logo

Genes within 1Mb (chr1:54998926:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 197603 sc-eQTL 5.71e-01 0.0584 0.103 0.186 B L1
ENSG00000116133 DHCR24 111731 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0639 0.0972 0.186 B L1
ENSG00000116205 TCEANC2 945342 sc-eQTL 7.00e-02 -0.152 0.0833 0.186 B L1
ENSG00000116209 TMEM59 945422 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0123 0.0511 0.186 B L1
ENSG00000116221 MRPL37 814885 sc-eQTL 8.21e-01 0.0152 0.0669 0.186 B L1
ENSG00000157216 SSBP3 585447 sc-eQTL 1.82e-01 0.0934 0.0698 0.186 B L1
ENSG00000162402 USP24 -216438 sc-eQTL 6.52e-01 0.0268 0.0593 0.186 B L1
ENSG00000215883 CYB5RL 798890 sc-eQTL 4.29e-01 0.0905 0.114 0.186 B L1
ENSG00000243725 TTC4 283065 sc-eQTL 9.88e-02 0.164 0.0989 0.186 B L1
ENSG00000006555 TTC22 197603 sc-eQTL 6.50e-01 0.0362 0.0796 0.186 CD4T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 945342 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0474 0.0651 0.186 CD4T L1
ENSG00000116209 TMEM59 945422 sc-eQTL 6.08e-01 0.0311 0.0607 0.186 CD4T L1
ENSG00000116221 MRPL37 814885 sc-eQTL 5.76e-01 -0.047 0.0838 0.186 CD4T L1
ENSG00000157216 SSBP3 585447 sc-eQTL 7.76e-02 -0.123 0.0691 0.186 CD4T L1
ENSG00000162402 USP24 -216438 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0103 0.0568 0.186 CD4T L1
ENSG00000243725 TTC4 283065 sc-eQTL 1.11e-02 0.215 0.0841 0.186 CD4T L1
ENSG00000006555 TTC22 197603 sc-eQTL 5.80e-01 0.0381 0.0687 0.186 CD8T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 945342 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0239 0.0857 0.186 CD8T L1
ENSG00000116209 TMEM59 945422 sc-eQTL 9.33e-01 0.00503 0.0595 0.186 CD8T L1
ENSG00000116221 MRPL37 814885 sc-eQTL 9.79e-01 0.00216 0.0819 0.186 CD8T L1
ENSG00000157216 SSBP3 585447 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0318 0.0588 0.186 CD8T L1
ENSG00000162402 USP24 -216438 sc-eQTL 1.54e-02 0.137 0.0561 0.186 CD8T L1
ENSG00000243725 TTC4 283065 sc-eQTL 4.11e-01 0.0812 0.0985 0.186 CD8T L1
ENSG00000116133 DHCR24 111731 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00765 0.0931 0.182 DC L1
ENSG00000116205 TCEANC2 945342 sc-eQTL 3.03e-01 0.107 0.104 0.182 DC L1
ENSG00000116209 TMEM59 945422 sc-eQTL 2.41e-01 0.0962 0.0818 0.182 DC L1
ENSG00000116221 MRPL37 814885 sc-eQTL 2.78e-01 -0.119 0.11 0.182 DC L1
ENSG00000157216 SSBP3 585447 sc-eQTL 5.01e-02 -0.192 0.0973 0.182 DC L1
ENSG00000162390 ACOT11 456669 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0623 0.0944 0.182 DC L1
ENSG00000162402 USP24 -216438 sc-eQTL 1.80e-02 -0.134 0.0562 0.182 DC L1
ENSG00000215883 CYB5RL 798890 sc-eQTL 1.72e-01 0.141 0.103 0.182 DC L1
ENSG00000243725 TTC4 283065 sc-eQTL 8.49e-01 0.0211 0.111 0.182 DC L1
ENSG00000116133 DHCR24 111731 sc-eQTL 1.05e-01 -0.108 0.0663 0.186 Mono L1
ENSG00000116205 TCEANC2 945342 sc-eQTL 7.79e-02 0.127 0.0714 0.186 Mono L1
ENSG00000116209 TMEM59 945422 sc-eQTL 4.91e-02 0.105 0.053 0.186 Mono L1
ENSG00000116221 MRPL37 814885 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0433 0.0894 0.186 Mono L1
ENSG00000157216 SSBP3 585447 sc-eQTL 9.70e-01 0.00388 0.102 0.186 Mono L1
ENSG00000162402 USP24 -216438 sc-eQTL 4.00e-02 0.125 0.0604 0.186 Mono L1
ENSG00000243725 TTC4 283065 sc-eQTL 8.02e-01 -0.027 0.107 0.186 Mono L1
ENSG00000006555 TTC22 197603 sc-eQTL 7.82e-01 0.0255 0.0919 0.187 NK L1
ENSG00000116133 DHCR24 111731 sc-eQTL 5.18e-02 -0.18 0.092 0.187 NK L1
ENSG00000116205 TCEANC2 945342 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00698 0.0915 0.187 NK L1
ENSG00000116209 TMEM59 945422 sc-eQTL 7.24e-01 0.0254 0.0717 0.187 NK L1
ENSG00000116221 MRPL37 814885 sc-eQTL 6.15e-01 0.0448 0.0891 0.187 NK L1
ENSG00000157216 SSBP3 585447 sc-eQTL 3.70e-01 0.0694 0.0772 0.187 NK L1
ENSG00000162398 LEXM 192863 sc-eQTL 9.43e-01 0.00622 0.0868 0.187 NK L1
ENSG00000162402 USP24 -216438 sc-eQTL 8.46e-03 0.138 0.0518 0.187 NK L1
ENSG00000243725 TTC4 283065 sc-eQTL 7.73e-01 0.0287 0.0995 0.187 NK L1
ENSG00000006555 TTC22 197603 sc-eQTL 1.76e-01 -0.11 0.0812 0.186 Other_T L1
ENSG00000116133 DHCR24 111731 sc-eQTL 3.18e-01 0.0631 0.0631 0.186 Other_T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 945342 sc-eQTL 3.00e-01 -0.0981 0.0944 0.186 Other_T L1
ENSG00000116209 TMEM59 945422 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0173 0.065 0.186 Other_T L1
ENSG00000116221 MRPL37 814885 sc-eQTL 7.31e-01 -0.021 0.0609 0.186 Other_T L1
ENSG00000157216 SSBP3 585447 sc-eQTL 9.23e-01 -0.00679 0.0704 0.186 Other_T L1
ENSG00000162402 USP24 -216438 sc-eQTL 5.83e-01 0.0412 0.0749 0.186 Other_T L1
ENSG00000215883 CYB5RL 798890 sc-eQTL 7.96e-01 0.0265 0.102 0.186 Other_T L1
ENSG00000243725 TTC4 283065 sc-eQTL 9.01e-01 0.0128 0.102 0.186 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 197603 sc-eQTL 3.82e-01 0.0781 0.0891 0.176 B_Activated L2
ENSG00000116133 DHCR24 111731 sc-eQTL 3.89e-01 0.0904 0.105 0.176 B_Activated L2
ENSG00000116205 TCEANC2 945342 sc-eQTL 5.76e-01 -0.063 0.113 0.176 B_Activated L2
ENSG00000116209 TMEM59 945422 sc-eQTL 1.00e-01 0.196 0.119 0.176 B_Activated L2
ENSG00000116221 MRPL37 814885 sc-eQTL 4.20e-01 -0.104 0.129 0.176 B_Activated L2
ENSG00000157216 SSBP3 585447 sc-eQTL 9.09e-01 0.0133 0.117 0.176 B_Activated L2
ENSG00000162402 USP24 -216438 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0171 0.114 0.176 B_Activated L2
ENSG00000215883 CYB5RL 798890 sc-eQTL 9.37e-01 0.00793 0.101 0.176 B_Activated L2
ENSG00000243725 TTC4 283065 sc-eQTL 3.63e-01 0.0995 0.109 0.176 B_Activated L2
ENSG00000006555 TTC22 197603 sc-eQTL 8.81e-01 0.0165 0.11 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000116133 DHCR24 111731 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0285 0.102 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000116205 TCEANC2 945342 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0187 0.102 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000116209 TMEM59 945422 sc-eQTL 9.56e-01 0.00483 0.087 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000116221 MRPL37 814885 sc-eQTL 1.19e-01 -0.159 0.102 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000157216 SSBP3 585447 sc-eQTL 3.98e-02 0.196 0.0947 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000162402 USP24 -216438 sc-eQTL 8.44e-02 0.139 0.08 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000215883 CYB5RL 798890 sc-eQTL 6.08e-01 0.0586 0.114 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000243725 TTC4 283065 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0581 0.104 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000006555 TTC22 197603 sc-eQTL 1.56e-01 0.148 0.104 0.183 B_Memory L2
ENSG00000116133 DHCR24 111731 sc-eQTL 3.26e-01 0.102 0.103 0.183 B_Memory L2
ENSG00000116205 TCEANC2 945342 sc-eQTL 6.01e-01 -0.058 0.111 0.183 B_Memory L2
ENSG00000116209 TMEM59 945422 sc-eQTL 8.54e-01 -0.017 0.0925 0.183 B_Memory L2
ENSG00000116221 MRPL37 814885 sc-eQTL 1.74e-01 0.127 0.0933 0.183 B_Memory L2
ENSG00000157216 SSBP3 585447 sc-eQTL 5.82e-01 0.0481 0.0874 0.183 B_Memory L2
ENSG00000162402 USP24 -216438 sc-eQTL 6.00e-01 0.0449 0.0855 0.183 B_Memory L2
ENSG00000215883 CYB5RL 798890 sc-eQTL 7.94e-02 0.185 0.105 0.183 B_Memory L2
ENSG00000243725 TTC4 283065 sc-eQTL 3.37e-01 0.105 0.109 0.183 B_Memory L2
ENSG00000006555 TTC22 197603 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0142 0.108 0.186 B_Naive1 L2
ENSG00000116133 DHCR24 111731 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0266 0.101 0.186 B_Naive1 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 945342 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0281 0.0905 0.186 B_Naive1 L2
ENSG00000116209 TMEM59 945422 sc-eQTL 8.02e-01 0.0165 0.0657 0.186 B_Naive1 L2
ENSG00000116221 MRPL37 814885 sc-eQTL 4.63e-01 0.0711 0.0968 0.186 B_Naive1 L2
ENSG00000157216 SSBP3 585447 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0326 0.0923 0.186 B_Naive1 L2
ENSG00000162402 USP24 -216438 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0107 0.0727 0.186 B_Naive1 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 798890 sc-eQTL 7.22e-01 -0.039 0.11 0.186 B_Naive1 L2
ENSG00000243725 TTC4 283065 sc-eQTL 4.12e-02 0.201 0.0981 0.186 B_Naive1 L2
ENSG00000006555 TTC22 197603 sc-eQTL 6.43e-02 0.198 0.107 0.187 B_Naive2 L2
ENSG00000116133 DHCR24 111731 sc-eQTL 4.43e-02 -0.188 0.0927 0.187 B_Naive2 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 945342 sc-eQTL 1.72e-01 -0.142 0.103 0.187 B_Naive2 L2
ENSG00000116209 TMEM59 945422 sc-eQTL 8.23e-01 0.0192 0.0855 0.187 B_Naive2 L2
ENSG00000116221 MRPL37 814885 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0526 0.101 0.187 B_Naive2 L2
ENSG00000157216 SSBP3 585447 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0803 0.099 0.187 B_Naive2 L2
ENSG00000162402 USP24 -216438 sc-eQTL 3.72e-01 -0.0702 0.0784 0.187 B_Naive2 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 798890 sc-eQTL 8.05e-01 0.0274 0.111 0.187 B_Naive2 L2
ENSG00000243725 TTC4 283065 sc-eQTL 6.27e-01 -0.056 0.115 0.187 B_Naive2 L2
ENSG00000006555 TTC22 197603 sc-eQTL 4.69e-01 0.0728 0.1 0.186 CD4_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 945342 sc-eQTL 1.62e-01 -0.145 0.103 0.186 CD4_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 945422 sc-eQTL 2.93e-01 -0.0989 0.0938 0.186 CD4_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 814885 sc-eQTL 9.46e-01 0.00784 0.116 0.186 CD4_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 585447 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00295 0.0712 0.186 CD4_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -216438 sc-eQTL 1.96e-01 0.126 0.0974 0.186 CD4_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 283065 sc-eQTL 5.04e-01 0.0732 0.109 0.186 CD4_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 197603 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0365 0.0933 0.186 CD4_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 945342 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0132 0.071 0.186 CD4_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 945422 sc-eQTL 3.70e-01 0.0619 0.0689 0.186 CD4_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 814885 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0232 0.089 0.186 CD4_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 585447 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0149 0.071 0.186 CD4_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -216438 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0343 0.0613 0.186 CD4_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 283065 sc-eQTL 2.85e-02 0.204 0.0924 0.186 CD4_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 197603 sc-eQTL 1.44e-01 0.143 0.0972 0.186 CD4_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 945342 sc-eQTL 9.04e-01 0.0115 0.0951 0.186 CD4_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 945422 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0243 0.0717 0.186 CD4_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 814885 sc-eQTL 9.30e-01 0.00797 0.0902 0.186 CD4_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 585447 sc-eQTL 9.91e-04 -0.288 0.0862 0.186 CD4_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -216438 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0457 0.0732 0.186 CD4_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 283065 sc-eQTL 3.77e-01 0.0932 0.105 0.186 CD4_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 197603 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0196 0.111 0.186 CD4_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 945342 sc-eQTL 7.88e-01 0.0283 0.105 0.186 CD4_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 945422 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00641 0.0812 0.186 CD4_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 814885 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0244 0.104 0.186 CD4_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 585447 sc-eQTL 5.54e-01 -0.053 0.0895 0.186 CD4_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -216438 sc-eQTL 2.14e-01 0.101 0.0812 0.186 CD4_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 283065 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0549 0.108 0.186 CD4_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 197603 sc-eQTL 7.79e-01 0.0252 0.0894 0.186 CD8_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 945342 sc-eQTL 3.27e-01 -0.097 0.0987 0.186 CD8_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 945422 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0346 0.086 0.186 CD8_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 814885 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0535 0.102 0.186 CD8_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 585447 sc-eQTL 5.01e-01 0.0469 0.0696 0.186 CD8_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -216438 sc-eQTL 1.26e-01 0.106 0.0689 0.186 CD8_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 283065 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0268 0.104 0.186 CD8_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 197603 sc-eQTL 8.82e-01 0.0149 0.101 0.186 CD8_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 945342 sc-eQTL 7.79e-02 0.16 0.0903 0.186 CD8_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 945422 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0789 0.0888 0.186 CD8_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 814885 sc-eQTL 9.99e-01 0.000147 0.107 0.186 CD8_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 585447 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0685 0.0806 0.186 CD8_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -216438 sc-eQTL 5.39e-01 0.0452 0.0734 0.186 CD8_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 283065 sc-eQTL 1.34e-01 0.161 0.107 0.186 CD8_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 197603 sc-eQTL 7.13e-01 0.039 0.106 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 945342 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0243 0.106 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 945422 sc-eQTL 6.86e-01 -0.038 0.0936 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 814885 sc-eQTL 1.38e-01 -0.157 0.106 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 585447 sc-eQTL 8.46e-01 -0.018 0.0922 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -216438 sc-eQTL 8.53e-01 0.0165 0.0893 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 283065 sc-eQTL 3.25e-01 0.107 0.108 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 197603 sc-eQTL 5.87e-01 0.0571 0.105 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 945342 sc-eQTL 2.98e-01 -0.114 0.109 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 945422 sc-eQTL 1.05e-01 0.172 0.105 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 814885 sc-eQTL 6.61e-01 0.0472 0.107 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 585447 sc-eQTL 8.31e-01 0.0217 0.102 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -216438 sc-eQTL 7.81e-01 0.0299 0.107 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 283065 sc-eQTL 1.66e-01 -0.151 0.108 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 197603 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0804 0.098 0.184 MAIT L2
ENSG00000116133 DHCR24 111731 sc-eQTL 7.62e-01 0.022 0.0726 0.184 MAIT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 945342 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0376 0.102 0.184 MAIT L2
ENSG00000116209 TMEM59 945422 sc-eQTL 2.19e-01 -0.113 0.092 0.184 MAIT L2
ENSG00000116221 MRPL37 814885 sc-eQTL 8.97e-02 0.19 0.112 0.184 MAIT L2
ENSG00000157216 SSBP3 585447 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0878 0.0993 0.184 MAIT L2
ENSG00000162402 USP24 -216438 sc-eQTL 8.18e-01 0.0203 0.0883 0.184 MAIT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 798890 sc-eQTL 5.80e-01 -0.057 0.103 0.184 MAIT L2
ENSG00000243725 TTC4 283065 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0285 0.102 0.184 MAIT L2
ENSG00000006555 TTC22 197603 sc-eQTL 9.80e-01 0.00266 0.107 0.187 NK_CD56bright L2
ENSG00000116133 DHCR24 111731 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0112 0.0944 0.187 NK_CD56bright L2
ENSG00000116205 TCEANC2 945342 sc-eQTL 8.87e-01 0.0142 0.0997 0.187 NK_CD56bright L2
ENSG00000116209 TMEM59 945422 sc-eQTL 4.85e-01 0.0679 0.0972 0.187 NK_CD56bright L2
ENSG00000116221 MRPL37 814885 sc-eQTL 7.07e-01 0.0409 0.109 0.187 NK_CD56bright L2
ENSG00000157216 SSBP3 585447 sc-eQTL 8.56e-02 0.14 0.0813 0.187 NK_CD56bright L2
ENSG00000162398 LEXM 192863 sc-eQTL 6.46e-01 0.0444 0.0967 0.187 NK_CD56bright L2
ENSG00000162402 USP24 -216438 sc-eQTL 3.51e-01 0.0777 0.0831 0.187 NK_CD56bright L2
ENSG00000243725 TTC4 283065 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0714 0.105 0.187 NK_CD56bright L2
ENSG00000006555 TTC22 197603 sc-eQTL 8.95e-01 0.012 0.0913 0.185 NK_CD56dim L2
ENSG00000116133 DHCR24 111731 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0693 0.0952 0.185 NK_CD56dim L2
ENSG00000116205 TCEANC2 945342 sc-eQTL 3.19e-01 -0.103 0.103 0.185 NK_CD56dim L2
ENSG00000116209 TMEM59 945422 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0353 0.0765 0.185 NK_CD56dim L2
ENSG00000116221 MRPL37 814885 sc-eQTL 8.63e-01 0.0172 0.0995 0.185 NK_CD56dim L2
ENSG00000157216 SSBP3 585447 sc-eQTL 4.06e-01 0.0677 0.0813 0.185 NK_CD56dim L2
ENSG00000162398 LEXM 192863 sc-eQTL 8.76e-01 0.0147 0.0937 0.185 NK_CD56dim L2
ENSG00000162402 USP24 -216438 sc-eQTL 1.52e-02 0.144 0.0587 0.185 NK_CD56dim L2
ENSG00000243725 TTC4 283065 sc-eQTL 4.03e-01 0.0852 0.102 0.185 NK_CD56dim L2
ENSG00000006555 TTC22 197603 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0501 0.108 0.185 NK_HLA L2
ENSG00000116133 DHCR24 111731 sc-eQTL 1.14e-01 -0.166 0.104 0.185 NK_HLA L2
ENSG00000116205 TCEANC2 945342 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0857 0.101 0.185 NK_HLA L2
ENSG00000116209 TMEM59 945422 sc-eQTL 4.05e-01 0.0838 0.1 0.185 NK_HLA L2
ENSG00000116221 MRPL37 814885 sc-eQTL 5.22e-01 0.071 0.111 0.185 NK_HLA L2
ENSG00000157216 SSBP3 585447 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0553 0.0904 0.185 NK_HLA L2
ENSG00000162398 LEXM 192863 sc-eQTL 9.82e-03 -0.262 0.1 0.185 NK_HLA L2
ENSG00000162402 USP24 -216438 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00537 0.0749 0.185 NK_HLA L2
ENSG00000243725 TTC4 283065 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0702 0.112 0.185 NK_HLA L2
ENSG00000006555 TTC22 197603 sc-eQTL 1.76e-01 0.131 0.0963 0.185 NK_cytokine L2
ENSG00000116133 DHCR24 111731 sc-eQTL 7.81e-02 -0.172 0.0971 0.185 NK_cytokine L2
ENSG00000116205 TCEANC2 945342 sc-eQTL 8.86e-01 -0.014 0.0971 0.185 NK_cytokine L2
ENSG00000116209 TMEM59 945422 sc-eQTL 8.68e-01 0.0132 0.0789 0.185 NK_cytokine L2
ENSG00000116221 MRPL37 814885 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0855 0.0971 0.185 NK_cytokine L2
ENSG00000157216 SSBP3 585447 sc-eQTL 4.41e-01 0.0629 0.0815 0.185 NK_cytokine L2
ENSG00000162398 LEXM 192863 sc-eQTL 3.15e-01 0.102 0.102 0.185 NK_cytokine L2
ENSG00000162402 USP24 -216438 sc-eQTL 1.45e-01 0.101 0.0691 0.185 NK_cytokine L2
ENSG00000243725 TTC4 283065 sc-eQTL 3.45e-01 0.0973 0.103 0.185 NK_cytokine L2
ENSG00000006555 TTC22 197603 sc-eQTL 2.74e-01 -0.151 0.138 0.163 PB L2
ENSG00000116133 DHCR24 111731 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0265 0.123 0.163 PB L2
ENSG00000116205 TCEANC2 945342 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0787 0.149 0.163 PB L2
ENSG00000116209 TMEM59 945422 sc-eQTL 6.09e-01 0.032 0.0623 0.163 PB L2
ENSG00000116221 MRPL37 814885 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0335 0.113 0.163 PB L2
ENSG00000157216 SSBP3 585447 sc-eQTL 6.31e-01 0.063 0.131 0.163 PB L2
ENSG00000162402 USP24 -216438 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0907 0.148 0.163 PB L2
ENSG00000215883 CYB5RL 798890 sc-eQTL 3.65e-02 0.32 0.151 0.163 PB L2
ENSG00000243725 TTC4 283065 sc-eQTL 4.83e-01 0.101 0.144 0.163 PB L2
ENSG00000006555 TTC22 197603 sc-eQTL 6.79e-02 -0.179 0.0974 0.189 Pro_T L2
ENSG00000116133 DHCR24 111731 sc-eQTL 6.90e-01 0.0333 0.0834 0.189 Pro_T L2
ENSG00000116205 TCEANC2 945342 sc-eQTL 4.62e-02 -0.202 0.101 0.189 Pro_T L2
ENSG00000116209 TMEM59 945422 sc-eQTL 8.01e-01 0.0178 0.0707 0.189 Pro_T L2
ENSG00000116221 MRPL37 814885 sc-eQTL 1.63e-01 0.0964 0.0689 0.189 Pro_T L2
ENSG00000157216 SSBP3 585447 sc-eQTL 5.32e-01 0.0485 0.0776 0.189 Pro_T L2
ENSG00000162402 USP24 -216438 sc-eQTL 1.44e-01 0.138 0.0942 0.189 Pro_T L2
ENSG00000215883 CYB5RL 798890 sc-eQTL 1.31e-01 0.141 0.0929 0.189 Pro_T L2
ENSG00000243725 TTC4 283065 sc-eQTL 1.99e-01 0.133 0.104 0.189 Pro_T L2
ENSG00000006555 TTC22 197603 sc-eQTL 8.92e-03 0.252 0.0954 0.186 Treg L2
ENSG00000116205 TCEANC2 945342 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00706 0.104 0.186 Treg L2
ENSG00000116209 TMEM59 945422 sc-eQTL 6.84e-01 0.0334 0.0821 0.186 Treg L2
ENSG00000116221 MRPL37 814885 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0574 0.102 0.186 Treg L2
ENSG00000157216 SSBP3 585447 sc-eQTL 3.67e-01 -0.0818 0.0905 0.186 Treg L2
ENSG00000162402 USP24 -216438 sc-eQTL 7.81e-01 0.024 0.0863 0.186 Treg L2
ENSG00000243725 TTC4 283065 sc-eQTL 7.04e-02 0.196 0.108 0.186 Treg L2
ENSG00000116133 DHCR24 111731 sc-eQTL 6.66e-01 0.0413 0.0956 0.168 cDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 945342 sc-eQTL 8.36e-02 0.195 0.112 0.168 cDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 945422 sc-eQTL 6.91e-01 0.0381 0.0958 0.168 cDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 814885 sc-eQTL 2.75e-01 -0.134 0.122 0.168 cDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 585447 sc-eQTL 1.87e-02 -0.264 0.111 0.168 cDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 456669 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0817 0.105 0.168 cDC L2
ENSG00000162402 USP24 -216438 sc-eQTL 2.38e-01 -0.139 0.117 0.168 cDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 798890 sc-eQTL 1.03e-01 0.164 0.1 0.168 cDC L2
ENSG00000243725 TTC4 283065 sc-eQTL 4.31e-01 0.0952 0.121 0.168 cDC L2
ENSG00000116133 DHCR24 111731 sc-eQTL 8.91e-01 -0.00912 0.0665 0.186 cMono_IL1B L2
ENSG00000116205 TCEANC2 945342 sc-eQTL 2.93e-01 0.0972 0.0921 0.186 cMono_IL1B L2
ENSG00000116209 TMEM59 945422 sc-eQTL 4.02e-02 0.115 0.0555 0.186 cMono_IL1B L2
ENSG00000116221 MRPL37 814885 sc-eQTL 2.92e-01 0.105 0.0996 0.186 cMono_IL1B L2
ENSG00000157216 SSBP3 585447 sc-eQTL 3.79e-01 0.0896 0.102 0.186 cMono_IL1B L2
ENSG00000162402 USP24 -216438 sc-eQTL 2.31e-01 0.0901 0.075 0.186 cMono_IL1B L2
ENSG00000243725 TTC4 283065 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0498 0.115 0.186 cMono_IL1B L2
ENSG00000116133 DHCR24 111731 sc-eQTL 2.64e-01 -0.0706 0.063 0.186 cMono_S100A L2
ENSG00000116205 TCEANC2 945342 sc-eQTL 1.95e-01 0.125 0.096 0.186 cMono_S100A L2
ENSG00000116209 TMEM59 945422 sc-eQTL 6.41e-01 0.036 0.0771 0.186 cMono_S100A L2
ENSG00000116221 MRPL37 814885 sc-eQTL 3.17e-01 -0.112 0.111 0.186 cMono_S100A L2
ENSG00000157216 SSBP3 585447 sc-eQTL 5.51e-01 -0.069 0.116 0.186 cMono_S100A L2
ENSG00000162402 USP24 -216438 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0707 0.0935 0.186 cMono_S100A L2
ENSG00000243725 TTC4 283065 sc-eQTL 9.52e-01 0.0071 0.117 0.186 cMono_S100A L2
ENSG00000006555 TTC22 197603 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0757 0.101 0.191 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 111731 sc-eQTL 4.16e-01 0.0917 0.112 0.191 gdT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 945342 sc-eQTL 6.19e-02 -0.21 0.112 0.191 gdT L2
ENSG00000116209 TMEM59 945422 sc-eQTL 2.66e-01 0.128 0.114 0.191 gdT L2
ENSG00000116221 MRPL37 814885 sc-eQTL 3.47e-01 -0.124 0.131 0.191 gdT L2
ENSG00000157216 SSBP3 585447 sc-eQTL 3.83e-01 0.0704 0.0804 0.191 gdT L2
ENSG00000162402 USP24 -216438 sc-eQTL 2.77e-01 0.118 0.108 0.191 gdT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 798890 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0585 0.112 0.191 gdT L2
ENSG00000243725 TTC4 283065 sc-eQTL 1.74e-01 0.172 0.126 0.191 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 111731 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0204 0.0851 0.178 intMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 945342 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0565 0.106 0.178 intMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 945422 sc-eQTL 9.00e-01 0.00982 0.0779 0.178 intMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 814885 sc-eQTL 2.32e-01 -0.142 0.119 0.178 intMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 585447 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0731 0.121 0.178 intMono L2
ENSG00000162402 USP24 -216438 sc-eQTL 5.29e-01 0.0684 0.108 0.178 intMono L2
ENSG00000243725 TTC4 283065 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0107 0.115 0.178 intMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 111731 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0174 0.0787 0.188 ncMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 945342 sc-eQTL 4.28e-01 0.078 0.0982 0.188 ncMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 945422 sc-eQTL 1.30e-03 0.25 0.0767 0.188 ncMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 814885 sc-eQTL 5.10e-01 -0.067 0.101 0.188 ncMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 585447 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0458 0.111 0.188 ncMono L2
ENSG00000162402 USP24 -216438 sc-eQTL 1.31e-01 0.134 0.0882 0.188 ncMono L2
ENSG00000243725 TTC4 283065 sc-eQTL 8.52e-01 0.0196 0.105 0.188 ncMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 111731 sc-eQTL 5.30e-01 0.0624 0.0991 0.172 pDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 945342 sc-eQTL 4.67e-01 0.0867 0.119 0.172 pDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 945422 sc-eQTL 9.19e-01 0.00968 0.095 0.172 pDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 814885 sc-eQTL 2.35e-01 -0.15 0.126 0.172 pDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 585447 sc-eQTL 9.64e-01 0.00504 0.112 0.172 pDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 456669 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0372 0.047 0.172 pDC L2
ENSG00000162402 USP24 -216438 sc-eQTL 2.65e-01 -0.0886 0.0793 0.172 pDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 798890 sc-eQTL 3.64e-01 0.0987 0.108 0.172 pDC L2
ENSG00000243725 TTC4 283065 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0507 0.126 0.172 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 197603 sc-eQTL 1.53e-01 0.147 0.102 0.186 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 111731 sc-eQTL 7.60e-01 0.0315 0.103 0.186 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 945342 sc-eQTL 1.31e-01 -0.151 0.0993 0.186 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 945422 sc-eQTL 6.42e-01 0.0362 0.0777 0.186 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 814885 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0406 0.093 0.186 B_Memory LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 585447 sc-eQTL 2.35e-01 0.096 0.0807 0.186 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -216438 sc-eQTL 1.23e-01 0.114 0.0734 0.186 B_Memory LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 798890 sc-eQTL 1.82e-01 0.151 0.113 0.186 B_Memory LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 283065 sc-eQTL 2.03e-01 0.129 0.101 0.186 B_Memory LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 197603 sc-eQTL 5.49e-01 0.0647 0.108 0.186 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 111731 sc-eQTL 2.19e-01 -0.119 0.0969 0.186 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 945342 sc-eQTL 2.74e-01 -0.0962 0.0876 0.186 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 945422 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0357 0.0624 0.186 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 814885 sc-eQTL 5.96e-01 0.0477 0.0897 0.186 B_Naive LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 585447 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0474 0.0802 0.186 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -216438 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0232 0.0689 0.186 B_Naive LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 798890 sc-eQTL 5.64e-01 0.0629 0.109 0.186 B_Naive LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 283065 sc-eQTL 1.10e-01 0.163 0.102 0.186 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 111731 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0332 0.0646 0.186 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 945342 sc-eQTL 4.82e-02 0.159 0.0802 0.186 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 945422 sc-eQTL 6.17e-02 0.104 0.0553 0.186 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 814885 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0211 0.0988 0.186 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 585447 sc-eQTL 6.87e-01 0.0418 0.103 0.186 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -216438 sc-eQTL 5.45e-01 0.0428 0.0706 0.186 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 283065 sc-eQTL 4.37e-01 -0.091 0.117 0.186 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 111731 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0275 0.0765 0.188 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 945342 sc-eQTL 6.45e-01 0.0464 0.101 0.188 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 945422 sc-eQTL 1.20e-02 0.187 0.0737 0.188 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 814885 sc-eQTL 7.78e-02 -0.18 0.102 0.188 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 585447 sc-eQTL 3.57e-01 -0.101 0.109 0.188 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -216438 sc-eQTL 1.63e-01 0.12 0.0858 0.188 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 283065 sc-eQTL 7.12e-01 0.04 0.108 0.188 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 197603 sc-eQTL 5.78e-01 0.0498 0.0894 0.185 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 111731 sc-eQTL 1.16e-01 -0.146 0.0929 0.185 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 945342 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0318 0.0916 0.185 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 945422 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00645 0.0709 0.185 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 814885 sc-eQTL 9.17e-01 0.00995 0.0949 0.185 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 585447 sc-eQTL 3.96e-01 0.0661 0.0777 0.185 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162398 LEXM 192863 sc-eQTL 9.56e-01 0.00484 0.0878 0.185 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -216438 sc-eQTL 8.28e-03 0.146 0.0547 0.185 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 283065 sc-eQTL 3.24e-01 0.0978 0.0989 0.185 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000162399 BSND 733 pQTL 0.0411 0.0816 0.0399 0.00103 0.0 0.185

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina