Genes within 1Mb (chr1:54970820:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 169497 sc-eQTL 6.74e-01 0.0434 0.103 0.171 B L1
ENSG00000116133 DHCR24 83625 sc-eQTL 5.51e-01 0.0582 0.0976 0.171 B L1
ENSG00000116205 TCEANC2 917236 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0595 0.0842 0.171 B L1
ENSG00000116209 TMEM59 917316 sc-eQTL 6.02e-01 0.0268 0.0513 0.171 B L1
ENSG00000116221 MRPL37 786779 sc-eQTL 7.49e-02 -0.119 0.0667 0.171 B L1
ENSG00000157216 SSBP3 557341 sc-eQTL 1.83e-01 -0.0935 0.07 0.171 B L1
ENSG00000162402 USP24 -244544 sc-eQTL 1.81e-01 -0.0796 0.0593 0.171 B L1
ENSG00000215883 CYB5RL 770784 sc-eQTL 6.26e-02 -0.213 0.114 0.171 B L1
ENSG00000243725 TTC4 254959 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0412 0.0998 0.171 B L1
ENSG00000006555 TTC22 169497 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0696 0.0814 0.171 CD4T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 917236 sc-eQTL 8.77e-01 0.0103 0.0667 0.171 CD4T L1
ENSG00000116209 TMEM59 917316 sc-eQTL 1.19e-01 0.0966 0.0618 0.171 CD4T L1
ENSG00000116221 MRPL37 786779 sc-eQTL 1.04e-02 -0.218 0.0846 0.171 CD4T L1
ENSG00000157216 SSBP3 557341 sc-eQTL 5.45e-01 0.0432 0.0713 0.171 CD4T L1
ENSG00000162402 USP24 -244544 sc-eQTL 1.83e-01 -0.0774 0.0579 0.171 CD4T L1
ENSG00000243725 TTC4 254959 sc-eQTL 6.44e-01 0.0404 0.0874 0.171 CD4T L1
ENSG00000006555 TTC22 169497 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00468 0.0709 0.171 CD8T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 917236 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0572 0.0883 0.171 CD8T L1
ENSG00000116209 TMEM59 917316 sc-eQTL 1.49e-01 0.0884 0.061 0.171 CD8T L1
ENSG00000116221 MRPL37 786779 sc-eQTL 3.03e-01 -0.0869 0.0842 0.171 CD8T L1
ENSG00000157216 SSBP3 557341 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0218 0.0607 0.171 CD8T L1
ENSG00000162402 USP24 -244544 sc-eQTL 7.86e-01 0.0159 0.0587 0.171 CD8T L1
ENSG00000243725 TTC4 254959 sc-eQTL 4.12e-01 0.0835 0.102 0.171 CD8T L1
ENSG00000116133 DHCR24 83625 sc-eQTL 2.98e-01 0.101 0.0967 0.162 DC L1
ENSG00000116205 TCEANC2 917236 sc-eQTL 2.00e-01 0.139 0.108 0.162 DC L1
ENSG00000116209 TMEM59 917316 sc-eQTL 2.74e-01 -0.0934 0.0851 0.162 DC L1
ENSG00000116221 MRPL37 786779 sc-eQTL 7.92e-01 0.0303 0.115 0.162 DC L1
ENSG00000157216 SSBP3 557341 sc-eQTL 3.56e-01 0.0944 0.102 0.162 DC L1
ENSG00000162390 ACOT11 428563 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00417 0.0983 0.162 DC L1
ENSG00000162402 USP24 -244544 sc-eQTL 3.60e-01 0.0544 0.0592 0.162 DC L1
ENSG00000215883 CYB5RL 770784 sc-eQTL 2.39e-01 -0.126 0.107 0.162 DC L1
ENSG00000243725 TTC4 254959 sc-eQTL 7.83e-01 0.0318 0.115 0.162 DC L1
ENSG00000116133 DHCR24 83625 sc-eQTL 3.13e-01 0.0687 0.0679 0.171 Mono L1
ENSG00000116205 TCEANC2 917236 sc-eQTL 1.31e-01 -0.111 0.0731 0.171 Mono L1
ENSG00000116209 TMEM59 917316 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0454 0.0545 0.171 Mono L1
ENSG00000116221 MRPL37 786779 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0487 0.0912 0.171 Mono L1
ENSG00000157216 SSBP3 557341 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0192 0.105 0.171 Mono L1
ENSG00000162402 USP24 -244544 sc-eQTL 1.23e-01 -0.0959 0.062 0.171 Mono L1
ENSG00000243725 TTC4 254959 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0274 0.11 0.171 Mono L1
ENSG00000006555 TTC22 169497 sc-eQTL 7.55e-01 0.0292 0.0935 0.172 NK L1
ENSG00000116133 DHCR24 83625 sc-eQTL 1.91e-01 -0.123 0.094 0.172 NK L1
ENSG00000116205 TCEANC2 917236 sc-eQTL 3.34e-01 0.0899 0.0929 0.172 NK L1
ENSG00000116209 TMEM59 917316 sc-eQTL 2.28e-01 0.0878 0.0727 0.172 NK L1
ENSG00000116221 MRPL37 786779 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0392 0.0906 0.172 NK L1
ENSG00000157216 SSBP3 557341 sc-eQTL 1.72e-01 -0.107 0.0783 0.172 NK L1
ENSG00000162398 LEXM 164757 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0581 0.0881 0.172 NK L1
ENSG00000162402 USP24 -244544 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0416 0.0534 0.172 NK L1
ENSG00000243725 TTC4 254959 sc-eQTL 4.47e-01 0.0769 0.101 0.172 NK L1
ENSG00000006555 TTC22 169497 sc-eQTL 6.16e-01 0.0418 0.0833 0.171 Other_T L1
ENSG00000116133 DHCR24 83625 sc-eQTL 2.17e-02 -0.148 0.0639 0.171 Other_T L1
ENSG00000116205 TCEANC2 917236 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0159 0.0968 0.171 Other_T L1
ENSG00000116209 TMEM59 917316 sc-eQTL 4.51e-01 0.0501 0.0663 0.171 Other_T L1
ENSG00000116221 MRPL37 786779 sc-eQTL 4.90e-01 -0.043 0.0622 0.171 Other_T L1
ENSG00000157216 SSBP3 557341 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0369 0.0719 0.171 Other_T L1
ENSG00000162402 USP24 -244544 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0619 0.0765 0.171 Other_T L1
ENSG00000215883 CYB5RL 770784 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0643 0.105 0.171 Other_T L1
ENSG00000243725 TTC4 254959 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0277 0.104 0.171 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 169497 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0696 0.0875 0.181 B_Activated L2
ENSG00000116133 DHCR24 83625 sc-eQTL 3.35e-01 -0.0993 0.103 0.181 B_Activated L2
ENSG00000116205 TCEANC2 917236 sc-eQTL 4.57e-01 0.0823 0.11 0.181 B_Activated L2
ENSG00000116209 TMEM59 917316 sc-eQTL 7.45e-01 0.0382 0.117 0.181 B_Activated L2
ENSG00000116221 MRPL37 786779 sc-eQTL 1.41e-01 0.186 0.126 0.181 B_Activated L2
ENSG00000157216 SSBP3 557341 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0925 0.115 0.181 B_Activated L2
ENSG00000162402 USP24 -244544 sc-eQTL 2.85e-01 -0.12 0.112 0.181 B_Activated L2
ENSG00000215883 CYB5RL 770784 sc-eQTL 2.79e-01 0.107 0.0986 0.181 B_Activated L2
ENSG00000243725 TTC4 254959 sc-eQTL 3.71e-01 0.096 0.107 0.181 B_Activated L2
ENSG00000006555 TTC22 169497 sc-eQTL 1.16e-01 0.174 0.111 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000116133 DHCR24 83625 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00641 0.103 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000116205 TCEANC2 917236 sc-eQTL 2.85e-01 0.11 0.103 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000116209 TMEM59 917316 sc-eQTL 3.71e-02 -0.183 0.0871 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000116221 MRPL37 786779 sc-eQTL 2.44e-01 -0.121 0.103 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000157216 SSBP3 557341 sc-eQTL 1.99e-01 -0.124 0.0964 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000162402 USP24 -244544 sc-eQTL 8.75e-02 -0.139 0.0809 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000215883 CYB5RL 770784 sc-eQTL 2.61e-01 -0.13 0.115 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000243725 TTC4 254959 sc-eQTL 9.09e-01 -0.012 0.105 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000006555 TTC22 169497 sc-eQTL 2.30e-01 0.128 0.107 0.172 B_Memory L2
ENSG00000116133 DHCR24 83625 sc-eQTL 1.20e-01 -0.165 0.106 0.172 B_Memory L2
ENSG00000116205 TCEANC2 917236 sc-eQTL 9.04e-01 0.0137 0.113 0.172 B_Memory L2
ENSG00000116209 TMEM59 917316 sc-eQTL 3.79e-01 0.0833 0.0945 0.172 B_Memory L2
ENSG00000116221 MRPL37 786779 sc-eQTL 5.95e-01 -0.051 0.0958 0.172 B_Memory L2
ENSG00000157216 SSBP3 557341 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0188 0.0895 0.172 B_Memory L2
ENSG00000162402 USP24 -244544 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0101 0.0875 0.172 B_Memory L2
ENSG00000215883 CYB5RL 770784 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0757 0.108 0.172 B_Memory L2
ENSG00000243725 TTC4 254959 sc-eQTL 1.10e-02 -0.283 0.11 0.172 B_Memory L2
ENSG00000006555 TTC22 169497 sc-eQTL 9.91e-01 0.00131 0.111 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000116133 DHCR24 83625 sc-eQTL 9.22e-01 0.0102 0.104 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 917236 sc-eQTL 1.17e-01 -0.145 0.0924 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000116209 TMEM59 917316 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0398 0.0674 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000116221 MRPL37 786779 sc-eQTL 2.12e-01 -0.124 0.0992 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000157216 SSBP3 557341 sc-eQTL 3.07e-01 0.0968 0.0946 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000162402 USP24 -244544 sc-eQTL 8.64e-01 0.0128 0.0747 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 770784 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0468 0.113 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000243725 TTC4 254959 sc-eQTL 8.22e-01 0.0229 0.102 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000006555 TTC22 169497 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00841 0.111 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000116133 DHCR24 83625 sc-eQTL 8.88e-01 0.0136 0.0965 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000116205 TCEANC2 917236 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0408 0.107 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000116209 TMEM59 917316 sc-eQTL 2.39e-01 0.104 0.0879 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000116221 MRPL37 786779 sc-eQTL 8.32e-01 -0.022 0.104 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000157216 SSBP3 557341 sc-eQTL 7.30e-01 0.0353 0.102 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000162402 USP24 -244544 sc-eQTL 6.66e-01 0.0351 0.081 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000215883 CYB5RL 770784 sc-eQTL 2.48e-01 -0.132 0.114 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000243725 TTC4 254959 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0311 0.119 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000006555 TTC22 169497 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0237 0.105 0.166 CD4_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 917236 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0483 0.109 0.166 CD4_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 917316 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0141 0.0987 0.166 CD4_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 786779 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0532 0.121 0.166 CD4_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 557341 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0711 0.0745 0.166 CD4_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -244544 sc-eQTL 1.13e-01 -0.162 0.102 0.166 CD4_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 254959 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0289 0.115 0.166 CD4_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 169497 sc-eQTL 1.51e-01 -0.14 0.0971 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 917236 sc-eQTL 8.09e-01 0.018 0.0743 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 917316 sc-eQTL 3.49e-01 0.0676 0.0721 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 786779 sc-eQTL 3.14e-02 -0.199 0.0921 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 557341 sc-eQTL 2.07e-01 0.0937 0.074 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -244544 sc-eQTL 2.68e-01 -0.071 0.0639 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 254959 sc-eQTL 2.76e-01 0.107 0.0974 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 169497 sc-eQTL 7.42e-01 0.0336 0.102 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 917236 sc-eQTL 2.74e-01 0.109 0.0992 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 917316 sc-eQTL 3.14e-01 0.0756 0.0749 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 786779 sc-eQTL 2.12e-01 -0.118 0.0941 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 557341 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0667 0.0924 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -244544 sc-eQTL 5.83e-01 0.0422 0.0766 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 254959 sc-eQTL 4.52e-02 -0.22 0.109 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 169497 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0464 0.115 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 917236 sc-eQTL 1.40e-01 -0.16 0.108 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 917316 sc-eQTL 8.21e-02 0.146 0.0837 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 786779 sc-eQTL 2.43e-01 -0.127 0.108 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 557341 sc-eQTL 8.90e-01 0.0129 0.093 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -244544 sc-eQTL 9.89e-02 -0.139 0.0841 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 254959 sc-eQTL 3.57e-01 0.103 0.112 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 169497 sc-eQTL 2.49e-01 0.106 0.0916 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000116205 TCEANC2 917236 sc-eQTL 6.30e-02 -0.189 0.101 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000116209 TMEM59 917316 sc-eQTL 2.05e-01 0.112 0.0882 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000116221 MRPL37 786779 sc-eQTL 7.70e-01 0.0307 0.105 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000157216 SSBP3 557341 sc-eQTL 8.38e-01 0.0147 0.0717 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000162402 USP24 -244544 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0411 0.0712 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000243725 TTC4 254959 sc-eQTL 1.23e-02 0.266 0.105 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000006555 TTC22 169497 sc-eQTL 2.50e-01 -0.12 0.104 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000116205 TCEANC2 917236 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000139 0.0944 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000116209 TMEM59 917316 sc-eQTL 1.87e-01 0.122 0.0919 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000116221 MRPL37 786779 sc-eQTL 7.05e-03 -0.296 0.109 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000157216 SSBP3 557341 sc-eQTL 7.51e-01 0.0266 0.0837 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000162402 USP24 -244544 sc-eQTL 9.96e-02 0.125 0.0757 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000243725 TTC4 254959 sc-eQTL 5.25e-02 -0.215 0.11 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000006555 TTC22 169497 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0646 0.114 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 917236 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0236 0.115 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000116209 TMEM59 917316 sc-eQTL 3.36e-01 0.0973 0.101 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000116221 MRPL37 786779 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00731 0.115 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000157216 SSBP3 557341 sc-eQTL 2.43e-01 0.116 0.0992 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000162402 USP24 -244544 sc-eQTL 1.32e-01 -0.145 0.0959 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000243725 TTC4 254959 sc-eQTL 3.22e-01 -0.116 0.117 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000006555 TTC22 169497 sc-eQTL 4.35e-01 0.0848 0.108 0.171 CD8_TEM L2
ENSG00000116205 TCEANC2 917236 sc-eQTL 9.12e-01 0.0125 0.113 0.171 CD8_TEM L2
ENSG00000116209 TMEM59 917316 sc-eQTL 6.32e-01 0.0526 0.109 0.171 CD8_TEM L2
ENSG00000116221 MRPL37 786779 sc-eQTL 7.29e-01 0.0384 0.111 0.171 CD8_TEM L2
ENSG00000157216 SSBP3 557341 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0155 0.105 0.171 CD8_TEM L2
ENSG00000162402 USP24 -244544 sc-eQTL 2.69e-01 0.122 0.11 0.171 CD8_TEM L2
ENSG00000243725 TTC4 254959 sc-eQTL 4.56e-01 0.0838 0.112 0.171 CD8_TEM L2
ENSG00000006555 TTC22 169497 sc-eQTL 8.38e-01 0.0203 0.0993 0.169 MAIT L2
ENSG00000116133 DHCR24 83625 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0323 0.0735 0.169 MAIT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 917236 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0608 0.103 0.169 MAIT L2
ENSG00000116209 TMEM59 917316 sc-eQTL 8.78e-02 0.159 0.0928 0.169 MAIT L2
ENSG00000116221 MRPL37 786779 sc-eQTL 8.47e-01 0.0219 0.114 0.169 MAIT L2
ENSG00000157216 SSBP3 557341 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0261 0.101 0.169 MAIT L2
ENSG00000162402 USP24 -244544 sc-eQTL 1.48e-01 -0.129 0.0889 0.169 MAIT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 770784 sc-eQTL 8.60e-01 0.0184 0.104 0.169 MAIT L2
ENSG00000243725 TTC4 254959 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0806 0.103 0.169 MAIT L2
ENSG00000006555 TTC22 169497 sc-eQTL 2.02e-01 -0.144 0.113 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000116133 DHCR24 83625 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0804 0.0997 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000116205 TCEANC2 917236 sc-eQTL 1.85e-01 -0.14 0.105 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000116209 TMEM59 917316 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0305 0.103 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000116221 MRPL37 786779 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0261 0.115 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000157216 SSBP3 557341 sc-eQTL 4.55e-01 0.0648 0.0865 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000162398 LEXM 164757 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0231 0.102 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000162402 USP24 -244544 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0424 0.088 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000243725 TTC4 254959 sc-eQTL 7.75e-01 0.0318 0.111 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000006555 TTC22 169497 sc-eQTL 5.25e-02 0.183 0.094 0.172 NK_CD56dim L2
ENSG00000116133 DHCR24 83625 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0858 0.0988 0.172 NK_CD56dim L2
ENSG00000116205 TCEANC2 917236 sc-eQTL 4.98e-01 0.0727 0.107 0.172 NK_CD56dim L2
ENSG00000116209 TMEM59 917316 sc-eQTL 5.30e-01 0.05 0.0794 0.172 NK_CD56dim L2
ENSG00000116221 MRPL37 786779 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0649 0.103 0.172 NK_CD56dim L2
ENSG00000157216 SSBP3 557341 sc-eQTL 3.74e-01 -0.0753 0.0845 0.172 NK_CD56dim L2
ENSG00000162398 LEXM 164757 sc-eQTL 6.99e-01 0.0376 0.0973 0.172 NK_CD56dim L2
ENSG00000162402 USP24 -244544 sc-eQTL 7.12e-01 0.0229 0.0618 0.172 NK_CD56dim L2
ENSG00000243725 TTC4 254959 sc-eQTL 3.21e-01 -0.105 0.106 0.172 NK_CD56dim L2
ENSG00000006555 TTC22 169497 sc-eQTL 3.66e-02 -0.232 0.11 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000116133 DHCR24 83625 sc-eQTL 1.98e-01 -0.14 0.108 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000116205 TCEANC2 917236 sc-eQTL 4.03e-01 0.088 0.105 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000116209 TMEM59 917316 sc-eQTL 7.48e-01 0.0336 0.104 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000116221 MRPL37 786779 sc-eQTL 1.11e-01 -0.183 0.114 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000157216 SSBP3 557341 sc-eQTL 1.86e-01 -0.124 0.0934 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000162398 LEXM 164757 sc-eQTL 2.70e-02 -0.233 0.105 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000162402 USP24 -244544 sc-eQTL 2.13e-01 0.0967 0.0774 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000243725 TTC4 254959 sc-eQTL 8.60e-02 0.199 0.115 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000006555 TTC22 169497 sc-eQTL 1.92e-01 0.131 0.0999 0.172 NK_cytokine L2
ENSG00000116133 DHCR24 83625 sc-eQTL 2.09e-01 -0.127 0.101 0.172 NK_cytokine L2
ENSG00000116205 TCEANC2 917236 sc-eQTL 1.87e-01 0.133 0.1 0.172 NK_cytokine L2
ENSG00000116209 TMEM59 917316 sc-eQTL 1.11e-01 0.13 0.0814 0.172 NK_cytokine L2
ENSG00000116221 MRPL37 786779 sc-eQTL 8.56e-01 0.0184 0.101 0.172 NK_cytokine L2
ENSG00000157216 SSBP3 557341 sc-eQTL 1.60e-01 -0.119 0.0843 0.172 NK_cytokine L2
ENSG00000162398 LEXM 164757 sc-eQTL 6.91e-01 0.0421 0.106 0.172 NK_cytokine L2
ENSG00000162402 USP24 -244544 sc-eQTL 5.48e-02 -0.138 0.0715 0.172 NK_cytokine L2
ENSG00000243725 TTC4 254959 sc-eQTL 1.69e-01 0.147 0.106 0.172 NK_cytokine L2
ENSG00000006555 TTC22 169497 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000125 0.119 0.207 PB L2
ENSG00000116133 DHCR24 83625 sc-eQTL 2.31e-01 0.126 0.105 0.207 PB L2
ENSG00000116205 TCEANC2 917236 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0625 0.128 0.207 PB L2
ENSG00000116209 TMEM59 917316 sc-eQTL 9.61e-02 0.0891 0.0531 0.207 PB L2
ENSG00000116221 MRPL37 786779 sc-eQTL 3.01e-02 -0.21 0.0957 0.207 PB L2
ENSG00000157216 SSBP3 557341 sc-eQTL 1.33e-01 -0.169 0.112 0.207 PB L2
ENSG00000162402 USP24 -244544 sc-eQTL 6.73e-01 0.0541 0.128 0.207 PB L2
ENSG00000215883 CYB5RL 770784 sc-eQTL 8.80e-01 0.0202 0.133 0.207 PB L2
ENSG00000243725 TTC4 254959 sc-eQTL 9.50e-01 0.00779 0.124 0.207 PB L2
ENSG00000006555 TTC22 169497 sc-eQTL 7.39e-01 0.0341 0.102 0.174 Pro_T L2
ENSG00000116133 DHCR24 83625 sc-eQTL 5.87e-02 -0.164 0.0861 0.174 Pro_T L2
ENSG00000116205 TCEANC2 917236 sc-eQTL 1.27e-01 0.161 0.105 0.174 Pro_T L2
ENSG00000116209 TMEM59 917316 sc-eQTL 7.63e-01 0.0222 0.0735 0.174 Pro_T L2
ENSG00000116221 MRPL37 786779 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0391 0.072 0.174 Pro_T L2
ENSG00000157216 SSBP3 557341 sc-eQTL 7.88e-01 0.0217 0.0808 0.174 Pro_T L2
ENSG00000162402 USP24 -244544 sc-eQTL 1.74e-01 0.134 0.0981 0.174 Pro_T L2
ENSG00000215883 CYB5RL 770784 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0494 0.0972 0.174 Pro_T L2
ENSG00000243725 TTC4 254959 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0959 0.108 0.174 Pro_T L2
ENSG00000006555 TTC22 169497 sc-eQTL 3.15e-01 -0.102 0.101 0.171 Treg L2
ENSG00000116205 TCEANC2 917236 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0251 0.109 0.171 Treg L2
ENSG00000116209 TMEM59 917316 sc-eQTL 8.21e-01 0.0194 0.0859 0.171 Treg L2
ENSG00000116221 MRPL37 786779 sc-eQTL 1.22e-01 -0.164 0.106 0.171 Treg L2
ENSG00000157216 SSBP3 557341 sc-eQTL 8.09e-01 0.0229 0.0949 0.171 Treg L2
ENSG00000162402 USP24 -244544 sc-eQTL 5.88e-01 -0.049 0.0903 0.171 Treg L2
ENSG00000243725 TTC4 254959 sc-eQTL 9.02e-01 -0.014 0.114 0.171 Treg L2
ENSG00000116133 DHCR24 83625 sc-eQTL 6.97e-01 0.0369 0.0946 0.168 cDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 917236 sc-eQTL 6.93e-01 0.0441 0.112 0.168 cDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 917316 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0326 0.0948 0.168 cDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 786779 sc-eQTL 2.19e-01 0.149 0.121 0.168 cDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 557341 sc-eQTL 3.27e-01 0.11 0.112 0.168 cDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 428563 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0232 0.104 0.168 cDC L2
ENSG00000162402 USP24 -244544 sc-eQTL 5.73e-01 0.0657 0.117 0.168 cDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 770784 sc-eQTL 1.97e-01 -0.129 0.0997 0.168 cDC L2
ENSG00000243725 TTC4 254959 sc-eQTL 7.54e-02 0.212 0.119 0.168 cDC L2
ENSG00000116133 DHCR24 83625 sc-eQTL 4.64e-01 0.0484 0.0659 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000116205 TCEANC2 917236 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0249 0.0917 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000116209 TMEM59 917316 sc-eQTL 2.37e-01 -0.0658 0.0554 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000116221 MRPL37 786779 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0848 0.0989 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000157216 SSBP3 557341 sc-eQTL 3.16e-01 0.102 0.101 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000162402 USP24 -244544 sc-eQTL 8.31e-01 -0.016 0.0747 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000243725 TTC4 254959 sc-eQTL 9.43e-01 0.00811 0.114 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000116133 DHCR24 83625 sc-eQTL 8.41e-01 0.0124 0.0619 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000116205 TCEANC2 917236 sc-eQTL 3.78e-02 -0.195 0.0934 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000116209 TMEM59 917316 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0429 0.0755 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000116221 MRPL37 786779 sc-eQTL 7.67e-01 0.0323 0.109 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000157216 SSBP3 557341 sc-eQTL 2.23e-01 -0.138 0.113 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000162402 USP24 -244544 sc-eQTL 2.64e-02 -0.203 0.0907 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000243725 TTC4 254959 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0242 0.115 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000006555 TTC22 169497 sc-eQTL 6.01e-01 0.0549 0.105 0.164 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 83625 sc-eQTL 2.98e-01 -0.122 0.116 0.164 gdT L2
ENSG00000116205 TCEANC2 917236 sc-eQTL 2.71e-01 0.129 0.117 0.164 gdT L2
ENSG00000116209 TMEM59 917316 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0765 0.119 0.164 gdT L2
ENSG00000116221 MRPL37 786779 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0348 0.137 0.164 gdT L2
ENSG00000157216 SSBP3 557341 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0685 0.0834 0.164 gdT L2
ENSG00000162402 USP24 -244544 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0414 0.112 0.164 gdT L2
ENSG00000215883 CYB5RL 770784 sc-eQTL 4.21e-01 0.0941 0.116 0.164 gdT L2
ENSG00000243725 TTC4 254959 sc-eQTL 9.33e-02 -0.22 0.13 0.164 gdT L2
ENSG00000116133 DHCR24 83625 sc-eQTL 3.54e-02 -0.174 0.0823 0.178 intMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 917236 sc-eQTL 6.96e-01 0.0406 0.104 0.178 intMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 917316 sc-eQTL 5.95e-01 0.0405 0.0761 0.178 intMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 786779 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0733 0.116 0.178 intMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 557341 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00977 0.119 0.178 intMono L2
ENSG00000162402 USP24 -244544 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0276 0.106 0.178 intMono L2
ENSG00000243725 TTC4 254959 sc-eQTL 2.04e-01 0.143 0.112 0.178 intMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 83625 sc-eQTL 2.36e-02 -0.192 0.0842 0.167 ncMono L2
ENSG00000116205 TCEANC2 917236 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0493 0.107 0.167 ncMono L2
ENSG00000116209 TMEM59 917316 sc-eQTL 3.93e-01 -0.073 0.0852 0.167 ncMono L2
ENSG00000116221 MRPL37 786779 sc-eQTL 1.63e-01 0.154 0.11 0.167 ncMono L2
ENSG00000157216 SSBP3 557341 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0237 0.12 0.167 ncMono L2
ENSG00000162402 USP24 -244544 sc-eQTL 6.34e-01 0.0459 0.0962 0.167 ncMono L2
ENSG00000243725 TTC4 254959 sc-eQTL 8.75e-01 -0.018 0.114 0.167 ncMono L2
ENSG00000116133 DHCR24 83625 sc-eQTL 1.61e-01 0.143 0.102 0.167 pDC L2
ENSG00000116205 TCEANC2 917236 sc-eQTL 2.93e-01 0.129 0.123 0.167 pDC L2
ENSG00000116209 TMEM59 917316 sc-eQTL 2.07e-01 -0.124 0.0977 0.167 pDC L2
ENSG00000116221 MRPL37 786779 sc-eQTL 8.71e-01 0.0212 0.131 0.167 pDC L2
ENSG00000157216 SSBP3 557341 sc-eQTL 3.74e-01 0.103 0.116 0.167 pDC L2
ENSG00000162390 ACOT11 428563 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0127 0.0487 0.167 pDC L2
ENSG00000162402 USP24 -244544 sc-eQTL 9.05e-01 -0.00982 0.0823 0.167 pDC L2
ENSG00000215883 CYB5RL 770784 sc-eQTL 2.93e-01 -0.118 0.112 0.167 pDC L2
ENSG00000243725 TTC4 254959 sc-eQTL 2.29e-01 -0.156 0.129 0.167 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000006555 TTC22 169497 sc-eQTL 3.19e-01 0.106 0.106 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 83625 sc-eQTL 2.63e-01 -0.119 0.106 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 917236 sc-eQTL 5.91e-01 0.0553 0.103 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 917316 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0592 0.0798 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 786779 sc-eQTL 2.43e-01 -0.112 0.0954 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 557341 sc-eQTL 3.02e-01 -0.0859 0.083 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -244544 sc-eQTL 4.97e-02 -0.149 0.0752 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 770784 sc-eQTL 3.38e-01 -0.112 0.116 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 254959 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0671 0.105 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 169497 sc-eQTL 9.00e-01 0.014 0.112 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 83625 sc-eQTL 7.05e-01 0.0381 0.1 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 917236 sc-eQTL 2.37e-01 -0.107 0.0904 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 917316 sc-eQTL 5.84e-01 0.0354 0.0644 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 786779 sc-eQTL 1.68e-01 -0.128 0.0923 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 557341 sc-eQTL 1.60e-01 0.116 0.0825 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -244544 sc-eQTL 8.31e-01 0.0152 0.0711 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000215883 CYB5RL 770784 sc-eQTL 3.42e-01 -0.107 0.112 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 254959 sc-eQTL 8.81e-01 0.0158 0.106 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 83625 sc-eQTL 1.89e-01 0.084 0.0638 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 917236 sc-eQTL 2.37e-01 -0.0948 0.0799 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 917316 sc-eQTL 2.35e-01 -0.0657 0.0551 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 786779 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0638 0.0978 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 557341 sc-eQTL 8.31e-01 0.0219 0.102 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -244544 sc-eQTL 2.16e-01 -0.0866 0.0698 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 254959 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0342 0.116 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 83625 sc-eQTL 7.61e-02 -0.143 0.0801 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 917236 sc-eQTL 7.91e-01 0.0282 0.106 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 917316 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0474 0.0788 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 786779 sc-eQTL 2.93e-01 0.114 0.108 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 557341 sc-eQTL 9.99e-01 0.00011 0.115 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -244544 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0221 0.0908 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 254959 sc-eQTL 4.50e-01 0.0861 0.114 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000006555 TTC22 169497 sc-eQTL 3.14e-01 0.0923 0.0915 0.172 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116133 DHCR24 83625 sc-eQTL 2.69e-01 -0.106 0.0956 0.172 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116205 TCEANC2 917236 sc-eQTL 1.87e-01 0.124 0.0936 0.172 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116209 TMEM59 917316 sc-eQTL 1.27e-01 0.111 0.0723 0.172 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116221 MRPL37 786779 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0389 0.0974 0.172 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000157216 SSBP3 557341 sc-eQTL 1.57e-01 -0.113 0.0795 0.172 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162398 LEXM 164757 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0301 0.09 0.172 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162402 USP24 -244544 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0359 0.0571 0.172 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000243725 TTC4 254959 sc-eQTL 8.23e-01 0.0227 0.102 0.172 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000006555 TTC22 169497 eQTL 0.00107 -0.0614 0.0187 0.0011 0.0 0.186


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000162402 \N -244544 1.28e-06 9.83e-07 2.65e-07 1.07e-06 3.53e-07 6.31e-07 1.58e-06 3.65e-07 1.45e-06 6.14e-07 1.89e-06 7.63e-07 2.34e-06 2.87e-07 5.42e-07 9.24e-07 9.01e-07 7.21e-07 8.61e-07 6.52e-07 7.68e-07 1.72e-06 9.11e-07 5.66e-07 2.21e-06 6.57e-07 9.62e-07 8.53e-07 1.48e-06 1.28e-06 7.47e-07 2.06e-07 3.01e-07 6.89e-07 5.28e-07 4.47e-07 6.08e-07 2.44e-07 4.94e-07 2.94e-07 2.83e-07 1.65e-06 1.1e-07 8.98e-08 2.47e-07 1.12e-07 2.6e-07 3.8e-08 1.6e-07