logo

Genes within 1Mb (chr1:55008652:A:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 207329 sc-eQTL 6.26e-01 0.051 0.105 0.184 B L1
ENSG00000116133 DHCR24 121457 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0902 0.0987 0.184 B L1
ENSG00000116205 TCEANC2 955068 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0465 0.0853 0.184 B L1
ENSG00000116209 TMEM59 955148 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00297 0.052 0.184 B L1
ENSG00000116221 MRPL37 824611 sc-eQTL 1.56e-01 0.0964 0.0677 0.184 B L1
ENSG00000157216 SSBP3 595173 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0319 0.0712 0.184 B L1
ENSG00000162402 USP24 -206712 sc-eQTL 4.92e-01 0.0414 0.0603 0.184 B L1
ENSG00000215883 CYB5RL 808616 sc-eQTL 1.20e-01 0.18 0.115 0.184 B L1
ENSG00000243725 TTC4 292791 sc-eQTL 1.95e-01 -0.131 0.101 0.184 B L1
ENSG00000006555 TTC22 207329 sc-eQTL 5.08e-01 0.0536 0.0809 0.184 CD4T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 955068 sc-eQTL 5.10e-01 0.0436 0.0662 0.184 CD4T L1
ENSG00000116209 TMEM59 955148 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0502 0.0616 0.184 CD4T L1
ENSG00000116221 MRPL37 824611 sc-eQTL 2.62e-01 0.0957 0.085 0.184 CD4T L1
ENSG00000157216 SSBP3 595173 sc-eQTL 8.87e-01 0.01 0.0708 0.184 CD4T L1
ENSG00000162402 USP24 -206712 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0165 0.0577 0.184 CD4T L1
ENSG00000243725 TTC4 292791 sc-eQTL 3.40e-01 -0.0828 0.0866 0.184 CD4T L1
ENSG00000006555 TTC22 207329 sc-eQTL 1.44e-01 -0.102 0.0698 0.184 CD8T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 955068 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0503 0.0873 0.184 CD8T L1
ENSG00000116209 TMEM59 955148 sc-eQTL 8.97e-01 -0.00784 0.0606 0.184 CD8T L1
ENSG00000116221 MRPL37 824611 sc-eQTL 6.66e-01 0.0361 0.0834 0.184 CD8T L1
ENSG00000157216 SSBP3 595173 sc-eQTL 9.95e-02 -0.0986 0.0596 0.184 CD8T L1
ENSG00000162402 USP24 -206712 sc-eQTL 1.41e-01 -0.0854 0.0577 0.184 CD8T L1
ENSG00000243725 TTC4 292791 sc-eQTL 9.67e-01 0.00419 0.101 0.184 CD8T L1
ENSG00000116133 DHCR24 121457 sc-eQTL 1.76e-01 -0.127 0.0932 0.185 DC L1
ENSG00000116205 TCEANC2 955068 sc-eQTL 1.43e-01 -0.153 0.104 0.185 DC L1
ENSG00000116209 TMEM59 955148 sc-eQTL 1.85e-01 0.109 0.0821 0.185 DC L1
ENSG00000116221 MRPL37 824611 sc-eQTL 5.60e-02 0.211 0.11 0.185 DC L1
ENSG00000157216 SSBP3 595173 sc-eQTL 2.71e-02 -0.217 0.0976 0.185 DC L1
ENSG00000162390 ACOT11 466395 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00417 0.095 0.185 DC L1
ENSG00000162402 USP24 -206712 sc-eQTL 8.37e-01 0.0118 0.0573 0.185 DC L1
ENSG00000215883 CYB5RL 808616 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0354 0.104 0.185 DC L1
ENSG00000243725 TTC4 292791 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0668 0.111 0.185 DC L1
ENSG00000116133 DHCR24 121457 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0525 0.0671 0.184 Mono L1
ENSG00000116205 TCEANC2 955068 sc-eQTL 6.96e-01 0.0283 0.0725 0.184 Mono L1
ENSG00000116209 TMEM59 955148 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0231 0.0538 0.184 Mono L1
ENSG00000116221 MRPL37 824611 sc-eQTL 1.20e-01 0.14 0.0895 0.184 Mono L1
ENSG00000157216 SSBP3 595173 sc-eQTL 9.29e-01 -0.00919 0.103 0.184 Mono L1
ENSG00000162402 USP24 -206712 sc-eQTL 1.34e-01 -0.0921 0.0612 0.184 Mono L1
ENSG00000243725 TTC4 292791 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0201 0.108 0.184 Mono L1
ENSG00000006555 TTC22 207329 sc-eQTL 1.45e-01 0.137 0.0937 0.182 NK L1
ENSG00000116133 DHCR24 121457 sc-eQTL 7.98e-01 0.0244 0.095 0.182 NK L1
ENSG00000116205 TCEANC2 955068 sc-eQTL 6.85e-01 0.0381 0.0937 0.182 NK L1
ENSG00000116209 TMEM59 955148 sc-eQTL 3.13e-01 -0.0741 0.0733 0.182 NK L1
ENSG00000116221 MRPL37 824611 sc-eQTL 2.80e-01 -0.0986 0.0911 0.182 NK L1
ENSG00000157216 SSBP3 595173 sc-eQTL 2.71e-01 0.0871 0.079 0.182 NK L1
ENSG00000162398 LEXM 202589 sc-eQTL 2.82e-01 0.0957 0.0886 0.182 NK L1
ENSG00000162402 USP24 -206712 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0328 0.0538 0.182 NK L1
ENSG00000243725 TTC4 292791 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0648 0.102 0.182 NK L1
ENSG00000006555 TTC22 207329 sc-eQTL 9.90e-02 -0.136 0.0821 0.184 Other_T L1
ENSG00000116133 DHCR24 121457 sc-eQTL 5.09e-01 0.0423 0.0641 0.184 Other_T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 955068 sc-eQTL 8.68e-01 -0.016 0.0959 0.184 Other_T L1
ENSG00000116209 TMEM59 955148 sc-eQTL 5.40e-01 0.0404 0.0658 0.184 Other_T L1
ENSG00000116221 MRPL37 824611 sc-eQTL 1.07e-01 0.0993 0.0613 0.184 Other_T L1
ENSG00000157216 SSBP3 595173 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0154 0.0713 0.184 Other_T L1
ENSG00000162402 USP24 -206712 sc-eQTL 3.60e-01 -0.0695 0.0758 0.184 Other_T L1
ENSG00000215883 CYB5RL 808616 sc-eQTL 5.77e-01 0.058 0.104 0.184 Other_T L1
ENSG00000243725 TTC4 292791 sc-eQTL 8.76e-01 0.0161 0.103 0.184 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 207329 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0167 0.0902 0.184 B_Activated L2
ENSG00000116133 DHCR24 121457 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0971 0.106 0.184 B_Activated L2
ENSG00000116205 TCEANC2 955068 sc-eQTL 7.64e-01 0.0341 0.114 0.184 B_Activated L2
ENSG00000116209 TMEM59 955148 sc-eQTL 7.36e-01 0.0409 0.121 0.184 B_Activated L2
ENSG00000116221 MRPL37 824611 sc-eQTL 5.02e-01 0.0877 0.13 0.184 B_Activated L2
ENSG00000157216 SSBP3 595173 sc-eQTL 6.79e-01 -0.049 0.118 0.184 B_Activated L2
ENSG00000162402 USP24 -206712 sc-eQTL 4.24e-01 0.0922 0.115 0.184 B_Activated L2
ENSG00000215883 CYB5RL 808616 sc-eQTL 2.88e-01 -0.108 0.101 0.184 B_Activated L2
ENSG00000243725 TTC4 292791 sc-eQTL 2.37e-01 0.13 0.11 0.184 B_Activated L2
ENSG00000006555 TTC22 207329 sc-eQTL 1.58e-01 0.156 0.11 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000116133 DHCR24 121457 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0431 0.103 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000116205 TCEANC2 955068 sc-eQTL 2.69e-02 -0.226 0.101 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000116209 TMEM59 955148 sc-eQTL 9.99e-01 -0.0001 0.0877 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000116221 MRPL37 824611 sc-eQTL 5.76e-02 0.195 0.102 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000157216 SSBP3 595173 sc-eQTL 1.28e-01 -0.147 0.0958 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000162402 USP24 -206712 sc-eQTL 4.87e-01 0.0564 0.0811 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000215883 CYB5RL 808616 sc-eQTL 3.22e-01 0.114 0.115 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000243725 TTC4 292791 sc-eQTL 6.74e-01 -0.044 0.104 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000006555 TTC22 207329 sc-eQTL 2.50e-01 -0.121 0.105 0.185 B_Memory L2
ENSG00000116133 DHCR24 121457 sc-eQTL 1.83e-01 -0.139 0.104 0.185 B_Memory L2
ENSG00000116205 TCEANC2 955068 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0253 0.112 0.185 B_Memory L2
ENSG00000116209 TMEM59 955148 sc-eQTL 8.90e-02 0.158 0.0925 0.185 B_Memory L2
ENSG00000116221 MRPL37 824611 sc-eQTL 2.67e-01 -0.105 0.094 0.185 B_Memory L2
ENSG00000157216 SSBP3 595173 sc-eQTL 9.49e-01 0.00562 0.088 0.185 B_Memory L2
ENSG00000162402 USP24 -206712 sc-eQTL 3.05e-01 0.0884 0.0859 0.185 B_Memory L2
ENSG00000215883 CYB5RL 808616 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0691 0.106 0.185 B_Memory L2
ENSG00000243725 TTC4 292791 sc-eQTL 8.17e-01 0.0256 0.11 0.185 B_Memory L2
ENSG00000006555 TTC22 207329 sc-eQTL 3.82e-01 0.0978 0.112 0.184 B_Naive1 L2
ENSG00000116133 DHCR24 121457 sc-eQTL 8.57e-01 0.0189 0.105 0.184 B_Naive1 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 955068 sc-eQTL 6.74e-03 0.252 0.0919 0.184 B_Naive1 L2
ENSG00000116209 TMEM59 955148 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0362 0.0679 0.184 B_Naive1 L2
ENSG00000116221 MRPL37 824611 sc-eQTL 6.11e-01 0.051 0.1 0.184 B_Naive1 L2
ENSG00000157216 SSBP3 595173 sc-eQTL 2.76e-02 -0.209 0.0944 0.184 B_Naive1 L2
ENSG00000162402 USP24 -206712 sc-eQTL 1.03e-01 -0.122 0.0747 0.184 B_Naive1 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 808616 sc-eQTL 1.08e-02 0.287 0.112 0.184 B_Naive1 L2
ENSG00000243725 TTC4 292791 sc-eQTL 8.61e-02 -0.175 0.102 0.184 B_Naive1 L2
ENSG00000006555 TTC22 207329 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0418 0.112 0.185 B_Naive2 L2
ENSG00000116133 DHCR24 121457 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0477 0.0975 0.185 B_Naive2 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 955068 sc-eQTL 2.80e-01 -0.117 0.108 0.185 B_Naive2 L2
ENSG00000116209 TMEM59 955148 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0106 0.0891 0.185 B_Naive2 L2
ENSG00000116221 MRPL37 824611 sc-eQTL 8.82e-01 0.0156 0.105 0.185 B_Naive2 L2
ENSG00000157216 SSBP3 595173 sc-eQTL 6.36e-01 0.049 0.103 0.185 B_Naive2 L2
ENSG00000162402 USP24 -206712 sc-eQTL 7.95e-01 0.0213 0.0819 0.185 B_Naive2 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 808616 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0458 0.115 0.185 B_Naive2 L2
ENSG00000243725 TTC4 292791 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0407 0.12 0.185 B_Naive2 L2
ENSG00000006555 TTC22 207329 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0387 0.104 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 955068 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0155 0.108 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 955148 sc-eQTL 8.09e-01 0.0236 0.0978 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 824611 sc-eQTL 1.58e-01 0.169 0.12 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 595173 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0232 0.074 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -206712 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0366 0.102 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 292791 sc-eQTL 5.31e-02 0.219 0.113 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 207329 sc-eQTL 1.58e-01 0.134 0.0945 0.184 CD4_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 955068 sc-eQTL 4.37e-01 0.0562 0.0721 0.184 CD4_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 955148 sc-eQTL 2.37e-01 -0.083 0.07 0.184 CD4_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 824611 sc-eQTL 2.25e-01 0.11 0.0902 0.184 CD4_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 595173 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0224 0.0723 0.184 CD4_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -206712 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0493 0.0623 0.184 CD4_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 292791 sc-eQTL 4.18e-01 -0.077 0.0949 0.184 CD4_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 207329 sc-eQTL 2.56e-01 0.113 0.0991 0.184 CD4_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 955068 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0278 0.0966 0.184 CD4_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 955148 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0129 0.0729 0.184 CD4_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 824611 sc-eQTL 1.64e-01 0.128 0.0913 0.184 CD4_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 595173 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0737 0.0898 0.184 CD4_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -206712 sc-eQTL 9.54e-01 0.00427 0.0745 0.184 CD4_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 292791 sc-eQTL 5.32e-01 0.0671 0.107 0.184 CD4_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 207329 sc-eQTL 8.91e-01 0.0158 0.115 0.184 CD4_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 955068 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0444 0.109 0.184 CD4_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 955148 sc-eQTL 7.14e-02 -0.152 0.0839 0.184 CD4_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 824611 sc-eQTL 2.98e-01 -0.113 0.109 0.184 CD4_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 595173 sc-eQTL 4.94e-01 0.0638 0.0932 0.184 CD4_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -206712 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0688 0.0848 0.184 CD4_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 292791 sc-eQTL 2.95e-01 -0.117 0.112 0.184 CD4_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 207329 sc-eQTL 1.25e-01 -0.142 0.0925 0.184 CD8_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 955068 sc-eQTL 2.91e-01 0.109 0.103 0.184 CD8_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 955148 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0467 0.0895 0.184 CD8_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 824611 sc-eQTL 9.62e-01 0.00508 0.106 0.184 CD8_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 595173 sc-eQTL 3.48e-01 -0.0681 0.0724 0.184 CD8_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -206712 sc-eQTL 2.06e-01 -0.0912 0.0719 0.184 CD8_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 292791 sc-eQTL 7.27e-01 0.0377 0.108 0.184 CD8_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 207329 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0583 0.102 0.184 CD8_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 955068 sc-eQTL 3.05e-02 -0.2 0.0917 0.184 CD8_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 955148 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0611 0.0906 0.184 CD8_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 824611 sc-eQTL 3.82e-01 0.0951 0.109 0.184 CD8_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 595173 sc-eQTL 1.43e-02 -0.201 0.0812 0.184 CD8_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -206712 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0309 0.0748 0.184 CD8_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 292791 sc-eQTL 8.57e-01 0.0198 0.11 0.184 CD8_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 207329 sc-eQTL 5.91e-01 0.0602 0.112 0.19 CD8_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 955068 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0477 0.113 0.19 CD8_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 955148 sc-eQTL 2.59e-01 0.112 0.0989 0.19 CD8_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 824611 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0113 0.112 0.19 CD8_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 595173 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0108 0.0976 0.19 CD8_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -206712 sc-eQTL 6.53e-01 0.0426 0.0946 0.19 CD8_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 292791 sc-eQTL 5.90e-01 0.062 0.115 0.19 CD8_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 207329 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0464 0.108 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 955068 sc-eQTL 2.58e-01 -0.128 0.113 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 955148 sc-eQTL 1.49e-01 -0.157 0.109 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 824611 sc-eQTL 6.40e-01 0.0518 0.111 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 595173 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000492 0.105 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -206712 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0923 0.11 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 292791 sc-eQTL 2.16e-01 -0.139 0.112 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 207329 sc-eQTL 3.37e-01 -0.0955 0.0993 0.186 MAIT L2
ENSG00000116133 DHCR24 121457 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0107 0.0736 0.186 MAIT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 955068 sc-eQTL 4.69e-01 0.0751 0.104 0.186 MAIT L2
ENSG00000116209 TMEM59 955148 sc-eQTL 6.27e-02 0.174 0.0929 0.186 MAIT L2
ENSG00000116221 MRPL37 824611 sc-eQTL 6.50e-01 0.0518 0.114 0.186 MAIT L2
ENSG00000157216 SSBP3 595173 sc-eQTL 2.05e-01 -0.128 0.1 0.186 MAIT L2
ENSG00000162402 USP24 -206712 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0325 0.0895 0.186 MAIT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 808616 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0233 0.104 0.186 MAIT L2
ENSG00000243725 TTC4 292791 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0132 0.103 0.186 MAIT L2
ENSG00000006555 TTC22 207329 sc-eQTL 8.49e-01 0.0215 0.113 0.184 NK_CD56bright L2
ENSG00000116133 DHCR24 121457 sc-eQTL 2.50e-01 0.115 0.0997 0.184 NK_CD56bright L2
ENSG00000116205 TCEANC2 955068 sc-eQTL 1.36e-01 0.157 0.105 0.184 NK_CD56bright L2
ENSG00000116209 TMEM59 955148 sc-eQTL 8.77e-01 0.016 0.103 0.184 NK_CD56bright L2
ENSG00000116221 MRPL37 824611 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0309 0.115 0.184 NK_CD56bright L2
ENSG00000157216 SSBP3 595173 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0526 0.0867 0.184 NK_CD56bright L2
ENSG00000162398 LEXM 202589 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0524 0.102 0.184 NK_CD56bright L2
ENSG00000162402 USP24 -206712 sc-eQTL 5.31e-01 0.0552 0.0881 0.184 NK_CD56bright L2
ENSG00000243725 TTC4 292791 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0863 0.111 0.184 NK_CD56bright L2
ENSG00000006555 TTC22 207329 sc-eQTL 2.93e-01 0.0988 0.0938 0.181 NK_CD56dim L2
ENSG00000116133 DHCR24 121457 sc-eQTL 6.95e-01 0.0385 0.098 0.181 NK_CD56dim L2
ENSG00000116205 TCEANC2 955068 sc-eQTL 9.77e-01 0.00309 0.106 0.181 NK_CD56dim L2
ENSG00000116209 TMEM59 955148 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0137 0.0787 0.181 NK_CD56dim L2
ENSG00000116221 MRPL37 824611 sc-eQTL 5.73e-02 -0.194 0.102 0.181 NK_CD56dim L2
ENSG00000157216 SSBP3 595173 sc-eQTL 5.21e-01 0.0538 0.0838 0.181 NK_CD56dim L2
ENSG00000162398 LEXM 202589 sc-eQTL 3.76e-01 0.0853 0.0962 0.181 NK_CD56dim L2
ENSG00000162402 USP24 -206712 sc-eQTL 8.71e-01 -0.00998 0.0613 0.181 NK_CD56dim L2
ENSG00000243725 TTC4 292791 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00497 0.105 0.181 NK_CD56dim L2
ENSG00000006555 TTC22 207329 sc-eQTL 8.32e-01 0.0243 0.114 0.187 NK_HLA L2
ENSG00000116133 DHCR24 121457 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0466 0.112 0.187 NK_HLA L2
ENSG00000116205 TCEANC2 955068 sc-eQTL 3.12e-01 0.109 0.107 0.187 NK_HLA L2
ENSG00000116209 TMEM59 955148 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0963 0.107 0.187 NK_HLA L2
ENSG00000116221 MRPL37 824611 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0325 0.118 0.187 NK_HLA L2
ENSG00000157216 SSBP3 595173 sc-eQTL 6.75e-02 0.175 0.0953 0.187 NK_HLA L2
ENSG00000162398 LEXM 202589 sc-eQTL 7.37e-01 0.0365 0.108 0.187 NK_HLA L2
ENSG00000162402 USP24 -206712 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00106 0.0796 0.187 NK_HLA L2
ENSG00000243725 TTC4 292791 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0977 0.119 0.187 NK_HLA L2
ENSG00000006555 TTC22 207329 sc-eQTL 1.82e-01 0.136 0.102 0.181 NK_cytokine L2
ENSG00000116133 DHCR24 121457 sc-eQTL 6.84e-01 0.0421 0.103 0.181 NK_cytokine L2
ENSG00000116205 TCEANC2 955068 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0283 0.103 0.181 NK_cytokine L2
ENSG00000116209 TMEM59 955148 sc-eQTL 1.39e-02 -0.204 0.0822 0.181 NK_cytokine L2
ENSG00000116221 MRPL37 824611 sc-eQTL 4.47e-01 0.0783 0.103 0.181 NK_cytokine L2
ENSG00000157216 SSBP3 595173 sc-eQTL 5.99e-01 0.0454 0.0862 0.181 NK_cytokine L2
ENSG00000162398 LEXM 202589 sc-eQTL 2.82e-01 0.116 0.107 0.181 NK_cytokine L2
ENSG00000162402 USP24 -206712 sc-eQTL 2.13e-01 -0.0915 0.0732 0.181 NK_cytokine L2
ENSG00000243725 TTC4 292791 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0248 0.109 0.181 NK_cytokine L2
ENSG00000006555 TTC22 207329 sc-eQTL 4.47e-03 -0.379 0.131 0.178 PB L2
ENSG00000116133 DHCR24 121457 sc-eQTL 9.75e-01 0.00374 0.12 0.178 PB L2
ENSG00000116205 TCEANC2 955068 sc-eQTL 3.94e-01 0.125 0.146 0.178 PB L2
ENSG00000116209 TMEM59 955148 sc-eQTL 3.16e-01 -0.0612 0.0608 0.178 PB L2
ENSG00000116221 MRPL37 824611 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0188 0.111 0.178 PB L2
ENSG00000157216 SSBP3 595173 sc-eQTL 2.18e-01 0.158 0.127 0.178 PB L2
ENSG00000162402 USP24 -206712 sc-eQTL 8.98e-02 -0.246 0.144 0.178 PB L2
ENSG00000215883 CYB5RL 808616 sc-eQTL 7.34e-01 0.0513 0.151 0.178 PB L2
ENSG00000243725 TTC4 292791 sc-eQTL 8.71e-01 -0.023 0.141 0.178 PB L2
ENSG00000006555 TTC22 207329 sc-eQTL 4.62e-01 -0.075 0.102 0.187 Pro_T L2
ENSG00000116133 DHCR24 121457 sc-eQTL 2.83e-01 0.0931 0.0865 0.187 Pro_T L2
ENSG00000116205 TCEANC2 955068 sc-eQTL 6.49e-01 0.0482 0.106 0.187 Pro_T L2
ENSG00000116209 TMEM59 955148 sc-eQTL 6.44e-01 0.034 0.0734 0.187 Pro_T L2
ENSG00000116221 MRPL37 824611 sc-eQTL 5.34e-01 0.0448 0.0719 0.187 Pro_T L2
ENSG00000157216 SSBP3 595173 sc-eQTL 1.21e-01 -0.125 0.0802 0.187 Pro_T L2
ENSG00000162402 USP24 -206712 sc-eQTL 2.49e-01 -0.113 0.0981 0.187 Pro_T L2
ENSG00000215883 CYB5RL 808616 sc-eQTL 5.29e-01 0.0612 0.097 0.187 Pro_T L2
ENSG00000243725 TTC4 292791 sc-eQTL 8.81e-01 0.0162 0.108 0.187 Pro_T L2
ENSG00000006555 TTC22 207329 sc-eQTL 5.31e-01 0.0626 0.0999 0.184 Treg L2
ENSG00000116205 TCEANC2 955068 sc-eQTL 4.57e-01 0.0797 0.107 0.184 Treg L2
ENSG00000116209 TMEM59 955148 sc-eQTL 4.88e-01 0.0588 0.0845 0.184 Treg L2
ENSG00000116221 MRPL37 824611 sc-eQTL 6.61e-01 0.0459 0.105 0.184 Treg L2
ENSG00000157216 SSBP3 595173 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0818 0.0933 0.184 Treg L2
ENSG00000162402 USP24 -206712 sc-eQTL 6.92e-01 0.0354 0.089 0.184 Treg L2
ENSG00000243725 TTC4 292791 sc-eQTL 6.15e-01 0.0564 0.112 0.184 Treg L2
ENSG00000116133 DHCR24 121457 sc-eQTL 6.42e-02 -0.171 0.0916 0.185 cDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 955068 sc-eQTL 7.63e-02 -0.193 0.108 0.185 cDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 955148 sc-eQTL 1.90e-01 0.121 0.0922 0.185 cDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 824611 sc-eQTL 7.10e-01 0.0442 0.118 0.185 cDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 595173 sc-eQTL 7.76e-02 -0.192 0.108 0.185 cDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 466395 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00135 0.102 0.185 cDC L2
ENSG00000162402 USP24 -206712 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0446 0.114 0.185 cDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 808616 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0321 0.0978 0.185 cDC L2
ENSG00000243725 TTC4 292791 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0825 0.117 0.185 cDC L2
ENSG00000116133 DHCR24 121457 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0561 0.0652 0.184 cMono_IL1B L2
ENSG00000116205 TCEANC2 955068 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0508 0.0906 0.184 cMono_IL1B L2
ENSG00000116209 TMEM59 955148 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00114 0.055 0.184 cMono_IL1B L2
ENSG00000116221 MRPL37 824611 sc-eQTL 9.99e-02 0.161 0.0974 0.184 cMono_IL1B L2
ENSG00000157216 SSBP3 595173 sc-eQTL 3.10e-01 -0.101 0.0998 0.184 cMono_IL1B L2
ENSG00000162402 USP24 -206712 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0303 0.0738 0.184 cMono_IL1B L2
ENSG00000243725 TTC4 292791 sc-eQTL 6.78e-01 0.047 0.113 0.184 cMono_IL1B L2
ENSG00000116133 DHCR24 121457 sc-eQTL 6.40e-01 0.0287 0.0612 0.184 cMono_S100A L2
ENSG00000116205 TCEANC2 955068 sc-eQTL 2.72e-01 0.103 0.0932 0.184 cMono_S100A L2
ENSG00000116209 TMEM59 955148 sc-eQTL 9.39e-01 -0.0057 0.0748 0.184 cMono_S100A L2
ENSG00000116221 MRPL37 824611 sc-eQTL 5.93e-01 0.0578 0.108 0.184 cMono_S100A L2
ENSG00000157216 SSBP3 595173 sc-eQTL 6.52e-01 0.0506 0.112 0.184 cMono_S100A L2
ENSG00000162402 USP24 -206712 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0643 0.0907 0.184 cMono_S100A L2
ENSG00000243725 TTC4 292791 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0188 0.114 0.184 cMono_S100A L2
ENSG00000006555 TTC22 207329 sc-eQTL 5.00e-01 0.0689 0.102 0.194 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 121457 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0416 0.114 0.194 gdT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 955068 sc-eQTL 8.72e-01 0.0184 0.114 0.194 gdT L2
ENSG00000116209 TMEM59 955148 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0134 0.116 0.194 gdT L2
ENSG00000116221 MRPL37 824611 sc-eQTL 8.71e-02 0.227 0.132 0.194 gdT L2
ENSG00000157216 SSBP3 595173 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0228 0.0814 0.194 gdT L2
ENSG00000162402 USP24 -206712 sc-eQTL 9.41e-01 0.0081 0.109 0.194 gdT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 808616 sc-eQTL 5.72e-01 0.0643 0.114 0.194 gdT L2
ENSG00000243725 TTC4 292791 sc-eQTL 1.96e-01 0.165 0.127 0.194 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 121457 sc-eQTL 1.27e-01 -0.129 0.0845 0.18 intMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 955068 sc-eQTL 1.42e-02 0.258 0.104 0.18 intMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 955148 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0495 0.0777 0.18 intMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 824611 sc-eQTL 3.27e-01 0.117 0.119 0.18 intMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 595173 sc-eQTL 7.27e-02 0.217 0.12 0.18 intMono L2
ENSG00000162402 USP24 -206712 sc-eQTL 2.20e-01 0.133 0.108 0.18 intMono L2
ENSG00000243725 TTC4 292791 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0768 0.115 0.18 intMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 121457 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0716 0.0806 0.183 ncMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 955068 sc-eQTL 4.63e-01 0.0741 0.101 0.183 ncMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 955148 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0361 0.0807 0.183 ncMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 824611 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0816 0.104 0.183 ncMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 595173 sc-eQTL 8.78e-01 0.0175 0.114 0.183 ncMono L2
ENSG00000162402 USP24 -206712 sc-eQTL 9.04e-01 -0.011 0.091 0.183 ncMono L2
ENSG00000243725 TTC4 292791 sc-eQTL 3.39e-01 -0.103 0.108 0.183 ncMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 121457 sc-eQTL 8.47e-01 0.0186 0.0963 0.195 pDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 955068 sc-eQTL 3.85e-01 -0.1 0.115 0.195 pDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 955148 sc-eQTL 5.76e-02 0.174 0.0912 0.195 pDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 824611 sc-eQTL 5.09e-03 0.34 0.119 0.195 pDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 595173 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0471 0.109 0.195 pDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 466395 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0362 0.0457 0.195 pDC L2
ENSG00000162402 USP24 -206712 sc-eQTL 7.34e-01 0.0263 0.0772 0.195 pDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 808616 sc-eQTL 1.64e-01 -0.147 0.105 0.195 pDC L2
ENSG00000243725 TTC4 292791 sc-eQTL 3.06e-01 -0.125 0.122 0.195 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 207329 sc-eQTL 1.83e-01 0.141 0.105 0.184 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 121457 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0888 0.106 0.184 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 955068 sc-eQTL 1.04e-01 -0.167 0.102 0.184 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 955148 sc-eQTL 3.96e-01 0.0679 0.0798 0.184 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 824611 sc-eQTL 4.99e-01 0.0647 0.0956 0.184 B_Memory LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 595173 sc-eQTL 2.48e-01 -0.0961 0.083 0.184 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -206712 sc-eQTL 1.97e-01 0.0978 0.0756 0.184 B_Memory LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 808616 sc-eQTL 5.20e-01 0.0751 0.117 0.184 B_Memory LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 292791 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0581 0.105 0.184 B_Memory LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 207329 sc-eQTL 9.33e-01 0.00953 0.113 0.184 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 121457 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0624 0.102 0.184 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 955068 sc-eQTL 2.14e-01 0.115 0.092 0.184 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 955148 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0442 0.0655 0.184 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 824611 sc-eQTL 4.90e-01 0.0652 0.0942 0.184 B_Naive LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 595173 sc-eQTL 1.43e-01 -0.123 0.0839 0.184 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -206712 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0645 0.0722 0.184 B_Naive LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 808616 sc-eQTL 1.04e-01 0.186 0.114 0.184 B_Naive LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 292791 sc-eQTL 8.26e-02 -0.187 0.107 0.184 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 121457 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0261 0.0633 0.184 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 955068 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0167 0.0792 0.184 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 955148 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0143 0.0546 0.184 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 824611 sc-eQTL 5.16e-02 0.188 0.0958 0.184 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 595173 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0512 0.101 0.184 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -206712 sc-eQTL 2.11e-01 -0.0866 0.0689 0.184 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 292791 sc-eQTL 5.96e-01 0.0609 0.115 0.184 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 121457 sc-eQTL 2.41e-01 -0.091 0.0774 0.181 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 955068 sc-eQTL 2.74e-02 0.224 0.101 0.181 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 955148 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0223 0.0759 0.181 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 824611 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0274 0.104 0.181 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 595173 sc-eQTL 2.63e-01 0.124 0.111 0.181 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -206712 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0124 0.0874 0.181 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 292791 sc-eQTL 5.00e-01 -0.074 0.11 0.181 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 207329 sc-eQTL 1.25e-01 0.141 0.0916 0.181 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 121457 sc-eQTL 9.78e-01 -0.0027 0.0962 0.181 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 955068 sc-eQTL 8.80e-01 0.0143 0.0944 0.181 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 955148 sc-eQTL 2.32e-01 -0.0873 0.0727 0.181 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 824611 sc-eQTL 3.44e-01 -0.0925 0.0976 0.181 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 595173 sc-eQTL 2.94e-01 0.0843 0.08 0.181 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162398 LEXM 202589 sc-eQTL 1.42e-01 0.133 0.09 0.181 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -206712 sc-eQTL 3.34e-01 -0.0554 0.0572 0.181 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 292791 sc-eQTL 9.25e-01 0.00965 0.102 0.181 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000198711 SSBP3-AS1 772212 eQTL 2.56e-02 -0.0559 0.025 0.00173 0.0 0.159

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000162390 \N 466395 7.57e-07 5.33e-07 7.6e-08 3.48e-07 1.05e-07 1.74e-07 4.42e-07 9.26e-08 2.81e-07 2.01e-07 4.88e-07 3.21e-07 5.39e-07 1.07e-07 1.12e-07 1.61e-07 2.07e-07 3.12e-07 9.97e-08 7.84e-08 1.57e-07 2.76e-07 3.02e-07 1.03e-07 6.39e-07 2.2e-07 2.08e-07 1.86e-07 2.11e-07 3.93e-07 2.19e-07 7.6e-08 4.98e-08 1.18e-07 1.56e-07 5.14e-08 8.75e-08 6.2e-08 5.7e-08 6.05e-08 4.83e-08 3.43e-07 2.63e-08 1.99e-08 5.49e-08 1.32e-08 9.83e-08 2.85e-09 4.68e-08