM59 962655 sc-eQTL 3.02e-01 -0.0736 0.0712 0.122 CD8T L1
ENSG00000116221 MRPL37 832118 sc-eQTL 4.16e-01 0.08 0.0981 0.122 CD8T L1
ENSG00000157216 SSBP3 602680 sc-eQTL 1.82e-01 -0.0942 0.0703 0.122 CD8T L1
ENSG00000162402 USP24 -199205 sc-eQTL 2.60e-01 -0.077 0.0681 0.122 CD8T L1
ENSG00000243725 TTC4 300298 sc-eQTL 6.92e-01 0.0469 0.118 0.122 CD8T L1
ENSG00000116133 DHCR24 128964 sc-eQTL 8.51e-01 0.0217 0.116 0.119 DC L1
ENSG00000116205 TCEANC2 962575 sc-eQTL 3.44e-01 -0.123 0.13 0.119 DC L1
ENSG00000116209 TMEM59 962655 sc-eQTL 2.60e-01 0.115 0.102 0.119 DC L1
ENSG00000116221 MRPL37 832118 sc-eQTL 2.89e-01 0.145 0.137 0.119 DC L1
ENSG00000157216 SSBP3 602680 sc-eQTL 8.64e-02 -0.209 0.121 0.119 DC L1
ENSG00000162390 ACOT11 473902 sc-eQTL 5.03e-01 0.0789 0.118 0.119 DC L1
ENSG00000162402 USP24 -199205 sc-eQTL 3.10e-01 -0.0721 0.0708 0.119 DC L1
ENSG00000215883 CYB5RL 816123 sc-eQTL 5.11e-01 0.0843 0.128 0.119 DC L1
ENSG00000243725 TTC4 300298 sc-eQTL 3.12e-02 0.296 0.136 0.119 DC L1
ENSG00000116133 DHCR24 128964 sc-eQTL 6.61e-01 0.0366 0.0833 0.122 Mono L1
ENSG00000116205 TCEANC2 962575 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0206 0.0899 0.122 Mono L1
ENSG00000116209 TMEM59 962655 sc-eQTL 7.51e-02 0.119 0.0663 0.122 Mono L1
ENSG00000116221 MRPL37 832118 sc-eQTL 8.70e-01 0.0183 0.112 0.122 Mono L1
ENSG00000157216 SSBP3 602680 sc-eQTL 6.54e-01 0.0574 0.128 0.122 Mono L1
ENSG00000162402 USP24 -199205 sc-eQTL 4.64e-02 -0.151 0.0756 0.122 Mono L1
ENSG00000243725 TTC4 300298 sc-eQTL 9.29e-01 -0.012 0.134 0.122 Mono L1
ENSG00000006555 TTC22 214836 sc-eQTL 1.28e-01 0.168 0.11 0.122 NK L1
ENSG00000116133 DHCR24 128964 sc-eQTL 1.25e-01 -0.171 0.111 0.122 NK L1
ENSG00000116205 TCEANC2 962575 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0952 0.11 0.122 NK L1
ENSG00000116209 TMEM59 962655 sc-eQTL 3.27e-01 -0.0845 0.0861 0.122 NK L1
ENSG00000116221 MRPL37 832118 sc-eQTL 9.90e-01 0.00133 0.107 0.122 NK L1
ENSG00000157216 SSBP3 602680 sc-eQTL 2.84e-01 0.0996 0.0927 0.122 NK L1
ENSG00000162398 LEXM 210096 sc-eQTL 5.92e-01 0.056 0.104 0.122 NK L1
ENSG00000162402 USP24 -199205 sc-eQTL 7.64e-02 -0.112 0.0628 0.122 NK L1
ENSG00000243725 TTC4 300298 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0615 0.12 0.122 NK L1
ENSG00000006555 TTC22 214836 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0185 0.0995 0.122 Other_T L1
ENSG00000116133 DHCR24 128964 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0688 0.0771 0.122 Other_T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 962575 sc-eQTL 6.20e-01 0.0574 0.116 0.122 Other_T L1
ENSG00000116209 TMEM59 962655 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0608 0.0792 0.122 Other_T L1
ENSG00000116221 MRPL37 832118 sc-eQTL 4.13e-02 0.151 0.0736 0.122 Other_T L1
ENSG00000157216 SSBP3 602680 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0739 0.0858 0.122 Other_T L1
ENSG00000162402 USP24 -199205 sc-eQTL 7.20e-01 0.0329 0.0915 0.122 Other_T L1
ENSG00000215883 CYB5RL 816123 sc-eQTL 2.65e-01 0.139 0.125 0.122 Other_T L1
ENSG00000243725 TTC4 300298 sc-eQTL 9.79e-02 -0.206 0.124 0.122 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 214836 sc-eQTL 5.98e-02 0.189 0.0995 0.125 B_Activated L2
ENSG00000116133 DHCR24 128964 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0728 0.118 0.125 B_Activated L2
ENSG00000116205 TCEANC2 962575 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0346 0.127 0.125 B_Activated L2
ENSG00000116209 TMEM59 962655 sc-eQTL 3.93e-01 -0.115 0.134 0.125 B_Activated L2
ENSG00000116221 MRPL37 832118 sc-eQTL 3.19e-01 -0.145 0.145 0.125 B_Activated L2
ENSG00000157216 SSBP3 602680 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0747 0.132 0.125 B_Activated L2
ENSG00000162402 USP24 -199205 sc-eQTL 5.50e-01 0.077 0.128 0.125 B_Activated L2
ENSG00000215883 CYB5RL 816123 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0325 0.113 0.125 B_Activated L2
ENSG00000243725 TTC4 300298 sc-eQTL 6.66e-01 0.0532 0.123 0.125 B_Activated L2
ENSG00000006555 TTC22 214836 sc-eQTL 4.34e-01 0.103 0.131 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000116133 DHCR24 128964 sc-eQTL 9.36e-01 0.00974 0.122 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000116205 TCEANC2 962575 sc-eQTL 9.62e-01 0.00574 0.122 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000116209 TMEM59 962655 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0311 0.104 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000116221 MRPL37 832118 sc-eQTL 3.98e-01 0.104 0.122 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000157216 SSBP3 602680 sc-eQTL 5.05e-03 -0.318 0.112 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000162402 USP24 -199205 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0674 0.0963 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000215883 CYB5RL 816123 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0921 0.136 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000243725 TTC4 300298 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0196 0.124 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000006555 TTC22 214836 sc-eQTL 2.25e-02 -0.286 0.124 0.123 B_Memory L2
ENSG00000116133 DHCR24 128964 sc-eQTL 3.96e-01 -0.106 0.125 0.123 B_Memory L2
ENSG00000116205 TCEANC2 962575 sc-eQTL 9.85e-01 0.00256 0.134 0.123 B_Memory L2
ENSG00000116209 TMEM59 962655 sc-eQTL 3.48e-01 -0.105 0.111 0.123 B_Memory L2
ENSG00000116221 MRPL37 832118 sc-eQTL 4.63e-02 0.224 0.112 0.123 B_Memory L2
ENSG00000157216 SSBP3 602680 sc-eQTL 1.44e-01 -0.154 0.105 0.123 B_Memory L2
ENSG00000162402 USP24 -199205 sc-eQTL 4.39e-01 0.0798 0.103 0.123 B_Memory L2
ENSG00000215883 CYB5RL 816123 sc-eQTL 4.72e-03 -0.357 0.125 0.123 B_Memory L2
ENSG00000243725 TTC4 300298 sc-eQTL 3.58e-01 0.121 0.132 0.123 B_Memory L2
ENSG00000006555 TTC22 214836 sc-eQTL 5.61e-02 -0.248 0.129 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000116133 DHCR24 128964 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0174 0.122 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 962575 sc-eQTL 7.12e-01 0.0404 0.109 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000116209 TMEM59 962655 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0334 0.0792 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000116221 MRPL37 832118 sc-eQTL 9.03e-01 0.0143 0.117 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000157216 SSBP3 602680 sc-eQTL 2.38e-02 -0.25 0.11 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000162402 USP24 -199205 sc-eQTL 5.48e-01 0.0527 0.0876 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 816123 sc-eQTL 4.19e-02 0.268 0.131 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000243725 TTC4 300298 sc-eQTL 7.93e-01 0.0313 0.119 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000006555 TTC22 214836 sc-eQTL 2.68e-01 -0.146 0.131 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000116133 DHCR24 128964 sc-eQTL 3.02e-01 -0.118 0.114 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 962575 sc-eQTL 2.85e-01 0.136 0.127 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000116209 TMEM59 962655 sc-eQTL 5.56e-02 0.2 0.104 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000116221 MRPL37 832118 sc-eQTL 5.26e-01 0.0782 0.123 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000157216 SSBP3 602680 sc-eQTL 4.74e-01 -0.087 0.121 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000162402 USP24 -199205 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0916 0.0961 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 816123 sc-eQTL 6.22e-01 -0.067 0.135 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000243725 TTC4 300298 sc-eQTL 7.88e-01 0.038 0.141 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000006555 TTC22 214836 sc-eQTL 5.04e-01 0.0814 0.122 0.123 CD4_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 962575 sc-eQTL 6.77e-01 0.0523 0.125 0.123 CD4_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 962655 sc-eQTL 2.14e-01 0.141 0.114 0.123 CD4_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 832118 sc-eQTL 7.03e-02 0.253 0.139 0.123 CD4_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 602680 sc-eQTL 1.73e-01 -0.117 0.0858 0.123 CD4_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -199205 sc-eQTL 7.49e-02 -0.21 0.117 0.123 CD4_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 300298 sc-eQTL 5.90e-01 0.0715 0.132 0.123 CD4_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 214836 sc-eQTL 6.13e-01 0.0572 0.113 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 962575 sc-eQTL 5.01e-01 -0.058 0.086 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 962655 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0475 0.0837 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 832118 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00873 0.108 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 602680 sc-eQTL 2.02e-01 0.11 0.0859 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -199205 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0178 0.0744 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 300298 sc-eQTL 1.17e-01 -0.177 0.113 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 214836 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0574 0.118 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 962575 sc-eQTL 9.77e-01 0.00336 0.115 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 962655 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0261 0.0869 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 832118 sc-eQTL 3.92e-01 0.0937 0.109 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 602680 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0841 0.107 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -199205 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0659 0.0887 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 300298 sc-eQTL 1.73e-01 -0.174 0.127 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 214836 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0957 0.134 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 962575 sc-eQTL 1.57e-01 -0.18 0.127 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 962655 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0106 0.0987 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 832118 sc-eQTL 3.47e-01 0.119 0.127 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 602680 sc-eQTL 2.75e-01 -0.119 0.109 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -199205 sc-eQTL 1.97e-01 -0.128 0.0987 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 300298 sc-eQTL 5.27e-01 0.083 0.131 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 214836 sc-eQTL 8.12e-01 0.0257 0.108 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 962575 sc-eQTL 3.28e-01 -0.117 0.119 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 962655 sc-eQTL 4.53e-01 -0.078 0.104 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 832118 sc-eQTL 3.31e-01 0.12 0.123 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 602680 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0808 0.0839 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -199205 sc-eQTL 1.06e-01 -0.135 0.0831 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 300298 sc-eQTL 9.24e-01 0.012 0.125 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 214836 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0549 0.121 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 962575 sc-eQTL 2.23e-01 -0.133 0.109 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 962655 sc-eQTL 1.52e-01 -0.153 0.106 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 832118 sc-eQTL 5.51e-01 0.0765 0.128 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 602680 sc-eQTL 3.28e-01 0.0949 0.0967 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -199205 sc-eQTL 4.61e-01 0.0651 0.088 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 300298 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0183 0.129 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 214836 sc-eQTL 3.45e-01 0.123 0.13 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 962575 sc-eQTL 4.65e-01 0.0958 0.131 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 962655 sc-eQTL 4.71e-02 0.228 0.114 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 832118 sc-eQTL 9.27e-01 0.0121 0.131 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 602680 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0942 0.113 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -199205 sc-eQTL 6.70e-01 0.0469 0.11 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 300298 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0345 0.134 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 214836 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0922 0.126 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 962575 sc-eQTL 3.82e-01 0.115 0.131 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 962655 sc-eQTL 8.54e-01 0.0234 0.127 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 832118 sc-eQTL 4.28e-01 0.102 0.129 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 602680 sc-eQTL 9.25e-01 0.0115 0.122 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -199205 sc-eQTL 8.03e-01 0.0321 0.128 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 300298 sc-eQTL 2.17e-01 0.161 0.13 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 214836 sc-eQTL 2.68e-01 0.128 0.115 0.123 MAIT L2
ENSG00000116133 DHCR24 128964 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0299 0.0856 0.123 MAIT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 962575 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0209 0.121 0.123 MAIT L2
ENSG00000116209 TMEM59 962655 sc-eQTL 7.34e-01 0.037 0.109 0.123 MAIT L2
ENSG00000116221 MRPL37 832118 sc-eQTL 1.61e-01 0.186 0.132 0.123 MAIT L2
ENSG00000157216 SSBP3 602680 sc-eQTL 4.29e-02 -0.237 0.116 0.123 MAIT L2
ENSG00000162402 USP24 -199205 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0104 0.104 0.123 MAIT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 816123 sc-eQTL 6.39e-01 0.0568 0.121 0.123 MAIT L2
ENSG00000243725 TTC4 300298 sc-eQTL 3.65e-01 -0.109 0.12 0.123 MAIT L2
ENSG00000006555 TTC22 214836 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00167 0.134 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000116133 DHCR24 128964 sc-eQTL 5.14e-01 0.0773 0.118 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000116205 TCEANC2 962575 sc-eQTL 6.05e-01 0.0648 0.125 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000116209 TMEM59 962655 sc-eQTL 8.30e-01 0.0263 0.122 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000116221 MRPL37 832118 sc-eQTL 9.05e-03 0.353 0.134 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000157216 SSBP3 602680 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0633 0.103 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000162398 LEXM 210096 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0888 0.121 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000162402 USP24 -199205 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0869 0.104 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000243725 TTC4 300298 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0209 0.132 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000006555 TTC22 214836 sc-eQTL 1.34e-01 0.168 0.111 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000116133 DHCR24 128964 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0712 0.117 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000116205 TCEANC2 962575 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0872 0.126 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000116209 TMEM59 962655 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0785 0.0937 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000116221 MRPL37 832118 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0435 0.122 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000157216 SSBP3 602680 sc-eQTL 3.13e-01 0.101 0.0997 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000162398 LEXM 210096 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00259 0.115 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000162402 USP24 -199205 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0506 0.0729 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000243725 TTC4 300298 sc-eQTL 9.07e-02 -0.211 0.124 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000006555 TTC22 214836 sc-eQTL 3.68e-02 0.288 0.137 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000116133 DHCR24 128964 sc-eQTL 3.86e-01 -0.117 0.135 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000116205 TCEANC2 962575 sc-eQTL 2.98e-01 0.136 0.13 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000116209 TMEM59 962655 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0145 0.129 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000116221 MRPL37 832118 sc-eQTL 6.32e-01 0.0684 0.143 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000157216 SSBP3 602680 sc-eQTL 5.71e-01 0.066 0.116 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000162398 LEXM 210096 sc-eQTL 5.41e-01 0.0804 0.131 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000162402 USP24 -199205 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0396 0.0963 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000243725 TTC4 300298 sc-eQTL 5.70e-01 0.0819 0.144 0.112 NK_HLA L2
ENSG00000006555 TTC22 214836 sc-eQTL 2.73e-01 0.129 0.118 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000116133 DHCR24 128964 sc-eQTL 5.88e-02 -0.225 0.118 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000116205 TCEANC2 962575 sc-eQTL 5.77e-02 -0.224 0.118 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000116209 TMEM59 962655 sc-eQTL 8.79e-01 0.0147 0.0964 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000116221 MRPL37 832118 sc-eQTL 5.55e-01 0.0701 0.119 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000157216 SSBP3 602680 sc-eQTL 1.26e-02 0.247 0.0982 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000162398 LEXM 210096 sc-eQTL 5.69e-01 0.0709 0.124 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000162402 USP24 -199205 sc-eQTL 8.40e-03 -0.222 0.0835 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000243725 TTC4 300298 sc-eQTL 6.04e-01 0.0654 0.126 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000006555 TTC22 214836 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0975 0.145 0.122 PB L2
ENSG00000116133 DHCR24 128964 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0758 0.129 0.122 PB L2
ENSG00000116205 TCEANC2 962575 sc-eQTL 1.57e-01 -0.221 0.155 0.122 PB L2
ENSG00000116209 TMEM59 962655 sc-eQTL 7.46e-01 0.0212 0.0655 0.122 PB L2
ENSG00000116221 MRPL37 832118 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0647 0.119 0.122 PB L2
ENSG00000157216 SSBP3 602680 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0732 0.137 0.122 PB L2
ENSG00000162402 USP24 -199205 sc-eQTL 8.76e-01 0.0244 0.156 0.122 PB L2
ENSG00000215883 CYB5RL 816123 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0186 0.162 0.122 PB L2
ENSG00000243725 TTC4 300298 sc-eQTL 1.73e-01 0.206 0.15 0.122 PB L2
ENSG00000006555 TTC22 214836 sc-eQTL 4.25e-01 -0.098 0.123 0.122 Pro_T L2
ENSG00000116133 DHCR24 128964 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0645 0.104 0.122 Pro_T L2
ENSG00000116205 TCEANC2 962575 sc-eQTL 4.80e-01 0.09 0.127 0.122 Pro_T L2
ENSG00000116209 TMEM59 962655 sc-eQTL 3.13e-01 -0.0892 0.0882 0.122 Pro_T L2
ENSG00000116221 MRPL37 832118 sc-eQTL 7.29e-02 0.155 0.0859 0.122 Pro_T L2
ENSG00000157216 SSBP3 602680 sc-eQTL 6.51e-01 0.0439 0.0971 0.122 Pro_T L2
ENSG00000162402 USP24 -199205 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0714 0.118 0.122 Pro_T L2
ENSG00000215883 CYB5RL 816123 sc-eQTL 3.98e-01 0.0988 0.117 0.122 Pro_T L2
ENSG00000243725 TTC4 300298 sc-eQTL 4.00e-01 -0.109 0.13 0.122 Pro_T L2
ENSG00000006555 TTC22 214836 sc-eQTL 8.92e-01 0.0162 0.119 0.122 Treg L2
ENSG00000116205 TCEANC2 962575 sc-eQTL 1.69e-01 0.176 0.127 0.122 Treg L2
ENSG00000116209 TMEM59 962655 sc-eQTL 7.31e-01 0.0348 0.101 0.122 Treg L2
ENSG00000116221 MRPL37 832118 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0608 0.125 0.122 Treg L2
ENSG00000157216 SSBP3 602680 sc-eQTL 1.55e-01 -0.159 0.111 0.122 Treg L2
ENSG00000162402 USP24 -199205 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0303 0.106 0.122 Treg L2
ENSG00000243725 TTC4 300298 sc-eQTL 6.48e-01 0.0613 0.134 0.122 Treg L2
ENSG00000116133 DHCR24 128964 sc-eQTL 8.18e-01 0.026 0.113 0.117 cDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 962575 sc-eQTL 2.94e-02 -0.289 0.132 0.117 cDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 962655 sc-eQTL 5.31e-01 0.0711 0.113 0.117 cDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 832118 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00533 0.145 0.117 cDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 602680 sc-eQTL 3.17e-01 -0.134 0.133 0.117 cDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 473902 sc-eQTL 4.78e-01 0.0882 0.124 0.117 cDC L2
ENSG00000162402 USP24 -199205 sc-eQTL 7.89e-02 -0.244 0.138 0.117 cDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 816123 sc-eQTL 5.61e-01 0.0696 0.12 0.117 cDC L2
ENSG00000243725 TTC4 300298 sc-eQTL 6.49e-02 0.263 0.142 0.117 cDC L2
ENSG00000116133 DHCR24 128964 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00124 0.0794 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000116205 TCEANC2 962575 sc-eQTL 3.98e-01 0.0932 0.11 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000116209 TMEM59 962655 sc-eQTL 5.24e-01 0.0427 0.0669 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000116221 MRPL37 832118 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00459 0.119 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000157216 SSBP3 602680 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0327 0.122 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000162402 USP24 -199205 sc-eQTL 3.61e-01 -0.0822 0.0897 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000243725 TTC4 300298 sc-eQTL 5.84e-01 0.0754 0.137 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000116133 DHCR24 128964 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0195 0.0746 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000116205 TCEANC2 962575 sc-eQTL 2.65e-01 -0.127 0.114 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000116209 TMEM59 962655 sc-eQTL 7.43e-02 0.162 0.0905 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000116221 MRPL37 832118 sc-eQTL 4.90e-01 -0.091 0.132 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000157216 SSBP3 602680 sc-eQTL 8.78e-01 0.021 0.137 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000162402 USP24 -199205 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0605 0.111 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000243725 TTC4 300298 sc-eQTL 6.26e-01 0.0675 0.139 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000006555 TTC22 214836 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0962 0.134 0.124 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 128964 sc-eQTL 3.02e-01 -0.154 0.149 0.124 gdT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 962575 sc-eQTL 5.57e-01 0.0883 0.15 0.124 gdT L2
ENSG00000116209 TMEM59 962655 sc-eQTL 8.13e-01 0.036 0.152 0.124 gdT L2
ENSG00000116221 MRPL37 832118 sc-eQTL 2.78e-01 0.189 0.174 0.124 gdT L2
ENSG00000157216 SSBP3 602680 sc-eQTL 1.77e-01 0.144 0.106 0.124 gdT L2
ENSG00000162402 USP24 -199205 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0646 0.144 0.124 gdT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 816123 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000768 0.149 0.124 gdT L2
ENSG00000243725 TTC4 300298 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0941 0.168 0.124 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 128964 sc-eQTL 6.90e-01 -0.04 0.1 0.118 intMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 962575 sc-eQTL 6.02e-01 0.0654 0.125 0.118 intMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 962655 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0506 0.0918 0.118 intMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 832118 sc-eQTL 7.76e-01 0.04 0.141 0.118 intMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 602680 sc-eQTL 3.64e-01 0.13 0.143 0.118 intMono L2
ENSG00000162402 USP24 -199205 sc-eQTL 7.47e-01 0.0414 0.128 0.118 intMono L2
ENSG00000243725 TTC4 300298 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0131 0.136 0.118 intMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 128964 sc-eQTL 5.03e-01 0.0679 0.101 0.113 ncMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 962575 sc-eQTL 2.89e-01 0.134 0.126 0.113 ncMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 962655 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00421 0.101 0.113 ncMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 832118 sc-eQTL 9.97e-01 0.000555 0.131 0.113 ncMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 602680 sc-eQTL 8.37e-01 0.0295 0.143 0.113 ncMono L2
ENSG00000162402 USP24 -199205 sc-eQTL 3.06e-01 -0.117 0.114 0.113 ncMono L2
ENSG00000243725 TTC4 300298 sc-eQTL 8.59e-01 -0.024 0.135 0.113 ncMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 128964 sc-eQTL 2.82e-01 0.128 0.118 0.124 pDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 962575 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0149 0.143 0.124 pDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 962655 sc-eQTL 9.81e-01 0.00277 0.114 0.124 pDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 832118 sc-eQTL 6.34e-02 0.28 0.15 0.124 pDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 602680 sc-eQTL 3.47e-03 -0.388 0.131 0.124 pDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 473902 sc-eQTL 3.35e-01 -0.0545 0.0563 0.124 pDC L2
ENSG00000162402 USP24 -199205 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0814 0.0952 0.124 pDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 816123 sc-eQTL 7.33e-01 0.0445 0.13 0.124 pDC L2
ENSG00000243725 TTC4 300298 sc-eQTL 5.36e-01 0.0933 0.15 0.124 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 214836 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0745 0.126 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 128964 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0771 0.127 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 962575 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0574 0.123 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 962655 sc-eQTL 2.16e-01 -0.118 0.0952 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 832118 sc-eQTL 7.56e-02 0.203 0.114 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 602680 sc-eQTL 3.39e-03 -0.289 0.0975 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -199205 sc-eQTL 7.67e-01 0.0269 0.0907 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 816123 sc-eQTL 3.47e-02 -0.293 0.138 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 300298 sc-eQTL 4.16e-01 0.102 0.125 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 214836 sc-eQTL 1.67e-02 -0.316 0.131 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 128964 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0915 0.119 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 962575 sc-eQTL 4.00e-01 0.0909 0.108 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 962655 sc-eQTL 4.31e-01 0.0605 0.0766 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 832118 sc-eQTL 6.04e-01 0.0573 0.11 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 602680 sc-eQTL 4.89e-02 -0.194 0.0978 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -199205 sc-eQTL 7.44e-01 0.0277 0.0847 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 816123 sc-eQTL 1.94e-01 0.174 0.134 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 300298 sc-eQTL 9.18e-01 0.013 0.126 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 128964 sc-eQTL 9.94e-01 -0.00057 0.077 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 962575 sc-eQTL 9.93e-01 0.000881 0.0964 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 962655 sc-eQTL 1.24e-01 0.102 0.0661 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 832118 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0255 0.118 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 602680 sc-eQTL 8.65e-01 0.0209 0.123 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -199205 sc-eQTL 2.35e-01 -0.1 0.0839 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 300298 sc-eQTL 4.06e-01 0.116 0.139 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 128964 sc-eQTL 5.38e-01 0.0595 0.0966 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 962575 sc-eQTL 1.68e-01 0.175 0.126 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 962655 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0109 0.0944 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 832118 sc-eQTL 4.31e-01 0.102 0.129 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 602680 sc-eQTL 4.39e-01 0.107 0.138 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -199205 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0796 0.109 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 300298 sc-eQTL 9.24e-01 0.013 0.136 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 214836 sc-eQTL 4.24e-02 0.22 0.108 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 128964 sc-eQTL 1.15e-01 -0.179 0.113 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 962575 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0887 0.111 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 962655 sc-eQTL 2.76e-01 -0.0939 0.0859 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 832118 sc-eQTL 6.34e-01 -0.055 0.115 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 602680 sc-eQTL 1.87e-01 0.125 0.0943 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162398 LEXM 210096 sc-eQTL 3.82e-01 0.0933 0.107 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -199205 sc-eQTL 4.76e-02 -0.134 0.067 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 300298 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0773 0.12 0.123 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000116205 TCEANC2 962575 eQTL 0.0544 -0.0498 0.0259 0.00135 0.0 0.105
ENSG00000169174 PCSK9 -23389 pQTL 0.0172 -0.105 0.0442 0.0 0.0 0.103
ENSG00000169174 PCSK9 -23389 eQTL 6.71e-08 -0.145 0.0266 0.0271 0.0681 0.105


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina