logo

Genes within 1Mb (chr1:55009099:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 207776 sc-eQTL 6.26e-01 0.051 0.105 0.184 B L1
ENSG00000116133 DHCR24 121904 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0902 0.0987 0.184 B L1
ENSG00000116205 TCEANC2 955515 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0465 0.0853 0.184 B L1
ENSG00000116209 TMEM59 955595 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00297 0.052 0.184 B L1
ENSG00000116221 MRPL37 825058 sc-eQTL 1.56e-01 0.0964 0.0677 0.184 B L1
ENSG00000157216 SSBP3 595620 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0319 0.0712 0.184 B L1
ENSG00000162402 USP24 -206265 sc-eQTL 4.92e-01 0.0414 0.0603 0.184 B L1
ENSG00000215883 CYB5RL 809063 sc-eQTL 1.20e-01 0.18 0.115 0.184 B L1
ENSG00000243725 TTC4 293238 sc-eQTL 1.95e-01 -0.131 0.101 0.184 B L1
ENSG00000006555 TTC22 207776 sc-eQTL 5.08e-01 0.0536 0.0809 0.184 CD4T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 955515 sc-eQTL 5.10e-01 0.0436 0.0662 0.184 CD4T L1
ENSG00000116209 TMEM59 955595 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0502 0.0616 0.184 CD4T L1
ENSG00000116221 MRPL37 825058 sc-eQTL 2.62e-01 0.0957 0.085 0.184 CD4T L1
ENSG00000157216 SSBP3 595620 sc-eQTL 8.87e-01 0.01 0.0708 0.184 CD4T L1
ENSG00000162402 USP24 -206265 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0165 0.0577 0.184 CD4T L1
ENSG00000243725 TTC4 293238 sc-eQTL 3.40e-01 -0.0828 0.0866 0.184 CD4T L1
ENSG00000006555 TTC22 207776 sc-eQTL 1.44e-01 -0.102 0.0698 0.184 CD8T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 955515 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0503 0.0873 0.184 CD8T L1
ENSG00000116209 TMEM59 955595 sc-eQTL 8.97e-01 -0.00784 0.0606 0.184 CD8T L1
ENSG00000116221 MRPL37 825058 sc-eQTL 6.66e-01 0.0361 0.0834 0.184 CD8T L1
ENSG00000157216 SSBP3 595620 sc-eQTL 9.95e-02 -0.0986 0.0596 0.184 CD8T L1
ENSG00000162402 USP24 -206265 sc-eQTL 1.41e-01 -0.0854 0.0577 0.184 CD8T L1
ENSG00000243725 TTC4 293238 sc-eQTL 9.67e-01 0.00419 0.101 0.184 CD8T L1
ENSG00000116133 DHCR24 121904 sc-eQTL 1.76e-01 -0.127 0.0932 0.185 DC L1
ENSG00000116205 TCEANC2 955515 sc-eQTL 1.43e-01 -0.153 0.104 0.185 DC L1
ENSG00000116209 TMEM59 955595 sc-eQTL 1.85e-01 0.109 0.0821 0.185 DC L1
ENSG00000116221 MRPL37 825058 sc-eQTL 5.60e-02 0.211 0.11 0.185 DC L1
ENSG00000157216 SSBP3 595620 sc-eQTL 2.71e-02 -0.217 0.0976 0.185 DC L1
ENSG00000162390 ACOT11 466842 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00417 0.095 0.185 DC L1
ENSG00000162402 USP24 -206265 sc-eQTL 8.37e-01 0.0118 0.0573 0.185 DC L1
ENSG00000215883 CYB5RL 809063 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0354 0.104 0.185 DC L1
ENSG00000243725 TTC4 293238 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0668 0.111 0.185 DC L1
ENSG00000116133 DHCR24 121904 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0525 0.0671 0.184 Mono L1
ENSG00000116205 TCEANC2 955515 sc-eQTL 6.96e-01 0.0283 0.0725 0.184 Mono L1
ENSG00000116209 TMEM59 955595 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0231 0.0538 0.184 Mono L1
ENSG00000116221 MRPL37 825058 sc-eQTL 1.20e-01 0.14 0.0895 0.184 Mono L1
ENSG00000157216 SSBP3 595620 sc-eQTL 9.29e-01 -0.00919 0.103 0.184 Mono L1
ENSG00000162402 USP24 -206265 sc-eQTL 1.34e-01 -0.0921 0.0612 0.184 Mono L1
ENSG00000243725 TTC4 293238 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0201 0.108 0.184 Mono L1
ENSG00000006555 TTC22 207776 sc-eQTL 1.45e-01 0.137 0.0937 0.182 NK L1
ENSG00000116133 DHCR24 121904 sc-eQTL 7.98e-01 0.0244 0.095 0.182 NK L1
ENSG00000116205 TCEANC2 955515 sc-eQTL 6.85e-01 0.0381 0.0937 0.182 NK L1
ENSG00000116209 TMEM59 955595 sc-eQTL 3.13e-01 -0.0741 0.0733 0.182 NK L1
ENSG00000116221 MRPL37 825058 sc-eQTL 2.80e-01 -0.0986 0.0911 0.182 NK L1
ENSG00000157216 SSBP3 595620 sc-eQTL 2.71e-01 0.0871 0.079 0.182 NK L1
ENSG00000162398 LEXM 203036 sc-eQTL 2.82e-01 0.0957 0.0886 0.182 NK L1
ENSG00000162402 USP24 -206265 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0328 0.0538 0.182 NK L1
ENSG00000243725 TTC4 293238 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0648 0.102 0.182 NK L1
ENSG00000006555 TTC22 207776 sc-eQTL 9.90e-02 -0.136 0.0821 0.184 Other_T L1
ENSG00000116133 DHCR24 121904 sc-eQTL 5.09e-01 0.0423 0.0641 0.184 Other_T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 955515 sc-eQTL 8.68e-01 -0.016 0.0959 0.184 Other_T L1
ENSG00000116209 TMEM59 955595 sc-eQTL 5.40e-01 0.0404 0.0658 0.184 Other_T L1
ENSG00000116221 MRPL37 825058 sc-eQTL 1.07e-01 0.0993 0.0613 0.184 Other_T L1
ENSG00000157216 SSBP3 595620 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0154 0.0713 0.184 Other_T L1
ENSG00000162402 USP24 -206265 sc-eQTL 3.60e-01 -0.0695 0.0758 0.184 Other_T L1
ENSG00000215883 CYB5RL 809063 sc-eQTL 5.77e-01 0.058 0.104 0.184 Other_T L1
ENSG00000243725 TTC4 293238 sc-eQTL 8.76e-01 0.0161 0.103 0.184 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 207776 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0167 0.0902 0.184 B_Activated L2
ENSG00000116133 DHCR24 121904 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0971 0.106 0.184 B_Activated L2
ENSG00000116205 TCEANC2 955515 sc-eQTL 7.64e-01 0.0341 0.114 0.184 B_Activated L2
ENSG00000116209 TMEM59 955595 sc-eQTL 7.36e-01 0.0409 0.121 0.184 B_Activated L2
ENSG00000116221 MRPL37 825058 sc-eQTL 5.02e-01 0.0877 0.13 0.184 B_Activated L2
ENSG00000157216 SSBP3 595620 sc-eQTL 6.79e-01 -0.049 0.118 0.184 B_Activated L2
ENSG00000162402 USP24 -206265 sc-eQTL 4.24e-01 0.0922 0.115 0.184 B_Activated L2
ENSG00000215883 CYB5RL 809063 sc-eQTL 2.88e-01 -0.108 0.101 0.184 B_Activated L2
ENSG00000243725 TTC4 293238 sc-eQTL 2.37e-01 0.13 0.11 0.184 B_Activated L2
ENSG00000006555 TTC22 207776 sc-eQTL 1.58e-01 0.156 0.11 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000116133 DHCR24 121904 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0431 0.103 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000116205 TCEANC2 955515 sc-eQTL 2.69e-02 -0.226 0.101 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000116209 TMEM59 955595 sc-eQTL 9.99e-01 -0.0001 0.0877 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000116221 MRPL37 825058 sc-eQTL 5.76e-02 0.195 0.102 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000157216 SSBP3 595620 sc-eQTL 1.28e-01 -0.147 0.0958 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000162402 USP24 -206265 sc-eQTL 4.87e-01 0.0564 0.0811 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000215883 CYB5RL 809063 sc-eQTL 3.22e-01 0.114 0.115 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000243725 TTC4 293238 sc-eQTL 6.74e-01 -0.044 0.104 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000006555 TTC22 207776 sc-eQTL 2.50e-01 -0.121 0.105 0.185 B_Memory L2
ENSG00000116133 DHCR24 121904 sc-eQTL 1.83e-01 -0.139 0.104 0.185 B_Memory L2
ENSG00000116205 TCEANC2 955515 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0253 0.112 0.185 B_Memory L2
ENSG00000116209 TMEM59 955595 sc-eQTL 8.90e-02 0.158 0.0925 0.185 B_Memory L2
ENSG00000116221 MRPL37 825058 sc-eQTL 2.67e-01 -0.105 0.094 0.185 B_Memory L2
ENSG00000157216 SSBP3 595620 sc-eQTL 9.49e-01 0.00562 0.088 0.185 B_Memory L2
ENSG00000162402 USP24 -206265 sc-eQTL 3.05e-01 0.0884 0.0859 0.185 B_Memory L2
ENSG00000215883 CYB5RL 809063 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0691 0.106 0.185 B_Memory L2
ENSG00000243725 TTC4 293238 sc-eQTL 8.17e-01 0.0256 0.11 0.185 B_Memory L2
ENSG00000006555 TTC22 207776 sc-eQTL 3.82e-01 0.0978 0.112 0.184 B_Naive1 L2
ENSG00000116133 DHCR24 121904 sc-eQTL 8.57e-01 0.0189 0.105 0.184 B_Naive1 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 955515 sc-eQTL 6.74e-03 0.252 0.0919 0.184 B_Naive1 L2
ENSG00000116209 TMEM59 955595 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0362 0.0679 0.184 B_Naive1 L2
ENSG00000116221 MRPL37 825058 sc-eQTL 6.11e-01 0.051 0.1 0.184 B_Naive1 L2
ENSG00000157216 SSBP3 595620 sc-eQTL 2.76e-02 -0.209 0.0944 0.184 B_Naive1 L2
ENSG00000162402 USP24 -206265 sc-eQTL 1.03e-01 -0.122 0.0747 0.184 B_Naive1 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 809063 sc-eQTL 1.08e-02 0.287 0.112 0.184 B_Naive1 L2
ENSG00000243725 TTC4 293238 sc-eQTL 8.61e-02 -0.175 0.102 0.184 B_Naive1 L2
ENSG00000006555 TTC22 207776 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0418 0.112 0.185 B_Naive2 L2
ENSG00000116133 DHCR24 121904 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0477 0.0975 0.185 B_Naive2 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 955515 sc-eQTL 2.80e-01 -0.117 0.108 0.185 B_Naive2 L2
ENSG00000116209 TMEM59 955595 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0106 0.0891 0.185 B_Naive2 L2
ENSG00000116221 MRPL37 825058 sc-eQTL 8.82e-01 0.0156 0.105 0.185 B_Naive2 L2
ENSG00000157216 SSBP3 595620 sc-eQTL 6.36e-01 0.049 0.103 0.185 B_Naive2 L2
ENSG00000162402 USP24 -206265 sc-eQTL 7.95e-01 0.0213 0.0819 0.185 B_Naive2 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 809063 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0458 0.115 0.185 B_Naive2 L2
ENSG00000243725 TTC4 293238 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0407 0.12 0.185 B_Naive2 L2
ENSG00000006555 TTC22 207776 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0387 0.104 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 955515 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0155 0.108 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 955595 sc-eQTL 8.09e-01 0.0236 0.0978 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 825058 sc-eQTL 1.58e-01 0.169 0.12 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 595620 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0232 0.074 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -206265 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0366 0.102 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 293238 sc-eQTL 5.31e-02 0.219 0.113 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 207776 sc-eQTL 1.58e-01 0.134 0.0945 0.184 CD4_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 955515 sc-eQTL 4.37e-01 0.0562 0.0721 0.184 CD4_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 955595 sc-eQTL 2.37e-01 -0.083 0.07 0.184 CD4_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 825058 sc-eQTL 2.25e-01 0.11 0.0902 0.184 CD4_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 595620 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0224 0.0723 0.184 CD4_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -206265 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0493 0.0623 0.184 CD4_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 293238 sc-eQTL 4.18e-01 -0.077 0.0949 0.184 CD4_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 207776 sc-eQTL 2.56e-01 0.113 0.0991 0.184 CD4_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 955515 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0278 0.0966 0.184 CD4_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 955595 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0129 0.0729 0.184 CD4_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 825058 sc-eQTL 1.64e-01 0.128 0.0913 0.184 CD4_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 595620 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0737 0.0898 0.184 CD4_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -206265 sc-eQTL 9.54e-01 0.00427 0.0745 0.184 CD4_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 293238 sc-eQTL 5.32e-01 0.0671 0.107 0.184 CD4_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 207776 sc-eQTL 8.91e-01 0.0158 0.115 0.184 CD4_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 955515 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0444 0.109 0.184 CD4_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 955595 sc-eQTL 7.14e-02 -0.152 0.0839 0.184 CD4_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 825058 sc-eQTL 2.98e-01 -0.113 0.109 0.184 CD4_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 595620 sc-eQTL 4.94e-01 0.0638 0.0932 0.184 CD4_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -206265 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0688 0.0848 0.184 CD4_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 293238 sc-eQTL 2.95e-01 -0.117 0.112 0.184 CD4_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 207776 sc-eQTL 1.25e-01 -0.142 0.0925 0.184 CD8_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 955515 sc-eQTL 2.91e-01 0.109 0.103 0.184 CD8_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 955595 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0467 0.0895 0.184 CD8_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 825058 sc-eQTL 9.62e-01 0.00508 0.106 0.184 CD8_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 595620 sc-eQTL 3.48e-01 -0.0681 0.0724 0.184 CD8_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -206265 sc-eQTL 2.06e-01 -0.0912 0.0719 0.184 CD8_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 293238 sc-eQTL 7.27e-01 0.0377 0.108 0.184 CD8_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 207776 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0583 0.102 0.184 CD8_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 955515 sc-eQTL 3.05e-02 -0.2 0.0917 0.184 CD8_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 955595 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0611 0.0906 0.184 CD8_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 825058 sc-eQTL 3.82e-01 0.0951 0.109 0.184 CD8_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 595620 sc-eQTL 1.43e-02 -0.201 0.0812 0.184 CD8_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -206265 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0309 0.0748 0.184 CD8_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 293238 sc-eQTL 8.57e-01 0.0198 0.11 0.184 CD8_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 207776 sc-eQTL 5.91e-01 0.0602 0.112 0.19 CD8_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 955515 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0477 0.113 0.19 CD8_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 955595 sc-eQTL 2.59e-01 0.112 0.0989 0.19 CD8_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 825058 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0113 0.112 0.19 CD8_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 595620 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0108 0.0976 0.19 CD8_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -206265 sc-eQTL 6.53e-01 0.0426 0.0946 0.19 CD8_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 293238 sc-eQTL 5.90e-01 0.062 0.115 0.19 CD8_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 207776 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0464 0.108 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 955515 sc-eQTL 2.58e-01 -0.128 0.113 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 955595 sc-eQTL 1.49e-01 -0.157 0.109 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 825058 sc-eQTL 6.40e-01 0.0518 0.111 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 595620 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000492 0.105 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -206265 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0923 0.11 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 293238 sc-eQTL 2.16e-01 -0.139 0.112 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 207776 sc-eQTL 3.37e-01 -0.0955 0.0993 0.186 MAIT L2
ENSG00000116133 DHCR24 121904 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0107 0.0736 0.186 MAIT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 955515 sc-eQTL 4.69e-01 0.0751 0.104 0.186 MAIT L2
ENSG00000116209 TMEM59 955595 sc-eQTL 6.27e-02 0.174 0.0929 0.186 MAIT L2
ENSG00000116221 MRPL37 825058 sc-eQTL 6.50e-01 0.0518 0.114 0.186 MAIT L2
ENSG00000157216 SSBP3 595620 sc-eQTL 2.05e-01 -0.128 0.1 0.186 MAIT L2
ENSG00000162402 USP24 -206265 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0325 0.0895 0.186 MAIT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 809063 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0233 0.104 0.186 MAIT L2
ENSG00000243725 TTC4 293238 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0132 0.103 0.186 MAIT L2
ENSG00000006555 TTC22 207776 sc-eQTL 8.49e-01 0.0215 0.113 0.184 NK_CD56bright L2
ENSG00000116133 DHCR24 121904 sc-eQTL 2.50e-01 0.115 0.0997 0.184 NK_CD56bright L2
ENSG00000116205 TCEANC2 955515 sc-eQTL 1.36e-01 0.157 0.105 0.184 NK_CD56bright L2
ENSG00000116209 TMEM59 955595 sc-eQTL 8.77e-01 0.016 0.103 0.184 NK_CD56bright L2
ENSG00000116221 MRPL37 825058 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0309 0.115 0.184 NK_CD56bright L2
ENSG00000157216 SSBP3 595620 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0526 0.0867 0.184 NK_CD56bright L2
ENSG00000162398 LEXM 203036 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0524 0.102 0.184 NK_CD56bright L2
ENSG00000162402 USP24 -206265 sc-eQTL 5.31e-01 0.0552 0.0881 0.184 NK_CD56bright L2
ENSG00000243725 TTC4 293238 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0863 0.111 0.184 NK_CD56bright L2
ENSG00000006555 TTC22 207776 sc-eQTL 2.93e-01 0.0988 0.0938 0.181 NK_CD56dim L2
ENSG00000116133 DHCR24 121904 sc-eQTL 6.95e-01 0.0385 0.098 0.181 NK_CD56dim L2
ENSG00000116205 TCEANC2 955515 sc-eQTL 9.77e-01 0.00309 0.106 0.181 NK_CD56dim L2
ENSG00000116209 TMEM59 955595 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0137 0.0787 0.181 NK_CD56dim L2
ENSG00000116221 MRPL37 825058 sc-eQTL 5.73e-02 -0.194 0.102 0.181 NK_CD56dim L2
ENSG00000157216 SSBP3 595620 sc-eQTL 5.21e-01 0.0538 0.0838 0.181 NK_CD56dim L2
ENSG00000162398 LEXM 203036 sc-eQTL 3.76e-01 0.0853 0.0962 0.181 NK_CD56dim L2
ENSG00000162402 USP24 -206265 sc-eQTL 8.71e-01 -0.00998 0.0613 0.181 NK_CD56dim L2
ENSG00000243725 TTC4 293238 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00497 0.105 0.181 NK_CD56dim L2
ENSG00000006555 TTC22 207776 sc-eQTL 8.32e-01 0.0243 0.114 0.187 NK_HLA L2
ENSG00000116133 DHCR24 121904 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0466 0.112 0.187 NK_HLA L2
ENSG00000116205 TCEANC2 955515 sc-eQTL 3.12e-01 0.109 0.107 0.187 NK_HLA L2
ENSG00000116209 TMEM59 955595 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0963 0.107 0.187 NK_HLA L2
ENSG00000116221 MRPL37 825058 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0325 0.118 0.187 NK_HLA L2
ENSG00000157216 SSBP3 595620 sc-eQTL 6.75e-02 0.175 0.0953 0.187 NK_HLA L2
ENSG00000162398 LEXM 203036 sc-eQTL 7.37e-01 0.0365 0.108 0.187 NK_HLA L2
ENSG00000162402 USP24 -206265 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00106 0.0796 0.187 NK_HLA L2
ENSG00000243725 TTC4 293238 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0977 0.119 0.187 NK_HLA L2
ENSG00000006555 TTC22 207776 sc-eQTL 1.82e-01 0.136 0.102 0.181 NK_cytokine L2
ENSG00000116133 DHCR24 121904 sc-eQTL 6.84e-01 0.0421 0.103 0.181 NK_cytokine L2
ENSG00000116205 TCEANC2 955515 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0283 0.103 0.181 NK_cytokine L2
ENSG00000116209 TMEM59 955595 sc-eQTL 1.39e-02 -0.204 0.0822 0.181 NK_cytokine L2
ENSG00000116221 MRPL37 825058 sc-eQTL 4.47e-01 0.0783 0.103 0.181 NK_cytokine L2
ENSG00000157216 SSBP3 595620 sc-eQTL 5.99e-01 0.0454 0.0862 0.181 NK_cytokine L2
ENSG00000162398 LEXM 203036 sc-eQTL 2.82e-01 0.116 0.107 0.181 NK_cytokine L2
ENSG00000162402 USP24 -206265 sc-eQTL 2.13e-01 -0.0915 0.0732 0.181 NK_cytokine L2
ENSG00000243725 TTC4 293238 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0248 0.109 0.181 NK_cytokine L2
ENSG00000006555 TTC22 207776 sc-eQTL 4.47e-03 -0.379 0.131 0.178 PB L2
ENSG00000116133 DHCR24 121904 sc-eQTL 9.75e-01 0.00374 0.12 0.178 PB L2
ENSG00000116205 TCEANC2 955515 sc-eQTL 3.94e-01 0.125 0.146 0.178 PB L2
ENSG00000116209 TMEM59 955595 sc-eQTL 3.16e-01 -0.0612 0.0608 0.178 PB L2
ENSG00000116221 MRPL37 825058 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0188 0.111 0.178 PB L2
ENSG00000157216 SSBP3 595620 sc-eQTL 2.18e-01 0.158 0.127 0.178 PB L2
ENSG00000162402 USP24 -206265 sc-eQTL 8.98e-02 -0.246 0.144 0.178 PB L2
ENSG00000215883 CYB5RL 809063 sc-eQTL 7.34e-01 0.0513 0.151 0.178 PB L2
ENSG00000243725 TTC4 293238 sc-eQTL 8.71e-01 -0.023 0.141 0.178 PB L2
ENSG00000006555 TTC22 207776 sc-eQTL 4.62e-01 -0.075 0.102 0.187 Pro_T L2
ENSG00000116133 DHCR24 121904 sc-eQTL 2.83e-01 0.0931 0.0865 0.187 Pro_T L2
ENSG00000116205 TCEANC2 955515 sc-eQTL 6.49e-01 0.0482 0.106 0.187 Pro_T L2
ENSG00000116209 TMEM59 955595 sc-eQTL 6.44e-01 0.034 0.0734 0.187 Pro_T L2
ENSG00000116221 MRPL37 825058 sc-eQTL 5.34e-01 0.0448 0.0719 0.187 Pro_T L2
ENSG00000157216 SSBP3 595620 sc-eQTL 1.21e-01 -0.125 0.0802 0.187 Pro_T L2
ENSG00000162402 USP24 -206265 sc-eQTL 2.49e-01 -0.113 0.0981 0.187 Pro_T L2
ENSG00000215883 CYB5RL 809063 sc-eQTL 5.29e-01 0.0612 0.097 0.187 Pro_T L2
ENSG00000243725 TTC4 293238 sc-eQTL 8.81e-01 0.0162 0.108 0.187 Pro_T L2
ENSG00000006555 TTC22 207776 sc-eQTL 5.31e-01 0.0626 0.0999 0.184 Treg L2
ENSG00000116205 TCEANC2 955515 sc-eQTL 4.57e-01 0.0797 0.107 0.184 Treg L2
ENSG00000116209 TMEM59 955595 sc-eQTL 4.88e-01 0.0588 0.0845 0.184 Treg L2
ENSG00000116221 MRPL37 825058 sc-eQTL 6.61e-01 0.0459 0.105 0.184 Treg L2
ENSG00000157216 SSBP3 595620 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0818 0.0933 0.184 Treg L2
ENSG00000162402 USP24 -206265 sc-eQTL 6.92e-01 0.0354 0.089 0.184 Treg L2
ENSG00000243725 TTC4 293238 sc-eQTL 6.15e-01 0.0564 0.112 0.184 Treg L2
ENSG00000116133 DHCR24 121904 sc-eQTL 6.42e-02 -0.171 0.0916 0.185 cDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 955515 sc-eQTL 7.63e-02 -0.193 0.108 0.185 cDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 955595 sc-eQTL 1.90e-01 0.121 0.0922 0.185 cDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 825058 sc-eQTL 7.10e-01 0.0442 0.118 0.185 cDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 595620 sc-eQTL 7.76e-02 -0.192 0.108 0.185 cDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 466842 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00135 0.102 0.185 cDC L2
ENSG00000162402 USP24 -206265 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0446 0.114 0.185 cDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 809063 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0321 0.0978 0.185 cDC L2
ENSG00000243725 TTC4 293238 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0825 0.117 0.185 cDC L2
ENSG00000116133 DHCR24 121904 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0561 0.0652 0.184 cMono_IL1B L2
ENSG00000116205 TCEANC2 955515 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0508 0.0906 0.184 cMono_IL1B L2
ENSG00000116209 TMEM59 955595 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00114 0.055 0.184 cMono_IL1B L2
ENSG00000116221 MRPL37 825058 sc-eQTL 9.99e-02 0.161 0.0974 0.184 cMono_IL1B L2
ENSG00000157216 SSBP3 595620 sc-eQTL 3.10e-01 -0.101 0.0998 0.184 cMono_IL1B L2
ENSG00000162402 USP24 -206265 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0303 0.0738 0.184 cMono_IL1B L2
ENSG00000243725 TTC4 293238 sc-eQTL 6.78e-01 0.047 0.113 0.184 cMono_IL1B L2
ENSG00000116133 DHCR24 121904 sc-eQTL 6.40e-01 0.0287 0.0612 0.184 cMono_S100A L2
ENSG00000116205 TCEANC2 955515 sc-eQTL 2.72e-01 0.103 0.0932 0.184 cMono_S100A L2
ENSG00000116209 TMEM59 955595 sc-eQTL 9.39e-01 -0.0057 0.0748 0.184 cMono_S100A L2
ENSG00000116221 MRPL37 825058 sc-eQTL 5.93e-01 0.0578 0.108 0.184 cMono_S100A L2
ENSG00000157216 SSBP3 595620 sc-eQTL 6.52e-01 0.0506 0.112 0.184 cMono_S100A L2
ENSG00000162402 USP24 -206265 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0643 0.0907 0.184 cMono_S100A L2
ENSG00000243725 TTC4 293238 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0188 0.114 0.184 cMono_S100A L2
ENSG00000006555 TTC22 207776 sc-eQTL 5.00e-01 0.0689 0.102 0.194 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 121904 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0416 0.114 0.194 gdT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 955515 sc-eQTL 8.72e-01 0.0184 0.114 0.194 gdT L2
ENSG00000116209 TMEM59 955595 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0134 0.116 0.194 gdT L2
ENSG00000116221 MRPL37 825058 sc-eQTL 8.71e-02 0.227 0.132 0.194 gdT L2
ENSG00000157216 SSBP3 595620 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0228 0.0814 0.194 gdT L2
ENSG00000162402 USP24 -206265 sc-eQTL 9.41e-01 0.0081 0.109 0.194 gdT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 809063 sc-eQTL 5.72e-01 0.0643 0.114 0.194 gdT L2
ENSG00000243725 TTC4 293238 sc-eQTL 1.96e-01 0.165 0.127 0.194 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 121904 sc-eQTL 1.27e-01 -0.129 0.0845 0.18 intMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 955515 sc-eQTL 1.42e-02 0.258 0.104 0.18 intMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 955595 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0495 0.0777 0.18 intMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 825058 sc-eQTL 3.27e-01 0.117 0.119 0.18 intMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 595620 sc-eQTL 7.27e-02 0.217 0.12 0.18 intMono L2
ENSG00000162402 USP24 -206265 sc-eQTL 2.20e-01 0.133 0.108 0.18 intMono L2
ENSG00000243725 TTC4 293238 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0768 0.115 0.18 intMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 121904 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0716 0.0806 0.183 ncMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 955515 sc-eQTL 4.63e-01 0.0741 0.101 0.183 ncMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 955595 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0361 0.0807 0.183 ncMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 825058 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0816 0.104 0.183 ncMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 595620 sc-eQTL 8.78e-01 0.0175 0.114 0.183 ncMono L2
ENSG00000162402 USP24 -206265 sc-eQTL 9.04e-01 -0.011 0.091 0.183 ncMono L2
ENSG00000243725 TTC4 293238 sc-eQTL 3.39e-01 -0.103 0.108 0.183 ncMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 121904 sc-eQTL 8.47e-01 0.0186 0.0963 0.195 pDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 955515 sc-eQTL 3.85e-01 -0.1 0.115 0.195 pDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 955595 sc-eQTL 5.76e-02 0.174 0.0912 0.195 pDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 825058 sc-eQTL 5.09e-03 0.34 0.119 0.195 pDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 595620 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0471 0.109 0.195 pDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 466842 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0362 0.0457 0.195 pDC L2
ENSG00000162402 USP24 -206265 sc-eQTL 7.34e-01 0.0263 0.0772 0.195 pDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 809063 sc-eQTL 1.64e-01 -0.147 0.105 0.195 pDC L2
ENSG00000243725 TTC4 293238 sc-eQTL 3.06e-01 -0.125 0.122 0.195 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 207776 sc-eQTL 1.83e-01 0.141 0.105 0.184 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 121904 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0888 0.106 0.184 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 955515 sc-eQTL 1.04e-01 -0.167 0.102 0.184 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 955595 sc-eQTL 3.96e-01 0.0679 0.0798 0.184 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 825058 sc-eQTL 4.99e-01 0.0647 0.0956 0.184 B_Memory LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 595620 sc-eQTL 2.48e-01 -0.0961 0.083 0.184 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -206265 sc-eQTL 1.97e-01 0.0978 0.0756 0.184 B_Memory LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 809063 sc-eQTL 5.20e-01 0.0751 0.117 0.184 B_Memory LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 293238 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0581 0.105 0.184 B_Memory LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 207776 sc-eQTL 9.33e-01 0.00953 0.113 0.184 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 121904 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0624 0.102 0.184 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 955515 sc-eQTL 2.14e-01 0.115 0.092 0.184 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 955595 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0442 0.0655 0.184 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 825058 sc-eQTL 4.90e-01 0.0652 0.0942 0.184 B_Naive LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 595620 sc-eQTL 1.43e-01 -0.123 0.0839 0.184 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -206265 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0645 0.0722 0.184 B_Naive LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 809063 sc-eQTL 1.04e-01 0.186 0.114 0.184 B_Naive LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 293238 sc-eQTL 8.26e-02 -0.187 0.107 0.184 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 121904 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0261 0.0633 0.184 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 955515 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0167 0.0792 0.184 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 955595 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0143 0.0546 0.184 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 825058 sc-eQTL 5.16e-02 0.188 0.0958 0.184 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 595620 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0512 0.101 0.184 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -206265 sc-eQTL 2.11e-01 -0.0866 0.0689 0.184 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 293238 sc-eQTL 5.96e-01 0.0609 0.115 0.184 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 121904 sc-eQTL 2.41e-01 -0.091 0.0774 0.181 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 955515 sc-eQTL 2.74e-02 0.224 0.101 0.181 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 955595 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0223 0.0759 0.181 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 825058 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0274 0.104 0.181 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 595620 sc-eQTL 2.63e-01 0.124 0.111 0.181 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -206265 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0124 0.0874 0.181 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 293238 sc-eQTL 5.00e-01 -0.074 0.11 0.181 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 207776 sc-eQTL 1.25e-01 0.141 0.0916 0.181 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 121904 sc-eQTL 9.78e-01 -0.0027 0.0962 0.181 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 955515 sc-eQTL 8.80e-01 0.0143 0.0944 0.181 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 955595 sc-eQTL 2.32e-01 -0.0873 0.0727 0.181 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 825058 sc-eQTL 3.44e-01 -0.0925 0.0976 0.181 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 595620 sc-eQTL 2.94e-01 0.0843 0.08 0.181 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162398 LEXM 203036 sc-eQTL 1.42e-01 0.133 0.09 0.181 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -206265 sc-eQTL 3.34e-01 -0.0554 0.0572 0.181 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 293238 sc-eQTL 9.25e-01 0.00965 0.102 0.181 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000198711 SSBP3-AS1 772659 eQTL 2.37e-02 -0.0571 0.0252 0.0018 0.0 0.159

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000162390 \N 466842 4.37e-07 2.56e-07 7.72e-08 2.92e-07 1.03e-07 1.26e-07 3.42e-07 7.56e-08 2.26e-07 1.28e-07 2.47e-07 1.96e-07 4.05e-07 8.55e-08 7.79e-08 1.14e-07 6.63e-08 2.66e-07 9.19e-08 7.49e-08 1.39e-07 2.07e-07 1.89e-07 5.11e-08 3.55e-07 1.76e-07 1.57e-07 1.54e-07 1.58e-07 2.1e-07 1.71e-07 6.68e-08 4.96e-08 1.23e-07 1.69e-07 5.14e-08 6.67e-08 7.51e-08 6.08e-08 8.16e-08 5.23e-08 2.41e-07 3.59e-08 1.78e-08 5.4e-08 8.76e-09 9.25e-08 2.85e-09 4.66e-08