logo

Genes within 1Mb (chr1:55012148:C:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 210825 sc-eQTL 5.14e-01 0.092 0.141 0.092 B L1
ENSG00000116133 DHCR24 124953 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00565 0.133 0.092 B L1
ENSG00000116205 TCEANC2 958564 sc-eQTL 5.46e-01 0.0696 0.115 0.092 B L1
ENSG00000116209 TMEM59 958644 sc-eQTL 1.05e-02 -0.178 0.069 0.092 B L1
ENSG00000116221 MRPL37 828107 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0677 0.0916 0.092 B L1
ENSG00000157216 SSBP3 598669 sc-eQTL 3.67e-01 -0.0866 0.0958 0.092 B L1
ENSG00000162402 USP24 -203216 sc-eQTL 2.60e-01 -0.0917 0.0811 0.092 B L1
ENSG00000215883 CYB5RL 812112 sc-eQTL 9.87e-01 0.00257 0.157 0.092 B L1
ENSG00000243725 TTC4 296287 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00278 0.136 0.092 B L1
ENSG00000006555 TTC22 210825 sc-eQTL 6.02e-01 -0.058 0.111 0.092 CD4T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 958564 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0226 0.0909 0.092 CD4T L1
ENSG00000116209 TMEM59 958644 sc-eQTL 5.41e-02 -0.163 0.0839 0.092 CD4T L1
ENSG00000116221 MRPL37 828107 sc-eQTL 9.17e-01 0.0122 0.117 0.092 CD4T L1
ENSG00000157216 SSBP3 598669 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00502 0.0972 0.092 CD4T L1
ENSG00000162402 USP24 -203216 sc-eQTL 3.34e-01 -0.0765 0.079 0.092 CD4T L1
ENSG00000243725 TTC4 296287 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0582 0.119 0.092 CD4T L1
ENSG00000006555 TTC22 210825 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0412 0.098 0.092 CD8T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 958564 sc-eQTL 5.72e-01 0.0691 0.122 0.092 CD8T L1
ENSG00000116209 TMEM59 958644 sc-eQTL 2.58e-01 -0.0959 0.0845 0.092 CD8T L1
ENSG00000116221 MRPL37 828107 sc-eQTL 6.92e-01 0.0463 0.117 0.092 CD8T L1
ENSG00000157216 SSBP3 598669 sc-eQTL 3.29e-01 -0.0819 0.0837 0.092 CD8T L1
ENSG00000162402 USP24 -203216 sc-eQTL 1.89e-02 -0.189 0.08 0.092 CD8T L1
ENSG00000243725 TTC4 296287 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0988 0.14 0.092 CD8T L1
ENSG00000116133 DHCR24 124953 sc-eQTL 7.24e-01 0.0441 0.124 0.097 DC L1
ENSG00000116205 TCEANC2 958564 sc-eQTL 4.35e-01 -0.109 0.139 0.097 DC L1
ENSG00000116209 TMEM59 958644 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0859 0.109 0.097 DC L1
ENSG00000116221 MRPL37 828107 sc-eQTL 1.41e-01 -0.216 0.146 0.097 DC L1
ENSG00000157216 SSBP3 598669 sc-eQTL 7.99e-01 0.0335 0.131 0.097 DC L1
ENSG00000162390 ACOT11 469891 sc-eQTL 6.02e-01 0.066 0.126 0.097 DC L1
ENSG00000162402 USP24 -203216 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0589 0.0761 0.097 DC L1
ENSG00000215883 CYB5RL 812112 sc-eQTL 1.31e-01 -0.208 0.137 0.097 DC L1
ENSG00000243725 TTC4 296287 sc-eQTL 4.03e-01 0.124 0.148 0.097 DC L1
ENSG00000116133 DHCR24 124953 sc-eQTL 2.69e-01 -0.103 0.0933 0.092 Mono L1
ENSG00000116205 TCEANC2 958564 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0474 0.101 0.092 Mono L1
ENSG00000116209 TMEM59 958644 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0652 0.0748 0.092 Mono L1
ENSG00000116221 MRPL37 828107 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0357 0.125 0.092 Mono L1
ENSG00000157216 SSBP3 598669 sc-eQTL 2.14e-01 -0.179 0.143 0.092 Mono L1
ENSG00000162402 USP24 -203216 sc-eQTL 2.28e-01 -0.103 0.0853 0.092 Mono L1
ENSG00000243725 TTC4 296287 sc-eQTL 1.51e-01 0.216 0.15 0.092 Mono L1
ENSG00000006555 TTC22 210825 sc-eQTL 9.68e-01 0.00506 0.128 0.092 NK L1
ENSG00000116133 DHCR24 124953 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0386 0.129 0.092 NK L1
ENSG00000116205 TCEANC2 958564 sc-eQTL 4.12e-01 0.104 0.127 0.092 NK L1
ENSG00000116209 TMEM59 958644 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0661 0.0996 0.092 NK L1
ENSG00000116221 MRPL37 828107 sc-eQTL 1.74e-01 0.168 0.123 0.092 NK L1
ENSG00000157216 SSBP3 598669 sc-eQTL 1.08e-01 -0.172 0.107 0.092 NK L1
ENSG00000162398 LEXM 206085 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0454 0.121 0.092 NK L1
ENSG00000162402 USP24 -203216 sc-eQTL 2.66e-01 -0.0813 0.0729 0.092 NK L1
ENSG00000243725 TTC4 296287 sc-eQTL 3.72e-01 -0.124 0.138 0.092 NK L1
ENSG00000006555 TTC22 210825 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0683 0.117 0.092 Other_T L1
ENSG00000116133 DHCR24 124953 sc-eQTL 4.22e-01 -0.073 0.0907 0.092 Other_T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 958564 sc-eQTL 1.09e-01 0.217 0.135 0.092 Other_T L1
ENSG00000116209 TMEM59 958644 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0196 0.0932 0.092 Other_T L1
ENSG00000116221 MRPL37 828107 sc-eQTL 5.30e-01 0.0549 0.0872 0.092 Other_T L1
ENSG00000157216 SSBP3 598669 sc-eQTL 7.65e-01 0.0302 0.101 0.092 Other_T L1
ENSG00000162402 USP24 -203216 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0705 0.107 0.092 Other_T L1
ENSG00000215883 CYB5RL 812112 sc-eQTL 6.42e-01 0.0683 0.147 0.092 Other_T L1
ENSG00000243725 TTC4 296287 sc-eQTL 4.88e-01 -0.102 0.146 0.092 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 210825 sc-eQTL 6.41e-01 0.0554 0.119 0.092 B_Activated L2
ENSG00000116133 DHCR24 124953 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0178 0.14 0.092 B_Activated L2
ENSG00000116205 TCEANC2 958564 sc-eQTL 7.90e-01 -0.04 0.15 0.092 B_Activated L2
ENSG00000116209 TMEM59 958644 sc-eQTL 4.80e-01 -0.113 0.159 0.092 B_Activated L2
ENSG00000116221 MRPL37 828107 sc-eQTL 1.21e-01 -0.266 0.171 0.092 B_Activated L2
ENSG00000157216 SSBP3 598669 sc-eQTL 1.63e-01 -0.217 0.155 0.092 B_Activated L2
ENSG00000162402 USP24 -203216 sc-eQTL 3.77e-01 -0.134 0.152 0.092 B_Activated L2
ENSG00000215883 CYB5RL 812112 sc-eQTL 4.72e-02 0.265 0.133 0.092 B_Activated L2
ENSG00000243725 TTC4 296287 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0354 0.146 0.092 B_Activated L2
ENSG00000006555 TTC22 210825 sc-eQTL 9.58e-01 0.00811 0.155 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000116133 DHCR24 124953 sc-eQTL 2.53e-01 -0.164 0.143 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000116205 TCEANC2 958564 sc-eQTL 4.71e-01 -0.103 0.143 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000116209 TMEM59 958644 sc-eQTL 2.32e-01 -0.146 0.122 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000116221 MRPL37 828107 sc-eQTL 9.92e-01 0.00137 0.144 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000157216 SSBP3 598669 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0978 0.134 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000162402 USP24 -203216 sc-eQTL 9.68e-01 0.00453 0.113 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000215883 CYB5RL 812112 sc-eQTL 2.49e-01 0.185 0.16 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000243725 TTC4 296287 sc-eQTL 5.23e-01 0.0934 0.146 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000006555 TTC22 210825 sc-eQTL 8.92e-01 0.02 0.147 0.093 B_Memory L2
ENSG00000116133 DHCR24 124953 sc-eQTL 8.22e-01 0.0327 0.145 0.093 B_Memory L2
ENSG00000116205 TCEANC2 958564 sc-eQTL 5.64e-03 0.427 0.153 0.093 B_Memory L2
ENSG00000116209 TMEM59 958644 sc-eQTL 9.86e-02 -0.214 0.129 0.093 B_Memory L2
ENSG00000116221 MRPL37 828107 sc-eQTL 5.33e-01 0.082 0.131 0.093 B_Memory L2
ENSG00000157216 SSBP3 598669 sc-eQTL 7.80e-01 0.0342 0.123 0.093 B_Memory L2
ENSG00000162402 USP24 -203216 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0532 0.12 0.093 B_Memory L2
ENSG00000215883 CYB5RL 812112 sc-eQTL 1.04e-01 -0.241 0.147 0.093 B_Memory L2
ENSG00000243725 TTC4 296287 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0767 0.154 0.093 B_Memory L2
ENSG00000006555 TTC22 210825 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00477 0.15 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000116133 DHCR24 124953 sc-eQTL 1.44e-01 -0.205 0.14 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 958564 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0535 0.125 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000116209 TMEM59 958644 sc-eQTL 2.54e-01 -0.104 0.0909 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000116221 MRPL37 828107 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0724 0.134 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000157216 SSBP3 598669 sc-eQTL 1.13e-01 -0.203 0.127 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000162402 USP24 -203216 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0414 0.101 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 812112 sc-eQTL 9.31e-01 0.0131 0.152 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000243725 TTC4 296287 sc-eQTL 2.86e-01 -0.147 0.137 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000006555 TTC22 210825 sc-eQTL 7.73e-01 0.044 0.153 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000116133 DHCR24 124953 sc-eQTL 8.96e-01 0.0173 0.133 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 958564 sc-eQTL 4.28e-01 0.117 0.147 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000116209 TMEM59 958644 sc-eQTL 1.16e-01 -0.19 0.121 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000116221 MRPL37 828107 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00424 0.143 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000157216 SSBP3 598669 sc-eQTL 8.81e-01 0.0211 0.141 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000162402 USP24 -203216 sc-eQTL 8.35e-01 0.0233 0.112 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 812112 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0191 0.157 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000243725 TTC4 296287 sc-eQTL 1.29e-01 0.248 0.163 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000006555 TTC22 210825 sc-eQTL 6.83e-02 -0.258 0.141 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 958564 sc-eQTL 3.38e-01 0.14 0.146 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 958644 sc-eQTL 1.66e-01 -0.184 0.132 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 828107 sc-eQTL 1.99e-01 0.21 0.163 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 598669 sc-eQTL 1.81e-01 -0.135 0.1 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -203216 sc-eQTL 1.99e-01 -0.177 0.138 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 296287 sc-eQTL 3.50e-01 -0.145 0.154 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 210825 sc-eQTL 1.46e-01 0.193 0.132 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 958564 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0489 0.101 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 958644 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0172 0.0984 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 828107 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0867 0.127 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 598669 sc-eQTL 6.26e-02 0.188 0.1 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -203216 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0697 0.0872 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 296287 sc-eQTL 3.35e-01 -0.128 0.133 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 210825 sc-eQTL 9.51e-01 0.00858 0.139 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 958564 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0394 0.135 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 958644 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0359 0.102 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 828107 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0572 0.128 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 598669 sc-eQTL 1.34e-02 0.309 0.124 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -203216 sc-eQTL 4.94e-01 0.0712 0.104 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 296287 sc-eQTL 7.20e-01 0.0537 0.15 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 210825 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0684 0.159 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 958564 sc-eQTL 5.29e-01 0.0949 0.15 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 958644 sc-eQTL 1.62e-01 -0.163 0.116 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 828107 sc-eQTL 5.15e-01 0.0979 0.15 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 598669 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0582 0.129 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -203216 sc-eQTL 3.88e-01 -0.101 0.117 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 296287 sc-eQTL 3.97e-01 0.131 0.155 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 210825 sc-eQTL 5.42e-01 0.0794 0.13 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 958564 sc-eQTL 1.00e+00 3.55e-05 0.144 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 958644 sc-eQTL 5.36e-01 0.0776 0.125 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 828107 sc-eQTL 4.23e-01 -0.119 0.148 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 598669 sc-eQTL 3.53e-01 -0.0943 0.101 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -203216 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0656 0.101 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 296287 sc-eQTL 5.19e-01 0.0974 0.151 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 210825 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0589 0.142 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 958564 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0641 0.128 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 958644 sc-eQTL 5.41e-02 -0.241 0.124 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 828107 sc-eQTL 8.99e-01 0.0191 0.15 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 598669 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0154 0.114 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -203216 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0359 0.103 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 296287 sc-eQTL 2.79e-01 -0.164 0.151 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 210825 sc-eQTL 9.29e-01 -0.014 0.157 0.086 CD8_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 958564 sc-eQTL 6.62e-01 0.0693 0.158 0.086 CD8_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 958644 sc-eQTL 9.92e-01 0.00134 0.139 0.086 CD8_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 828107 sc-eQTL 6.43e-01 0.0733 0.158 0.086 CD8_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 598669 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0618 0.137 0.086 CD8_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -203216 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00186 0.133 0.086 CD8_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 296287 sc-eQTL 2.73e-01 -0.177 0.161 0.086 CD8_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 210825 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0385 0.15 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 958564 sc-eQTL 5.38e-01 0.0967 0.157 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 958644 sc-eQTL 7.66e-01 0.0451 0.152 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 828107 sc-eQTL 8.84e-01 0.0225 0.154 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 598669 sc-eQTL 6.70e-01 0.062 0.145 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -203216 sc-eQTL 2.08e-01 -0.193 0.153 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 296287 sc-eQTL 1.18e-01 0.243 0.155 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 210825 sc-eQTL 9.38e-01 -0.0108 0.14 0.093 MAIT L2
ENSG00000116133 DHCR24 124953 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0723 0.103 0.093 MAIT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 958564 sc-eQTL 3.84e-02 0.3 0.144 0.093 MAIT L2
ENSG00000116209 TMEM59 958644 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0344 0.131 0.093 MAIT L2
ENSG00000116221 MRPL37 828107 sc-eQTL 9.93e-01 0.00144 0.16 0.093 MAIT L2
ENSG00000157216 SSBP3 598669 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0701 0.142 0.093 MAIT L2
ENSG00000162402 USP24 -203216 sc-eQTL 6.62e-01 -0.055 0.126 0.093 MAIT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 812112 sc-eQTL 5.99e-01 0.0769 0.146 0.093 MAIT L2
ENSG00000243725 TTC4 296287 sc-eQTL 9.77e-01 0.00418 0.145 0.093 MAIT L2
ENSG00000006555 TTC22 210825 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00787 0.153 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000116133 DHCR24 124953 sc-eQTL 1.45e-01 -0.197 0.135 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000116205 TCEANC2 958564 sc-eQTL 1.42e-02 0.349 0.141 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000116209 TMEM59 958644 sc-eQTL 3.22e-01 -0.138 0.139 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000116221 MRPL37 828107 sc-eQTL 9.40e-01 -0.0117 0.156 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000157216 SSBP3 598669 sc-eQTL 2.29e-01 0.141 0.117 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000162398 LEXM 206085 sc-eQTL 1.82e-01 -0.185 0.138 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000162402 USP24 -203216 sc-eQTL 7.64e-02 -0.211 0.118 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000243725 TTC4 296287 sc-eQTL 9.52e-01 -0.009 0.151 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000006555 TTC22 210825 sc-eQTL 7.52e-01 0.0408 0.129 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000116133 DHCR24 124953 sc-eQTL 4.07e-01 -0.112 0.135 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000116205 TCEANC2 958564 sc-eQTL 8.72e-01 0.0235 0.146 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000116209 TMEM59 958644 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000129 0.108 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000116221 MRPL37 828107 sc-eQTL 3.14e-01 0.142 0.141 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000157216 SSBP3 598669 sc-eQTL 2.12e-01 -0.144 0.115 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000162398 LEXM 206085 sc-eQTL 3.85e-01 -0.115 0.132 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000162402 USP24 -203216 sc-eQTL 8.37e-02 -0.145 0.0837 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000243725 TTC4 296287 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0333 0.144 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000006555 TTC22 210825 sc-eQTL 9.60e-02 0.257 0.154 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000116133 DHCR24 124953 sc-eQTL 9.13e-01 0.0165 0.151 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000116205 TCEANC2 958564 sc-eQTL 9.90e-01 0.0019 0.146 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000116209 TMEM59 958644 sc-eQTL 3.08e-01 -0.147 0.144 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000116221 MRPL37 828107 sc-eQTL 9.89e-01 -0.0022 0.159 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000157216 SSBP3 598669 sc-eQTL 4.26e-01 -0.104 0.13 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000162398 LEXM 206085 sc-eQTL 8.41e-01 0.0295 0.147 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000162402 USP24 -203216 sc-eQTL 5.85e-01 0.0588 0.108 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000243725 TTC4 296287 sc-eQTL 5.06e-01 -0.107 0.161 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000006555 TTC22 210825 sc-eQTL 1.40e-02 -0.334 0.135 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000116133 DHCR24 124953 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0129 0.138 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000116205 TCEANC2 958564 sc-eQTL 9.52e-01 0.00823 0.137 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000116209 TMEM59 958644 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0231 0.112 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000116221 MRPL37 828107 sc-eQTL 6.62e-02 0.252 0.137 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000157216 SSBP3 598669 sc-eQTL 3.54e-02 -0.242 0.114 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000162398 LEXM 206085 sc-eQTL 7.34e-01 0.0492 0.144 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000162402 USP24 -203216 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0684 0.0983 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000243725 TTC4 296287 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0992 0.146 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000006555 TTC22 210825 sc-eQTL 5.76e-01 0.0961 0.171 0.1 PB L2
ENSG00000116133 DHCR24 124953 sc-eQTL 4.51e-01 0.115 0.152 0.1 PB L2
ENSG00000116205 TCEANC2 958564 sc-eQTL 4.74e-01 -0.132 0.185 0.1 PB L2
ENSG00000116209 TMEM59 958644 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0479 0.0772 0.1 PB L2
ENSG00000116221 MRPL37 828107 sc-eQTL 6.29e-01 0.068 0.14 0.1 PB L2
ENSG00000157216 SSBP3 598669 sc-eQTL 3.45e-01 -0.153 0.162 0.1 PB L2
ENSG00000162402 USP24 -203216 sc-eQTL 8.57e-01 0.0333 0.184 0.1 PB L2
ENSG00000215883 CYB5RL 812112 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0648 0.191 0.1 PB L2
ENSG00000243725 TTC4 296287 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0858 0.178 0.1 PB L2
ENSG00000006555 TTC22 210825 sc-eQTL 9.71e-01 0.00513 0.143 0.089 Pro_T L2
ENSG00000116133 DHCR24 124953 sc-eQTL 1.68e-01 -0.167 0.121 0.089 Pro_T L2
ENSG00000116205 TCEANC2 958564 sc-eQTL 2.91e-01 -0.156 0.148 0.089 Pro_T L2
ENSG00000116209 TMEM59 958644 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0299 0.103 0.089 Pro_T L2
ENSG00000116221 MRPL37 828107 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00737 0.101 0.089 Pro_T L2
ENSG00000157216 SSBP3 598669 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0409 0.113 0.089 Pro_T L2
ENSG00000162402 USP24 -203216 sc-eQTL 6.56e-01 0.0614 0.137 0.089 Pro_T L2
ENSG00000215883 CYB5RL 812112 sc-eQTL 8.66e-01 -0.023 0.136 0.089 Pro_T L2
ENSG00000243725 TTC4 296287 sc-eQTL 2.79e-01 0.164 0.151 0.089 Pro_T L2
ENSG00000006555 TTC22 210825 sc-eQTL 5.20e-02 -0.269 0.138 0.092 Treg L2
ENSG00000116205 TCEANC2 958564 sc-eQTL 1.67e-01 -0.205 0.148 0.092 Treg L2
ENSG00000116209 TMEM59 958644 sc-eQTL 1.69e-01 -0.162 0.117 0.092 Treg L2
ENSG00000116221 MRPL37 828107 sc-eQTL 8.59e-01 0.026 0.146 0.092 Treg L2
ENSG00000157216 SSBP3 598669 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0272 0.13 0.092 Treg L2
ENSG00000162402 USP24 -203216 sc-eQTL 3.17e-01 0.124 0.123 0.092 Treg L2
ENSG00000243725 TTC4 296287 sc-eQTL 4.57e-01 -0.116 0.156 0.092 Treg L2
ENSG00000116133 DHCR24 124953 sc-eQTL 1.80e-01 0.17 0.126 0.1 cDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 958564 sc-eQTL 5.16e-01 0.0974 0.149 0.1 cDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 958644 sc-eQTL 8.61e-01 0.0224 0.127 0.1 cDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 828107 sc-eQTL 1.19e-01 -0.253 0.162 0.1 cDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 598669 sc-eQTL 6.53e-01 0.0675 0.15 0.1 cDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 469891 sc-eQTL 8.14e-01 0.0329 0.139 0.1 cDC L2
ENSG00000162402 USP24 -203216 sc-eQTL 2.39e-01 0.184 0.156 0.1 cDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 812112 sc-eQTL 1.83e-01 -0.178 0.134 0.1 cDC L2
ENSG00000243725 TTC4 296287 sc-eQTL 5.46e-01 0.0969 0.16 0.1 cDC L2
ENSG00000116133 DHCR24 124953 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0816 0.0896 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000116205 TCEANC2 958564 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0359 0.125 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000116209 TMEM59 958644 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00306 0.0757 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000116221 MRPL37 828107 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0989 0.135 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000157216 SSBP3 598669 sc-eQTL 3.18e-01 -0.137 0.137 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000162402 USP24 -203216 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00867 0.102 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000243725 TTC4 296287 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0515 0.155 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000116133 DHCR24 124953 sc-eQTL 8.40e-02 -0.147 0.0848 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000116205 TCEANC2 958564 sc-eQTL 6.33e-01 0.0624 0.13 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000116209 TMEM59 958644 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0586 0.104 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000116221 MRPL37 828107 sc-eQTL 6.12e-01 0.0764 0.151 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000157216 SSBP3 598669 sc-eQTL 3.86e-01 -0.136 0.156 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000162402 USP24 -203216 sc-eQTL 8.18e-02 -0.22 0.126 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000243725 TTC4 296287 sc-eQTL 3.01e-01 0.164 0.158 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000006555 TTC22 210825 sc-eQTL 4.13e-01 -0.118 0.144 0.094 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 124953 sc-eQTL 1.69e-01 -0.221 0.16 0.094 gdT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 958564 sc-eQTL 4.50e-01 0.122 0.161 0.094 gdT L2
ENSG00000116209 TMEM59 958644 sc-eQTL 2.62e-01 -0.184 0.163 0.094 gdT L2
ENSG00000116221 MRPL37 828107 sc-eQTL 5.04e-01 0.126 0.188 0.094 gdT L2
ENSG00000157216 SSBP3 598669 sc-eQTL 1.56e-01 0.163 0.114 0.094 gdT L2
ENSG00000162402 USP24 -203216 sc-eQTL 1.96e-01 -0.2 0.154 0.094 gdT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 812112 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00594 0.161 0.094 gdT L2
ENSG00000243725 TTC4 296287 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0924 0.181 0.094 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 124953 sc-eQTL 8.16e-01 0.0265 0.114 0.093 intMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 958564 sc-eQTL 2.54e-01 -0.162 0.142 0.093 intMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 958644 sc-eQTL 3.78e-02 -0.216 0.103 0.093 intMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 828107 sc-eQTL 9.46e-01 -0.0109 0.16 0.093 intMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 598669 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0212 0.163 0.093 intMono L2
ENSG00000162402 USP24 -203216 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00989 0.145 0.093 intMono L2
ENSG00000243725 TTC4 296287 sc-eQTL 4.97e-02 0.303 0.153 0.093 intMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 124953 sc-eQTL 2.33e-02 -0.254 0.111 0.093 ncMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 958564 sc-eQTL 3.20e-01 -0.14 0.141 0.093 ncMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 958644 sc-eQTL 4.01e-02 -0.23 0.112 0.093 ncMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 828107 sc-eQTL 3.05e-01 -0.149 0.145 0.093 ncMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 598669 sc-eQTL 1.71e-01 -0.217 0.158 0.093 ncMono L2
ENSG00000162402 USP24 -203216 sc-eQTL 2.72e-01 -0.14 0.127 0.093 ncMono L2
ENSG00000243725 TTC4 296287 sc-eQTL 1.18e-01 0.235 0.149 0.093 ncMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 124953 sc-eQTL 1.57e-01 -0.181 0.128 0.102 pDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 958564 sc-eQTL 7.83e-01 0.0424 0.154 0.102 pDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 958644 sc-eQTL 1.10e-01 -0.196 0.122 0.102 pDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 828107 sc-eQTL 4.82e-01 -0.115 0.163 0.102 pDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 598669 sc-eQTL 2.37e-01 -0.172 0.144 0.102 pDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 469891 sc-eQTL 4.70e-01 0.0441 0.0609 0.102 pDC L2
ENSG00000162402 USP24 -203216 sc-eQTL 1.33e-02 -0.253 0.101 0.102 pDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 812112 sc-eQTL 9.35e-01 -0.0115 0.141 0.102 pDC L2
ENSG00000243725 TTC4 296287 sc-eQTL 1.76e-01 0.22 0.162 0.102 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 210825 sc-eQTL 9.92e-01 0.00153 0.145 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 124953 sc-eQTL 8.09e-01 -0.035 0.145 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 958564 sc-eQTL 4.95e-01 0.0958 0.14 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 958644 sc-eQTL 9.10e-03 -0.283 0.107 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 828107 sc-eQTL 8.18e-01 0.0301 0.131 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 598669 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0829 0.114 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -203216 sc-eQTL 3.39e-01 -0.0992 0.103 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 812112 sc-eQTL 8.78e-01 0.0245 0.159 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 296287 sc-eQTL 4.88e-01 0.0992 0.143 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 210825 sc-eQTL 9.65e-01 0.00672 0.151 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 124953 sc-eQTL 4.30e-01 -0.108 0.136 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 958564 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00234 0.123 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 958644 sc-eQTL 4.70e-02 -0.173 0.0868 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 828107 sc-eQTL 3.59e-01 -0.116 0.126 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 598669 sc-eQTL 9.66e-02 -0.187 0.112 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -203216 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0224 0.0966 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 812112 sc-eQTL 9.93e-01 -0.0013 0.153 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 296287 sc-eQTL 9.92e-01 0.00137 0.144 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 124953 sc-eQTL 5.92e-02 -0.165 0.087 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 958564 sc-eQTL 9.16e-01 0.0116 0.11 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 958644 sc-eQTL 9.31e-01 0.00658 0.0757 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 828107 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0445 0.134 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 598669 sc-eQTL 2.52e-01 -0.161 0.14 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -203216 sc-eQTL 1.61e-01 -0.134 0.0955 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 296287 sc-eQTL 5.75e-01 0.0892 0.159 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 124953 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0469 0.107 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 958564 sc-eQTL 3.09e-01 -0.143 0.141 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 958644 sc-eQTL 2.65e-04 -0.377 0.102 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 828107 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0189 0.144 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 598669 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0783 0.153 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -203216 sc-eQTL 8.81e-01 0.0181 0.121 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 296287 sc-eQTL 1.35e-02 0.372 0.149 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 210825 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0477 0.125 0.093 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 124953 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0461 0.131 0.093 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 958564 sc-eQTL 8.40e-01 0.026 0.128 0.093 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 958644 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0697 0.0992 0.093 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 828107 sc-eQTL 2.48e-01 0.154 0.133 0.093 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 598669 sc-eQTL 5.63e-02 -0.208 0.108 0.093 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162398 LEXM 206085 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0308 0.123 0.093 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -203216 sc-eQTL 2.54e-01 -0.089 0.0778 0.093 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 296287 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0493 0.139 0.093 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000116133 DHCR24 124953 eQTL 0.00631 -0.125 0.0457 0.0 0.0 0.0913
ENSG00000234810 AL603840.1 -317140 eQTL 0.017 -0.126 0.0527 0.00119 0.0 0.0913
ENSG00000280378 AL353898.3 977268 eQTL 0.0177 0.113 0.0474 0.0 0.0 0.0913

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000162398 \N 206085 1.64e-06 1.84e-06 3e-07 1.25e-06 4.41e-07 6.4e-07 1.24e-06 4.44e-07 1.78e-06 6.94e-07 1.86e-06 1.26e-06 2.73e-06 4.66e-07 3.18e-07 1.16e-06 1.12e-06 1.35e-06 5.76e-07 7.22e-07 6.57e-07 1.95e-06 1.56e-06 9.6e-07 2.44e-06 1.12e-06 1.05e-06 1.08e-06 1.63e-06 1.5e-06 7.66e-07 2.7e-07 3.71e-07 8.72e-07 7.35e-07 6.76e-07 7.27e-07 3.36e-07 6.03e-07 2.14e-07 2.74e-07 2.5e-06 3.52e-07 1.75e-07 3.98e-07 3.28e-07 4.23e-07 2.11e-07 2.46e-07
ENSG00000280378 AL353898.3 977268 2.69e-07 1.25e-07 4.47e-08 1.82e-07 9.16e-08 1e-07 1.49e-07 5.43e-08 1.45e-07 4.94e-08 1.62e-07 8.55e-08 1.41e-07 6.56e-08 6.17e-08 7.53e-08 3.93e-08 1.26e-07 5.39e-08 4.45e-08 1.13e-07 1.28e-07 1.39e-07 3.42e-08 1.37e-07 1.14e-07 1.07e-07 9.57e-08 1.09e-07 1.07e-07 9.64e-08 4.09e-08 3.35e-08 8.44e-08 8.76e-08 3.95e-08 5.03e-08 9.23e-08 6.56e-08 3.37e-08 3.57e-08 1.33e-07 4.89e-08 1.71e-08 5.7e-08 1.83e-08 1.21e-07 3.89e-09 4.9e-08