logo

Genes within 1Mb (chr1:54975367:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 174044 sc-eQTL 6.31e-01 0.0506 0.105 0.169 B L1
ENSG00000116133 DHCR24 88172 sc-eQTL 3.97e-01 0.0843 0.0994 0.169 B L1
ENSG00000116205 TCEANC2 921783 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0649 0.0858 0.169 B L1
ENSG00000116209 TMEM59 921863 sc-eQTL 5.76e-01 0.0293 0.0523 0.169 B L1
ENSG00000116221 MRPL37 791326 sc-eQTL 7.74e-02 -0.121 0.068 0.169 B L1
ENSG00000157216 SSBP3 561888 sc-eQTL 2.12e-01 -0.0894 0.0714 0.169 B L1
ENSG00000162402 USP24 -239997 sc-eQTL 1.74e-01 -0.0825 0.0605 0.169 B L1
ENSG00000215883 CYB5RL 775331 sc-eQTL 4.43e-02 -0.234 0.116 0.169 B L1
ENSG00000243725 TTC4 259506 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0646 0.102 0.169 B L1
ENSG00000006555 TTC22 174044 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0707 0.0829 0.169 CD4T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 921783 sc-eQTL 8.02e-01 0.017 0.0679 0.169 CD4T L1
ENSG00000116209 TMEM59 921863 sc-eQTL 1.15e-01 0.0996 0.0629 0.169 CD4T L1
ENSG00000116221 MRPL37 791326 sc-eQTL 1.10e-02 -0.221 0.0861 0.169 CD4T L1
ENSG00000157216 SSBP3 561888 sc-eQTL 6.09e-01 0.0372 0.0726 0.169 CD4T L1
ENSG00000162402 USP24 -239997 sc-eQTL 1.64e-01 -0.0823 0.0589 0.169 CD4T L1
ENSG00000243725 TTC4 259506 sc-eQTL 7.35e-01 0.0302 0.089 0.169 CD4T L1
ENSG00000006555 TTC22 174044 sc-eQTL 9.95e-01 0.000476 0.0723 0.169 CD8T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 921783 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0434 0.09 0.169 CD8T L1
ENSG00000116209 TMEM59 921863 sc-eQTL 1.43e-01 0.0913 0.0622 0.169 CD8T L1
ENSG00000116221 MRPL37 791326 sc-eQTL 2.59e-01 -0.097 0.0858 0.169 CD8T L1
ENSG00000157216 SSBP3 561888 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0245 0.0618 0.169 CD8T L1
ENSG00000162402 USP24 -239997 sc-eQTL 9.01e-01 0.00744 0.0598 0.169 CD8T L1
ENSG00000243725 TTC4 259506 sc-eQTL 4.49e-01 0.0786 0.104 0.169 CD8T L1
ENSG00000116133 DHCR24 88172 sc-eQTL 3.40e-01 0.0945 0.0987 0.16 DC L1
ENSG00000116205 TCEANC2 921783 sc-eQTL 1.87e-01 0.146 0.11 0.16 DC L1
ENSG00000116209 TMEM59 921863 sc-eQTL 2.67e-01 -0.0967 0.0869 0.16 DC L1
ENSG00000116221 MRPL37 791326 sc-eQTL 8.40e-01 0.0236 0.117 0.16 DC L1
ENSG00000157216 SSBP3 561888 sc-eQTL 4.19e-01 0.0844 0.104 0.16 DC L1
ENSG00000162390 ACOT11 433110 sc-eQTL 9.88e-01 0.00147 0.1 0.16 DC L1
ENSG00000162402 USP24 -239997 sc-eQTL 3.35e-01 0.0585 0.0604 0.16 DC L1
ENSG00000215883 CYB5RL 775331 sc-eQTL 2.22e-01 -0.134 0.109 0.16 DC L1
ENSG00000243725 TTC4 259506 sc-eQTL 9.04e-01 0.0143 0.118 0.16 DC L1
ENSG00000116133 DHCR24 88172 sc-eQTL 3.42e-01 0.0661 0.0693 0.169 Mono L1
ENSG00000116205 TCEANC2 921783 sc-eQTL 1.74e-01 -0.102 0.0746 0.169 Mono L1
ENSG00000116209 TMEM59 921863 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0524 0.0555 0.169 Mono L1
ENSG00000116221 MRPL37 791326 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0429 0.093 0.169 Mono L1
ENSG00000157216 SSBP3 561888 sc-eQTL 9.18e-01 -0.011 0.107 0.169 Mono L1
ENSG00000162402 USP24 -239997 sc-eQTL 1.52e-01 -0.091 0.0633 0.169 Mono L1
ENSG00000243725 TTC4 259506 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0411 0.112 0.169 Mono L1
ENSG00000006555 TTC22 174044 sc-eQTL 7.80e-01 0.0266 0.0954 0.17 NK L1
ENSG00000116133 DHCR24 88172 sc-eQTL 2.07e-01 -0.121 0.0959 0.17 NK L1
ENSG00000116205 TCEANC2 921783 sc-eQTL 2.61e-01 0.107 0.0947 0.17 NK L1
ENSG00000116209 TMEM59 921863 sc-eQTL 2.08e-01 0.0937 0.0741 0.17 NK L1
ENSG00000116221 MRPL37 791326 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0494 0.0925 0.17 NK L1
ENSG00000157216 SSBP3 561888 sc-eQTL 1.70e-01 -0.11 0.0799 0.17 NK L1
ENSG00000162398 LEXM 169304 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0694 0.0899 0.17 NK L1
ENSG00000162402 USP24 -239997 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0435 0.0545 0.17 NK L1
ENSG00000243725 TTC4 259506 sc-eQTL 3.67e-01 0.0931 0.103 0.17 NK L1
ENSG00000006555 TTC22 174044 sc-eQTL 5.69e-01 0.0485 0.085 0.169 Other_T L1
ENSG00000116133 DHCR24 88172 sc-eQTL 2.07e-02 -0.152 0.0651 0.169 Other_T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 921783 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0105 0.0987 0.169 Other_T L1
ENSG00000116209 TMEM59 921863 sc-eQTL 4.11e-01 0.0557 0.0676 0.169 Other_T L1
ENSG00000116221 MRPL37 791326 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0492 0.0634 0.169 Other_T L1
ENSG00000157216 SSBP3 561888 sc-eQTL 4.79e-01 -0.052 0.0733 0.169 Other_T L1
ENSG00000162402 USP24 -239997 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0692 0.078 0.169 Other_T L1
ENSG00000215883 CYB5RL 775331 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0677 0.107 0.169 Other_T L1
ENSG00000243725 TTC4 259506 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0398 0.106 0.169 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 174044 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0682 0.0897 0.179 B_Activated L2
ENSG00000116133 DHCR24 88172 sc-eQTL 3.23e-01 -0.104 0.105 0.179 B_Activated L2
ENSG00000116205 TCEANC2 921783 sc-eQTL 4.90e-01 0.0782 0.113 0.179 B_Activated L2
ENSG00000116209 TMEM59 921863 sc-eQTL 7.18e-01 0.0436 0.12 0.179 B_Activated L2
ENSG00000116221 MRPL37 791326 sc-eQTL 1.69e-01 0.179 0.129 0.179 B_Activated L2
ENSG00000157216 SSBP3 561888 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0954 0.117 0.179 B_Activated L2
ENSG00000162402 USP24 -239997 sc-eQTL 3.21e-01 -0.114 0.115 0.179 B_Activated L2
ENSG00000215883 CYB5RL 775331 sc-eQTL 2.30e-01 0.121 0.101 0.179 B_Activated L2
ENSG00000243725 TTC4 259506 sc-eQTL 4.26e-01 0.0876 0.11 0.179 B_Activated L2
ENSG00000006555 TTC22 174044 sc-eQTL 1.09e-01 0.182 0.113 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000116133 DHCR24 88172 sc-eQTL 9.04e-01 0.0127 0.105 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000116205 TCEANC2 921783 sc-eQTL 2.46e-01 0.122 0.105 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000116209 TMEM59 921863 sc-eQTL 2.93e-02 -0.195 0.0889 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000116221 MRPL37 791326 sc-eQTL 2.02e-01 -0.135 0.105 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000157216 SSBP3 561888 sc-eQTL 1.99e-01 -0.127 0.0984 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000162402 USP24 -239997 sc-eQTL 6.82e-02 -0.151 0.0825 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000215883 CYB5RL 775331 sc-eQTL 2.26e-01 -0.142 0.117 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000243725 TTC4 259506 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00548 0.107 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000006555 TTC22 174044 sc-eQTL 2.21e-01 0.133 0.109 0.17 B_Memory L2
ENSG00000116133 DHCR24 88172 sc-eQTL 1.46e-01 -0.157 0.108 0.17 B_Memory L2
ENSG00000116205 TCEANC2 921783 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00293 0.116 0.17 B_Memory L2
ENSG00000116209 TMEM59 921863 sc-eQTL 3.20e-01 0.096 0.0964 0.17 B_Memory L2
ENSG00000116221 MRPL37 791326 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0593 0.0978 0.17 B_Memory L2
ENSG00000157216 SSBP3 561888 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0109 0.0913 0.17 B_Memory L2
ENSG00000162402 USP24 -239997 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0196 0.0893 0.17 B_Memory L2
ENSG00000215883 CYB5RL 775331 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0767 0.11 0.17 B_Memory L2
ENSG00000243725 TTC4 259506 sc-eQTL 7.72e-03 -0.303 0.113 0.17 B_Memory L2
ENSG00000006555 TTC22 174044 sc-eQTL 8.85e-01 0.0164 0.113 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000116133 DHCR24 88172 sc-eQTL 8.40e-01 0.0214 0.106 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 921783 sc-eQTL 1.19e-01 -0.147 0.0942 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000116209 TMEM59 921863 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0524 0.0687 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000116221 MRPL37 791326 sc-eQTL 2.49e-01 -0.117 0.101 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000157216 SSBP3 561888 sc-eQTL 2.36e-01 0.114 0.0963 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000162402 USP24 -239997 sc-eQTL 9.19e-01 0.00776 0.0761 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 775331 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0701 0.115 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000243725 TTC4 259506 sc-eQTL 9.83e-01 0.00224 0.104 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000006555 TTC22 174044 sc-eQTL 9.43e-01 0.00809 0.113 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000116133 DHCR24 88172 sc-eQTL 7.97e-01 0.0253 0.0984 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 921783 sc-eQTL 6.67e-01 -0.047 0.109 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000116209 TMEM59 921863 sc-eQTL 3.05e-01 0.0922 0.0897 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000116221 MRPL37 791326 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0289 0.106 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000157216 SSBP3 561888 sc-eQTL 8.60e-01 0.0185 0.104 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000162402 USP24 -239997 sc-eQTL 5.40e-01 0.0507 0.0826 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 775331 sc-eQTL 2.56e-01 -0.132 0.116 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000243725 TTC4 259506 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0679 0.121 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000006555 TTC22 174044 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0264 0.108 0.164 CD4_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 921783 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0365 0.111 0.164 CD4_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 921863 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00102 0.101 0.164 CD4_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 791326 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0585 0.124 0.164 CD4_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 561888 sc-eQTL 3.47e-01 -0.0718 0.0761 0.164 CD4_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -239997 sc-eQTL 1.04e-01 -0.17 0.104 0.164 CD4_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 259506 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0393 0.117 0.164 CD4_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 174044 sc-eQTL 1.44e-01 -0.145 0.0988 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 921783 sc-eQTL 7.22e-01 0.0269 0.0755 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 921863 sc-eQTL 3.65e-01 0.0665 0.0733 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 791326 sc-eQTL 3.88e-02 -0.195 0.0937 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 561888 sc-eQTL 2.81e-01 0.0814 0.0754 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -239997 sc-eQTL 2.90e-01 -0.069 0.065 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 259506 sc-eQTL 3.51e-01 0.0927 0.0992 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 174044 sc-eQTL 6.94e-01 0.041 0.104 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 921783 sc-eQTL 3.32e-01 0.0984 0.101 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 921863 sc-eQTL 3.22e-01 0.0757 0.0763 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 791326 sc-eQTL 1.85e-01 -0.127 0.0957 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 561888 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0623 0.0941 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -239997 sc-eQTL 6.66e-01 0.0338 0.0781 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 259506 sc-eQTL 5.84e-02 -0.212 0.112 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 174044 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0478 0.117 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 921783 sc-eQTL 1.17e-01 -0.173 0.11 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 921863 sc-eQTL 9.34e-02 0.144 0.0853 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 791326 sc-eQTL 2.62e-01 -0.124 0.11 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 561888 sc-eQTL 9.74e-01 0.00312 0.0948 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -239997 sc-eQTL 7.90e-02 -0.151 0.0856 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 259506 sc-eQTL 4.07e-01 0.0944 0.114 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 174044 sc-eQTL 2.33e-01 0.112 0.0934 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 921783 sc-eQTL 6.83e-02 -0.189 0.103 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 921863 sc-eQTL 1.55e-01 0.128 0.0898 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 791326 sc-eQTL 8.08e-01 0.026 0.107 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 561888 sc-eQTL 8.28e-01 0.0159 0.0731 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -239997 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0621 0.0726 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 259506 sc-eQTL 1.30e-02 0.268 0.107 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 174044 sc-eQTL 3.01e-01 -0.11 0.106 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 921783 sc-eQTL 8.52e-01 0.018 0.0961 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 921863 sc-eQTL 1.93e-01 0.122 0.0937 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 791326 sc-eQTL 5.79e-03 -0.309 0.111 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 561888 sc-eQTL 7.92e-01 0.0225 0.0853 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -239997 sc-eQTL 9.22e-02 0.13 0.0771 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 259506 sc-eQTL 3.92e-02 -0.233 0.112 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 174044 sc-eQTL 5.60e-01 -0.068 0.117 0.167 CD8_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 921783 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00705 0.117 0.167 CD8_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 921863 sc-eQTL 3.83e-01 0.0902 0.103 0.167 CD8_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 791326 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0156 0.117 0.167 CD8_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 561888 sc-eQTL 2.95e-01 0.106 0.101 0.167 CD8_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -239997 sc-eQTL 1.16e-01 -0.155 0.0979 0.167 CD8_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 259506 sc-eQTL 3.00e-01 -0.124 0.119 0.167 CD8_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 174044 sc-eQTL 4.73e-01 0.0796 0.111 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 921783 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00546 0.116 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 921863 sc-eQTL 6.97e-01 0.0436 0.112 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 791326 sc-eQTL 7.81e-01 0.0315 0.113 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 561888 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00774 0.107 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -239997 sc-eQTL 2.43e-01 0.132 0.113 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 259506 sc-eQTL 4.56e-01 0.0856 0.115 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 174044 sc-eQTL 8.24e-01 0.0225 0.101 0.167 MAIT L2
ENSG00000116133 DHCR24 88172 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0286 0.0748 0.167 MAIT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 921783 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0559 0.105 0.167 MAIT L2
ENSG00000116209 TMEM59 921863 sc-eQTL 8.30e-02 0.165 0.0945 0.167 MAIT L2
ENSG00000116221 MRPL37 791326 sc-eQTL 9.14e-01 0.0126 0.116 0.167 MAIT L2
ENSG00000157216 SSBP3 561888 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0361 0.102 0.167 MAIT L2
ENSG00000162402 USP24 -239997 sc-eQTL 1.53e-01 -0.13 0.0906 0.167 MAIT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 775331 sc-eQTL 8.41e-01 0.0213 0.106 0.167 MAIT L2
ENSG00000243725 TTC4 259506 sc-eQTL 3.61e-01 -0.0961 0.105 0.167 MAIT L2
ENSG00000006555 TTC22 174044 sc-eQTL 2.41e-01 -0.135 0.115 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000116133 DHCR24 88172 sc-eQTL 3.69e-01 -0.0915 0.102 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000116205 TCEANC2 921783 sc-eQTL 1.81e-01 -0.144 0.107 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000116209 TMEM59 921863 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0321 0.105 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000116221 MRPL37 791326 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0368 0.117 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000157216 SSBP3 561888 sc-eQTL 4.28e-01 0.0701 0.0882 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000162398 LEXM 169304 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0364 0.104 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000162402 USP24 -239997 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0469 0.0897 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000243725 TTC4 259506 sc-eQTL 6.34e-01 0.0539 0.113 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000006555 TTC22 174044 sc-eQTL 5.56e-02 0.185 0.096 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000116133 DHCR24 88172 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0854 0.101 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000116205 TCEANC2 921783 sc-eQTL 3.62e-01 0.0998 0.109 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000116209 TMEM59 921863 sc-eQTL 5.03e-01 0.0543 0.081 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000116221 MRPL37 791326 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0718 0.105 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000157216 SSBP3 561888 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0708 0.0862 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000162398 LEXM 169304 sc-eQTL 7.22e-01 0.0354 0.0993 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000162402 USP24 -239997 sc-eQTL 8.04e-01 0.0157 0.0631 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000243725 TTC4 259506 sc-eQTL 3.39e-01 -0.103 0.108 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000006555 TTC22 174044 sc-eQTL 3.29e-02 -0.242 0.113 0.171 NK_HLA L2
ENSG00000116133 DHCR24 88172 sc-eQTL 2.48e-01 -0.128 0.111 0.171 NK_HLA L2
ENSG00000116205 TCEANC2 921783 sc-eQTL 4.40e-01 0.0829 0.107 0.171 NK_HLA L2
ENSG00000116209 TMEM59 921863 sc-eQTL 8.98e-01 0.0137 0.106 0.171 NK_HLA L2
ENSG00000116221 MRPL37 791326 sc-eQTL 1.16e-01 -0.184 0.117 0.171 NK_HLA L2
ENSG00000157216 SSBP3 561888 sc-eQTL 1.91e-01 -0.125 0.0954 0.171 NK_HLA L2
ENSG00000162398 LEXM 169304 sc-eQTL 3.92e-02 -0.222 0.107 0.171 NK_HLA L2
ENSG00000162402 USP24 -239997 sc-eQTL 2.18e-01 0.0976 0.079 0.171 NK_HLA L2
ENSG00000243725 TTC4 259506 sc-eQTL 1.08e-01 0.19 0.118 0.171 NK_HLA L2
ENSG00000006555 TTC22 174044 sc-eQTL 1.90e-01 0.134 0.102 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000116133 DHCR24 88172 sc-eQTL 2.43e-01 -0.121 0.103 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000116205 TCEANC2 921783 sc-eQTL 1.60e-01 0.144 0.102 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000116209 TMEM59 921863 sc-eQTL 8.77e-02 0.142 0.083 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000116221 MRPL37 791326 sc-eQTL 9.47e-01 0.00688 0.103 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000157216 SSBP3 561888 sc-eQTL 1.50e-01 -0.124 0.086 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000162398 LEXM 169304 sc-eQTL 7.62e-01 0.0327 0.108 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000162402 USP24 -239997 sc-eQTL 7.12e-02 -0.132 0.073 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000243725 TTC4 259506 sc-eQTL 1.36e-01 0.162 0.109 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000006555 TTC22 174044 sc-eQTL 8.13e-01 0.029 0.122 0.204 PB L2
ENSG00000116133 DHCR24 88172 sc-eQTL 3.47e-01 0.102 0.108 0.204 PB L2
ENSG00000116205 TCEANC2 921783 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0548 0.132 0.204 PB L2
ENSG00000116209 TMEM59 921863 sc-eQTL 6.82e-02 0.1 0.0543 0.204 PB L2
ENSG00000116221 MRPL37 791326 sc-eQTL 3.73e-02 -0.207 0.0982 0.204 PB L2
ENSG00000157216 SSBP3 561888 sc-eQTL 1.28e-01 -0.175 0.114 0.204 PB L2
ENSG00000162402 USP24 -239997 sc-eQTL 5.82e-01 0.0725 0.131 0.204 PB L2
ENSG00000215883 CYB5RL 775331 sc-eQTL 7.86e-01 0.037 0.136 0.204 PB L2
ENSG00000243725 TTC4 259506 sc-eQTL 9.93e-01 -0.00113 0.127 0.204 PB L2
ENSG00000006555 TTC22 174044 sc-eQTL 7.55e-01 0.0324 0.104 0.172 Pro_T L2
ENSG00000116133 DHCR24 88172 sc-eQTL 7.18e-02 -0.159 0.0877 0.172 Pro_T L2
ENSG00000116205 TCEANC2 921783 sc-eQTL 1.83e-01 0.144 0.107 0.172 Pro_T L2
ENSG00000116209 TMEM59 921863 sc-eQTL 7.01e-01 0.0288 0.0748 0.172 Pro_T L2
ENSG00000116221 MRPL37 791326 sc-eQTL 5.67e-01 -0.042 0.0733 0.172 Pro_T L2
ENSG00000157216 SSBP3 561888 sc-eQTL 8.00e-01 0.0209 0.0822 0.172 Pro_T L2
ENSG00000162402 USP24 -239997 sc-eQTL 2.21e-01 0.123 0.0999 0.172 Pro_T L2
ENSG00000215883 CYB5RL 775331 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0879 0.0988 0.172 Pro_T L2
ENSG00000243725 TTC4 259506 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0952 0.11 0.172 Pro_T L2
ENSG00000006555 TTC22 174044 sc-eQTL 2.26e-01 -0.125 0.103 0.169 Treg L2
ENSG00000116205 TCEANC2 921783 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0179 0.111 0.169 Treg L2
ENSG00000116209 TMEM59 921863 sc-eQTL 7.89e-01 0.0234 0.0875 0.169 Treg L2
ENSG00000116221 MRPL37 791326 sc-eQTL 1.29e-01 -0.164 0.108 0.169 Treg L2
ENSG00000157216 SSBP3 561888 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00221 0.0966 0.169 Treg L2
ENSG00000162402 USP24 -239997 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0594 0.0919 0.169 Treg L2
ENSG00000243725 TTC4 259506 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0267 0.116 0.169 Treg L2
ENSG00000116133 DHCR24 88172 sc-eQTL 7.64e-01 0.0291 0.0968 0.166 cDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 921783 sc-eQTL 6.59e-01 0.0505 0.114 0.166 cDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 921863 sc-eQTL 7.19e-01 -0.035 0.097 0.166 cDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 791326 sc-eQTL 2.28e-01 0.15 0.124 0.166 cDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 561888 sc-eQTL 3.72e-01 0.102 0.114 0.166 cDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 433110 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0203 0.106 0.166 cDC L2
ENSG00000162402 USP24 -239997 sc-eQTL 4.83e-01 0.0838 0.119 0.166 cDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 775331 sc-eQTL 1.65e-01 -0.142 0.102 0.166 cDC L2
ENSG00000243725 TTC4 259506 sc-eQTL 7.97e-02 0.214 0.121 0.166 cDC L2
ENSG00000116133 DHCR24 88172 sc-eQTL 5.26e-01 0.0427 0.0672 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000116205 TCEANC2 921783 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0252 0.0934 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000116209 TMEM59 921863 sc-eQTL 2.37e-01 -0.067 0.0565 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000116221 MRPL37 791326 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0834 0.101 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000157216 SSBP3 561888 sc-eQTL 3.09e-01 0.105 0.103 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000162402 USP24 -239997 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0104 0.0761 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000243725 TTC4 259506 sc-eQTL 9.42e-01 0.00854 0.116 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000116133 DHCR24 88172 sc-eQTL 9.19e-01 0.00643 0.0631 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000116205 TCEANC2 921783 sc-eQTL 5.58e-02 -0.184 0.0955 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000116209 TMEM59 921863 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0455 0.077 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000116221 MRPL37 791326 sc-eQTL 6.68e-01 0.0478 0.111 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000157216 SSBP3 561888 sc-eQTL 2.60e-01 -0.13 0.115 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000162402 USP24 -239997 sc-eQTL 2.86e-02 -0.204 0.0925 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000243725 TTC4 259506 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0537 0.117 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000006555 TTC22 174044 sc-eQTL 5.26e-01 0.0687 0.108 0.161 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 88172 sc-eQTL 2.61e-01 -0.135 0.12 0.161 gdT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 921783 sc-eQTL 2.59e-01 0.137 0.12 0.161 gdT L2
ENSG00000116209 TMEM59 921863 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0839 0.123 0.161 gdT L2
ENSG00000116221 MRPL37 791326 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0395 0.141 0.161 gdT L2
ENSG00000157216 SSBP3 561888 sc-eQTL 3.47e-01 -0.081 0.0859 0.161 gdT L2
ENSG00000162402 USP24 -239997 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0614 0.116 0.161 gdT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 775331 sc-eQTL 4.22e-01 0.0967 0.12 0.161 gdT L2
ENSG00000243725 TTC4 259506 sc-eQTL 7.96e-02 -0.237 0.134 0.161 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 88172 sc-eQTL 4.19e-02 -0.172 0.0841 0.176 intMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 921783 sc-eQTL 6.05e-01 0.0547 0.106 0.176 intMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 921863 sc-eQTL 5.04e-01 0.052 0.0777 0.176 intMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 791326 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0746 0.119 0.176 intMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 561888 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0118 0.121 0.176 intMono L2
ENSG00000162402 USP24 -239997 sc-eQTL 7.82e-01 -0.03 0.108 0.176 intMono L2
ENSG00000243725 TTC4 259506 sc-eQTL 2.69e-01 0.127 0.115 0.176 intMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 88172 sc-eQTL 1.51e-02 -0.211 0.0861 0.165 ncMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 921783 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0497 0.109 0.165 ncMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 921863 sc-eQTL 3.50e-01 -0.0818 0.0872 0.165 ncMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 791326 sc-eQTL 1.42e-01 0.166 0.112 0.165 ncMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 561888 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0216 0.123 0.165 ncMono L2
ENSG00000162402 USP24 -239997 sc-eQTL 6.30e-01 0.0474 0.0985 0.165 ncMono L2
ENSG00000243725 TTC4 259506 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0263 0.117 0.165 ncMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 88172 sc-eQTL 2.43e-01 0.123 0.105 0.164 pDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 921783 sc-eQTL 3.10e-01 0.129 0.126 0.164 pDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 921863 sc-eQTL 2.19e-01 -0.124 0.101 0.164 pDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 791326 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00285 0.134 0.164 pDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 561888 sc-eQTL 3.67e-01 0.108 0.119 0.164 pDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 433110 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0108 0.0502 0.164 pDC L2
ENSG00000162402 USP24 -239997 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0231 0.0848 0.164 pDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 775331 sc-eQTL 3.21e-01 -0.115 0.116 0.164 pDC L2
ENSG00000243725 TTC4 259506 sc-eQTL 1.45e-01 -0.195 0.133 0.164 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 174044 sc-eQTL 2.99e-01 0.112 0.108 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 88172 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0994 0.108 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 921783 sc-eQTL 6.16e-01 0.0526 0.105 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 921863 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0609 0.0814 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 791326 sc-eQTL 1.99e-01 -0.125 0.0973 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 561888 sc-eQTL 3.31e-01 -0.0826 0.0847 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -239997 sc-eQTL 3.82e-02 -0.16 0.0767 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 775331 sc-eQTL 3.23e-01 -0.118 0.119 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 259506 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0726 0.107 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 174044 sc-eQTL 7.81e-01 0.0317 0.114 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 88172 sc-eQTL 5.89e-01 0.0554 0.102 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 921783 sc-eQTL 2.36e-01 -0.11 0.0922 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 921863 sc-eQTL 7.19e-01 0.0236 0.0657 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 791326 sc-eQTL 1.82e-01 -0.126 0.0941 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 561888 sc-eQTL 1.45e-01 0.123 0.0841 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -239997 sc-eQTL 7.90e-01 0.0194 0.0725 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 775331 sc-eQTL 2.71e-01 -0.126 0.115 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 259506 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0103 0.108 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 88172 sc-eQTL 2.24e-01 0.0794 0.0651 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 921783 sc-eQTL 2.65e-01 -0.091 0.0815 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 921863 sc-eQTL 2.32e-01 -0.0672 0.0562 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 791326 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0582 0.0997 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 561888 sc-eQTL 7.82e-01 0.0289 0.104 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -239997 sc-eQTL 2.44e-01 -0.0831 0.0711 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 259506 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0531 0.118 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 88172 sc-eQTL 6.69e-02 -0.151 0.0818 0.17 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 921783 sc-eQTL 7.52e-01 0.0343 0.108 0.17 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 921863 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0524 0.0805 0.17 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 791326 sc-eQTL 2.68e-01 0.122 0.11 0.17 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 561888 sc-eQTL 9.75e-01 0.00371 0.118 0.17 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -239997 sc-eQTL 8.05e-01 -0.023 0.0928 0.17 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 259506 sc-eQTL 5.01e-01 0.0783 0.116 0.17 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 174044 sc-eQTL 3.25e-01 0.0921 0.0934 0.17 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 88172 sc-eQTL 2.97e-01 -0.102 0.0976 0.17 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 921783 sc-eQTL 1.34e-01 0.143 0.0954 0.17 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 921863 sc-eQTL 1.08e-01 0.119 0.0738 0.17 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 791326 sc-eQTL 6.15e-01 -0.05 0.0994 0.17 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 561888 sc-eQTL 1.62e-01 -0.114 0.0812 0.17 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162398 LEXM 169304 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0392 0.0919 0.17 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -239997 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0372 0.0582 0.17 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 259506 sc-eQTL 7.73e-01 0.0299 0.104 0.17 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000006555 TTC22 174044 eQTL 0.00152 -0.0603 0.019 0.0 0.0 0.182

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000162402 \N -239997 1.54e-06 1.57e-06 2.72e-07 1.22e-06 4.72e-07 6.58e-07 1.25e-06 3.93e-07 1.73e-06 7.04e-07 2.02e-06 1.29e-06 2.64e-06 4.82e-07 3.64e-07 1.06e-06 1.07e-06 1.16e-06 5.51e-07 6.49e-07 6.18e-07 1.83e-06 1.58e-06 9.49e-07 2.48e-06 1e-06 1.03e-06 9.91e-07 1.66e-06 1.46e-06 7.56e-07 2.86e-07 3.97e-07 7.48e-07 6.88e-07 6.58e-07 7.26e-07 3.5e-07 6.91e-07 1.68e-07 3.05e-07 2.35e-06 3.43e-07 1.32e-07 3.48e-07 3.25e-07 3.36e-07 2.49e-07 2.98e-07