logo

Genes within 1Mb (chr1:54973252:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 171929 sc-eQTL 8.16e-01 0.0277 0.119 0.126 B L1
ENSG00000116133 DHCR24 86057 sc-eQTL 2.26e-01 0.136 0.112 0.126 B L1
ENSG00000116205 TCEANC2 919668 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0301 0.0972 0.126 B L1
ENSG00000116209 TMEM59 919748 sc-eQTL 5.98e-01 0.0313 0.0592 0.126 B L1
ENSG00000116221 MRPL37 789211 sc-eQTL 4.42e-02 -0.155 0.0768 0.126 B L1
ENSG00000157216 SSBP3 559773 sc-eQTL 1.56e-01 -0.115 0.0808 0.126 B L1
ENSG00000162402 USP24 -242112 sc-eQTL 2.20e-01 -0.0843 0.0685 0.126 B L1
ENSG00000215883 CYB5RL 773216 sc-eQTL 1.85e-01 -0.175 0.132 0.126 B L1
ENSG00000243725 TTC4 257391 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0952 0.115 0.126 B L1
ENSG00000006555 TTC22 171929 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0766 0.0938 0.126 CD4T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 919668 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0635 0.0767 0.126 CD4T L1
ENSG00000116209 TMEM59 919748 sc-eQTL 1.54e-02 0.172 0.0706 0.126 CD4T L1
ENSG00000116221 MRPL37 789211 sc-eQTL 2.79e-03 -0.293 0.0969 0.126 CD4T L1
ENSG00000157216 SSBP3 559773 sc-eQTL 9.93e-02 0.135 0.0816 0.126 CD4T L1
ENSG00000162402 USP24 -242112 sc-eQTL 5.71e-01 -0.038 0.0669 0.126 CD4T L1
ENSG00000243725 TTC4 257391 sc-eQTL 3.83e-01 0.0879 0.101 0.126 CD4T L1
ENSG00000006555 TTC22 171929 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0137 0.0812 0.126 CD8T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 919668 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00686 0.101 0.126 CD8T L1
ENSG00000116209 TMEM59 919748 sc-eQTL 1.03e-01 0.114 0.0698 0.126 CD8T L1
ENSG00000116221 MRPL37 789211 sc-eQTL 9.27e-02 -0.162 0.096 0.126 CD8T L1
ENSG00000157216 SSBP3 559773 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0305 0.0694 0.126 CD8T L1
ENSG00000162402 USP24 -242112 sc-eQTL 7.25e-01 0.0237 0.0671 0.126 CD8T L1
ENSG00000243725 TTC4 257391 sc-eQTL 2.00e-01 0.149 0.116 0.126 CD8T L1
ENSG00000116133 DHCR24 86057 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00774 0.113 0.119 DC L1
ENSG00000116205 TCEANC2 919668 sc-eQTL 3.96e-01 0.107 0.126 0.119 DC L1
ENSG00000116209 TMEM59 919748 sc-eQTL 3.23e-01 -0.0981 0.0989 0.119 DC L1
ENSG00000116221 MRPL37 789211 sc-eQTL 9.51e-01 -0.0082 0.133 0.119 DC L1
ENSG00000157216 SSBP3 559773 sc-eQTL 5.95e-01 0.0632 0.119 0.119 DC L1
ENSG00000162390 ACOT11 430995 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0435 0.114 0.119 DC L1
ENSG00000162402 USP24 -242112 sc-eQTL 1.59e-01 0.0969 0.0686 0.119 DC L1
ENSG00000215883 CYB5RL 773216 sc-eQTL 8.53e-02 -0.214 0.124 0.119 DC L1
ENSG00000243725 TTC4 257391 sc-eQTL 7.87e-01 0.0362 0.134 0.119 DC L1
ENSG00000116133 DHCR24 86057 sc-eQTL 2.49e-01 0.0915 0.0791 0.126 Mono L1
ENSG00000116205 TCEANC2 919668 sc-eQTL 1.81e-01 -0.115 0.0853 0.126 Mono L1
ENSG00000116209 TMEM59 919748 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0458 0.0635 0.126 Mono L1
ENSG00000116221 MRPL37 789211 sc-eQTL 6.93e-01 -0.042 0.106 0.126 Mono L1
ENSG00000157216 SSBP3 559773 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0826 0.122 0.126 Mono L1
ENSG00000162402 USP24 -242112 sc-eQTL 3.37e-01 -0.0697 0.0725 0.126 Mono L1
ENSG00000243725 TTC4 257391 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0409 0.128 0.126 Mono L1
ENSG00000006555 TTC22 171929 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00742 0.107 0.127 NK L1
ENSG00000116133 DHCR24 86057 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0262 0.108 0.127 NK L1
ENSG00000116205 TCEANC2 919668 sc-eQTL 1.83e-01 0.142 0.107 0.127 NK L1
ENSG00000116209 TMEM59 919748 sc-eQTL 6.47e-02 0.154 0.0831 0.127 NK L1
ENSG00000116221 MRPL37 789211 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0213 0.104 0.127 NK L1
ENSG00000157216 SSBP3 559773 sc-eQTL 1.19e-01 -0.141 0.0898 0.127 NK L1
ENSG00000162398 LEXM 167189 sc-eQTL 1.82e-01 -0.135 0.101 0.127 NK L1
ENSG00000162402 USP24 -242112 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00264 0.0615 0.127 NK L1
ENSG00000243725 TTC4 257391 sc-eQTL 8.33e-01 0.0246 0.116 0.127 NK L1
ENSG00000006555 TTC22 171929 sc-eQTL 8.82e-01 0.0143 0.096 0.126 Other_T L1
ENSG00000116133 DHCR24 86057 sc-eQTL 5.31e-03 -0.206 0.0732 0.126 Other_T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 919668 sc-eQTL 6.65e-01 0.0484 0.111 0.126 Other_T L1
ENSG00000116209 TMEM59 919748 sc-eQTL 3.89e-01 0.0659 0.0764 0.126 Other_T L1
ENSG00000116221 MRPL37 789211 sc-eQTL 8.96e-01 -0.00936 0.0717 0.126 Other_T L1
ENSG00000157216 SSBP3 559773 sc-eQTL 3.31e-01 -0.0806 0.0827 0.126 Other_T L1
ENSG00000162402 USP24 -242112 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0573 0.0882 0.126 Other_T L1
ENSG00000215883 CYB5RL 773216 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0628 0.121 0.126 Other_T L1
ENSG00000243725 TTC4 257391 sc-eQTL 6.30e-01 0.0579 0.12 0.126 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 171929 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0646 0.102 0.133 B_Activated L2
ENSG00000116133 DHCR24 86057 sc-eQTL 8.05e-01 0.0296 0.12 0.133 B_Activated L2
ENSG00000116205 TCEANC2 919668 sc-eQTL 4.03e-01 0.107 0.128 0.133 B_Activated L2
ENSG00000116209 TMEM59 919748 sc-eQTL 7.90e-01 0.0365 0.136 0.133 B_Activated L2
ENSG00000116221 MRPL37 789211 sc-eQTL 2.03e-01 0.188 0.147 0.133 B_Activated L2
ENSG00000157216 SSBP3 559773 sc-eQTL 3.04e-01 -0.137 0.133 0.133 B_Activated L2
ENSG00000162402 USP24 -242112 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0733 0.13 0.133 B_Activated L2
ENSG00000215883 CYB5RL 773216 sc-eQTL 5.35e-01 0.0713 0.115 0.133 B_Activated L2
ENSG00000243725 TTC4 257391 sc-eQTL 7.06e-01 0.0472 0.125 0.133 B_Activated L2
ENSG00000006555 TTC22 171929 sc-eQTL 4.27e-01 0.102 0.128 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000116133 DHCR24 86057 sc-eQTL 3.51e-01 0.111 0.119 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000116205 TCEANC2 919668 sc-eQTL 1.71e-01 0.163 0.118 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000116209 TMEM59 919748 sc-eQTL 3.23e-02 -0.217 0.101 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000116221 MRPL37 789211 sc-eQTL 1.14e-01 -0.189 0.119 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000157216 SSBP3 559773 sc-eQTL 2.11e-01 -0.14 0.111 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000162402 USP24 -242112 sc-eQTL 1.38e-01 -0.139 0.0937 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000215883 CYB5RL 773216 sc-eQTL 3.12e-01 -0.135 0.133 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000243725 TTC4 257391 sc-eQTL 9.22e-01 0.0118 0.121 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000006555 TTC22 171929 sc-eQTL 5.64e-01 0.0713 0.123 0.127 B_Memory L2
ENSG00000116133 DHCR24 86057 sc-eQTL 1.53e-01 -0.175 0.122 0.127 B_Memory L2
ENSG00000116205 TCEANC2 919668 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0414 0.131 0.127 B_Memory L2
ENSG00000116209 TMEM59 919748 sc-eQTL 8.59e-01 0.0194 0.109 0.127 B_Memory L2
ENSG00000116221 MRPL37 789211 sc-eQTL 2.10e-01 -0.139 0.11 0.127 B_Memory L2
ENSG00000157216 SSBP3 559773 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0496 0.103 0.127 B_Memory L2
ENSG00000162402 USP24 -242112 sc-eQTL 2.23e-01 0.123 0.101 0.127 B_Memory L2
ENSG00000215883 CYB5RL 773216 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0416 0.125 0.127 B_Memory L2
ENSG00000243725 TTC4 257391 sc-eQTL 8.87e-03 -0.337 0.127 0.127 B_Memory L2
ENSG00000006555 TTC22 171929 sc-eQTL 9.74e-01 0.0041 0.127 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000116133 DHCR24 86057 sc-eQTL 8.32e-01 0.0253 0.119 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 919668 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0923 0.106 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000116209 TMEM59 919748 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0148 0.0773 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000116221 MRPL37 789211 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0852 0.114 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000157216 SSBP3 559773 sc-eQTL 4.75e-01 0.0776 0.108 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000162402 USP24 -242112 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0519 0.0854 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 773216 sc-eQTL 4.13e-01 -0.106 0.129 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000243725 TTC4 257391 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0581 0.116 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000006555 TTC22 171929 sc-eQTL 6.22e-01 0.0628 0.127 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000116133 DHCR24 86057 sc-eQTL 8.44e-01 0.0218 0.111 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 919668 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0251 0.123 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000116209 TMEM59 919748 sc-eQTL 3.40e-01 0.0968 0.101 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000116221 MRPL37 789211 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0139 0.119 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000157216 SSBP3 559773 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0322 0.117 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000162402 USP24 -242112 sc-eQTL 5.35e-01 0.0578 0.0931 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 773216 sc-eQTL 7.26e-01 -0.046 0.131 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000243725 TTC4 257391 sc-eQTL 3.35e-01 -0.132 0.136 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000006555 TTC22 171929 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0287 0.121 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 919668 sc-eQTL 6.81e-01 0.0515 0.125 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 919748 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0188 0.114 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 789211 sc-eQTL 2.62e-01 -0.157 0.139 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 559773 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0536 0.0858 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -242112 sc-eQTL 7.25e-02 -0.211 0.117 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 257391 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0665 0.132 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 171929 sc-eQTL 1.11e-01 -0.179 0.112 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 919668 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0623 0.0854 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 919748 sc-eQTL 6.91e-02 0.151 0.0825 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 789211 sc-eQTL 7.08e-03 -0.287 0.105 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 559773 sc-eQTL 2.79e-01 0.0925 0.0853 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -242112 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0371 0.0738 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 257391 sc-eQTL 2.54e-01 0.128 0.112 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 171929 sc-eQTL 5.01e-01 0.0795 0.118 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 919668 sc-eQTL 7.55e-01 0.0359 0.115 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 919748 sc-eQTL 1.10e-01 0.138 0.086 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 789211 sc-eQTL 2.28e-01 -0.131 0.109 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 559773 sc-eQTL 3.89e-01 0.0919 0.107 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -242112 sc-eQTL 5.79e-01 0.0491 0.0884 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 257391 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0872 0.127 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 171929 sc-eQTL 1.20e-01 -0.207 0.133 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 919668 sc-eQTL 7.98e-02 -0.221 0.126 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 919748 sc-eQTL 3.40e-01 0.0936 0.0979 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 789211 sc-eQTL 1.93e-01 -0.164 0.126 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 559773 sc-eQTL 8.24e-01 0.024 0.108 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -242112 sc-eQTL 8.34e-02 -0.17 0.0978 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 257391 sc-eQTL 1.77e-01 0.175 0.13 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 171929 sc-eQTL 2.37e-01 0.126 0.106 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 919668 sc-eQTL 2.34e-01 -0.14 0.117 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 919748 sc-eQTL 9.59e-02 0.17 0.102 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 789211 sc-eQTL 8.04e-01 0.0302 0.121 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 559773 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0104 0.0829 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -242112 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0618 0.0823 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 257391 sc-eQTL 1.33e-02 0.304 0.122 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 171929 sc-eQTL 1.96e-01 -0.156 0.12 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 919668 sc-eQTL 8.43e-01 0.0216 0.109 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 919748 sc-eQTL 2.26e-01 0.129 0.106 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 789211 sc-eQTL 5.49e-03 -0.353 0.126 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 559773 sc-eQTL 6.32e-01 0.0464 0.0968 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -242112 sc-eQTL 9.90e-02 0.145 0.0875 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 257391 sc-eQTL 1.95e-01 -0.167 0.128 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 171929 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0673 0.134 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 919668 sc-eQTL 8.56e-01 0.0245 0.135 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 919748 sc-eQTL 3.73e-01 0.106 0.119 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 789211 sc-eQTL 4.51e-01 -0.102 0.135 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 559773 sc-eQTL 3.52e-01 0.109 0.117 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -242112 sc-eQTL 1.03e-01 -0.185 0.113 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 257391 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0466 0.138 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 171929 sc-eQTL 4.86e-01 0.0876 0.126 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 919668 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0747 0.131 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 919748 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0176 0.127 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 789211 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0796 0.128 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 559773 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00312 0.122 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -242112 sc-eQTL 6.53e-01 0.0578 0.128 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 257391 sc-eQTL 4.57e-01 0.0969 0.13 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 171929 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0184 0.115 0.123 MAIT L2
ENSG00000116133 DHCR24 86057 sc-eQTL 1.30e-01 -0.128 0.0844 0.123 MAIT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 919668 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0374 0.119 0.123 MAIT L2
ENSG00000116209 TMEM59 919748 sc-eQTL 1.31e-01 0.163 0.107 0.123 MAIT L2
ENSG00000116221 MRPL37 789211 sc-eQTL 5.99e-01 0.0691 0.131 0.123 MAIT L2
ENSG00000157216 SSBP3 559773 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0319 0.116 0.123 MAIT L2
ENSG00000162402 USP24 -242112 sc-eQTL 1.40e-01 -0.152 0.103 0.123 MAIT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 773216 sc-eQTL 6.99e-01 0.0465 0.12 0.123 MAIT L2
ENSG00000243725 TTC4 257391 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0954 0.119 0.123 MAIT L2
ENSG00000006555 TTC22 171929 sc-eQTL 9.31e-02 -0.221 0.131 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000116133 DHCR24 86057 sc-eQTL 2.84e-01 -0.125 0.116 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000116205 TCEANC2 919668 sc-eQTL 2.13e-01 -0.153 0.123 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000116209 TMEM59 919748 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0124 0.12 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000116221 MRPL37 789211 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0387 0.134 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000157216 SSBP3 559773 sc-eQTL 6.91e-01 0.0404 0.101 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000162398 LEXM 167189 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0798 0.119 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000162402 USP24 -242112 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0683 0.103 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000243725 TTC4 257391 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0271 0.13 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000006555 TTC22 171929 sc-eQTL 5.00e-02 0.212 0.107 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000116133 DHCR24 86057 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00806 0.113 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000116205 TCEANC2 919668 sc-eQTL 2.12e-01 0.153 0.122 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000116209 TMEM59 919748 sc-eQTL 1.34e-01 0.136 0.0903 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000116221 MRPL37 789211 sc-eQTL 5.31e-01 -0.074 0.118 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000157216 SSBP3 559773 sc-eQTL 1.61e-01 -0.135 0.0962 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000162398 LEXM 167189 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0706 0.111 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000162402 USP24 -242112 sc-eQTL 6.85e-01 0.0287 0.0706 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000243725 TTC4 257391 sc-eQTL 2.64e-01 -0.135 0.121 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000006555 TTC22 171929 sc-eQTL 5.11e-03 -0.361 0.128 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000116133 DHCR24 86057 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0774 0.127 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000116205 TCEANC2 919668 sc-eQTL 3.49e-01 0.115 0.122 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000116209 TMEM59 919748 sc-eQTL 4.75e-01 0.087 0.121 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000116221 MRPL37 789211 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0656 0.134 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000157216 SSBP3 559773 sc-eQTL 1.98e-01 -0.141 0.109 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000162398 LEXM 167189 sc-eQTL 2.04e-01 -0.157 0.123 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000162402 USP24 -242112 sc-eQTL 9.34e-02 0.152 0.0899 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000243725 TTC4 257391 sc-eQTL 2.96e-01 0.141 0.135 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000006555 TTC22 171929 sc-eQTL 7.11e-01 0.0429 0.116 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000116133 DHCR24 86057 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0604 0.117 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000116205 TCEANC2 919668 sc-eQTL 1.15e-01 0.183 0.115 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000116209 TMEM59 919748 sc-eQTL 2.00e-01 0.121 0.0941 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000116221 MRPL37 789211 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0107 0.116 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000157216 SSBP3 559773 sc-eQTL 7.62e-02 -0.173 0.0969 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000162398 LEXM 167189 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0272 0.122 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000162402 USP24 -242112 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0426 0.0831 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000243725 TTC4 257391 sc-eQTL 6.37e-02 0.228 0.122 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000006555 TTC22 171929 sc-eQTL 6.18e-01 0.0671 0.134 0.152 PB L2
ENSG00000116133 DHCR24 86057 sc-eQTL 5.43e-01 0.0725 0.119 0.152 PB L2
ENSG00000116205 TCEANC2 919668 sc-eQTL 8.62e-01 0.0252 0.145 0.152 PB L2
ENSG00000116209 TMEM59 919748 sc-eQTL 3.51e-02 0.127 0.0593 0.152 PB L2
ENSG00000116221 MRPL37 789211 sc-eQTL 1.80e-02 -0.257 0.107 0.152 PB L2
ENSG00000157216 SSBP3 559773 sc-eQTL 1.27e-01 -0.193 0.126 0.152 PB L2
ENSG00000162402 USP24 -242112 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0502 0.144 0.152 PB L2
ENSG00000215883 CYB5RL 773216 sc-eQTL 5.12e-01 0.0982 0.149 0.152 PB L2
ENSG00000243725 TTC4 257391 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0778 0.139 0.152 PB L2
ENSG00000006555 TTC22 171929 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0224 0.118 0.128 Pro_T L2
ENSG00000116133 DHCR24 86057 sc-eQTL 3.75e-02 -0.207 0.0989 0.128 Pro_T L2
ENSG00000116205 TCEANC2 919668 sc-eQTL 1.92e-01 0.159 0.121 0.128 Pro_T L2
ENSG00000116209 TMEM59 919748 sc-eQTL 7.48e-01 0.0272 0.0846 0.128 Pro_T L2
ENSG00000116221 MRPL37 789211 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0544 0.0828 0.128 Pro_T L2
ENSG00000157216 SSBP3 559773 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0249 0.0929 0.128 Pro_T L2
ENSG00000162402 USP24 -242112 sc-eQTL 2.11e-01 0.142 0.113 0.128 Pro_T L2
ENSG00000215883 CYB5RL 773216 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0877 0.112 0.128 Pro_T L2
ENSG00000243725 TTC4 257391 sc-eQTL 9.92e-01 0.0013 0.124 0.128 Pro_T L2
ENSG00000006555 TTC22 171929 sc-eQTL 9.73e-02 -0.193 0.116 0.126 Treg L2
ENSG00000116205 TCEANC2 919668 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0179 0.125 0.126 Treg L2
ENSG00000116209 TMEM59 919748 sc-eQTL 7.55e-01 0.0309 0.0988 0.126 Treg L2
ENSG00000116221 MRPL37 789211 sc-eQTL 3.04e-01 -0.126 0.122 0.126 Treg L2
ENSG00000157216 SSBP3 559773 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0536 0.109 0.126 Treg L2
ENSG00000162402 USP24 -242112 sc-eQTL 7.03e-01 0.0397 0.104 0.126 Treg L2
ENSG00000243725 TTC4 257391 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0203 0.131 0.126 Treg L2
ENSG00000116133 DHCR24 86057 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0623 0.11 0.122 cDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 919668 sc-eQTL 7.99e-01 0.0333 0.13 0.122 cDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 919748 sc-eQTL 2.16e-01 -0.137 0.11 0.122 cDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 789211 sc-eQTL 3.40e-01 0.135 0.141 0.122 cDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 559773 sc-eQTL 5.11e-01 0.086 0.13 0.122 cDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 430995 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0818 0.121 0.122 cDC L2
ENSG00000162402 USP24 -242112 sc-eQTL 2.59e-01 0.154 0.136 0.122 cDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 773216 sc-eQTL 3.60e-02 -0.244 0.116 0.122 cDC L2
ENSG00000243725 TTC4 257391 sc-eQTL 9.27e-02 0.234 0.139 0.122 cDC L2
ENSG00000116133 DHCR24 86057 sc-eQTL 3.67e-01 0.0697 0.077 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000116205 TCEANC2 919668 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0836 0.107 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000116209 TMEM59 919748 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0193 0.065 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000116221 MRPL37 789211 sc-eQTL 3.75e-01 -0.103 0.116 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000157216 SSBP3 559773 sc-eQTL 5.88e-01 0.0641 0.118 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000162402 USP24 -242112 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0185 0.0873 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000243725 TTC4 257391 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0862 0.133 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000116133 DHCR24 86057 sc-eQTL 3.32e-01 0.07 0.072 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000116205 TCEANC2 919668 sc-eQTL 3.06e-01 -0.113 0.11 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000116209 TMEM59 919748 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0549 0.0881 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000116221 MRPL37 789211 sc-eQTL 7.99e-01 0.0325 0.127 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000157216 SSBP3 559773 sc-eQTL 2.02e-01 -0.169 0.132 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000162402 USP24 -242112 sc-eQTL 3.49e-02 -0.225 0.106 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000243725 TTC4 257391 sc-eQTL 7.52e-01 0.0424 0.134 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000006555 TTC22 171929 sc-eQTL 8.88e-01 0.0172 0.122 0.124 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 86057 sc-eQTL 2.56e-01 -0.154 0.135 0.124 gdT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 919668 sc-eQTL 1.41e-01 0.201 0.136 0.124 gdT L2
ENSG00000116209 TMEM59 919748 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0485 0.139 0.124 gdT L2
ENSG00000116221 MRPL37 789211 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0566 0.159 0.124 gdT L2
ENSG00000157216 SSBP3 559773 sc-eQTL 2.23e-01 -0.118 0.0968 0.124 gdT L2
ENSG00000162402 USP24 -242112 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0363 0.131 0.124 gdT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 773216 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0292 0.136 0.124 gdT L2
ENSG00000243725 TTC4 257391 sc-eQTL 1.10e-01 -0.244 0.152 0.124 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 86057 sc-eQTL 1.84e-02 -0.229 0.0962 0.131 intMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 919668 sc-eQTL 2.17e-01 0.15 0.121 0.131 intMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 919748 sc-eQTL 9.65e-01 0.00391 0.0892 0.131 intMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 789211 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0597 0.136 0.131 intMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 559773 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0637 0.139 0.131 intMono L2
ENSG00000162402 USP24 -242112 sc-eQTL 4.02e-01 0.104 0.124 0.131 intMono L2
ENSG00000243725 TTC4 257391 sc-eQTL 2.47e-01 0.153 0.132 0.131 intMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 86057 sc-eQTL 1.97e-02 -0.23 0.0978 0.122 ncMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 919668 sc-eQTL 2.39e-01 -0.146 0.124 0.122 ncMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 919748 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0481 0.0992 0.122 ncMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 789211 sc-eQTL 2.47e-02 0.286 0.126 0.122 ncMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 559773 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0673 0.14 0.122 ncMono L2
ENSG00000162402 USP24 -242112 sc-eQTL 5.33e-01 0.0697 0.112 0.122 ncMono L2
ENSG00000243725 TTC4 257391 sc-eQTL 6.09e-01 0.0678 0.132 0.122 ncMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 86057 sc-eQTL 4.79e-01 0.0855 0.121 0.119 pDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 919668 sc-eQTL 6.32e-01 0.0696 0.145 0.119 pDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 919748 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0968 0.115 0.119 pDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 789211 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0445 0.154 0.119 pDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 559773 sc-eQTL 5.08e-01 0.0904 0.136 0.119 pDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 430995 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0153 0.0574 0.119 pDC L2
ENSG00000162402 USP24 -242112 sc-eQTL 4.73e-01 0.0697 0.0968 0.119 pDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 773216 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0829 0.132 0.119 pDC L2
ENSG00000243725 TTC4 257391 sc-eQTL 2.61e-01 -0.172 0.152 0.119 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 171929 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00325 0.123 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 86057 sc-eQTL 9.96e-01 0.00056 0.123 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 919668 sc-eQTL 6.39e-01 0.0559 0.119 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 919748 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0855 0.0925 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 789211 sc-eQTL 5.76e-02 -0.21 0.11 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 559773 sc-eQTL 1.69e-01 -0.133 0.0961 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -242112 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0734 0.0879 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 773216 sc-eQTL 3.23e-01 -0.134 0.135 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 257391 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0938 0.121 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 171929 sc-eQTL 6.53e-01 0.0576 0.128 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 86057 sc-eQTL 5.75e-01 0.0648 0.115 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 919668 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0621 0.104 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 919748 sc-eQTL 5.26e-01 0.047 0.074 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 789211 sc-eQTL 2.60e-01 -0.12 0.106 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 559773 sc-eQTL 4.75e-01 0.0681 0.0952 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -242112 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0267 0.0817 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 773216 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0902 0.129 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 257391 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0697 0.122 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 86057 sc-eQTL 1.38e-01 0.111 0.0742 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 919668 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0832 0.0932 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 919748 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0422 0.0643 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 789211 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0835 0.114 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 559773 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0289 0.119 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -242112 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0776 0.0814 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 257391 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0826 0.135 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 86057 sc-eQTL 4.41e-02 -0.188 0.0926 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 919668 sc-eQTL 9.68e-01 0.00499 0.123 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 919748 sc-eQTL 4.18e-01 -0.074 0.0913 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 789211 sc-eQTL 1.72e-01 0.171 0.125 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 559773 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0841 0.133 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -242112 sc-eQTL 3.78e-01 0.0928 0.105 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 257391 sc-eQTL 2.44e-01 0.154 0.132 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 171929 sc-eQTL 7.82e-01 0.0291 0.105 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 86057 sc-eQTL 9.47e-01 0.00737 0.11 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 919668 sc-eQTL 1.00e-01 0.177 0.107 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 919748 sc-eQTL 3.40e-02 0.176 0.0826 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 789211 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0198 0.112 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 559773 sc-eQTL 6.84e-02 -0.167 0.091 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162398 LEXM 167189 sc-eQTL 3.04e-01 -0.106 0.103 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -242112 sc-eQTL 8.46e-01 0.0128 0.0656 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 257391 sc-eQTL 9.58e-01 0.00615 0.117 0.127 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000006555 TTC22 171929 eQTL 0.0009 -0.0736 0.0221 0.0 0.0 0.128

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000162402 \N -242112 4.02e-06 4.86e-06 7.32e-07 2.89e-06 4.65e-07 8.07e-07 2.22e-06 4.54e-07 2.24e-06 8.16e-07 4.22e-06 1.45e-06 7.51e-06 1.96e-06 9.92e-07 9.88e-07 1.98e-06 1.89e-06 6.59e-07 1.09e-06 9.23e-07 3.01e-06 2.46e-06 1.01e-06 4.64e-06 1.13e-06 1.17e-06 1.44e-06 2.17e-06 1.84e-06 1.96e-06 7.28e-08 2.76e-07 1.92e-06 1.93e-06 1.03e-06 8.88e-07 3.66e-07 1.17e-06 1.85e-07 2.84e-07 6.25e-06 6.31e-07 1.96e-07 3.71e-07 7.44e-07 2.45e-07 2.25e-07 1.12e-07