logo

Genes within 1Mb (chr1:55010293:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 208970 sc-eQTL 8.14e-01 0.0246 0.104 0.184 B L1
ENSG00000116133 DHCR24 123098 sc-eQTL 2.81e-01 -0.106 0.0983 0.184 B L1
ENSG00000116205 TCEANC2 956709 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0334 0.085 0.184 B L1
ENSG00000116209 TMEM59 956789 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0167 0.0518 0.184 B L1
ENSG00000116221 MRPL37 826252 sc-eQTL 1.72e-01 0.0925 0.0675 0.184 B L1
ENSG00000157216 SSBP3 596814 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0323 0.0709 0.184 B L1
ENSG00000162402 USP24 -205071 sc-eQTL 5.80e-01 0.0333 0.0601 0.184 B L1
ENSG00000215883 CYB5RL 810257 sc-eQTL 1.44e-01 0.169 0.115 0.184 B L1
ENSG00000243725 TTC4 294432 sc-eQTL 1.71e-01 -0.138 0.1 0.184 B L1
ENSG00000006555 TTC22 208970 sc-eQTL 4.65e-01 0.0592 0.0809 0.184 CD4T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 956709 sc-eQTL 7.53e-01 0.0209 0.0663 0.184 CD4T L1
ENSG00000116209 TMEM59 956789 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0499 0.0616 0.184 CD4T L1
ENSG00000116221 MRPL37 826252 sc-eQTL 2.67e-01 0.0947 0.0851 0.184 CD4T L1
ENSG00000157216 SSBP3 596814 sc-eQTL 6.09e-01 0.0363 0.0708 0.184 CD4T L1
ENSG00000162402 USP24 -205071 sc-eQTL 8.67e-01 -0.00966 0.0577 0.184 CD4T L1
ENSG00000243725 TTC4 294432 sc-eQTL 3.14e-01 -0.0875 0.0867 0.184 CD4T L1
ENSG00000006555 TTC22 208970 sc-eQTL 1.47e-01 -0.102 0.0699 0.184 CD8T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 956709 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0483 0.0874 0.184 CD8T L1
ENSG00000116209 TMEM59 956789 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0063 0.0607 0.184 CD8T L1
ENSG00000116221 MRPL37 826252 sc-eQTL 7.21e-01 0.0299 0.0836 0.184 CD8T L1
ENSG00000157216 SSBP3 596814 sc-eQTL 1.84e-01 -0.0798 0.0598 0.184 CD8T L1
ENSG00000162402 USP24 -205071 sc-eQTL 1.90e-01 -0.076 0.0578 0.184 CD8T L1
ENSG00000243725 TTC4 294432 sc-eQTL 9.00e-01 0.0126 0.101 0.184 CD8T L1
ENSG00000116133 DHCR24 123098 sc-eQTL 1.78e-01 -0.126 0.0931 0.185 DC L1
ENSG00000116205 TCEANC2 956709 sc-eQTL 1.51e-01 -0.15 0.104 0.185 DC L1
ENSG00000116209 TMEM59 956789 sc-eQTL 2.62e-01 0.0923 0.0821 0.185 DC L1
ENSG00000116221 MRPL37 826252 sc-eQTL 6.39e-02 0.204 0.11 0.185 DC L1
ENSG00000157216 SSBP3 596814 sc-eQTL 2.56e-02 -0.219 0.0974 0.185 DC L1
ENSG00000162390 ACOT11 468036 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0187 0.0949 0.185 DC L1
ENSG00000162402 USP24 -205071 sc-eQTL 8.23e-01 0.0128 0.0572 0.185 DC L1
ENSG00000215883 CYB5RL 810257 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0119 0.103 0.185 DC L1
ENSG00000243725 TTC4 294432 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0869 0.111 0.185 DC L1
ENSG00000116133 DHCR24 123098 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0545 0.067 0.184 Mono L1
ENSG00000116205 TCEANC2 956709 sc-eQTL 7.55e-01 0.0226 0.0724 0.184 Mono L1
ENSG00000116209 TMEM59 956789 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0353 0.0537 0.184 Mono L1
ENSG00000116221 MRPL37 826252 sc-eQTL 1.12e-01 0.143 0.0894 0.184 Mono L1
ENSG00000157216 SSBP3 596814 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00425 0.103 0.184 Mono L1
ENSG00000162402 USP24 -205071 sc-eQTL 1.45e-01 -0.0894 0.0611 0.184 Mono L1
ENSG00000243725 TTC4 294432 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0169 0.108 0.184 Mono L1
ENSG00000006555 TTC22 208970 sc-eQTL 2.28e-01 0.114 0.0941 0.182 NK L1
ENSG00000116133 DHCR24 123098 sc-eQTL 7.61e-01 0.0291 0.0953 0.182 NK L1
ENSG00000116205 TCEANC2 956709 sc-eQTL 5.99e-01 0.0495 0.094 0.182 NK L1
ENSG00000116209 TMEM59 956789 sc-eQTL 2.63e-01 -0.0825 0.0735 0.182 NK L1
ENSG00000116221 MRPL37 826252 sc-eQTL 3.26e-01 -0.09 0.0914 0.182 NK L1
ENSG00000157216 SSBP3 596814 sc-eQTL 2.01e-01 0.102 0.0791 0.182 NK L1
ENSG00000162398 LEXM 204230 sc-eQTL 5.15e-01 0.0581 0.089 0.182 NK L1
ENSG00000162402 USP24 -205071 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0226 0.054 0.182 NK L1
ENSG00000243725 TTC4 294432 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0635 0.102 0.182 NK L1
ENSG00000006555 TTC22 208970 sc-eQTL 1.17e-01 -0.129 0.0821 0.184 Other_T L1
ENSG00000116133 DHCR24 123098 sc-eQTL 3.98e-01 0.0542 0.064 0.184 Other_T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 956709 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00729 0.0959 0.184 Other_T L1
ENSG00000116209 TMEM59 956789 sc-eQTL 5.57e-01 0.0387 0.0657 0.184 Other_T L1
ENSG00000116221 MRPL37 826252 sc-eQTL 1.30e-01 0.0932 0.0613 0.184 Other_T L1
ENSG00000157216 SSBP3 596814 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00478 0.0713 0.184 Other_T L1
ENSG00000162402 USP24 -205071 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0491 0.0758 0.184 Other_T L1
ENSG00000215883 CYB5RL 810257 sc-eQTL 4.61e-01 0.0764 0.104 0.184 Other_T L1
ENSG00000243725 TTC4 294432 sc-eQTL 7.31e-01 0.0356 0.103 0.184 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 208970 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0184 0.0902 0.184 B_Activated L2
ENSG00000116133 DHCR24 123098 sc-eQTL 3.40e-01 -0.101 0.106 0.184 B_Activated L2
ENSG00000116205 TCEANC2 956709 sc-eQTL 8.61e-01 0.02 0.114 0.184 B_Activated L2
ENSG00000116209 TMEM59 956789 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00439 0.121 0.184 B_Activated L2
ENSG00000116221 MRPL37 826252 sc-eQTL 4.34e-01 0.102 0.13 0.184 B_Activated L2
ENSG00000157216 SSBP3 596814 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0359 0.118 0.184 B_Activated L2
ENSG00000162402 USP24 -205071 sc-eQTL 5.49e-01 0.0693 0.115 0.184 B_Activated L2
ENSG00000215883 CYB5RL 810257 sc-eQTL 2.62e-01 -0.114 0.101 0.184 B_Activated L2
ENSG00000243725 TTC4 294432 sc-eQTL 4.18e-01 0.0895 0.11 0.184 B_Activated L2
ENSG00000006555 TTC22 208970 sc-eQTL 2.48e-01 0.128 0.11 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000116133 DHCR24 123098 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0288 0.102 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000116205 TCEANC2 956709 sc-eQTL 3.91e-02 -0.21 0.101 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000116209 TMEM59 956789 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00345 0.0874 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000116221 MRPL37 826252 sc-eQTL 8.16e-02 0.179 0.102 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000157216 SSBP3 596814 sc-eQTL 7.64e-02 -0.17 0.0953 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000162402 USP24 -205071 sc-eQTL 5.13e-01 0.053 0.0808 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000215883 CYB5RL 810257 sc-eQTL 2.99e-01 0.119 0.114 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000243725 TTC4 294432 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0545 0.104 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000006555 TTC22 208970 sc-eQTL 1.63e-01 -0.146 0.104 0.185 B_Memory L2
ENSG00000116133 DHCR24 123098 sc-eQTL 1.78e-01 -0.14 0.104 0.185 B_Memory L2
ENSG00000116205 TCEANC2 956709 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0164 0.111 0.185 B_Memory L2
ENSG00000116209 TMEM59 956789 sc-eQTL 1.72e-01 0.127 0.0924 0.185 B_Memory L2
ENSG00000116221 MRPL37 826252 sc-eQTL 2.43e-01 -0.11 0.0937 0.185 B_Memory L2
ENSG00000157216 SSBP3 596814 sc-eQTL 8.92e-01 0.0119 0.0878 0.185 B_Memory L2
ENSG00000162402 USP24 -205071 sc-eQTL 3.89e-01 0.074 0.0857 0.185 B_Memory L2
ENSG00000215883 CYB5RL 810257 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0566 0.106 0.185 B_Memory L2
ENSG00000243725 TTC4 294432 sc-eQTL 9.63e-01 0.00507 0.11 0.185 B_Memory L2
ENSG00000006555 TTC22 208970 sc-eQTL 5.17e-01 0.0721 0.111 0.184 B_Naive1 L2
ENSG00000116133 DHCR24 123098 sc-eQTL 7.75e-01 0.0298 0.104 0.184 B_Naive1 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 956709 sc-eQTL 5.29e-03 0.258 0.0915 0.184 B_Naive1 L2
ENSG00000116209 TMEM59 956789 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0554 0.0676 0.184 B_Naive1 L2
ENSG00000116221 MRPL37 826252 sc-eQTL 6.75e-01 0.0419 0.0998 0.184 B_Naive1 L2
ENSG00000157216 SSBP3 596814 sc-eQTL 1.89e-02 -0.222 0.0938 0.184 B_Naive1 L2
ENSG00000162402 USP24 -205071 sc-eQTL 1.15e-01 -0.118 0.0744 0.184 B_Naive1 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 810257 sc-eQTL 2.56e-02 0.251 0.112 0.184 B_Naive1 L2
ENSG00000243725 TTC4 294432 sc-eQTL 1.03e-01 -0.166 0.101 0.184 B_Naive1 L2
ENSG00000006555 TTC22 208970 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0265 0.112 0.185 B_Naive2 L2
ENSG00000116133 DHCR24 123098 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0329 0.0976 0.185 B_Naive2 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 956709 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0999 0.108 0.185 B_Naive2 L2
ENSG00000116209 TMEM59 956789 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0316 0.0892 0.185 B_Naive2 L2
ENSG00000116221 MRPL37 826252 sc-eQTL 9.30e-01 0.00921 0.105 0.185 B_Naive2 L2
ENSG00000157216 SSBP3 596814 sc-eQTL 5.22e-01 0.0663 0.103 0.185 B_Naive2 L2
ENSG00000162402 USP24 -205071 sc-eQTL 8.40e-01 0.0165 0.082 0.185 B_Naive2 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 810257 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0276 0.115 0.185 B_Naive2 L2
ENSG00000243725 TTC4 294432 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0453 0.12 0.185 B_Naive2 L2
ENSG00000006555 TTC22 208970 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0363 0.105 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 956709 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0121 0.108 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 956789 sc-eQTL 6.63e-01 0.0426 0.0978 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 826252 sc-eQTL 1.24e-01 0.185 0.12 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 596814 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0111 0.074 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -205071 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0415 0.102 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 294432 sc-eQTL 4.61e-02 0.226 0.113 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 208970 sc-eQTL 1.80e-01 0.127 0.0944 0.184 CD4_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 956709 sc-eQTL 5.08e-01 0.0478 0.0721 0.184 CD4_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 956789 sc-eQTL 2.75e-01 -0.0766 0.07 0.184 CD4_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 826252 sc-eQTL 2.35e-01 0.107 0.0901 0.184 CD4_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 596814 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0148 0.0722 0.184 CD4_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -205071 sc-eQTL 5.42e-01 -0.038 0.0622 0.184 CD4_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 294432 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0808 0.0948 0.184 CD4_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 208970 sc-eQTL 2.25e-01 0.12 0.099 0.184 CD4_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 956709 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0657 0.0966 0.184 CD4_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 956789 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0207 0.0729 0.184 CD4_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 826252 sc-eQTL 1.61e-01 0.128 0.0913 0.184 CD4_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 596814 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0544 0.0898 0.184 CD4_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -205071 sc-eQTL 9.29e-01 -0.0066 0.0745 0.184 CD4_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 294432 sc-eQTL 5.58e-01 0.063 0.107 0.184 CD4_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 208970 sc-eQTL 6.94e-01 0.0453 0.115 0.184 CD4_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 956709 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0487 0.109 0.184 CD4_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 956789 sc-eQTL 5.16e-02 -0.164 0.0836 0.184 CD4_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 826252 sc-eQTL 2.61e-01 -0.122 0.108 0.184 CD4_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 596814 sc-eQTL 3.58e-01 0.0856 0.0929 0.184 CD4_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -205071 sc-eQTL 5.47e-01 -0.051 0.0847 0.184 CD4_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 294432 sc-eQTL 2.33e-01 -0.133 0.112 0.184 CD4_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 208970 sc-eQTL 1.38e-01 -0.138 0.0927 0.184 CD8_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 956709 sc-eQTL 3.15e-01 0.104 0.103 0.184 CD8_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 956789 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0476 0.0896 0.184 CD8_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 826252 sc-eQTL 8.56e-01 0.0193 0.106 0.184 CD8_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 596814 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0599 0.0725 0.184 CD8_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -205071 sc-eQTL 1.88e-01 -0.0951 0.0719 0.184 CD8_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 294432 sc-eQTL 6.72e-01 0.0458 0.108 0.184 CD8_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 208970 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0682 0.102 0.184 CD8_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 956709 sc-eQTL 4.83e-02 -0.182 0.0917 0.184 CD8_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 956789 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0787 0.0904 0.184 CD8_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 826252 sc-eQTL 3.31e-01 0.106 0.108 0.184 CD8_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 596814 sc-eQTL 2.25e-02 -0.187 0.0811 0.184 CD8_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -205071 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0116 0.0747 0.184 CD8_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 294432 sc-eQTL 8.68e-01 0.0182 0.109 0.184 CD8_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 208970 sc-eQTL 5.62e-01 0.065 0.112 0.19 CD8_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 956709 sc-eQTL 8.53e-01 -0.021 0.113 0.19 CD8_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 956789 sc-eQTL 2.51e-01 0.114 0.099 0.19 CD8_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 826252 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00789 0.113 0.19 CD8_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 596814 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00114 0.0977 0.19 CD8_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -205071 sc-eQTL 6.55e-01 0.0424 0.0947 0.19 CD8_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 294432 sc-eQTL 4.97e-01 0.0782 0.115 0.19 CD8_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 208970 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0501 0.108 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 956709 sc-eQTL 3.07e-01 -0.115 0.113 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 956789 sc-eQTL 1.51e-01 -0.157 0.109 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 826252 sc-eQTL 8.20e-01 0.0252 0.111 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 596814 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00409 0.105 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -205071 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0894 0.11 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 294432 sc-eQTL 2.44e-01 -0.131 0.112 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 208970 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0805 0.0995 0.186 MAIT L2
ENSG00000116133 DHCR24 123098 sc-eQTL 9.20e-01 -0.00741 0.0738 0.186 MAIT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 956709 sc-eQTL 4.32e-01 0.0816 0.104 0.186 MAIT L2
ENSG00000116209 TMEM59 956789 sc-eQTL 6.13e-02 0.175 0.093 0.186 MAIT L2
ENSG00000116221 MRPL37 826252 sc-eQTL 6.23e-01 0.056 0.114 0.186 MAIT L2
ENSG00000157216 SSBP3 596814 sc-eQTL 1.80e-01 -0.135 0.101 0.186 MAIT L2
ENSG00000162402 USP24 -205071 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0275 0.0897 0.186 MAIT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 810257 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0139 0.104 0.186 MAIT L2
ENSG00000243725 TTC4 294432 sc-eQTL 9.09e-01 0.0119 0.104 0.186 MAIT L2
ENSG00000006555 TTC22 208970 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0139 0.113 0.184 NK_CD56bright L2
ENSG00000116133 DHCR24 123098 sc-eQTL 3.15e-01 0.1 0.0996 0.184 NK_CD56bright L2
ENSG00000116205 TCEANC2 956709 sc-eQTL 1.82e-01 0.141 0.105 0.184 NK_CD56bright L2
ENSG00000116209 TMEM59 956789 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00965 0.103 0.184 NK_CD56bright L2
ENSG00000116221 MRPL37 826252 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000652 0.115 0.184 NK_CD56bright L2
ENSG00000157216 SSBP3 596814 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0316 0.0866 0.184 NK_CD56bright L2
ENSG00000162398 LEXM 204230 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0696 0.102 0.184 NK_CD56bright L2
ENSG00000162402 USP24 -205071 sc-eQTL 6.72e-01 0.0373 0.088 0.184 NK_CD56bright L2
ENSG00000243725 TTC4 294432 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0743 0.111 0.184 NK_CD56bright L2
ENSG00000006555 TTC22 208970 sc-eQTL 4.16e-01 0.0766 0.094 0.181 NK_CD56dim L2
ENSG00000116133 DHCR24 123098 sc-eQTL 7.04e-01 0.0373 0.0982 0.181 NK_CD56dim L2
ENSG00000116205 TCEANC2 956709 sc-eQTL 8.65e-01 0.0181 0.106 0.181 NK_CD56dim L2
ENSG00000116209 TMEM59 956789 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0216 0.0789 0.181 NK_CD56dim L2
ENSG00000116221 MRPL37 826252 sc-eQTL 6.51e-02 -0.189 0.102 0.181 NK_CD56dim L2
ENSG00000157216 SSBP3 596814 sc-eQTL 4.22e-01 0.0674 0.0839 0.181 NK_CD56dim L2
ENSG00000162398 LEXM 204230 sc-eQTL 4.76e-01 0.0688 0.0965 0.181 NK_CD56dim L2
ENSG00000162402 USP24 -205071 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00179 0.0614 0.181 NK_CD56dim L2
ENSG00000243725 TTC4 294432 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0159 0.105 0.181 NK_CD56dim L2
ENSG00000006555 TTC22 208970 sc-eQTL 8.34e-01 0.024 0.114 0.187 NK_HLA L2
ENSG00000116133 DHCR24 123098 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0303 0.111 0.187 NK_HLA L2
ENSG00000116205 TCEANC2 956709 sc-eQTL 5.35e-01 0.0668 0.107 0.187 NK_HLA L2
ENSG00000116209 TMEM59 956789 sc-eQTL 3.32e-01 -0.104 0.106 0.187 NK_HLA L2
ENSG00000116221 MRPL37 826252 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0168 0.118 0.187 NK_HLA L2
ENSG00000157216 SSBP3 596814 sc-eQTL 5.82e-02 0.181 0.0951 0.187 NK_HLA L2
ENSG00000162398 LEXM 204230 sc-eQTL 7.22e-01 0.0386 0.108 0.187 NK_HLA L2
ENSG00000162402 USP24 -205071 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00545 0.0794 0.187 NK_HLA L2
ENSG00000243725 TTC4 294432 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0763 0.118 0.187 NK_HLA L2
ENSG00000006555 TTC22 208970 sc-eQTL 2.31e-01 0.123 0.102 0.181 NK_cytokine L2
ENSG00000116133 DHCR24 123098 sc-eQTL 6.48e-01 0.0473 0.103 0.181 NK_cytokine L2
ENSG00000116205 TCEANC2 956709 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0125 0.103 0.181 NK_cytokine L2
ENSG00000116209 TMEM59 956789 sc-eQTL 1.17e-02 -0.209 0.0823 0.181 NK_cytokine L2
ENSG00000116221 MRPL37 826252 sc-eQTL 5.18e-01 0.0666 0.103 0.181 NK_cytokine L2
ENSG00000157216 SSBP3 596814 sc-eQTL 4.85e-01 0.0603 0.0863 0.181 NK_cytokine L2
ENSG00000162398 LEXM 204230 sc-eQTL 5.37e-01 0.0668 0.108 0.181 NK_cytokine L2
ENSG00000162402 USP24 -205071 sc-eQTL 3.01e-01 -0.0761 0.0734 0.181 NK_cytokine L2
ENSG00000243725 TTC4 294432 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0199 0.109 0.181 NK_cytokine L2
ENSG00000006555 TTC22 208970 sc-eQTL 3.69e-03 -0.392 0.132 0.178 PB L2
ENSG00000116133 DHCR24 123098 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0342 0.122 0.178 PB L2
ENSG00000116205 TCEANC2 956709 sc-eQTL 5.59e-01 0.0866 0.148 0.178 PB L2
ENSG00000116209 TMEM59 956789 sc-eQTL 2.93e-01 -0.065 0.0616 0.178 PB L2
ENSG00000116221 MRPL37 826252 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0728 0.112 0.178 PB L2
ENSG00000157216 SSBP3 596814 sc-eQTL 3.38e-01 0.124 0.129 0.178 PB L2
ENSG00000162402 USP24 -205071 sc-eQTL 1.33e-01 -0.221 0.146 0.178 PB L2
ENSG00000215883 CYB5RL 810257 sc-eQTL 5.73e-01 0.0862 0.153 0.178 PB L2
ENSG00000243725 TTC4 294432 sc-eQTL 8.07e-01 0.0349 0.143 0.178 PB L2
ENSG00000006555 TTC22 208970 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0927 0.102 0.187 Pro_T L2
ENSG00000116133 DHCR24 123098 sc-eQTL 2.00e-01 0.111 0.0862 0.187 Pro_T L2
ENSG00000116205 TCEANC2 956709 sc-eQTL 6.40e-01 0.0494 0.106 0.187 Pro_T L2
ENSG00000116209 TMEM59 956789 sc-eQTL 6.00e-01 0.0385 0.0732 0.187 Pro_T L2
ENSG00000116221 MRPL37 826252 sc-eQTL 5.25e-01 0.0456 0.0717 0.187 Pro_T L2
ENSG00000157216 SSBP3 596814 sc-eQTL 2.32e-01 -0.0962 0.0802 0.187 Pro_T L2
ENSG00000162402 USP24 -205071 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0888 0.098 0.187 Pro_T L2
ENSG00000215883 CYB5RL 810257 sc-eQTL 5.19e-01 0.0625 0.0968 0.187 Pro_T L2
ENSG00000243725 TTC4 294432 sc-eQTL 8.02e-01 0.027 0.108 0.187 Pro_T L2
ENSG00000006555 TTC22 208970 sc-eQTL 5.70e-01 0.0569 0.0999 0.184 Treg L2
ENSG00000116205 TCEANC2 956709 sc-eQTL 6.40e-01 0.0501 0.107 0.184 Treg L2
ENSG00000116209 TMEM59 956789 sc-eQTL 4.96e-01 0.0577 0.0846 0.184 Treg L2
ENSG00000116221 MRPL37 826252 sc-eQTL 6.54e-01 0.047 0.105 0.184 Treg L2
ENSG00000157216 SSBP3 596814 sc-eQTL 3.00e-01 -0.0968 0.0932 0.184 Treg L2
ENSG00000162402 USP24 -205071 sc-eQTL 4.08e-01 0.0737 0.0889 0.184 Treg L2
ENSG00000243725 TTC4 294432 sc-eQTL 5.90e-01 0.0605 0.112 0.184 Treg L2
ENSG00000116133 DHCR24 123098 sc-eQTL 5.81e-02 -0.174 0.0911 0.185 cDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 956709 sc-eQTL 1.11e-01 -0.173 0.108 0.185 cDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 956789 sc-eQTL 2.67e-01 0.102 0.0919 0.185 cDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 826252 sc-eQTL 6.89e-01 0.0473 0.118 0.185 cDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 596814 sc-eQTL 5.97e-02 -0.204 0.108 0.185 cDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 468036 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0208 0.101 0.185 cDC L2
ENSG00000162402 USP24 -205071 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0519 0.113 0.185 cDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 810257 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0292 0.0974 0.185 cDC L2
ENSG00000243725 TTC4 294432 sc-eQTL 3.60e-01 -0.107 0.116 0.185 cDC L2
ENSG00000116133 DHCR24 123098 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0544 0.065 0.184 cMono_IL1B L2
ENSG00000116205 TCEANC2 956709 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0521 0.0904 0.184 cMono_IL1B L2
ENSG00000116209 TMEM59 956789 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0103 0.0549 0.184 cMono_IL1B L2
ENSG00000116221 MRPL37 826252 sc-eQTL 5.40e-02 0.188 0.0969 0.184 cMono_IL1B L2
ENSG00000157216 SSBP3 596814 sc-eQTL 3.13e-01 -0.101 0.0996 0.184 cMono_IL1B L2
ENSG00000162402 USP24 -205071 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0215 0.0737 0.184 cMono_IL1B L2
ENSG00000243725 TTC4 294432 sc-eQTL 6.69e-01 0.0483 0.113 0.184 cMono_IL1B L2
ENSG00000116133 DHCR24 123098 sc-eQTL 5.59e-01 0.0358 0.0611 0.184 cMono_S100A L2
ENSG00000116205 TCEANC2 956709 sc-eQTL 2.83e-01 0.1 0.0931 0.184 cMono_S100A L2
ENSG00000116209 TMEM59 956789 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0219 0.0747 0.184 cMono_S100A L2
ENSG00000116221 MRPL37 826252 sc-eQTL 6.79e-01 0.0448 0.108 0.184 cMono_S100A L2
ENSG00000157216 SSBP3 596814 sc-eQTL 7.09e-01 0.0418 0.112 0.184 cMono_S100A L2
ENSG00000162402 USP24 -205071 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0564 0.0906 0.184 cMono_S100A L2
ENSG00000243725 TTC4 294432 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0137 0.114 0.184 cMono_S100A L2
ENSG00000006555 TTC22 208970 sc-eQTL 5.46e-01 0.0619 0.102 0.197 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 123098 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0349 0.114 0.197 gdT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 956709 sc-eQTL 8.57e-01 0.0206 0.114 0.197 gdT L2
ENSG00000116209 TMEM59 956789 sc-eQTL 9.96e-01 0.000651 0.116 0.197 gdT L2
ENSG00000116221 MRPL37 826252 sc-eQTL 1.10e-01 0.212 0.132 0.197 gdT L2
ENSG00000157216 SSBP3 596814 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0179 0.0815 0.197 gdT L2
ENSG00000162402 USP24 -205071 sc-eQTL 9.64e-01 0.00497 0.11 0.197 gdT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 810257 sc-eQTL 5.37e-01 0.0704 0.114 0.197 gdT L2
ENSG00000243725 TTC4 294432 sc-eQTL 1.88e-01 0.169 0.127 0.197 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 123098 sc-eQTL 8.41e-02 -0.146 0.0841 0.18 intMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 956709 sc-eQTL 1.90e-02 0.246 0.104 0.18 intMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 956789 sc-eQTL 3.69e-01 -0.0697 0.0774 0.18 intMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 826252 sc-eQTL 3.56e-01 0.109 0.118 0.18 intMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 596814 sc-eQTL 6.96e-02 0.219 0.12 0.18 intMono L2
ENSG00000162402 USP24 -205071 sc-eQTL 2.55e-01 0.123 0.108 0.18 intMono L2
ENSG00000243725 TTC4 294432 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0798 0.115 0.18 intMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 123098 sc-eQTL 3.28e-01 -0.0788 0.0805 0.183 ncMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 956709 sc-eQTL 4.43e-01 0.0774 0.101 0.183 ncMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 956789 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0619 0.0806 0.183 ncMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 826252 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0608 0.104 0.183 ncMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 596814 sc-eQTL 7.38e-01 0.0382 0.114 0.183 ncMono L2
ENSG00000162402 USP24 -205071 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0214 0.091 0.183 ncMono L2
ENSG00000243725 TTC4 294432 sc-eQTL 3.44e-01 -0.102 0.107 0.183 ncMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 123098 sc-eQTL 8.71e-01 0.0157 0.0963 0.195 pDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 956709 sc-eQTL 3.13e-01 -0.116 0.115 0.195 pDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 956789 sc-eQTL 9.11e-02 0.155 0.0914 0.195 pDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 826252 sc-eQTL 8.87e-03 0.318 0.12 0.195 pDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 596814 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0442 0.109 0.195 pDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 468036 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0337 0.0457 0.195 pDC L2
ENSG00000162402 USP24 -205071 sc-eQTL 6.69e-01 0.033 0.0772 0.195 pDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 810257 sc-eQTL 2.73e-01 -0.116 0.105 0.195 pDC L2
ENSG00000243725 TTC4 294432 sc-eQTL 2.97e-01 -0.127 0.122 0.195 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 208970 sc-eQTL 3.25e-01 0.104 0.105 0.184 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 123098 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0849 0.106 0.184 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 956709 sc-eQTL 1.04e-01 -0.166 0.102 0.184 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 956789 sc-eQTL 6.21e-01 0.0394 0.0796 0.184 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 826252 sc-eQTL 5.59e-01 0.0557 0.0952 0.184 B_Memory LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 596814 sc-eQTL 2.60e-01 -0.0934 0.0827 0.184 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -205071 sc-eQTL 2.50e-01 0.0869 0.0754 0.184 B_Memory LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 810257 sc-eQTL 4.99e-01 0.0786 0.116 0.184 B_Memory LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 294432 sc-eQTL 3.38e-01 -0.0999 0.104 0.184 B_Memory LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 208970 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000707 0.113 0.184 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 123098 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0483 0.102 0.184 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 956709 sc-eQTL 1.54e-01 0.131 0.0916 0.184 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 956789 sc-eQTL 3.09e-01 -0.0665 0.0652 0.184 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 826252 sc-eQTL 5.40e-01 0.0577 0.094 0.184 B_Naive LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 596814 sc-eQTL 1.53e-01 -0.12 0.0837 0.184 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -205071 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0618 0.072 0.184 B_Naive LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 810257 sc-eQTL 1.29e-01 0.173 0.114 0.184 B_Naive LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 294432 sc-eQTL 1.01e-01 -0.176 0.107 0.184 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 123098 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0225 0.0631 0.184 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 956709 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0225 0.079 0.184 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 956789 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0199 0.0545 0.184 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 826252 sc-eQTL 4.30e-02 0.195 0.0955 0.184 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 596814 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0522 0.101 0.184 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -205071 sc-eQTL 2.41e-01 -0.0808 0.0688 0.184 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 294432 sc-eQTL 5.84e-01 0.0627 0.114 0.184 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 123098 sc-eQTL 1.76e-01 -0.105 0.0771 0.181 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 956709 sc-eQTL 3.21e-02 0.217 0.101 0.181 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 956789 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0433 0.0756 0.181 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 826252 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0243 0.104 0.181 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 596814 sc-eQTL 2.11e-01 0.138 0.11 0.181 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -205071 sc-eQTL 8.01e-01 -0.022 0.0872 0.181 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 294432 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0713 0.109 0.181 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 208970 sc-eQTL 1.89e-01 0.121 0.092 0.181 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 123098 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000515 0.0965 0.181 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 956709 sc-eQTL 7.62e-01 0.0287 0.0946 0.181 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 956789 sc-eQTL 1.88e-01 -0.0962 0.0729 0.181 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 826252 sc-eQTL 3.44e-01 -0.0927 0.0978 0.181 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 596814 sc-eQTL 2.13e-01 0.1 0.0801 0.181 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162398 LEXM 204230 sc-eQTL 3.09e-01 0.0922 0.0904 0.181 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -205071 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0432 0.0574 0.181 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 294432 sc-eQTL 9.49e-01 0.00657 0.102 0.181 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000198711 SSBP3-AS1 773853 eQTL 3.42e-02 -0.0536 0.0253 0.00138 0.0 0.161

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000162390 \N 468036 3.71e-07 2.4e-07 6.72e-08 2.58e-07 1.07e-07 1.32e-07 3.11e-07 8.11e-08 1.98e-07 1.21e-07 2.18e-07 1.72e-07 3.04e-07 8.42e-08 7.35e-08 1.1e-07 8.42e-08 2.43e-07 8e-08 8.1e-08 1.6e-07 2.09e-07 2.04e-07 4.91e-08 2.99e-07 1.82e-07 1.37e-07 1.44e-07 1.48e-07 1.85e-07 1.39e-07 7.71e-08 4.76e-08 1.03e-07 1.31e-07 5.23e-08 7.97e-08 6.56e-08 4.78e-08 7.53e-08 4.68e-08 2.41e-07 3.14e-08 1.77e-08 5.49e-08 9.65e-09 9.12e-08 2.99e-09 4.74e-08