Genes within 1Mb (chr1:55007370:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 206047 sc-eQTL 9.54e-01 0.0063 0.11 0.156 B L1
ENSG00000116133 DHCR24 120175 sc-eQTL 2.53e-01 -0.118 0.103 0.156 B L1
ENSG00000116205 TCEANC2 953786 sc-eQTL 8.49e-01 0.0171 0.0894 0.156 B L1
ENSG00000116209 TMEM59 953866 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0292 0.0544 0.156 B L1
ENSG00000116221 MRPL37 823329 sc-eQTL 2.42e-01 0.0834 0.0711 0.156 B L1
ENSG00000157216 SSBP3 593891 sc-eQTL 8.30e-01 -0.016 0.0746 0.156 B L1
ENSG00000162402 USP24 -207994 sc-eQTL 8.63e-01 0.0109 0.0632 0.156 B L1
ENSG00000215883 CYB5RL 807334 sc-eQTL 1.32e-01 0.183 0.121 0.156 B L1
ENSG00000243725 TTC4 291509 sc-eQTL 1.18e-01 -0.165 0.105 0.156 B L1
ENSG00000006555 TTC22 206047 sc-eQTL 5.38e-01 0.0528 0.0856 0.156 CD4T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 953786 sc-eQTL 4.86e-01 0.0488 0.07 0.156 CD4T L1
ENSG00000116209 TMEM59 953866 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0329 0.0652 0.156 CD4T L1
ENSG00000116221 MRPL37 823329 sc-eQTL 6.00e-01 0.0473 0.0901 0.156 CD4T L1
ENSG00000157216 SSBP3 593891 sc-eQTL 6.57e-02 0.137 0.0743 0.156 CD4T L1
ENSG00000162402 USP24 -207994 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0205 0.061 0.156 CD4T L1
ENSG00000243725 TTC4 291509 sc-eQTL 4.94e-02 -0.18 0.091 0.156 CD4T L1
ENSG00000006555 TTC22 206047 sc-eQTL 2.29e-01 -0.0897 0.0743 0.156 CD8T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 953786 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0219 0.0929 0.156 CD8T L1
ENSG00000116209 TMEM59 953866 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0375 0.0644 0.156 CD8T L1
ENSG00000116221 MRPL37 823329 sc-eQTL 7.70e-01 0.0259 0.0888 0.156 CD8T L1
ENSG00000157216 SSBP3 593891 sc-eQTL 3.11e-01 -0.0646 0.0636 0.156 CD8T L1
ENSG00000162402 USP24 -207994 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0361 0.0616 0.156 CD8T L1
ENSG00000243725 TTC4 291509 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0644 0.107 0.156 CD8T L1
ENSG00000116133 DHCR24 120175 sc-eQTL 1.99e-01 -0.127 0.0984 0.158 DC L1
ENSG00000116205 TCEANC2 953786 sc-eQTL 1.08e-01 -0.178 0.11 0.158 DC L1
ENSG00000116209 TMEM59 953866 sc-eQTL 9.26e-01 0.00815 0.0871 0.158 DC L1
ENSG00000116221 MRPL37 823329 sc-eQTL 8.18e-02 0.203 0.116 0.158 DC L1
ENSG00000157216 SSBP3 593891 sc-eQTL 2.97e-02 -0.226 0.103 0.158 DC L1
ENSG00000162390 ACOT11 465113 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0611 0.1 0.158 DC L1
ENSG00000162402 USP24 -207994 sc-eQTL 4.81e-02 0.119 0.0599 0.158 DC L1
ENSG00000215883 CYB5RL 807334 sc-eQTL 8.27e-01 0.024 0.109 0.158 DC L1
ENSG00000243725 TTC4 291509 sc-eQTL 3.66e-01 -0.106 0.117 0.158 DC L1
ENSG00000116133 DHCR24 120175 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0215 0.0711 0.156 Mono L1
ENSG00000116205 TCEANC2 953786 sc-eQTL 9.53e-01 0.00456 0.0767 0.156 Mono L1
ENSG00000116209 TMEM59 953866 sc-eQTL 1.14e-01 -0.0898 0.0566 0.156 Mono L1
ENSG00000116221 MRPL37 823329 sc-eQTL 2.85e-01 0.102 0.0951 0.156 Mono L1
ENSG00000157216 SSBP3 593891 sc-eQTL 7.32e-01 0.0374 0.109 0.156 Mono L1
ENSG00000162402 USP24 -207994 sc-eQTL 1.86e-01 -0.0861 0.0648 0.156 Mono L1
ENSG00000243725 TTC4 291509 sc-eQTL 3.50e-01 -0.107 0.114 0.156 Mono L1
ENSG00000006555 TTC22 206047 sc-eQTL 8.19e-01 0.0232 0.101 0.155 NK L1
ENSG00000116133 DHCR24 120175 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0475 0.102 0.155 NK L1
ENSG00000116205 TCEANC2 953786 sc-eQTL 6.62e-01 0.044 0.101 0.155 NK L1
ENSG00000116209 TMEM59 953866 sc-eQTL 1.64e-01 -0.11 0.0785 0.155 NK L1
ENSG00000116221 MRPL37 823329 sc-eQTL 2.24e-01 -0.119 0.0977 0.155 NK L1
ENSG00000157216 SSBP3 593891 sc-eQTL 1.78e-01 0.114 0.0846 0.155 NK L1
ENSG00000162398 LEXM 201307 sc-eQTL 3.07e-01 0.0973 0.0951 0.155 NK L1
ENSG00000162402 USP24 -207994 sc-eQTL 1.48e-01 -0.0835 0.0576 0.155 NK L1
ENSG00000243725 TTC4 291509 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0261 0.109 0.155 NK L1
ENSG00000006555 TTC22 206047 sc-eQTL 5.02e-02 -0.169 0.086 0.156 Other_T L1
ENSG00000116133 DHCR24 120175 sc-eQTL 4.16e-01 0.0548 0.0673 0.156 Other_T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 953786 sc-eQTL 8.33e-01 0.0213 0.101 0.156 Other_T L1
ENSG00000116209 TMEM59 953866 sc-eQTL 9.32e-01 0.00589 0.0692 0.156 Other_T L1
ENSG00000116221 MRPL37 823329 sc-eQTL 1.57e-01 0.0916 0.0645 0.156 Other_T L1
ENSG00000157216 SSBP3 593891 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0186 0.075 0.156 Other_T L1
ENSG00000162402 USP24 -207994 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0657 0.0797 0.156 Other_T L1
ENSG00000215883 CYB5RL 807334 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0315 0.109 0.156 Other_T L1
ENSG00000243725 TTC4 291509 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00879 0.109 0.156 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 206047 sc-eQTL 3.69e-01 0.0858 0.0952 0.156 B_Activated L2
ENSG00000116133 DHCR24 120175 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0618 0.112 0.156 B_Activated L2
ENSG00000116205 TCEANC2 953786 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0691 0.12 0.156 B_Activated L2
ENSG00000116209 TMEM59 953866 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0482 0.128 0.156 B_Activated L2
ENSG00000116221 MRPL37 823329 sc-eQTL 5.35e-01 0.0857 0.138 0.156 B_Activated L2
ENSG00000157216 SSBP3 593891 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0206 0.125 0.156 B_Activated L2
ENSG00000162402 USP24 -207994 sc-eQTL 2.95e-01 0.128 0.122 0.156 B_Activated L2
ENSG00000215883 CYB5RL 807334 sc-eQTL 1.10e-01 -0.172 0.107 0.156 B_Activated L2
ENSG00000243725 TTC4 291509 sc-eQTL 5.20e-01 0.0753 0.117 0.156 B_Activated L2
ENSG00000006555 TTC22 206047 sc-eQTL 9.99e-01 7.46e-05 0.116 0.157 B_Intermediate L2
ENSG00000116133 DHCR24 120175 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0275 0.107 0.157 B_Intermediate L2
ENSG00000116205 TCEANC2 953786 sc-eQTL 3.27e-01 -0.105 0.107 0.157 B_Intermediate L2
ENSG00000116209 TMEM59 953866 sc-eQTL 5.17e-01 0.0595 0.0916 0.157 B_Intermediate L2
ENSG00000116221 MRPL37 823329 sc-eQTL 2.08e-02 0.248 0.106 0.157 B_Intermediate L2
ENSG00000157216 SSBP3 593891 sc-eQTL 4.06e-02 -0.205 0.0997 0.157 B_Intermediate L2
ENSG00000162402 USP24 -207994 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0464 0.0848 0.157 B_Intermediate L2
ENSG00000215883 CYB5RL 807334 sc-eQTL 9.63e-01 0.0055 0.12 0.157 B_Intermediate L2
ENSG00000243725 TTC4 291509 sc-eQTL 3.31e-01 -0.106 0.109 0.157 B_Intermediate L2
ENSG00000006555 TTC22 206047 sc-eQTL 6.28e-02 -0.205 0.11 0.157 B_Memory L2
ENSG00000116133 DHCR24 120175 sc-eQTL 2.20e-01 -0.134 0.109 0.157 B_Memory L2
ENSG00000116205 TCEANC2 953786 sc-eQTL 5.40e-01 -0.072 0.117 0.157 B_Memory L2
ENSG00000116209 TMEM59 953866 sc-eQTL 6.34e-01 0.0466 0.0978 0.157 B_Memory L2
ENSG00000116221 MRPL37 823329 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0224 0.0991 0.157 B_Memory L2
ENSG00000157216 SSBP3 593891 sc-eQTL 3.84e-01 0.0805 0.0923 0.157 B_Memory L2
ENSG00000162402 USP24 -207994 sc-eQTL 7.00e-01 0.0349 0.0904 0.157 B_Memory L2
ENSG00000215883 CYB5RL 807334 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0755 0.112 0.157 B_Memory L2
ENSG00000243725 TTC4 291509 sc-eQTL 7.49e-01 0.0371 0.116 0.157 B_Memory L2
ENSG00000006555 TTC22 206047 sc-eQTL 3.34e-01 0.115 0.118 0.156 B_Naive1 L2
ENSG00000116133 DHCR24 120175 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0721 0.111 0.156 B_Naive1 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 953786 sc-eQTL 7.30e-03 0.264 0.0975 0.156 B_Naive1 L2
ENSG00000116209 TMEM59 953866 sc-eQTL 2.63e-01 -0.0807 0.0718 0.156 B_Naive1 L2
ENSG00000116221 MRPL37 823329 sc-eQTL 9.87e-01 -0.0017 0.106 0.156 B_Naive1 L2
ENSG00000157216 SSBP3 593891 sc-eQTL 1.43e-01 -0.148 0.101 0.156 B_Naive1 L2
ENSG00000162402 USP24 -207994 sc-eQTL 1.57e-01 -0.113 0.0793 0.156 B_Naive1 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 807334 sc-eQTL 1.14e-02 0.302 0.118 0.156 B_Naive1 L2
ENSG00000243725 TTC4 291509 sc-eQTL 2.20e-02 -0.248 0.107 0.156 B_Naive1 L2
ENSG00000006555 TTC22 206047 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0154 0.118 0.157 B_Naive2 L2
ENSG00000116133 DHCR24 120175 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0288 0.102 0.157 B_Naive2 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 953786 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0369 0.114 0.157 B_Naive2 L2
ENSG00000116209 TMEM59 953866 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0181 0.0936 0.157 B_Naive2 L2
ENSG00000116221 MRPL37 823329 sc-eQTL 8.65e-01 0.0188 0.11 0.157 B_Naive2 L2
ENSG00000157216 SSBP3 593891 sc-eQTL 7.80e-02 0.191 0.108 0.157 B_Naive2 L2
ENSG00000162402 USP24 -207994 sc-eQTL 5.63e-01 0.0498 0.0859 0.157 B_Naive2 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 807334 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00177 0.121 0.157 B_Naive2 L2
ENSG00000243725 TTC4 291509 sc-eQTL 8.24e-01 0.0281 0.126 0.157 B_Naive2 L2
ENSG00000006555 TTC22 206047 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0575 0.11 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 953786 sc-eQTL 1.56e-01 0.16 0.112 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 953866 sc-eQTL 6.17e-01 0.0514 0.103 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 823329 sc-eQTL 1.45e-01 0.184 0.126 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 593891 sc-eQTL 3.46e-01 0.0732 0.0775 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -207994 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00809 0.107 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 291509 sc-eQTL 1.41e-01 0.175 0.119 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 206047 sc-eQTL 1.31e-01 0.152 0.1 0.156 CD4_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 953786 sc-eQTL 3.76e-01 0.0678 0.0764 0.156 CD4_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 953866 sc-eQTL 1.94e-01 -0.0967 0.0742 0.156 CD4_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 823329 sc-eQTL 2.96e-01 0.1 0.0957 0.156 CD4_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 593891 sc-eQTL 5.02e-01 0.0515 0.0765 0.156 CD4_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -207994 sc-eQTL 8.45e-01 -0.013 0.0661 0.156 CD4_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 291509 sc-eQTL 1.21e-01 -0.156 0.1 0.156 CD4_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 206047 sc-eQTL 1.68e-01 0.145 0.105 0.156 CD4_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 953786 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0688 0.103 0.156 CD4_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 953866 sc-eQTL 5.58e-01 0.0454 0.0774 0.156 CD4_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 823329 sc-eQTL 5.83e-01 0.0535 0.0973 0.156 CD4_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 593891 sc-eQTL 3.24e-01 0.0941 0.0952 0.156 CD4_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -207994 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0677 0.079 0.156 CD4_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 291509 sc-eQTL 7.88e-01 0.0307 0.114 0.156 CD4_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 206047 sc-eQTL 7.68e-01 0.0359 0.122 0.156 CD4_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 953786 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0917 0.115 0.156 CD4_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 953866 sc-eQTL 7.47e-02 -0.159 0.0886 0.156 CD4_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 823329 sc-eQTL 3.21e-01 -0.114 0.115 0.156 CD4_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 593891 sc-eQTL 5.34e-01 0.0613 0.0984 0.156 CD4_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -207994 sc-eQTL 2.20e-01 -0.11 0.0893 0.156 CD4_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 291509 sc-eQTL 6.11e-02 -0.221 0.117 0.156 CD4_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 206047 sc-eQTL 1.07e-01 -0.158 0.0975 0.156 CD8_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 953786 sc-eQTL 2.21e-01 0.133 0.108 0.156 CD8_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 953866 sc-eQTL 3.09e-01 -0.0961 0.0943 0.156 CD8_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 823329 sc-eQTL 9.08e-01 -0.013 0.112 0.156 CD8_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 593891 sc-eQTL 6.10e-01 -0.039 0.0765 0.156 CD8_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -207994 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0226 0.0761 0.156 CD8_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 291509 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0515 0.114 0.156 CD8_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 206047 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0561 0.107 0.156 CD8_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 953786 sc-eQTL 1.08e-01 -0.156 0.0966 0.156 CD8_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 953866 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0642 0.0949 0.156 CD8_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 823329 sc-eQTL 2.46e-01 0.132 0.114 0.156 CD8_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 593891 sc-eQTL 1.42e-01 -0.126 0.0858 0.156 CD8_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -207994 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00319 0.0785 0.156 CD8_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 291509 sc-eQTL 8.82e-01 0.017 0.115 0.156 CD8_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 206047 sc-eQTL 3.71e-01 0.105 0.117 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 953786 sc-eQTL 4.72e-01 0.0846 0.117 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 953866 sc-eQTL 1.04e-01 0.168 0.103 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 823329 sc-eQTL 4.78e-01 0.0833 0.117 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 593891 sc-eQTL 5.56e-01 -0.06 0.102 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -207994 sc-eQTL 4.25e-01 0.0788 0.0985 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 291509 sc-eQTL 8.29e-01 0.026 0.12 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 206047 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0963 0.112 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 953786 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0911 0.117 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 953866 sc-eQTL 5.03e-02 -0.221 0.112 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 823329 sc-eQTL 7.18e-01 0.0415 0.115 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 593891 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0492 0.109 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -207994 sc-eQTL 2.03e-01 -0.146 0.114 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 291509 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0972 0.116 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 206047 sc-eQTL 1.42e-01 -0.154 0.105 0.158 MAIT L2
ENSG00000116133 DHCR24 120175 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0117 0.0779 0.158 MAIT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 953786 sc-eQTL 1.94e-01 0.142 0.109 0.158 MAIT L2
ENSG00000116209 TMEM59 953866 sc-eQTL 1.17e-01 0.155 0.0984 0.158 MAIT L2
ENSG00000116221 MRPL37 823329 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0208 0.12 0.158 MAIT L2
ENSG00000157216 SSBP3 593891 sc-eQTL 2.35e-01 -0.127 0.106 0.158 MAIT L2
ENSG00000162402 USP24 -207994 sc-eQTL 8.91e-01 0.013 0.0947 0.158 MAIT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 807334 sc-eQTL 2.40e-01 -0.129 0.11 0.158 MAIT L2
ENSG00000243725 TTC4 291509 sc-eQTL 9.06e-01 0.013 0.109 0.158 MAIT L2
ENSG00000006555 TTC22 206047 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0341 0.119 0.153 NK_CD56bright L2
ENSG00000116133 DHCR24 120175 sc-eQTL 5.70e-01 0.0597 0.105 0.153 NK_CD56bright L2
ENSG00000116205 TCEANC2 953786 sc-eQTL 2.46e-01 0.129 0.111 0.153 NK_CD56bright L2
ENSG00000116209 TMEM59 953866 sc-eQTL 9.11e-01 0.0121 0.108 0.153 NK_CD56bright L2
ENSG00000116221 MRPL37 823329 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0662 0.121 0.153 NK_CD56bright L2
ENSG00000157216 SSBP3 593891 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0437 0.0911 0.153 NK_CD56bright L2
ENSG00000162398 LEXM 201307 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0904 0.107 0.153 NK_CD56bright L2
ENSG00000162402 USP24 -207994 sc-eQTL 8.38e-01 0.019 0.0927 0.153 NK_CD56bright L2
ENSG00000243725 TTC4 291509 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0479 0.117 0.153 NK_CD56bright L2
ENSG00000006555 TTC22 206047 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0117 0.1 0.153 NK_CD56dim L2
ENSG00000116133 DHCR24 120175 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00136 0.105 0.153 NK_CD56dim L2
ENSG00000116205 TCEANC2 953786 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0126 0.113 0.153 NK_CD56dim L2
ENSG00000116209 TMEM59 953866 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0635 0.0839 0.153 NK_CD56dim L2
ENSG00000116221 MRPL37 823329 sc-eQTL 3.09e-01 -0.111 0.109 0.153 NK_CD56dim L2
ENSG00000157216 SSBP3 593891 sc-eQTL 3.85e-01 0.0778 0.0893 0.153 NK_CD56dim L2
ENSG00000162398 LEXM 201307 sc-eQTL 2.14e-01 0.128 0.103 0.153 NK_CD56dim L2
ENSG00000162402 USP24 -207994 sc-eQTL 3.18e-01 -0.0653 0.0653 0.153 NK_CD56dim L2
ENSG00000243725 TTC4 291509 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00349 0.112 0.153 NK_CD56dim L2
ENSG00000006555 TTC22 206047 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0154 0.122 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000116133 DHCR24 120175 sc-eQTL 2.46e-01 -0.138 0.119 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000116205 TCEANC2 953786 sc-eQTL 1.41e-01 0.169 0.114 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000116209 TMEM59 953866 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0998 0.114 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000116221 MRPL37 823329 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0663 0.126 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000157216 SSBP3 593891 sc-eQTL 1.62e-01 0.143 0.102 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000162398 LEXM 201307 sc-eQTL 5.35e-01 0.0717 0.115 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000162402 USP24 -207994 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0578 0.0847 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000243725 TTC4 291509 sc-eQTL 9.57e-01 0.00678 0.127 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000006555 TTC22 206047 sc-eQTL 7.57e-01 0.0337 0.109 0.153 NK_cytokine L2
ENSG00000116133 DHCR24 120175 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0491 0.11 0.153 NK_cytokine L2
ENSG00000116205 TCEANC2 953786 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0351 0.109 0.153 NK_cytokine L2
ENSG00000116209 TMEM59 953866 sc-eQTL 2.17e-02 -0.203 0.0876 0.153 NK_cytokine L2
ENSG00000116221 MRPL37 823329 sc-eQTL 6.88e-01 0.0439 0.109 0.153 NK_cytokine L2
ENSG00000157216 SSBP3 593891 sc-eQTL 2.84e-01 0.0982 0.0915 0.153 NK_cytokine L2
ENSG00000162398 LEXM 201307 sc-eQTL 6.11e-01 0.0584 0.115 0.153 NK_cytokine L2
ENSG00000162402 USP24 -207994 sc-eQTL 1.04e-01 -0.127 0.0776 0.153 NK_cytokine L2
ENSG00000243725 TTC4 291509 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00603 0.116 0.153 NK_cytokine L2
ENSG00000006555 TTC22 206047 sc-eQTL 6.63e-02 -0.253 0.136 0.148 PB L2
ENSG00000116133 DHCR24 120175 sc-eQTL 9.68e-01 0.00485 0.123 0.148 PB L2
ENSG00000116205 TCEANC2 953786 sc-eQTL 5.96e-01 0.0791 0.149 0.148 PB L2
ENSG00000116209 TMEM59 953866 sc-eQTL 1.41e-01 -0.0916 0.0617 0.148 PB L2
ENSG00000116221 MRPL37 823329 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0501 0.113 0.148 PB L2
ENSG00000157216 SSBP3 593891 sc-eQTL 8.40e-01 0.0264 0.131 0.148 PB L2
ENSG00000162402 USP24 -207994 sc-eQTL 2.60e-01 -0.167 0.148 0.148 PB L2
ENSG00000215883 CYB5RL 807334 sc-eQTL 8.20e-01 0.0351 0.154 0.148 PB L2
ENSG00000243725 TTC4 291509 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0251 0.144 0.148 PB L2
ENSG00000006555 TTC22 206047 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0437 0.107 0.159 Pro_T L2
ENSG00000116133 DHCR24 120175 sc-eQTL 5.79e-01 0.0502 0.0905 0.159 Pro_T L2
ENSG00000116205 TCEANC2 953786 sc-eQTL 7.72e-01 -0.032 0.111 0.159 Pro_T L2
ENSG00000116209 TMEM59 953866 sc-eQTL 2.41e-01 -0.0899 0.0765 0.159 Pro_T L2
ENSG00000116221 MRPL37 823329 sc-eQTL 7.46e-01 0.0244 0.0751 0.159 Pro_T L2
ENSG00000157216 SSBP3 593891 sc-eQTL 9.51e-02 -0.14 0.0837 0.159 Pro_T L2
ENSG00000162402 USP24 -207994 sc-eQTL 2.64e-01 -0.115 0.102 0.159 Pro_T L2
ENSG00000215883 CYB5RL 807334 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0314 0.101 0.159 Pro_T L2
ENSG00000243725 TTC4 291509 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0144 0.113 0.159 Pro_T L2
ENSG00000006555 TTC22 206047 sc-eQTL 2.78e-01 -0.114 0.105 0.156 Treg L2
ENSG00000116205 TCEANC2 953786 sc-eQTL 7.14e-01 0.0414 0.113 0.156 Treg L2
ENSG00000116209 TMEM59 953866 sc-eQTL 2.68e-01 0.0989 0.089 0.156 Treg L2
ENSG00000116221 MRPL37 823329 sc-eQTL 5.21e-01 0.0709 0.11 0.156 Treg L2
ENSG00000157216 SSBP3 593891 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0724 0.0985 0.156 Treg L2
ENSG00000162402 USP24 -207994 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00547 0.0939 0.156 Treg L2
ENSG00000243725 TTC4 291509 sc-eQTL 7.88e-01 0.0318 0.118 0.156 Treg L2
ENSG00000116133 DHCR24 120175 sc-eQTL 9.40e-02 -0.165 0.0978 0.156 cDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 953786 sc-eQTL 5.01e-02 -0.227 0.115 0.156 cDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 953866 sc-eQTL 7.26e-01 0.0347 0.0987 0.156 cDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 823329 sc-eQTL 7.78e-01 0.0357 0.126 0.156 cDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 593891 sc-eQTL 2.49e-01 -0.134 0.116 0.156 cDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 465113 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0779 0.108 0.156 cDC L2
ENSG00000162402 USP24 -207994 sc-eQTL 8.30e-01 0.0261 0.121 0.156 cDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 807334 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0463 0.104 0.156 cDC L2
ENSG00000243725 TTC4 291509 sc-eQTL 1.68e-01 -0.171 0.124 0.156 cDC L2
ENSG00000116133 DHCR24 120175 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0517 0.0689 0.156 cMono_IL1B L2
ENSG00000116205 TCEANC2 953786 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0866 0.0957 0.156 cMono_IL1B L2
ENSG00000116209 TMEM59 953866 sc-eQTL 6.92e-01 -0.023 0.0581 0.156 cMono_IL1B L2
ENSG00000116221 MRPL37 823329 sc-eQTL 2.41e-01 0.121 0.103 0.156 cMono_IL1B L2
ENSG00000157216 SSBP3 593891 sc-eQTL 1.74e-01 -0.144 0.105 0.156 cMono_IL1B L2
ENSG00000162402 USP24 -207994 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0247 0.0781 0.156 cMono_IL1B L2
ENSG00000243725 TTC4 291509 sc-eQTL 6.79e-01 0.0495 0.119 0.156 cMono_IL1B L2
ENSG00000116133 DHCR24 120175 sc-eQTL 4.94e-01 0.0444 0.0648 0.156 cMono_S100A L2
ENSG00000116205 TCEANC2 953786 sc-eQTL 2.60e-01 0.112 0.0987 0.156 cMono_S100A L2
ENSG00000116209 TMEM59 953866 sc-eQTL 3.40e-01 -0.0756 0.0791 0.156 cMono_S100A L2
ENSG00000116221 MRPL37 823329 sc-eQTL 8.71e-01 0.0187 0.114 0.156 cMono_S100A L2
ENSG00000157216 SSBP3 593891 sc-eQTL 2.17e-01 0.147 0.118 0.156 cMono_S100A L2
ENSG00000162402 USP24 -207994 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0629 0.0961 0.156 cMono_S100A L2
ENSG00000243725 TTC4 291509 sc-eQTL 3.49e-01 -0.113 0.12 0.156 cMono_S100A L2
ENSG00000006555 TTC22 206047 sc-eQTL 3.98e-01 0.0909 0.107 0.17 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 120175 sc-eQTL 5.88e-01 -0.065 0.12 0.17 gdT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 953786 sc-eQTL 4.00e-01 0.101 0.12 0.17 gdT L2
ENSG00000116209 TMEM59 953866 sc-eQTL 5.63e-01 0.0706 0.122 0.17 gdT L2
ENSG00000116221 MRPL37 823329 sc-eQTL 2.15e-01 0.173 0.139 0.17 gdT L2
ENSG00000157216 SSBP3 593891 sc-eQTL 6.41e-01 0.04 0.0856 0.17 gdT L2
ENSG00000162402 USP24 -207994 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0177 0.115 0.17 gdT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 807334 sc-eQTL 7.33e-01 0.0409 0.12 0.17 gdT L2
ENSG00000243725 TTC4 291509 sc-eQTL 6.49e-01 0.0614 0.135 0.17 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 120175 sc-eQTL 3.52e-01 -0.0832 0.0892 0.151 intMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 953786 sc-eQTL 1.65e-01 0.154 0.111 0.151 intMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 953866 sc-eQTL 1.98e-01 -0.105 0.0815 0.151 intMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 823329 sc-eQTL 4.81e-01 0.0883 0.125 0.151 intMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 593891 sc-eQTL 9.17e-02 0.215 0.127 0.151 intMono L2
ENSG00000162402 USP24 -207994 sc-eQTL 1.41e-01 0.167 0.113 0.151 intMono L2
ENSG00000243725 TTC4 291509 sc-eQTL 2.82e-01 -0.131 0.121 0.151 intMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 120175 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0592 0.0852 0.156 ncMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 953786 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00518 0.107 0.156 ncMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 953866 sc-eQTL 1.47e-01 -0.124 0.0849 0.156 ncMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 823329 sc-eQTL 5.16e-01 0.0716 0.11 0.156 ncMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 593891 sc-eQTL 6.38e-01 0.0568 0.12 0.156 ncMono L2
ENSG00000162402 USP24 -207994 sc-eQTL 6.11e-01 -0.049 0.0962 0.156 ncMono L2
ENSG00000243725 TTC4 291509 sc-eQTL 1.25e-01 -0.174 0.113 0.156 ncMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 120175 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0571 0.105 0.155 pDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 953786 sc-eQTL 4.09e-01 -0.104 0.126 0.155 pDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 953866 sc-eQTL 2.66e-01 0.112 0.1 0.155 pDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 823329 sc-eQTL 2.81e-02 0.291 0.131 0.155 pDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 593891 sc-eQTL 2.71e-01 -0.131 0.118 0.155 pDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 465113 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0157 0.0498 0.155 pDC L2
ENSG00000162402 USP24 -207994 sc-eQTL 2.80e-01 0.0909 0.0839 0.155 pDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 807334 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0551 0.115 0.155 pDC L2
ENSG00000243725 TTC4 291509 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0983 0.133 0.155 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 206047 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00752 0.111 0.156 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 120175 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0695 0.111 0.156 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 953786 sc-eQTL 1.81e-01 -0.144 0.107 0.156 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 953866 sc-eQTL 8.15e-01 0.0196 0.0836 0.156 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 823329 sc-eQTL 1.17e-01 0.157 0.0996 0.156 B_Memory LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 593891 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0634 0.087 0.156 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -207994 sc-eQTL 8.40e-01 0.0161 0.0794 0.156 B_Memory LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 807334 sc-eQTL 9.95e-01 0.000837 0.122 0.156 B_Memory LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 291509 sc-eQTL 2.84e-01 -0.117 0.109 0.156 B_Memory LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 206047 sc-eQTL 7.91e-01 0.0316 0.119 0.156 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 120175 sc-eQTL 3.31e-01 -0.105 0.107 0.156 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 953786 sc-eQTL 5.49e-02 0.186 0.0962 0.156 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 953866 sc-eQTL 3.77e-01 -0.061 0.0689 0.156 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 823329 sc-eQTL 8.46e-01 0.0193 0.0992 0.156 B_Naive LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 593891 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0313 0.0887 0.156 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -207994 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0514 0.076 0.156 B_Naive LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 807334 sc-eQTL 7.65e-02 0.213 0.12 0.156 B_Naive LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 291509 sc-eQTL 6.22e-02 -0.211 0.112 0.156 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 120175 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0331 0.0669 0.156 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 953786 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0376 0.0838 0.156 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 953866 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0532 0.0577 0.156 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 823329 sc-eQTL 1.85e-01 0.135 0.102 0.156 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 593891 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0266 0.107 0.156 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -207994 sc-eQTL 2.83e-01 -0.0786 0.073 0.156 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 291509 sc-eQTL 9.27e-01 0.0112 0.121 0.156 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 120175 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0354 0.0815 0.153 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 953786 sc-eQTL 3.17e-01 0.107 0.107 0.153 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 953866 sc-eQTL 1.90e-01 -0.104 0.0793 0.153 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 823329 sc-eQTL 5.54e-01 0.0647 0.109 0.153 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 593891 sc-eQTL 1.18e-01 0.181 0.116 0.153 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -207994 sc-eQTL 9.41e-01 0.00674 0.0918 0.153 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 291509 sc-eQTL 8.07e-02 -0.2 0.114 0.153 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 206047 sc-eQTL 8.27e-01 0.0216 0.0986 0.153 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 120175 sc-eQTL 3.51e-01 -0.0962 0.103 0.153 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 953786 sc-eQTL 7.94e-01 0.0264 0.101 0.153 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 953866 sc-eQTL 1.19e-01 -0.122 0.0777 0.153 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 823329 sc-eQTL 4.39e-01 -0.081 0.105 0.153 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 593891 sc-eQTL 2.10e-01 0.108 0.0856 0.153 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162398 LEXM 201307 sc-eQTL 1.80e-01 0.13 0.0964 0.153 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -207994 sc-eQTL 7.68e-02 -0.108 0.0609 0.153 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 291509 sc-eQTL 6.04e-01 0.0568 0.109 0.153 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000162390 \N 465113 9.47e-07 8.69e-07 1.45e-07 3.22e-07 1.18e-07 2.95e-07 7.02e-07 2.03e-07 8.32e-07 3.05e-07 1.09e-06 5.4e-07 1.05e-06 1.72e-07 3.16e-07 3.79e-07 5.27e-07 4.44e-07 2.88e-07 2.15e-07 2.49e-07 5.34e-07 4.69e-07 2.68e-07 1.46e-06 2.41e-07 4.9e-07 3.88e-07 6.19e-07 7.42e-07 4.47e-07 5.4e-08 5.78e-08 1.73e-07 3.34e-07 1.19e-07 1.64e-07 1.03e-07 7.99e-08 1.58e-08 1.36e-07 8.03e-07 5.51e-08 1.29e-08 2e-07 2.71e-08 1.18e-07 2.25e-08 6.14e-08